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    過表達(dá)Spt7對(duì)黑曲霉生長(zhǎng)及抗逆性影響

    2022-06-10 03:25:42薛鮮麗王靜然畢杭杭王德培
    生物技術(shù)通報(bào) 2022年5期
    關(guān)鍵詞:黑曲霉菌體結(jié)構(gòu)域

    薛鮮麗 王靜然 畢杭杭 王德培,2

    (1. 天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457;2. 工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300457)

    Spt-Ada-Gcn5-乙酰轉(zhuǎn)移酶(SAGA)復(fù)合體是一種多蛋白復(fù)合物,是一個(gè)多亞基保守的轉(zhuǎn)錄輔助因子,主要負(fù)責(zé)體內(nèi)10%以上的基因轉(zhuǎn)錄[1]。Spt7是構(gòu)成 SAGA 復(fù)合物的核心結(jié)構(gòu)之一,維持 SAGA 復(fù)合物的穩(wěn)定。其含有至少一個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,參與生物體轉(zhuǎn)錄調(diào)控,例如Bromo結(jié)構(gòu)域,可以結(jié)合乙?;嚢彼幔?-3]。SAGA作為一類多功能蛋白復(fù)合體,通過對(duì)組蛋白進(jìn)行乙酰化[4]和去泛素化[5]修飾,實(shí)現(xiàn)染色質(zhì)結(jié)構(gòu)在沉默和活躍狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)換,為基因轉(zhuǎn)錄起始創(chuàng)造了合適的遺傳條件;另外它通過與轉(zhuǎn)錄激活因子以及RNA 聚合酶 II等結(jié)合,幫助將它們募集到靶基因的啟動(dòng)子區(qū)域發(fā)揮作用;除此之外它還參與到DNA損傷修復(fù)、mRNA輸出[6-8]等多種生物學(xué)過程。

    目前發(fā)現(xiàn) SAGA 復(fù)合體由至少 20 個(gè)蛋白組成[9],以酵母SAGA復(fù)合物為例,它是由20個(gè)亞基組成,在結(jié)構(gòu)上可分為4個(gè)不同的模塊:由Ubp8、Sgf11、Sgf73和Sus1組成的雙歧化(DUB)模塊,由Gcn5、Ada2、Ada3和Sgf29組成組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶(HAT)模塊,TATA結(jié)合蛋白(TBP)相關(guān)因子(TAF)模塊,以及由Spt3、Spt8、Tra1、Spt20、Spt7和Ada1組成Ty(SPT)模塊。SAGA復(fù)合體的完整性主要依賴核心組件Spt7、Spt20和Ada1三個(gè)亞基,其中SPT模塊與SAGA復(fù)合體的招募有關(guān)。研究發(fā)現(xiàn)Spt7參與調(diào)節(jié)Spt20和Ada1的水平,并且含有Spt7的部分SAGA復(fù)合物可以在Spt20和Ada1都不存在的情況下組裝[10]。Spt7最初被發(fā)現(xiàn)是通過在釀酒酵母HIS4和LYS2基因的5'非編碼區(qū)的δ 插入突變以及Ty表型的影響[11],后來發(fā)現(xiàn)spt7編碼一種定位于細(xì)胞核的大型酸性蛋白質(zhì),缺失spt7基因的細(xì)胞可以存活,但生長(zhǎng)緩慢,并呈現(xiàn)多種表型如肌醇營(yíng)養(yǎng)不良、細(xì)胞形態(tài)發(fā)生改變、產(chǎn)孢缺陷以及Ty元素的轉(zhuǎn)錄改變[12]等。最新研究發(fā)現(xiàn)來自釀酒酵母的SAGA復(fù)合物核心是Taf5、Sgf73和Spt20亞基和組蛋白八聚體樣折疊[13-14],八具體折疊中還包含了異二聚體Taf6-Taf9、Taf10-Spt7和Taf12-Ada1,以及Spt3中的兩個(gè)組蛋白折疊結(jié)構(gòu)域。

    SAGA 復(fù)合體在真核生物中高度保守,釀酒酵母中 SAGA 復(fù)合物各亞基的同源蛋白已在果蠅、植物與人中得到鑒定[15-19]。雖然 SAGA 復(fù)合體三維結(jié)構(gòu)在酵母與人體細(xì)胞中高度相似,但研究發(fā)現(xiàn)SAGA 復(fù)合體在不同物種中發(fā)揮的功能存在差異性。迄今為止,黑曲霉乃至絲狀真菌范疇中均未見有關(guān)Spt7的報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)過程中意外的發(fā)現(xiàn)spt7基因缺失使菌株與原始菌株黑曲霉的菌落形態(tài)大相徑庭。與原始菌株相比,Δspt7菌株菌絲頂端膨大、菌絲短小、粗細(xì)不均勻,且部分區(qū)域出現(xiàn)類似酵母的念珠狀結(jié)構(gòu),不生成分生孢子。且spt7基因的缺失無法通過添加外源碳源得到彌補(bǔ)。從文獻(xiàn)得知此基因是 SAGA 復(fù)合物結(jié)構(gòu)穩(wěn)定核心亞基之一,其缺失可能使 SAGA 復(fù)合體失活,從而影響黑曲霉菌體生長(zhǎng)發(fā)育及分生孢子形成關(guān)鍵性基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證Spt7的功能,本研究構(gòu)建一株過表達(dá)Spt7的菌株,對(duì)其生長(zhǎng)形態(tài)、分生孢子形成、抗氧化脅迫、高溫及高滲耐受性等進(jìn)行觀察分析。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    1.1.1 菌種 黑曲霉(Aspergillus niger 1062)由江蘇國(guó)信協(xié)聯(lián)能源有限公司天津分公司保藏。大腸桿菌DH5α和根癌農(nóng)桿菌AGL1采購(gòu)于中國(guó)普通微生物菌株保藏管理中心,由天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院生化過程與技術(shù)研究室保藏。

