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    泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前后肝臟組織轉(zhuǎn)錄組對(duì)比分析

    2020-12-16 03:00:30章敬旗章瑋月何文杰
    關(guān)鍵詞:差異基因泰州激素

    張 蕾,章敬旗,章瑋月,糜 娟,何文杰,王 健

    (江蘇農(nóng)牧科技職業(yè)學(xué)院,江蘇 泰州 225300)

    0 引言

    【研究意義】家禽的繁殖過(guò)程受到下丘腦-垂體-性腺軸的調(diào)控,該軸可分泌一系列激素從而影響家禽產(chǎn)蛋和繁殖周期[1?2]。正常情況下,家禽的性成熟開(kāi)始于下丘腦分泌的GnRH(Gonadotropin-releasing hormone,性腺激素釋放激素),從而刺激垂體分泌促LH(Luteinizing hormone,黃體生成素)和FSH(Follicle-stimulating hormone,促卵泡激素),這些相互關(guān)聯(lián)的激素將觸發(fā)鞘細(xì)胞和顆粒細(xì)胞合成性腺類(lèi)固醇(雌二醇、睪酮、黃體酮),從而促進(jìn)卵巢中卵泡的生長(zhǎng),也包括排卵前卵泡的發(fā)育和排卵[3?5]。家禽這種控制卵子形成的神經(jīng)內(nèi)分泌系統(tǒng)不僅僅使輸卵管和卵巢發(fā)生相應(yīng)生理變化,也刺激肝臟中相關(guān)激素依賴(lài)基因的表達(dá)[6?8]。肝臟中這些激素依賴(lài)基因的表達(dá)同時(shí)也支持著與生殖器官發(fā)育相關(guān)的脂質(zhì)變化,包括蛋黃以及支持組織的形成等過(guò)程[9?10]。由此可見(jiàn),肝臟在家禽產(chǎn)蛋過(guò)程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】有研究表明,開(kāi)產(chǎn)后蛋雞的肝臟活動(dòng)發(fā)生變化,開(kāi)始合成大量的脂蛋白[11?12]。Li 等[13]首次對(duì)蛋雞不同產(chǎn)蛋時(shí)期的肝臟轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了對(duì)比分析,構(gòu)建了蛋雞肝臟中的脂肪代謝模式;張臻等[14]應(yīng)用RNA-seq 技術(shù)對(duì)首次產(chǎn)蛋前后的雞肝臟組織進(jìn)行對(duì)比分析,獲得了222 個(gè)差異基因,這些基因影響了肝臟中物質(zhì)代謝途徑的變化。我國(guó)養(yǎng)鵝歷史悠久,是全球鵝品種資源遺傳多樣性最豐富的國(guó)家,現(xiàn)已知經(jīng)國(guó)家或地方鑒定的大中小型地方鵝品種或者培育品種有40 多個(gè)[15]。隨著經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展,“安全、營(yíng)養(yǎng)、健康、綠色”的食品需求日益遞增,鵝蛋、鵝肉等產(chǎn)品已經(jīng)逐漸開(kāi)始成為大眾的消費(fèi)熱潮[16]。在養(yǎng)鵝生產(chǎn)蓬勃發(fā)展的推動(dòng)下,對(duì)鵝優(yōu)良品種的選育提出了更高的需求,推動(dòng)了鵝遺傳繁育研究工作的進(jìn)展。泰州鵝是泰州市肉蛋兼用型地方優(yōu)良畜禽資源,10 周齡體重可達(dá)4.0 kg,肉質(zhì)優(yōu)良;母鵝初產(chǎn)年產(chǎn)蛋量可達(dá)60~65 枚,高于大多數(shù)國(guó)內(nèi)外其他大中型鵝種?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】但是由于受到季節(jié)性繁殖的限制和其他商品鵝配套系的沖擊,泰州鵝種質(zhì)資源一直未能很好地開(kāi)發(fā)與利用。目前有關(guān)鵝產(chǎn)蛋過(guò)程中肝臟分子調(diào)控機(jī)制的研究甚少。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】本研究通過(guò)RNA-Seq 技術(shù),對(duì)首次開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝的肝臟轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行了對(duì)比分析。通過(guò)挖掘篩選差異表達(dá)基因并進(jìn)行GO分析和KEGG 生物信息學(xué)分析,以獲得參與泰州鵝肝臟中與其開(kāi)產(chǎn)相關(guān)的候選關(guān)鍵基因和信號(hào)通路,為加速泰州鵝地方種群的進(jìn)一步選育以及特色配套系的開(kāi)發(fā)利用提供理論參考。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)動(dòng)物

