TCF25干擾慢病毒載體的構(gòu)建與鑒定

李佑鋒++彭浩++高建芳等

摘 要 為構(gòu)建一個(gè)針對TCF25（transcription factor 25）基因的慢病毒干擾載體， 設(shè)計(jì)并合成3組針對TCF25的短發(fā)夾RNA序列 （shRNA），通過基因重組技術(shù)連入 pLL3.7載體，酶切鑒定及DNA測序后，重組正確的pLL3.7質(zhì)粒與病毒包裝質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293FT細(xì)胞，培養(yǎng)48 h后，分別收集細(xì)胞培養(yǎng)上清液，感染H9C2細(xì)胞，Westernblot檢測TCF25在H9C2細(xì)胞中的表達(dá).結(jié)果顯示TCF25蛋白在H9C2細(xì)胞中的表達(dá)被抑制.這說明TCF25的慢病毒干擾載體構(gòu)建成功.

關(guān)鍵詞 TCF25基因；293FT細(xì)胞；H9C2 細(xì)胞；慢病毒載體

中圖分類號 Q786文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A文章編號 10002537（2016）02002306

Construction and Characterization of a Lentiviral Vector for RNA Interference of TCF25

LI Youfeng， PENG Hao， GAO Jianfang， GAO Jing， CHEN Yu， WU Xiushan， LI Yongqing*

（Center for Heart Department， Key lab of MOE for Department Biology and Protein Chemistry，

Hunan Normal University， Changsha 410005， China）

Abstract Objective To construct a lentiviral vector for RNA interference of TCF25 （transcription factor 25） gene and identify it. Methods Three pairs of complementary short hairpin RNA （shRNA） oligonucleotides targeting the TCF25 gene were designed， synthesized， and then inserted into pLL3.7 vectors by gene recombination technology. The recombinant plasmid was identified by enzyme digestion and DNA sequencing. Correct recombinant plasmids were cotransfected with packaging plasmids into 293FT cells. The cell culture supernatant was obtained after 48 hours， and then applied to infect H9C2 cells. The expression of TCF25 in H9C2 cells was detected by westernblot. Results The recombinant plasmid was successfully constructed. The westernblot showed that the expression of TCF25 in H9C2 cells was inhibited after the cells were successfully infected with the lentiviral vector supernatant. Conclusion The lentiviral vector interfering TCF25 was constructed successfully.

Key words TCF25 gene； 293FT cell； H9C2 cell； lentiviral vector

TCF25（transcription factor 25）是在小鼠胚胎發(fā)育過程中廣泛表達(dá)的一個(gè)含有bHLH結(jié)構(gòu)域的轉(zhuǎn)錄因子，且其C端還含有一個(gè)功能未知的DUF654結(jié)構(gòu)域.根據(jù)TCF25廣泛的表達(dá)模式和包含的轉(zhuǎn)錄激活結(jié)構(gòu)域，推測其可能在腦和心臟等各種器官發(fā)育過程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用[13].同時(shí)，已有研究表明TCF25作為SRF信號通路的抑制因子調(diào)控基因的表達(dá)，且能夠抑制P19CL6細(xì)胞向心肌細(xì)胞分化[4]，但其具體作用機(jī)制需要繼續(xù)探索.