    1.1.2 試劑 無水葡萄糖、酵母粉、瓊脂粉、胰蛋白胨采購(gòu)自天津市北方天醫(yī)試劑公司,硫酸銨、磷酸二氫鉀、磷酸氫二甲、硫酸鎂、氯化鈣、氯化鉀、七水合硫酸亞鐵、五水合硫酸銅、硫酸錳、硼酸、七水合硫酸鋅、六水合氯化鈷、苯酚、氯仿、冰乙酸、甲醇、氯化鈉、氫氧化鈉、氫氧化鉀、無水乙醇、甘油、乙酰丁香酮、頭孢噻肟鈉、氨芐青霉素、卡那霉素、潮霉素(均為分析純)采購(gòu)自北京市索來寶科技有限公司,DL5000 DNA Maker、快速 DNA 聚合酶(5 U/μL)采購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司,T4-DNA連接酶(10 U/μL),限制性內(nèi)切酶 BamH I(15 U/μL)采購(gòu)自寶日醫(yī)生物技術(shù)有限公司,真菌RNA提取試劑盒(50T)采購(gòu)自北京酷來博科技有限公司,RNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒HiS cript III RT Super Mix for qPCR(+Gdna wiper)(100rxn)采購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司,ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix(500 rxns)采購(gòu)自南京諾唯贊生物科技有限公司。

    1.1.3 培養(yǎng)基 LB培養(yǎng)基:1% NaCl,0.5%酵母粉,1%胰蛋白胨;大腸桿菌感受態(tài)轉(zhuǎn)化篩選培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基添加(0.01%)卡那霉素;電轉(zhuǎn)根癌農(nóng)桿菌篩選培養(yǎng)基:LB培養(yǎng)基添加0.012%卡那霉素;CM培養(yǎng)基:ASP+N-母液2%、葡萄糖1%、1 mol/L MgSO4母液0.2%、CM Trace elements 0.1%、酪蛋白水解物0.1%、酵母浸出物0.5%(ASP+N-母液:氯化鉀2.61%、磷酸二氫鉀7.48%、硝酸鈉29.75%、氫氧化鉀調(diào)節(jié)pH至5.5;CM Trace elements:七水合硫酸鋅2.1%、硼酸1.1%、四水合氯化錳0.5%、七水合硫酸亞鐵0.5%、四水合氯化鈷0.17%、五水合硫酸銅0.16%、二水合鉬酸鈉0.15%、EDTA5.1%);根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化初步篩選培養(yǎng)基:CM培養(yǎng)基外源添加0.01%氨芐青霉素、0.008%頭孢噻肟鈉和0.015%潮霉素;根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化初步篩選培養(yǎng)基:CM培養(yǎng)基添加0.025%潮霉素;農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化所用 IM 培養(yǎng)基參照文獻(xiàn)[20]配制;提RNA 所用培養(yǎng)基:2%葡萄糖,1%酵母粉,0.2%磷酸二氫鉀,0.2%硫酸鎂。

    1.1.4 儀器與設(shè)備 LRH-250A生化培養(yǎng)箱采購(gòu)自韶關(guān)市泰宏醫(yī)療器械有限公司,WXL-A30002電子天平采購(gòu)自北京賽多利斯儀器系統(tǒng)有限公司,LDZX-50FB 立式壓力蒸汽滅菌器采購(gòu)自上海申安醫(yī)療器械廠,ChampGel5000全自動(dòng)凝膠成像儀采購(gòu)自北京賽智創(chuàng)業(yè)科技有限公司,Eppendorf PCR儀采購(gòu)自上海恒久醫(yī)療器械有限公司,CX23 型光學(xué)顯微鏡采購(gòu)自O(shè)LYMPUS 公司,實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Stepone Plus)采購(gòu)自美國(guó)ABI公司,由天津科技大學(xué)生物學(xué)院分析測(cè)試中心保存。

