王琦,蔣敬庭,魏文祥
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B7-H4實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的建立及其在人胃癌組織中的初步應(yīng)用
王琦,蔣敬庭,魏文祥
215123 蘇州大學(xué)醫(yī)學(xué)部基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與生物科學(xué)學(xué)院細(xì)胞與分子生物學(xué)教研室(王琦、魏文祥);213003 常州,蘇州大學(xué)附屬第三醫(yī)院腫瘤生物診療中心(蔣敬庭)
建立實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)B7-H4 的方法并初步應(yīng)用于人胃癌組織。
將 B7-H4 和內(nèi)參 GAPDH 的 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)測(cè)序鑒定正確后克隆入載體 pMD19-T,構(gòu)建重組質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品,并純化、定量及梯度稀釋?zhuān)謩e建立 B7-H4 和 GAPDH 的標(biāo)準(zhǔn)曲線,應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) 8 例人胃癌組織中的 B7-H4 相對(duì)于 GAPDH 的表達(dá)情況。
B7-H4 的最低檢測(cè)拷貝數(shù)為 5.27 拷貝,線性范圍 5.27 × 101~ 5.27 × 107拷貝,標(biāo)準(zhǔn)曲線方程 y = –3.1395 x + 41.805,直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.994 904,批間變異系數(shù)范圍 2.39% ~ 3.59%,擴(kuò)增效率 108.2%;GAPDH 的最低檢測(cè)拷貝數(shù)為 38.6 拷貝,線性范圍 3.86 × 102~ 3.86 × 107拷貝,標(biāo)準(zhǔn)曲線方程 y = –3.2436x + 41.083,直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.998 913,批間變異系數(shù)范圍 2.26% ~ 3.86%,擴(kuò)增效率 103.4%。8 例人胃癌組織的 B7-H4 相對(duì)于 GAPDH mRNA 表達(dá)水平在 0.044 ~ 0.888 之間。
熒光定量 PCR 檢測(cè) B7-H4 的方法具備較高的敏感性和特異性,且系統(tǒng)有良好的重復(fù)性和線性范圍。
胃腫瘤; 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR; B7-H4
B7 家族屬于提供第二信號(hào)的共刺激分子免疫球蛋白超家族,通過(guò)向 T 細(xì)胞傳遞協(xié)同刺激信號(hào)在 T 細(xì)胞充分活化和功能發(fā)揮中起著重要的作用。目前報(bào)道發(fā)現(xiàn)的 B7 家族分子共有 7 種,對(duì) B7 家族分子進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育學(xué)比較,可將 B7 家族分子分為三組:I 組包括 B7-1(CD80)、B7-2(CD86)和 B7-H2[1-4](B7 homolog 2,又稱(chēng) GL50、B7h、B7RP-1、ICOS-L);II 組包括 B7-H1[5-6](B7 homolog 1,又稱(chēng) Programmed death-1 ligand 1 即:PD-L1)和 B7-DC[7](又稱(chēng) Programmed death-1 ligand 2 即:PD-L2);III 組包括 B7-H3[8](B7 homolog 3)和 B7-H4[9](B7 homolog 4 又稱(chēng) B7S1 和 B7x)。B7-H4 是 B7 家族中最新發(fā)現(xiàn)的成員,其通過(guò)抑制細(xì)胞因子的產(chǎn)生、細(xì)胞周期的進(jìn)程、T 細(xì)胞的增殖分化,負(fù)性調(diào)控 T 細(xì)胞的免疫應(yīng)答,在多種惡性腫瘤中有異常表達(dá)[10-11]。本課題組前期工作通過(guò)胃癌組織免疫組化實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn) B7-H4 在胃癌組織中有表達(dá)[12],本研究建立實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) B7-H4 的方法,并在此基礎(chǔ)上定量檢測(cè)胃癌患者癌組織及對(duì)應(yīng)癌旁組織中 B7-H4 的表達(dá)水平。
