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    宏基因組文庫新型β-葡萄糖苷酶的篩選、克隆及酶學(xué)性質(zhì)分析

    2018-02-09 00:53:50唐樂麗王曉萌吳秀玲
    食品科學(xué) 2018年4期
    關(guān)鍵詞:文庫糖苷酶克隆

    唐樂麗,王曉萌,吳秀玲,黃 慶,李 荷*

    (廣東藥科大學(xué)藥學(xué)院,廣東 廣州 510006)

    微生物資源在地球上的含量十分豐富,其中原核細(xì)胞數(shù)量和種類高達(dá)到6×1030~8×1030個[1],微生物具有的多樣性特質(zhì),為挖掘新酶、新的代謝物質(zhì)和生物活性物質(zhì)提供了一種新來源[2]。然而Bakken等[3]研究發(fā)現(xiàn),自然界中高達(dá)99%的微生物是未培養(yǎng)微生物,即在目前的實驗環(huán)境下是不能被培養(yǎng)生長的,如果利用傳統(tǒng)培養(yǎng)微生物學(xué)的方法,只能獲得地球上極少數(shù)微生物的活性物質(zhì),從而興起了宏基因組技術(shù),1985年,Pace等通過提取環(huán)境微生物總DNA法,成功研究了大量未培養(yǎng)微生物所攜帶的遺傳學(xué)信息,這之后,許多研究者都通過此方法對未培養(yǎng)微生物進(jìn)行了研究[4-5]。

    β-葡萄糖苷酶(β-D-glucosidase,EC3.2.1.21),屬于纖維素酶類,是3 種纖維素分解酶中的重要組成成分之一,它能夠水解結(jié)合于末端非還原性的β-D-葡萄糖鍵,同時釋放出β-D-葡萄糖和相應(yīng)的配基。β-葡萄糖苷酶有較廣泛的工業(yè)應(yīng)用,可用來降解纖維素[6-8]生產(chǎn)生物乙醇、改善食品風(fēng)味、轉(zhuǎn)化大豆異黃酮糖苷化合物、制備低聚龍膽糖、防治病蟲害[9-11]等。但目前工業(yè)用β-葡萄糖苷酶多數(shù)來源于木霉等真菌及茶樹類植物[12-13],反應(yīng)條件(如溫度、pH值)適應(yīng)范圍相對較窄,且酶活力偏低,造成經(jīng)濟(jì)成本較高,制約β-葡萄糖苷酶的廣泛應(yīng)用[14-15]。而且生物酶應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn)的條件比較苛刻,要求生物酶具有良好的熱穩(wěn)定性、有機(jī)溶劑耐受性、金屬離子耐受性以及在特定pH值、溫度條件下的高酶活力,因此需要發(fā)掘酶學(xué)性質(zhì)更加優(yōu)良的β-葡萄糖苷酶來提高工業(yè)生產(chǎn)效率,降低生產(chǎn)成本。宏基因組技術(shù)研究對象是微生物總DNA并獨(dú)立于宿主之外進(jìn)行研究,所獲得的新基因一般都較完整,相似度也較低,可以用來大量篩選新的有開發(fā)前景的工業(yè)酶[16-18]。黑龍江玉米秸稈還田土壤中纖維素資源豐富,可能含有能夠產(chǎn)生酶活力較高的β-葡萄糖苷酶微生物。本研究以黑龍江玉米秸稈還田土壤微生物為對象,構(gòu)建其宏基因組文庫,利用功能篩選方法,擬從文庫中篩選具有酶活力較高的新型β-葡萄糖苷酶基因并對其酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行分析。

    1 材料與方法

    1.1 材料與試劑

    土樣采自黑龍江省牡丹江市郊區(qū)玉米秸稈還田土壤,采集表層下10~20 cm的土樣,-20 ℃保存。Escherichia coli DH5α、E. coli BL21由本實驗室保存。建庫所用載體質(zhì)粒pUC118、pET-32a(+)購自大連TaKaRa公司。