    1.2 方法

    1.2.1 Spt7同源序列分析及進(jìn)化樹的構(gòu)建 根據(jù) GenBank中登錄的相關(guān)Aspergillus niger CGMCC 10142中spt7序列,采用NCBI比對(duì)后獲得的Spt7的同源氨基酸序列。選取釀酒酵母及黑曲霉中的Spt7蛋白序列在SMART網(wǎng)址進(jìn)行比對(duì)分析其內(nèi)部結(jié)構(gòu)。選取序列Aspergillus niger CBS 513.88來源的轉(zhuǎn)錄激活因子Spt7(XP 001399796.1),Aspergillus sclerotioniger CBS 115572來源的溴結(jié)構(gòu)域 蛋 白(bromodomain protein)(XP 025466510.1),Aspergillus saccharolyticus JOP 1030-1來源的組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶SAGA/ADA 催化亞基PCAF/GCN5(XP 025427320.1),Penicilliopsis zonata CBS 506.65來源的假定蛋白ASPZODRAFT 127728(XP 022586128.1),Byssochlamys spectabilis No. 5來源的溴結(jié)構(gòu)域蛋白(GAD99092.1),Monascus purpureus來源的轉(zhuǎn)錄激活因子Spt7(TQB67779.1),用MEGA7.0.26軟件構(gòu)建Spt7氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化樹。

    1.2.2 spt7過表達(dá)質(zhì)粒pOE spt7的構(gòu)建 pOE spt7質(zhì)粒即p66-PglaA-spt7的構(gòu)建:以p66質(zhì)粒為出發(fā)質(zhì)粒,選用BamH I進(jìn)行單酶切線性化,A. niger 1062基因組為模板,分別通過引物spt7-F和spt7-R(含終止子)、引物Pgla-F和Pgla-R擴(kuò)增片段片段spt7和pgla;將片段pgla和片段spt7通過Over-lap PCR的方法融合成一個(gè)片段pgla-spt7。通過重組酶進(jìn)行連接獲得質(zhì)粒pOE spt7,并熱激轉(zhuǎn)化至大腸桿菌。以大腸桿菌菌液為模板驗(yàn)證pOE spt7質(zhì)粒。本研究所用引物均由金唯智生物科技公司合成,如表1 所示。

    表1 試驗(yàn)中用到引物Table 1 Primers used in the experiment

    1.2.3 農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化黑曲霉及過表達(dá)spt7陽性轉(zhuǎn)化子的篩選 將pOE spt7質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌 AGL1 感受態(tài)細(xì)胞,并以菌液為模板驗(yàn)證農(nóng)桿菌。按照文獻(xiàn)所述方法孵育農(nóng)桿菌[21],之后將農(nóng)桿菌與黑曲霉新鮮孢子置于 IM 固體培養(yǎng)基硝酸纖維膜上,25℃避光共培養(yǎng) 48 h。待共培養(yǎng)過后用無菌生理鹽水將黑曲霉孢子從膜上洗到篩選培養(yǎng)基,37℃黑暗培養(yǎng) 2-3 d。待初篩版上長(zhǎng)出白色單菌落后,挑單菌落進(jìn)行復(fù)篩驗(yàn)證。

    1.2.4 OE spt7轉(zhuǎn)化子菌落、菌絲觀察及分生孢子計(jì)數(shù) 將OE spt7轉(zhuǎn)化子及出發(fā)菌株同時(shí)接種到CM培養(yǎng)基,30℃培養(yǎng)3 d,取爬片顯微鏡下觀察菌絲形態(tài);對(duì)菌落孢子數(shù)進(jìn)行計(jì)數(shù):用直徑 20 mmol/L 的打孔器從菌落中心打孔采樣,將孢子用 1 mL 無菌水洗下,血球計(jì)數(shù)板計(jì)數(shù),進(jìn)行產(chǎn)孢量分析。

    1.2.5 OE spt7菌株抗氧化脅迫性觀察 將OE spt7轉(zhuǎn)化子及出發(fā)菌株同時(shí)接種到含有6 mmol/L H2O2、15 mmol/L H2O2的CM培養(yǎng)基中,培養(yǎng)4 d,觀察菌落生長(zhǎng)情況。

    1.2.6 OE spt7轉(zhuǎn)化子高溫、高滲抗逆性實(shí)驗(yàn) 將OE spt7轉(zhuǎn)化子及出發(fā)菌株同時(shí)接種到含有15% NaCl的CM培養(yǎng)基中,置于30℃下培養(yǎng)9 d,觀察菌落生長(zhǎng)狀況。

    將對(duì)照組與OE spt7轉(zhuǎn)化子點(diǎn)種在CM培養(yǎng)基上,置于39℃下培養(yǎng),觀察1-4 d菌落生長(zhǎng)形態(tài)。

