郭錦翠,張艷艷,楊振邦,牛澤人,張雪梅
(1.華北理工大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,河北 唐山 063000;2.華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,河北 唐山 063000)
腫瘤是全人類面臨的一個巨大公共衛(wèi)生問題,肺 癌在所有惡性腫瘤死因中居首位[1]。腫瘤發(fā)生的主要原因之一是腫瘤對補體監(jiān)視的免疫逃避[2]。膜結(jié)合性補體調(diào)節(jié)蛋白(membrane-bound complement regulatory proteins, mCRPs)在機體內(nèi)能夠與補體相互作用,動態(tài)調(diào)節(jié)補體的激活與抑制,在保護(hù)自身組織的同時還能有效殺滅外來有害成分[3]。CD59作為mCRPs中重要成分之一,與炎癥、創(chuàng)傷及某些腫瘤等疾病有密切的關(guān)系[4-5]。研究表明,CD59在乳腺癌[5-6]、結(jié)腸癌[7]、肺癌組織[8]中顯現(xiàn)出高表達(dá)。
基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism, SNP)是人群中普遍存在的核苷酸改變,而啟動子區(qū)的多態(tài)性影響基因的轉(zhuǎn)錄水平,進(jìn)一步導(dǎo)致蛋白表達(dá)水平的改變,導(dǎo)致腫瘤和疾病的發(fā)生和發(fā)展[9]。本研究旨在探討CD59啟動子區(qū)遺傳變異對基因轉(zhuǎn)錄的影響。
質(zhì)粒pGL3-Basic、pRL-SV40以及雙熒光素酶報告基因檢測、凝膠回收、質(zhì)粒提取試劑盒購自美國Promega公司,LipofectamineTM2000試劑購自美國Invitrogen公司,限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、NheⅠ和連接酶T4 DNA分別購自美國New England Biolabs和日本TaKaRa公司。A549、NCI-H2030、NCI-H23非小細(xì)胞肺癌細(xì)胞株購自美國菌種保藏中心。
1.2.1 啟動子區(qū)SNP篩選 對國際共享數(shù)據(jù)庫Ensembl中基因CD59啟動子區(qū)SNP信息進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,將CD59基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游擴展1 500 bp,篩選出可影響基因轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的SNP位點,規(guī)定在中國人群中的最小等位基因頻率不>0.05,采用轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(www.gene-regulation.com)中的軟件TRANSFAC分析軟件預(yù)測對轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合有影響的SNP位點,最終共篩選出1個SNP位點(CD59 rs79077373)。
1.2.2 CD59啟動子區(qū)報告基因載體構(gòu)建與鑒定 使用Primer Premier 5.0軟件進(jìn)行引物設(shè)計,CD59啟動子區(qū)PCR擴增所用引物序列:正向5'-GGGGTACCCCTC AAGCAACGCAAACTAC-3',反向5'-CTAGCTAGCTA GCCCCCGCATTCTTTCGCT-3'。該PCR產(chǎn)物長2 282 bp(-2 234 bp,+47 bp)引物兩端分別加上酶切位點KpnⅠ、NheⅠ及對應(yīng)的保護(hù)堿基。
調(diào)整PCR儀器反應(yīng)程序,將反應(yīng)體系離心6 s,立即放置到PCR儀,進(jìn)行片段的擴增,一般在94℃的溫度條件下預(yù)變性10 min,然后進(jìn)入循環(huán)擴增階段:第1階段為94℃變性45 s,第2階段為61.5℃退火45 s,第3階段為72℃延伸2 min,這3個階段進(jìn)行35個循環(huán),循環(huán)完成后進(jìn)行10min的72℃延伸。將擴增片段切膠回收,使用KpnⅠ、NheⅠ進(jìn)行雙酶切后與pGL3-Basic報告基因載體進(jìn)行連接。隨后將連接后的產(chǎn)物進(jìn)一步轉(zhuǎn)化成腸桿菌DH5α,接著挑取其中的陽性單克隆,最后進(jìn)行測序的確認(rèn),構(gòu)建完成的質(zhì)粒定點突變由蘇州泓迅生物技術(shù)有限公司完成,根據(jù)測序結(jié)果將重組質(zhì)粒分別標(biāo)記為pGL3-rs79077373C和pGL3-rs79077373T。
