王中一 劉慶慧① 黃 倢
(1. 青島海洋科學與技術國家實驗室海洋漁業(yè)科學與食物產(chǎn)出過程功能實驗室 農(nóng)業(yè)部海水養(yǎng)殖病害防治重點實驗室青島市海水養(yǎng)殖流行病學與生物安保重點實驗室 中國水產(chǎn)科學研究院黃海水產(chǎn)研究所 青島 266071;2. 水產(chǎn)科學國家級實驗教學示范中心 上海海洋大學水產(chǎn)與生命學院 上海 201306)
白斑綜合征病毒(WSSV)是水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中主要的病原之一,不僅侵染各種野生及養(yǎng)殖對蝦,而且侵染其他水生甲殼類如蟹類、螯蝦和龍蝦等。該病一旦流行,對蝦在3–7 d內(nèi)的死亡率可達100%,不僅給對蝦養(yǎng)殖造成嚴重的損失,也給海洋生態(tài)平衡帶來一定的威脅(馬曉燕等, 2012)。由于WSSV基因的復雜性,針對WSSV的致病機理及WSSV侵染宿主細胞的途徑尚未得到深入闡釋。
網(wǎng)格重鏈蛋白(Clathrin Heavy Chain, CHC)是網(wǎng)格蛋白的主要成分之一,是進化上保守的大分子蛋白,迄今只在真核生物中發(fā)現(xiàn),包括近端區(qū)、連接區(qū)、腳踝區(qū)、膝彎曲區(qū)、腿遠端區(qū)、腿近端區(qū)和鉸鏈區(qū)。網(wǎng)格重鏈蛋白N端有一個銜接蛋白結(jié)合結(jié)構(gòu)域(TD),通過結(jié)合銜接蛋白連接要運輸?shù)奈镔|(zhì)(Teret al, 1998;Pearseet al, 2000; Zhu, 2015)。網(wǎng)格蛋白具有介導膜蛋白、生長因子、受體、病原體、突觸等物質(zhì)進行內(nèi)吞的作用(Vonet al, 2011)。Royle等(2005)研究表明,在有絲分裂過程中,網(wǎng)格蛋白可與紡錘體結(jié)合,提高紡錘體的穩(wěn)定性,促進染色體的聯(lián)會。另外,網(wǎng)格蛋白可與微管或者微管相關蛋白直接結(jié)合來穩(wěn)定著絲粒。這些研究表明,網(wǎng)格蛋白參與多種細胞生物學過程,對細胞生長發(fā)育、分化和環(huán)境響應具有重要的生物學功能(Royleet al, 2012)。然而,網(wǎng)格蛋白介導的內(nèi)吞途徑是 G蛋白偶聯(lián)受體介導的最主要的經(jīng)典內(nèi)吞途徑,同時也是病毒侵染細胞的主要途徑之一(Liet al, 2016)。Posiri等(2015)研究表明,在敲除斑節(jié)對蝦(Penaeus monodon)的網(wǎng)格重鏈蛋白基因后,延遲了感染黃頭病毒(Yellow Head Virus, YHV)的斑節(jié)對蝦的死亡。黃家駿等(2015)也證明,WSSV是通過網(wǎng)格蛋白介導的內(nèi)吞途徑進入造血組織細胞的。王修芳(2016)首次克隆凡納濱對蝦(Litopenaeus vannamei)網(wǎng)格重鏈蛋白基因,全長5052 bp,編碼1684個氨基酸,含有 clathtin propel repeat、clathrin heavy-chain linker、clathrin-H-link、clathrin heavy chain repeat homology四個結(jié)構(gòu)域,并利用RNA干擾技術可抑制CHC基因的表達,感染W(wǎng)SSV凡納濱對蝦的死亡率明顯降低。
本研究針對凡納濱對蝦網(wǎng)格重鏈蛋白的 2個功能基因,進行重組表達并獲得純化重組蛋白,利用Far-Western技術篩選出能與這 2個功能蛋白相互作用的WSSV蛋白,為探討網(wǎng)格蛋白介導WSSV的侵染提供理論依據(jù),同時也為更加深入全面探索WSSV感染機制和防治措施奠定基礎。
WSSV結(jié)構(gòu)蛋白 VP26、VP28N和 VP37,表達載體pBAD/gⅢA和凡納濱對蝦網(wǎng)格重鏈蛋白重組質(zhì)粒由本實驗室保存;E.coliTop10感受態(tài)細胞購自TIANGEN公司;Taq酶及DNA標準(DNA Marker DL 2000)購自TaKaRa公司;T4 DNA Ligase、限制性內(nèi)切酶NcoⅠ、XbaⅠ及蛋白Marker購自Thermo公司;地高辛(DIG)購自Roche公司;氨芐青霉素(Amp+)、L-阿拉伯糖(L-Arab)、質(zhì)粒小提試劑盒購自 Solarbio公司;膠回收試劑盒購自ZYMO公司。