    1.2.7 OE spt7菌株RNA提取及過氧化物酶及熱休克蛋白轉(zhuǎn)錄水平 將OE spt7菌株及對(duì)照組的孢子置于含有15 mmol/L H2O2的CM液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)40 h,參考真菌RNA提取試劑盒說明書提取RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行qRT-PCR。目前在生物體內(nèi)常見的抗氧化酶有過氧化氫酶(catalase,CAT),超氧化物歧化酶Orgotein(superoxide dismutase,SOD),谷胱甘肽過氧化物酶(glutathione peroxidase,GSH-Px),過氧化氫酶過氧化物酶編碼基因(catalase-peroxidaseencoding gene,CpeB)。

    選取熱休克蛋白家族中的Hsp40、Hsp70、Hsp90蛋白進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平的檢測(cè)。將OE spt7菌株及對(duì)照組的孢子置于CM液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)36 h后在置于42℃水浴分別熱處理3 h和5 h,提取RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄后進(jìn)行qRT-PCR。

    qRT-PCR方法及操作步驟參考 ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix試劑盒說明書進(jìn)行,所使用的引物如表1所示。

    2 結(jié)果

    2.1 Spt7氨基酸序列比對(duì)及遺傳進(jìn)化樹分析

    目前關(guān)于以Spt7為核心組分的SAGA復(fù)合物的研究?jī)H集中在酵母、果蠅、人、植物細(xì)胞內(nèi),不同物種的Spt7氨基酸相似性極低,但結(jié)構(gòu)相似,如圖1-A所示,在黑曲霉與釀酒酵母的Spt7序列中,都含有溴結(jié)構(gòu)域,但是溴結(jié)構(gòu)域所在位點(diǎn)不同。本研究中黑曲霉和釀酒酵母Spt7多肽鏈全長(zhǎng)分別含有1 175和1 332個(gè)氨基酸殘基,二者Spt7氨基酸多序列比對(duì)結(jié)果如圖1-B所示,相似性僅有21.96%。將不同絲狀真菌來源的Spt7的氨基酸序列比對(duì)后構(gòu)建進(jìn)化樹如圖1-C所示,結(jié)果發(fā)現(xiàn)黑曲霉Spt7與曲霉菌A. sclerotioniger的溴域蛋白處于同一分支,通過文獻(xiàn)查找發(fā)現(xiàn)1995年報(bào)道了一篇關(guān)于酵母的Spt7,它是一個(gè)含有溴結(jié)構(gòu)域的酸性蛋白,推測(cè)在曲霉菌中Spt7同樣含有溴結(jié)構(gòu)域。同時(shí)與糖曲霉A. saccharolyticus JOP 1030組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶SAGA/ADA催化亞基PCAF/GCN5也有較近的親緣關(guān)系。曲霉菌與帶狀青霉P. zonata CBS 506.6的假定蛋白分別處于一分支。與絲衣霉B. spectabilis No. 5的溴域蛋白及紫色紅曲M. purpureus的轉(zhuǎn)錄活性因子Spt7的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

    2.2 Spt7對(duì)絲狀真菌菌絲形態(tài)及分生孢子形成的影響

    將轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組孢子點(diǎn)種在CM培養(yǎng)基上觀察3 d,結(jié)果如圖2-A所示,對(duì)照組與轉(zhuǎn)化子的菌落大小無明顯區(qū)別,兩菌株整體呈棕色,菌落中間有大量棕色孢子,邊緣菌絲呈乳黃色;與對(duì)照組菌株相比,轉(zhuǎn)化子菌落中間褶皺更深,有更多凸起,而對(duì)照組菌株較為平整。第2天對(duì)照組產(chǎn)孢比轉(zhuǎn)化子多但是轉(zhuǎn)化子菌絲更加茂密,而到第3天轉(zhuǎn)化子的孢子產(chǎn)量(數(shù)值)明顯比對(duì)照組高(數(shù)值)(圖2-B),3個(gè)轉(zhuǎn)化子的孢子數(shù)量分別是5.8×107/cm2、6.2×107/cm2、6.3×107/cm2比對(duì)照組2.3×107/cm2高了2.5-2.7倍。說明過表達(dá)spt7基因使菌體產(chǎn)孢延遲,但是增加了孢子產(chǎn)量。為了進(jìn)一步觀察過表達(dá)spt7對(duì)菌體菌絲的影響,通過制備爬片并在顯微鏡觀察菌絲形態(tài),如圖2-C所示,對(duì)照菌株菌絲相對(duì)疏松,枝節(jié)細(xì)長(zhǎng)且直,轉(zhuǎn)化子菌株菌絲稠密,枝節(jié)較多且短而粗。

    圖2 30℃下對(duì)照組及轉(zhuǎn)化子的生長(zhǎng)形態(tài)觀察及孢子計(jì)數(shù)Fig. 2 Growth morphology observation and spore count of control and transformants at 30℃

