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    嗜酸乳桿菌ATCC4356分選酶A基因克隆、表達(dá)及功能分析

    2018-02-09 01:03:16王文文熊蓉露潘道東曾小群郭宇星
    食品科學(xué) 2018年4期
    關(guān)鍵詞:查爾乳酸菌位點(diǎn)

    吳 京,王文文,熊蓉露,吳 振,*,潘道東,,*,曾小群,郭宇星

    (1.寧波大學(xué) 浙江省動(dòng)物蛋白食品精深加工技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 寧波 315211;2.南京師范大學(xué)金陵女子學(xué)院,江蘇 南京 210097)

    革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的表面蛋白可以使細(xì)菌黏附于一些細(xì)胞和組織表面,這種機(jī)制可以促使細(xì)菌成功定殖于機(jī)體內(nèi)并逃避宿主的免疫監(jiān)視[1]。部分表面蛋白發(fā)揮作用之前需要分選酶A(sortase A,SrtA)的參與,它可以識(shí)別表面蛋白特定的LPXTG序列(X表示任意一種氨基酸),并將表面蛋白在蘇氨酸(T)和甘氨酸(G)之間切開(kāi),使表面蛋白錨定在細(xì)胞壁上[2-3]。

    分選酶是一種膜結(jié)合類(lèi)的轉(zhuǎn)肽酶,很多表面蛋白發(fā)揮功能之前都需要分選酶的參與。目前為止發(fā)現(xiàn)的6 種分選酶中,SrtA可以識(shí)別LPXTG等序列,使表面蛋白正常發(fā)揮功能[4];可催化細(xì)菌的多種黏附素或毒力因子錨定在細(xì)胞壁表面,在致病菌入侵宿主細(xì)胞的過(guò)程中發(fā)揮著重要作用[5-6]。在對(duì)多種革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的SrtA基因進(jìn)行敲除后發(fā)現(xiàn),SrtA缺陷菌株生理狀況沒(méi)有明顯變化,但對(duì)宿主細(xì)胞的黏附作用大幅下降,從而很大程度上降低了病原菌的致病性[7-8]。

    相較于其他革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌,乳酸菌的分選酶及表面蛋白沒(méi)有毒性,因此其分選酶錨定機(jī)制被認(rèn)為是比較安全的。研究發(fā)現(xiàn),乳酸菌SrtA在細(xì)菌黏附過(guò)程中同樣扮演著重要角色。Malik等[9]研究了植物乳桿菌CMPG5300對(duì)陰道上皮細(xì)胞的黏附,結(jié)果發(fā)現(xiàn),CMPG5300 SrtA基因被敲除后,自身的聚集效應(yīng)明顯降低,同時(shí)對(duì)陰道上皮細(xì)胞的黏附作用也會(huì)減弱,而對(duì)SrtA缺陷菌株進(jìn)行基因回補(bǔ)后,CMPG5300對(duì)細(xì)胞的黏附能力又有所回升,表明乳酸菌SrtA同樣會(huì)影響它對(duì)宿主細(xì)胞的黏附;SrtA基因的缺失也會(huì)影響其他基因的表達(dá),并影響乳酸菌細(xì)胞膜的形成。

    乳酸菌SrtA可以識(shí)別多種表面蛋白,并介導(dǎo)乳酸菌對(duì)腸道細(xì)胞的黏附,抑制病原菌的入侵[10-11]。雖然這些表面蛋白與腸道細(xì)胞的結(jié)合位點(diǎn)尚不明確,但可以肯定的是,乳酸菌的表面蛋白可以抑制病原菌對(duì)腸道細(xì)胞的黏附,并提高乳酸菌在腸胃中的存活率;表面蛋白與腸道細(xì)胞受體結(jié)合還可以刺激免疫細(xì)胞的增殖,增強(qiáng)人體免疫力[12-13];乳酸菌SrtA也有望被開(kāi)發(fā)為一種蛋白質(zhì)連接工具[14]。因此,對(duì)乳酸菌SrtA的研究有助于進(jìn)一步探究表面蛋白的具體功能,揭示乳酸菌的益生機(jī)理。

