董運(yùn)海, 胡 蝶, 鄔敏辰, 唐詩涵, 王春娟, 李劍芳
(1.江南大學(xué) 食品學(xué)院,江蘇 無錫 214122;2.江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫 214122;3.江南大學(xué) 無錫醫(yī)學(xué)院,江蘇 無錫214122)
定點(diǎn)突變改善β-甘露聚糖酶AuMan5A的酶學(xué)性質(zhì)
董運(yùn)海1, 胡 蝶2, 鄔敏辰*3, 唐詩涵1, 王春娟1, 李劍芳1
(1.江南大學(xué) 食品學(xué)院,江蘇 無錫 214122;2.江南大學(xué) 生物工程學(xué)院,江蘇 無錫 214122;3.江南大學(xué) 無錫醫(yī)學(xué)院,江蘇 無錫214122)
基于糖苷水解酶5家族(GHF5)β-甘露聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,對(duì)宇佐美曲霉GHF5 β-甘露聚糖酶AuMan5A的關(guān)鍵位點(diǎn)氨基酸實(shí)施定點(diǎn)突變以獲得酶學(xué)性質(zhì)優(yōu)良的突變酶AuMan5AG320D。采用大引物PCR技術(shù)將AuMan5A基因 (Auman5A)中編碼Gly320的密碼子GGT突變?yōu)锳sp320的GAC,構(gòu)建出突變酶基因Auman5AG320D。分別將Auman5A和Auman5AG320D在畢赤酵母GS115中進(jìn)行了表達(dá),分析了表達(dá)產(chǎn)物AuMan5A和AuMan5AG320D的酶學(xué)性質(zhì)。結(jié)果表明:AuMan5AG320D的最適溫度Topt由突變前的65℃提升至70℃,在70℃的半衰期t1/270由原酶的10 min延長至25 min;AuMan5AG320D的比活性由突變前的351.2 U/mg提高到1 729.1 U/mg,其催化效率(kcat/Km)是原酶的9.3倍。將Gly320突變?yōu)锳sp320不僅改善了AuMan5A的溫度特性,而且顯著提高了該酶的比活性和催化效率。
β-甘露聚糖酶;定點(diǎn)突變;溫度特性;比活性;催化效率
β-甘露聚糖酶 (endo-β-1,4-D-mannanases,EC 3.2.1.78)廣泛存在于各種生物體尤其是微生物中,從甘露聚糖分子主鏈的內(nèi)部隨機(jī)切割β-1,4-D-甘露糖苷鍵產(chǎn)生不同聚合度的甘露寡糖,是甘露聚糖降解酶系中最關(guān)鍵的組分[1]?;谝患?jí)結(jié)構(gòu)同源性比對(duì)和疏水簇分析,β-甘露聚糖酶屬于糖苷水解酶家族(GHF) 5、26 和 113,具有相似的(β/α)8-TIM桶狀折疊[2]。隨著甘露寡糖生理功能的發(fā)現(xiàn)、綠色飼料的興起以及半纖維素資源的開發(fā),β-甘露聚糖酶在諸多工業(yè)領(lǐng)域的應(yīng)用潛力日益凸顯[3-4]。然而,野生型β-甘露聚糖酶在酶學(xué)性質(zhì)上或多或少存在缺陷,難以滿足工業(yè)化應(yīng)用的要求[5-6]。采用基因工程技術(shù)定向改造酶蛋白分子,已有較多成功的實(shí)例,但有關(guān)β-甘露聚糖酶分子改造的報(bào)道較少[7]。Li等[8]基于三維結(jié)構(gòu)分析,對(duì)酶蛋白分子進(jìn)行定向改造,提高了假蜜環(huán)菌β-甘露聚糖酶的蛋白酶耐受性。Xu等[9]通過對(duì)酶分子表面結(jié)構(gòu)的優(yōu)化設(shè)計(jì)并結(jié)合定點(diǎn)突變,提高了枯草芽孢桿菌β-甘露聚糖酶的耐酸性。
迄今為止,已有許多絲狀真菌的GHF5 β-甘露聚糖酶編碼基因被克隆和表達(dá),并分析了它們的酶學(xué)性質(zhì)[10]。作者所在實(shí)驗(yàn)室克隆了Aspergillususamii GHF5 β-甘露聚糖酶基因Auman5A,并對(duì)該基因及其編碼的氨基酸序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析[6];其后,本實(shí)驗(yàn)室魏喜換等[11]基于理性設(shè)計(jì)并結(jié)合定點(diǎn)突變,顯著提高了AuMan5A對(duì)底物瓜爾豆膠的親和力。為進(jìn)一步改善AuMan5A的酶學(xué)性質(zhì),本研究中通過對(duì)GHF5 β-甘露聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,推測(cè)AuMan5A的底物結(jié)合凹槽側(cè)壁上320位點(diǎn)處的氨基酸殘基對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)有較大的影響。據(jù)此,借助定點(diǎn)突變構(gòu)建突變酶基因Auman5AG320D,將該基因在畢赤酵母GS115中表達(dá),分析AuMan5A突變前后的溫度特性、比活性和催化效率。