    XhoⅠ、EcoRⅠ等限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶以及各種DNA MarkerPrime、STARTMMax Premix、蛋白質(zhì)分子質(zhì)量Marker 大連TaKaRa公司;DNA凝膠回收試劑盒(E.Z.N.A?Gel Extraction Kit)、質(zhì)粒提取試劑盒(E.Z.N.A?Plasmid Mini Kit)、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)產(chǎn)物回收試劑盒(E.Z.N.A?Cycle-Pure Kit) 美國Omega公司;氨芐青霉素(ampicillin,Amp)、5-溴-4-氯-3-吲哚-α-D-半乳糖苷(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-α-D-galactopyranoside,X-gal)、異丙基-β-D-硫代吡喃半乳糖苷(isopropylβ-D-1-thiogalactopyranoside,IPTG) 美國Sigma公司;七葉苷、對硝基苯酚(p-nitrophenol,pNP),對硝基苯基-β-D-吡喃葡萄糖苷(p-nitrophenyl-β-D-glucopyranoside,pNPG) 生工生物工程(上海)有限公司;其他化學(xué)試劑均為國產(chǎn)分析純。

    1.2 儀器與設(shè)備

    凝膠成像系統(tǒng) 美國BioTek公司;電泳儀 北京六一儀器公司;PCR儀 美國AB公司;恒溫水浴鍋上海精密實驗設(shè)備公司;電擊儀 美國Bio-Rad公司;Nanodrop2000c超微量紫外-可見光分光光度計 賽默飛世爾科技公司;PB-10型pH計 德國Sartorius公司。

    1.3 方法

    1.3.1 玉米秸稈還田土壤基因組總DNA的提取[19]及純化

    取4 個高壓滅菌后的50 mL離心管,稱取玉米土壤樣品,每管6 g,各加DNA 提取緩沖液13.5 mL,渦旋振蕩混勻后,放搖床220 r/min、37 ℃活化30 min。各管加1.5 mL質(zhì)量濃度20 g/100 mL 的十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS),使其終質(zhì)量濃度達(dá)到2 g/100 mL。在65 ℃水浴鍋中水浴2 h,每隔30 min上下輕輕顛倒數(shù)次混勻。25 ℃、6 000 r/min離心10 min。將上清液轉(zhuǎn)移至高壓滅菌的50 mL高速離心管,加入等體積的氯仿-異戊醇(24∶1)混合液,上下輕輕顛倒混勻。25 ℃、11 000 r/min離心30 min。收集上清液,加入0.6 倍體積的異丙醇上下輕輕顛倒混勻,室溫靜置3 h以上。25 ℃、11 000 r/min離心30 min。棄上清液,用4 ℃預(yù)冷的75%乙醇溶液洗滌沉淀1 次。4 ℃、8 000 r/min離心10 min,棄上清液,放入60 ℃烘箱烘干。每管加0.2 mL 65 ℃預(yù)熱的ddH2O,并65 ℃溫浴5 min,溶解基因組DNA。1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測提取的基因組DNA,并立即純化回收基因組DNA。提取的粗基因組DNA用1.0%的瓊脂糖進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,使用Omega的DNA Extraction Kit回收并純化所提取的玉米土壤基因組DNA。

    1.3.2 玉米秸稈還田土壤宏基因組文庫的構(gòu)建

    選擇EcoRⅠ酶對提取純化的玉米土壤DNA進(jìn)行不完全酶切80 min,回收2.3~8 kb的DNA片段。將回收的酶切DNA片段連接到線性化的經(jīng)EcoRⅠ酶切的克隆載體上,用TaKaRa T4 DNA Ligase于16 ℃連接12~16 h。對連接產(chǎn)物進(jìn)行純化:取出DNA酶切片段與載體的連接產(chǎn)物,加入2.5 倍體積-20 ℃提前預(yù)冷的無水乙醇和0.05 倍體積的3 mol/L乙酸鈉輕輕混勻,-20 ℃沉淀1 h以上;4 ℃、12 000 r/min離心20 min;棄上清液,用-20 ℃預(yù)冷的70%乙醇溶液輕輕洗滌沉淀2 次。4 ℃、12 000 r/min離心20 min,收集管中沉淀,60 ℃烘箱中烘干;加入10 μL 65 ℃預(yù)熱的dd H2O重懸連接的載體DNA。將純化的連接產(chǎn)物的電擊轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)入大腸桿菌E. coli DH5α感受態(tài)細(xì)胞。取適量培養(yǎng)物涂布于LAXI培養(yǎng)基(100 mg/L Amp、20% IPTG和20 mg/L X-gal),37 ℃培養(yǎng)過夜,即得玉米土壤宏基因組文庫。

    1.3.3 土壤宏基因組文庫β-葡萄糖苷酶的篩選

    挑選白色菌落,剔除藍(lán)色菌落,點(diǎn)到β-葡萄糖苷酶篩選培養(yǎng)(100 μg/mL Amp、0.25%檸檬酸鐵銨、0.1%七葉苷)平板上,37 ℃培養(yǎng)24 h,觀察菌落周圍是否有黑色水解圈,有黑色水解圈的菌落為β-葡萄糖苷酶陽性克隆子[20]。