    目前為止,對(duì)SrtA的研究主要集中在致病菌及其抑制物的開(kāi)發(fā)上[15-17],雖然獲得了諸多成果,但它們對(duì)分選酶家族的廣譜抑制效應(yīng)尚少見(jiàn)研究。乳酸菌作為人體腸道中的優(yōu)勢(shì)菌群,鮮有文獻(xiàn)報(bào)道這些抑制劑對(duì)乳酸菌SrtA的影響。本研究擬利用pET28a(+)載體對(duì)Lactobacillus acidophilus ATCC4356的SrtA進(jìn)行異源表達(dá),并分析其酶學(xué)特性,期望獲得具有活性的SrtA,驗(yàn)證分選酶抑制劑對(duì)乳酸菌SrtA的抑制作用,為提高乳酸菌分選酶的催化效率以及為后續(xù)分選酶抑制劑的篩選奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    L. acidophilus ATCC4356、pET28a(+)為本實(shí)驗(yàn)室保存;熒光多肽Dabcyl-QALPTTGEE(Edans)由上海強(qiáng)耀生物科技有限公司合成;大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞Trans1-T1、Transetta(DE3)、克隆載體pEASY-Blunt Zero、親和層析柱Ni-NTA Resin 北京全式金生物技術(shù)有限公司;高保真DNA聚合酶、限制性?xún)?nèi)切酶、T4 DNA連接酶 日本TaKaRa公司;查爾酮 天津一方科技有限公司。

    1.2 儀器與設(shè)備

    INFINITE M200 PRO酶標(biāo)儀 瑞士TECAN公司;H2500R-2、H-2050R低溫離心機(jī) 長(zhǎng)沙湘儀離心機(jī)儀器有限公司;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀 美國(guó)Labnet公司;超聲波細(xì)胞粉碎機(jī) 寧波新芝生物科技股份有限公司;Universal HoodⅡ凝膠成像分析系統(tǒng) 美國(guó)Bio-Rad公司;Mini Drop超微量分光光度計(jì) 依科賽生物科技有限公司;MC99-3自動(dòng)液相分離層析儀 上海滬西分析儀器廠(chǎng)有限公司。

    1.3 方法

    1.3.1 嗜酸乳桿菌SrtA基因的克隆及鑒定

    表1 PCR引物序列Table1 Sequences of primers used for PCR

    使用信號(hào)肽分析軟件SignaIP分析SrtA的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)L. acidophilus ATCC4356 SrtA(Lap-SrtA)存在一個(gè)信號(hào)肽剪切位點(diǎn),位于第48個(gè)氨基酸處。根據(jù)分析結(jié)果,如表1所示,設(shè)計(jì)引物SrtAΔN48-F、SrtAΔN48-R去除Lap-SrtA N端48 個(gè)氨基酸,以XhoⅠ和BamHⅠ作為酶切位點(diǎn),通過(guò)PCR克隆得到目的基因SrtAΔN48,用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR結(jié)果。PCR程序:98 ℃預(yù)變性4 min;98 ℃ 10 s,58 ℃ 5 s,72 ℃ 1 min,30 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。

    PCR產(chǎn)物割膠回收后與Blunt Zero克隆載體連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌Trans1-T1感受態(tài)細(xì)胞,卡納霉素篩選轉(zhuǎn)化子,雙酶切驗(yàn)證,并送至上海桑尼生物技術(shù)有限公司測(cè)序。

    1.3.2 重組原核表達(dá)載體的構(gòu)建

    用BamH I和Xho I分別雙酶切Blunt Zero-SrtAΔN48和完整質(zhì)粒pET28a(+),瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)酶切效果,然后割膠回收目的基因SrtAΔN48和被切開(kāi)的載體pET28a(+)。用T4 DNA連接酶連接pET28a(+)與SrtAΔN48,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入大腸桿菌Transetta(DE3),卡那霉素篩選轉(zhuǎn)化子。并通過(guò)雙酶切、測(cè)序等獲取重組表達(dá)載體pET28a-SrtAΔN48。

    1.3.3 重組載體在大腸桿菌中的誘導(dǎo)表達(dá)

    將含有重組表達(dá)載體pET28a-SrtAΔN48的大腸桿菌接種于卡那霉素質(zhì)量濃度為100 mg/mL的LB肉湯培養(yǎng)基中,37 ℃ 180 r/min 搖床培養(yǎng)至600 nm波長(zhǎng)吸光度約為0.6,加入異丙基硫代半乳糖苷(isopropyl β-D-thiogalactoside,IPTG)至終濃度為0.4 mmol/L,25 ℃繼續(xù)培養(yǎng)16 h,同時(shí)以未加IPTG的培養(yǎng)物作為對(duì)照。誘導(dǎo)結(jié)束后,5 000 r/min離心收集菌體,用0.01 mol/L PBS緩沖液重懸,超聲波破碎細(xì)菌,10 000 r/min離心30 min,收集上清液,利用Ni-NTA親和層析柱純化目的蛋白,然后進(jìn)行十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠蛋白電泳分析,確定蛋白表達(dá)情況。

