摘要:文章介紹了利用PubMed數(shù)據(jù)庫檢索循證中醫(yī)藥證據(jù)時的檢索技巧和四種有效而快捷的檢索方式,并結(jié)合實例分析各方式的檢索特點,以期為循證中醫(yī)藥研究人員檢索PubMed時提供參考。
關(guān)鍵詞:PubMed;循證醫(yī)學(xué);中醫(yī)藥;檢索
中圖分類號:R2-03
Abstract:This paper introduces the search tips and foureffective andefficientways to usePubMedto retrieveevidenceof evidence-based traditionalChinese medicine, use retrieval case to analyzethe characteristic ofeachway,in order toprovide references to evidence-basedtraditional Chinesemedicineresearchersretrieve inPubMed.
Key words:PubMed;Evidence-based medicine;Traditional Chinese Medicine;Retrieval
循證醫(yī)學(xué)(evidence-based medicine,EBM)是國際臨床領(lǐng)域20世紀(jì)90年代誕生的一種新醫(yī)學(xué)模式,是指在臨床決策時需要慎重、準(zhǔn)確、明智的應(yīng)用當(dāng)前所能獲得的最佳證據(jù),結(jié)合臨床醫(yī)生的個人專業(yè)技能和多年臨床經(jīng)驗,同時考慮患者的權(quán)利、價值和期望[1]。循證醫(yī)學(xué)從誕生至今短短二十幾年,在國際醫(yī)學(xué)領(lǐng)域得到了迅速發(fā)展,也得到了國內(nèi)外中醫(yī)藥界的高度重視,越來越多的研究人員將循證醫(yī)學(xué)的思想理念引人了中醫(yī)藥的臨床研究之中。循證中醫(yī)藥研究步驟是:提出擬解決的問題→檢索證據(jù)→評價證據(jù)→應(yīng)用證據(jù)→后效評價,檢索證據(jù)是循證中醫(yī)藥研究的第二個步驟且必不可少,證據(jù)檢索的好壞最終影響臨床決策,循證中醫(yī)藥的證據(jù)檢索跟一般的中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索有一定區(qū)別,主要因為循證中醫(yī)藥的證據(jù)是以患者為研究對象的各種臨床研究所得到的結(jié)果和結(jié)論,通常不包括體外細(xì)胞實驗、離體器官的研究和動物試驗[2]。本文探討世界著名生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫PubMed的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索。
1 PubMed概述
PubMed是循證中醫(yī)藥研究證據(jù)檢索環(huán)節(jié)的一個重要外文數(shù)據(jù)庫,該庫是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館下屬的國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)的一個基于Web的免費生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng),學(xué)科范疇涉及生物醫(yī)學(xué)各方面,文獻(xiàn)量超過240余萬篇,檢索途徑多(有基本檢索、高級檢索、主題詞檢索、期刊檢索等),檢索功能強(具有自動詞語匹配功能、主題詞檢索功能、檢索結(jié)果多種限定、擴展和加權(quán)檢索等),檢索效果好(有多種方式保障檢全率和檢準(zhǔn)率)。其數(shù)據(jù)主要來源為MEDLINE,MEDLINE是由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館創(chuàng)建和維護的世界上最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文摘數(shù)據(jù)庫,其文獻(xiàn)均使用美國國立醫(yī)學(xué)圖書館編制的《醫(yī)學(xué)主題詞表》(Medical Subject Heading,MeSH)進(jìn)行主題標(biāo)引。
PubMed收錄的循證中醫(yī)藥證據(jù)有原始研究證據(jù)和二次研究證據(jù)。原始研究證據(jù)是指直接以患者或健康人為研究對象,對相關(guān)問題進(jìn)行研究所獲得的第一手?jǐn)?shù)據(jù),經(jīng)統(tǒng)計學(xué)處理、分析、總結(jié)而形成的研究報告。相關(guān)的文獻(xiàn)類型有病例對照研究、病例分析、個案報告、隨機對照試驗等。二次研究證據(jù)是指在全面收集針對某一問題的所有原始研究證據(jù)的基礎(chǔ)上,經(jīng)嚴(yán)格評價、整合處理、分析總結(jié)而形成的研究報告,比如:系統(tǒng)評價/Meta分析、臨床實踐指南、臨床路徑、衛(wèi)生技術(shù)評估、衛(wèi)生經(jīng)濟學(xué)研究等。證據(jù)的質(zhì)量可參照證據(jù)分級標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行評價。
2 PubMed的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索技巧