    所用的泰州鵝為江蘇省泰州市豐達(dá)水禽育種提供,選擇同一來(lái)源(同批孵化、同批出雛、同一環(huán)境下予以全價(jià)日糧自由采食)的健康鵝群。隨機(jī)抽樣選取開(kāi)產(chǎn)前10 周齡泰州鵝個(gè)體3 只(樣品編號(hào)1、2、3)以及開(kāi)產(chǎn)后40 周齡泰州鵝個(gè)體3 只(樣品編號(hào)4、5、6)。按照國(guó)家實(shí)驗(yàn)動(dòng)物處理行為準(zhǔn)則進(jìn)行屠宰,并立即采取肝臟組織放入無(wú)酶凍存管,保存于液氮中備用。

    1.2 試驗(yàn)方法

    1.2.1 RNA 提取及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 通過(guò)Trizol 法進(jìn)行泰州鵝肝臟組織總RNA 提取,Nanodrop 檢測(cè)提取的RNA 純度,Qubit 2.0 檢測(cè)提取的RNA 濃度,Aglient 2100 檢測(cè)RNA 的完整性。所有樣品RNA 提取并檢測(cè)合格后,用干冰保存并送至上海歐易生物技術(shù)有限公司,應(yīng)用Illumina HiSeq2500 高通量測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行測(cè)序分析[17]。

    1.2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)分析 對(duì)測(cè)序?yàn)V得的clean data,通過(guò)TopHat2 軟件進(jìn)行序列比對(duì),獲得泰州鵝肝臟樣本特異序列信息,并進(jìn)行基因組定位分析。以|log2Fold change|≥1(P<0.05)為閾值進(jìn)行差異表達(dá)基因的篩選,結(jié)合GO(Gene Ontology,基因本體)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因與基因組百科全書(shū))數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)篩選獲得的差異表達(dá)基因進(jìn)行功能注釋及通路富集分析[18]。

    1.2.3 qRT-PCR 檢測(cè) 隨機(jī)選取1.2.2 中獲得的5 個(gè)差異表達(dá)基因,采用Oligo 7.5 軟件設(shè)計(jì)qRT-PCR 引物(表1),以反轉(zhuǎn)錄得到的開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝肝臟樣本(樣本號(hào)1~6)的cDNA 為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,驗(yàn)證上述基因的表達(dá)規(guī)律。

    1.3 數(shù)據(jù)分析

    所有數(shù)據(jù)以平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤(X±SEM)表示,應(yīng)用SPASS 19.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件,采用兩樣本均數(shù)間t檢驗(yàn)的方法,以P<0.05 視為差異顯著(“*”表示);P<0.01 視為差異極顯著(“**”表示)。目的基因表達(dá)量qRT-PCR 結(jié)果分析采用 2?△△Ct方法。

    表 1 qRT-PCR 引物序列、退火溫度以及目的片段大小Table 1 Primer sequences, annealing temperature, andpredicted length for qRT-PCR

    2 結(jié)果與分析

    2.1 開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝肝臟組織轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