    1.3.4 測序及序列的生物信息學(xué)分析

    1.3.4.1 ORF Finder

    挑選轉(zhuǎn)化后仍然具有黑色透明圈的克隆子,提取質(zhì)粒,EcoRⅠ單酶切,若仍舊能夠切出載體和目的DNA條帶,則將重組質(zhì)粒送到Invitrogen公司進(jìn)行序列測定。將測序得到的目的DNA序列用NCBI的ORF Finder在線工具查找該序列的開放閱讀框(open reading frame,ORF),再將ORF序列經(jīng)pBlast逐一比對,得到序列與已報道的功能蛋白的相似度等信息。

    1.3.4.2 系統(tǒng)發(fā)育樹和氨基酸保守性分析[21-22]

    將疑似功能蛋白的基因與已報道的該蛋白各家族成員序列先用Clustal W軟件比對序列并導(dǎo)出序列對比結(jié)果,再用MEGA 4.0軟件中Unrooted Neighbor-Joining Method,the Bootstrap Test選擇(1000 replicates)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,得到基因的種屬信息和與已報道基因的親緣關(guān)系。

    1.3.4.3 等電點(diǎn)、信號肽等性質(zhì)分析

    用在線分析軟件ExPASy ProtParam tool(http://web.expasy.org/protparam/)分析氨基酸等電點(diǎn)、半衰期、分子質(zhì)量、不穩(wěn)定系數(shù)和親疏水性等。用TMHMM 2.0和SignalP 4.1 servers,分析氨基酸的跨膜區(qū)和信號肽序列。用SOPMA預(yù)測蛋白的二級結(jié)構(gòu)。

    1.3.5 bgl2238基因的PCR擴(kuò)增與重組菌株的表達(dá)

    根據(jù)測序結(jié)果設(shè)計一對引物:bgl2238-F和bgl2238-R,引物兩端引入EcoRⅠ和XhoⅠ酶切位點(diǎn),引物序列如下:bgl2238-fw:5′-CCGGAATTCATGAAAC ACATCCTAAACCTATGCC-3′(下劃線部分為EcoRⅠ酶切位點(diǎn));bgl2238-rv:5′-CCGCTCGAGTTATCGTACG CTAAAAGTAAGGGCTTC-3′(下劃線部分為XhoⅠ酶切位點(diǎn))。引物由Invitrogen公司合成;以包含pUC118-bgl2238的質(zhì)粒為模板,采用Prime STARTMMax Premix進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR回收試劑盒對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化回收。

    分別用XhoⅠ和EcoRⅠ將純化后的PCR產(chǎn)物和載體pET-32a(+)進(jìn)行雙酶切,用PCR回收試劑盒純化雙酶切產(chǎn)物,采用T4 DNA Ligase對雙酶切處理的pET-32a(+)及PCR產(chǎn)物16 ℃連接12~16 h,直接轉(zhuǎn)化E. coli BL21(DE3)。隨機(jī)挑取轉(zhuǎn)化子經(jīng)培養(yǎng)后,提取其質(zhì)粒并雙酶切驗證。挑取酶切驗證正確的轉(zhuǎn)化子于37 ℃搖床中培養(yǎng),當(dāng)OD值達(dá)到0.8左右時,加入IPTG,使其終濃度為1.0 mmol/L,25 ℃誘導(dǎo)表達(dá)11 h,收集菌體,超聲破碎菌體后得粗酶液。粗酶液采用His·Bind?Resin試劑盒進(jìn)行純化。

    1.3.6 β-葡萄糖苷酶活力的測定

    將重組菌株接種于裝有20 mL LB液體培養(yǎng)基中,25 ℃、220 r/min培養(yǎng)11 h,取菌液3 mL,6 000 r/min離心20 min,棄上清液,用冰預(yù)冷的無菌dd H2O洗滌沉淀兩次,再用4 mL dd H2O重懸細(xì)胞沉淀,超聲波破碎菌液直至變清,即為粗酶液。取10 μL一定稀釋倍數(shù)的粗酶液、80 μL最適pH值的B-R緩沖液、50 mmol/L的pNPG 10 μL混合,最適溫度下水浴20 min,取200 μL 1 mol/L Na2CO3溶液終止酶促反應(yīng),取上述混合物200 μL,測定OD405nm。一個酶活力單位(U)定義為每分鐘分解pNPG產(chǎn)生1 μmol pNP所需的酶量。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 玉米秸稈還田土壤總DNA的提取及純化