PubMed采用MeSH詞表進(jìn)行主題標(biāo)引,該此表一直在不斷增加中醫(yī)藥學(xué)方面的主題詞,因此,在PubMed的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索時,不僅可以用關(guān)鍵詞檢索,還可以采用主題詞檢索。
2.1關(guān)鍵詞檢索技巧 關(guān)鍵詞檢索應(yīng)該提煉檢索課題中有實質(zhì)意義的詞,要把各種英文表達(dá)的可能性盡量都考慮進(jìn)去,中醫(yī)藥的英文譯名往往有多個,要考慮漢語拼音名稱、英文名稱、拉丁文等,比如蒼耳子英文就有cangerzi,cangerzi,cangerzi,Cocklebur Fruit,F(xiàn)ructusXanthii,XanthiiFructus,the ac
hene of Siberia cocklebur等。
2.2主題詞檢索技巧 進(jìn)行主題詞檢索時,首先要盡可能全面的收集需要檢索的中醫(yī)藥名詞術(shù)語的不同英文表達(dá)形式,然后使用這些詞在MeSH Database中查找到對應(yīng)的主題詞,并組合相應(yīng)的副主題詞進(jìn)行檢索。比如中醫(yī)有zhongyi,zhongyixue,Traditional Chinese Medicine,Chinese Traditional Medicine
TCM等,然后通過系統(tǒng)找到相對應(yīng)主題詞為Medicine,Chinese Traditional。對于中藥和方劑,在PubMed中一般為補充物質(zhì)概念(Supplementary Concept),比如小柴胡,在PubMed主題詞數(shù)據(jù)庫中檢索后發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)把該詞標(biāo)引為xiaochaihu [Supplementary Concept]。另外PubMed沒有諸如《中國中醫(yī)藥學(xué)主題詞表》針對中醫(yī)藥的副主題詞,比如中藥療法、按摩療法、中醫(yī)病機之類,因此,PubMed在檢索此類概念的時候只能再查找相對應(yīng)的主題詞或者關(guān)鍵詞進(jìn)行檢索。
2.3主題詞結(jié)合關(guān)鍵詞檢索 在PubMed中檢索出中醫(yī)藥主題詞后,為了避免漏檢(中醫(yī)藥主題詞可能會出現(xiàn)漏標(biāo)或者標(biāo)引不準(zhǔn)確),需要再用關(guān)鍵詞補充檢索,比如\"Acupuncture\"[Mesh] 檢索到文獻(xiàn)1299篇,用Acupuncture[Title/Abstract]可以檢索出16470篇,\"xiaochaihu\" [Supplementary Concept]檢索到僅8篇文獻(xiàn),用xiaochaihu OR xiao chai hu可以檢索到文獻(xiàn)35篇,關(guān)鍵詞檢索結(jié)果與主題詞檢索結(jié)果可以進(jìn)行邏輯或運算。
3 PubMed的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索方式
PubMed數(shù)據(jù)庫中主要提供四種方式進(jìn)行快速而有效的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)的檢索:①利用檢索結(jié)果Filter功能;②利用Clinical Queries模塊;③askMEDLINE功能;④利用PICO要素檢索。
3.1利用檢索結(jié)果Filter功能進(jìn)行循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索 PubMed的Filter將文獻(xiàn)類型限定為Practice Guideline(實踐指南)、Meta-analysis(Meta分析)、 Clinical Trial(臨床試驗)、Clinical Trial, Phase I(一期臨床試驗)、Clinical Trial, Phase II(二期臨床試驗)、Clinical Trial, Phase III(三期臨床試驗)、Clinical Trial, Phase IV(四期臨床試驗)、Systematic Reviews(系統(tǒng)評價)、Controlled Clinical Trial(臨床對照試驗)、Case Reports(病例報告)、Randomized Controlled Trial(隨機對照試驗)、Multicenter Study(多中心研究)、Pragmatic Clinical Trial(實效性臨床試驗)、Comparative Study(比較研究)等即可獲得相關(guān)特定文獻(xiàn)類型的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)。具體檢索方法是在PubMed檢索結(jié)果界面對檢索結(jié)果進(jìn)行Filter限定,例如檢索針灸應(yīng)用于青光眼的系統(tǒng)評價,檢索式見表1(檢索時間為2015年11月13日)。
