劉少軍 胡坤華 劉慰華
【摘要】 目的:從蛋白質(zhì)組學的角度探討C-反應(yīng)蛋白(CRP)損傷內(nèi)皮細胞(EC)的作用機制。方法:采用培養(yǎng)的人冠狀動脈內(nèi)皮細胞HCAEC第4代用于實驗,25 ?g/mL CRP刺激HCAEC 24 h,2D DIGE結(jié)合MALDI-ToF-ToF質(zhì)譜鑒定進行蛋白質(zhì)組學分析研究。結(jié)果:發(fā)現(xiàn)差異表達蛋白斑點11個,鑒定出其中4個,包括Heat shock cognate 71 kDa protein、Elongation factor 1-beta和Proteasome activator complex subunit 1等。結(jié)論:通過蛋白質(zhì)組學研究,篩選了CRP損傷EC的差異表達蛋白,為深入理解EC損傷的分子機制提供有益的線索。
【關(guān)鍵詞】 C-反應(yīng)蛋白; 內(nèi)皮細胞; 蛋白質(zhì)組學研究; 動脈粥樣硬化
Proteomics Analysis of C-relative Protein Effect on Endothelial Cell/LIU Shao-jun,HU Kun-hua,LIU Wei-hua.//Medical Innovation of China,2017,14(19):015-018
【Abstract】 Objective:To investigate the role of CRP in endothelial cell by proteomics analysis.Method:Human coronary artery endothelial cells were used at passage 4.25 ?g/mL CRP served as stimulus for endothelial cell injury.Differentially expressed proteins were analyzed by 2D DIGE and identified by MALDI-ToF-ToF MS analysis.Result:Differentially expressed 11 spots were visualized and 4 were identified,including Heat shock cognate 71 kDa protein, Elongation factor 1-beta and Proteasome activator complex subunit 1.Conclusion:This study screen differentially expressed proteins by CRP stimulus via proteomics analysis,providing useful understand of the underlying molecular mechanism of endothelial cell injury.
【Key words】 C-relative protein; Endothelial cell; Proteomics analysis; Atherosclerosis
First-authors address:Second Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University,Guangzhou 510260,China
doi:10.3969/j.issn.1674-4985.2017.19.005
在正常血清中,CRP(C-reactive protein,CRP)以微量形式存在。當發(fā)生炎癥時,炎癥因子刺激肝細胞產(chǎn)生CRP,血清CRP顯著升高。因此,CRP是一個炎癥反應(yīng)的標志分子。大量研究表明,CRP與動脈粥樣硬化的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[1-7]。CRP對內(nèi)皮細胞(endothelial cells,EC)的損傷主要存在以下幾個方面:(1)激活補體經(jīng)典途徑,進而攻擊內(nèi)膜;(2)促進EC釋放內(nèi)皮素及IL-6;(3)下調(diào)一氧化氮合酶的mRNA和蛋白的表達,從而抑制一氧化氮的表達與合成;(4)誘導(dǎo)細胞粘附因子的表達和釋放,從而誘導(dǎo)單核免疫細胞粘附聚集。筆者前期工作也報道了CRP誘導(dǎo)EC損傷的分子機制[8-10]。蛋白質(zhì)組學是一種較新較前沿的研究方法,具有系統(tǒng)性、高通量、高靈敏度等特點[11-12]。本研究中,筆者首次采用蛋白質(zhì)組學的方法,從系統(tǒng)生物學的角度探討CRP損傷EC的分子機制,現(xiàn)報道如下。