    2.3 OE spt7菌株抗氧化脅迫性分析

    氧化脅迫的產(chǎn)生是由于胞內(nèi)活性氧含量過高,使得胞內(nèi)氧化還原的狀態(tài)失衡,進(jìn)而引起菌體一系列應(yīng)激反應(yīng),菌體通過激活相關(guān)基因的表達(dá)來降解活性氧從而修復(fù)和維持細(xì)胞的動(dòng)態(tài)平衡。為探究Spt7對(duì)黑曲霉氧化耐受的影響,分別測(cè)定6 mmol/L H2O2以及15 mmol/L H2O2脅迫下,黑曲霉對(duì)照組及OE spt7菌株的生長(zhǎng)情況。如圖3 所示,在6 mmol/L H2O2上對(duì)照組延遲24 h萌發(fā),但在后期4-5 d時(shí)生長(zhǎng)情況與轉(zhuǎn)化子無明顯差異。在15 mmol/L H2O2的CM培養(yǎng)基上,對(duì)照組孢子延遲萌發(fā)且萌發(fā)后菌落生長(zhǎng)受到抑制,菌落直徑明顯小于轉(zhuǎn)化子,充分說明了過表達(dá)Spt7可以提高菌株的抗氧化脅迫能力。通過轉(zhuǎn)化子對(duì)H2O2的抗逆性觀察實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)過表達(dá)Spt7增加了菌體對(duì)的H2O2耐受性。

    圖3 對(duì)照組及OE spt7轉(zhuǎn)化子在含有不同濃度H2O2 CM培養(yǎng)基的生長(zhǎng)情況Fig. 3 Growths of control group and OE spt7 transformants in CM medium containing different concentrations of H2O2

    2.4 OE spt7菌株高滲耐受性分析

    本研究進(jìn)一步驗(yàn)證OE spt7轉(zhuǎn)化子對(duì)其他不良環(huán)境的耐受性,于是將轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組孢子點(diǎn)種在含有15% NaCl的CM培養(yǎng)基上進(jìn)行9 d的觀察實(shí)驗(yàn),結(jié)果如圖4所示。從整體來看,對(duì)照組與轉(zhuǎn)化子都能在高鹽板上萌發(fā)及生長(zhǎng),但是萌發(fā)都受到抑制,對(duì)照組受抑制較為明顯。轉(zhuǎn)化子在第2天即可看到孢子的萌發(fā)跡象,但對(duì)照組則是在第3天開始出現(xiàn)氣生菌絲,隨后較轉(zhuǎn)化子均生長(zhǎng)緩慢,菌體顏色偏灰白色;從第3-5天的生長(zhǎng)情況觀察,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化子的氣生菌絲明顯比對(duì)照組稀少,但在培養(yǎng)6 d后氣生菌絲忽然增加,并且隨著菌落的生長(zhǎng),氣生菌絲也越來茂密;在菌體生長(zhǎng)的7-9 d,轉(zhuǎn)化子的生長(zhǎng)明顯比對(duì)照組快,且菌落顏色相對(duì)對(duì)照組更加嫩黃,菌體更加鮮活。說明過表達(dá)Spt7可以提高菌株對(duì)高滲不良環(huán)境的耐受能力。

    圖4 對(duì)照組及OE spt7轉(zhuǎn)化子在含有15%NaCl的CM培養(yǎng)基生長(zhǎng)情況Fig. 4 Growths of control group and OE spt7 transformants in CM medium containing 15% NaCl

    2.5 OE spt7菌株高溫耐受性分析

    將對(duì)照組與OE spt7轉(zhuǎn)化子點(diǎn)種在CM培養(yǎng)基上,置于39℃下培養(yǎng),觀察1-4 d菌落生長(zhǎng)形態(tài),結(jié)果如圖5所示,對(duì)照組與轉(zhuǎn)化子在39℃孢子均能萌發(fā),較最適溫度30℃相比生長(zhǎng)緩慢,與對(duì)照組相比轉(zhuǎn)化子孢子萌發(fā)更快、生長(zhǎng)狀態(tài)良好且菌落依然飽滿,但是對(duì)照組在后期不僅生長(zhǎng)相對(duì)緩慢且菌落干癟、失水嚴(yán)重。

    圖5 對(duì)照組及OE spt7轉(zhuǎn)化子在39℃高溫下生長(zhǎng)情況Fig. 5 Growths of control group and OE spt7 transformants at 39℃ of high temperature

    2.6 過氧化物酶qRT-PCR結(jié)果

    從表征觀察發(fā)現(xiàn)過表達(dá)Spt7后,菌株的抗氧化能力提高,于是對(duì)轉(zhuǎn)化子及對(duì)照組通過qRT-PCR分析關(guān)鍵性的過氧化物酶的轉(zhuǎn)錄水平,結(jié)果如圖6所示,可以看出在含有H2O2的培養(yǎng)基中培養(yǎng)轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組,過表達(dá)Spt7使spt7的轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)2.15倍;同時(shí)超氧化物歧化酶SOD轉(zhuǎn)錄水平相對(duì)對(duì)照組上調(diào)了3.8倍,谷胱甘肽過氧化物酶GPX以及過氧化氫酶-過氧化物酶CepB編碼基因的轉(zhuǎn)錄也上調(diào)了1.89倍;但是對(duì)于過氧化氫酶CatR的轉(zhuǎn)錄下調(diào)了3.56倍。

