劉夢(mèng)雅,蘇加坤,王若琪,徐 達(dá),秦秀軍,李建國(guó),安 全,蔡繼寶,*
(1.中國(guó)輻射防護(hù)研究院,藥物毒理與放射損傷藥物山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中核放射毒理與放射性藥物臨床前評(píng)價(jià)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西 太原030006;2.江西中煙工業(yè)有限責(zé)任公司,江西 南昌 330096)
據(jù)2019年發(fā)布的《中國(guó)心血管病報(bào)告2018》顯示,我國(guó)心血管病現(xiàn)患人數(shù)為2.9億,心血管病死亡率居首位[1]。流行病學(xué)數(shù)據(jù)分析以及許多試驗(yàn)研究結(jié)果表明,吸煙除直接危害到人體的呼吸系統(tǒng)外,對(duì)人體的心腦血管、消化道等組織器官均產(chǎn)生不同程度的損害[2]。而多項(xiàng)研究表明煙草中含有引起冠狀動(dòng)脈硬化、高血壓、冠心病等心血管疾病的發(fā)病率升高的成分[3-5]。本草香是香藥本草制備的各種香料,其在疾病預(yù)防與治療方面的功用也受到人們的關(guān)注[6],本研究采用添加本草香成分香煙與普通香煙干預(yù)大鼠后,利用串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)記(tandem mass tags,TMT)定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究技術(shù)探索本草香對(duì)大鼠心血管系統(tǒng)相關(guān)蛋白的改變情況,旨在尋找差異蛋白以及相關(guān)生物學(xué)通路,為進(jìn)一步研究本草香的生物學(xué)功效提供研究線索。
SPF級(jí)雄性SD大鼠24只,體質(zhì)量200~220 g,購(gòu)于北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司,生產(chǎn)許可證號(hào)SCXK-(京)2016-0006,質(zhì)量合格證號(hào)11400700300671。飼養(yǎng)管理于中國(guó)輻射防護(hù)研究院動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中心,實(shí)驗(yàn)動(dòng)物使用許可證號(hào)SYXK(晉)2013-0002。
普通卷煙和添加本草香成分的金圣4號(hào)卷煙,均產(chǎn)自江西中煙工業(yè)有限責(zé)任公司,每支卷煙含煙堿1.0 mg,焦油10.0 mg,一氧化碳10.0 mg;HRH-WBE 3986型動(dòng)物全身煙氣暴露系統(tǒng),購(gòu)于北京慧榮和科技有限公司;TMT標(biāo)記試劑盒,購(gòu)于Thermo Fisher公司。
根據(jù)動(dòng)物體質(zhì)量按分段均衡隨機(jī)分組法(DAS1.0軟件)將動(dòng)物進(jìn)行分組,分為普通香煙煙氣暴露組和金圣4號(hào)香煙煙氣暴露組,每組12只。兩組分別放置于染毒腔體內(nèi)進(jìn)行主流煙氣暴露染毒60 min,煙氣濃度控制在(1 100±110)mg/m3。每天染毒1次,3個(gè)月后麻醉取心臟,送樣本檢測(cè)。
將冷凍的樣品心臟組織取出適量,轉(zhuǎn)移至1.5 mL離心管中。加入300 μL樣品裂解液,加入蛋白酶抑制劑PMSF使其終濃度為1 mmol/L。冰上超聲破碎3 min。將溶液在室溫下12 000 r/min離心10 min,取上清,并再次離心取上清。上清即為樣品的總蛋白溶液,進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定并分裝后儲(chǔ)存于-80℃?zhèn)溆?。蛋白采用BCA法測(cè)定蛋白濃度。每個(gè)樣品取10 μg蛋白,采用12%SDS-PAGE進(jìn)行分離;分離后的凝膠采用考馬斯亮蘭染色法進(jìn)行染色。