1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)及重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染 轉(zhuǎn)染前1天將狀態(tài)良好的A549、NCI-H23和NCI-H2030以每孔2×105個細(xì)胞均勻接種到板中,當(dāng)密度到70%后,根據(jù)使用說明書轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒。質(zhì)粒轉(zhuǎn)染情況為:800 ng的重組質(zhì)粒(pGL3-rs79077373C或pGL3-rs79077373T)和10 ng的內(nèi)參質(zhì)粒pRL-SV40,每組轉(zhuǎn)染質(zhì)粒的細(xì)胞至少設(shè)置3個實驗的復(fù)孔,每次以相同的條件相同的試劑至少重復(fù)3次實驗。培養(yǎng)24 h后,對細(xì)胞進(jìn)行裂解,然后收集細(xì)胞,測定熒光素酶活性。
1.2.4 雙熒光素酶活性檢測 根據(jù)雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒提供的說明書進(jìn)行操作并設(shè)定發(fā)光檢測儀,型號為Glo Max 20/20。600 μl PBS清洗,加100 μl PLB裂解液,室溫下輕搖板15 min,將裂解液移至EP管中,瞬時離心后進(jìn)行進(jìn)一步檢測。EP管中加入50 μl LAR Ⅱ和15 μl裂解產(chǎn)物,F(xiàn)值即Firefly熒光素酶活性應(yīng)被即刻檢測,隨后50 μl 1×Stop &Glo溶液被立即加入到24孔板中,R 值即Renilla熒光素酶活性,計算熒光素酶活性即F值與R值之比。
數(shù)據(jù)分析采用SPSS 18.0統(tǒng)計軟件,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,比較采用t檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
應(yīng)用轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(www.gene-regulation.com)中的軟件TRANSFAC分析預(yù)測CD59 rs79077373 C/T遺傳變異對潛在的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點影響(見圖1)。無轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的情況是當(dāng)該位點為C等位基因時;當(dāng)該位點出現(xiàn)T等位基因,此時存在轉(zhuǎn)錄因子TBP與之結(jié)合。因此采用雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞C預(yù)測結(jié)果,探討生物學(xué)意義。
圖1 生物信息學(xué)預(yù)測rs79077373 C/T對轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的影響
CD59重組質(zhì)粒經(jīng)測序驗證后rs79077373位點為C等位基因,將其命名為pGL3-rs79077373C,利用構(gòu)建好的重組質(zhì)粒將rs79077373位點進(jìn)行定點突變,突變后的重組質(zhì)粒命名為pGL3-rs79077373T。重組質(zhì)粒利用雙酶切后經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行驗證,酶切片段與插入片段長度相符(見圖2A)。重組質(zhì)粒測序結(jié)果利用Blast與NCBI數(shù)據(jù)庫中CD59基因啟動子區(qū)序列進(jìn)行比對,一致性為100%(見圖2B)。
圖2 CD59基因啟動子區(qū)載體構(gòu)建結(jié)果驗證