    圖6 對(duì)照組及OE spt7轉(zhuǎn)化子抗氧化物酶的轉(zhuǎn)錄水平Fig. 6 Transcript levels of antioxidant enzymes in the control and OE spt7 transformants

    2.7 熱休克蛋白qRT-PCR結(jié)果

    因OE spt7轉(zhuǎn)化子在高溫下生狀態(tài)良好,因此推測(cè)其內(nèi)部熱休克蛋白發(fā)揮作用。將其與對(duì)照組分別熱激3 h與5 h后,qRT-PCR驗(yàn)證其熱休克蛋白的轉(zhuǎn)錄水平。如圖7-A所示,熱激3 h后,OE spt7轉(zhuǎn)化子Spt7的轉(zhuǎn)錄水平相對(duì)對(duì)照組上調(diào)了1.92倍,OE spt7轉(zhuǎn)化子的熱休克蛋白Hsp40、Hsp70、Hsp90相比對(duì)照組分別下調(diào)了0.9、0.1、0.5倍,但OE spt7轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組熱休克蛋白轉(zhuǎn)錄水平并未呈現(xiàn)出顯著差異性。為了進(jìn)一步觀察熱休克蛋白的轉(zhuǎn)錄情況,作者將熱激時(shí)間延長(zhǎng)到5 h,較熱激3 h結(jié)果相比,OE spt7轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組Spt7、Hsp40及Hsp70的轉(zhuǎn)錄水平?jīng)]有差異性,但OE spt7轉(zhuǎn)化子Hsp90轉(zhuǎn)錄水平較對(duì)照組上調(diào)了19倍(圖7-B)。

    圖7 對(duì)照組及OE spt7轉(zhuǎn)化子在42℃熱激條件下胞內(nèi)熱休克蛋白的轉(zhuǎn)錄水平Fig. 7 Transcript levels of intracellular heat shock proteins in the control and OE spt7 transformants under heat stress conditions at 42℃

    3 討論

    3.1 Spt7同源序列分析結(jié)果及蛋白結(jié)構(gòu)域分析

    系統(tǒng)進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn),不同菌種中Spt7的氨基酸序列差別很大,黑曲霉與釀酒酵母的Spt7氨基酸序列比對(duì)后只有21.9%的相似性,說明在不同物種間,Spt7同源性較低。通過與釀酒酵母的Spt7蛋白結(jié)構(gòu)比較,發(fā)現(xiàn)兩菌種中的Spt7都含有溴結(jié)構(gòu)域,只是結(jié)構(gòu)域所在位點(diǎn)不同。而溴結(jié)構(gòu)域本身是一種能識(shí)別乙?;嚢彼釟埢牡鞍捉Y(jié)構(gòu)域。有些學(xué)者認(rèn)為溴結(jié)構(gòu)域作為調(diào)節(jié)蛋白可以直接識(shí)別組蛋白中乙?;馁嚢彼?,從而被乙?;慕M蛋白募集。在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中,啟動(dòng)子可以通過溴結(jié)構(gòu)域蛋白判斷許多的關(guān)鍵的調(diào)節(jié)因子是否存在,從而決定相關(guān)基因的表達(dá)或者沉默[22]。目前已經(jīng)鑒定出大量含有溴結(jié)構(gòu)域的調(diào)節(jié)蛋白。并且關(guān)于溴結(jié)構(gòu)域的功能還未完全發(fā)現(xiàn),而溴結(jié)構(gòu)域作為Spt7蛋白結(jié)構(gòu)的主要結(jié)構(gòu)域,其在Spt7相關(guān)功能中可能起到主要作用。

    3.2 過表達(dá)spt7對(duì)菌體表征的影響

    通過與原始菌株的形態(tài)觀察比較,從整體來看,菌體形態(tài)并無太大區(qū)別,但是在生長(zhǎng)過程中,轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組在產(chǎn)生分生孢子前,轉(zhuǎn)化子的菌絲更加茂密,進(jìn)一步用顯微鏡觀察菌絲形態(tài),發(fā)現(xiàn)菌絲分枝增多。但是菌體產(chǎn)孢延遲說明過表達(dá)spt7對(duì)菌體生長(zhǎng)繁殖十分有利,并且在產(chǎn)孢期,轉(zhuǎn)化子的孢子數(shù)量明顯提高是對(duì)照組的2-3倍,通過以上現(xiàn)象我們推測(cè)spt7可能是菌體生長(zhǎng)繁殖的關(guān)鍵基因。研究發(fā)現(xiàn)Spt7基因的缺失導(dǎo)致釀酒酵母生長(zhǎng)緩慢且Ty、INO1、MFA1等基因的轉(zhuǎn)錄受到抑制[10-12],且本課題組獲得的一株缺失Spt7基因的高產(chǎn)檸檬酸黑曲霉菌落聚縮生長(zhǎng)、不產(chǎn)分生孢子以及無法正常產(chǎn)酸,總之Spt7是酵母細(xì)胞、黑曲霉生長(zhǎng)很重要的核蛋白,對(duì) RNA 聚合酶轉(zhuǎn)錄的某些基因的表達(dá)有關(guān)鍵性的調(diào)控作用。