    1.3.4 重組蛋白的活性測(cè)定

    分選酶活性測(cè)定選用Dabcyl-QALPTTGEE(Edans)熒光多肽,分選酶可以識(shí)別LPTTG序列,并在T與G之間切割肽鍵,使熒光基團(tuán)Edans脫落并發(fā)出熒光,通過(guò)測(cè)定反應(yīng)體系中的熒光強(qiáng)度來(lái)測(cè)定分選酶的活性。熒光多肽Dabcyl-QALPTTGEE(Edans)用pH 7.5的Tris-HCl緩沖液稀釋至5 mmol/L作為儲(chǔ)備液。

    純化的蛋白用蛋白活性緩沖液(50 mmol/L Tris-HCl緩沖液,150 mmol/L NaCl溶液,pH 8.0)稀釋至0.5 mg/mL,加入96 孔板黑板中,并加入分選酶底物肽至終濃度為10 μmol/L(終反應(yīng)體系為200 μL),在37 ℃培養(yǎng)箱中孵育2 h,使用酶標(biāo)儀記錄孵育前后體系中的熒光強(qiáng)度(激發(fā)波長(zhǎng)350 nm,發(fā)射波長(zhǎng)520 nm),以蛋白活性緩沖液作為陰性對(duì)照。

    為研究金屬離子對(duì)Lap-SrtA酶活性的影響,反應(yīng)體系中分別加入5 mmol/L的CaCl2、MgCl2、ZnCl2及MnCl2溶液(終反應(yīng)體系為200 μL),以不加任何金屬離子的反應(yīng)體系作為對(duì)照,37 ℃培養(yǎng)箱中孵育2 h,測(cè)定反應(yīng)體系中熒光強(qiáng)度,計(jì)算相對(duì)酶活力。

    1.3.5 分選酶抑制劑查爾酮對(duì)重組蛋白活性的影響

    查爾酮用二甲基亞砜溶解,加入反應(yīng)體系中,使其終濃度分別為20、40、80、120、160、200 μmol/L,在37 ℃培養(yǎng)箱中孵育30 min后,加入熒光肽底物至終濃度為10 μmol/L(終反應(yīng)體系為200 μL),繼續(xù)孵育2 h,按之前的方法讀取熒光強(qiáng)度,計(jì)算相對(duì)酶活力。

    1.3.6 嗜酸乳桿菌SrtA生物信息學(xué)分析

    分別用ExPASY、TMHMM、PSIPRED、SWISS MODEL[18-19]等蛋白質(zhì)在線(xiàn)分析軟件分析分選酶的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)并與其他分選酶進(jìn)行比對(duì)。

    1.4 數(shù)據(jù)處理

    所有數(shù)據(jù)用Origin 8.5軟件繪制趨勢(shì)曲線(xiàn)圖,采用一維方差分析比較數(shù)據(jù)平均值之間的差異顯著性。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 SrtA基因的PCR擴(kuò)增和重組表達(dá)載體的構(gòu)建

    圖1 SrtAΔN48基因PCR產(chǎn)物電泳圖Fig. 1 Agarose gel electrophoresis of PCR products of SrtAΔN48 gene

    由圖1可知,以L(fǎng). acidophilus ATCC4356基因組DNA為模板擴(kuò)增產(chǎn)物長(zhǎng)度為546 bp,符合預(yù)計(jì)長(zhǎng)度。測(cè)序結(jié)果經(jīng)過(guò)NCBI對(duì)比,與L. acidophilus NCFM序列相似性為99%,氨基酸序列完全相同。將克隆載體Blunt Zero-SrtAΔN48雙酶切后得到的SrtAΔN48與pET28a(+)連接,卡那霉素篩選陽(yáng)性菌,并送至上海桑尼生物技術(shù)有限公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果顯示整個(gè)克隆過(guò)程中沒(méi)有引入突變堿基。

    2.2 SrtA基因在大腸桿菌中的表達(dá)與純化

    圖2 Transetta(DE3)/pET28a-SrtAΔN48的表達(dá)產(chǎn)物十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳分析Fig. 2 SDS-PAGE analysis of expression product from Transetta (ED3)/pET28a-SrtAΔN48

