徐劍豪,吳 銳,馬曉杰,張 琳,王若朋,趙英偉*
(蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)部,江蘇 蘇州 215000)
腸道產(chǎn)超廣譜β內(nèi)酰胺酶大腸埃希菌研究情況
徐劍豪,吳 銳,馬曉杰,張 琳,王若朋,趙英偉*
(蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)部,江蘇 蘇州 215000)
目的對超廣譜β內(nèi)酰胺酶(ESBLs)的大腸埃希菌(E.coli)攜帶率、耐藥性及基因型分析。方法 采集糞便標(biāo)本涂種于產(chǎn)色培養(yǎng)基篩查陽性菌,并定期追蹤;選取藥物行K-B法藥敏試驗(yàn);PCR擴(kuò)增常見基因型,并分析耐藥性差異。結(jié)果 篩查陽性率39%;青霉素類、一代頭孢、氨基糖苷類、四環(huán)素類、磺胺類對耐藥菌株無效,而單環(huán)類、碳青霉烯類、氟喹諾酮類、四代頭孢對耐藥菌株抗菌效果佳;基因擴(kuò)增示38份陽性菌中OXA型37株(97.37%)、TEM型37株(97.37%)、CTM-M型30株(78.95%)、SHV型15株(39.47%),且不同基因型在耐藥方面存在差異。結(jié)論 ESBLs陽性E.coli定植及耐藥狀況嚴(yán)峻,OXA與TEM混合型為主。
大腸埃希菌,ESBLs,耐藥性,基因型
ESBLs來源甚廣,但大部分由腸桿菌科產(chǎn)生。此類水解酶,能破壞β-內(nèi)酰胺類抗生素化學(xué)結(jié)構(gòu)中的β-內(nèi)酰胺環(huán),從而產(chǎn)生耐藥。目前,有很多產(chǎn)ESBLs E.coli的臨床報(bào)道,但是研究ESBLs陽性 E.coli社區(qū)定植和耐藥性則相對少見。本研究對醫(yī)學(xué)生糞便中ESBLs陽性E.coli攜帶率進(jìn)行動態(tài)分析、研究其基因分型及耐藥性、探索易感因素,為臨床提供防治思路。
1.1.1 標(biāo)本來源
2014年7月至2015年1月分批隨機(jī)招募蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)部臨床專業(yè)志愿者100名,每人采集一份糞便標(biāo)本。并于2015年5月、2015年12月、2016年4月進(jìn)行了三次跟蹤,每次同樣每人采集一份糞便標(biāo)本。
1.1.2 試劑及儀器
ChromID ESBLs產(chǎn)色培養(yǎng)基(法國生物梅里埃公司);MH瓊脂;手提式滅菌器;恒溫培養(yǎng)箱;生化鑒定試劑盒;藥敏紙片(杭州微生物有限公司);Loading Buffer(6×)、TaqDNA聚合酶(5 U/μL)、dNTP Mix(10 mmol/L)、基因擴(kuò)增引物(TEM、SHV、CTX、OXA四型),引物參考有關(guān)文獻(xiàn)[1];瓊脂糖;PCR擴(kuò)增儀。
1.1.3 質(zhì)量控制
質(zhì)控菌株為大腸埃希菌ATCC 25922。
1.2.1 ESBLs陽性E.coli篩查及跟蹤
將糞便標(biāo)本接種于ChromID ESBLs產(chǎn)色培養(yǎng)基,35 ℃溫箱培養(yǎng)18 h,篩查ESBLs陽性E.coli。
1.2.2 菌株鑒定及藥敏試驗(yàn)
大腸埃希菌分離與鑒定嚴(yán)格按衛(wèi)生部《全國臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》進(jìn)行;藥敏試驗(yàn)采用K-B法,結(jié)果評價(jià)按照NCCLS第七版進(jìn)行。
1.2.3 常見β-內(nèi)酰胺類基因PCR擴(kuò)增
擴(kuò)增引物:TEM(F:CGCCGCA TACACTA TTCTCAGAA TGA,R:ACGCTCACCGGCTCCAGATTTAT;445 bp)