    3.3 OE spt7菌體對(duì)不良環(huán)境的抗逆性分析

    過氧化氫作為強(qiáng)氧化劑損耗細(xì)胞內(nèi)抗氧化物質(zhì),使細(xì)胞抗氧化能力低下,進(jìn)而引起細(xì)胞衰亡。過表達(dá)spt7轉(zhuǎn)化子菌體在高濃度過氧化氫環(huán)境培養(yǎng)后,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化子的生長(zhǎng)幾乎不受過氧化氫的影響,推測(cè)Spt7參與了抗氧脅迫關(guān)鍵性基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控。有研究顯示細(xì)胞在與逆境和活性氧做斗爭(zhēng)的過程中,細(xì)胞進(jìn)化出一套完整的應(yīng)答調(diào)控機(jī)制,通過調(diào)節(jié)體內(nèi)活性氧的代謝平衡,來保護(hù)DNA、脂質(zhì)和蛋白質(zhì)等免受氧化攻擊[23]。胞內(nèi)相應(yīng)抗氧化酶表達(dá)量提高,抗自由基氧化能力增強(qiáng)。在好氧發(fā)酵過程氧脅迫是影響發(fā)酵菌種生物量和菌體存活的關(guān)鍵因素之一。而過表達(dá)spt7提高菌體的抗氧化能力,降低氧脅迫對(duì)菌體造成的損失,對(duì)菌體發(fā)酵及提高發(fā)酵產(chǎn)物產(chǎn)量提供了一個(gè)思路。

    在15%NaCl的高滲透壓的條件下培養(yǎng)OE spt7轉(zhuǎn)化子與對(duì)照組,生長(zhǎng)過程中可見對(duì)照組菌體變白,菌落較為干癟且菌體直徑變化不明顯。相對(duì)對(duì)照組轉(zhuǎn)化子菌絲依舊為淡黃色,說明菌體在高滲條件下依舊保持較高的活性。從分子層面分析,推測(cè)Spt7蛋白對(duì)相關(guān)Na+/K+-ATPase亞基基因[24]有所調(diào)節(jié),從而提高了菌體對(duì)高滲環(huán)境的耐受性。

    本研究中的黑曲霉1062最適生長(zhǎng)溫度是30℃,但在39℃條件下,OE spt7轉(zhuǎn)化子較對(duì)照組孢子萌發(fā)更快、生長(zhǎng)狀態(tài)良好且菌落依然飽滿,但是對(duì)照組孢子不僅萌發(fā)緩慢且在后期生長(zhǎng)也滯后且菌落干癟、失水嚴(yán)重。說明了過表達(dá)Spt7可以提高菌體的高溫耐受性。

    3.4 OE spt7菌體過氧化物酶轉(zhuǎn)錄水平分析

    常見的抗氧化酶有過氧化氫酶(catalase,CAT)、超氧化物歧化酶Orgotein(superoxide dismutase,SOD)以及谷胱甘肽過氧化物酶(glutathione peroxidase,GSH-Px),為了驗(yàn)證該猜測(cè),進(jìn)一步對(duì)這些過氧化物酶做轉(zhuǎn)錄組分析,驗(yàn)證過表達(dá)Spt7對(duì)這些酶的影響。從實(shí)驗(yàn)結(jié)果來看,過表達(dá)Spt7對(duì)CAT的轉(zhuǎn)錄水平無明顯影響,但是SOD、GPX、CpeB的轉(zhuǎn)錄水平明顯上調(diào),推測(cè)過表達(dá)spt7提高了細(xì)胞對(duì)氧自由基的氧化損傷的防御,因氧化損傷的根本原因是細(xì)胞內(nèi)蛋白結(jié)構(gòu)的破壞,推測(cè)Spt7對(duì)維持蛋白結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性有著決定性的作用。接下來對(duì)高溫耐受性的分析及細(xì)胞內(nèi)熱休克打敗的轉(zhuǎn)錄水平情況分析也進(jìn)一步證明了該猜測(cè)。

