丁澤紅 鐵韋韋 付莉莉 顏彥 胡偉
摘要:[目的]克隆木薯海藻糖合成酶基因MeTPS6,并分析其在干旱、低溫、遮蔭等非生物脅迫應(yīng)答中的表達(dá)情況,為研究TPS因功能及抗逆分子機(jī)理提供參考。[方法]采用RT-PCR從木薯中克隆MeTPS6基因,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析及構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹。采用熒光定量PCR(qPCR)分析MeTPS6基因在干旱、低溫和遮蔭脅迫下不同木薯品種不同組織中的表達(dá)特性及模式。[結(jié)果]克隆獲得的MeTPS6基因具有一個(gè)2565 bp的開放閱讀框,編碼854個(gè)氨基酸,含有TPS家族保守結(jié)構(gòu)域(Glyco_transf_20)。MeTPS6蛋白與楊樹(Potri.010G104500)和杞柳(SapurV1A.0015s0610)同源蛋白氨基酸序列的相似性分別達(dá)92.6%和90.0%,表明木薯與楊樹和杞柳的親緣關(guān)系較近。MeTPS6~因的啟動(dòng)子序列中存在大量非生物脅迫相關(guān)元件(低溫相關(guān)元件LTR、干旱相關(guān)元件MBS等)、激素相關(guān)元件(脫落酸相關(guān)的元件ABRE~I(xiàn)CE3、水楊酸相關(guān)元件TCA-element~)及光響應(yīng)相關(guān)元件(ACE、Box I等)。MeTPS6基因在木薯儲(chǔ)藏根中的表達(dá)量最高,須根次之,二者均顯著高于莖、葉柄和葉片中的表達(dá)量(P<0.05,下同),且在干旱、低溫和遮蔭脅迫下,不同組織中的表達(dá)模式存在明顯差異。對(duì)于不同木薯品種,干旱、低溫和遮蔭脅迫處理均顯著誘導(dǎo)其MeTPS6基因表達(dá)。在高置信度(confidence=0.8)的情況下,共找到13個(gè)共表達(dá)基因,其中有10個(gè)為TPS同源基因,表明這些同源基因可能相互協(xié)調(diào),共同參與植物生物學(xué)過程;另外3個(gè)基因(CAT、CAT1和F5M15.5)均編碼過氧化氫酶,主要參與保護(hù)細(xì)胞免受過氧化氫的毒性作用。[結(jié)論]MeTPS6基因主要在木薯的根(特別是儲(chǔ)藏根)中表達(dá),并從轉(zhuǎn)錄水平參與干旱、低溫和遮蔭脅迫響應(yīng),可作為候選基因進(jìn)一步研究其在木薯抗逆中的功能。
關(guān)鍵詞:木薯;海藻糖合成酶;MeTPS6基因;干旱;低溫;遮蔭;表達(dá)分析
中圖分類號(hào):S533.034 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):2095-1191(2017)11-1923-07
0引言
[研究意義]木薯(Manihot esculenta Crantz)屬于大戟科木薯屬塊根植物,其塊根富含淀粉,是熱帶、亞熱帶地區(qū)重要的經(jīng)濟(jì)作物和糧食作物。木薯作為典型的熱帶作物,適應(yīng)性強(qiáng),耐旱耐瘠,但在低溫、長(zhǎng)時(shí)間干旱或嚴(yán)重干旱條件下,其塊根產(chǎn)量大幅度減產(chǎn)甚至絕收(盧賽清等,2009;Okogbenin et a1.,2013)。此外,塊根產(chǎn)量還受遮蔭、耕作方式等因素的影響,如拉丁美洲等經(jīng)濟(jì)落后地區(qū)將木薯與其他作物(橡膠樹、玉米等)問作使其受到不同程度的遮蔭脅迫,其產(chǎn)量顯著減少(Okoli and Wilson,1986;Fu et a1.,2016)。海藻糖-6-磷酸合成酶(Trehalose-6-phosphate synthase,TPS)是海藻糖生物合成代謝的關(guān)鍵酶,在植物干旱、低溫等逆境脅迫中發(fā)揮重要作用(Li et a1.,2011;Yang et a1.,2012;Mu et a1.,2016)。因此,克隆木薯TPS相關(guān)基因并進(jìn)行表達(dá)分析對(duì)深入研究其在木薯抗脅迫中的表達(dá)調(diào)控作用具有重要意義。[前人研究進(jìn)展]海藻糖是由2個(gè)葡萄糖分子通過α-1,1糖苷鍵連接而成的非還原性雙糖,植物在干旱、低溫、氧化等脅迫下其大量積累,可保護(hù)蛋白質(zhì)、核酸、生物膜等生物大分子物質(zhì),以增強(qiáng)植物的抗逆性(Garg et a1.,2002;郭蓓等,2008)。