1.2.1 凡納濱對蝦功能基因LvCHC1和LvCHC2的克隆 根據(jù)LvCHC的2個功能結(jié)構(gòu)域clathtin propel repeat(600~1350 bp、200~450 aa)和 clathrin heavy chain repeat homology(1650~2340 bp、550~780 aa),分別命名為LvCHC1和LvCHC2(圖1),設計2對引物(CIH1s、CIH1a; CIH2s、CIH2a) (表1)。將 LvCHC重組載體保種液取出,在LB(Amp+, 100 μg/ml)固體培養(yǎng)基中劃線,37℃倒置過夜培養(yǎng)。PCR擴增LvCHC1基因和LvCHC2基因,擴增程序:25 μl體系,94℃,預變性 5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s,擴增35個循環(huán);72℃延伸7 min。擴增產(chǎn)物經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳后,分別膠回收,膠回收的方法按照ZYMO公司膠回收試劑盒進行,并用NanoDrop 2000c檢測目的基因LvCHC1和LvCHC2的濃度。
1.2.2 表達載體的構(gòu)建 將pBAD/gⅢA質(zhì)粒和膠回收的2個片段LvCHC1、LvCHC2分別進行NcoⅠ、XbaⅠ雙酶切。酶切效果用1%瓊脂糖凝膠電泳觀察,將電泳條帶切膠回收,并測定核酸濃度。用T4 DNA ligase將目的片段與 pBAD/gⅢA載體連接;取連接產(chǎn)物5 μl加入到50 μl TOP 10感受態(tài)細胞中,冰浴30 min;42℃熱激60 s,將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入感受態(tài)細胞中;加入890 μl LB液體培養(yǎng)基,37℃振蕩培養(yǎng)1 h,使質(zhì)?;謴涂剐裕蝗?100 μl恢復抗性的菌液涂布在LB固體培養(yǎng)基(Amp+, 100 μg/ml)中,37℃倒置培養(yǎng)14 h。挑取單菌落加入LB液體培養(yǎng)基900 μl中(Amp+,100 μg/ml),培養(yǎng)5 h后,以菌液為模板,用pBAD/gⅢA載體通用引物進行菌落 PCR鑒定,將電泳結(jié)果正確的陽性菌液測序。
1.2.3 LvCHC1蛋白和 LvCHC2蛋白的表達 將測序正確的菌液分別按照 1%的比例加入新鮮的 LB液體培養(yǎng)基中(Amp+, 100 μg/ml),過夜培養(yǎng)。然后按照1%的比例將菌液分別加入LB液體培養(yǎng)基(Amp+,100 μg/ml)中擴大培養(yǎng),培養(yǎng)5 h后,加入L-阿拉伯糖(終濃度為 0.2 g/L)誘導蛋白表達,對照組不加 L-阿拉伯糖,4 h后,菌液以10000 r/min離心5 min,用 PBS緩沖液重懸沉淀,超聲破碎儀超聲破碎,將誘導和未誘導菌液分別取適量的上清液和沉淀于 EP管中,沉淀用PBS緩沖液重懸,SDS-PAGE檢測分析。
圖1 凡納濱對蝦網(wǎng)格重鏈蛋白氨基酸序列(摘自王修芳, 2016)Fig.1 Amino acid sequence of LvCHC (By Wang, 2016)
1.2.4 鈷離子柱親和層析純化蛋白 破碎液經(jīng)10000 r/min離心30 min,棄上清液,沉淀用A液(含6 mol/L鹽酸胍)溶解后,于 4℃條件下,10000 r/min離心10 min,收集上清液并分別經(jīng)0.8 μm和0.45 μm濾膜過濾。將樹脂裝入層析柱中,先用 PBS平衡洗柱,用A液將紫外吸收峰洗至0,加入蛋白上清液,混勻后冰浴2 h,再用A液將峰值洗脫至0,然后用150 mmol/L咪唑洗脫,收集重組蛋白,在尿素梯度復性液中復性透析,之后用超濾管進行濃縮,用SDS-PAGE檢驗蛋白純化效果。
表1 引物序列Tab.1 Sequence of primers
