MUKAMA Omar,LEO Bemena,王曉文,高曉冬,中西秀樹(shù)
(江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無(wú)錫 214122)
釀酒酵母的產(chǎn)孢過(guò)程是在碳源以及氮源匱乏等饑餓條件下引起的一個(gè)連續(xù)的過(guò)程。在此過(guò)程中,釀酒酵母營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞的細(xì)胞膜轉(zhuǎn)化為孢子膜[1],最終在二倍體細(xì)胞中形成四個(gè)單倍體孢子。孢子壁由四層結(jié)構(gòu)組成,從內(nèi)到外依次為:甘露糖層、葡聚糖層、殼聚糖層和二酪氨酸層。相較于營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞,孢子可以有效抵抗外界的惡劣環(huán)境,該特性主要是由于殼聚糖層和二酪氨酸層的保護(hù)作用。孢子壁結(jié)構(gòu)是由內(nèi)到外依次合成,在殼聚糖層形成后,二酪氨酸層才開(kāi)始合成[2]。二酪氨酸層主要是由酵母細(xì)胞質(zhì)中兩個(gè)L-酪氨酸交聯(lián)形成的二肽(LL-二甲酰基-N,N’-二酪氨酸)為主體的結(jié)構(gòu),該形成過(guò)程分為兩步:L-酪氨酸的N-甲酰化以及L-甲酰酪氨酸的二聚化[3]。這兩個(gè)步驟分別由Dit1 和Dit2 兩個(gè)蛋白調(diào)控完成[4]。隨后,LL-二甲?;?N,N’-二酪氨酸分子通過(guò)包括Dtr1 在內(nèi)的多個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白協(xié)助下,運(yùn)送到形成過(guò)程中的孢子壁上[5],且二酪氨酸層的組裝機(jī)制目前尚不清楚。
氧化劑可以通過(guò)自由基的介導(dǎo)來(lái)催化反應(yīng),其氧化性會(huì)對(duì)生物大分子(核酸,蛋白質(zhì),糖類和脂類)造成傷害,因此,氧化劑在生物體內(nèi)有很大的危害。H2O2作為氧化劑,進(jìn)入細(xì)胞后,主要通過(guò)抑制ATP 的合成(GAPDH 失活)影響糖酵解途徑,并且通過(guò)引起氧化應(yīng)激影響線粒體的氧化磷酸化途徑[6]。在過(guò)渡金屬存在時(shí),即使低濃度的H2O2(20~80 μmol/L)也可以影響煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)的活性,NAD+對(duì)于DNA 修復(fù)酶(多-ADP 核糖聚合酶)的活性是十分重要的。羥基自由基會(huì)造成不可逆的DNA 鏈斷裂[2,7],以及堿基的羥基化。因此,氧化劑最終會(huì)造成細(xì)胞的損傷或者死亡。酚類化合物可以通過(guò)抑制自由基(如H2O2)與金屬離子(如Fe2+)的螯合從而抑制氧化性。在該機(jī)制中,自由基奪走酚基的一個(gè)氫原子,而酚基可以從抗氧化劑上得到一個(gè)電子轉(zhuǎn)變?yōu)樽杂苫?yáng)離子[8]。酵母孢子的二酪氨酸是一種酚類化合物.過(guò)去的研究顯示,相較于營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞,酵母孢子對(duì)消化酶、乙醚處理、部分有機(jī)溶劑及高溫等特殊條件具有抵抗能力[9]。本研究目的是研究孢子對(duì)外源活性氧的抵抗能力,以及通過(guò)釀酒酵母營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞合成NN′-二NN′甲?;野彼岵⒀芯?二甲?;野彼岬目寡趸匦浴?/p>
除了另外標(biāo)注的技術(shù)外,本文所提到的基因操作參考文獻(xiàn)[10]。所用到的酵母菌株見(jiàn)表1,引物序列表2。
在克隆過(guò)程中,大腸桿菌在加入氨芐青霉素(100 μL/mL)的LB 培養(yǎng)基(1%酵母提取物,2%蛋白胨,2%NaCl)中培養(yǎng)。酵母營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞是在YPAD(1%酵母提取物,2%蛋白胨,2%葡萄糖,0.033%腺嘌呤)和/或去除某一或某幾種特殊氨基酸的氨基酸混合物的完全培養(yǎng)基(營(yíng)養(yǎng)缺陷型選擇培養(yǎng)基)中培養(yǎng)。酵母產(chǎn)孢細(xì)胞的培養(yǎng)是在YPACe 培養(yǎng)基(1%酵母提取物,2%蛋白胨,2%乙酸鉀)。