將 重 組 質(zhì) 粒 pGL3-rs79077373C、pGL3-rs79077373T、空質(zhì)粒pGL3-Basic分別與內(nèi)參質(zhì)粒pRLSV40共 轉(zhuǎn) 染 于 NCI-H2030、NCI-H23、A549 3株非小細(xì)胞肺癌后,熒光素酶活性的表達(dá)情況檢測見圖3。重組質(zhì)粒熒光素酶相對活性經(jīng)對照組校正,每組質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞至少設(shè)置3個復(fù)孔,數(shù)據(jù)由3次獨立重復(fù)實驗得出,用(±s)表示每組數(shù)值。A549細(xì)胞中,pGL3-rs79077373T組的熒光素酶相對活性值為(17.95±0.50),pGL3-rs79077373C組的熒光素酶相對活性值為(8.99±0.56),經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=-20.639,P=0.000),pGL3-rs79077373T組的熒光素酶相對活性值為pGL3-rs79077373C組的2.00倍。NCI-H23細(xì)胞中,pGL3-rs79077373T組的熒光素酶相對活性值為(18.89±1.13),pGL3-rs79077373C組的熒光素酶相對活性值為(10.36±0.44),經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=-12.150,P=0.000),pGL3-rs79077373T 組的熒光素酶相對活性值為pGL3-rs79077373C組的1.82倍。NCIH2030細(xì)胞中,pGL3-rs79077373T組的熒光素酶相對活性值為(6.17±0.71),pGL3-rs79077373C組的熒光素酶相對活性值為(4.36±0.43),經(jīng)t檢驗,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=-3.752,P=0.020),pGL3-rs79077373T組的熒光素酶相對活性值為pGL3-rs79077373C組的1.42倍。
圖3 CD59基因rs79077373報告基因熒光素酶相對活性
CD59又稱保護(hù)素,位于人類11號染色體長臂,其糖基磷脂酰肌醇(GPI)錨定到細(xì)胞膜表面。CD59蛋白的功能突出表現(xiàn)在以下幾個方面:①CD59通過與C8和(或)C9結(jié)合、干擾C9插入細(xì)胞膜內(nèi)或C9的多聚化,進(jìn)而阻斷補體攻膜復(fù)合物(MAC)的裝配,保護(hù)宿主細(xì)胞免于受補體的溶破[10]。②CD59可以作為第二信號刺激物,一方面可以誘導(dǎo)T淋巴細(xì)胞的激活,另外參與免疫反應(yīng)的調(diào)節(jié)過程[11]。③CD59作為CD2的配體能夠與CD2相結(jié)合形成CD59-CD2復(fù)合物,隨后激活T細(xì)胞并且誘導(dǎo)T細(xì)胞及其他組織細(xì)胞的黏附,并進(jìn)一步調(diào)節(jié)組織細(xì)胞的生長[12]。
CD59在腫瘤細(xì)胞中的高表達(dá)可能有助于腫瘤逃避免疫監(jiān)視和補體介導(dǎo)的細(xì)胞溶解。CD59在結(jié)直腸癌中表達(dá)上調(diào),與結(jié)直腸癌的臨床分化和病理分期明顯相關(guān),并且CD59沉默的結(jié)腸癌細(xì)胞會增強對化療藥物的敏感性[7,13]。在乳腺癌研究中,CD59表達(dá)明顯增加并且CD59的缺失可導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞的凋亡,抑制腫瘤細(xì)胞的CD59基因表達(dá)后,F(xiàn)as和Caspase-3的表達(dá)上調(diào)Bcl-2的表達(dá)降低,從而誘發(fā)腫瘤細(xì)胞的凋亡和生長抑制[14]。在CD59與肺癌關(guān)系的研究中[8,15],通過體內(nèi)和體外實驗都發(fā)現(xiàn)CD59在腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)要高于正常肺組織細(xì)胞,補體系統(tǒng)對腫瘤細(xì)胞介導(dǎo)的裂解作用被抑制,CD59的高表達(dá)可能是腫瘤細(xì)胞逃避補體攻擊和抵制單克隆抗體治療肺癌的重要原因,提示CD59是腫瘤發(fā)生及惡性進(jìn)展的主要因素之一。
本研究證實,CD59啟動子區(qū)SNP rs79077373 T等位基因可增加CD59的啟動子區(qū)轉(zhuǎn)錄活性,說明CD59啟動子區(qū)遺傳變異可以在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控其表達(dá),為深入研究CD59基因在腫瘤中高表達(dá)的分子機制奠定了基礎(chǔ)。