    在大腸桿菌中有人提出了饑餓誘導(dǎo)交叉保護(hù),即在大腸桿菌細(xì)胞生長(zhǎng)過程中,因?yàn)槿狈Ρ匾獱I(yíng)養(yǎng)物質(zhì)而導(dǎo)致細(xì)胞生長(zhǎng)停滯,細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生過氧化氫酶和其他過氧化物酶使細(xì)胞對(duì)過氧化氫產(chǎn)生了較強(qiáng)抵抗力[25-28]。另外還有人認(rèn)為在真核細(xì)胞中細(xì)胞衰老過程中各種功能逐漸下降是因?yàn)樵谡IL(zhǎng)代謝過程中產(chǎn)生的活性氧(ROS)引起的氧化損傷的累 積[29]。被氧化的蛋白質(zhì)失去了完整的結(jié)構(gòu)而喪失了催化活性[30],從而引起細(xì)胞的衰老與死亡。在耗氧細(xì)胞進(jìn)化過程中產(chǎn)生了相應(yīng)的抗氧化機(jī)制即抗氧化酶如氧化氫酶(CAT)、超氧化物歧化酶(SODs)和谷胱甘肽過氧化物酶(GPXs)。它們協(xié)同工作以保護(hù)細(xì)胞免受來自內(nèi)源性代謝或外部微環(huán)境的過多活性氧物種(ROS)的傷害。它們分工明確,其中CAT將H2O2分解為H2O與O2[31],負(fù)責(zé)去除高濃度H2O2;而SOD將高活性的超氧陰離子(O2-)歧化為O2與低活性的H2O2[32];GPXs和PRDXs負(fù)責(zé)降解低濃度下的H2O2[33]。在實(shí)驗(yàn)中CAT的轉(zhuǎn)錄水平下調(diào),作者推測(cè)是H2O2的濃度對(duì)于轉(zhuǎn)化子來說過低,不足以CAT發(fā)揮作用,所以發(fā)揮主要作用的為SOD以及GPX。

    3.5 OE spt7菌體熱休克蛋白轉(zhuǎn)錄水平分析

    以往研究表明,在植物細(xì)胞中,高溫會(huì)加快細(xì)胞內(nèi)活性氧(ROS)的積累,從而導(dǎo)致細(xì)胞衰老甚至死亡[34-36]。同時(shí)應(yīng)激會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞蛋白質(zhì)平衡失調(diào)和細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)聚集[37-38]。熱休克反應(yīng)機(jī)制包括高溫引起的熱休克轉(zhuǎn)錄因子(heat shock factors HSFs)和熱休克蛋白(heat shock proteins HSPs)的變化[39]。其中HSF是調(diào)節(jié)植物中HSP表達(dá)的重要轉(zhuǎn)錄因子。熱休克蛋白具有分子伴侶的功能,可以穩(wěn)定蛋白質(zhì),修復(fù)受損的蛋白質(zhì),并確保在熱應(yīng)激期間蛋白質(zhì)的正確組裝和折疊[40]。作者對(duì)轉(zhuǎn)化子及對(duì)照組的部分熱激蛋白進(jìn)行轉(zhuǎn)錄水平的觀察,有意思的是,在熱激3 h條件下,較對(duì)照組相比轉(zhuǎn)化子的Spt7轉(zhuǎn)錄水平略微上調(diào),但Hsp40、Hsp70及Hsp90的轉(zhuǎn)錄水平?jīng)]有顯著性差異;在熱激5 h條件下,僅有Hsp90的轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生了差異性的變化。查文獻(xiàn)得知當(dāng)HSP處于應(yīng)激狀態(tài)下時(shí),它們的合成速度會(huì)很明顯的加快,通常能夠在半小時(shí)內(nèi)達(dá)到巔峰水平。因?yàn)榇藸顟B(tài)下熱休克蛋白的合成增多,所以其他的蛋白會(huì)相應(yīng)的合成速度降低,合成數(shù)量減少[41]。

    從菌體表征看過表達(dá)Spt7對(duì)菌體的生長(zhǎng)及對(duì)不良環(huán)境的耐受性均有很大的幫助。該蛋白可能對(duì)生物細(xì)胞內(nèi)糖代謝、各類氨基酸代謝途徑的關(guān)鍵酶基因具有調(diào)控作用,作為SAGA復(fù)合體的組成成分之一,Spt7可能參與SAGA的調(diào)控,在不同的環(huán)境中作為單獨(dú)的調(diào)控因子對(duì)細(xì)胞內(nèi)相關(guān)基因進(jìn)行定向調(diào)控。對(duì)黑曲霉內(nèi)Spt7的研究彌補(bǔ)絲狀真菌領(lǐng)域Spt7相關(guān)研究的空缺。

    4 結(jié)論

    本文以黑曲霉1062為出發(fā)菌株過表達(dá)Spt7,OE spt7轉(zhuǎn)化子較原始菌株菌絲生長(zhǎng)更茂盛,菌絲分枝增多,且分枝變短,菌體產(chǎn)孢延遲但產(chǎn)孢增多。較原始菌株相比OE spt7轉(zhuǎn)化子的過氧化氫耐受性、高溫耐受性及高滲耐受性均明顯增強(qiáng)。對(duì)不同環(huán)境下相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄情況觀察發(fā)現(xiàn),Spt7通過對(duì)抗氧化脅迫及高溫調(diào)控關(guān)鍵性的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控從而提高菌株的不良環(huán)境的抗逆性。總之,過表達(dá)Spt7有利于菌體的生長(zhǎng)及繁殖,在不良環(huán)境下,延長(zhǎng)了菌體的時(shí)序壽命,增加了菌體對(duì)不良環(huán)境的耐受性。

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