大腸桿菌(Escherichia coli)JM109和 DH5α 菌株,畢赤酵母(Pichia pastoris)GS115菌株和表達(dá)質(zhì)粒pPICZαA,由作者所在實(shí)驗(yàn)室保藏;克隆質(zhì)粒pUCm-T,購自上海Sangon公司;重組質(zhì)粒pUCm-T-Auman5A,由本實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建和保藏;LB,LLB,YPD,YPDS-Zeocin,BMGY 和 BMMY 培養(yǎng)基的配制,參照 EasySelectTMPichia Expression Kit(Invitrogen公司)操作手冊(cè)。
各種限制性內(nèi)切酶,rTaq DNA聚合酶,T4DNA連接酶,250 bpDNA Ladder Marker和低相對(duì)分子質(zhì)量蛋白質(zhì)Marker,均購自大連TaKaRa公司;Zeocin和EZ-10柱式DNA膠回收試劑盒,購自上海Sangon公司;角豆膠和標(biāo)準(zhǔn)甘露糖,為Sigma公司產(chǎn)品;DEAE Sepharose Fast Flow和Sephadex G-75,均為Amersham Pharmacia Biotech公司產(chǎn)品;其它試劑均為國產(chǎn)或進(jìn)口分析純。
以 GHF5 AuMan5A一級(jí)結(jié)構(gòu)(GenBank:ADZ99027)為模板,運(yùn)用BLAST服務(wù)器在GenBank數(shù) 據(jù) 庫 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)中 搜尋絲狀真菌來源的、分別與AuMan5A序列同源性>60%的若干 GHF5 β-甘露聚糖酶序列;運(yùn)用ClustalW2 程 序 (http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalw2/)和DNAMAN 6.0軟件對(duì)這些酶進(jìn)行多序列同源性比對(duì),重點(diǎn)分析這些酶C末端一級(jí)結(jié)構(gòu)的主要差異,以確定擬突變的位點(diǎn)及在其上的氨基酸殘基。
在 PDB 數(shù)據(jù)庫(http://www.rcsb.org/) 尋找一種與AuMan5A序列同源性高的GHF5 β-甘露聚糖酶晶體結(jié)構(gòu),用作AuMan5A及其突變體同源建模的模板;運(yùn)用 MODELLER 9.11 程序(http://salilab.org/modeller/)進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)同源建模。針對(duì)酶蛋白分子的三維結(jié)構(gòu),使用PyMol軟件(http://pymol.org)分析各位點(diǎn)氨基酸殘基之間的距離(?)。
基于GHF5 β-甘露聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,擬將AuMan5A一級(jí)結(jié)構(gòu)中的Gly320突變?yōu)?Asp320。根據(jù) Auman5A核苷酸序列(GenBank:HQ839639)設(shè)計(jì)PCR引物,由上海Sangon公司合成。
G320D-F:5′—GGGAAGTCGCCGGATGACGGG AATACTATCTAC—3′,加框部分為突變密碼子;
Man5A-F:5′—GAATTCTCCTTCGCCAGCACC TC—3′,下劃線部分為EcoRⅠ酶切位點(diǎn);
Man5A-R:5′—GCGGCCGCTTAGGCACTATCA ATAGCAG—3′,下劃線部分為NotⅠ酶切位點(diǎn)。
以 pUCm-T-Auman5A為模板、G320D-F和Man5A-R為引物,PCR擴(kuò)增基因片段GM;再利用同一模板、Man5A-F和GM為引物,采用大引物PCR技術(shù)[12]擴(kuò)增突變酶基因Auman5AG320D。將目的PCR產(chǎn)物與pUCm-T連接,獲重組質(zhì)粒pUCm-TAuman5AG320D,轉(zhuǎn)化E.coli JM109,陽性轉(zhuǎn)化子的測(cè)序結(jié)果與預(yù)期一致。將pUCm-T-Auman5A和pUCm-T-Auman5AG320D分別經(jīng)EcoRⅠ和NotⅠ雙酶切,回收目的條帶,與經(jīng)同樣雙酶切的pPICZαA連接,獲重組表達(dá)質(zhì)粒pPICZαA-Auman5A和pPICZαA-Auman5AG320D,轉(zhuǎn)化 E.coli DH5α,DNA 測(cè)序驗(yàn)證。
