兔出血癥病毒SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用

王　波，李桂黎，王　印，姚學(xué)萍，楊澤曉

(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)　動(dòng)物醫(yī)學(xué)院，四川 成都　611130)

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兔出血癥病毒SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用

王波，李桂黎，王印，姚學(xué)萍，楊澤曉*

(四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院，四川 成都611130)

兔病毒性出血癥(rabbit hemorrhagic disease，RHD)是一種具有高度傳染性的疾病，嚴(yán)重威脅養(yǎng)兔業(yè)的健康發(fā)展。為了建立一種能夠快速、高效、敏感的檢測(cè)RHDV的方法，試驗(yàn)設(shè)計(jì)了一對(duì)特異性引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增，得到RHDV VP60基因中979 bp的保守序列，并將其克隆到pMD19-T載體中作為標(biāo)準(zhǔn)品建立標(biāo)準(zhǔn)曲線；在擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)設(shè)計(jì)一對(duì)簡(jiǎn)并引物，建立SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR檢測(cè)方法，優(yōu)化反應(yīng)條件，并驗(yàn)證該方法的敏感性、特異性、重復(fù)性。結(jié)果表明：該方法可檢測(cè)到的模板的最低拷貝數(shù)為8.18×101copies，只能特異性擴(kuò)增RHDV，pGM19-T-EBHSV、兔巴氏桿菌、兔沙門氏菌、兔大腸埃希菌和健康兔組織RNA的擴(kuò)增均為陰性，具有良好的特異性和重復(fù)性；同時(shí)用此方法對(duì)人工感染家兔的內(nèi)臟分別進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果表明SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR能快速檢測(cè)到不同臟器中的兔病毒性出血癥病毒RNA含量，可用于臨床兔瘟病毒的檢測(cè)。

兔病毒性出血癥病毒(RHD)；VP60；SYBR Green Ⅰ；實(shí)時(shí)熒光定量PCR

兔病毒性出血癥(rabbit hemorrhagic disease，RHD)是一種急性的、具有高度傳染性、高致死性的疾病[1]，又稱兔瘟。它由兔出血癥病毒(rabbit hemorrhagic disease virus，RHDV)引起，在自然條件下主要侵害青年兔和成年兔，2月齡以下的仔兔自然感染時(shí)一般不會(huì)發(fā)病死亡。兔瘟病毒感染兔群時(shí)發(fā)病率和死亡率高達(dá)90%～100%，已成為嚴(yán)重危害養(yǎng)兔業(yè)健康發(fā)展的一種疾病。1984年該病首先在我國(guó)江蘇省暴發(fā)[2]，隨后歐、亞、美、澳四大洲的一些國(guó)家均報(bào)道有本病流行[3]，隨著世界各地關(guān)于兔瘟報(bào)道的增多，說明兔瘟現(xiàn)在已呈現(xiàn)出全球流行性[4-5]。世界動(dòng)物衛(wèi)生組織在1989年將兔瘟列為B類傳染病，我國(guó)也將其列為二類傳染病。

RHDV屬于杯狀病毒科(Caliciviridae)兔病毒屬(Lagovirus)[6]，是沒有囊膜的、單股正鏈RNA病毒[7]。目前被廣泛用來檢測(cè)的方法主要有：血凝試驗(yàn)、Western blot、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)、免疫瓊擴(kuò)試驗(yàn)、RT-PCR等。這些方法的前期準(zhǔn)備比較煩瑣、耗時(shí)費(fèi)力，而且試驗(yàn)敏感性低，SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR作為熒光定量PCR方法中的一種，當(dāng)熒光染料嵌合于DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的小溝部位后，會(huì)發(fā)射熒光信號(hào)，隨著PCR反應(yīng)的進(jìn)行，SYBR Green Ⅰ不斷與新合成的dsDNA結(jié)合，熒光強(qiáng)度隨著聚合反應(yīng)的進(jìn)行逐漸增加，便可被熒光探測(cè)系統(tǒng)檢測(cè)到[8]，熒光強(qiáng)度又與初始模板濃度量相關(guān)，既可定性檢測(cè)也可定量檢測(cè)。考慮到RHDV的變異，本研究根據(jù)GenBank中已公布RHDV VP60基因序列設(shè)計(jì)1對(duì)簡(jiǎn)并引物，對(duì)兔瘟病毒的SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量檢測(cè)方法進(jìn)行了初步研究。