    將重組載體pET28a-SrtAΔN48轉(zhuǎn)入表達(dá)菌株Transetta(DE3),在25 ℃、0.4 mmol/L IPTG條件下表達(dá)及純化結(jié)果如圖2所示。SrtA作為一種膜蛋白,其氨基酸序列的N端含有一段強(qiáng)疏水性序列,包括跨膜區(qū)域和信號(hào)肽,這段序列可以使膜蛋白成功錨定在細(xì)胞壁上;但在基因異源表達(dá)過(guò)程中,疏水性序列會(huì)嚴(yán)重影響蛋白質(zhì)的正確折疊以及可溶性表達(dá)[7,20]。為獲得具有活性的SrtA蛋白,本研究設(shè)計(jì)引物去除了SrtA酶N端的48 個(gè)氨基酸,然后使用pET系列載體在大腸桿菌內(nèi)表達(dá)目的基因Lap-SrtAΔN48。L. acidophilus ATCC4356 SrtA基因原本編碼229 個(gè)氨基酸,切除N端48 個(gè)氨基酸后,相對(duì)分子質(zhì)量會(huì)有所減小。由圖2可知,SrtAΔN48在約20 kDa的位置出現(xiàn)了明顯的條帶,同時(shí),利用Ni-NTA親和層析柱,獲得了高純度的SrtAΔN48蛋白。

    2.3 金屬離子及查爾酮對(duì)嗜酸乳桿菌SrtA酶活力的影響

    分選酶進(jìn)行轉(zhuǎn)肽作用時(shí)不需要ATP的參與,因此在體外可以較為方便地測(cè)定Lap-SrtAΔN48的活性。利用帶有熒光基團(tuán)的底物肽Dabcyl-QALPTTGEE(Edans)測(cè)定SrtA的活性,Lap-SrtAΔN48切割熒光基團(tuán)結(jié)果如圖3所示。由于對(duì)照組沒(méi)有分選酶活性,在孵育過(guò)程中,熒光強(qiáng)度會(huì)衰減,因此相對(duì)酶活力呈負(fù)值,SrtA在37 ℃時(shí)可以成功切斷肽段LPTTG,使熒光基團(tuán)Edans發(fā)出熒光。

    圖3 不同金屬離子對(duì)Lap-SrtAΔN48蛋白活性的影響Fig. 3 Effect of different metal ions on Lap-SrtAΔN48 activity

    金屬離子是生命體不可缺少的微量元素,對(duì)酶的活力和機(jī)體生長(zhǎng)發(fā)育有著重要的影響。由圖3可知,Mg2+、Mn2+可顯著提高Lap-SrtAΔN48的活力(P<0.05);Zn2+也可以提高Lap-SrtAΔN48的活力,但效果并不顯著(P>0.05);Ca2+不會(huì)影響Lap-SrtAΔN48的活力(P>0.05),明顯區(qū)別于其他SrtA酶。Ilangovan[3]、Li Hong’en[21]等在對(duì)金黃色葡萄球菌OS2分選酶(Sa-SrtA)及單核細(xì)胞性李斯特菌BUG1600分選酶(Lm-SrtA)的研究過(guò)程中發(fā)現(xiàn),Ca2+可以提高Sa-SrtA及Lm-SrtA的活力至原來(lái)的4 倍以上。Naik等[22]研究了Sa-SrtAΔN59與Ca2+的關(guān)系,結(jié)果表明,Sa-SrtA β6與β7之間的谷氨酸(Glu171)可以使Ca2+結(jié)合到酶活中心附近,改變Sa-SrtA的動(dòng)力學(xué)結(jié)構(gòu),提高Sa-SrtA的催化效率,而Lap-SrtAΔN48在這一區(qū)域并未發(fā)現(xiàn)功能相似的氨基酸(圖6)。

    圖4 查爾酮對(duì)SrtA蛋白活性的抑制作用Fig. 4 Inhibitory activity of chalcone on SrtA

    由圖4可知,查爾酮在體外可以顯著抑制Lap-SrtAΔN48的活性,抑制效果與查爾酮的濃度有關(guān),濃度越高,查爾酮的抑制作用越強(qiáng)。結(jié)合以往的研究結(jié)果,查爾酮可以與熒光肽底物競(jìng)爭(zhēng)酶活位點(diǎn),使Lap-SrtAΔN48喪失轉(zhuǎn)肽能力。