將測(cè)序正確的pPICZαA-Auman5A和pPICZαAAuman5AG320D分別用SacⅠ線性化,電轉(zhuǎn)化P.pastoris GS115,具體操作參照基因脈沖儀(Bio-Rad公司)說明書。重組畢赤酵母的鑒定、多拷貝篩選和誘導(dǎo)表達(dá)等參照EasySelectTMPichia Expression Kit操作手冊(cè)。誘導(dǎo)表達(dá)上清液用80%飽和度的(NH4)2SO4鹽析,離心收集沉淀,溶于適量20 mmol/L NaH2PO4-Na2HPO4緩沖液(pH 7.0);粗酶液經(jīng)透析、超濾濃縮(膜截留相對(duì)分子質(zhì)量為10 000,Millipore公司),上樣DEAE Sepharose Fast Flow陰離子交換層析柱(2.0 cm×20 cm), 用含 0.1~1.0 mol/L NaCl的上述磷酸緩沖液進(jìn)行梯度洗脫,分步收集洗脫液;合并具有β-甘露聚糖酶活性的洗脫液,超濾濃縮至1 mL,上樣 Sephadex G-75凝膠層析柱(1.6 cm×80 cm)進(jìn)行純化。
β-甘露聚糖酶活性測(cè)定參見文獻(xiàn)[13],并略作修改。在2.4 mL 5 mg/mL角豆膠溶液 (pH 3.6、50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液配制)中加入0.1 mL適當(dāng)稀釋的酶液,65℃準(zhǔn)確反應(yīng)10 min,加入2.5 mL DNS試劑,在沸水浴中顯色7 min,測(cè)定OD540值。在上述反應(yīng)條件下,每分鐘產(chǎn)生1 μmol還原糖(以甘露糖計(jì))所需的酶量定義為1個(gè)β-甘露聚糖酶活性單位(U)。采用SDS-PAGE分析重組表達(dá)產(chǎn)物;Bradford法測(cè)定蛋白質(zhì)含量。
用不同pH值(pH 2.5~7.0)的檸檬酸-Na2HPO4緩沖液配制角豆膠溶液,按1.6方法測(cè)定酶活性。最適pH定義為最高酶活性 (以相對(duì)酶活性100%計(jì))所對(duì)應(yīng)的pH值。將酶液在不同pH值(pH 2.0~10.0檸檬酸-Na2HPO4緩沖液)、40℃保溫60 min,按1.6方法測(cè)定殘余酶活性。酶的pH穩(wěn)定性定義為殘余酶活性在85%以上的pH范圍。
在不同溫度(50~75℃)下,按1.6方法測(cè)定酶活性。最適溫度Topt定義為最高酶活性(以相對(duì)酶活性100%計(jì))所對(duì)應(yīng)的溫度。將酶液置于70℃下處理0~80 min,按1.6方法測(cè)定殘余酶活性,未經(jīng)處理酶液的酶活性以100%計(jì)。酶的半衰期t1/270定義為經(jīng)70℃處理殘余酶活性為50%時(shí)所對(duì)應(yīng)的時(shí)間。
以不同濃度 (1.0~10.0 mg/mL)的角豆膠溶液(用 pH 3.6、50 mmol/L檸檬酸-Na2HPO4緩沖液配制)為底物,在酶各自的最適溫度下按1.6方法測(cè)定其活性,采用Origin 8.0軟件進(jìn)行非線性擬合,計(jì)算β-甘露聚糖酶的Km和kcat值。
將 AuMan5A序列 (ADZ99027)分別與其它GHF5 β-甘露聚糖酶序列進(jìn)行同源性比對(duì),發(fā)現(xiàn)AuMan5A 與 硫 色 曲 霉 (Aspergillussulphureus,AsMan5A,ABC59553)、 棘 孢 曲 霉 (A.aculeatus,AaMan5A,AAA67426)、 構(gòu) 巢 曲 霉 (A.nidulans,AnMan5A,AGG69666) 和嗜松青霉 (Penicilliumpinophilum,PpMan5A,AEV41143) β-甘露聚糖酶的同源性較高,分別為94%、74%、67%和63%。再運(yùn)用ClustalW2程序?qū)@5種酶進(jìn)行多序列同源性比對(duì),其中C末端的比對(duì)結(jié)果如圖1所示。由圖1可見,AuMan5A 320 位點(diǎn)處為 Gly(G),而其它 4 種 β-甘露聚糖酶與之對(duì)應(yīng)的均為Asp(D,用紅框表示)。
圖1 5種不同來源的GHF5 β-甘露聚糖酶C末端的多序列同源性比對(duì)Fig.1 Multiple sequence alignment of C-termini among fiveGHF5β-mannanasesfrom different organisms