為了敲除DIT1,以pFA6a-HIS3MX6[11]為模板,以BLD1 和BLD2 為引物,通過(guò)PCR 技術(shù)擴(kuò)增得到一條DNA 片段,將該片段分別融合進(jìn)單倍體AN117-4B 和AN117-16D,然后將二者融合,得到dit1△二倍體菌株。
表1 本實(shí)驗(yàn)所用到的釀酒酵母菌株Table 1 S.cerevisiae strains used in this study
表2 本實(shí)驗(yàn)所用的引物Table 2 Primers used in this study
本文所用的質(zhì)粒見(jiàn)表3。pRS424-GAL-DIT1,pRS426-GAL-DIT2 and pRS424-TEF-DTR1 三個(gè)質(zhì)粒是按如下方法構(gòu)建的。
首先,DIT1,DIT2 和DTR1三個(gè)基因是以AN120 酵母菌株的基因組DNA 為模板[12]分別用引物 HXO599 和 HXO600,HXO601 和 HXO602,HXO603 和HXO604 通過(guò)PCR 擴(kuò)增的。得到的擴(kuò)增片段用SpeI 和XhoI 進(jìn)行切割,然后將其連接到以同樣酶切位點(diǎn)切割的質(zhì)粒pRS424-GAL,pRS426-GAL 或pRS425-TEF。用醋酸鋰轉(zhuǎn)化法將目的質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到酵母YH499 菌株中進(jìn)行表達(dá)[16]。所有構(gòu)建的質(zhì)粒均由基因測(cè)序確認(rèn)(BGI,China,Beijing)。
表3 本實(shí)驗(yàn)所用到的質(zhì)粒Table 3 Plasmids used in this study
取單菌落在5 mL 的YPAD 中培養(yǎng)過(guò)夜,然后將1 mL 菌液轉(zhuǎn)接到200 mL 的YPA 培養(yǎng)基中培養(yǎng)24 h。離心(5 600 g,30 s)收集細(xì)胞,并用去離子水洗,然后將其轉(zhuǎn)移到2%的醋酸鉀培養(yǎng)24 h。產(chǎn)孢后,離心(5 600 g,30 s)收集孢子,并用6 mol/L NaCl 溶液洗滌2 次。
氧化劑的處理實(shí)驗(yàn)是根據(jù)文獻(xiàn)[17]稍作調(diào)整后進(jìn)行的。當(dāng)細(xì)胞生長(zhǎng)到穩(wěn)定期后,收集菌體處理到105cells/mL,用1 μL 的氧化劑(2 mmol/L FeSO4/2 mmol/L H2O2或者2 mmol/L FeCl3/2 mmol/L H2O2)處理。混合液在30 ℃培養(yǎng)1 h,依次按梯度稀釋10 倍后震蕩混勻后分別取5 μL 點(diǎn)板到Y(jié)PAD 培養(yǎng)基上,重復(fù)上述實(shí)驗(yàn)一次。同樣的細(xì)胞用去離子水稀釋100 倍,分別涂于兩塊相同的平板上,對(duì)生長(zhǎng)的菌落計(jì)數(shù),取兩板的平均值。實(shí)驗(yàn)圖片是用Image Quant LAS 4 000(GE Healthcare,USA)拍攝的。
含有空載(對(duì)照)和質(zhì)粒pRS424-GAL-DIT1,pRS426 -GAL -DIT2 和 pRS424 -TEF -DTR1 的YPH499 單菌落在含2%葡萄糖的SD 培養(yǎng)基上培養(yǎng)到指數(shù)期,離心(8 560 g,2 min)收集菌體,去離子水洗2 次,然后轉(zhuǎn)入含有2%半乳糖的SD 培養(yǎng)基上培養(yǎng)48 h。培養(yǎng)后含有LL-二甲酰基-N,N′-二酪氨酸的培養(yǎng)基(4 mg/mL)將用于下一步的實(shí)驗(yàn)。
LL-二酪氨酸和LL-二甲?;?N,N′-二酪氨酸通過(guò)[18]所描述的用L-酪氨酸或者N-甲?;?L-酪氨酸(Sigma-Aldrich)進(jìn)行氧化反應(yīng)從而合成。反應(yīng)過(guò)程如下:2 mL 的Tris-HCl(0.3 mmol/L,pH 8.5),1.5 mL 的L-tyrosine 或者N-甲酰基-L-酪氨酸(2 mg/mL),0.1 mL 的過(guò)氧化氫(8.82×10-5mol/L),0.5 mL 的過(guò)氧化物酶(1 mg/mL,Sangon,Shanghai,China),混合,20 ℃培養(yǎng)1 h。然后進(jìn)行LC-MS 分析,確認(rèn)LL-二酪氨酸和LL-二甲酰基-N,N′-二酪氨酸是否合成。