海藻糖合成包括兩步反應(yīng):一是由尿苷二磷酸葡萄糖和6-磷酸葡萄糖在TPS的催化下生成6-磷酸海藻糖;二是6-磷酸海藻糖在海藻糖6-磷酸酯酶的水解作用下生成海藻糖(史健志等,2015)??梢?,TPS是海藻糖生物合成途徑中的一個(gè)關(guān)鍵酶。經(jīng)研究證實(shí),植物體內(nèi)TPS基因表達(dá)與海藻糖含量密切相關(guān)(Garg eta1.,2002;Li et a1.,2011)。目前,已從棉花(Kosmaset a1.,2006)、水稻(Li et a1.,2011)、茶樹(丁菲等,2012)、擬南芥(Delorge et a1.,2014)、壇紫菜(史健志等,2015)、堿茅(李瑩和柳參奎,2015)、辣椒(魏兵強(qiáng)等,2016)、香蕉(王安邦等,2016;邢文婷等,2017)等植物中克隆獲得TPS基因,并對(duì)其功能進(jìn)行深入研究,結(jié)果表明非生物脅迫可誘導(dǎo)TPS基因表達(dá),植物體內(nèi)海藻糖含量明顯升高。郭蓓等(2008)研究發(fā)現(xiàn),將擬南芥TPS基因轉(zhuǎn)入煙草后,轉(zhuǎn)基因煙草植株體內(nèi)海藻糖含量明顯增加,其耐受鹽脅迫的能力顯著增強(qiáng)。Garg等(2002)、Li等(2011)研究發(fā)現(xiàn),在干旱、低溫和高鹽條件下,轉(zhuǎn)OsTPS1基因水稻植株抗性均明顯增強(qiáng),其植株體內(nèi)海藻糖含量是野生型的2倍。Kosmas等(2006)、Deng等(2014)研究表明,在干旱脅迫下,棉花GkTPS基因和海帶SiTPS基因的表達(dá)量顯著升高。丁菲等(2012)、魏兵強(qiáng)等(2016)研究表明,在低溫脅迫下,辣椒CaTPS基因和茶樹GsTPS基因的表達(dá)量均顯著升高。史健志等(2015)研究表明,在高溫和干旱脅迫下,壇紫菜PhTPS基因的表達(dá)顯著上調(diào)。Henry等(2014)研究表明,在遮蔭脅迫下,玉米TPS因的表達(dá)量發(fā)生顯著變化。此外,TPS因的表達(dá)量在同一植物不同組織中呈差異性表達(dá)(丁菲等,2012;魏兵強(qiáng)等,2016)。綜上所述,植物體內(nèi)TPS基因受干旱、低溫、遮蔭等脅迫誘導(dǎo)表達(dá),通過提高其表達(dá)量可增強(qiáng)植株的抗逆性。[本研究切入點(diǎn)]目前尚未見有關(guān)木薯TPS因克隆及其在非生物脅迫下表達(dá)分析的研究報(bào)道。[擬解決的關(guān)鍵問題]克隆木薯TPS基因(MeTPS6),并采用熒光定量PCR(qPCR)檢測(cè)其在不同品種、同一品種不同組織及在干旱、低溫和遮蔭等脅迫下的表達(dá)特性,為研究MeTPS6基因功能及抗逆分子機(jī)理提供參考。
1材料與方法
1.1試驗(yàn)材料
供試材料為木薯栽培品種Arg7和Ku50及野生種W14(M.esculenta ssp.Flabellifolia),來自中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院熱帶生物技術(shù)研究所試驗(yàn)基地。Arg7和Ku50是w14經(jīng)人工選擇與馴化獲得,其適應(yīng)性和部分農(nóng)藝性狀均優(yōu)于W14,如Ku50的塊根產(chǎn)量和淀粉含量較高,抗逆性較好;Arg7適宜于高緯度地區(qū)生長(zhǎng),但抗旱性一般。主要試劑:RNA抽提試劑盒購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司];cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自Fermentas公司;SYBR Premix Ex Taq(SYBR Green I)試劑盒購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司。主要儀器設(shè)備:Mx 3005P熒光定量PCR儀(Stratagene,美國(guó))。
1.2種植與脅迫處理