1.2.5 DIG標記LvCHC1蛋白和LvCHC2蛋白
用槍頭取少量DIG粉末溶于DMSO中,分別加入純化的 LvCHC1蛋白和 LvCHC2蛋白,旋轉(zhuǎn)混合儀中混勻2 h,4℃ PBS溶液中過夜透析,去除過量的DIG。
1.2.6 Far-Western檢測與 LvCHC1蛋白和 LvCHC2蛋白相互作用的WSSV蛋白 將表達純化的WSSV重組蛋白VP26、VP28N、VP37進行15% SDS-PAGE后,轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,4℃在5% BSA中封閉過夜,PBS-T清洗后分別加入DIG標記的LvCHC1蛋白和LvCHC2蛋白,室溫避光孵育2 h,PBS-T清洗3遍后加入Anti-DIG-AP (1∶3000),室溫避光孵育2 h,PBS-T清洗3遍后用BCIP/NBT顯色液避光顯色。將顯色結(jié)果掃描分析。
利用設計的 ClH1s、ClH1a和 ClH2s、ClH2a兩對特異性引物分別擴增LvCHC1基因和LvCHC2基因,電泳結(jié)果見圖2。前面條帶出現(xiàn)在750 bp左右,與LvCHC1基因750 bp基本相符。后面條帶出現(xiàn)在500 bp和750 bp之間,與LvCHC2基因590 bp基本相符。
圖2 LvCHC1和LvCHC2基因的克隆Fig.2 Cloning of LvCHC1 and LvCHC2
圖3 重組質(zhì)粒菌液PCRFig.3 PCR identification of the recombinant vector
圖4 重組載體菌液PCRFig.4 PCR identification of the recombinant vector
用T4 DNA Ligase將雙酶切后的片段與具有相同粘性末端的pBAD/gⅢA表達載體連接,將構(gòu)建好的表達載體轉(zhuǎn)化到Top 10大腸桿菌感受態(tài)細胞中,經(jīng)Amp+抗性篩選后,挑取單克隆,37℃培養(yǎng) 5 h后,進行菌液PCR鑒定,PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果見圖3和圖4,條帶大小在1000 bp左右,初步斷定為陽性克隆。取陽性克隆菌液測序,經(jīng)過DNAMAN軟件分析,證明重組表達載體序列完全正確,無移碼錯配。
將重組表達載體正確的菌液進行擴大培養(yǎng),經(jīng)L-阿拉伯糖誘導后,將誘導和未誘導的上清液和沉淀分別進行蛋白質(zhì)凝膠電泳(圖5和圖6)。分析圖5發(fā)現(xiàn),誘導上清液和未誘導的上清液蛋白條帶一致,沒有誘導條帶;而誘導沉淀在25~35 kDa之間比未誘導的沉淀多1條蛋白帶(圖中紅色箭頭所指),其條帶大小與LvCHC1理論蛋白分子質(zhì)量26.19 kDa相符,說明該條帶有可能是LvCHC1蛋白。分析圖6發(fā)現(xiàn),誘導上清液和未誘導的上清液蛋白一致,沒有出現(xiàn)誘導條帶;而誘導沉淀在25 kDa左右比未誘導的明顯多1條蛋白帶(圖中紅色箭頭所指),其條帶大小與LvCHC2理論蛋白分子質(zhì)量17.49 kDa相符,說明該條帶有可能是LvCHC2蛋白。將符合目的蛋白的條帶進行蛋白質(zhì)譜分析,經(jīng)驗證發(fā)現(xiàn),LvCHC1蛋白和LvCHC2蛋白表達正確(表2和表3)。2個功能蛋白都出現(xiàn)在誘導的沉淀中,說明2個蛋白為包涵體。
圖5 LvCHC1蛋白的表達Fig.5 The expression of LvCHC1 protein
圖6 LvCHC2蛋白的表達Fig.6 The expression of LvCHC2 protein
表達載體pBAD/gⅢA上帶有6×His標簽,可利用Co2+親和層析法對其進行純化,洗脫液經(jīng)尿素梯度復性后得到正確折疊的蛋白,然后進行 SDS-PAGE檢測分析,結(jié)果顯示,經(jīng)純化的蛋白純度較高,可用于進一步實驗(圖7)。
表2 LvCHC1質(zhì)譜分析結(jié)果Tab.2 MS analysis of LvCHC1 protein
表3 LvCHC2質(zhì)譜分析結(jié)果Tab.3 MS analysis of LvCHC2 protein