通過在PDB數(shù)據(jù)庫中搜尋,選定與AuMan5A同源性最高的黑曲霉 (A.niger)β-甘露聚糖酶晶體結(jié)構(gòu)(PDB:3WH9)為模板,對(duì)AuMan5A進(jìn)行三維結(jié)構(gòu)同源建模?;谌S結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,發(fā)現(xiàn)AuMan5A 320位點(diǎn)處的Gly位于其一個(gè)loop結(jié)構(gòu)(306W~G327) 內(nèi), 該 loop結(jié)構(gòu)的部分序列(317SPDGGN322)在三維結(jié)構(gòu)上參與構(gòu)成了底物結(jié)合凹槽的側(cè)壁(圖2)。Dilokpimol等[14]分析認(rèn)為該位點(diǎn)氨基酸 (通常為Asp)參與構(gòu)成了底物結(jié)合位點(diǎn)(subsite)-2。 同時(shí),該位點(diǎn)鄰近于在 GHF5 β-甘露聚糖酶中絕對(duì)保守的Trp位點(diǎn)(如AuMan5A 306位點(diǎn)處的Trp),該保守位點(diǎn)是subsite-1處結(jié)合糖環(huán)的疏水平臺(tái)[15]。Huang等[10]構(gòu)建了AnMan5A的兩個(gè)突變體W306G和W306Y,它們的酶活性分別僅為野生型酶的6%和11%。上述對(duì)GHF5 β-甘露聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的分析結(jié)果表明,AuMan5A 320位點(diǎn)處的氨基酸殘基可能對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)有較大影響。據(jù)此,借助定點(diǎn)突變將Gly320突變?yōu)槠渌概c之對(duì)應(yīng)的Asp320。
將AuMan5A一級(jí)結(jié)構(gòu)中編碼Gly320的密碼子GGT突變?yōu)榫幋aAsp320的GAC。以pUCm-TAuman5A為模板、G320D-F和Man5A-R為引物,經(jīng)第一輪PCR擴(kuò)增獲得長度約為100 bp的基因片段GM(圖3泳道1);再利用同一模板、Man5A-F和GM為引物,經(jīng)第二輪PCR擴(kuò)增獲得長度約為1050 bp的突變酶基因Auman5AG320D(圖3泳道2)。測(cè)序結(jié)果與預(yù)期一致。分別將酶基因Auman5A和Auman5AG320D克隆至pPICZαA,獲得重組表達(dá)質(zhì)粒pPICZαA-Auman5A 和 pPICZαA-Auman5AG320D。
圖2 AuMan5A三維結(jié)構(gòu)的表面構(gòu)型Fig.2 Surface conformation of the three-dimensional structure of AuMan5A
圖3 PCR產(chǎn)物的瓊脂糖凝膠電泳分析(12 g/L)Fig.3 AnalysisofPCR productsby agarose gel electrophoresis(12 g/L)
挑選若干在 YPDS-Zeocin(400 μg/mL) 平板上生長良好的單菌落,按照EasySelectTMPichia Expression Kit操作手冊(cè)進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),篩選到2個(gè)產(chǎn)AuMan5A和AuMan5AG320D活性最高的轉(zhuǎn)化子GS115/Auman5A和GS115/Auman5AG320D,酶活性分別為50.8和304.2 U/mL,空白對(duì)照GS115/pPICZαA上清液中未檢測(cè)到β-甘露聚糖酶活性。將2個(gè)轉(zhuǎn)化子的表達(dá)上清液分別經(jīng)(NH4)2SO4鹽析、陰離子交換層析和凝膠層析分離純化。SDS-PAGE分析顯示,純化的AuMan5A和AuMan5AG320D均在約49.5×103(表觀相對(duì)分子質(zhì)量)處呈現(xiàn)單一條帶(圖4)。按1.6方法測(cè)得純化酶的比活性分別為351.2 U/mg和 1 729.1 U/mg。
圖4 誘導(dǎo)表達(dá)上清液和純化酶的SDS-PAGE分析Fig.4 Analysisoftheexpression supernatantsand purified enzymes by SDS-PAGE
按1.7方法分析了pH對(duì)AuMan5A和AuMan5AG320D活性的影響,結(jié)果顯示AuMan5A和AuMan5AG320D均在pH值為3.5時(shí)具有最大的催化活性,且在pH 3.0~8.0范圍內(nèi)穩(wěn)定。單點(diǎn)突變并未影響AuMan5A的pH特性。
