姚靜 龐劍月 何瑾 馮婷婷 張淑綺 李恒芬
遺傳是重性抑郁癥(major depressive disorder,MDD)發(fā)病的因素之一,但至今仍缺乏MDD相關(guān)功能基因突變的定位或可用于臨床的分子遺傳學(xué)標(biāo)記[1-3]。究其原因,除與影響功能基因蛋白表達(dá)的因素有關(guān)外,還與MDD表型異質(zhì)性及遺傳數(shù)據(jù)分析方法等有關(guān)[4-5]。既往研究發(fā)現(xiàn),反復(fù)發(fā)作抑郁癥 (recurrent major depressive disorder,RMDD)患者似乎存在更高的遺傳傾向及復(fù)雜的臨床表征[6-7]。5-羥色胺 1A 受體(5-hydroxytryptamine 1A receptor,5-HTR1A)和 5-羥色胺 2A受體(5-hydroxtryptamine 2A receptor,5-HTR2A)相關(guān)藥物臨床效應(yīng)已揭示其與MDD關(guān)系密切,但有關(guān)兩者基因多態(tài)性研究的結(jié)果多不一致[8-9]。標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性(tagging single nucleotide polymorphisms,tagSNPs)是第三代遺傳學(xué)標(biāo)記,利用tagSNPs探討基因與疾病的關(guān)系,可大大縮小具有功能意義基因區(qū)域的尋找范圍[10]。本研究納入RMDD患者,結(jié)合有關(guān)5-HTR1A和5-HTR2A基因的文獻(xiàn)及數(shù)據(jù)庫,選取高連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD)值傾向的tagSNPs位點,探討RMDD與其關(guān)系,尋找RMDD的分子遺傳學(xué)標(biāo)記。
1.1 研究對象 病例組來自2005年11月至2017年5月(隨訪截點)鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院和新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院門診或住院的RMDD患者。納入標(biāo)準(zhǔn):①符合《美國精神障礙診斷與統(tǒng)計手冊第四版》(Diagnostic and Statistical Manual of Mental Disorders,F(xiàn)ourth Edition,DSM-IV)中重性抑郁障礙,反復(fù)發(fā)作的診斷標(biāo)準(zhǔn);②24項漢密爾頓抑郁量表 (24-item Hamilton depression rating scale,HAMD-24)總分≥21分;③漢族;④年齡 18~65歲,性別不限;⑤隨訪3年以上。排除標(biāo)準(zhǔn):①有腦器質(zhì)性精神障礙或其他精神障礙病史;②有遺傳性疾病家族史;③有精神發(fā)育遲滯或癡呆者;④有精神活性物質(zhì)濫用史。共納入1030例患者。
對照組來自2005年11月至2017年5月鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院、新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院和河南科技學(xué)院校醫(yī)院體檢科的健康體檢者。納入標(biāo)準(zhǔn):①無精神障礙病史;②HAMD-24總分<7分;③漢族;④年齡18~65歲,性別不限。排除標(biāo)準(zhǔn):①有遺傳性疾病家族史;②有精神發(fā)育遲滯或癡呆者;③有精神活性物質(zhì)濫用史。共納入851名對照。
本研究經(jīng)鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)。所有參與者均簽署知情同意書。
1.2 研究方法
1.2.1 臨床資料收集 采用自編人口學(xué)資料問卷收集受試者社會人口學(xué)資料,包括姓名、性別、年齡、民族、婚姻狀況、工作狀況、受教育程度等。病例組診斷由接受過DSM-Ⅳ疾病結(jié)構(gòu)式臨床訪談[11](Structured Clinical Interview for the DSM-Ⅳ AxisⅠ Disorders,SCID-I)培訓(xùn)的2名高年資精神科醫(yī)師 (主任醫(yī)師或副主任醫(yī)師)做出。入組受試者HAMD-24評估由2名研究員共同完成,先后共8名研究員,均接受過量表培訓(xùn),并通過一致性檢驗(Kappa為0.87~0.95)。采用面談和電話相結(jié)合的方式進(jìn)行跟蹤隨訪,隨訪內(nèi)容包括病情變化、年發(fā)作頻次、用藥情況以及療效等,每年隨訪4次以上,隨訪3年以上診斷仍未變更者納入本研究病例組。
1.2.2 DNA樣本采集 所有受試者入組后采集靜脈血5 mL于乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝管中,-70℃保存待測。使用TIANGEN公司的DP348-3全血基因組DNA純化試劑盒成批提取受試者DNA,于-20℃中保存。