SHV(F:CTTTATCGGCCCTCACTCAA R:ACGCTCACCGGCTCCAGATTTAT,237 bp)
CTX-M(F:CTTTATCGGCCCTCA CTCAA,R:TGGGTGAAGTAAGTGACCAGAATCAGCGG,593 bp)
OXA(F:ACACAATACATATCAACTTCGC,R:AGTGTGT TTAGAATGGTGATC,814 bp)。煮沸法提取細(xì)菌DNA為模板進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)體系為:總體積50 μL,引物(20 μmol/L)各1 μL,dNTP Mixture(各2.5 mmol/L)4 μL,PCR Buffer(Mg2+Free)5 μL,TaqDNA聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,MgCl2(25 mmol/L)3 μL,模板DNA各1 μL。熱循環(huán)參數(shù):94℃預(yù)變性3 min→94℃變性30 s→55℃退火30 s→72℃延伸30 s,共30個循環(huán),最后1次延伸時間為10 min。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2% 瓊脂糖凝膠電泳后觀察結(jié)果。
2.1.1 ESBLs表型篩查
共收集100份糞便標(biāo)本,其中檢出39株ESBLs陽性E.coli,陽性率為39% 。
2.1.2 ESBLs跟蹤實(shí)驗(yàn)
2015年5月第一次陽性群體跟蹤,受訪34人,其中檢出29株ESBLs陽性E.coli,占比85.29% ;2015年12月第二次陽性群體跟蹤,受訪29人,其中檢出17株ESBLs陽性E.coli,占比58.62%;2016年4月第三次陽性群體跟蹤,受訪34人,其中檢出7株ESBLs陽性E.coli,占比20.59%。
39株ESBLs陽性E.coli對青霉素類、一代頭孢均耐藥(阿莫西林、氨芐西林、青霉素G100%耐藥,僅二株對哌拉西林敏感;僅一株對頭孢拉定敏感);對碳青霉烯類藥物美羅培南普遍敏感(僅一株耐藥)。其余耐藥情況見表1。
2.3.1 常見β-內(nèi)酰胺類基因擴(kuò)增
38株ESBLs陽性E.coliβ-內(nèi)酰胺類基因擴(kuò)增結(jié)果:OXA38株,TEM37株,CTX-M30株,SHV15株。37株E.coli同時攜帶兩種或兩種以上ESBLs基因。
2.3.2 38株ESBLs陽性E.coli基因型及其耐藥情況
3 8株E S B L s陽性E.c o l i基因型情況共分5組:A組(T E M+S H V-O X A+C T X M+)1 7例,B組(TEM+SHV+OXA+CTXM+)13例,C組(TEM+SHVOXA+CTXM-)5例,D組(TEM+SHV+OXA+CTXM-)2例,E組(TEM-SHV-OXA+CTXM-)1例。不同基因型耐藥譜差異:青霉素類(阿莫西林、氨芐西林、哌拉西林、青霉素G)及一代頭孢(頭孢拉定)均耐藥,除E組一株對哌拉西林敏感;對碳青霉烯類藥物美羅培南均敏感;其余耐藥性差異見表2。
表1 39株大腸埃希菌對抗菌藥物的藥敏率(n,%)
表2 不同基因組產(chǎn)ESBLs E.coli的耐藥率(%)
在社區(qū)獲得性感染方面,近年來ESBLs菌株檢出率日益增高,并有向健康人群蔓延的趨勢。本實(shí)驗(yàn)篩查ESBLs陽性E.coli檢出率為39%。查閱同類的社區(qū)研究,許江燕等人2013年在杭州研究結(jié)果顯示,正常人ESBLs陽性E.coli攜帶率為36.25%[2],兩者結(jié)果相近。然而,福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)生ESBLs陽性E.coli的攜帶率為82.61%[3]。同為臨床醫(yī)學(xué)生,兩地差異如此明顯,提示定植情況或與地域因素相關(guān)。根據(jù)對陽性群體的每6個月一次的跟蹤隨訪,發(fā)現(xiàn)ESBLs陽性E.coli定植率逐步下降。提示ESBLs陽性E.coli易受外界環(huán)境干擾,為臨床尋找干預(yù)措施提供依據(jù)。
