甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群18個STR基因座的遺傳多態(tài)性

張建，馬新，趙興春，莫曉婷，馬溫華，尚蕾，余政梁，孫輝，李萬水，葉健

（公安部物證鑒定中心，北京 100038）

甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群18個STR基因座的遺傳多態(tài)性

張建，馬新，趙興春*，莫曉婷，馬溫華，尚蕾，余政梁，孫輝，李萬水，葉健

（公安部物證鑒定中心，北京 100038）

目的 研究D5S818、D8S1179、D7S820、CSF1PO、D2S1338、D3S1358、vWA、D21S11、D16S539、PentaE、TPOX、TH01、D19S433、D18S51、FGA、D6S1043、D13S317、D12S391等18個短串聯(lián)重復(fù)序列（short tandem repeats，STR）基因座在甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群的遺傳多態(tài)性。方法 采用PCR擴增及毛細管電泳技術(shù)對615名甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族個體18個STR基因座進行分析。結(jié)果 615名甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族個體在18個STR基因座上，共檢出213種等位基因，850種基因型，其分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P > 0.05），18個基因座的雜合度（H）在0.633～0.928之間，匹配概率（Pm）在0.013～0.205之間，個體識別概率（DP）在0.795～0.987之間，多態(tài)信息含量（PIC）在0.560～0.920之間，非父排除概率（PE）值在0.332～0.854之間。結(jié)論 實驗研究了甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群18個STR基因座的遺傳多態(tài)性，為人類群體遺傳學(xué)及法醫(yī)學(xué)后續(xù)研究提供詳實可靠的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

群體遺傳學(xué)；DNATyperTM19；STR多態(tài)性；甘肅東鄉(xiāng)族

短串聯(lián)重復(fù)序列（short tandem repeats，STR）是法醫(yī)DNA鑒定領(lǐng)域重要的遺傳標記，具有多態(tài)性好、易于復(fù)合擴增、靈敏、突變率低、自動化檢測程度高等諸多優(yōu)點，廣泛應(yīng)用于人類個體識別、親子鑒定及繪制遺傳進化樹［1-3］。許多專門機構(gòu)致力于DNA檢測基因座的群體遺傳學(xué)研究［4-9］，以尋找到適合于不同民族、不同群體個人識別和親權(quán)鑒定的基因座。本文采用FAM（藍色）、HEX（綠色）、TAMRA（黃色）、ROX（紅色）標記的熒光復(fù)合擴增試劑盒DNATyperTM19對甘肅地區(qū)615名東鄉(xiāng)族無關(guān)個體進行檢驗，獲得了該地區(qū)東鄉(xiāng)族群體18個STR基因座（D5S818、D8S1179、D7S820、CSF1PO、D2S1338、D3S1358、vWA、D21S11、D16S539、PentaE、TPOX、TH01、D19S433、D18S51、FGA、D6S1043、D13S317和D12S391）的遺傳學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)，為法醫(yī)學(xué)研究和實踐提供了基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

1　材料與方法

1.1實驗樣本

從本實驗室DNA數(shù)據(jù)庫建設(shè)所積累血樣中篩選甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族個體血樣共615份，通過對戶籍地及STR分型的比對，排除樣品間存在同戶、同卵雙生及單親遺傳關(guān)系。

1.2擴增及檢驗

采用DNATyperTM19直擴試劑盒（公安部物證鑒定中心）在ABI9700型擴增儀上進行直接擴增［10-12］，擴增產(chǎn)物經(jīng)3730xl型遺傳分析儀（美國Life Technologies公司）檢測，GeneMapper v3.2.1軟件分型。

1.3統(tǒng)計學(xué)分析

根據(jù)基因分型結(jié)果計算18個STR基因座的基因頻率，用SPSS17.0軟件對所得群體遺傳學(xué)參數(shù)進行Hardy-Weinberg平衡檢驗。應(yīng)用Power Stars分析軟件統(tǒng)計各基因座的等位基因頻率、雜合度（H）、個體識別概率（DP）、匹配概率（Pm）、非父排除概率（PE）和多態(tài)性信息含量（PIC）等法醫(yī)遺傳學(xué)參數(shù)，并計算累積個體識別率（TDP）和累積非父排除率（CPE）［13］。