    圖1 土壤基因組DNA的瓊脂糖電泳分析Fig. 1 Agarose gel electrophoresis of soil genomic DNA

    通過直接提取法獲得玉米秸稈還田土壤基因組DNA,結(jié)果如圖1所示,基因大小片段集中在15 kb以上,大約是23~30 kb之間,拖尾現(xiàn)象不明顯,只有極少量DNA被降解,表明直接提取法獲得的基因組DNA質(zhì)量非常好,滿足建庫的需要。

    2.2 土壤宏基因組文庫的評估

    將擴(kuò)大酶切后的土壤基因組DNA與載體連接,電擊轉(zhuǎn)化入大腸桿菌E. coli DH5α,構(gòu)建宏基因組文庫,隨機(jī)挑取16 個白色克隆子,EcoRⅠ酶切驗證插入片段的大小,有14 個克隆子含有不同插入片段,文庫陽性克隆率較高,重組率為87.5%,文庫插入片段大小0.8~8.0 kb,該文庫含有大約5 500 個陽性克隆子,其插入片段平均長度在4.5 kb左右,片段特異性較好。

    2.3 土壤宏基因組文庫中β-葡萄糖苷酶的篩選

    利用底物七葉苷功能篩選法,對宏基因組文庫進(jìn)行初步篩選,從構(gòu)建的宏基因組文庫5 500 個克隆子中,發(fā)現(xiàn)1 個克隆子在七葉苷平板上有黑色水解圈,初步確定其具有β-葡萄糖苷酶活性,編號為44號克隆子,如圖2所示。后期通過提質(zhì)粒、酶切驗證后送Invitrogen公司測序。

    圖 2β-葡萄糖苷酶陽性克隆子的篩選Fig. 2 Screening of positive clones with β-glucosidase activity

    2.4 測序及生物信息學(xué)分析

    2.4.1 NCBI的ORF Finder

    將44號克隆子的質(zhì)粒送交Invitrogen公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果顯示44號克隆子基因序列全長為2 470 bp。利用NCBI網(wǎng)站中Sequence Analysis的在線查找工具ORF Finder(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)對此序列進(jìn)行ORF查找,從2 470 bp的插入片段中發(fā)現(xiàn)一個β-葡萄糖苷酶編碼基因的ORF序列,該ORF基因序列全長2 238 bp,編碼745 個氨基酸,基因命名為bgl2238,預(yù)測其蛋白分子質(zhì)量為80.67 kDa,序列已提交至NCBI核酸數(shù)據(jù)庫(GenBank),登錄號為KU320675。經(jīng)NCBI的BlastP在線序列比對分析,發(fā)現(xiàn)bgl2238基因序列所編碼的蛋白bgl2238含有GH3超家族和GH3C超家族的結(jié)構(gòu)域(圖3),其與來源于Bacteroides thetaiotaomicron的β-葡萄糖苷酶(GenBank:WP_048691945.1)具有58%的相似性。

    圖3 推測的bgl2238的保守序列區(qū)域Fig. 3 Putative conserved domains of bgl2238

    2.4.2 系統(tǒng)發(fā)育樹

    使用生物信息學(xué)軟件Clustal W和MEGA 4.0對bgl2238與親源性較近的蛋白質(zhì)進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建,結(jié)果如圖4所示,可以看出,bgl2238與來源于Alistipes CAG: 435和未培養(yǎng)微生物(登錄號:AAZ32298.1)的β-葡萄糖苷酶親緣關(guān)系較近,與其他來源的β-葡萄糖苷酶親緣關(guān)系都較遠(yuǎn)。

    圖4 bgl2238與親緣性較近蛋白的系統(tǒng)發(fā)育分析Fig. 4 Phylogenetic analysis of bgl2238

    2.4.3 bgl2238的氨基酸序列、二級結(jié)構(gòu)分析

    用生物信息學(xué)方法預(yù)測bgl2238的蛋白分子質(zhì)量、等電點(diǎn)PI、半衰期、不穩(wěn)定系數(shù)和親疏水性等基本理化性質(zhì)、氨基酸跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽序列見表1,信號肽序列分析結(jié)果見圖5,二級結(jié)構(gòu)見圖6。