該樣品是用Discovery C18 柱(150 mm×4.6 mm ID,5 μm particles)(Sigma Aldrich,U.S.A)在Waters分離模塊e2695 HPLCs 系統(tǒng)(Wexford,UK)進(jìn)行分析。每組加入10 μL 樣品。柱子經(jīng)過(guò)含有100%CH3CN 的0.01 M 三氟乙酸梯度洗脫(0~50%的CH3CN,55 min。樣品流速為1 mL/min,紫外熒光檢測(cè)條件為:激發(fā)波長(zhǎng)285 nm,發(fā)射波長(zhǎng)425 nm。
DPPH 和ABTS 溶液被用來(lái)檢測(cè)二甲酰基-二酪氨酸的自由基清除能力。DPPH 的用法是根據(jù)[19-20]中所描述的方法進(jìn)行的。在99%甲醇溶液中,加入3.5 mL 的60 mol/L 的DPPH,然后分別加入10,20,50 μL 的含有培養(yǎng)基的LL-二甲?;?N,N′-二酪氨酸,空質(zhì)粒,單獨(dú)的培養(yǎng)基和合成的LL-二甲?;?N,N′-二酪氨酸?;旌先芤涸诤诎抵惺覝嘏囵B(yǎng)20 min,然后在517 nm(吸光度)下用Ultrospec 2100 pro UV/Visible Spectrophotometer(GE healthcare,F(xiàn)airfield,USA)讀數(shù)。清除力的計(jì)算如下:
ABTS 工作溶液的制備過(guò)程是按照[21-22]中的描述。本實(shí)驗(yàn)中,在99%甲醇溶液中,加入3.5 mL 的60 mol/L 的ABTS,然后分別加入10,20,50 μL 的含有培養(yǎng)基的LL-二甲?;?N,N′-二酪氨酸,空質(zhì)粒,單獨(dú)的培養(yǎng)基和合成的LL-二甲酰基-N,N′-二酪氨酸?;旌先芤涸诤诎抵惺覝嘏囵B(yǎng)16 h,然后在734 nm(吸光度)下用Ultrospec 2100 pro UV/Visible Spectrophotometer(GE healthcare,F(xiàn)airfield,USA)讀數(shù)。
本研究至少做了3 次的獨(dú)立實(shí)驗(yàn),如±SE 所顯示的。
為了測(cè)試孢子是否具有抗氧化能力,將營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞和孢子分別用2 mmol/L FeCl3/2 mmol/L H2O2或2 mmol/L FeSO4/2 mmol/L H2O2處理。通過(guò)氧化反應(yīng),F(xiàn)eCl3可以與H2O2反應(yīng)并產(chǎn)生帶超氧陰離子。Fe2+與H2O2反應(yīng)產(chǎn)生羥基自由基。將細(xì)胞在該溶液中培養(yǎng)1 h 后在YPAD 上點(diǎn)板。如圖1 所示,用FeCl3/H2O2或FeSO4/H2O2處理的孢子與未處理的孢子生長(zhǎng)狀況相似。然而,處理后的營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞的生存力顯著降低。這些結(jié)果表明,與營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞相比,孢子具有抗氧化能力。
圖1 營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞和孢子對(duì)氧化應(yīng)激的敏感性Fig.1 Susceptibility of vegetative cells and spores toward oxidative stress
本研究評(píng)估了二酪氨酸層是否具有抗氧化性。由于DIT1 基因控制合成二酪氨酸,其突變導(dǎo)致二酪氨酸層缺失。如圖2(a)所示,dit1△突變株孢子對(duì)FeCl3/H2O2和FeSO4/H2O2比野生型孢子更敏感。