RNA干擾（RNA interference，縮寫RNAi）是指在進(jìn)化過程中高度保守的雙鏈RNA（doublestranded RNA，dsRNA）誘發(fā)的基因沉默現(xiàn)象，能夠特異性剔除或關(guān)閉靶基因的表達(dá)[5].目前，該技術(shù)已被廣泛用于探索基因功能和基因治療領(lǐng)域等[6].RNAi技術(shù)主要是將siRNA序列設(shè)計(jì)為一段shRNA（short hairpin RNA，短發(fā)夾RNA）克隆進(jìn)質(zhì)粒載體中，轉(zhuǎn)染細(xì)胞后被轉(zhuǎn)錄形成一個(gè)雙鏈RNA誘導(dǎo)基因沉默發(fā)生.慢病毒載體是根據(jù)HIV病毒基因特征，利用其基因結(jié)構(gòu)重組構(gòu)建而成.其能夠?qū)⑼庠茨康幕蚧蛲庠吹膕hRNA高效地整合到宿主基因組上并持久表達(dá)[78].慢病毒載體能夠高效地感染心肌細(xì)胞、腫瘤細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞等各類細(xì)胞系.同時(shí)，對于原代細(xì)胞和不分化細(xì)胞等較難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞，慢病毒載體也能夠大大提高目的基因的轉(zhuǎn)染效率和基因整合到宿主細(xì)胞基因組上的幾率.基于其強(qiáng)大的轉(zhuǎn)染能力，慢病毒載體已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于基礎(chǔ)和臨床醫(yī)學(xué)研究[910].

為將TCF25的shRNA高效且穩(wěn)定地導(dǎo)入各類細(xì)胞中，本實(shí)驗(yàn)擬構(gòu)建針對TCF25的重組慢病毒載體，用于研究TCF25的功能機(jī)制.

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 載體 慢病毒載體系統(tǒng)為3質(zhì)粒系統(tǒng)，包括pLL3.7，pMDG，psPAX2（為本實(shí)驗(yàn)室保存質(zhì)粒）.

1.1.2 細(xì)胞 慢病毒包裝細(xì)胞293FT細(xì)胞株，H9C2細(xì)胞，COS7細(xì)胞，分離的新生大鼠心肌細(xì)胞（本實(shí)驗(yàn)室保存細(xì)胞和分離）.

1.1.3 試劑及儀器 XhoⅠ，HpaⅠ，NotⅠ和XbaⅠ限制性內(nèi)切酶，T4連接酶購自上海生工公司；DH5α感受態(tài)為本實(shí)驗(yàn)室制備和保存；胎牛血清、細(xì)胞高糖培養(yǎng)基DMEM和抗生素購自Invitrogen公司；質(zhì)粒DNA提取試劑盒購自康為世紀(jì)生物公司；凝膠回收試劑盒購自O(shè)MEGA公司；TCF25抗體購自美國圣克魯斯生物技術(shù)公司；βactin抗體和辣根過氧化物酶偶聯(lián)的山羊抗兔抗體購自康為世紀(jì)生物公司；倒置熒光顯微鏡購自O(shè)LYMPUS公司；PBS，無水乙醇，Ampicillin和5×SDS上樣緩沖液等常用試劑購自上海生工公司；PCR儀、移液槍和CO2培養(yǎng)箱購自德國Eppendorf公司.

1.2 方法

1.2.1 TCF25基因干擾寡核苷酸的合成 利用shRNA在線設(shè)計(jì)工具針對TCF25基因的核苷酸序列設(shè)計(jì)3對shRNA單鏈寡核苷酸片段，干擾shRNA中的loop結(jié)構(gòu)選用了TTCAAGAGA以避免形成終止信號.見表1.設(shè)計(jì)完成后由上海生工生物公司合成.

1.2.2 重組慢病毒干擾質(zhì)粒pLL3.7TCF25RNAi的構(gòu)建 首先將合成的引物配對退火；取2 μg的pLL3.7載體質(zhì)粒經(jīng)XhoⅠ/HpaⅠ雙酶切后凝膠電泳回收酶切產(chǎn)物；pLL3.7載體質(zhì)粒膠回收產(chǎn)物與引物退火后產(chǎn)物用T4連接酶連接，16 ℃恒溫水浴1 h；連接后轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)，選擇Amp抗性LB固體培養(yǎng)基平板進(jìn)行涂板，37 ℃培養(yǎng)箱過夜；第二天挑菌體單克隆接種到含Amp抗性的LB液體培養(yǎng)基中，37 ℃搖床過夜；質(zhì)粒提取，酶切和測序鑒定.序列比對正確后，高純度去內(nèi)毒素質(zhì)粒中量抽提試劑盒抽提正確重組的pLL3.7干擾質(zhì)粒，用于包裝病毒.

