王煦
自2020年年初新型冠狀病毒導(dǎo)致的肺炎在國內(nèi)暴發(fā)以來,感染人數(shù)不斷上升。2020年3月11日,世界衛(wèi)生組織總干事譚德塞在日內(nèi)瓦記者會(huì)上宣布,此次由新型冠狀病毒導(dǎo)致的疫情具有大流行病的特征[1]。 截至2020年3月16日,各國累計(jì)確診病例中,排名前四的國家為:中國81062例,意大利21270例,伊朗13938例,韓國8162例[2]。目前,我國感染新型冠狀病毒的人數(shù)新增量在不斷減少,但是對(duì)于其他國家來說,形勢(shì)依然十分嚴(yán)峻。
3月4日,國家衛(wèi)健委印發(fā)新型冠狀病毒肺炎診療方案(試行第七版)[3],此診療方案中提到,疑似病例的確診標(biāo)準(zhǔn)之一為實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,反轉(zhuǎn)錄·聚合酶鏈反應(yīng))檢測(cè)新型冠狀病毒核酸陽性。但是,這個(gè)被稱為“金標(biāo)準(zhǔn)”的實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)技術(shù)在臨床應(yīng)用中卻被報(bào)道存在假陰性,即被檢測(cè)者已經(jīng)感染了新型冠狀病毒,但是檢測(cè)不出病毒核酸。
實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR,很多沒有醫(yī)學(xué)、生物背景的朋友初次聽到這個(gè)名字也許會(huì)十分疑惑,什么是核酸?什么是實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR?為什么被稱為“金標(biāo)準(zhǔn)”的RT-PCR檢測(cè)技術(shù)在臨床實(shí)踐過程中并不能100%檢測(cè)出新型冠狀病毒?下面為大家一一解答。
什么是核酸
核酸,簡(jiǎn)單來講就是遺傳物質(zhì),一種能夠傳遞遺傳信息的物質(zhì),通常由親代傳給子代,能夠控制子代的生長(zhǎng)發(fā)育。一般來說,不同的生物所攜帶的遺傳信息都是獨(dú)特的(同卵雙胞胎除外)。遺傳物質(zhì)分為DNA(脫氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸),大多數(shù)病毒的遺傳物質(zhì)都為RNA。以新型冠狀病毒為例,此病毒的核酸就是RNA,其RNA由四種不同核糖核苷酸排列組成,因?yàn)榕帕械捻樞蛞约八煌N類核糖核苷酸的數(shù)量不同,使得新型冠狀病毒的RNA與其他RNA病毒的RNA有所不同。實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù)就是利用新型冠狀病毒所具有的獨(dú)特RNA,對(duì)其進(jìn)行特異性檢測(cè)。
實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù)原理
實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR是將實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)和RT-PCR技術(shù)相結(jié)合[4],首先,采用RT-PCR技術(shù),使新型冠狀病毒的RNA逆轉(zhuǎn)錄DNA;然后,用DNA作為模板,采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)DNA進(jìn)行擴(kuò)增[5];同時(shí),使用探針(目前的試劑盒主要使用的是Taq Man探針1)與對(duì)應(yīng)的核酸片段進(jìn)行結(jié)合,結(jié)合在核酸片段上的探針在特殊的外切酶活性作用下發(fā)生水解,產(chǎn)生熒光。隨著DNA片段的不斷擴(kuò)增,熒光信號(hào)不斷增強(qiáng),DNA的數(shù)量以熒光信號(hào)的形式間接地被相關(guān)儀器記錄。最后,根據(jù)熒光信號(hào)與擴(kuò)增循環(huán)數(shù)之間的關(guān)系可以繪制出實(shí)時(shí)擴(kuò)增曲線,從而檢測(cè)出標(biāo)本中是否含有新型冠狀病毒核酸[6-7]。