按1.7方法分析了溫度對(duì)AuMan5A和AuMan5AG320D活性的影響,結(jié)果如圖5所示。由圖5(a) 可見,AuMan5AG320D的最適溫度 Topt為 70 ℃,較AuMan5A的65℃略有提升。由圖5(b)可見,AuMan5AG320D在 70℃的半衰期 t1/270為 25 min,是AuMan5A(t1/270=10 min)的2.5倍。分析結(jié)果顯示,將Gly320突變?yōu)锳sp320改善了AuMan5A的溫度特性。
圖5 AuMan5A和AuMan5AG320D溫度特性的分析Fig.5 Temperature characteristics of AuMan5A and AuMan5AG320D
按1.3方法模擬了AuMan5AG320D的三維結(jié)構(gòu)。在酶蛋白分子三維結(jié)構(gòu)上,利用PyMol軟件測(cè)得在AuMan5AG320D中Asp320與Trp306之間的距離為2.9 ?,處于氫鍵成鍵距離之內(nèi)[16],而在AuMan5A中Gly320與Trp306的距離超出了形成氫鍵的范圍(圖6)。由此推測(cè),Asp320與Trp306所形成的氫鍵可使參與底物結(jié)合凹槽側(cè)壁構(gòu)成的部分loop結(jié)構(gòu)(317SPDGGN322)更加穩(wěn)固,增加了酶蛋白分子的剛性[17]。
圖6 AuMan5A和AnMan5AG320D局部結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析Fig.6 Comparison ofthelocalstructuresbetween AuMan5A and AnMan5AG320D
在AuMan5A和AuMan5AG320D各自的最適溫度(Topt=65℃和70℃)下,按1.8方法測(cè)得AuMan5A和AuMan5AG320D對(duì)角豆膠的Km值分別為1.75和0.99 mg/mL,kcat值分別為 584.2 和 3 058.6 s-1;AuMan5AG320D的催化效率 (kcat/Km)是AuMan5A的9.3倍。測(cè)定結(jié)果顯示,將Gly320突變?yōu)锳sp320顯著提高了AuMan5A的催化效率。
基于理性設(shè)計(jì)對(duì)關(guān)鍵位點(diǎn)上的氨基酸殘基進(jìn)行單點(diǎn)突變,可使酶的比活性或催化效率大幅度提高。如Srikrishnan等[18]基于內(nèi)切葡聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,所獲Thermoascusaurantiacus內(nèi)切葡聚糖酶Eg1單點(diǎn)突變子Y95F的催化效率較野生型酶提高了4.4倍;Cheng等[19]通過晶體結(jié)構(gòu)解析,并結(jié)合單點(diǎn)突變(Y61G),將Thermotogamaritima纖維素酶Cel12A的比活性提高了70%。
本研究中以宇佐美曲霉AuMan5A為對(duì)象,基于絲狀真菌的GHF5 β-甘露聚糖酶一級(jí)、三維結(jié)構(gòu)的比對(duì)和分析,推測(cè)AuMan5A底物結(jié)合凹槽側(cè)壁上320位點(diǎn)處的氨基酸殘基對(duì)其酶學(xué)性質(zhì)有較大的影響。在此分析基礎(chǔ)上,采用大引物PCR技術(shù)將Auman5A中編碼Gly320的密碼子GGT突變?yōu)锳sp320的GAC,構(gòu)建出突變酶基因Auman5AG320D。分別將Auman5A和Auman5AG320D在畢赤酵母GS115中進(jìn)行了表達(dá),分析了重組表達(dá)產(chǎn)物AuMan5A和AuMan5AG320D的酶學(xué)性質(zhì)。結(jié)果表明,將Gly320突變?yōu)锳sp320不僅改善了AuMan5A的溫度特性,而且顯著提高了該酶的比活性和催化效率。產(chǎn)AuMan5AG320D的重組酵母菌株有望用于β-甘露聚糖酶的工業(yè)化生產(chǎn)。
[1]VAN Z W H,ROSE S H,TROLLOPE K,et al.Fungal β-mannanases:mannan hydrolysis,heterologous production and biotechnological applications[J].Process Biochemistry,2010,45(8):1203-1213.