1.1.1 標(biāo)本來(lái)源 2008 年 8 月至 2009 年 3 月在蘇州大學(xué)附屬第三醫(yī)院胃腸外科接受手術(shù)治療的原發(fā)性胃癌患者 8 例,其中男性 6 例,女性2 例,年齡 51 ~ 74 歲,符合 1990 年《中國(guó)常見(jiàn)惡性腫瘤診治規(guī)范》原發(fā)性胃癌患者診斷標(biāo)準(zhǔn),臨床病理資料完整。胃癌 TNM 分期:II 期 1 例,III 期 2 例,IV 期 5 例;其中有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 7 例,無(wú)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移 1 例;術(shù)前未接受任何放射和化學(xué)治療。手術(shù)后在胃癌組織原發(fā)灶取病理切片的同時(shí),取癌組織置液氮罐備用。
1.1.2 試劑、引物及探針 Trizol、RT-PCR 和 PCR Master Mix(2 ×)試劑盒購(gòu)自加拿大 Fermentas 公司;瓊脂糖購(gòu)自西班牙 Biowest 公司;EB 購(gòu)自上海生工生物工程公司;DNA marker 購(gòu)自加拿大 Bio Basic 公司;快速膠回收試劑盒購(gòu)自美國(guó) Invitrogen 公司;pMD19-T 載體連接試劑盒購(gòu)自日本 Takara 公司;質(zhì)粒抽提試劑盒購(gòu)自德國(guó) Qiagen公司;TaqMan PCR 試劑盒購(gòu)自美國(guó)ABI 公司;依據(jù) GenBank 收錄的 B7-H4 mRNA 全序列 Homo NM-024626.2 與 GAPDH mRNA 全序列 Homo NM-002046,利用引物設(shè)計(jì)軟件 Primer Premier 5.0 設(shè)計(jì)引物和 TaqMan 探針,均由上海生工生物工程公司合成。β-actin:上游引物:5' AGC GAG CTA CCC CCA AAG TT 3';下游引物:5' GGG CAC GAA GGC TCA TCA TT 3';擴(kuò)增片段 285 bp。B7-H4(A):上游引物:5' GTT TTA GGC TTG GTC CAT GAG T 3';下游引物:5' GCC AGC ATC TGT GAG TTG C 3';擴(kuò)增片段 158 bp。GAPDH:上游引物:5' GGA AGG TGA AGG TCG GAG TC 3';下游引物:5' CGT TCT CAG CCT TGA CGG T 3';TaqMan 探針:FAM-TTT GGT CGT ATT GGG CGC CTG-TAMRA;擴(kuò)增片段 189 bp。B7-H4(B):上游引物:5' CAC CAG GAT AAC ATC TCT CAG TGA A 3';下游引物:5' TGG CTT GCA GGG TAG AAT GA 3';TaqMan 探針:FAM-AAG CTG AAG ATA ATC CCA TCA GGC AT-TAMRA;擴(kuò)增片段120 bp。
1.2.1 RT-PCR 檢測(cè) B7-H4 在胃癌組織中的表達(dá) Trizol 法提取在液氮中保存的胃癌組織總 RNA,用 Nanodrop 2000 微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)總 RNA 的濃度和純度(260/280在 2.00 左右為純 RNA)。取各組織樣總 RNA 2.0 μg 為模板,按照逆轉(zhuǎn)錄試劑盒中的操作說(shuō)明書(shū)逆轉(zhuǎn)錄 cDNA,以 β-actin 和 B7-H4(A) 引物 PCR,所得 PCR 產(chǎn)物各取 5 μl 進(jìn)行 2% 瓊脂糖凝膠電泳,于凝膠成像儀觀察和分析電泳結(jié)果。
1.2.2 cDNA 目的片段克隆 將 PCR 產(chǎn)物用快速膠回收試劑盒進(jìn)行割膠回收,利用 pMD19-T 載體連接試劑盒連接膠回收后的目的 DNA 片段和 pMD19-T 載體,12 ~ 16 ℃保溫 8 ~ 16 h。然后將連接產(chǎn)物進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),涂板培養(yǎng),37 ℃,12 ~16 h。觀察平板挑取 4 ~ 5 個(gè)單菌落,分別于 5 ml Amp+LB 培養(yǎng)基中,37 ℃、225 r/min 振蕩過(guò)夜培養(yǎng) 12 ~ 16 h。
1.2.3 重組質(zhì)粒鑒定 以培養(yǎng)的 1 μl 菌液為模板,10 μmol/L M13 載體通用上下游引物作為 PCR 引物,進(jìn)行 PCR。陰性對(duì)照為相同的反應(yīng)體系中不加模板菌液。取 10 μl PCR 產(chǎn)物進(jìn)行 2% 瓊脂糖電泳,觀察條帶位置是否與設(shè)計(jì)的插入片段一致。條帶位置正確的菌液,用質(zhì)粒抽提試劑盒分別抽提質(zhì)粒,取部分測(cè)序,blast 比對(duì)同源性。
1.2.4 重組質(zhì)粒濃度測(cè)定及標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立 經(jīng)測(cè)序正確的重組質(zhì)粒作為標(biāo)準(zhǔn)品,用 Nanodrop 2000 微量紫外分光光度計(jì)檢測(cè)質(zhì)粒 DNA 的濃度和純度(260/280在 1.80 左右為純 DNA)。將標(biāo)準(zhǔn)品原液調(diào)整至 108拷貝/ml,貯于–80 ℃。標(biāo)準(zhǔn)品原液以 10 倍梯度稀釋成 107~ 101拷貝/ml7 個(gè)數(shù)量級(jí)的標(biāo)準(zhǔn)品,分別以 B7-H4(B) 和 GAPDH 引物進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量 PCR,各數(shù)量級(jí)的樣品均重復(fù) 5 次,根據(jù)模板起始拷貝數(shù)和對(duì)應(yīng)的臨界循環(huán)數(shù)制作標(biāo)準(zhǔn)曲線得出標(biāo)準(zhǔn)方程。每條標(biāo)準(zhǔn)曲線分別重復(fù) 5 次。