表1的檢索式中#1~#9檢索的是針灸相關(guān)的文獻(xiàn),其中#1~#5采用針灸相關(guān)的主題詞檢索,#6~#8采用的是針灸的相關(guān)關(guān)鍵詞檢索,為了提高文獻(xiàn)檢準(zhǔn)率,限定在題名或摘要字段中檢索,#9對前八項檢索結(jié)果進(jìn)行邏輯或,得到了針灸相關(guān)的所有文獻(xiàn)。#10檢索的是青光眼做主題詞的文獻(xiàn),并對其下位主題詞進(jìn)行擴展檢索,#11~#13檢索的是青光眼相關(guān)的關(guān)鍵詞在題名或摘要中出現(xiàn)文獻(xiàn),#14對#10~#13進(jìn)行了邏輯或運算,得到了青光眼相關(guān)的所有文獻(xiàn),#15再將針灸相關(guān)文獻(xiàn)和青光眼相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行邏輯與運算,檢索結(jié)果為針灸應(yīng)用于青光眼的文獻(xiàn),#16將針灸應(yīng)用于青光眼的文獻(xiàn)類型限定為Systematic Reviews,即實現(xiàn)了針灸應(yīng)用于青光眼的系統(tǒng)評價文獻(xiàn)的檢索。同理,若需檢索隨機對照試驗的文獻(xiàn),在最后一個步驟Filter文獻(xiàn)類型限定為Randomized Controlled Trial即可,若需同時檢索幾種文獻(xiàn)類型的文獻(xiàn),比如檢索針灸應(yīng)用于青光眼的系統(tǒng)評價或Meta分析文獻(xiàn),只需在文獻(xiàn)類型限定中同時選中Systematic Reviews和Meta-Analysis,此方式的優(yōu)點有:可與基本檢索、高級檢索、主題詞檢索結(jié)合進(jìn)行檢索,檢全率和檢準(zhǔn)率有保障,可根據(jù)實際需要靈活選擇各種不同文獻(xiàn)類型。
3.2利用Clinical Queries模塊進(jìn)行循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索 PubMed數(shù)據(jù)庫的Clinical Queries模塊專為臨床醫(yī)生設(shè)計,可檢索Clinical Study Category(臨床研究)以及Systematic Review(系統(tǒng)評價)。其中Clinical Study Category主要提供臨床的原始研究文獻(xiàn),可選擇病因、治療、診斷、預(yù)后、臨床預(yù)測五方面進(jìn)行瀏覽,Systematic Review則供檢索疾病的系統(tǒng)評價、Meta分析、臨床試驗綜述、指南等方面的文獻(xiàn),為二次研究證據(jù)。
若用此法查找針灸應(yīng)用于青光眼的循證中醫(yī)藥文獻(xiàn),可以在檢索框輸入\"(Acupuncture[tw] OR Electroacupuncture[tw] OR Acupoint*[tw])AND Glaucoma*[tw]\",點擊Search后,在Clinical Study Category得到12篇臨床文獻(xiàn),可選擇治療、預(yù)后等類目進(jìn)行瀏覽,在Systematic Review中則直接返回命中的4條相關(guān)系統(tǒng)評價、meta分析等二次文獻(xiàn)。此方法的優(yōu)點是檢索出的都是臨床循證醫(yī)學(xué)相關(guān)文獻(xiàn),但是此檢索只提供一個檢索框,適合檢索式相對簡單的檢索。
3.3利用askMEDLINE功能檢索 askMEDLINE原為PubMed手持終端應(yīng)用,也可在PC上檢索,網(wǎng)址為http://pubmedhh.nlm.nih.gov/。該法直接輸入臨床問題,選擇文獻(xiàn)類型,點擊提交即可,其中文獻(xiàn)類型有臨床試驗、Meta分析、隨機對照試驗、系統(tǒng)評價或綜述、實踐指南這幾類涉及循證醫(yī)學(xué)方面的文獻(xiàn)。例如針灸應(yīng)用于青光眼的文獻(xiàn),可以直接輸入口語化的臨床問題\"use acupuncturefor glaucoma\"或者\"acupuncture forglaucoma\"等,提交問題之后選擇系統(tǒng)評價可得到46條結(jié)果,選擇臨床試驗有51條結(jié)果,選擇Meta分析有25條結(jié)果。該方法的優(yōu)點是不需要考慮太多檢索技巧,直接用自然語言表達(dá)的問題進(jìn)行檢索,并且檢索結(jié)果相對較多。
3.4利用PICO功能檢索 PICO檢索也為PubMed手持終端應(yīng)用,可在PC機上檢索,網(wǎng)址同askMEDLINE。該法需要將臨床問題分解為循證中醫(yī)藥的PICO四要素,依據(jù)PICO四要素進(jìn)行檢索。P為Patient/Problem(患者人群或臨床問題),I為Intervention(治療、診斷等),C為Compare(對照,可無),O為Outcome(結(jié)局,可無),還可選擇文獻(xiàn)類型,選項有臨床試驗、Meta分析、隨機對照試驗、系統(tǒng)評價、綜述、實踐指南。若檢索針灸應(yīng)用于青光眼的系統(tǒng)評價文獻(xiàn),利用PICO檢索可為:P為Glaucoma,I為Acupuncture,文獻(xiàn)類型限定為Systematic Reviews,可以檢出4篇系統(tǒng)評價。應(yīng)用此法的前提是正確的將循證中醫(yī)藥臨床問題分解PICO要素,輸入相應(yīng)檢索框即可簡便的進(jìn)行檢索。
4 結(jié)語
文章所述四種檢索方法都是在PubMed檢索循證中醫(yī)藥文獻(xiàn)比較行之有效的辦法,法1利用檢索結(jié)果的文獻(xiàn)類型Filter功能可靈活滿足循證中醫(yī)藥研究對不同研究文獻(xiàn)的特定需求,同時又能結(jié)合基本檢索、高級檢索和主題詞檢索功能,可運用多種檢索規(guī)則和技巧,較好的保障檢全率和檢準(zhǔn)率;法2、法3和法4各有針對性,檢索較簡單,檢索技巧較法1少,在選擇時,若要一次性獲得相關(guān)的原始研究證據(jù)和二次研究證據(jù),并且將兩者分開顯示,則可以運用法2即Clinical Queries模塊檢索,若不想考慮太多的檢索技巧,利用自然語言進(jìn)行檢索,可以采用法3即askMEDLINE檢索,若遇到的循證中醫(yī)藥問題能分解出比較明確的PICO要素,可以采用法4即PICO檢索。
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編輯/蔡睿琳