[2]ZHANG Y,JU J,PENG H,et al.Biochemical and structural characterization of the intracellular mannanase AaManA of Alicyclobacillus acidocaldarius reveals a novel glycoside hydrolase family belonging to clan GH-A[J].The Journal of Biological Chemistry,2008,283(46):31551-31558.
[3]CHAUHAN P S,PURI N,SHARMA P,et al.Mannanases:microbial sources,production,properties and potential biotechnological applications[J].Applied Microbiology and Biotechnology,2012,93(5):1817-1830.
[4]DHAWAN S,KAUR J.Microbial mannanases:an overview of production and applications[J].Critical Reviews in Biotechnology,2007,27(4):197-216.
[5]CHEN X,CAO Y,DING Y,et al.Cloning,functional expression and characterization of Aspergillus sulphureus β-mannanase in Pichia pastoris[J].Journal of Biotechnology,2007,128(3):452-461.
[6]TANG C,GUO J,WU M,et al.Cloning and bioinformatics analysis of a novel acidophilic β-mannanase gene,Auman5A,from Aspergillus usamii YL-01-78[J].World Journal of Microbiology and Biotechnology,2011,27(12):2921-2929.
[7]COUTURIER M,F(xiàn)ELIU J,BOZONNET S,et al.Molecular engineering of fungal GH5 and GH26 beta-(1,4)-mannanases toward improvement of enzyme activity[J].PLoS ONE,2013,8(11):e79800.
[8]LI Y,HU F,WANG X,et al.A rational design for trypsin-resistant improvement of Armillariella tabescens β-mannanase MAN47 based on molecular structure evaluation[J].Journal of Biotechnology,2013,163(4):401-407.
[9]XU M,ZHANG R,LIU X,et al.Improving the acidic stability of a β-mannanase from Bacillus subtilis by site-directed mutagenesis[J].Process Biochemistry,2013,48(8):1166-1173.
[10]HUANG J W,CHEN C C,HUANG C H,et al.Improving the specific activity of β-mannanase from Aspergillus niger BK01 by structure-based rational design[J].Biochimica et Biophysica Acta,2014,1844(3):663-669.
[11]WEI Xihuan,WANG Chunjuan,ZHAO Mei,et al.Directed modification of β-mannanase substrate affinity based on rational design[J].Journal of Zhejiang University(Agric,&Life Sci.),2014,40(1):58-64.(in Chinese)
[12]XIE Z H,SHI X J.Fast and almost 100%efficiency site-directed mutagenesis by the megaprimer PCR method[J].Progress in Biochemistry and Biophysics,2009,36(11):1490-1494.