1.2.3 tagSNPs篩選及檢測 根據(jù)NCBI和NHGRI聯(lián)合構(gòu)建的dbSNP數(shù)據(jù)庫(Hapmap Data Rel28PhaseⅡ+Ⅲ,August10,onNCBI B36 assembly,dbSNPb126-CHB+JPT數(shù)據(jù))初步選擇tagSNPs位點,設(shè)置條件為r2>0.8,最小等位基因頻率(minor allele frequency,MAF)>0.001,最終選擇 5-HTR1A(rs878567) 和 5-HTR2A(rs1328683、rs17068986、rs9534495)的4個 tagSNPs。在 384孔板中用Sequenom質(zhì)譜分析(北京京虹匯盛科技有限公司質(zhì)譜儀)進(jìn)行tagSNPs位點基因分型檢測。
1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 22.0對一般資料進(jìn)行統(tǒng)計分析,使用檢驗進(jìn)行Hardy-Weinberg平衡(H-W平衡)檢驗。利用SHEsis軟件,采用檢驗對基因型和等位基因頻率分布進(jìn)行組間比較,計算比值比(odds ratio,OR)和95%可信區(qū)間(confidence intervals,CI)。采用 SNPstats 軟件,使用非條件logistic回歸分析單位點基因型與疾病關(guān)聯(lián),根據(jù)阿凱克信息準(zhǔn)則 (Akaike information criteria,AIC)選擇最佳模型,即AIC值越小模型越準(zhǔn)確,統(tǒng)計結(jié)果均采用Bonferroni校正,檢驗水準(zhǔn)α=0.0125(0.05/4)。采用廣義多因子降維法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)BetaV0.7軟件包分析基因—基因交互作用。校正年齡和性別兩個協(xié)變量后,基于交叉驗證一致性和檢驗精確度選擇最佳基因—基因交互模型。檢驗水準(zhǔn)α=0.05。
2.1 社會人口學(xué)資料及臨床特征 病例組1030例患者,男性 422例(41.0%),女性 608例(59.0%);年齡 18~65 歲,平均(39.1±13.6)歲;已婚 793 例(77.0%),未婚(含離異和喪偶)237 例(23.0%);有工作 600例(58.3%),無工作 430例(41.7%);高中及以下教育程度732例 (71.1%),本科及以上298例(28.9%)。對照組851名健康體檢者,男性468名(55.0%),女性 383名(45.0%);年齡 18~65歲,平均(35.9±12.9)歲;已婚 630 名(74.0%),未婚 221名(26.0%);有工作 470名(55.2%),無工作381名 (44.8%);高中及以下教育程度600名(70.5%),本科及以上 251名(29.5%)。病例組和對照組性別構(gòu)成具有統(tǒng)計學(xué)差異 (=36.761,P<0.001),其他資料組間差異均無統(tǒng)計學(xué)意義 (P>0.05)。病例組初入組時 HAMD-24總分 (28.9±8.5)分;至本研究隨訪截點,病例組發(fā)作次數(shù)2~9次,中位數(shù)(上下四分位數(shù))為 3(2,5)次。
2.2 H-W平衡檢驗 病例組和對照組4個tagSNPs的基因型和等位基因分布均符合H-W平衡定律(P>0.05)。
2.3 基因型及等位基因頻率分布 病例組與對照組比較,5-HTR2A rs17068986基因型 (=8.727,P=0.013)及等位基因(=4.955,P=0.025)頻率分布差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義,病例組T等位基因頻率高于對照組(OR=1.158,95%CI:1.018~1.318)。其他tagSNPs(rs878567、rs1328683、rs9534495)基因型及等位基因頻率在兩組間分布差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)(表 1)。
2.4 4個tagSNPs在不同遺傳模型中基因型分布5-HTR2A rs17068986基因型分布符合共顯性 (P=0.011,AIC=2519.7)、顯性(P=0.003,AIC=2517.9)和加性(P=0.036,AIC=2522.3)遺傳模型,其中顯性遺傳模型為最佳模型(AIC值最?。?,經(jīng)Bonferroni校正,該模型中基因型分布差異仍具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.0125),該模型中病例組TT+TC基因型頻率高于對照組 (81.0%vs.75.4%,OR=1.410,95%CI:1.120~1.760)。其他 tagSNPs(rs878567、rs1328683、rs9534495)在不同遺傳模型中的基因型分布均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05)(表 2)。