    本試驗(yàn)共構(gòu)建開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝6 個(gè)肝臟組織轉(zhuǎn)錄組文庫(kù),從表2 中可以看出,本試驗(yàn)6 個(gè)樣品獲得75 754 528~81 525 658 條reads,測(cè)序數(shù)據(jù)去除接頭以及低質(zhì)量數(shù)據(jù)后分別獲得73 596 894~79 837 756個(gè)高質(zhì)量數(shù)據(jù)(Clean reads),過(guò)濾后高質(zhì)量序列數(shù)占原始下機(jī)序列數(shù)的比例均大于97%,表明6 個(gè)樣品構(gòu)建的文庫(kù)質(zhì)量較好;同時(shí),過(guò)濾后總序列中準(zhǔn)確率在99.9% 以上的堿基總數(shù)比例(Q30%)占95%以上,進(jìn)一步說(shuō)明測(cè)序結(jié)果質(zhì)量較好。以上結(jié)果表明,本試驗(yàn)構(gòu)建的泰州鵝6 個(gè)肝臟組織轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)質(zhì)量好,可用于進(jìn)一步試驗(yàn),保證了后續(xù)研究的可靠性。

    表 2 樣本數(shù)據(jù)質(zhì)量預(yù)處理評(píng)價(jià)分析Table 2 Quality evaluation and analysis on data preprocessing

    2.2 測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)分析

    基因覆蓋數(shù)指每個(gè)基因上的 reads 覆蓋的堿基數(shù)跟基因編碼區(qū)所有堿基數(shù)的比值。將RNA-Seq 過(guò)濾后的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(Clean data)與參考基因組進(jìn)行比對(duì)分析,比對(duì)效率在88.61%~90.45%,多重覆蓋率在2.5%~3.1%(表3)。上述比對(duì)結(jié)果表明,本試驗(yàn)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)利用率正常,所選用的參考基因組能夠滿(mǎn)足后續(xù)數(shù)據(jù)分析的要求。進(jìn)一步結(jié)合HISAT軟件對(duì)獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組結(jié)構(gòu)比對(duì)分析,泰州鵝產(chǎn)蛋前、后肝臟組織的clean reads 依次分布于外顯子區(qū)域、內(nèi)含子區(qū)域和基因間區(qū),其中外顯子區(qū)域分布最多(圖1)。上述比對(duì)結(jié)果表明,本試驗(yàn)的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)豐富性較好,能有效篩選差異基因。

    圖 1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)比對(duì)基因區(qū)域分布統(tǒng)計(jì)Fig. 1 Transcriptome data vs. regional distribution of genes

    2.3 差異基因篩選與驗(yàn)證

    結(jié)合FPKM 值定量估計(jì)所檢測(cè)的基因表達(dá)值,以開(kāi)產(chǎn)前泰州鵝肝臟組織為對(duì)照,開(kāi)產(chǎn)后泰州鵝肝臟組織為試驗(yàn)組,獲得檢測(cè)基因的參考差異倍數(shù)(Fold change 值),進(jìn)一步篩選|log2Fold change|≥1(P<0.05)的差異基因作為顯著差異基因,根據(jù)差異基因的Fold change 對(duì)數(shù)值以及統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著程度繪制火山圖(圖2),以進(jìn)一步獲得開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝肝臟組織差異基因表達(dá)水平的分布情況。最終篩選出202 個(gè)差異基因,其中上調(diào)差異表達(dá)基因100 個(gè),下調(diào)差異表達(dá)基因102 個(gè)。

    圖 2 差異表達(dá)基因火山圖Fig. 2 Volcano plot of differentially expressed genes

    對(duì)上述篩選出的差異表達(dá)基因進(jìn)行聚類(lèi)分析(圖3),開(kāi)產(chǎn)前、后泰州鵝肝臟組織的3 個(gè)生物學(xué)重復(fù)各自聚類(lèi)到了一起,而不同時(shí)間點(diǎn)的基因表達(dá)模式則出現(xiàn)分離,表明本試驗(yàn)所用樣本生物學(xué)重復(fù)性較好,且樣本的分組也較為合理。