[13]ZHAO Mei,WEI Xihuan,WANG Chunjuan,et al.Gene cloning and expression of a thermostable β-mannanase and its enzymatic properties[J].Journal of Food Science and Biotechnology,2014,33(6):590-596.(in Chinese)
[14]DILOKPIMOL A,NAKAI H,GOTFREDSEN C H,et al.Recombinant production and characterisation of two related GH5 endo-β-1,4-mannanases from Aspergillus nidulans FGSC A4 showing distinctly different transglycosylation capacity[J].Biochimica et Biophysica Acta,2011,1814(12):1720-1729.
[15]SABINI E,SCHUBERT H,MURSHUDOV G,et al.The three-dimensional structure of a Trichoderma reesei β-mannanase from glycoside hydrolase family 5[J].Acta Crystallographica Section D:Biological Crystallography,2000,56:3-13.
[16]NAZARI R M,KHAJEH K,Aminian M,et al.Enhancement of thermal stability of chondroitinase ABC I by site-directed mutagenesis:An insight from Ramachandran plot[J].Biochimicaet Biophysica Acta,2013,1834(2):479-486.
[17]FEI B,XU H,CAO Y,et al.A multi-factors rational design strategy for enhancing the thermostability of Escherichia coli AppA phytase[J].Journal of Industrial Microbiology&Biotechnology,2013,40(5):457-464.
[18]SRIKRISHNAN S,RANDALL A,BALDI P,et al.Rationally selected single-site mutants of the thermoascus aurantiacus endoglucanase increase hydrolytic activity on cellulosic substrates[J].Biotechnology and Bioengineering,2012,109 (6):1595-1599.
[19]CHENG Y S,KO T P,HUANG J W,et al.Enhanced activity of Thermotoga maritima cellulase 12A by mutating a unique surface loop[J].Applied Microbiology and Biotechnology,2012,93(3):661-669.
會(huì)議名稱(中文):第五屆食用昆蟲與微生物轉(zhuǎn)化廢棄物及資源化利用研討會(huì)
所屬學(xué)科:動(dòng)植物微生物學(xué),細(xì)胞生物學(xué),植物營養(yǎng)學(xué),農(nóng)林植物保護(hù)學(xué)
開始日期:2017-09-22 結(jié)束日期:2017-09-25
所在城市:湖北省 武漢市
主辦單位:中國微生物學(xué)會(huì)農(nóng)業(yè)微生物專業(yè)委員會(huì)、環(huán)境微生物專業(yè)委員會(huì)和微生物資源專業(yè)委員會(huì)、中國昆蟲學(xué)會(huì)昆蟲微生物組專業(yè)委員會(huì)
承辦單位:湖北省暨武漢微生物學(xué)會(huì)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、華中師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院
摘要截稿日期:2017-09-10 聯(lián)系人:鄭龍玉 博士 E-MAIL:ly.zheng@mail.hzau.edu.cn
會(huì)議網(wǎng)站:http://csm.im.ac.cn/templates/team/introduction.aspx?nodeid=9&page=ContentPage&contentid=4835
會(huì)議背景介紹:昆蟲在自然界有一百多萬種,占地球上生物種類的一半以上。除有害種類外,有益種類在食用(飼用、食用、藥用)、環(huán)境治理、工業(yè)資源、觀賞、土壤改良等方面發(fā)揮著極其重要的作用,它還蘊(yùn)藏著豐富的昆蟲微生物資源。昆蟲與微生物密不可分,在食用昆蟲與微生物聯(lián)合轉(zhuǎn)化廢棄物變廢為寶的過程中,微生物在提高廢棄物轉(zhuǎn)化效率、拮抗病原微生物、降解抗生素、引誘成蟲交配產(chǎn)卵等方面發(fā)揮著極其重要作用,已成為國內(nèi)外研發(fā)的熱點(diǎn)。我國每年產(chǎn)生畜禽糞便38億噸,餐廚剩余物上億噸,嚴(yán)重污染了環(huán)境,并可能傳播疾病、威脅人類安全。隨著人口大幅增長和養(yǎng)殖業(yè)快速發(fā)展,飼料與人類競(jìng)爭蛋白質(zhì)等營養(yǎng)物質(zhì)的問題日益凸顯,食用昆蟲與微生物轉(zhuǎn)化廢棄物,能提供蟲體蛋白等營養(yǎng)物質(zhì)和功能微生物肥料,完全做到零排放,可以創(chuàng)造顯著的經(jīng)濟(jì)效益。在《國家中長期科技發(fā)展綱要(2006-2020)》中,已將“綜合治污與廢棄物循環(huán)利用”列為農(nóng)業(yè)重點(diǎn)領(lǐng)域和優(yōu)先主題。