1 材料與方法
1.1 實驗設(shè)計 本研究采用2D DIGE研究的標準設(shè)計,方案見表1。
1.2 試劑和儀器 CRP購買自Trichem Rsources及Calbiochem公司,CRP的透析參照筆者之前的文章進行[10]。硫脲、賴氨酸、二甲基甲酰胺購自美國Sigma公司,尿素、CHAPS、玻璃板硅烷化劑、甘氨酸、低熔點瓊脂糖、固相IPG干膠條、IPG buffer、蛋白質(zhì)純化試劑盒Clean-up Kit、定量試劑盒Quant Kit、熒光標記試劑盒[CyDye DIGE Flour (minimal Dye) Labelling Kit]、Deep purple熒光染料、三氟乙酸均購自GE Healthcare公司,正丁醇為德國Merck公司產(chǎn)品。乙腈購自美國Fisher公司,測序級胰酶購自美國Promega公司。IPGphor Ⅲ等電聚焦電泳儀,Ettan DALT Six System SDS垂直電泳儀,Typhoon Trio掃描儀、Ettan Picker、Ettan Digester、DeCyder V7.0 Software均為GE Healthcare公司產(chǎn)品。MALDI-ToF-ToF質(zhì)譜儀為美國Bruker Dalton公司生產(chǎn)。
1.3 HCAEC的培養(yǎng)及處理 人冠狀動脈內(nèi)皮細胞(HCAEC),購買自Cell Applications公司,HCAEC的培養(yǎng)按照說明書進行。本研究使用的HCAEC為第4代,實驗處理細胞之前,改為含0.1% FBS且不含細胞因子的EGM-2基礎(chǔ)培養(yǎng)基培養(yǎng)24 h。實驗組為HCAEC用25 μg/mL CRP處理24 h。endprint
1.4 樣品處理 在4 ℃預(yù)冷Tris-buffered sucrose solution(10mM Tris,250mM sucrose)中洗滌細胞,重復(fù)3次去除殘余培養(yǎng)基。每個10 cm皿中加入Standard lysis buffer(7M Urea,2M Thiourea,30mM Tris,4% CHAPS,)300 μL,刮下細胞并充分裂解,超聲破碎。4 ℃,20000 g離心30 min,轉(zhuǎn)移上清液進行蛋白質(zhì)純化。蛋白質(zhì)的純化和定量嚴格按照2D Clean-up Kit或2D Quant Kit說明書進行。
1.5 2D DIGE 樣品的熒光標記按照筆者已經(jīng)報道過的方法進行操作[13-14],簡述如下:按照2D DIGE實驗設(shè)計,在4 ℃條件下,每個樣品50 μg用400 pmol Cy2、Cy3或者Cy5 在冰浴、避光條件下標記30 min,然后用Lysine solution終止反應(yīng)。第一向等電聚焦程序如下:30 V,12 h,step-n-hold;500 V,1 h,step-n-hold;1000 V,1 h,step-n-hold;10 000 V,10 h,step-n-hold;Total:90 000Vh。用DTT和IAA進行兩步平衡后進行第二向SDS-PAGE電泳,SDS-PAGE凝膠為12.5%。
1.6 DIGE凝膠掃描和差異蛋白的獲取 在進行2D DIGE分析膠電泳的同時,另外準備2張制備膠(500 μg/膠),按照Deep Purple stain kit操作說明進行制備膠的熒光染色,用Typhoon Trio掃描儀進行2D DIGE分析膠和Deep Purple制備膠的圖像采集,用DeCyder7.0軟件進行分析,在Ettan Picker上獲取差異蛋白質(zhì)樣品。
1.7 蛋白質(zhì)鑒定 獲取的目的蛋白斑點在Ettan Digester上進行酶解。之后在MALDI-ToF-ToF質(zhì)譜儀上進行蛋白鑒定,Mascot進行檢索。
2 結(jié)果
2.1 CRP刺激EC的2D DIGE差異分析 本研究按實驗設(shè)計操作共獲得4張2D DIGE凝膠,每張2D DIGE凝膠經(jīng)過三種不同波長的激光掃描后,可以得到3個分別由Cy2、Cy3和Cy5熒光標記的不同處理的樣品圖像及合并(merge)的膠內(nèi)差異凝膠圖像(圖1顯示其中一張分析膠)。通過DeCyder7.0軟件的自動匹配和隨后的人工核對,檢測到(2231±389)個蛋白斑點,不同處理組間的匹配率都接近80%,符合分析的標準。經(jīng)過仔細分析,共發(fā)現(xiàn)差異大于1.5倍的蛋白質(zhì)斑點11個,其中CRP處理組上調(diào)9個(斑點926、951、959、1921、1972、1989、1993、1994和1996),下調(diào)的斑點2個(1793和1889),見圖1。