    查爾酮是一種黃酮類(lèi)化合物,普遍存在于植物體內(nèi)[23]。研究發(fā)現(xiàn),查爾酮可以直接封閉蛋白酶的活性位點(diǎn),阻止SrtA的轉(zhuǎn)肽作用,抑制Listeria monocytogenes、Streptococcus mutans、S. pyogenes[21,24]等多種致病菌對(duì)宿主細(xì)胞的黏附,具有良好的應(yīng)用前景。由于查爾酮有較高的廣譜抑制效果,本實(shí)驗(yàn)選擇它作為研究Lap-SrtAΔN48特性的工具。結(jié)果顯示,查爾酮同樣會(huì)抑制Lap-SrtAΔN48的活性,查爾酮特殊的分子結(jié)構(gòu)具有較大的柔性,如果人體腸道中其他益生菌的SrtA結(jié)構(gòu)與L. acidophilus ATCC4356相似,查爾酮就會(huì)干擾正常的腸道微生物環(huán)境,影響人體健康。查爾酮對(duì)多種SrtA的抑制效應(yīng)也表明,依靠特殊的分子結(jié)構(gòu)抑制SrtA酶活力的方法沒(méi)有特異性,因而在通過(guò)查爾酮阻止腸道致病菌對(duì)腸道的吸附作用進(jìn)行治療時(shí),可能會(huì)影響人體內(nèi)原有的微生物,引發(fā)一定的副作用。

    2.4 Lap-SrtAΔN48重組蛋白生物信息學(xué)分析

    圖5 預(yù)測(cè)的Lap-SrtA三維結(jié)構(gòu)Fig. 5 Structure of Lap-SrtA predicted by SWISS MODEL

    使用ExPASY在線(xiàn)檢測(cè)工具對(duì)Lap-SrtAΔN48分析后發(fā)現(xiàn),Lap-SrtAΔN48總氨基酸數(shù)為181,分子質(zhì)量約為20 kDa,理論等電點(diǎn)為9.95,分子式為C891H1466N244O255S11,脂肪指數(shù)為85.14,不穩(wěn)定指數(shù)為23.95,屬于穩(wěn)定蛋白質(zhì)(不穩(wěn)定指數(shù)大于40屬于不穩(wěn)定蛋白質(zhì))。SrtA屬于Ⅱ類(lèi)膜拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)(N端位于細(xì)胞膜內(nèi)側(cè),C端位于細(xì)胞膜外側(cè)),蛋白質(zhì)在細(xì)胞壁外側(cè)發(fā)揮作用。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)顯示,Lap-SrtAΔN48中含有14.92%的α螺旋結(jié)構(gòu)和26.52%的β折疊結(jié)構(gòu);可能存在11 個(gè)蛋白質(zhì)識(shí)別位點(diǎn)和1 個(gè)蛋白質(zhì)-核酸結(jié)合位點(diǎn)。SrtA可以催化多種表面蛋白,這些蛋白質(zhì)識(shí)別位點(diǎn)可能對(duì)應(yīng)的是不同的表面蛋白。

    由圖5可知,采用SWISS MODEL構(gòu)建的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)顯示,Lap-SrtAΔN48由5 段α螺旋和8 段β折疊結(jié)構(gòu)組成,其中,8 條反向平行的β折疊形成了一個(gè)β中心桶狀結(jié)構(gòu),與單核細(xì)胞性李斯特菌、金黃色葡萄球菌、釀膿鏈球菌的基本結(jié)構(gòu)相同。β中心桶狀結(jié)構(gòu)是SrtA的經(jīng)典結(jié)構(gòu),是分選酶進(jìn)行轉(zhuǎn)肽作用的基礎(chǔ),研究表明,位于β4、β7和β8上活性位點(diǎn)會(huì)形成一個(gè)口袋結(jié)構(gòu),這種結(jié)構(gòu)可以識(shí)別表面蛋白的LPXTG序列,并攻擊T與G之間的肽鍵,催化轉(zhuǎn)肽過(guò)程(圖4)[25]。

    圖6 Lap-SrtA蛋白與同源蛋白序列比對(duì)結(jié)果Fig. 6 Results of multiple sequence alignment of Lap-SrtA protein and homologous proteins

    由圖6可知,以L(fǎng)m-SrtA為模板,將Lap-SrtAΔN48與其他革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌分選酶序列比對(duì)后發(fā)現(xiàn),多種革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌SrtA之間有很高的同源性,并且均存在組氨酸(H)-半胱氨酸(C)-精氨酸(R)三聯(lián)體活性中心,這是SrtA的主要活性氨基酸,此外,組氨酸附近存在LAGH等保守序列,半胱氨酸附近也存在TLITC保守序列,可能與分選酶活性有關(guān)。結(jié)合序列比對(duì)結(jié)果,本研究推測(cè)Lap-SrtA活性氨基酸為His137、Cys198、Arg205。組氨酸和精氨酸是SrtA酶抓取LPXTG序列的必需氨基酸,而半胱氨酸可以將底物從TG之間切開(kāi)[26]。