通俗來講,新型冠狀病毒與實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR的關(guān)系就是,新型冠狀病毒的RNA可以看成它的身份證,而實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中的引物并不能直接識(shí)別這種身份證上的信息,所以當(dāng)我們從患者標(biāo)本中獲取到RNA時(shí),首先需要采用RT-PCR對(duì)身份證的信息進(jìn)行翻譯轉(zhuǎn)換,將病毒的RNA逆轉(zhuǎn)錄為DNA,使其病毒信息能夠被實(shí)時(shí)熒光定量PCR的引物和探針識(shí)別。但是,我們從原始標(biāo)本獲得的RNA太少,低于了儀器檢測(cè)的下限,所以,我們首先要對(duì)獲得的信息進(jìn)行復(fù)制擴(kuò)增,在擴(kuò)增的同時(shí)將這些信息打上標(biāo)簽(探針),而被打上的標(biāo)簽在一定作用下(特定酶水解作用)可以發(fā)出熒光,被儀器檢測(cè)到,這樣就可以通過檢測(cè)病毒核酸的存在來間接證實(shí)病毒的存在。
“金標(biāo)準(zhǔn)”為何“失效”
根據(jù)上述原理可知,新型冠狀病毒的核酸檢測(cè)與很多因素相關(guān)。采用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù)而得到假陰性結(jié)果(即已經(jīng)是感染者,但檢測(cè)不出病毒核酸)的原因主要有兩點(diǎn)[8]。
第一個(gè)原因是原始標(biāo)本中的RNA含量太低,低于了實(shí)時(shí)熒光定量PCR的檢測(cè)下限,使得病毒核酸無法得到有效擴(kuò)增,從而無法產(chǎn)生足夠的熒光信號(hào)而導(dǎo)致檢測(cè)結(jié)果為陰性。
這與標(biāo)本的取材、患者感染的時(shí)間以及取到標(biāo)本后檢測(cè)的時(shí)間都有關(guān)系。受病毒感染機(jī)制影響,不同組織來源的標(biāo)本病毒核酸含量差異較大。研究顯示,新型冠狀病毒更趨向于結(jié)合肺泡上皮細(xì)胞,因此,理論上來說,感染者下呼吸道標(biāo)本病毒核酸檢測(cè)準(zhǔn)確率會(huì)比上呼吸道標(biāo)本的更高?;颊吒腥镜臅r(shí)間也是一個(gè)重要因素。病毒在侵入人體細(xì)胞之后需要時(shí)間去繁殖,如果是早期患者的標(biāo)本,病毒剛剛?cè)肭旨?xì)胞,沒有足夠的時(shí)間復(fù)制,細(xì)胞中也就沒有那么多病毒核酸。此外,這次感染的人數(shù)眾多,人力、物力都十分有限,很多患者標(biāo)本在取到后都來不及及時(shí)檢測(cè),在等待檢測(cè)的時(shí)間里,病毒RNA會(huì)有一定程度的分解,這也導(dǎo)致了原始病毒的核酸過低。
第二個(gè)原因是在原理中提到的探針結(jié)合,在實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)中,探針能夠特異性結(jié)合到病毒核酸片段上,在酶的參與作用下發(fā)出熒光信號(hào),從而間接反映病毒核酸的存在。但是,如果探針結(jié)合的病毒核酸部位發(fā)生變異,可能會(huì)影響探針的結(jié)合效率,導(dǎo)致熒光信號(hào)檢測(cè)不到,而出現(xiàn)假陰性的結(jié)果。
此外,假陰性的發(fā)生也跟此技術(shù)本身的靈敏度有關(guān),此次新型冠狀病毒肺炎暴發(fā)得太突然,目前,應(yīng)用于臨床的試劑盒并不成熟,靈敏度還不夠。
多方面改善假陰性問題
針對(duì)上述假陰性問題,國家正從各方面努力進(jìn)行改善。比如,標(biāo)本質(zhì)量不好,國家衛(wèi)健委公布的第六版新型冠狀病毒肺炎診療方案[9]指出需要全面規(guī)范采樣,在這之后,公開報(bào)道的假陰性患者數(shù)量明顯減少;比如,試劑盒不夠靈敏,國內(nèi)各個(gè)醫(yī)院、研究機(jī)構(gòu)正在不斷努力,已經(jīng)研發(fā)出了一些新的核酸檢測(cè)試劑盒。四川大學(xué)華西醫(yī)院成功研發(fā)出了多款新型冠狀病毒檢測(cè)試劑盒,有兩項(xiàng)已經(jīng)進(jìn)入臨床驗(yàn)證階段。2020年3月,新型冠狀病毒引起的肺炎在中國已經(jīng)初步得到了控制,相信在不久的將來,一切都會(huì)恢復(fù)正常。
參考文獻(xiàn)
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[8] 高維寅,張洪,羅陽.新型冠狀病毒肺炎核酸檢測(cè)中的假陰性分析及對(duì)策~(*)[J/OL].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志:1-8[2020-03-17]. http://kns.cnki.net/kcms/detail/50.1176.R.20200304.1030.004.html.
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