圖7 SDS-PAGE分析純化的LvCHC1蛋白和LvCHC2蛋白Fig.7 SDS-PAGE analysis of purified protein LvCHC1 and LvCHC2
將 VP26、VP28N、VP37和蛋白 Marker對稱點樣,轉(zhuǎn)印于PVDF膜上,與DIG標記的LvCHC1蛋白和LvCHC2蛋白作用,圖8顯示,LvCHC1蛋白與VP37和VP26有結(jié)合活性,但與VP26相比,VP37處的條帶結(jié)合較弱。圖9顯示,LvCHC2蛋白與VP37和VP26都有結(jié)合活性,但與VP26相比,VP37處的條帶也較微弱。
網(wǎng)格蛋白是由三個網(wǎng)格重鏈蛋白和三個網(wǎng)格輕鏈蛋白構(gòu)成的,每一個網(wǎng)格重鏈蛋白結(jié)合一個輕鏈蛋白為基本單位組裝成三腳蛋白復合體。本研究根據(jù)凡納濱對蝦網(wǎng)格重鏈蛋白基因,分別設計2對特異性的引物,并克隆它的2個功能基因LvCHC1和LvCHC2,經(jīng)過NcoⅠ、XbaⅠ雙酶切后連接到pBAD/gⅢA載體并轉(zhuǎn)入到 TOP10感受態(tài)細胞中,選擇陽性克隆的菌落通過原核表達獲得 2個功能蛋白即 LvCHC1和LvCHC2,2個蛋白分別經(jīng)過鈷離子柱純化得到純化的目的蛋白,之后應用 Far-Western研究它們分別與WSSV病毒結(jié)構(gòu)蛋白VP26、VP28N和VP37的相互作用。
蛋白檢測表明 LvCHC1蛋白和 LvCHC2蛋白均出現(xiàn)在誘導的沉淀中,屬于包涵體蛋白。Far-Western結(jié)果表明,LvCHC1蛋白和 LvCHC2蛋白與 VP28N都沒有相互結(jié)合的能力,但都能與VP26和VP37相互作用,而且2個蛋白與VP26的結(jié)合力強于與VP37的結(jié)合能力。VP26是WSSV中含量較高的被膜蛋白(Tsaiet al, 2006),可以與囊膜蛋白VP28、核衣殼蛋白VP51結(jié)合,起到連接作用(Changet al, 2008; Wanet al, 2008),重組表達的 VP26與中國明對蝦(Fenneropenaeus chinensis)和螯蝦血細胞都具有結(jié)合作用,經(jīng)質(zhì)譜分析,與VP26有結(jié)合作用的是β-肌動蛋白(Liuet al, 2011; Xieet al, 2005),而 β-肌動蛋白在細胞內(nèi)物質(zhì)和器官運輸過程中起重要作用,并被報道參與到一些病毒的入侵、細胞內(nèi)轉(zhuǎn)運和釋放等過程中,推測其主要在病毒粒子的組裝中發(fā)揮作用,以及病毒進胞后促進其沿著微絲進行遷移(Gouinet al,2005)。而VP37是WSSV病毒的一個重要囊膜蛋白,它含有一個RGD位點,推測其在WSSV感染機制中發(fā)揮重要作用,研究表明,VP37與蝦血細胞和鰓細胞膜蛋白結(jié)合的蛋白為ATP合酶β亞基,推測其可能為VP37在宿主細胞的受體蛋白(Huanget al, 2002;Lianget al, 2005)。根據(jù)實驗結(jié)果可初步推斷WSSV在入侵凡納濱對蝦的細胞時,VP26和 VP37通過與網(wǎng)格重鏈蛋白作用,介導 WSSV進入宿主細胞內(nèi),從而加快了WSSV病毒在宿主體內(nèi)的傳播。
雖然本研究得出網(wǎng)格重鏈蛋白能與 WSSV病毒的VP26和VP37相互作用,但關于網(wǎng)格重鏈蛋白是如何調(diào)控 WSSV入侵凡納濱對蝦等分子機制還沒有闡明,仍需要進一步的研究。
圖8 Far-Western-blot分析LvCHC1與VP26, VP28N及VP37的相互作用Fig.8 Far-Western-blot analysis of LvCHC1 interaction with VP26, VP28N and VP37
圖9 Far-Western-blot分析LvCHC2與VP26,VP28N及VP37相互作用Fig.9 Far-Western-blot detection of LvCHC2 interaction with VP26, VP28N and VP37
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