為此,由中國微生物學(xué)會(huì)農(nóng)業(yè)微生物專業(yè)委員會(huì)、環(huán)境微生物專業(yè)委員會(huì)和微生物資源專業(yè)委員會(huì)、中國昆蟲學(xué)會(huì)昆蟲微生物組專業(yè)委員會(huì)聯(lián)合主辦,湖北省暨武漢微生物學(xué)會(huì)、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、華中師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院共同承辦的【第五屆食用昆蟲與微生物轉(zhuǎn)化廢棄物及資源化利用研討會(huì)】暨【第二屆昆蟲腸道微生物與環(huán)境治理學(xué)術(shù)研討會(huì)】,定于 2017年 9月 22-25日在武漢召開。
研討會(huì)內(nèi)容:
(1)食用昆蟲與微生物聯(lián)合轉(zhuǎn)化畜禽糞便工藝及機(jī)制;(2)食用昆蟲的基因組學(xué)與基因工程;(3)昆蟲腸道微生物多樣性及研究新技術(shù);(4)昆蟲腸道微生物資源挖掘及應(yīng)用;(5)昆蟲腸道微生物功能及其與宿主互作;(6)昆蟲抗菌物質(zhì)的研究與應(yīng)用;(7)昆蟲與微生物高效降解木質(zhì)纖維素系統(tǒng);(8)食用昆蟲與微生物無害化處理餐廚剩余物工藝及應(yīng)用;(9)食用昆蟲作為飼料添加劑在養(yǎng)殖業(yè)中的應(yīng)用(10)食用昆蟲與微生物轉(zhuǎn)化有機(jī)廢棄物開發(fā)功能肥料及應(yīng)用。
Improvement in the Enzymatic Properties of β-Mannanase(AuMan5A) by Site-Directed Mutagenesis
DONG Yunhai1, HU Die2, WU Minchen*3, TANG Shihan1, WANG Chunjuan1, LI Jianfang1
(1.SchoolofFood Science and Technology,Jiangnan University,Wuxi214122,China;2.Schoolof Biotechnology,Jiangnan University,Wuxi 214122,China;3.Wuxi Medical School,Jiangnan University,Wuxi 214122,China)
Based on comparison and analysis of primary and three-dimensional (3-D)structures of glycoside hydrolase family 5 (GHF5) β-mannanases,an amino acid at the key site of Aspergillususamii GHF5 β-mannanase (AuMan5A) was subjected to site-directed mutagenesis to obtain a mutant enzyme AuMan5AG320Dwith superior enzymatic properties.Using the megaprimer PCR method,the AuMan5AG320D-encoding gene,Auman5AG320D,was constructed by mutating the Gly320-encoding codon GGT of Auman5A into Asp320-encoding GAC.Then,two genes,Auman5A and Auman5AG320D,were extracellularly expressed in Pichia pastoris GS115 and the enzymatic properties of expressed products were analyzed.Results indicated that the optimal temperature ofAuMan5AG320Dwas 70℃ and and its half-life at 70 ℃(t1/270)was 25 min.The specific activity of AuMan5AG320Dwas increased from 351.2 U/mg to 1 729.1 U/mg and its catalytic efficiency(kcat/Km)was 9.3 times higher than that of AuMna5A.Through mutating Gly320into Asp320,this work not only improved the temperature characteristics of AuMan5A,but also significantly enhanced its specific activity and catalytic efficiency.
β-mannanase,site-directed mutagenesis,temperature characteristics,specific activity,catalytic efficiency
TS 201.25
A
1673—1689(2017)08—0819—07
10.3969/j.issn. 1673-1689.2017.08.006
2015-04-27
國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31271811)。
*通信作者:鄔敏辰(1962—),男,江蘇無錫人,理學(xué)博士,教授,博士研究生導(dǎo)師,主要從事酶工程與基因工程研究。E-mail:bioch@163.com
董運(yùn)海,胡蝶,鄔敏辰,等.定點(diǎn)突變改善β-甘露聚糖酶AuMan5A的酶學(xué)性質(zhì)[J].食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào),2017,36(08):819-825.