    圖 3 差異表達(dá)基因熱圖聚類(lèi)分析Fig. 3 Heat map of differentially expressed genes

    為進(jìn)一步了解每個(gè)差異表達(dá)基因的功能,通過(guò)En-semble、NCBI 以及Uniprot 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異表達(dá)基因進(jìn)行綜合注釋?zhuān)@得差異表達(dá)基因的詳細(xì)描述信息。篩選泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前后肝臟組織差異基因表達(dá)最顯著的TOP10 基因進(jìn)行說(shuō)明,結(jié)果見(jiàn)表4。為檢驗(yàn)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)篩選出的差異表達(dá)基因的表達(dá)量是否準(zhǔn)確,隨機(jī)篩選上述10 個(gè)差異表達(dá)基因中的CHRNA9、SLC13A5、MRAP、EPSTI1和TLDC2等5 個(gè)基因,并以β-actin為內(nèi)參基因來(lái)進(jìn)行qRT-PCR驗(yàn)證。qRTPCR 結(jié)果顯示,上述5 個(gè)基因的表達(dá)規(guī)律與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的表達(dá)規(guī)律基本一致。所以轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果可信,可繼續(xù)進(jìn)行后續(xù)數(shù)據(jù)分析(圖4)。

    圖 4 開(kāi)產(chǎn)前后泰州鵝肝臟組織相關(guān)基因表達(dá)檢測(cè)Fig. 4 Expressions of related genes in liver of Taizhou geese before and after start of egg-laying

    表 3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與參考基因組比對(duì)結(jié)果統(tǒng)計(jì)Table 3 Results of clean reads on sample vs. reference genome

    2.4 差異基因GO 功能富集分析

    為進(jìn)一步了解差異表達(dá)基因的功能,通過(guò)GO(Gene Ontology,基因本體)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)篩選到的差異表達(dá)基因進(jìn)行基因功能富集分類(lèi),包括細(xì)胞組分(Cellular component,CC)、生物過(guò)程(Biological process,BP)以及分子功能(Molecular function,MF)3 個(gè)方面(圖5)。202 個(gè)顯著差異基因進(jìn)行GO 功能注釋后,上述3 個(gè)功能分別被區(qū)分為5、18 和9 個(gè)功能亞類(lèi),共計(jì)42 個(gè)類(lèi)別,詳情如圖4 所示。在CC 功能中,兩組間的差異表達(dá)基因在細(xì)胞結(jié)構(gòu)(Cell part)與膜結(jié)構(gòu)(Membrane part)中所占比例最大;在BP 功能中,細(xì)胞過(guò)程(Cellular process)與生物調(diào)控(Biological regulation)富集到的差異基因數(shù)目最多。在MF 功能中,差異基因在結(jié)合功能(Binding)中所占的比例最高,催化活性(Catalytic activity)次之。

    表 4 泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前、后肝臟組織上調(diào)/下調(diào)差異最大的前10 位基因Table 4 Top 10 upregulated and downregulated genes in Taizhou geese before and after start of egg-laying

    2.5 差異基因KEGG 通路注釋

    為深入解析差異基因在泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前、后肝臟細(xì)胞活動(dòng)過(guò)程中的作用,通過(guò)KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,京都基因與基因組百科全書(shū))的信號(hào)通路數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)篩選獲得的差異基因進(jìn)行通路注釋分析(P≤0.05),共獲得202 個(gè)差異表達(dá)基因富集的信號(hào)通路,以差異富集值(Rich ratio≥1)進(jìn)行篩選,共獲得顯著性富集的63 條差異信號(hào)通路(圖6),文中列舉出富集后最顯著的前5 個(gè)通路以作示例說(shuō)明(表5),包括:藥物代謝-細(xì)胞色素P450(Drug metabolism-cytochrome P450)信號(hào)通路、氮代謝(Nitrogen metabolism)信號(hào)通路、戊糖和葡萄糖醛酸相互轉(zhuǎn)化(Pentose and glucuronate interconversion)信號(hào)通路、視黃醇代謝(Retinol metabolism)信號(hào)通路以及類(lèi)固醇激素生物合成(Steroid hormone biosynthesis)信號(hào)通路。

    表 5 泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前、后肝臟組織富集顯著性最顯著的前5 條通路Table 5 Top 5 enriched pathways in liver of Taizhou geese before and after start of egg-laying

