李琳,喻超,潘耀振,陳玲,鄧路,雷林翰,孫誠(chéng)誼*
(貴州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院 肝膽外科,貴州醫(yī)科大學(xué) 肝膽胰脾重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,貴州省肝膽胰脾疾病研究所,貴州 貴陽(yáng) 550004)
胰腺癌(pancreatic cancer,PC)是世界上最常見(jiàn)的癌癥之一,中位生存期僅3~6個(gè)月,5年生存率不到5%[1]。盡管手術(shù)技術(shù)方法和輔助藥物治療取得了長(zhǎng)足的進(jìn)步,但過(guò)去40年中關(guān)于PC的預(yù)后沒(méi)有明顯改變,死亡率接近發(fā)病率[2]。PC的高致死率主要源于其生物學(xué)行為,早期轉(zhuǎn)移且缺乏早期發(fā)現(xiàn)的標(biāo)志物等特性都導(dǎo)致PC在發(fā)生早期很難被發(fā)現(xiàn)[3],因此發(fā)掘早期診斷的標(biāo)志物對(duì)于PC的診斷和治療至關(guān)重要[4]?;|(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMPs)是能夠降解幾乎所有類(lèi)型細(xì)胞外基質(zhì)的酶,它們?cè)谏磉^(guò)程中發(fā)揮著廣泛的作用,例如癌癥進(jìn)展等[5]。已有研究表明基質(zhì)金屬蛋白酶28(matrix metalloproteinase 28,MMP28)可能參與癌癥的發(fā)生發(fā)展,并且與癌癥的轉(zhuǎn)移機(jī)制相關(guān)[6-7]。磷酸肌醇3-激酶(phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑是人類(lèi)癌癥中最常改變的途徑之一,在驅(qū)動(dòng)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用[8-10]。PI3K信號(hào)級(jí)聯(lián)反應(yīng)的過(guò)度激活是人類(lèi)癌癥中最常見(jiàn)的反應(yīng)之一,在細(xì)胞內(nèi)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)對(duì)細(xì)胞外刺激物的響應(yīng)起關(guān)鍵協(xié)調(diào)作用[11],但目前有關(guān)MMP28在PC中的作用和機(jī)制研究還比較缺乏。本文通過(guò)對(duì)MMP28進(jìn)行生物信息學(xué)分析,觀察可能生物學(xué)過(guò)程及其通路,并通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量核酸擴(kuò)增檢測(cè)系統(tǒng)(real-time quantitative PCR detecting system,qPCR)和免疫印跡實(shí)驗(yàn)(Western blot)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證MMP28在PC細(xì)胞中的作用與機(jī)制,報(bào)告如下。
1.1材料
1.1.1細(xì)胞株與主要試劑 人PC細(xì)胞株P(guān)ANC-1細(xì)胞為中山大學(xué)腫瘤防治中心惠贈(zèng),胎牛血清(fatal bovine serun,F(xiàn)BS)、胰蛋白酶及培養(yǎng)基(dulbecco's modified eagle medium, DMEM)購(gòu)自美國(guó)Gibco公司,RNA提取試劑Trizol購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司,B淋巴細(xì)胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,BCL2)、叉頭框轉(zhuǎn)錄因子1(forkhead box O1,F(xiàn)OXO1)和細(xì)胞程序性細(xì)胞死亡因子4(programmed cell death 4,PDCD4)引物購(gòu)自上海生工生物工程公司,相應(yīng)WB一抗購(gòu)自美國(guó)proteintech公司,MMP28轉(zhuǎn)染試劑(包括MMP28對(duì)照試劑、MMP28下調(diào)試劑及MMP28上調(diào)試劑)購(gòu)自廣州銳博生物公司,逆轉(zhuǎn)錄試劑盒和SYBR Premix ExTaq試劑盒均購(gòu)自日本TaKaRa公司。
1.1.2主要儀器 CFX96 Bio-Rad熒光定量PCR儀購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司,ChemiDocTMTouch bio-rad化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司。
1.2方法