參照Ding等(2016)的方法種植木薯:將Ku50種莖切成10-15cm莖段,選擇粗細(xì)均勻且具有2~4個(gè)芽眼的莖段扦插于塑料盆(上直徑18.5cm,下直徑14.8cm,高18.5cm)中,每盆扦插1個(gè)莖段。木薯盆栽基質(zhì)是由蛭石與營(yíng)養(yǎng)土按照1:1(v/v)混合而成。種植10d后進(jìn)行間苗,每盆保留1棵苗,用于脅迫處理。干旱脅迫處理:木薯種植60d后,挑選生長(zhǎng)狀況基本一致的植株,施用20%PEG-6000溶液進(jìn)行模擬干旱脅迫處理,以不施PEG-6000(澆自來水)的植株-為對(duì)照。于脅迫0、3和24h后分別采集未展開葉、第一片完全展開葉、老葉和根,液氮速凍后,于80℃保存?zhèn)溆?;低溫脅迫處理:木薯種植60d后,挑選長(zhǎng)勢(shì)基本一致的植株置于光照培養(yǎng)箱,于4℃條件下進(jìn)行低溫脅迫處理。于脅迫0、6和24h后分別采集未展開葉、第一片完全展開葉和根,液氮速凍后,于-80℃保存?zhèn)溆茫徽谑a脅迫處理:將木薯種植于橡膠樹下進(jìn)行遮蔭脅迫處理,以正常光照下種植的木薯為對(duì)照。種植60d后挑選長(zhǎng)勢(shì)基本一致的植株,采集其未展開葉、第一片完全展開葉和老葉,液氮速凍后,于80℃保存?zhèn)溆谩?/p>
2015年夏季將W14、Ku50和Arg7的種莖(10~15cmK,含2~4個(gè)芽眼)分別種植于中國(guó)熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院文昌試驗(yàn)基地,株行距0.8m×1.0m,各30株,水肥管理與大田種植相同。種植90d后分別采集W14、Ku50和Arg7的葉片和根,用于qPCR檢測(cè)不同木薯品種不同組織中MeTPS6基因的表達(dá)情況;采集Ku50的葉片、葉柄、莖、須根和儲(chǔ)藏根,用于qPCR檢測(cè)同一品種不同組織中MeTPS6基因的表達(dá)情況。
1.3RNA提取及cDNA合成
參照RNA抽提試劑盒說明提取樣品總RNA,并使用cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)錄成cDNA,于-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4引物設(shè)計(jì)及合成
根據(jù)Phytozome木薯數(shù)據(jù)庫(kù)提供的TPS基因序列(cassava4.1001584m),采用Primer6.0設(shè)計(jì)引物,包括MeTPS6基因全長(zhǎng)擴(kuò)增引物(MeTPS6-F:5'-ATGGTGTCAAGGTCATACTCA-3';MeTPS6-R:5'-TTACACTGCAACTGTTTGTTCT-3')、MeTP$6基因qPCR引物(qMeTPS6-F:5'-TCTGGGGAGTCTCCATCGTT-Y:qMeTPS6-R:5-TGCCCTTATTGGCAGCTGA-3)和actin基因qPCR引物(qActin-F:5'-TGATGAGTCTGGTCCATCCA-3';qActin-R:5'-CCTCCTACGACCCAATCTCA-3')(Fu et a1.,2016)。引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.5基因克隆
以木薯葉片cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。反應(yīng)體系50.0μL:cDNA模板1.0μL,2.5mmol/L dNTPs4.0μL,10xLA Buffer 5.0μL,5 U/μL LA Taq DNA聚合酶0.5μL,10μmol/L正、反向引物各1.0μL,ddH20補(bǔ)充至50.0μL。擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5.0min;94℃45s,50℃45s,72℃3.5min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72℃延伸7.0min;25℃保存。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),并送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。
1.6qPCR檢測(cè)