1　材料與方法

1.1主要試劑

熒光定量SYBR Green Ⅰ染料購買自生工生物工程(上海)股份有限公司；病毒基因組RNA提取試劑盒、DNA膠回收純化試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購買自天根生化科技(北京)有限公司；反轉(zhuǎn)錄試劑盒購買自寶生物工程(大連)有限公司；大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物檢疫實(shí)驗(yàn)室制備并保存。

1.2毒株

感染兔出血癥病毒(RHDV)的病料、兔巴氏桿菌病菌種、兔沙門氏菌病菌種、兔大腸埃希菌菌種、健康兔組織由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)室保存；歐洲野兔綜合征病毒(EBHSV)重組陽性質(zhì)粒由四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院實(shí)驗(yàn)室王印[9]老師構(gòu)建并保存。

1.3引物的設(shè)計(jì)與合成

在NCBI上下載已公布的RHDV VP60基因序列若干條，用DNAStar進(jìn)行比對(duì)分析，利用Beacon Designer 8軟件在其保守區(qū)設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物F1，F(xiàn)2，可擴(kuò)增VP60基因的片段長(zhǎng)度為979 bp，上游引物F1：5′-TCACTGGTGTTGGCAATG-3′，下游引物F2:5′-CAGACATAAGAAAAGCC-3′；在F1，F(xiàn)2引物的擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)，設(shè)計(jì)1對(duì)SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR引物P1(5′-TGGAGATYGGTTTRAGTG-3′)，P2(5′-AATGAGTTCAGTCARGTCAA-3′)，可擴(kuò)增的片段為165 bp。引物由北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司合成。

1.4病毒RNA的提取及反轉(zhuǎn)錄

根據(jù)病毒基因組RNA提取試劑盒說明書提取組織中病毒RNA，作為模板進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄，反轉(zhuǎn)錄體系為10.0 μL，其中5×PrimeScript Buffer 2.0 μL，RNase Free dH2O 2.0 μL，Ramdom 6 mers 2.0 μL，Oligo dT Primer 0.5 μL，PrimeScript RT Enzyme Mix I 0.5 μL，RNA 3.0 μL。反轉(zhuǎn)錄程序?yàn)椋?7℃ 15 min，87℃ 5 s。得到cDNA，-20℃保存。

1.5VP60基因的PCR擴(kuò)增和質(zhì)粒的構(gòu)建

用反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA作模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增，擴(kuò)增的反應(yīng)總體系為20.0 μL：其中2×Taq Master Mix 10.0 μL，cDNA 2.0 μL，F(xiàn)1、F2各1.0 μL(10 μmol·L-1)，加超純水至20.0 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃ 5 min；94℃ 30 s，57℃ 45 s，72℃ 1 min，35個(gè)循環(huán)；72℃延伸10 min。擴(kuò)增后用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)。

將目的片段純化回收，把回收的DNA連接到pMD19-T載體，再轉(zhuǎn)化到大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中，構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD-19T-VP60，經(jīng)PCR鑒定后，將陽性質(zhì)粒送北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司測(cè)序鑒定。將構(gòu)建的質(zhì)粒pMD-19T-VP60利用核酸蛋白儀測(cè)定其在260和280 nm處的吸光度，計(jì)算出DNA的濃度和純度，之后將其進(jìn)行10倍梯度稀釋，作為陽性定量的標(biāo)準(zhǔn)模板，進(jìn)行熒光定量PCR的擴(kuò)增和建立標(biāo)準(zhǔn)曲線。

1.6實(shí)時(shí)熒光定量PCR的擴(kuò)增及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立

將簡(jiǎn)并引物P1和P2進(jìn)行PCR擴(kuò)增，反應(yīng)條件和反應(yīng)程序同上，擴(kuò)增后用1%瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)，驗(yàn)證引物是否合理。