    3 討 論

    分選酶錨定機(jī)制是細(xì)菌外蛋白的5 種錨定方式之一[27],本研究利用大腸桿菌表達(dá)載體獲得了具有活性的Lap-SrtA蛋白,并對(duì)其分子生物學(xué)特性作了初步分析。

    相較于Sa-SrtA、Lm-SrtA,Ca2+不會(huì)影響Lap-SrtA的活性,氨基酸序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),Lap-SrtA在β6與β7之間沒(méi)有谷氨酸(Glu),這可能是Lap-SrtA對(duì)Ca2+不敏感的原因之一。谷氨酸是Sa-SrtA結(jié)合Ca2+的關(guān)鍵氨基酸 ,在Sa-SrtA催化轉(zhuǎn)肽作用時(shí),Ca2+可以同時(shí)結(jié)合β6/β7之間的谷氨酸和β3/β4之間天冬氨酸、天冬酰胺、谷氨酸等氨基酸,拉近兩段肽鏈之間的距離,使Sa-SrtA的活性位點(diǎn)發(fā)生形變,提高催化效率。另外,金黃色葡萄球菌,單核細(xì)胞性李斯特菌均為致病菌,其分選酶及分選酶依賴(lài)蛋白多數(shù)為毒性蛋白,Sa-SrtA及Lm-SrtA對(duì)Ca2+的敏感性很可能是為了適應(yīng)毒性蛋白的錨定而進(jìn)化的特殊性質(zhì)[22]。

    生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,Lap-SrtA的結(jié)構(gòu)和活性位點(diǎn)與Sa-SrtA、Sp-SrtA和Lm-SrtA相似,均由8條β折疊和若干α螺旋及部分β轉(zhuǎn)角組成;其中,位于β4、β7、β8上的組氨酸-半胱氨酸-精氨酸構(gòu)成了SrtA的三聯(lián)體活性中心。由于具有相似的結(jié)構(gòu)和相同的活性位點(diǎn),查爾酮同樣可以抑制Lap-SrtA的活性。通過(guò)與Lap-SrtA的活性位點(diǎn)相結(jié)合,查爾酮可以阻止Lap-SrtA與底物蛋白間的相互作用,抑制Lap-SrtA的催化作用[24]。因此,查爾酮雖然對(duì)多種分選酶有抑制效果,但它也有一定的副作用,如果長(zhǎng)期作用于生物體,很可能會(huì)影響機(jī)體內(nèi)的正常菌群。鑒于查爾酮的廣譜抑制效應(yīng),本研究認(rèn)為,以競(jìng)爭(zhēng)性抑制為原理篩得的SrtA抑制劑有一定的缺陷,針對(duì)致病菌分選酶抑制劑的開(kāi)發(fā)可以從它們對(duì)Ca2+的敏感性入手,如果可以進(jìn)一步確定Ca2+的作用機(jī)制,設(shè)計(jì)相關(guān)實(shí)驗(yàn),降低SrtA與Ca2+的相互作用,同樣可以有效抑制致病菌SrtA的活性,同時(shí)不影響嗜酸乳桿菌ATCC4356分選酶的正常功能。

    乳酸菌必須定殖于人體腸道中才能發(fā)揮益生作用,因此,乳酸菌對(duì)腸道細(xì)胞的黏附被認(rèn)為是定殖的首要條件[28]。但是近年來(lái)不斷有研究顯示,目前的益生菌產(chǎn)品中的乳酸菌在腸道中的滯留能力并不理想。雖然乳酸菌可以耐受人體消化道嚴(yán)苛的環(huán)境,成功到達(dá)腸道,但它們大部分并不能成功定殖,多數(shù)外源乳酸菌在腸道內(nèi)存在時(shí)間很短,一旦停止從外界攝入,它們的數(shù)目會(huì)在2 周內(nèi)迅速衰減[29-30]。因此,提高乳酸菌的定殖能力一直是乳品研究者們努力的方向。本實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),Lap-SrtA對(duì)Ca2+不敏感,催化效率較低,會(huì)導(dǎo)致細(xì)菌表面黏附蛋白含量減少,對(duì)宿主細(xì)胞的黏附能力也會(huì)降低,因此,嗜酸乳桿菌在腸道中定殖成功率不高,很容易被其他腸道菌群排斥。目前,可以通過(guò)改變?nèi)樗峋呐囵B(yǎng)條件,篩選黏附性較強(qiáng)的乳酸菌菌種,改善乳酸菌在腸道中的定殖率;另一方面,通過(guò)分子生物學(xué)的方法增強(qiáng)乳酸菌分選酶的含量,進(jìn)而提高乳酸菌的黏附能力也是一個(gè)可行的方法。