胰蛋白酶酶解及標(biāo)記:蛋白定量后每個(gè)樣品各取100 μg于10 K的超濾管中,取120 μL還原劑緩沖液(10 mmol/L DTT,8 mol/L尿素,100 mmol/L TEAB,pH=8.0),60℃反應(yīng)1 h;加入IAA至終濃度為50 mmol/L,室溫避光反應(yīng)40 min;4℃、12 000 r/min離心20 min,棄掉收集管底部溶液;加入300 mmol/L的TEAB緩沖液100 μL,12 000 r/min離心20 min,2次;更換新收集管,在超濾管中加入300 mmol/L的TEAB緩沖液100 μL,并加入1 μg/μL的測(cè)序級(jí)胰蛋白酶溶液2 μL,37℃反應(yīng)12 h;12 000 r/min離心20 min,收集酶解后肽段,在超濾管中再加入200 mmol/L的TEAB緩沖液50 μL,12 000 r/min離心20 min,收集管底溶液并凍干。向凍干樣品中加入200 mmol/L的TEAB緩沖液100 μL,渦流混勻,取出40 μL樣品于1.5 mL EP管中進(jìn)行標(biāo)記反應(yīng);從冰箱中取出TMT試劑,平衡到室溫,加入41 μL無(wú)水乙腈,渦流5 min,離心;取41 μL TMT試劑加到樣品中,渦流混勻,室溫放置1 h;加入8 μL 5%羥胺終止反應(yīng)15 min,凍干后于-80℃保存。反相色譜分離:梯度洗脫收集8~60 min的樣品,依次每隔1 min收集洗脫液到1~15號(hào)離心管中,按此順序循環(huán)收樣至梯度結(jié)束。收集好后真空冷凍干燥抽干,樣品冷凍保存進(jìn)行質(zhì)譜檢測(cè)。
采用Proteome DiscovererTM2.2(美國(guó)Thermo公司)軟件分析差異蛋白,所用數(shù)據(jù)庫(kù)為來(lái)自于UniProt的大鼠數(shù)據(jù)庫(kù)。肽段鑒定的假陽(yáng)性率控制在1%以下,利用倍數(shù)變化值進(jìn)行差異蛋白篩選,篩選的標(biāo)準(zhǔn)為上調(diào)或者下調(diào)倍數(shù)變化值≥1.2且P≤0.05。采用基因本體(gene ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(Kyoto Gene and Genomic Encyclopedia,KEGG)數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異蛋白進(jìn)行富集分析,以判定差異蛋白主要影響的生物學(xué)功能或者通路。對(duì)差異蛋白進(jìn)行非監(jiān)督層次聚類,利用熱圖的形式展示差異基因在不同樣本間的表達(dá)模式。
用TMT法檢測(cè)吸煙3個(gè)月后普通香煙組與金圣4號(hào)香煙組大鼠心臟組織蛋白的表達(dá)情況,在兩組組織中,表達(dá)水平差異在1.2倍以上的蛋白43個(gè),其中在金圣4號(hào)香煙組心臟組織中下調(diào)表達(dá)41個(gè),上調(diào)表達(dá)2個(gè)。圖1將比較產(chǎn)生的差異表達(dá)情況反映到火山圖中,圖2為聚類分析結(jié)果,即對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行的非監(jiān)督層次聚類,如同一樣品能通過(guò)聚類出現(xiàn)在同一簇中,則聚在同一簇中的蛋白可能具有相似的生物學(xué)功能。
圖1 普通香煙組與金圣4號(hào)香煙組大鼠心臟組織差異表達(dá)蛋白火山圖
圖2 普通香煙組與金圣4號(hào)香煙組大鼠心臟組織差異蛋白熱圖
根據(jù)GO分析對(duì)基因的注釋,對(duì)普通香煙組與金圣4號(hào)香煙組大鼠43個(gè)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行分子功能、細(xì)胞組分及生物學(xué)過(guò)程的分類,分析結(jié)果顯示分子功能富集主要涉及結(jié)構(gòu)分子活動(dòng)、NADPH綁定和細(xì)胞黏附分子結(jié)合等;細(xì)胞組分富集主要涉及細(xì)胞外空間、細(xì)胞外區(qū)域部分和細(xì)胞外區(qū)域等;生物過(guò)程富集主要涉及細(xì)胞激活、調(diào)節(jié)體液水平和血小板活化等。詳見(jiàn)圖3~5。
圖3 分子功能富集分析結(jié)果
圖4 細(xì)胞組分富集分析結(jié)果
圖5 生物過(guò)程富集分析結(jié)果
對(duì)普通卷煙和金圣4號(hào)香煙煙氣暴露3個(gè)月組大鼠心臟組織差異蛋白進(jìn)行KEGG富集分析,得到蛋白質(zhì)在細(xì)胞中的代謝途徑以及這些蛋白質(zhì)的功能差異,差異蛋白涉及血小板活化、補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)、氮代謝、半乳糖代謝、戊糖和葡萄糖醛酸的相互轉(zhuǎn)化、果糖和甘露糖代謝等6個(gè)生物學(xué)通路。見(jiàn)表4和圖6。