利用SYBR Premix EX Taq試劑盒在Mx 3005P熒光定量PCR儀上進(jìn)行qPCR檢測(cè)。反應(yīng)體系20.0μL:SYBR Green I 10.0μL,ROX 0.4μL,正、反向引物各0.4μL,cDNA模板2.0μL,ddH20補(bǔ)充至20.0μL。擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性30s;95℃10s,55℃10s,72℃20s,進(jìn)行40個(gè)循環(huán)。每個(gè)樣品重復(fù)3次,采用2法計(jì)算基因相對(duì)表達(dá)量(Fu et a1.,2016)。
1.7生物信息學(xué)分析
在Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)中利用BLASTp在線搜索MeTPS6基因的同源序列,利用ClustalX進(jìn)行序列比對(duì)(Jeanmougin et a1.,1998),利用MEGA 5.2構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(Tamura et a1.,2011),利用ExPASyProtParam分析蛋白質(zhì)的理化性質(zhì),利用Plant-mPLoc進(jìn)行亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè),利用NCBI-CDD數(shù)據(jù)庫(kù)分析蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域,利用PlantCARE分析啟動(dòng)子元件,利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建基因共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
1.8統(tǒng)計(jì)分析
采用Excel 2007進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和制圖,并以Duncan s進(jìn)行差異顯著性分析。
2結(jié)果與分析
2.1MerPS6基因克隆及序列分析結(jié)果
MeTPS6基因PCR擴(kuò)增結(jié)果顯示,擴(kuò)增條帶單一且清晰,長(zhǎng)度約2500bp,與預(yù)期結(jié)果相符(圖1)。測(cè)序結(jié)果顯示,該序列長(zhǎng)度為2565bp,編碼854個(gè)氨基酸。經(jīng)BLASTx比對(duì)分析,發(fā)現(xiàn)MeTPS6基因與擬南芥TPS基因的同源性最高(83.3%)。將MeTP$6基因序列提交至GenBank,登錄號(hào)為MF684374。MeTP$6基因與參考序列(cassava4.1 001 584m)的比對(duì)分析結(jié)果顯示,二者存在7個(gè)堿基差異,但均為同義突變。MeTPS6基因與基因組DNA序列的比對(duì)分析結(jié)果顯示,該基因含3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,MeTPS6基因編碼蛋白(MeTPS6)分子量為96860-4 Da,理論等電點(diǎn)(pI)為5.83,屬于不穩(wěn)定蛋白,不穩(wěn)定系數(shù)為45.76,定位于葉綠體,含有TPS家族保守結(jié)構(gòu)域(GlyCO transf_20)(圖2)。
2.2系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹分析結(jié)果
經(jīng)BLASTp同源序列比對(duì),獲得與MeTPS6蛋白氨基酸序列同源性較高的其他物種蛋白氨基酸序列,并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖3)。結(jié)果顯示,這些同源蛋白可分為四大類:第1類包括水稻、高粱、狗尾草、柳枝稷、谷子和玉米,除水稻外均為C4物種,且水稻與柳枝稷親緣關(guān)系最近;第Ⅱ類包括琴葉擬南芥、鼠耳芥、擬南芥、薺菜花和白菜型油菜,均為十字花科的物種;第Ⅲ類包括木薯、楊樹和杞柳,木薯MeTPS6蛋白分別與楊樹(Potri.010G104500)和杞柳(SapurVlA.0015s0610)同源蛋白的氨基酸序列相似性分別達(dá)92.6%和90.0%,表明木薯與楊樹和杞柳的親緣關(guān)系最近;第Ⅳ類僅包括二穗短柄草,雖然二穗短柄草然也為C4物種,但其序列與其他C4物種存在明顯差異,故單獨(dú)聚為一類。
