周 偉、易榮大、彭 文、孫 磊、亓振國(guó)、江立新
(合肥天麥生物科技發(fā)展有限公司,合肥 230601)
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周 偉、易榮大、彭 文、孫 磊、亓振國(guó)、江立新*
(合肥天麥生物科技發(fā)展有限公司,合肥 230601)
目的:分析小分子多肽抑肽酶的相對(duì)分子質(zhì)量。方法:用Tricine-SDS-PAGE法,采用三羥甲基氨基甘氨酸(Tricine)代替甘氨酸作為尾隨離子,用來檢測(cè)小分子多肽的相對(duì)分子質(zhì)量。結(jié)果:根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線測(cè)算抑肽酶分子量分別為6 487.5 Da(1 μg)、6 677.6 Da(2 μg),接近真實(shí)值。結(jié)論:本方法能夠消除由于多肽分子與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的不同帶來的誤差,并克服了普通SDS-PAGE小分子蛋白條帶帶型彌散的缺點(diǎn)。
Tricine-SDS-PAGE,小分子多肽,抑肽酶,相對(duì)分子質(zhì)量
抑肽酶(aprotinin) 是一種Kunitz型蛋白酶抑制劑,由58個(gè)氨基酸組成,分子量6 512 Da,等電點(diǎn)為pH 10.5,通過3對(duì)鏈內(nèi)二硫鍵形成穩(wěn)定的三級(jí)結(jié)構(gòu)。天然抑肽酶的第15位賴氨酸是其活性中心, 參與和多種絲氨酸蛋白酶催化中心的特異結(jié)合,是一種廣譜的絲氨酸蛋白酶抑制劑,能夠抑制如胰蛋白酶、糜乳蛋白酶、纖溶酶、凝血酶、組織激肽釋放酶等多種酶的活性,用途十分廣泛[1-3]。需要控制這些酶活性或適時(shí)終止這些酶切反應(yīng)時(shí),可以選擇抑肽酶。因而,有必要建立簡(jiǎn)單快速定性或定量檢測(cè)抑肽酶的方法。
國(guó)內(nèi)對(duì)小分子量蛋白的分子量檢測(cè)長(zhǎng)期采用凝膠色譜法[4,5],但該方法對(duì)標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)與待測(cè)蛋白質(zhì)的分子空間構(gòu)象的一致性要求較高[6],操作較復(fù)雜,測(cè)定所需時(shí)間較長(zhǎng)。十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),簡(jiǎn)稱 SDS電泳,主要用于測(cè)定蛋白質(zhì)亞基分子量。與層析方法(凝膠過濾)相比,其不需要昂貴的儀器設(shè)備,操作簡(jiǎn)便,能在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)得到結(jié)果,有較高的重復(fù)性,且不需要非常純的樣品(取決于樣品的組成和對(duì)結(jié)果的要求),是目前所接受的用于測(cè)定亞基分子量的一種最好的方法。常規(guī)甘氨酸(Glycine)-SDS-PAGE能分離10~200 kDa的蛋白大分子,而對(duì)10 kDa以下的抑肽酶(6 512 Da)分辨率低,且極易擴(kuò)散丟失,無著色帶。本試驗(yàn)擬建立一套分析小分子多肽抑肽酶的Tricine-SDS-PAGE方法。Tricine-SDS-PAGE采用Tricine (三羥甲基氨基甘氨酸)代替甘氨酸作為尾隨離子,用來檢測(cè)小分子多肽分子量,消除由于多肽分子與標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)空間構(gòu)象的不同帶來的誤差,克服了普通SDS-PAGE小分子蛋白條帶帶型彌散的缺點(diǎn)[7],定量準(zhǔn)確;通過試驗(yàn)摸索,確定采用兩層不連續(xù)SDS-PAGE,與通行Tricine-SDS-PAGE相比無需灌注夾層膠,操作簡(jiǎn)單,有一定推廣應(yīng)用價(jià)值。