用陽性質(zhì)粒做模板進(jìn)行SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR擴(kuò)增，將其反應(yīng)條件和反應(yīng)程序進(jìn)行優(yōu)化，確定其最佳反應(yīng)條件和反應(yīng)程序；將重組質(zhì)粒進(jìn)行10倍梯度稀釋，作為熒光定量PCR擴(kuò)增的模板，建立SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR擴(kuò)增的標(biāo)準(zhǔn)曲線。

1.7特異性試驗(yàn)

將實(shí)驗(yàn)室保存的歐洲野兔綜合征病毒重組質(zhì)粒、兔巴氏桿菌病菌種、兔沙門氏菌病菌種和兔大腸埃希菌菌種復(fù)蘇，用菌液當(dāng)模板，進(jìn)行SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR擴(kuò)增。

1.8敏感性試驗(yàn)

將制備的陽性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品按10倍梯度稀釋后，進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增，以此來測(cè)定熒光定量PCR所能檢測(cè)出來的模板的最低拷貝數(shù)。

1.9重復(fù)性試驗(yàn)

用同一次提取的不同濃度的陽性質(zhì)粒作為模板，在同一次試驗(yàn)中做3個(gè)重復(fù)，進(jìn)行熒光定量PCR 擴(kuò)增，測(cè)定標(biāo)準(zhǔn)品的穩(wěn)定性，同時(shí)做陰性對(duì)照。

1.10初步應(yīng)用

將含RHDV的病料組織研磨液經(jīng)過過濾后，取1 mL對(duì)健康成年家兔(3只)進(jìn)行腹腔注射，3 d后家兔死亡。分別取心臟、肝臟、脾臟、肺臟、腎臟提取RNA，反轉(zhuǎn)錄為cDNA，用建立的SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR方法進(jìn)行檢測(cè)，同時(shí)與普通RT-PCR[10]的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行比較。

2　結(jié)果與分析

2.1VP60基因的PCR擴(kuò)增

從實(shí)驗(yàn)室保存的病料中提取RNA，將其反轉(zhuǎn)錄成cDNA后用F1，F(xiàn)2和P1，P2分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增，經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后分別得到979 bp的目的片段(圖1-A)和165 bp的目的片段(圖1-B)，均無雜帶，與預(yù)期的結(jié)果相符。

M： DL2000 Marker；1： 病料擴(kuò)增產(chǎn)物;2： 靶基因擴(kuò)增產(chǎn)物圖1　RHDV VP60和靶基因PCR擴(kuò)增Fig.1　PCR results of RHDV VP60 and target gene

2.2質(zhì)粒的構(gòu)建

將PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用0.8%瓊脂糖凝膠純化回收，連接到pMD19-T載體，轉(zhuǎn)化到大腸埃希菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞，構(gòu)建重組質(zhì)粒pMD-19T-VP60，將其測(cè)序結(jié)果直接在NCBI上BLAST，得到的結(jié)果與RHDV VP60基因的同源性為96%。用核酸蛋白儀測(cè)定其濃度為32.9 mg·L-1，pMD-19T長(zhǎng)度為2 692 bp，引物擴(kuò)增長(zhǎng)度為979 bp，DNA length=載體長(zhǎng)度+引物擴(kuò)增片段，即DNA length=(2692+979)bp=3671 bp，根據(jù)拷貝數(shù)計(jì)算公式：(6.02×1023)×質(zhì)粒濃度(g·mL-1)/DNA length×660=copies·mL-1，得到重組質(zhì)粒DNA拷貝數(shù)：(6.02×1023×32.9×10-6)μg·mL-1/(3671×660)=8.18×1012copies·μL-1。