由表1可見,ESBLs陽性E.coli的耐藥現(xiàn)狀已十分嚴(yán)重。其中,以青霉素類和一代頭孢耐藥率最高,均高于95%;此外,耐藥率>50.0%的抗菌藥物有頭孢噻肟、慶大霉素、四環(huán)素、復(fù)方新諾明。因此,臨床使用以上抗菌藥物應(yīng)根據(jù)藥敏結(jié)果進(jìn)行選擇。美洛培南、頭孢他啶、頭孢吡肟、環(huán)丙沙星耐藥率均小于10%,因此,治療E.coli所致的感染可以選擇此類藥物治療。因耐藥酶由質(zhì)粒介導(dǎo),通過水平轉(zhuǎn)移途徑,其他ESBLs陰性細(xì)菌可獲得耐藥性從而造成危害[4]。另外,編碼質(zhì)粒上可以同時存在其他抗生素的耐藥基因,這就使得ESBLs菌株多藥耐藥[5]。據(jù)報(bào)道,國內(nèi)頭孢噻肟濫用而耐藥率高[6],本實(shí)驗(yàn)結(jié)果亦驗(yàn)證了這一點(diǎn)。
目前,ESBLs已研究出十幾種型別,而TEM、OXA、CTX-M、SHV四種分類占據(jù)主要[7]。研究表明,OXA型的編碼基因一般存在于整合子和/或質(zhì)粒中,有較強(qiáng)傳播性[8]。本研究中OXA型高表達(dá),可能原因?yàn)樵撔虴SBLs陽性的其他菌株通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)化方式,將耐藥基因傳遞給E.coli。關(guān)于TEM型ESBLs,岳欣等[9]研究報(bào)道淄博市產(chǎn)ESBLs埃希菌株TEM基因型檢出率為60.78%,張霞等[10]研究報(bào)道鄭州產(chǎn)ESBLs菌中TEM型基因檢出率為29.6%,陳楓等[11]研究報(bào)道川南地區(qū)產(chǎn)ESBLs埃希菌株以TEM型為主,檢出率為39.29%,本次研究中TEM基因型在產(chǎn)ESBLs菌中檢出率近100%,大幅高出岳欣[9]、張霞[10]、陳楓[11]等人的研究,提示定基因型分布或與地域因素相關(guān)。CTX-M型ESBL是近10年來倍受關(guān)注的一類ESBL,因其對頭孢噻肟的水解能力高而得名。西班牙的多項(xiàng)研究均提示,超過60%社區(qū)來源的ESBL均為CTX-M型酶[13]。在許江燕等[2]的實(shí)驗(yàn)中,所有ESBLs陽性E.coli均為CTX-M型。本次研究CTX-M基因型檢出率高達(dá)79%(30/38)與情勢相符。關(guān)于SHV型基因,張霞等[10]研究報(bào)道鄭州產(chǎn)ESBLs菌中SHV型基因檢出率為11.1%。陳楓等[11]研究報(bào)道川南地區(qū)產(chǎn)ESBLs埃希菌株SHV型檢出率為21.43%。本次研究CTX-M基因型檢出率亦相較其他基因型偏低,為39%(15/38),提示SHV型目前非流行基因型。
值得一提的是,在本次研究38株ESBLs陽性E.coli中有37株細(xì)菌同時攜帶多種ESBLs基因,其中絕大多數(shù)為OXA、TEM、CTX-M三型混合以及OXA、TEM、CTX-M、SHV基因四型混合,分別占比44.74%及34.21%,提示我校大學(xué)生ESBLs陽性E.coli的交叉流行情況,應(yīng)重視ESBLs陽性E.coli攜帶多種基因型的情況,并給以一定的隔離與防護(hù)措施。
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B
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趙英偉