2.3MeTPS6基因啟動(dòng)子元件分析結(jié)果
啟動(dòng)子是基因的重要組成部分,調(diào)控著基因轉(zhuǎn)錄的起始時(shí)間和表達(dá)水平。本研究選取MeTPS6基因起始密碼子上游1500bp進(jìn)行啟動(dòng)子元件分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該基因的啟動(dòng)子序列中不僅存在大量非生物脅迫相關(guān)的元件,如低溫相關(guān)元件LTR、干旱相關(guān)元件MBs等,還存在許多激素相關(guān)的元件,如脫落酸相關(guān)的元件ABRE和CE3、水楊酸相關(guān)元件TCA-ele-ment、生長(zhǎng)素相關(guān)元件TGA-element、茉莉酸相關(guān)元件TGACG-motif,赤霉素相關(guān)元件GARE-motif及光響應(yīng)相關(guān)元件ACE、Box I、Box II和G-Box等。其中,脫落酸是一種重要的激素,在植物低溫、干旱、高鹽等非生物脅迫中發(fā)揮非常關(guān)鍵的調(diào)控作用。表明MeTPS6基因可能從轉(zhuǎn)錄水平參與干旱、低溫和光照(遮蔭)脅迫響應(yīng)。
2.4MeTPS6基因在不同品種不同組織中的表達(dá)特性分析結(jié)果
MeTPS6基因在w14、Ku50和Arg7葉片和根中的表達(dá)情況如圖4所示。在葉片中,MeTPS6基因在W14的表達(dá)量最高,Ku50次之,Arg7最低,均達(dá)顯著差異(P<0.05,下同);在根中,MeTPS6~因在Ku50的表達(dá)量顯著高于W14和Arg7,而w14和Arg7的差異不顯著(P>0.05,下同)。對(duì)7:Ku50和Arg7,MeTPS6基因在根中的表達(dá)量均顯著高于葉片,但對(duì)于W14,MeTPS6基因在根和葉片中的表達(dá)量無(wú)顯著差異,故推測(cè)木薯從野生種到栽培種的馴化過程中MeTPS6基因受到了人為選擇,使得MeTPS6基因主要在木薯栽培種的根中起調(diào)控作用。MeTPS6基因在Ku50不同組織中的表達(dá)特性如圖5所示。MeTPS6基因的表達(dá)量在儲(chǔ)藏根中最高,須根次之,二者均顯著高于莖、葉柄和葉片。
2.5MeTPS6基因在不同脅迫處理下的表達(dá)模式分析結(jié)果
干旱脅迫下,MeTPS6基因在Ku50不同組織中的表達(dá)模式如圖6-A所示。隨干旱脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),MeTPS6基因的表達(dá)量在未展開葉顯著下調(diào),在脅迫3和24h后表達(dá)量分別下降17%和24%;MeTPS6基因的表達(dá)量在第一片完全展開葉和老葉中均無(wú)顯著變化;MeTPS6基因的表達(dá)量在根中顯著上調(diào),在脅迫3和24垢的表達(dá)量分別是對(duì)照(脅迫0h)的3.0和2.7倍。
低溫脅迫下,MeTPS6基因在Ku50不同組織中的表達(dá)模式如圖6-B所示。MeTPS6基因的表達(dá)模式在不同組織中存在明顯差異,隨低溫脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),在未展開葉中MeTPS6基因的表達(dá)量先顯著上升后顯著下降;在第一片完全展開葉中MeTPS6基因的表達(dá)量先無(wú)顯著變化后顯著下降;在根中MeTPS6基因的表達(dá)量先顯著上升后無(wú)顯著變化。
遮蔭脅迫下,MeTPS6基因在Ku50不同組織中的表達(dá)如圖6-C所示。MeTPS6基因的表達(dá)量在未展開葉、第一片完全展開葉和老葉中均顯著上調(diào),脅迫后MeTPS6基因的表達(dá)量分別是對(duì)照的1.2、1.5和1.3倍。
綜上所述,干旱、低溫和遮蔭脅迫可顯著誘導(dǎo)MeTPS6基因表達(dá),且在干旱和低溫脅迫下,MeTPS6基因在不同組織中的表達(dá)模式存在明顯差異,推測(cè)在不同組織中MeTPS6基因抗逆境脅迫的調(diào)控功能不同。
2.6MeTPS6基因共表達(dá)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果