    圖 5 差異表達(dá)基因GO 注釋Fig. 5 GO annotation on differentially expressed genes

    圖 6 KEGG 富集分析Fig. 6 KEGG enrichment on differentially expressed genes

    3 討論與結(jié)論

    肝臟是禽類(lèi)脂質(zhì)合成的主要場(chǎng)所,約有超過(guò)90% 的脂肪是在禽類(lèi)肝臟中合成的[19]。在性成熟時(shí),家禽的肝臟會(huì)發(fā)生許多代謝活動(dòng)以支持卵黃發(fā)生;在產(chǎn)蛋時(shí)期,家禽的肝臟脂質(zhì)代謝活動(dòng)會(huì)變得極為活躍,主要合成分泌極低密度脂蛋白(Very low density lipoprotein y, VLDLy)、 中 密 度 脂 蛋 白(Intermediate density lipoprotein, IDL)以及低密度脂蛋 白(Low density lipoprotein, LDL)[20?22]。其 中,VLDLy 可以直接到達(dá)卵母細(xì)胞的質(zhì)膜中,通過(guò)膜上受體介導(dǎo)的內(nèi)吞作用進(jìn)入到卵母細(xì)胞,最終被卵母細(xì)胞吸收沉積,形成卵黃[23]。除此之外,肝臟也是生物機(jī)體最大、功能較多的腺體器官,參與膽汁分泌、激素合成等多項(xiàng)生理活動(dòng)[24]。

    轉(zhuǎn)錄組測(cè)序簡(jiǎn)稱(chēng)為RNA-Seq 技術(shù),主要研究某一時(shí)間段內(nèi)特定細(xì)胞在一種功能狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄出的所有RNA 的總和,是研究基因遺傳圖譜以及蛋白質(zhì)生物信息功能的重要方法[18]。本研究通過(guò)RNA-Seq 技術(shù)對(duì)開(kāi)產(chǎn)前、后的泰州鵝肝臟組織進(jìn)行了差異表達(dá)基因篩選,并對(duì)其中的5 個(gè)基因進(jìn)行了qRT-PCR 驗(yàn)證。上述篩選并驗(yàn)證的基因中,部分基因已有相關(guān)報(bào)道表明參與肝臟的脂質(zhì)代謝過(guò)程。黑皮質(zhì)素受體輔助蛋白(Melanocortin receptor accessory protein,MRAP)屬于G 蛋白偶聯(lián)受體家族中的一員,是一種含有跨膜域的小蛋白,影響著動(dòng)物的生長(zhǎng)、發(fā)育和代謝過(guò)程[25]。雌激素與雞肝臟脂肪代謝過(guò)程密切相關(guān),任俊曉等[26]研究表明,雞肝臟中MRAP 的表達(dá)受到雌激素的調(diào)控,是雌激素在肝臟的重要靶基因之一。SLC13A5(Solute carrier family 13 member 5)是溶質(zhì)載體家族成員,是一種鈉偶聯(lián)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,可介導(dǎo)細(xì)胞對(duì)檸檬酸的吸收,從而脂肪酸和膽固醇合成中發(fā)揮著重要作用[27],小鼠SLC13A5 基因的敲除可有效抑制肝臟脂質(zhì)的從頭合成過(guò)程[28]。

    在qRT-PCR 驗(yàn)證確保了測(cè)序結(jié)果可靠性的基礎(chǔ)上,本試驗(yàn)結(jié)合GO 數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異基因主要參與的生物學(xué)過(guò)程進(jìn)行了分類(lèi),發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)基因主要參與細(xì)胞結(jié)構(gòu)、細(xì)胞過(guò)程以及結(jié)合功能等生物學(xué)過(guò)程。泰州鵝的開(kāi)產(chǎn)意味著其已經(jīng)開(kāi)始性成熟并發(fā)生著其他重要的生理變化,肝臟是性成熟的重要因素。本試驗(yàn)通過(guò)差異基因GO 富集得到42 個(gè)生物學(xué)功能,綜合分布于細(xì)胞組分、生物過(guò)程以及分子功能3 個(gè)亞類(lèi),由此可以看出,開(kāi)產(chǎn)后泰州鵝的肝臟在生殖激素的刺激下發(fā)生了許多生理性和代謝變化,以適應(yīng)自身生殖功能(產(chǎn)蛋)的需求。其中,生物過(guò)程中富集到了生殖過(guò)程與泰州鵝的產(chǎn)蛋性能密切相關(guān),其在肝臟中的調(diào)控機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

