郭 娟 李永杰 梁寧生
(廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院藥學(xué)部,南寧市 530021,電子郵箱:1599168279@qq.com)
細(xì)菌耐藥問題日趨嚴(yán)重,不僅危害人類健康,還給社會(huì)帶來(lái)沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。在歐盟國(guó)家,每年因耐藥菌感染引起的死亡數(shù)超過25 000人,費(fèi)用總計(jì)超過9億歐元;在美國(guó),每年因耐藥菌感染引起的死亡數(shù)約有23 000人,醫(yī)療費(fèi)用達(dá)260億美元[1]。開發(fā)新型抗菌藥物以有效對(duì)抗耐藥菌是解決耐藥菌感染的方法之一??咕淖畛跏窃谏矬w內(nèi)發(fā)現(xiàn)的一類具有抗菌活性的小分子多肽,后來(lái)出現(xiàn)人工合成的抗菌肽,它們具有分子量小、抗菌譜廣、抗菌活性高、不易產(chǎn)生耐藥性、作用機(jī)理獨(dú)特等優(yōu)點(diǎn)[2],有望成為新型高效抗菌藥物,從而解決耐藥菌問題。目前,有幾種人工合成的抗菌肽已進(jìn)入臨床試驗(yàn)階段,用于局部和全身感染的治療。Pexiganan是一種含有22個(gè)氨基酸的magainin-2類似物,是第一種用于糖尿病足潰瘍局部治療的抗菌肽[3]。
人ⅡA型磷脂酶A2(phospholipase A2,PLA2),也稱為血小板型PLA2,是哺乳動(dòng)物重要的抗菌蛋白之一,在宿主防御細(xì)菌感染方面發(fā)揮重要的作用[4]。本課題組在前期研究中發(fā)現(xiàn)ⅡA 型PLA2對(duì)革蘭陽(yáng)性菌和革蘭陰性菌均有殺菌作用[5],并且根據(jù)其C-末端及N-末端分別衍生合成的多肽也都具有殺菌活性[6-7]。本研究根據(jù)ⅡA型PLA2的N末端15個(gè)氨基酸序列合成多肽,并以此多肽為模板,改變不同位置的氨基酸,最終合成6種衍生肽;比較模板肽ⅡA型PLA2N端15肽(PLA2-N15)及6種衍生肽的殺菌活性,進(jìn)而分析多肽分子結(jié)構(gòu)與殺菌活性間的關(guān)系。
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)細(xì)菌標(biāo)準(zhǔn)株:革蘭陰性菌大腸埃希菌ATCC 44113以及革蘭陽(yáng)性菌金黃色葡萄球菌ATCC 26003均由廣西醫(yī)科大學(xué)微生物學(xué)教研室提供,均購(gòu)自中國(guó)食品藥品檢定研究院。
1.1.2 實(shí)驗(yàn)藥品與試劑:模板肽PLA2-N15(批號(hào):pep16080425)及其6種衍生肽PLA2-H6R(批號(hào):pep16080426)、PLA2-H6R-T12R(批號(hào):pep16080429)、PLA2-H6R-T12V(批號(hào):pep16040509)、PLA2-N4R-H6R(批號(hào):pep16080428)、PLA2-N4R-H6R-T13R(批號(hào):pep16080430)、PLA2-N1A-H6R-T12L(批號(hào):pep16080427)均由本課題組設(shè)計(jì)經(jīng)上海波泰有限公司合成,純度均為90%;1%小牛血清白蛋白(V/W)(批號(hào):323N057)由北京索萊寶科技有限公司提供;RPMI-1640(批號(hào):0025316)培養(yǎng)基由Biological Industries公司提供;無(wú)水氯化鈣(批號(hào):10043-52-4)由成都市科隆化工試劑廠提供;4-羥乙基哌嗪乙磺酸(純度≥99%,批號(hào):513C0412)由北京索萊寶科技有限公司提供;LB營(yíng)養(yǎng)瓊脂(批號(hào):170206)由北京路橋技術(shù)有限責(zé)任公司提供;LB培養(yǎng)基粉(批號(hào):A507007-0205)由生工生物工程股份有限公司(上海)提供。