1.2.3 慢病毒的包裝與收集 用已經(jīng)培養(yǎng)了24 h的293 FT cells進(jìn)行病毒的制備：

（a） 取1 mL無血清的DMEM高糖培養(yǎng)液加入EP管中，依次加入：插入shRNA的pLL3.7TCF25RNAi質(zhì)粒8 μg，pMDG （envolope plasmid）4 μg，psPAX2 （package plasmid）6 μg；再加入Fugene HD轉(zhuǎn)染試劑36 μL，移液槍吸打混勻后室溫下靜置30 min；

（b） 給293FT細(xì)胞更換預(yù)熱的新DMEM培養(yǎng)液（5 mL/培養(yǎng)皿），然后用1 mL槍將上步配好的轉(zhuǎn)染溶液均勻地滴加在培養(yǎng)液液面上輕輕搖勻，放入37 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)12 h；

（c） 12 h后更換10%FBS的DMEM高糖培養(yǎng)液12 mL，24 h后進(jìn)行GEP綠色熒光表達(dá)的檢測并開始收集被感染細(xì)胞的培養(yǎng)液和換新培養(yǎng)液，連續(xù)收集3天，共36 mL于一個(gè)50 mL離心管中；

（d） 2 000 r/min在4 ℃下離心10 min，取上清；

（e） 0.45 μm濾器過濾各組干擾TCF25慢病毒上清液，-80 ℃保存?zhèn)溆?

1.2.4 H9C2細(xì)胞中篩選TCF25基因有效干擾序列 慢病毒感染細(xì)胞前一天將H9C2細(xì)胞接種到6孔培養(yǎng)皿中，待細(xì)胞濃度為60%～75%時(shí)吸去舊培養(yǎng)基，向H9C2細(xì)胞中分別加入不含抗生素、10%FBS的DMEM高糖培養(yǎng)液500 μL和慢病毒上清液500 μL，包括未重組pLL3.7（對照組）組、TCF25RNAi1組、TCF25RNAi2組、TCF25RNAi3組；病毒感染24 h后將培養(yǎng)液換為新鮮的10%FBS的DMEM高糖培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)，轉(zhuǎn)染48 h后觀察GFP綠色熒光蛋白的表達(dá)；轉(zhuǎn)染72 h后，收集細(xì)胞；蛋白提取，取1 mL 過濾滅菌后的PBS清洗細(xì)胞2次，加100 μL含蛋白酶抑制劑PMSF（1∶100）的RIPA細(xì)胞強(qiáng)裂解液裂解細(xì)胞，反復(fù)凍融3次；用移液槍吸取裂解液到1.5 mL EP管中， 4 ℃，13 000 g離心10 min，取上清即為蛋白溶液；按比例加入5×SDS蛋白電泳上樣緩沖液，沸水浴5 min； 自然冷卻后進(jìn)行SDSPAGE電泳，轉(zhuǎn)PVDF膜.封閉液（5%脫脂奶粉）室溫封閉1 h，TBST稀釋的TCF25一抗（1∶250）4 ℃過夜或者室溫2 h，TBST稀釋的辣根過氧化物酶偶聯(lián)的山羊抗兔二抗（1∶2 000）室溫1 h，內(nèi)參蛋白抗體為βactin，各過程間用TBST洗膜3次，每次10 min；顯影，蛋白表達(dá)結(jié)果分析.

1.2.5 觀察指標(biāo) 重組慢病毒干擾質(zhì)粒酶切電泳圖和質(zhì)粒測序結(jié)果，慢病毒感染細(xì)胞后GFP熒光檢測，TCF25蛋白的表達(dá).