2.2 質(zhì)譜鑒定及數(shù)據(jù)庫檢索 接著對此11個蛋白斑點進行MALDI-TOF-TOF質(zhì)譜鑒定,其中有6個斑點獲得了較好的譜圖,經(jīng)Mascot檢索成功鑒定出4個蛋白質(zhì)(其中斑點926與951為同一個蛋白,斑點1993與1994為同一個蛋白質(zhì)),鑒定出來的差異表達蛋白見表2。
2.3 CRP誘導(dǎo)表達差異的蛋白 CRP誘導(dǎo)EC上調(diào)表達的蛋白有HSPA8(Heat shock cognate 71 kDa protein)(圖2A)和PSME1(Proteasome activator complex subunit 1)(圖2B)。HSPA8是熱應(yīng)急蛋白質(zhì)HSP70家族的一員。而PSME1屬于蛋白降解系統(tǒng)的蛋白質(zhì)。該發(fā)現(xiàn)提示,CRP可能一方面促使EC應(yīng)激,另外一方面促進異常蛋白質(zhì)的降解。蛋白EEF1B2(Elongation factor 1-beta)為本研究發(fā)現(xiàn)的CRP誘導(dǎo)EC表達下調(diào)的蛋白(圖2C),EEF1B2的主要功能是參與蛋白質(zhì)的翻譯延長過程。該結(jié)果提示,CRP可能通過下調(diào)表達EEF1B2而抑制蛋白質(zhì)的翻譯。
3 討論
2D DIGE引入了內(nèi)標的概念,最大限度的消除了凝膠之間實驗誤差引起的差異,因此2D DIGE檢測的蛋白質(zhì)差異數(shù)據(jù)更精確、更可靠。其次,2D DIGE采用熒光標記的方法,與傳統(tǒng)的后染色雙向電泳比較很大程度上提高了檢測靈敏度,使得檢測到的可能的差異蛋白質(zhì)數(shù)量增加。本研究每張凝膠平均檢測到2231個蛋白斑點,而且凝膠之間匹配率都接近80%,說明靈敏度和精確度還是比較好的。
CRP(C-reactive protein,CRP)主要功能是調(diào)理感染,激活補體系統(tǒng),參與細胞的凋亡。大量的研究表明,CRP能夠活化內(nèi)皮細胞(endothelial cells,EC)和損傷內(nèi)皮功能[15],而且降壓藥物有較明顯的保護性干預(yù)作用[16]。Turu等[17]用TaqMan Low-density Arrays的方法鑒定出與CRP損傷EC相關(guān)的基因6個,有關(guān)學者則用芯片分析的方法發(fā)現(xiàn)CRP誘導(dǎo)EC的11個基因表達差異[12]。本研究采用2D DIGE結(jié)合MALDI-ToF-ToF的方法從蛋白質(zhì)組學研究的角度探索CRP損傷EC的可能分子機制,篩選鑒定出4個差異表達蛋白。
HSPA8是熱應(yīng)急蛋白質(zhì)HSP70家族的一員,熱休克蛋白是細胞內(nèi)古老的分子之一,是一種保護性的蛋白質(zhì)。也是一種常見的分子伴侶。受到外界刺激時,熱休克蛋白被大量合成,幫助細胞來維持正常的生理活動,阻止蛋白質(zhì)的相互作用和聚集。此外,HSPA8還是一個轉(zhuǎn)錄激活的抑制子,發(fā)揮抑制轉(zhuǎn)錄的功能[18]。CRP刺激EC細胞造成應(yīng)激,誘導(dǎo)熱休克蛋白的表達上調(diào),可能發(fā)揮代償性保護細胞的作用。PSME1屬于蛋白降解系統(tǒng)[19],CRP刺激EC時誘導(dǎo)其表達上調(diào)。CRP一方面促進蛋白質(zhì)的正確折疊,另外一方面可能促進異常蛋白質(zhì)的降解。EEF1B2的主要功能是作為鳥嘌呤核苷酸交換因子參與蛋白質(zhì)的翻譯延長過程[20],CRP可能通過下調(diào)表達EEF1B2進而抑制蛋白質(zhì)的翻譯。endprint
值得注意的是,斑點1993和1994在CRP處理組表達明顯上升,而這兩個斑點經(jīng)質(zhì)譜鑒定恰恰就是CRP本身。這說明雖然在本研究中,裂解蛋白之前使用Tris-buffered sucrose solution對細胞進行了3次洗滌,但是并沒有完全清除掉CRP蛋白本身,處理組存在CRP遺留下來的“蛋白污染”。一個重要的可能原因是:CRP與其EC上的受體CD32、CD64結(jié)合緊密有關(guān)[1-3]。
CRP對EC的損傷作用是比較明確的,但是本研究發(fā)現(xiàn)的差異蛋白比實驗前預(yù)計的少,只有11個。其中一個可能的原因是,刺激EC的CRP濃度偏低(25 μg/mL),一般認為中位濃度為50 μg/mL[3]。另外一個可能的原因是,目前對于CRP損傷EC的作用大多報道的是信號通路分子,比如蛋白激酶。而信號通路分子的蛋白豐度一般都比較低,以2D DIGE的靈敏度比較難檢測出來。
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(收稿日期:2017-03-16) (本文編輯:周亞杰)endprint