2.3熒光定量PCR標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立

將陽性質(zhì)粒經(jīng)10倍梯度稀釋后選取8.18×107～8.18×1012拷貝數(shù)的樣品作為模板進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增，通過對(duì)引物濃度的優(yōu)化、退火溫度的優(yōu)化和各程序反應(yīng)時(shí)間的優(yōu)化，最終確定的最佳反應(yīng)條件和反應(yīng)程序?yàn)椋涸?0.0 μL的反應(yīng)體系中，2×SG Fast qPCR Master Mix 10.0 μL，P1和P2各加0.5 μL，DNF Buffer 2.0 μL，模板2.0 μL，滅菌超純水5.0 μL；反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃ 3 min；95℃ 5 s，57℃ 10 s，72℃ 30 s，共40個(gè)循壞；生成動(dòng)力學(xué)曲線(圖2)和標(biāo)準(zhǔn)曲線(圖3)。由圖可見，NTC無特異性擴(kuò)增，在所測(cè)定的范圍內(nèi)標(biāo)準(zhǔn)品與Ct值之間存在線性關(guān)系，線性回歸方程Ct=-3.383×lgcopies+34.946(R2=0.997)。

2.4特異性試驗(yàn)

用建立的SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR反應(yīng)體系對(duì)RHDV陽性質(zhì)粒、EBHSV陽性質(zhì)粒、兔巴氏桿菌、兔沙門氏菌、兔大腸埃希菌和兔健康組織RNA進(jìn)行熒光定量PCR檢測(cè)，結(jié)果表明所設(shè)計(jì)的引物只能特異性的擴(kuò)增RHDV，對(duì)EBHSV陽性質(zhì)粒、兔巴氏桿菌、兔沙門氏菌等的檢測(cè)結(jié)果均為陰性(圖4)，說明所建立SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR方法具有很好的特異性。

1,8.18×1012 copies·mL-1;2,8.18×1011 copies·mL-1;3,8.18×1010 copies·mL-1;4,8.18×109 copies·mL-1;5,8.18×108 copies·mL-1;6,8.18×107 copies·mL-1;7,NTC(ddH2O)。圖2　SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR動(dòng)力學(xué)曲線Fig.2　The amplification of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

圖3　標(biāo)準(zhǔn)曲線Fig.3　The standard curve of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

1:RHDV;2:pGM-T-EBHSV;3:兔巴氏桿菌;4： 兔沙門氏菌;5： 兔大腸埃希菌;6： 健康兔組織RNA;7:NTC(ddH2O)。圖4　SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR的特異性試驗(yàn)Fig.4　The specificity assay of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

2.5敏感性試驗(yàn)

將制備的陽性質(zhì)粒10倍梯度稀釋后，作為模板進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增，得到的擴(kuò)增曲線(圖5)顯示，在8.18×100copies時(shí)與陰性對(duì)照結(jié)果基本重合，說明其靈敏度為8.18×101copies。

2.6重復(fù)性試驗(yàn)

選取質(zhì)粒濃度為8.18×1012～8.18×107copies·mL-1的樣品模板按制備標(biāo)準(zhǔn)曲線的反應(yīng)程序和反應(yīng)條件進(jìn)行熒光定量PCR擴(kuò)增，所得到的樣品Ct值在組內(nèi)的變異系數(shù)分別為1.12%，0.34%，0.36%，0.23%，0.51%，0.29%(表1)，而Tm值一直維持相同的數(shù)值(81℃)，同時(shí)，從PCR擴(kuò)增曲線(圖6)可以看出每個(gè)樣本的3條S曲線之間的誤差都不到1個(gè)循環(huán)，說明此方法具有良好的重復(fù)性和準(zhǔn)確性。

1,8.18×106 copies;2,8.18×105 copies;3,8.18×104 copies;4,8.18×103 copies;5,8.18×102 copies;6,8.18×101 copies;7,8.18×100 copies;8,NTC(ddH2O)。圖5　SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR的靈敏度試驗(yàn)Fig.5　The sensitivity assay of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

表1SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR重復(fù)性試驗(yàn)

Table 1The reproducibility assay of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

質(zhì)粒濃度/(8.18×10n)Ct值(n=3)平均值標(biāo)準(zhǔn)差變異系數(shù)CV/%1012313.430.1511.121011317.620.0600.341010320.890.0770.36109324.440.0570.23108327.050.1480.51107330.910.0920.29