2 結(jié)果

2.1 pLL3.7TCF25RNAi重組質(zhì)粒酶切和測序結(jié)果

見圖1，將構(gòu)建的pLL37TCF25RNAi1組、pLL37TCF25RNAi2組和pLL3.7TCF25RNAi3重組質(zhì)粒DNA和對照組PLL3.7通過XbaⅠ和NotⅠ雙酶切鑒定，凝膠電泳圖顯示對照組在450 bp處都會(huì)切出一條帶，3個(gè)實(shí)驗(yàn)組在500 bp處都會(huì)有一條帶，較對照組條帶大50 bp左右，證明干擾序列成功連入pLL3.7質(zhì)粒.

測序結(jié)果證實(shí)3組pLL3.7TCF25RNAi重組質(zhì)粒DNA上均含有實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)并合成的干擾靶序列，表明實(shí)驗(yàn)成功將TCF25的shRNA雙鏈DNAoligo（干擾引物退火產(chǎn)物）精確地插入pLL3.7載體中，成功構(gòu)建了干擾TCF25基因mRNA的pLL3.7重組載體質(zhì)粒.見圖2.

圖2 pLL3.7TCF25RNAi1，pLL3.7TCF25RNAi2 和pLL3.7TCF25RNAi3質(zhì)粒DNA 測序結(jié)果

Fig.2 DNA sequencing of pLL3.7TCF25RNAi1， pLL3.7TCF25RNAi2 and pLL3.7TCF25RNAi3 plasmids

2.2 TCF25干擾重組慢病毒的包裝和收集

pLL3.7空質(zhì)粒和3組pLL3.7TCF25RNAi重組質(zhì)粒分別同慢病毒包裝質(zhì)粒 pMDG 和psPAX2 共同轉(zhuǎn)染293FT細(xì)胞，24 h后可見GFP大量表達(dá).連續(xù)收集3 d感染細(xì)胞上的培養(yǎng)基共36 mL于一個(gè)50 mL離心管中.2 000 r/min在4 ℃下離心10 min，取上清.將各組RNA干擾質(zhì)粒包裝的病毒上清液以0.45 μm過濾器過濾，-80 ℃保存.見圖3（彩圖見封三）.

2.3 TCF25重組慢病毒感染H9C2細(xì)胞的GFP熒光檢測

將包裝好的TCF25干擾重組慢病毒上清液轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞H9C2細(xì)胞，48 h后，熒光顯微鏡觀察到較強(qiáng)的綠色熒光表達(dá)，證實(shí)包裝的慢病毒成功轉(zhuǎn)染H9C2細(xì)胞.見圖4（彩圖見封三）.

2.4 Westernblot 檢測慢病毒感染后TCF25蛋白表達(dá)情況

對各組TCF25重組慢病毒感染后的H9C2細(xì)胞總蛋白提取，WB檢測TCF25蛋白表達(dá)情況.與對照組pLL3.7相比，可觀察到RNAi1組、RNAi2組、RNAi3組中TCF25蛋白表達(dá)均被抑制，其中RNAi2組中TCF25表達(dá)被抑制最明顯，表明TCF25RNAi2干擾序列為最佳干擾靶點(diǎn).見圖5.

2.5 TCF25重組慢病毒感染分離的新生大鼠心肌細(xì)胞和COS7細(xì)胞

為了進(jìn)一步鑒定已包裝的TCF25RNAi載體慢病毒的高效感染能力，檢測其對其他細(xì)胞的感染活性，分別轉(zhuǎn)染分離的新生大鼠心肌細(xì)胞和COS7細(xì)胞后都能明顯檢測到GFP熒光蛋白的表達(dá).見圖6和圖7（彩圖見封三）.