如圖2(b)所示,經(jīng)FeCl3/H2O2處理后,dit1△的孢子,野生型孢子和營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞的存活率分別降低到28.55%,60%和0,經(jīng)過(guò)FeSO4/H2O2處理,dit1△的孢子,野生型孢子和營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞的存活率分別降低到37.43%,90.84%和0。該結(jié)果表面二酪氨酸層賦予孢子抗氧化的能力。
二酪氨酸層主要由二甲?;野彼峤M成。本研究檢測(cè)了二甲?;野彼崾欠耧@示出抗氧化活性。為了獲得大量的二甲?;野彼?,本研究采用生物法合成二甲?;野彼?。
圖2 二酪氨酸層的缺失對(duì)細(xì)胞抗氧化性的影響Fig.2 Effect of the loss of the dityrosine layer on oxidative stress resistance
之前研究表明,即使在增殖期營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞中,二甲?;野彼嵋部捎蒁IT1,DIT2 和DTR1 三個(gè)基因控制合成的[3-5]。因此,分別構(gòu)建了在GAL1 啟動(dòng)子下游含有DIT1,DIT2 及DTR1的質(zhì)粒。在GAL1 啟動(dòng)子調(diào)控下,在含有葡萄糖的培養(yǎng)基中抑制基因表達(dá),并通過(guò)含半乳糖的培養(yǎng)基來(lái)誘導(dǎo)基因表達(dá)。
轉(zhuǎn)化構(gòu)建得到的3 種質(zhì)粒到酵母菌株YPH499中,挑取單個(gè)轉(zhuǎn)化子在含有葡萄糖或半乳糖的培養(yǎng)基中培養(yǎng)48 h。離心除去細(xì)胞并將培養(yǎng)基濃縮10倍。二酪氨酸是一種熒光分子:激發(fā)波長(zhǎng)為380 nm,發(fā)射波長(zhǎng)為475 nm。在半乳糖培養(yǎng)基中,檢測(cè)到強(qiáng)烈的二酪氨酸熒光信號(hào)。在葡萄糖培養(yǎng)基中,未檢測(cè)到強(qiáng)烈的熒光信號(hào)。表達(dá)了空載體的培養(yǎng)基中,未檢測(cè)到熒光信號(hào)。
為了進(jìn)一步驗(yàn)證培養(yǎng)了表達(dá)Dit1,Dit2 和Dtr1細(xì)胞的培養(yǎng)基中含有二甲酰二酪氨酸,本實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了HPLC 驗(yàn)證。在表達(dá)Dit1,Dit2 和Dtr1 細(xì)胞用過(guò)的培養(yǎng)基中檢測(cè)到二甲?;野彼岱澹诤锌蛰d體的細(xì)胞的培養(yǎng)基中沒(méi)有檢測(cè)到(圖3)因此,實(shí)驗(yàn)用過(guò)的培養(yǎng)基中含有二甲?;野彼帷?/p>
圖3 在表達(dá)DIT1,DIT2 和DTR1 細(xì)胞用過(guò)的培養(yǎng)基中檢測(cè)二甲酰基二酪氨酸Fig.3 Detection of bisformyl dityrosine in spent media cultured DIT1,DIT2,and DTR1 expressing cells
通過(guò)使用DPPH 和ABTS 測(cè)定,本研究檢測(cè)了二甲?;野彼崾欠窬哂锌寡趸钚?。如圖4 所示,兩種方法測(cè)定顯示含二甲?;野彼岬呐囵B(yǎng)基具有抗氧化活性,而在表達(dá)了空載體的細(xì)胞培養(yǎng)基中沒(méi)有觀察到這種活性。
圖4 二甲基二酪氨酸的抗氧化活性Fig.4 Antioxidant activity of bisformyl dityrosine
孢子具有對(duì)外界環(huán)境的抵抗能力。本研究證實(shí)了孢子的抗氧化性比營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞更強(qiáng)。由于二酪氨酸層的存在,孢子展示出了部分的抗氧化性。根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,可證實(shí)二甲?;野彼釋?duì)強(qiáng)氧化劑有清除能力,因此具有抗氧化活性。在釀酒酵母中異源表達(dá)DIT1,DIT2 和DTR1 可證實(shí)二甲?;野彼釙?huì)分泌到培養(yǎng)基中,也可被用作抗氧化劑。因此,二甲?;野彼岬纳a(chǎn)十分便捷。二甲?;野彼岷玩咦游磥?lái)可以被用作相關(guān)的抗氧化材料。