1,8.18×1012 copies·mL-1;2,8.18×1011 copies·mL-1;3,8.18×1010 copies·mL-1;4,8.18×109 copies·mL-1;5,8.18×108 copies·mL-1;6,8.18×107 copies·mL-1;7,NTC(ddH2O)。圖6　SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR的重復(fù)性試驗(yàn)Fig.6　The reproducibility assay of SYBR Green Ⅰ real-time PCR

2.7初步應(yīng)用

用建立的SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR法和普通RT-PCR法同時(shí)對(duì)實(shí)驗(yàn)室人工感染家兔的內(nèi)臟分別進(jìn)行檢測(cè)，擴(kuò)增完成后系統(tǒng)自動(dòng)分析得到各臟器的Ct值(表2)，根據(jù)Ct值的大小與各臟器的含毒量相關(guān)性可知臟器中含毒量最多的是脾臟。普通RT-PCR方法的檢測(cè)結(jié)果(圖7)顯示脾臟的條帶最清晰，病毒含量最高，而心臟、肺臟的條帶不明顯，病毒含量相對(duì)較低，與SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR檢測(cè)結(jié)果相符合，表明熒光定量PCR方法在RHDV的檢測(cè)中不僅可以定量檢測(cè)，而且具有更高的敏感性。

表2人工感染家兔內(nèi)臟的Ct值

Table 2The Ct value of artificial infection rabbits

人工感染兔心臟肝臟脾臟肺臟腎臟A(Ct)28.0525.4018.6922.2235.45B(Ct)33.6121.2819.3531.2229.55C(Ct)23.8023.9021.8223.6126.40

M:DL2000 Marker；1： 心臟；2： 肝臟；3： 脾臟；4： 肺臟；5： 腎臟。圖7　家兔內(nèi)臟RHDV RT-PCR檢測(cè)部分結(jié)果Fig.7　RT-PCR detection of rabbit organs

3　討論

實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法是20世紀(jì)90年代發(fā)展起來的一種新型核酸定量技術(shù)。目前，在臨床醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)領(lǐng)域都得到了廣泛的應(yīng)用，已成為病毒含毒量檢測(cè)的常用方法[11]，它解決了傳統(tǒng)PCR方法在DNA序列擴(kuò)增和之后的產(chǎn)物分析中量化困難的問題。SYBR Green Ⅰ染料法與熒光探針法相比，染料法不需設(shè)計(jì)、標(biāo)記熒光探針，成本更低；另外，DNA在擴(kuò)增和分析的過程都在同樣的封閉系統(tǒng)完成，避免了樣品和產(chǎn)物的污染，而且不需要進(jìn)行PCR后續(xù)的實(shí)驗(yàn)處理或電泳檢測(cè)，更加省時(shí)，操作更簡(jiǎn)便，可直接進(jìn)行定性分析和定量分析，具有很好的實(shí)用性。