3 討論

2014年末美國心臟協(xié)會(huì)（AHA）對心臟病和卒中的數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)顯示，在全球范圍內(nèi)心血管疾病仍然是死亡的主要原因，每年奪去1 730萬人的生命.心血管疾病不再只是西方世界的疾病，全球低、中收入國家中80%的死亡是由心血管疾病引起的 [11].對心臟發(fā)育相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子進(jìn)行研究，將為心臟病的臨床預(yù)防和治療提供新的思路和策略.

bHLH（basic HelixLoopHelix，堿性螺旋環(huán)螺旋）蛋白是一類真核生物中轉(zhuǎn)錄因子大家族.bHLH蛋白含有2個(gè)保守結(jié)構(gòu)區(qū)域，分別為一個(gè)能與DNA結(jié)合的堿性區(qū)域和α螺旋環(huán)α螺旋結(jié)構(gòu)組成.1989年，在小鼠中bHLH轉(zhuǎn)錄因子（E12和E47）首次被鑒定出，隨后在各物種得到廣泛的鑒定.目前，其轉(zhuǎn)錄功能在哺乳動(dòng)物類內(nèi)研究最為透徹，參與調(diào)控生物體的諸多生命活動(dòng)，如肌細(xì)胞生成、神經(jīng)元發(fā)生、性別決定和細(xì)胞增殖等[1115].TCF25屬于bHLH轉(zhuǎn)錄因子亞家族成員，在小鼠和人類各組織中廣泛表達(dá)，尤其在胚胎發(fā)育階段高表達(dá).有研究表明TCF25作為一個(gè)轉(zhuǎn)錄抑制因子對SRF信號通路起著極強(qiáng)的抑制作用.同時(shí)還有研究發(fā)現(xiàn)TCF25基因抑制P19CL6細(xì)胞向心肌細(xì)胞分化.由此可見，TCF25對于心臟發(fā)育具有非常重要的調(diào)控功能.

RNAi技術(shù)是通過在細(xì)胞內(nèi)形成短的雙鏈RNA結(jié)構(gòu)來介導(dǎo)目的靶mRNA特異性的降解，在轉(zhuǎn)錄后水平實(shí)現(xiàn)目的基因的沉默.RNAi效應(yīng)由大小為21～23 bp的shRNA分子所介導(dǎo)，針對目的mRNA不同位點(diǎn)設(shè)計(jì)的shRNA表現(xiàn)明顯不同的活性.shRNA介導(dǎo)的基因沉默效率主要取決于其21～23 bp個(gè)堿基序列的合理設(shè)計(jì)，本實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)了3對針對TCF25基因mRNA序列不同位點(diǎn)的shRNA干擾引物，分別與pLL3.7質(zhì)粒連接，成功構(gòu)建了3對pLL3.7TCF25重組載體質(zhì)粒，經(jīng)過酶切電泳和質(zhì)粒測序證明與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)合成的靶向鏈完全一致.病毒載體介導(dǎo)shRNA的表達(dá)與質(zhì)粒轉(zhuǎn)染相比，具有感染效率高和轉(zhuǎn)染效果更加穩(wěn)定的優(yōu)勢.本實(shí)驗(yàn)所用病毒包裝系統(tǒng)為3質(zhì)粒系統(tǒng)，分別為病毒包裝質(zhì)粒 pMDG和psPAX2及高效重組載體pLL3.7.其中pLL3.7質(zhì)粒含有能表達(dá)綠色熒光蛋白（GFP）元件，pMDG和psPAX2含有病毒包裝所必須的元件.

TCF25RNAi載體慢病毒轉(zhuǎn)染H9C2細(xì)胞后， Westernblot檢測表明目的蛋白TCF25表達(dá)量顯著降低；在設(shè)計(jì)的3個(gè)靶點(diǎn)中，第2個(gè)靶序列對目的基因表達(dá)的干擾作用最明顯，為最佳靶點(diǎn).同時(shí)在其他細(xì)胞系中實(shí)驗(yàn)證明包裝的TCF25RNAi載體慢病毒具有較高的轉(zhuǎn)染效率，為后期進(jìn)一步研究TCF25基因在心臟發(fā)育中的作用機(jī)制奠定了良好的基礎(chǔ).

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（編輯 WJ）