1.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器: (1)DRP-9272型恒溫培養(yǎng)箱(上海森信儀器有限公司);(2)AnkeTGL-16C型離心機(jī)(上海安亭科技儀器廠);(3)Thermo MAXQ8000型恒溫?fù)u床(Thermo Scientific Electron公司);(4)UV756型分光光度計(jì)(上海菁華科技儀器有限公司);(5)DK-914型恒溫水浴鍋(上海森信儀器有限公司)。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 多肽的設(shè)計(jì)與合成:查詢NCBI網(wǎng)站的基因庫(kù),獲取人ⅡA型PLA2蛋白質(zhì)N末端第1~15個(gè)氨基酸序列NLVNFHRMIKLTTGK (N為天冬酰胺,L為亮氨酸,V為纈氨酸,F(xiàn)為苯丙氨酸,H為組氨酸,R為精氨酸,M為甲硫氨酸,I為異亮氨酸,K為賴氨酸,T為蘇氨酸,G為甘氨酸)。以上述氨基酸序列為模板合成PLA2-N15及其衍生肽。(1)PLA2-H6R,第6位的H替換為R;(2)PLA2-H6R-T12R,第6位的H替換為R、第12位的T替換為R;(3)PLA2-H6R-T12V,第6位的H替換為R、第12位的T替換為V;(4)PLA2-N4R-H6R,第4位的N替換為R、第6位的H替換為R; (5)PLA2-N4R-H6R-T13R,第4位的N替換為R、第6位的H替換為R、第13位的T替換為R;(6)PLA2-N1A-H6R-T12L,首位的N替換為A、第6位的H替換為R、第12位的T替換為L(zhǎng)。見表1。
表1 PLA2-N15及其衍生肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)及結(jié)構(gòu)改變特點(diǎn)
注:下劃線標(biāo)注者代表被替換的氨基酸。
1.2.2 多肽的配制與保存:將PLA2-N15及其6種衍生肽分別溶于400 μl滅菌的雙蒸水中,配制成濃度為10 g/L的多肽母液,以20 μl/管分裝于EP管中,-20℃冷凍保存,根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要取用,避免反復(fù)凍融。
1.2.3 殺菌活性的測(cè)定:采用瓊脂鋪板計(jì)數(shù)法[8]測(cè)定多肽殺菌活性。(1)細(xì)菌培養(yǎng)及菌液制備。取過夜培養(yǎng)的細(xì)菌,按1 ∶50的比例加入3 ml新鮮的LB培養(yǎng)液中,置于37℃的恒溫?fù)u床孵育2.5 h,達(dá)對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期。室溫下1 000 r/min離心45 s后收集細(xì)菌,用生理鹽水洗滌細(xì)菌并再次離心,棄上清液,將所得細(xì)菌沉淀物重懸于500 μl生理鹽水并混勻,于紫外分光光度計(jì)的540 nm波長(zhǎng)處測(cè)定吸光度值,記錄吸光度值達(dá)0.1時(shí)所需的細(xì)菌量(μl),計(jì)算細(xì)菌的稀釋倍數(shù),并將細(xì)菌稀釋至每毫升1×107菌落形成單位(colony-forming unit,CFU)備用。(2)配制細(xì)菌孵育體系。取過濾后的RPMI-1640液900 μl,加入50 μl小牛血清白蛋白(1%)、20 μl 4-羥乙基哌嗪乙磺酸(10 mmol/L)、20 μl氯化鈣(1 mmol/L),配制成pH≈7.40的反應(yīng)體系。(3)實(shí)驗(yàn)分組。將每條衍生肽分為對(duì)照組和4個(gè)實(shí)驗(yàn)組(衍生肽終濃度分別為8、40、200、1 000 μg/ml),取80 μl反應(yīng)體系,各實(shí)驗(yàn)組加10 μl菌液和10 μl相應(yīng)終濃度的衍生肽,對(duì)照組加入10 μl菌液和等體積的生理鹽水。混勻后置于37℃恒溫水浴2 h。(4)計(jì)算殺菌率。2 h后從上述各反應(yīng)體系中取出反應(yīng)液40 μl,加入360 μl滅菌生理鹽水中,連續(xù)10倍稀釋,共稀釋5次,取100 μl稀釋液于無(wú)菌培養(yǎng)皿(直徑約55 mm)中,加入滅菌的LB營(yíng)養(yǎng)瓊脂6 ml搖勻,待瓊脂凝固后,放入37℃恒溫箱中過夜培養(yǎng)18~24 h。計(jì)數(shù)瓊脂板上的CFU,取CFU為30~300之間的瓊脂板進(jìn)行計(jì)數(shù)。計(jì)算衍生肽作用后的殺菌率(%),殺菌率=(對(duì)照組CFU-實(shí)驗(yàn)組CFU)/對(duì)照組CFU×100%。每組實(shí)驗(yàn)重復(fù)5次,取平均值。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。計(jì)量資料以(x±s)表示,組間比較采用單因素方差分析。以P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 不同多肽濃度PLA2-N15及其衍生肽對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌率比較 多肽濃度為200 μg/ml和1 000 μg/ml時(shí),6種衍生肽的殺菌率均高于PLA2-N15(均P<0.05);任一濃度下PLA2-H6R-T12V與PLA2-N1A-H6R-T12L的殺菌率均高于PLA2-N15及其他4種衍生肽(均P<0.05);多肽濃度為8 μg/ml、40 μg/ml時(shí),PLA2-H6R-T12V的殺菌率均高于PLA2-N1A-H6R-T12L(均P<0.05)。見表2。