    分選酶雖然在多種乳酸菌中被發(fā)現(xiàn),但它識(shí)別表面蛋白的種類(lèi)及底物識(shí)別機(jī)制尚不明確,SrtA在腸道環(huán)境中的催化效率、轉(zhuǎn)運(yùn)方式、相應(yīng)的激活劑及抑制劑等仍需要進(jìn)一步闡明。只有獲得這些酶更為詳細(xì)的信息,才能使乳酸菌及其制品獲得更好的應(yīng)用。

    [1] 石潔, 王長(zhǎng)軍. 病原菌逃避宿主細(xì)胞防御的策略[J]. 微生物學(xué)通報(bào),2012, 39(1): 90-98.

    [2] MARRAFFINI L A, DEDENT A C, SCHNEEWIND O. Sortases and the art of anchoring proteins to the envelopes of Gram-positive bacteria[J]. Microbiology & Molecular Biology Reviews Mmbr, 2006,70(1): 192-221. DOI:10.1128/MMBR.70.1.192-221.2006.

    [3] ILANGOVAN U, TONTHAT H, IWAHARA J, et al. Structure of sortase, the transpeptidase that anchors proteins to the cell wall of Staphylococcus aureus[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2001, 98(11): 6056-6061. DOI:10.1073/pnas.101064198.

    [4] 羅立新, 施周銘. 一種抗革蘭氏陽(yáng)性致病菌新型靶酶: 分選酶[J]. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展, 2006, 33(9): 828-833.

    [5] CHEN J, DONG H, MURFIN K E, et al. Active site analysis of sortase A from Staphylococcus simulans, indicates function in cleavage of putative cell wall proteins[J]. Biochemical & Biophysical Research Communications, 2016, 478(4): 1653-1659. DOI:10.1016/j.bbrc.2016.08.175.

    [6] 李森, 熱依漢古麗·麥麥提力. 單增李斯特菌srtA基因敲除菌株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性[J]. 食品科學(xué), 2017, 38(4): 113-117. DOI:10.7506/spkx1002-6630-201704019.

    [7] MAZMANIAN S K, LIU G, TONTHAT H, et al. Staphylococcus aureus sortase, an enzyme that anchors surface proteins to the cell wall[J]. Science, 1999, 285(5428): 760-763.

    [8] PATERSON G K, MITCHELL T J. The role of Streptococcus pneumoniae, sortase A in colonisation and pathogenesis[J]. Microbes &Infection, 2006, 8(1): 145-153. DOI:10.1016/j.micinf.2005.06.009.

    [9] MALIK S, PETROVA M I, CLAES I J, et al. The highly autoaggregative and adhesive phenotype of the vaginal Lactobacillus plantarum strain CMPG5300 is sortase dependent[J]. Applied & Environmental Microbiology, 2013, 79(15): 4576-4585. DOI:10.1128/AEM.00926-13.

    [10] LEBEER S. Functional analysis of Lactobacillus rhamnosus GG pili in relation to adhesion and immunomodulatory interactions with intestinal epithelial cells[J]. Applied & Environmental Microbiology, 2012, 78(1):185-193. DOI:10.1128/AEM.06192-11.

    [11] WU Z, GUO X, WANG Q, et al. Sortase A-catalyzed transpeptidation of glycosylphosphatidylinositol derivatives for chemoenzymatic synthesis of GPI-anchored proteins[J]. Journal of the American Chemical Society,2010, 132(5): 1567-1571. DOI:10.1021/ja906611x.

    [12] KONSTANTINOV S R, SMIDT H, DE VOS W M, et al. S layer protein A of Lactobacillus acidophilus NCFM regulates immature dendritic cell and T cell functions[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2008, 105(49): 19474-19479.DOI:10.1073/pnas.0810305105.

    [13] RASK C, ADLERBERTH I, BERGGREN A, et al. Differential effect on cell-mediated immunity in human volunteers after intake of different lactobacilli[J]. Clinical & Experimental Immunology, 2013, 172(2): 321-332. DOI:10.1111/cei.12055.