    表1 bgl2238的氨基酸性質(zhì)分析Table1 Amino acid properties of bgl2238

    由表1可知,bgl2238的pI值為4.95,屬酸性蛋白質(zhì),蛋白結(jié)構(gòu)較穩(wěn)定,疏水性高,位于細(xì)胞膜外且無信號肽序列。

    圖5 預(yù)測的蛋白bgl2238信號肽分析Fig. 5 Signal peptide analysis prediction of protein bgl2238

    圖6 預(yù)測蛋白bgl2238的二級結(jié)構(gòu)Fig. 6 Secondary structure prediction of protein bgl2238

    不同的mRNA結(jié)構(gòu)可能編碼不同的蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu),翻譯慢的mRNA區(qū)域傾向于編碼β折疊、無規(guī)則卷曲結(jié)構(gòu),翻譯快的mRNA區(qū)域更傾向于編碼α螺旋結(jié)構(gòu)。由圖6可知,bgl2238的二級結(jié)構(gòu)中,α螺旋結(jié)構(gòu)占37.05%,無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)為49.93%,延伸片層結(jié)構(gòu)占13.02%,說明蛋白bgl2238的mRNA翻譯較快。

    2.5 bgl2238基因克隆與表達(dá)

    圖7 基因bgl2238的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig. 7 Amplified products of gene bgl2238

    以pUC118-bgl2238重組質(zhì)粒為模板,以bgl2238-F和bgl2238-R為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到一條非常明顯的DNA條帶,大小位于2 000~3 000 bp之間,與預(yù)期基因大小2 238 bp一致(圖7)。重組質(zhì)粒pET-32a(+)-bgl2238直接化轉(zhuǎn)E .coli BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,對重組菌株誘導(dǎo)表達(dá)得粗酶液。對粗酶液進(jìn)行純化,進(jìn)行SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,在大約100 kDa處出現(xiàn)了目標(biāo)條帶(圖8),與理論計算得到β-葡萄糖苷酶分子質(zhì)量大?。?0.67 kDa)加上分子標(biāo)簽(18.15 kDa)相符合。

    圖8 bgl2238蛋白純化SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳圖Fig. 8 SDS-PAGE analysis of recombinant bgl2238

    2.6 β-葡萄糖苷酶bgl2238酶學(xué)性質(zhì)分析

    2.6.1 pH值對酶活力及穩(wěn)定性的影響

    圖9 pH值對β-葡萄糖苷酶bgl2238活力及穩(wěn)定性的影響Fig. 9 Effect of pH value on the activity and stability of β-glucosidase bgl2238

    保持反應(yīng)溫度為44℃,不同pH值緩沖液中(1.98、2.87、4.10、5.02、6.09、6.59、7.0、7.54、7.96、8.95、9.91、10.88、11.82),測定β-葡萄糖苷酶bgl2238活力,獲得一級pH值梯度下的最適pH值范圍后,將pH值梯度進(jìn)一步縮小,以最終獲得酶最適反應(yīng)pH值。將經(jīng)pH 2.0~12.0緩沖液稀釋的粗酶液4 ℃放置4 h后,測定剩余酶活力。將最適pH值下未經(jīng)4 h孵育的最高酶活力定義為100%。結(jié)果如圖9所示,bgl2238酶的最適反應(yīng)pH值為6.10,用pH 6.09~6.59緩沖液處理粗酶液4 h后仍能保持60%以上的酶活力,酶促反應(yīng)的pH值范圍較窄,在偏酸和偏堿性環(huán)境下bgl2238的酶活性和穩(wěn)定性都很低,表明bgl2238屬于一種偏中性酶。

    2.6.2 溫度對酶活力及穩(wěn)定性的影響

    于最適pH值的B-R緩沖液中,分別置于4、15、30、40、45、50、60、70 ℃和80 ℃水浴中進(jìn)行酶活力測定,獲得一級溫度梯度下的最適溫度范圍,再將溫度梯度進(jìn)一步縮小,以獲得酶最適反應(yīng)溫度。將適當(dāng)稀釋的粗酶液分別放于4~80 ℃不同水浴中保溫4 h,測定剩余酶活力。以未經(jīng)熱處理(4 ℃)的酶液的酶活力定為100%。結(jié)果如圖10所示,bgl2238酶促反應(yīng)的最適溫度為44 ℃,在32~44 ℃范圍內(nèi),酶活力隨溫度的升高而增大,44 ℃后,酶活力隨溫度上升而急劇下降,至60 ℃時bgl2238完全失活;在4~50 ℃之間不同溫度下熱處理bgl2238 4 h,發(fā)現(xiàn)bgl2238仍保留70%以上的酶活力,表明β-葡萄糖苷酶活力在50 ℃以下穩(wěn)定性良好。在44 ℃、pH 6.10時bgl2238酶活力最高,計算其酶活力為29.1 U/mg。