1.2.1生物信息學(xué)分析 利用cBioPortal網(wǎng)站在線分析TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.cbioportal.org/),選擇胰腺導(dǎo)管腺癌數(shù)據(jù)庫(kù)PAAD,數(shù)據(jù)類(lèi)型選擇mRNA表達(dá)譜,根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果,選取與MMP28相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較大(Person系數(shù)>0.5)的基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析。GO富集分析包括與MMP28相關(guān)的細(xì)胞組成(cellular component,CC)分析、生物過(guò)程(biological process,BP)分析及分子功能(molecular function,MF)分析,KEGG富集分析與MMP28相關(guān)的通路分析,并通過(guò)GEPIA網(wǎng)站(http://gepia.cancer-pku.cn/)分析MMP28與其互作基因之間的關(guān)系。
1.2.2細(xì)胞培養(yǎng)及分組 PANC-1細(xì)胞培養(yǎng)于10%FBS的DMEM培養(yǎng)基、37 ℃的5%CO2恒溫恒濕培養(yǎng)箱,將PANC-1細(xì)胞消化鋪于培養(yǎng)瓶中、105個(gè)細(xì)胞/瓶;鋪板6 h后,將細(xì)胞分為MMP28對(duì)照組(NC組,給與MMP28對(duì)照試劑)、MMP28下調(diào)組(si-MMP28組,給與MMP28下調(diào)試劑)及MMP28上調(diào)組(U-MMP28組,給與MMP28上調(diào)試劑),待48 h后取細(xì)胞進(jìn)行其他實(shí)驗(yàn)。
1.2.3qPCR檢測(cè)BCL2、FOXO1及PDCD4 mRNA的表達(dá) 選擇各組處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的PANC-1細(xì)胞,提取總RNA,依照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒的說(shuō)明分別將樣品逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,再選擇GAPDH作為內(nèi)參,使用SYBR Premix ExTaq試劑盒進(jìn)行qPCR實(shí)驗(yàn)以檢測(cè)BCL2、FOXO1及PDCD4 mRNA的表達(dá)。
1.2.4Western blot檢測(cè)Akt和磷酸化蛋白激酶B(phosphorylase protein kinase B,p-Akt)的蛋白表達(dá) 選擇各組處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的PANC-1細(xì)胞,提取細(xì)胞總蛋白,根據(jù)蛋白定量結(jié)果進(jìn)行電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉、孵一抗、洗膜、孵二抗、洗膜及曝光,用Image Lab軟件分析所得條帶的灰度值,檢測(cè)Akt和p-Akt的蛋白表達(dá)量。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.1MMP28的生物學(xué)功能
根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果選取與MMP28相關(guān)的基因中相關(guān)系數(shù)較大(P>0.5)的基因進(jìn)行GO富集分析,CC結(jié)果顯示MMP28與細(xì)胞外泌體、膜轉(zhuǎn)運(yùn)及細(xì)胞黏附功能相關(guān)(圖1A);BP結(jié)果顯示MMP28可能與細(xì)胞黏附、細(xì)胞與細(xì)胞間黏附及表皮發(fā)生發(fā)展相關(guān)(圖1B);MF結(jié)果顯示MMP28可能與Ca2+結(jié)合及結(jié)構(gòu)分子活性相關(guān)(圖1C)。
2.2MMP28的信號(hào)通路
根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)分析結(jié)果,選取與MMP28相關(guān)的信號(hào)通路中相關(guān)性前10的信號(hào)通路進(jìn)行分析,結(jié)果顯示MMP28可能參與多種和癌癥發(fā)生發(fā)展相關(guān)的信號(hào)通路,包括黏著斑信號(hào)通路和PI3K-Akt信號(hào)通路。見(jiàn)圖2。
注:A為與MMP28相關(guān)的細(xì)胞組分圖,B為與MMP28相關(guān)的分子功能圖,C為與MMP28相關(guān)的生物學(xué)過(guò)程圖。
圖2 生物信息學(xué)分析MMP28的信號(hào)通路
2.3MMP28對(duì)PI3K-Akt信號(hào)通路的影響
通過(guò)GEPIA網(wǎng)站分析結(jié)果顯示,MMP28與BCL2、FOXO1及PDCD4等信號(hào)分子呈負(fù)相關(guān)關(guān)系(圖3A、3B及3C);qPCR結(jié)果表明,與NC組相比,si-MMP28組PANC-1細(xì)胞的BCL2、FOXO1及PDCD4 mRNA表達(dá)水平上調(diào),U-MMP28組PANC-1細(xì)胞BCL2、FOXO1及PDCD4表達(dá)水平下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05,圖3D)。
注:A、B、C分別為MMP28與BCL2、FOXO1、PDCD4表達(dá)的關(guān)系,D為3種基因表達(dá)的直條圖;(1)與NC組比較,P<0.05。
2.4MMP28對(duì)PI3K-Akt信號(hào)通路活性的影響