為初步了解MeTPS6基因參與的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)將MeTPS6基因映射到擬南芥同源序列(AtTPS6)進(jìn)行共表達(dá)分析,結(jié)果如圖7所示。在高置信度(Confidence=0.8)的情況下,共找到13個(gè)共表達(dá)基因,其中有10個(gè)為TPS同源基因,表明這些同源基因可能相互協(xié)調(diào),共同參與植物生物學(xué)過程;另外3個(gè)基因(CAT、CAT1和F5M15.5)均編碼過氧化氫酶,主要參與保護(hù)細(xì)胞免受過氧化氫的毒性作用。推測(cè)TPS基因與CAT基因在脅迫條件下共同發(fā)揮氧化還原作用,以保護(hù)植物細(xì)胞免受傷害,從而增強(qiáng)植物的抗逆性。
3討論
TPS是海藻糖生物合成途徑中的關(guān)鍵酶,在植物干旱、低溫、高鹽等逆境脅迫下發(fā)揮重要作用。植物中TPS基因以基因家族的形式存在,大部分TPS蛋白含有TPS基因家族保守結(jié)構(gòu)域(Henry et a1.,2014)。目前,已從擬南芥、水稻、香蕉、辣椒等多個(gè)物種中克隆獲得TPS基因,并對(duì)其功能進(jìn)行深入研究(Li et a1.,2011;魏兵強(qiáng)等,2016;邢文婷等,2017),但在木薯中尚無(wú)相關(guān)報(bào)道。本研究從木薯葉片克隆獲得MeTPS6基因,其編碼854個(gè)氨基酸,含有TPS家族保守結(jié)構(gòu)域,與楊樹和杞柳TPS基因的親緣關(guān)系較近。
TPS基因在植物不同組織中的表達(dá)量存在明顯差異(丁菲等,2012;魏兵強(qiáng)等,2016),故推測(cè)TPS基因在植物不同組織中發(fā)揮不同的調(diào)控功能,如辣椒CaTPS基因在葉片中的表達(dá)量是根和莖中的5.0~6.0倍(魏兵強(qiáng)等,2016);香蕉MaTPS基因在球莖、假莖和葉中表達(dá)量較高,在果實(shí)中較低(王安邦等,2016);茶樹CsTPS基因在花中表達(dá)量最高,根次之,最低是莖、芽、葉和種子,表達(dá)豐度僅為花的13%~41%(丁菲等,2012),因此,TPS;~因表達(dá)呈明顯的組織特異性。本研究也發(fā)現(xiàn),MeTPS6基因在儲(chǔ)藏根中的表達(dá)量最高,在莖、葉柄和葉片中的表達(dá)量最低,表明MeTPS6基因主要在木薯的儲(chǔ)藏根中發(fā)揮抗脅迫調(diào)控作用。
啟動(dòng)子是基因表達(dá)調(diào)控的重要元件。本研究通過對(duì)MeTPS6基因的啟動(dòng)子序列進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子序列存在大量非生物脅迫相關(guān)元件、激素相關(guān)元件及光響應(yīng)相關(guān)元件,由此推測(cè)MeTPS6基因參與低溫、干旱和光照(遮蔭)脅迫下抗脅迫相關(guān)的調(diào)控。因此,本研究分別對(duì)木薯進(jìn)行干旱、低溫和遮蔭脅迫,并比較分析木薯不同組織中MeTPS6基因的表達(dá)情況,結(jié)果表明,MeTPS6基因表達(dá)受干旱、低溫和遮蔭脅迫誘導(dǎo),其原因可能是在干旱、低溫等脅迫條件下,植物體內(nèi)會(huì)迅速積累各種小分子化合物(海藻糖、脯氨酸等)以保持細(xì)胞的水含量,同時(shí)細(xì)胞中抵抗氧化損傷的關(guān)鍵酶包括超氧化物歧化酶、過氧化物酶和過氧化氫酶會(huì)被激活(Fu et a1.,2016),故相關(guān)基因表達(dá)上調(diào)。本研究還發(fā)現(xiàn)多個(gè)TPS同源基因(包括METPS6)和CA瑾因共表達(dá),間接驗(yàn)證了上述推論。脫落酸是植物響應(yīng)干旱、低溫等非生物脅迫的一種重要的植物激素(Shinozaki,2007)。雖然本研究在MeTPS6基因的啟動(dòng)子區(qū)域發(fā)現(xiàn)脫落酸相關(guān)元件(ABRE),但MeTPS6基因是否通過脫落酸途徑參與木薯抗干旱、低溫等非生物脅迫,及CAT基因是否也參與相關(guān)基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)尚不清楚,均有待深入研究。
4結(jié)論
MeTPS6基因主要在木薯的根(特別是儲(chǔ)藏根)中表達(dá),并從轉(zhuǎn)錄水平參與干旱、低溫和遮蔭脅迫響應(yīng),可作為候選基因進(jìn)一步研究其在木薯抗逆中的功能。
(責(zé)任編輯陳燕)