表2 不同多肽濃度PLA2-N15及其衍生肽對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌率比較(x±s,%)
注:與PLA2-N15比較,aP<0.05;與PLA2-H6R比較,bP<0.05;與PLA2-H6R-T12V比較,cP<0.05;與PLA2-N1A-H6R-T12L比較,dP<0.05。
2.2 不同多肽濃度PLA2-N15及其衍生肽對(duì)革蘭陰性菌的殺菌率比較 多肽濃度為200 μg/ml和1 000 μg/ml時(shí),除PLA2-H6R外,其他5種衍生肽的殺菌率均高于PLA2-N15(均P<0.05);多肽濃度為200 μg/ml和1 000 μg/ml時(shí),PLA2-H6R-T12V與PLA2-N1A-H6R-T12L的殺菌率均高于其他4種衍生肽(均P<0.05);多肽濃度為40 μg/ml時(shí),PLA2-H6R-T12V的殺菌率低于PLA2-N1A-H6R-T12L(P<0.05)。見表3。
表3 不同多肽濃度PLA2-N15及其衍生肽對(duì)革蘭陰性菌的殺菌率比較(x±s,%)
注:與PLA2-N15比較,aP<0.05;與PLA2-H6R比較,bP<0.05;與PLA2-H6R-T12V比較,cP<0.05;與PLA2-N1A-H6R-T12L比較,dP<0.05。
3.1 PLA2-N15及其衍生肽的設(shè)計(jì) 利用美國(guó)NCBI網(wǎng)站的基因庫(kù),查詢目前能夠獲取的所有哺乳類生物ⅡA型PLA2的N末端15個(gè)氨基酸殘基序列,包括人、猩猩、猴、兔、牛、豚鼠、大鼠、小鼠共8種生物,其氨基酸殘基序列如圖1所示。對(duì)8種生物氨基酸序列的構(gòu)成情況進(jìn)行對(duì)比發(fā)現(xiàn),不同物種第5、8、9、13、14、15位的氨基酸完全一致,其他位置上則存在差別。前期研究表明,多肽分子的酸堿性和疏水性對(duì)其殺菌活性有重要影響[9],但不同的肽分子其殺菌活性又有所不同。故我們?cè)冖駻型PLA2的N末端15個(gè)氨基酸殘基序列多肽分子中對(duì)不同位置的酸堿性和疏水性氨基酸進(jìn)行改造,并分析其殺菌活性。考慮到高度保守的氨基酸對(duì)分子結(jié)構(gòu)可能起到關(guān)鍵作用,我們?cè)谠O(shè)計(jì)衍生肽時(shí)不改變其高度保守的氨基酸;同時(shí),不同物種ⅡA型PLA2的N末端氨基酸序列的第2位氨基酸種類雖不同,但性質(zhì)相同,都是疏水性氨基酸,故也不作改變,最終選擇第1、4、6、12、13位氨基酸進(jìn)行改造。
圖1 8種哺乳類生物ⅡA型PLA2N末端15個(gè)氨基酸殘基構(gòu)成情況
注:上排數(shù)字(1~15)代表多肽一級(jí)結(jié)構(gòu)的氨基酸順序;下排數(shù)字代表氨基酸取代次數(shù)(與人ⅡA型PLA2N末端15個(gè)氨基酸殘基相同位置比較)。
3.2 PLA2-N15及其衍生肽的分子結(jié)構(gòu)與殺菌活性的關(guān)系
3.2.1 多肽的殺菌作用與疏水性氨基酸的關(guān)系:任一濃度下,PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌率高于其他多肽,在200 μg/ml和1 000 μg/ml下對(duì)革蘭陰性菌的殺菌率高于其他多肽(P<0.05)。提示7種多肽中殺菌作用最強(qiáng)的是多肽PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L。分析其結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),與PLA2-N15相比,多肽PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L都增加了疏水性氨基酸,疏水性氨基酸比例由0.467分別上升至0.533和0.600,提示適度增加疏水性氨基酸比例可明顯增強(qiáng)殺菌活性。Yin等[10]的研究結(jié)果也顯示,增加抗菌肽疏水性在一定程度上可改善殺菌活性[11]。