與NC組比較,si-MMP28組PANC-1細(xì)胞的p-Akt蛋白表達(dá)水平上調(diào),U-MMP28組PANC-1細(xì)胞的p-Akt蛋白表達(dá)水平下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖4。
注:(1)與NC組比較,P<0.05。
PC因其極高的病死率一直是醫(yī)學(xué)研究攻克的一個(gè)難點(diǎn),無(wú)論是早期診斷、治療,提高患者的生存時(shí)間和生存質(zhì)量都是學(xué)者們持續(xù)研究的目標(biāo)[12-14]。目前已有大量研究探索PC的發(fā)生機(jī)制并力圖找到可應(yīng)用的靶點(diǎn)[15-16]。本研究為了探索MMP28在PC中的作用機(jī)制,首先通過(guò)富集分析MMP28在PC中可能有關(guān)的細(xì)胞成分、生物學(xué)過(guò)程和分子功能,分析結(jié)果可以看出MMP28與膜轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān);與細(xì)胞黏附功能也相關(guān);與結(jié)構(gòu)分子活性相關(guān),經(jīng)過(guò)系統(tǒng)分析表明MMP28應(yīng)參與PC的侵襲轉(zhuǎn)移過(guò)程。通過(guò)對(duì)MMP28的進(jìn)一步分析,發(fā)現(xiàn)已有研究表明MMP28可作為胃癌侵襲轉(zhuǎn)移的獨(dú)立預(yù)后標(biāo)志物[6]。進(jìn)一步富集分析發(fā)現(xiàn)MMP28可能參與的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,發(fā)現(xiàn)MMP28可能參與與PI3K-Akt轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。PI3K-Akt轉(zhuǎn)導(dǎo)通路是在癌癥發(fā)生發(fā)展過(guò)程中極其重要的一個(gè)通路[17-19]。Wei等[20]通過(guò)研究表明可以部分通過(guò)PI3K/Akt/mTOR和PI3K/Akt/GSK-3β信號(hào)通路調(diào)節(jié)PI3K的活性以促進(jìn)自噬并抑制上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化。Yang等[21]研究發(fā)現(xiàn)用4-甲基亞磺酰基-3-丁烯基異硫氰酸酯處理的肺癌細(xì)胞表現(xiàn)出對(duì)PI3K-Akt信號(hào)通路的顯著抑制;Wang等[22]發(fā)現(xiàn)SOX9/miR-203a軸對(duì)PI3K/Akt途徑的激活作用及其在癌癥中的作用。這些都表明PI3K-Akt信號(hào)通路是癌癥的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中及其重要的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。
為探索MMP28是否參與PI3K/Akt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,首先在GEPIA網(wǎng)站中搜索MMP28與之相關(guān)的PI3K信號(hào)通路上的信號(hào)分子,結(jié)果顯示MMP28與BCL2、FOXO1及PDCD4等信號(hào)分子呈負(fù)相關(guān)關(guān)系,而B(niǎo)CL2、FOXO1及PDCD4都參與PI3K-Akt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路[23-26]。進(jìn)而通過(guò)檢測(cè)3組PANC-1細(xì)胞中的BCL2、FOXO1及PDCD4表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)與前面分析的結(jié)果相同,MMP28與BCL2、FOXO1及PDCD4等信號(hào)分子呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。為進(jìn)一步驗(yàn)證MMP28參與PI3K-Akt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,通過(guò)WB來(lái)驗(yàn)證Akt和p-Akt在不同分組中的表達(dá)情況,結(jié)果表明3組PANC-1細(xì)胞Akt的蛋白表達(dá)基本相同,p-Akt的蛋白表達(dá)則不同。與NC組相比,U-MMP28組PANC-1細(xì)胞p-Akt的表達(dá)減少,si-MMP28組PANC-1細(xì)胞p-Akt的表達(dá)增加,這表明MMP28與Akt的激活相關(guān),參與PI3K-Akt信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,也表明了MMP28可能與癌癥的增殖、分化及凋亡等相關(guān)。
綜上所述,本研究通過(guò)生物信息學(xué)分析并結(jié)合相關(guān)實(shí)驗(yàn)表明MMP28在PC細(xì)胞相關(guān)腫瘤信號(hào)通路PI3K-Akt信號(hào)通路的激活過(guò)程中發(fā)揮重要作用,MMP28通過(guò)調(diào)控該通路中Akt的磷酸化水平,進(jìn)而調(diào)控下游靶基因的表達(dá),但是相關(guān)機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。
貴州醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2020年6期