表4 煙氣染毒干預(yù)3個(gè)月后兩組大鼠心臟組織差異蛋白的生物學(xué)通路
圖6 煙氣染毒3個(gè)月后兩組大鼠心臟組織差異蛋白的生物學(xué)通路
基于OmicsBean組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析云平臺(tái),進(jìn)行了差異蛋白及KEGG通路之間的蛋白互作分析,分析得到蛋白互作匯總結(jié)果。KEGG富集結(jié)果中顯著性前十的通路以及與之互作的蛋白之間的互作網(wǎng)絡(luò)圖,結(jié)果見(jiàn)圖7。
在我國(guó),心腦血管疾病的發(fā)病率和死亡率居高不下,占居民疾病死亡構(gòu)成的40%以上。研究表明,吸煙可引起心血管系統(tǒng)的損傷,增加心血管發(fā)病的風(fēng)險(xiǎn)[1]。研究顯示,損傷作用機(jī)制可能與吸煙對(duì)血液中的血小板黏性的改變有關(guān),血小板黏性增加可導(dǎo)致冠脈血栓的形成,從而增加心肌梗死的發(fā)病率,此外,血小板在冠心病中冠狀動(dòng)脈粥樣硬化斑塊破裂及血栓形成導(dǎo)致猝死中起重要作用[7]。
圖7 蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖
本草香是中國(guó)醫(yī)藥史中一類具有多種功效的香藥,見(jiàn)載于《本草綱目》等重要本草典籍,研究表明,本草香藥除能產(chǎn)生良好的香味刺激外,還能促進(jìn)機(jī)體免疫球蛋白含量提高,進(jìn)而增強(qiáng)人體防御疾病的能力[6],本文旨在研究本草香的生物學(xué)功效。通過(guò)采用GO和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)吸煙組43個(gè)差異蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析,結(jié)果顯示,在吸煙后3個(gè)月蛋白表達(dá)的改變涉及到多種分子功能、細(xì)胞組分及生物學(xué)過(guò)程的變化,主要包括結(jié)構(gòu)分子活動(dòng)、血小板活化、血液凝固、細(xì)胞外空間等。
我們篩選出與脂蛋白的轉(zhuǎn)化與代謝過(guò)程有關(guān)的載脂蛋白E(ApoE),ApoE是一種多態(tài)性蛋白,其濃度與血漿甘油三酯含量呈正相關(guān)。研究表明,ApoE基因多態(tài)性與血脂異常以及冠狀動(dòng)脈粥樣硬化的關(guān)系密切,其中ApoE4型是冠心病發(fā)生的重要影響因子[8]。差異表達(dá)基因的KEGG富集分析的結(jié)果顯示,差異表達(dá)蛋白涉及6個(gè)生物學(xué)通路,主要有血小板活化、補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)及代謝功能等。血小板活化是動(dòng)脈粥樣硬化血栓的標(biāo)志特征之一,血小板活化后會(huì)發(fā)生血小板聚集率增加,氧自由基,血栓素以及血小板活化因子合成明顯增加,同時(shí)在冠心病的發(fā)病中也起著重要作用[9]。凝血與補(bǔ)體級(jí)聯(lián)反應(yīng)信號(hào)通路中有多種與疾病相關(guān)的炎癥或免疫類差異蛋白,這些蛋白各自執(zhí)行生理功能,且又相互聯(lián)系[10],該信號(hào)通路上的差異蛋白點(diǎn)可以作為本草香發(fā)揮作用的關(guān)鍵靶點(diǎn)。除此之外,差異表達(dá)蛋白還涉及氮代謝以及糖代謝途徑。
本研究主要觀察了兩種香煙干預(yù)3個(gè)月后大鼠心臟組織蛋白表達(dá)的變化,篩選出差異蛋白,這些蛋白多數(shù)與血小板活化、補(bǔ)體和凝血級(jí)聯(lián)和代謝等生物學(xué)途徑相關(guān)。表明本草香干預(yù)對(duì)心血管系統(tǒng)的影響涉及多個(gè)蛋白及生物學(xué)過(guò)程,是一個(gè)復(fù)雜且相互影響的過(guò)程,此次篩選出的相關(guān)結(jié)果將為進(jìn)一步研究普通香煙組大鼠與金圣4號(hào)香煙組造成的差異表蛋白以及作用機(jī)制提供研究線索,為研究本草香的生物學(xué)功效提供研究幫助。