2.5 5-HTR1A與5-HTR2A基因交互作用 校正性別和年齡后,GMDR結(jié)果顯示一階、三階和四階模型均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。比較交叉驗證一致性及檢驗精確度,四階模型為最優(yōu)模型,該模型經(jīng)過1000次置換檢驗具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.001),交叉驗證一致性為10/10,檢驗精確度為0.534。二階模型無統(tǒng)計學(xué)意義 (1000次置換檢驗P>0.05)(表 3)。
表1 病例組與對照組基因型及等位基因頻率分布
表2 4個tagSNPs在不同遺傳模型中的基因型分布
本研究發(fā)現(xiàn),5-HTR2A rs17068986位點等位基因頻率及基因型分布在兩組間存在統(tǒng)計學(xué)差異,TT+TC基因型攜帶者相對于CC基因型攜帶者患病風(fēng)險增加(OR=1.410),提示該位點可能為中國漢族RMDD患者的易感基因位點。全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)證實抑郁癥與精神分裂癥具有共同的遺傳風(fēng)險背景[12],BANI-FATEMI等[13]發(fā)現(xiàn) rs17068986 位點與精神分裂癥患者自殺企圖密切相關(guān),推測該位點與抑郁癥也可能存在關(guān)聯(lián)。rs17068986位于13號染色體,屬于內(nèi)含子區(qū)域的tagSNP。tagSNPs是在高度連鎖不平衡的基因組區(qū)域中具有代表性的SNPs,可代表其所在單體型區(qū)域的單體型(haplotype)信息。既往多項研究發(fā)現(xiàn)5-HTR2A基因的rs7997012位點與抑郁癥相關(guān)[14],而rs17068986位點與該位點僅相距4 kb的距離,因此rs17068986位點極有可能連鎖該致病位點,在5-HTR2A基因的表達(dá)路徑上發(fā)揮一定作用,進(jìn)而增加RMDD的易感風(fēng)險。目前國內(nèi)外尚無其他關(guān)于RMDD與rs17068986位點的研究,因此該位點研究結(jié)果的可復(fù)制性及功能意義需要后續(xù)研究進(jìn)一步證實。
表3 5-HTR1A與5-HTR2A基因交互模型
一項包括日本人、白種人、德國人和意大利人的大樣本meta分析顯示5-HTR1A的rs878567位點與抑郁癥有關(guān)[15],有研究顯示rs6295與抑郁癥發(fā)病有關(guān),且rs878567與rs6295之間存在強連鎖不平衡[16]。國內(nèi)一項針對漢族人群5-HTR1A基因rs878567位點的研究則未見其與抑郁癥存在關(guān)聯(lián)[17]。本研究再次在中國漢族人群中探討rs878567、rs1328683和rs9534495與RMDD的關(guān)系,仍未找到關(guān)聯(lián)的證據(jù),提示除種族因素外,不同的診斷亞型可能也是影響因素之一。rs878567位點位于5-HTR1A基因的3′非翻譯區(qū),與rs6295位點僅相距2 kb距離,可能同屬一個單倍型,但本研究的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果未能證實其與RMDD有關(guān),推測與其遺傳效應(yīng)過低有關(guān)。
抑郁癥屬多基因遺傳病,多個微效基因作用疊加是目前公認(rèn)的假說[18],5-HTR1A和5-HTR2A基因也存在相互影響[19]。GMDR是目前分子遺傳領(lǐng)域常用的數(shù)據(jù)處理方法,可以獲得兩個以上基因是否存在交互作用的數(shù)據(jù)信息[20]。本研究采用GMDR方法發(fā)現(xiàn),校正性別、年齡后,5-HTR1A(rs87856) 和 5-HTR2A (rs1328683、rs17068986、rs9534495)基因存在交互作用,提示5-HTR1A和5-HTR2A基因突變可產(chǎn)生交互作用,增加個體的RMDD易感風(fēng)險?!?-HT受體不平衡假說”認(rèn)為5-HTR1A和5-HTR2A的效應(yīng)相互影響或相互拮抗,目前國內(nèi)外研究也驗證了這一假說[21-22],因此5-HTR1A和5-HTR2A基因交互作用對RMDD的影響從生物學(xué)角度也可以解釋。
本研究以RMDD患者為研究對象,目的是盡可能排除亞組異質(zhì)性,但仍不能完全排除其他亞型的患者,例如伴精神病性癥狀的抑郁癥患者。另外,SNP只是點突變,是否影響下游蛋白表達(dá),以及其與其他低頻突變或罕見變異的關(guān)系等,均需后續(xù)研究加以證實。
致謝:衷心感謝新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院王新友主任及河南科技學(xué)院校醫(yī)院何茶葉院長在前期樣本收集過程中提供的幫助。