    圖10 溫度對β-葡萄糖苷酶bgl2238活力及穩(wěn)定性的影響Fig. 10 Effect of temperature on the activity and stability of β-glucosidase bgl2238

    2.6.3 金屬離子對酶活力的影響

    在80 μL含金屬離子終濃度分別為1 mmol/L或10 mmol/L的最適pH值緩沖液中加入10 μL經(jīng)稀釋的粗酶液,4 ℃放置4 h后,于最適溫度條件下測定剩余酶活力。將未加金屬離子的酶促反應(yīng)中酶活力定義為100%。如圖11所示,不同濃度的K+、Na+、Fe2+、Mg2+、Mn2+、Ca2+、Co2+和Ni2+對酶活力均有促進(jìn)作用,其中Fe2+對bgl2238酶活力的促進(jìn)作用最大,10 mmol/L Fe2+使相對酶活力高達(dá)260%,增加至酶的原始活性的2 倍多,而重金屬離子Ag+、Hg2+及Cu2+對酶活力有強(qiáng)烈抑制作用。

    圖11 金屬離子對β-葡萄糖苷酶bgl2238活性的影響Fig. 11 Effect of metal ions on the activity of β-glucosidase bgl2238

    2.6.4 β-葡萄糖苷酶bgl2238酶促動力學(xué)分析

    以pNPG為底物,將粗酶液稀釋50 倍,利用Lineweaver-Burk雙倒數(shù)法測定bgl2238的米氏常數(shù),以1/V為縱坐標(biāo)、1/[S]為橫坐標(biāo)作圖,曲線與x軸相交的點(diǎn)為-1/Km,與y軸相交的點(diǎn)為1/Vmax。結(jié)果如圖12所示,β-葡萄糖苷酶bgl2238以pNPG為底物時,Vmax=576 μmoL/(L·min),Km= 0.296 mmol/L。

    圖12 β-葡萄糖苷酶bgl2238以pNPG為底物的動力學(xué)參數(shù)Fig. 12 Lineweaver-Burk plot for β-glucosidase bgl2238 with pNPG as substrate

    3 結(jié) 論

    宏基因組技術(shù)通過基因克隆、序列篩選或者功能篩選法、基因表達(dá)等手段,避開了絕大多數(shù)微生物難以分離培養(yǎng)的問題,為挖掘新型生物催化劑開辟了新途徑[23-29]。本研究篩選到的β-葡萄糖苷酶bgl2238經(jīng)測定,最適pH值為6.10,用pH 6.09~6.59緩沖液處理粗酶液4 h后仍能保持60%以上的酶活力,表明bgl2238屬于一種偏中性酶,在生產(chǎn)過程中只需保持酶促反應(yīng)的pH值在中性附近即可,對生產(chǎn)設(shè)備的酸堿度耐受性要求低,節(jié)約成本。β-葡萄糖苷酶bgl2238最適溫度為44 ℃,當(dāng)酶促反應(yīng)溫度升高到50 ℃時,相對酶活力不足40%,說明此酶不耐高溫。不同的金屬離子影響酶的活性,目前大約35%已知酶在金屬離子存在下活性增加[30-31],金屬離子通過與帶負(fù)電的氨基酸殘基結(jié)合而增加酶結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。本研究中不同濃度的幾種金屬離子對β-葡萄糖苷酶bgl2238活力均有激活作用,其中Fe2+對酶活力的促進(jìn)作用最大,10 mmol/L Fe2+使相對酶活力高達(dá)260%,增加至酶的原始活性的2 倍多,利用β-葡萄糖苷酶bgl2238這一特性,向酶促反應(yīng)體系中加入適當(dāng)濃度的K+、Na+、Fe2+可以明顯提升bgl2238的酶活力,從而避免某些酶因嚴(yán)重依賴一些金屬離子(如Mg2+、Mn2+、Cu2+、Ca2+、Co2+、Zn2+和Ni2+等)而造成的金屬環(huán)境污染。為使得bgl2238能夠更好、更廣泛地應(yīng)用于工業(yè)生產(chǎn),后期可通過易錯PCR對β-葡萄糖苷酶bgl2238進(jìn)行改造并構(gòu)建突變文庫,以期獲得對溫度和pH值耐受性更好的酶。

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