2　結(jié)果與討論

615名甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族個體在18個STR基因座上，共檢出213種等位基因，850種基因型，基因頻率見表1。經(jīng)χ2檢驗，所有基因座型頻率均符合Hardy-Weinberg平衡（P > 0.05），表明該群體調(diào)查數(shù)據(jù)可信。各基因座遺傳學(xué)參數(shù)見表2。

表1.甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族群體18個STR基因座等位基因頻率（n=615）Table1 Gansu Dongxiang population allelic frequencies of 18 STR loci（n=615）

表2.甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群18個STR基因座法醫(yī)遺傳學(xué)參數(shù)（n=615）Table2 Gansu Dongxiang population genetics parameters of 18 STR loci（n=615）

由表2可知，甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族人群18個STR基因座的雜合度（H）在0.633～0.928之間，匹配概率（Pm）在0.013～0.205之間，DP值在0.795～0.987之間，PIC值在0.560～0.920之間，PE值在0.332～0.854之間。本文數(shù)據(jù)顯示，D5S818、D8S1179、D7S820、D2S1338、vWA、D21S11、D16S539、PentaE、D19S433、D18S51、FGA、D6S1043、D13S317、D12S391等14個STR基因座的H值均大于0.7，DP值均大于0.9，PE值均大于0.5，PIC值均大于0.7，屬于高識別力、高雜合度、高信息量的遺傳標記［14，15］，其中PentaE基因座鑒別能力最高，發(fā)現(xiàn)的等位基因數(shù)最多（138個）；CSF1PO、D3S1358、TH01、TPOX等4個STR基因座與其他基因座相比，H、DP、PE和PIC各值均偏低，其中多態(tài)性最差的是TPOX基因座。經(jīng)參照文獻計算［13］，18個STR基因座的累積匹配概率為1.9×10-22，累積個體識別率大于0.999 999 999 999 999 999 999 81，累積非父排除概率為0.9999999831，實驗結(jié)果同時表明，這18個STR基因座聯(lián)合應(yīng)用具有高度的個體識別和親權(quán)鑒定能力，適合于甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族群體的個體識別分析。本文的調(diào)查數(shù)據(jù)可以作為群體遺傳學(xué)中甘肅地區(qū)東鄉(xiāng)族群體的有效補充。

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Polymorphism of 18 Short Tandem Repeat Loci of Dongxiang Population from Gansu Region

Zhang Jian，Ma Xin，Zhao Xingchun*，Mo Xiaoting，Ma Wenhua，Shang Lei，Yu Zhengliang，Sun Hui，Li Wanshui，Ye Jian
（Institute of Forensic Science，Ministry of Public Security，Beijing 100038，China）

Objective This study was to determine the frequencies and parameters of Dongxiang population 18 short tandem repeat loci（D5S818、D8S1179、D7S820、CSF1PO、D2S1338、D3S1358、vWA、D21S11、D16S539、PentaE、TPOX、TH01、D19S433、D18S51、FGA、D6S1043、D13S317、D12S391）in Gansu region. Methods PCR amplification and capillary electrophoresis technologies were employed to determine the genetypes of 18 STR loci for 615 unrelated Dongxiang individuals. Results 213 alleles and 850 genotypes were recognized in Dongxiang population from Gansu region. The results demonstrated that all loci were found to be no deviation from Hardy-Weinberg equilibrium（P > 0.05）. Heterozygosity（H）ranged from 0.633 to 0.928，matching probability（Pm）ranged from 0.013 to 0.205，power of discrimination（DP）ranged from 0.795 to 0.987，polymorphism information content（PIC）ranged from 0.560 to 0.920，power of exclusion（PE）ranged from 0.332 to 0.854. Conclusion This work studied the genetic polymorphism of 18 short tanderm repeat loci of Dongxiang population in Gansu region. The resulting genetic data to provide basic data for subsequent human population genetics and forensic DNA research work.

Population genetics； DNATyperTM19； STR Polymorphism； Gansu Dongxiang population

D909.1 ［Document Code］ A

10. 11967/ 2016140406

D909.1

ADOI: 10. 11967/ 2016140406

中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費專項資金項目（2013JB003）；中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費專項資金項目（2015JB016）；中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)費發(fā)展支撐項目（2016JB040）。

張建（1982-），男，安徽蒙城人，碩士，副主任法醫(yī)師，主要從事法醫(yī)遺傳學(xué)研究工作。 E-mail: j_zhang@yeah.net。

趙興春，男，主任法醫(yī)師，主要從事法醫(yī)遺傳學(xué)研究工作。E-mail: zhaoxchun@sina.com。