    [14] CALL E K, KLAENHAMMER T R. Relevance and application of sortase and sortase-dependent proteins in lactic acid bacteria[J]. Frontiers in Microbiology, 2013, 4(3): 73. DOI:10.3389/fmicb.2013.00073.

    [15] ZHULENKOVS D, RUDEVICA Z, JAUDZEMS K, et al.Discovery and structure-activity relationship studies of irreversible benzisothiazolinone-based inhibitors against Staphylococcus aureus sortase A transpeptidase[J]. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2014,22(21): 5988-6003. DOI:10.1016/j.bmc.2014.09.011.

    [16] BI C, WANG L, NIU X, et al. The use of chlorogenic acid and its analogues as inhibitors: an investigation of the inhibition of sortase A of Staphylococcus aureus, using molecular docking and dynamic simulation[J]. Biotechnology Letters, 2016, 38(8): 1-7. DOI:10.1007/s10529-016-2112-5.

    [17] LIU B, CHEN F, BI C, et al. Quercitrin, an inhibitor of sortase A,interferes with the adhesion of Staphylococcal aureus[J]. Molecules,2015, 20(4): 6533-6543. DOI:10.3390/molecules20046533.

    [18] LARKIN M A, BLACKSHIELDS G, BROWN N P, et al. Clustal W and Clustal X version 2.0[J]. Bioinformatics, 2007, 23(21): 2947-2948.DOI:10.1093/bioinformatics/btm404.

    [19] GOUET P, COURCELLE E, STUART D I. ESPript: analysis of multiple sequence alignments in PostScript[J]. Bioinformatics, 1999,15(4): 305-308.

    [20] 羅立新, 江彬強(qiáng), 陳謀通. 新抗菌靶點(diǎn)分選酶基因(srtA)在兩種原核載體中的克隆表達(dá)[J]. 微生物學(xué)報(bào), 2009, 49(2): 186-190.

    [21] LI H, CHEN Y, ZHANG B, et al. Inhibition of sortase A by chalcone prevents Listeria monocytogenes, infection[J]. Biochemical Pharmacology, 2016, 106: 19-29. DOI:10.1016/j.bcp.2016.01.018.

    [22] NAIK M T, SUREE N, ILANGOVAN U, et al. Staphylococcus aureus sortase A transpeptidase. calcium promotes sorting signal binding by altering the mobility and structure of an active site loop[J]. Journal of Biological Chemistry, 2005, 281(3): 1817-1826. DOI:10.1074/jbc.M506123200.

    [23] KUMAR D, KUMAR M, KUMAR A, et al. Chalcone and curcumin derivatives: a way ahead for malarial treatment[J]. Mini Reviews in Medicinal Chemistry, 2013, 13(14): 2116.

    [24] 李洪恩. 查爾酮對(duì)單增李斯特桿菌以及肺炎鏈球菌D39分選酶A抑制活性的分子機(jī)制研究[D]. 長(zhǎng)春: 吉林大學(xué), 2016: 51-70.

    [25] WALLOCK-RICHARDS D J, MARLES-WRIGHT J, CLARKE D J,et al. Molecular basis of Streptococcus mutans sortase A inhibition by the flavonoid natural product trans-chalcone[J]. Chemical Communications, 2015, 51(52): 10483-10485. DOI:10.1039/c5cc01816a.

    [26] ZONG Y, BICE T T H, SCHNEEWIND O, et al. Crystal structures of Staphylococcus aureus sortase A and its substrate complex[J]. Journal of Biological Chemistry, 2004, 279(30): 31383-31389. DOI:10.1074/jbc.M401374200.

    [27] COSSART P, JONQUIèRES R. Sortase, a universal target for therapeutic agents against Gram-positive bacteria?[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2000, 97(10): 5013-5015.

    [28] 周方方, 郭本恒, 吳正鈞, 等. 干酪乳桿菌LC2W對(duì)兩種不同胃癌細(xì)胞的黏附作用[J]. 中國(guó)乳品工業(yè), 2007, 35(8): 15-18.

    [29] CHARBONNEAU D, GIBB R D, QUIGLEY E M M. Fecal excretion of Bifidobacterium infantis 35624 and changes in fecal microbiota after eight weeks of oral supplementation with encapsulated probiotic[J].Gut Microbes, 2013, 4(3): 201-211. DOI:10.4161/gmic.24196.

    [30] FRESE S A, HUTKINS R W, WALTER J. Comparison of the colonization ability of autochthonous and allochthonous strains of lactobacilli in the human gastrointestinal tract[J]. Advances in Microbiology, 2012, 2(3): 399-409. DOI:10.4236/aim.2012.23051.

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