兔瘟自暴發(fā)以來，已給養(yǎng)兔業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失，亞洲、歐洲、澳洲對(duì)于兔瘟的報(bào)道也越來越多[12-13]，近年來雖有所控制，但仍有散發(fā)的報(bào)道。所以，建立一種快速、準(zhǔn)確、省時(shí)的檢測(cè)方法很有必要?？紤]到RHDV存在基因突變，本試驗(yàn)通過在RHDV VP60序列的保守區(qū)設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物，并優(yōu)化引物濃度、退火溫度及反應(yīng)程序，成功建立了一種SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR檢測(cè)方法。簡(jiǎn)并引物具有相對(duì)較寬的檢測(cè)范圍，解決了因基因變異引起的難以擴(kuò)增的問題，國(guó)內(nèi)尚無使用簡(jiǎn)并引物檢測(cè)RHDV的熒光RT-PCR研究的公開報(bào)道。2015年，Liu等[14]報(bào)道設(shè)計(jì)1對(duì)普通特異性引物建立了一種RHDV SYBR Green Ⅰ 熒光RT-PCR方法，并對(duì)臨床樣品和人工感染樣品進(jìn)行了檢測(cè)，結(jié)果顯示，受檢樣品中脾臟含毒量最多，這與本研究的檢測(cè)結(jié)果一致。然而2007年張秀娥等[15]報(bào)道用建立的RHDV TaqMan MGB熒光RT-PCR檢測(cè)方法，并對(duì)人工感染家兔內(nèi)臟的病毒含量進(jìn)行檢測(cè)，結(jié)果顯示，病毒在肝臟含量高于脾臟、血液、心臟、肺臟、腎臟和體液，這可能與病毒感染劑量或者感染途徑有關(guān)。本研究采用一對(duì)帶有簡(jiǎn)并堿基的引物通過反應(yīng)條件優(yōu)化、特異性試驗(yàn)、敏感性試驗(yàn)、標(biāo)準(zhǔn)曲線建立和人工感染樣品的檢測(cè)應(yīng)用建立了RHDV的SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR方法，該方法能檢測(cè)到的陽性質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品的最低拷貝數(shù)為8.18×101copies，樣品的組內(nèi)變異系數(shù)為0.23%～1.12%，重復(fù)性和準(zhǔn)確性高，與平行檢測(cè)RT-PCR方法檢測(cè)結(jié)果一致，且具有比普通RT-PCR更高的敏感性。因此，本試驗(yàn)建立的SYBR Green Ⅰ熒光定量PCR方法在定性、定量方面均具有良好的實(shí)用性，不僅可用于不同地方不同RHDV毒株的實(shí)驗(yàn)室快速檢測(cè)診斷，也可用于RHDV不同組織中定量檢測(cè)和致病機(jī)制的相關(guān)研究中。

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(責(zé)任編輯盧福莊)

Establishment and application of SYBR Green Ⅰ real-time PCR for detection of rabbit hemorrhagic disease virus

WANG Bo，LI Gui-li，WANG Yin，YAO Xue-ping，YANG Ze-xiao*

(College of Veterinary Medicine，Sichuan Agricultural University，Chengdu 611130，China )

Rabbit hemorrhagic disease is a highly contagious disease which causes serious damage to the healthy development of rabbit keeping.In order to establish a quick，efficient and sensitive detection method，a pair of specific primers were designed for PCR amplification to obtain 979 bp sequence of rabbit hemorrhagic disease virus(RHDV) VP60 gene.Then cloned it into pMD19-T vector to construct recombinant plasmid named pMD-19T-VP60，which was served as template to establish the standard curve.Meanwhile，a pair of degenerate primer was designed in the amplification region to establish the SYBR Green Ⅰ real-time PCR detection method，and the reaction condition was optimized，and the sensitivity，specificity and reproducibility were tested.The results showed that the SYBR Green Ⅰ real-time PCR could specifically detect RHDV that the limited detection content was 8.18×101copies and no amplification of pGM19-T-EBHSV，Pasteurella multocida，Salmonella，Escherichina coli and healthy organs from rabbits.At the same time，this method was used to detect the internal organs of artificial infection rabbits.The results showed that the SYBR Green Ⅰ fluorescence quantitative PCR could quickly detect the content of the virus RNA in different organs.So this assay could be applied in clinical diagnosis of RHDV.

rabbit hemorrhagic disease virus(RHDV);VP60;SYBR Green Ⅰ;real-time quantitative PCR

浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)Acta Agriculturae Zhejiangensis，2016，28(3):400-405http://www.zjnyxb.cn

王波，李桂黎，王印，等.兔出血癥病毒SYBR Green Ⅰ實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及初步應(yīng)用[J].浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)，2016，28(3):400-405.

10.3969/j.issn.1004-1524.2016.03.07

2015-11-04

國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(3140222)；四川省教育廳青年基金資助項(xiàng)目(11ZB064)

王波(1990—)，女，四川邛崍人，碩士研究生，研究方向?yàn)轭A(yù)防獸醫(yī)學(xué)。E-mail：18728156822@163.com

，楊澤曉，E-mail：yzxyang2003@126.com

S852.65+9.6

A

1004-1524(2016)03-0400-06