    為進(jìn)一步分析差異表達(dá)基因功能,本試驗(yàn)繼續(xù)結(jié)合KEGG 富集分析,篩選出65 個(gè)差異表達(dá)基因顯著富集的信號(hào)通路,列舉富集后最顯著的前5 個(gè)通路,包括藥物代謝-細(xì)胞色素P450 信號(hào)通路、氮代謝信號(hào)通路、戊糖和葡萄糖醛酸相互轉(zhuǎn)化信號(hào)通路、視黃醇代謝信號(hào)通路以及類(lèi)固醇激素生物合成信號(hào)通路。其中,視黃醇代謝信號(hào)通路參與胚胎發(fā)育、細(xì)胞增殖和分化、生殖生理等過(guò)程。視黃醇是維生素A 的活性衍生物,視黃醇在體內(nèi)被進(jìn)一步氧化為視黃酸(Retinoic Acid, RA)[29],在生物機(jī)體細(xì)胞內(nèi)擴(kuò)散并到達(dá)細(xì)胞核,組織中RA 的表達(dá)水平與視黃酸代謝酶細(xì)胞色素P450 密切相關(guān)[30],進(jìn)一步表明RA 影響畜禽的生殖系統(tǒng)功能,尤其在減數(shù)分裂啟動(dòng)和性別分化中起到重要作用[31]。本試驗(yàn)篩選出的Top 5 信號(hào)通路中同時(shí)包含了藥物代謝-細(xì)胞色素P450 信號(hào)通路和視黃醇代謝信號(hào)通路,表明在泰州鵝的開(kāi)產(chǎn)期,上述2 條通路可能在肝臟中發(fā)揮著協(xié)同作用,是否參與此階段泰州鵝的生殖調(diào)控過(guò)程還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。類(lèi)固醇激素包括雌二醇、睪酮、黃體酮等,脂肪水解形成的膽固醇是類(lèi)固醇激素形成的原材料,有研究表明類(lèi)固醇激素能通過(guò)黃體類(lèi)固醇激素受體直接參與生殖系統(tǒng)功能調(diào)節(jié)過(guò)程[32],可以調(diào)控卵泡生長(zhǎng),包括排卵前卵泡的發(fā)育和排卵[5],這些功能也應(yīng)征了本試驗(yàn)篩選出的類(lèi)固醇激素生物合成信號(hào)通路。綜上所述,參與泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前后肝臟組織脂質(zhì)代謝以及生殖過(guò)程相關(guān)的信號(hào)通路相互交織,組成了一個(gè)龐大復(fù)雜的細(xì)胞信號(hào)傳導(dǎo)網(wǎng)絡(luò),其具體的功能和調(diào)節(jié)機(jī)制有待進(jìn)一步研究。

    本試驗(yàn)選取開(kāi)產(chǎn)前、后泰州鵝肝臟組織進(jìn)行RNA-Seq 測(cè)序分析,初步篩選出10 個(gè)差異表達(dá)基因以及5 條信號(hào)通路,可能參與泰州鵝開(kāi)產(chǎn)前后肝臟的脂質(zhì)代謝以及生殖過(guò)程調(diào)控。試驗(yàn)結(jié)果豐富了與泰州鵝開(kāi)產(chǎn)相關(guān)的肝臟組織功能分析,為進(jìn)一步研究泰州鵝肝臟的產(chǎn)蛋調(diào)控以及加速泰州鵝地方種群的進(jìn)一步選育提供了新的數(shù)據(jù)支撐。

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