同時(shí),當(dāng)多肽濃度小于200 μg/ml時(shí),PLA2-N1A-H6R-T12L對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌活性低于PLA2-H6R-T12V(P<0.05),可能與其將首位親水性氨基酸N替換為疏水性氨基酸A有關(guān),提示首位為親水性氨基酸對(duì)于提高ⅡA型PLA2N端肽對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌活性更為重要,這點(diǎn)不同于Ⅰ型PLA2[11]。對(duì)革蘭陽(yáng)性菌和革蘭陰性菌的殺菌活性,多肽PLA2-N1A-H6R-T12L均明顯強(qiáng)于PLA2-H6R-T12R,分析結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),前者同時(shí)增加堿性氨基酸和疏水性氨基酸比例,而后者僅增加堿性氨基酸,提示適當(dāng)增加疏水性氨基酸比例能更有效地提高多肽的抗菌活性。與PLA2-N15相比,衍生肽PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L對(duì)革蘭陽(yáng)性菌和革蘭陰性菌的殺菌活性均增強(qiáng),這可能與它們的疏水性結(jié)構(gòu)更易于與細(xì)菌表面結(jié)合有關(guān)。進(jìn)一步分析其結(jié)構(gòu)特點(diǎn),將為今后抗菌肽新藥的開發(fā)與應(yīng)用提供新依據(jù)。
3.2.2 多肽殺菌作用與堿性氨基酸的關(guān)系:多數(shù)學(xué)者認(rèn)為,抗菌肽是通過損傷細(xì)菌細(xì)胞膜來(lái)發(fā)揮殺菌作用的[12]。而抗菌肽發(fā)揮殺菌作用的重要結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)是堿性氨基酸,可使抗菌肽分子帶正電荷,并與帶負(fù)電荷的細(xì)菌膜表面相結(jié)合,進(jìn)而導(dǎo)致細(xì)菌裂解死亡而起到滅菌作用[13]。Malmsten等[14]研究發(fā)現(xiàn),在一定范圍內(nèi),增加抗菌肽分子正電荷數(shù),其抗菌活性也隨之增強(qiáng)。本研究結(jié)果顯示,PLA2-N15及其6種衍生肽在一定濃度下對(duì)革蘭陽(yáng)性菌和革蘭陰性菌均有殺菌作用,且多肽濃度為200 μg/ml和1 000 μg/ml時(shí),6種衍生肽的殺菌作用均強(qiáng)于PLA2-N15。其中,與PLA2-N15相比,多肽PLA2-H6R將弱堿性氨基酸(H)替換為強(qiáng)堿性氨基酸(R),凈正電荷未增加,其殺菌活性弱于PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L;多肽PLA2-N4R-H6R、PLA2-H6R-T12R和PLA2-N4R-H6R-T13R除了將弱堿性氨基酸(H)替換為強(qiáng)堿性氨基酸(R),還將中性氨基酸(N或T)替換為堿性氨基酸(R),凈正電荷數(shù)由+4分別增加至+5、+5和+6,多肽濃度為200 μg/ml和1 000 μg/ml時(shí),其對(duì)革蘭陰性菌的殺菌活性較PLA2-N15、PLA2-H6R均增強(qiáng),同時(shí),PLA2-H4R-H6R(1 000 g/ml時(shí))、PLA2-H6R-T12R(200 g/ml時(shí))和PLA2-N4R-H6R-T13R(除8 g/ml外)對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌活性均強(qiáng)于PLA2-H6R,且三種衍生肽對(duì)革蘭陽(yáng)性菌的殺菌作用均強(qiáng)于PLA2-N15(除8 g/ml外),提示增加凈正電荷有助于增強(qiáng)其殺菌活性,這與我們前期的研究結(jié)果類似[15],但其殺菌效果仍弱于PLA2-H6R-T12V和PLA2-N1A-H6R-T12L,可能與后兩種多肽結(jié)構(gòu)中均包含有4個(gè)堿性氨基酸以及凈正電荷數(shù)只增加到+4有關(guān)。這是因?yàn)槟0?5肽含有4個(gè)正電荷,已經(jīng)屬于堿性較強(qiáng)的分子,進(jìn)一步增加凈正電荷數(shù),使抗菌肽與細(xì)菌膜結(jié)合牢固,反而影響其穿膜效率,最終導(dǎo)致抗菌肽殺菌活性降低[16]。
綜上所述,人ⅡA型PLA2N端衍生肽的殺菌活性與其疏水性氨基酸比例及位置、氨基酸的酸堿性密切相關(guān),適當(dāng)?shù)奈恢迷黾邮杷园被峄驂A性氨基酸,在一定程度上可增強(qiáng)衍生肽的殺菌活性,且將衍生肽第12位氨基酸替換為疏水性氨基酸時(shí)殺菌活性最強(qiáng),這或可為今后開發(fā)新的抗菌藥物提供新思路。