1.1 儀器與試藥 PowerPac Basic電泳電源、Gel Doc XR+凝膠成像系統(tǒng)、Criterion Cell垂直電泳槽(BIO-RAD公司);POS-300平板搖床(Grant-Bio公司);Mili-Q超純水機(jī)(密理博公司)。丙烯酰胺(上海生工,批號(hào)LY0320B0213J),甲叉雙丙烯酰胺(國(guó)藥集團(tuán),批號(hào)20111012),十二烷基磺酸鈉(SDS,sigma,批號(hào)BCBH3065V),四甲基乙二胺(TEMED,合肥博美,批號(hào)HFBII15012010528),考馬斯亮藍(lán)R-250(國(guó)藥集團(tuán),批號(hào)W20110926),過硫酸銨(APS,國(guó)藥集團(tuán),批號(hào)F20111213),三羥甲基氨基甲烷(Tris,國(guó)藥集團(tuán),批號(hào)20120327),三羥甲基甲基甘氨酸(Tricine)、2×Tricine Loading Buffer(上海生工生物工程有限責(zé)任公司);甲醇為分析純,乙酸為優(yōu)級(jí)純;低分子量蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品P0032-1(6 200~66 200 Da,蘭旭生物科技有限公司)。
1.2 方法
1.2.1 電泳貯存液的制備 按表1和表2配制陽極緩沖液、陰極緩沖液、凝膠緩沖液以及不同濃度的丙烯酰胺貯存液備用。
表1 電泳緩沖液
表2 丙烯酰胺儲(chǔ)存液
1.2.2 凝膠配制 依照表3給出的數(shù)據(jù)分別配制分離膠和濃縮膠。
表3 凝膠配方
1.2.3 樣品制備 稱取抑肽酶凍干粉適量,加入超純水分別配制成0.2和0.1 mg/ml的溶液,各取10 μl,分別加入等體積的2×Tricine Loading Buffer,中速渦旋混勻后室溫靜置15 min。
1.2.4 電泳條件及凝膠染色脫色處理 采用不連續(xù)緩沖系統(tǒng),上、下層儲(chǔ)液槽分別裝入陰、陽極緩沖液。用微量移液器小心吸取20 μl處理好的抑肽酶樣品及標(biāo)準(zhǔn)分子量多肽,加入點(diǎn)樣孔。恒流10 mA電泳約30 min,待樣品進(jìn)入分離膠后,將電流調(diào)節(jié)至40 mA,運(yùn)行約2 h,停止電泳。使用0.125%的考馬斯亮藍(lán)染色液,室溫震蕩染色約1 h,棄去染色液,加入純化水約200 ml,微波爐高火加熱3 min脫色,重復(fù)5次。
Tricine-SDS-PAGE系統(tǒng)中,使用16% T、6% C的分離膠能使各條帶帶型緊致無擴(kuò)散。用標(biāo)準(zhǔn)蛋白分子量對(duì)其在分離膠中遷移的距離進(jìn)行直線回歸分析,回歸方程為Y=-1.31X+4.79(R2=0.975 6),線性范圍為6 200~66 200 Da。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線測(cè)算抑肽酶分子量分別為6 487.5 Da(1 μg)和6 677.6 Da(2 μg),接近真實(shí)值,見圖1。
圖1 16% TricineSDSPAGE電泳照片
Tricine-SDS-PAGE電泳方法重復(fù)性好,條件穩(wěn)定,可有效分離分子量小于10 kDa的抑肽酶,為小分子量多肽研究作參考。然而不同的實(shí)驗(yàn)樣本需要考慮到不同的濃縮膠和分離膠的濃度。
SDS-PAGE對(duì)蛋白質(zhì)的有效分離范圍取決于聚丙烯酰胺的濃度和交聯(lián)度,其孔徑隨著雙丙烯酰胺與丙烯酰胺比率的增加而減小,比率接近于 1∶20時(shí),孔徑達(dá)到最小值。分子量低于10 kD的小分子肽類,即使用較高濃度的聚丙烯酰胺凝膠的SDS-PAGE也得不到很好的分離。在含SDS緩沖液的樣品中,小分子多肽的濃縮是較困難的,這是因?yàn)樾》肿佣嚯呐cSDS形成的復(fù)合體具有和SDS本身類似的電荷和大小,因此濃縮對(duì)于小分子多肽的SDS-PAGE來說就成了一個(gè)突出的問題。上述方法中Tricine以陽離子形式存在可以作為拖尾離子,使小分子多肽能夠在濃縮膠中形成盡可能窄的帶。
此外,快速的固定、染色和脫色對(duì)于小分子多肽電泳是必要的。這主要是由于小分子多肽對(duì)染料的結(jié)合力較弱,易擴(kuò)散沖洗掉而著色較差[7],另外分離膠中添加尿素更會(huì)導(dǎo)致這一現(xiàn)象的加劇。采用純化水高溫脫色,可以避免銀染的煩瑣,及高濃度考染耗時(shí)長(zhǎng)的缺點(diǎn)[8],短時(shí)間內(nèi)高質(zhì)量地完成凝膠脫色。
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2015-02-05
R927.11
A
1006-5687(2015)03-0011-03
*通訊作者:江立新,E-mail:jianglixin@htbt.com.cn。