1.2.5 胃癌組織中 B7-H4 相對(duì) RNA 水平的檢測(cè) 各胃癌組織樣本提取 RNA,逆轉(zhuǎn)錄,利用相同的反應(yīng)體系和反應(yīng)條件進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量 PCR,得到對(duì)應(yīng)的 Ct 值,根據(jù)建立好的 B7-H4 和 GAPDH 的標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得 B7-H4 和 GAPDH 的絕對(duì)含量,兩數(shù)值之比即為該胃癌組織中 B7-H4 相對(duì)于內(nèi)參 GAPDH 的 RNA 表達(dá)水平。
結(jié)果顯示 3 例胃癌組織內(nèi)參照 β-actin 的表達(dá)基本一致,B7-H4 在 3 例胃癌組織中均有表達(dá),但程度不同(圖 1)。
M:DNA 分子量標(biāo)記;1 ~ 3:B7-H4(A) 和 β-actin 產(chǎn)物大小分別為 158 和 285 bp
Figure 1 Amplified electrophoretogram of B7-H4(A) and β-actin
在 ABI3730 全自動(dòng)測(cè)序儀上對(duì)提取的重組質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序。用 Vector NTI advance 10 軟件將重組質(zhì)粒的測(cè)序結(jié)果和 B7-H4 和 GAPDH 的基因序列進(jìn)行比對(duì),達(dá)到 100% 的符合率。
2.3.1 B7-H4 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立及線性檢測(cè)范圍 B7-H4 質(zhì)粒濃度為 15.554 ng/μl,根據(jù)公式[質(zhì)粒濃度(g/μl)/(660 × 質(zhì)粒長(zhǎng)度bp)]× 6.022 × 1026(拷貝/L),換算出質(zhì)粒 DNA 濃度為 5.27 × 1012拷貝/L,進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)来螢?5.27 × 107~ 5.27 × 101拷貝/ml。
B7-H4 標(biāo)準(zhǔn)品的擴(kuò)增曲線(圖 2)顯示了一組間距相等的平行曲線,107個(gè)拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品從第 15 個(gè)循環(huán)開(kāi)始出現(xiàn)熒光信號(hào),10 個(gè)拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品從第 33 個(gè)循環(huán)開(kāi)始出現(xiàn)熒光信號(hào),表明實(shí)時(shí)定量 PCR 檢測(cè)基因拷貝數(shù)有良好的線性范圍。軟件進(jìn)一步分析顯示,標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.994 904,所有標(biāo)準(zhǔn)品的值基本在一條直線上,沒(méi)有任何一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品出現(xiàn)大的偏差,表明標(biāo)準(zhǔn)品的制備成功。
B7-H4 標(biāo)準(zhǔn)品實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 標(biāo)準(zhǔn)曲線方程為 y = –3.1395x + 41.805,2= 0.9949。其中x 代表模板量的對(duì)數(shù)值(LogC0),y 代表 Ct 值。其線性范圍可達(dá) 7 個(gè)數(shù)量級(jí),擴(kuò)增效率 E =(101/3.1395-1)× 100% = 108.2%。
2.3.2 GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立及線性檢測(cè)范圍 GAPDH 質(zhì)粒濃度為 11.383 ng/μl,根據(jù)公式[質(zhì)粒濃度(g/μl)/(660 × 質(zhì)粒長(zhǎng)度bp)] × 6.022 × 1026(拷貝/L)換算出質(zhì)粒 DNA 濃度為 3.86 × 1012拷貝/L,進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)来螢?3.86 × 107~ 3.86 × 101拷貝/ml。
GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)品的擴(kuò)增曲線(圖 3)顯示了一組間距相等的平行曲線,107個(gè)拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品從第 14 個(gè)循環(huán)開(kāi)始出現(xiàn)熒光信號(hào),102個(gè)拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)品從第 29 個(gè)循環(huán)開(kāi)始出現(xiàn)熒光信號(hào),表明實(shí)時(shí)定量 PCR 檢測(cè)基因拷貝數(shù)有良好的線性范圍。軟件進(jìn)一步分析顯示,標(biāo)準(zhǔn)曲線的直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.998 913,所有標(biāo)準(zhǔn)品的值基本在一條直線上,沒(méi)有任何一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)品出現(xiàn)大的偏差,表明標(biāo)準(zhǔn)品的制備成功。
圖 2 B7-H4 標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線
Figure 2 B7-H4 amplification curve and standard curve
圖 3 GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)品擴(kuò)增曲線及標(biāo)準(zhǔn)曲線
Figure 3 GAPDH amplification curve and standard curve
GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)品實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 標(biāo)準(zhǔn)曲線方程為 y = –3.2436 x + 41.083,2= 0.9989。其中x 代表模板量的對(duì)數(shù)值(LogC0),y 代表Ct 值。其線性范圍可達(dá) 6 個(gè)數(shù)量級(jí),擴(kuò)增效率E =(101/3.2436-1)× 100% = 103.4%。
將 B7-H4 質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品 5.27 × 107拷貝/ml 數(shù)量級(jí)的標(biāo)準(zhǔn)品原液依次進(jìn)行 10 倍梯度稀釋?zhuān)瑢?shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) Ct 值,重復(fù) 5 次,變異系數(shù)范圍在 2.39% ~ 3.59%;將 GAPDH 質(zhì)粒標(biāo)準(zhǔn)品3.86 × 107拷貝/ml 數(shù)量級(jí)的標(biāo)準(zhǔn)品原液進(jìn)行 10 倍梯度稀釋?zhuān)瑢?shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) Ct 值,重復(fù)5 次,變異系數(shù)范圍在 2.26% ~ 3.86%(表 1)。
表 1 B7-H4 標(biāo)準(zhǔn)品和 GAPDH 標(biāo)準(zhǔn)品的批間重復(fù)性
表 2 各胃癌組織標(biāo)本病例資料
表 3 各胃癌組織及對(duì)應(yīng)癌旁組織 B7-H4 相對(duì) RNA 水平
8 例胃癌組織標(biāo)本病例資料(表 2)及根據(jù)建立好的 B7-H4 和 GAPDH 的標(biāo)準(zhǔn)曲線獲得胃癌組織及其相對(duì)應(yīng)的癌旁組織的 B7-H4 和 GAPDH 的 Quantity值(即定量結(jié)果),兩數(shù)值之比即為該胃癌組織中 B7-H4 相對(duì)于 GAPDH 的 RNA 表達(dá)水平,范圍在 0.044 ~ 0.888 之間(表 3)。
熒光定量 PCR 技術(shù)中,應(yīng)用最廣泛的是 TaqMan 探針?lè)?,其核心是利?Taq 酶的 5'-3' 外切核酸酶活性,切斷探針,產(chǎn)生熒光信號(hào)[13]。探針?lè)ㄏ鄬?duì)于染料法來(lái)說(shuō)排除了引物二聚體產(chǎn)生的熒光信號(hào)而干擾目的基因?qū)嶋H所產(chǎn)生的總熒光信號(hào)強(qiáng)度。實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 中標(biāo)準(zhǔn)曲線法是最為簡(jiǎn)單、準(zhǔn)確的定量方法[14-15],將一系列已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品制成標(biāo)準(zhǔn)曲線,在相同的條件下測(cè)得的目的基因熒光信號(hào)量同標(biāo)準(zhǔn)曲線進(jìn)行對(duì)比,從而得到目的基因的絕對(duì)表達(dá)量。標(biāo)準(zhǔn)曲線是以起始拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)(LogC0)為橫坐標(biāo)、Ct 值為縱坐標(biāo);理論上來(lái)說(shuō),依次 10 倍稀釋的標(biāo)準(zhǔn)品所得的標(biāo)準(zhǔn)曲線,斜率應(yīng)該在–3.3 左右。實(shí)際上當(dāng)相關(guān)系數(shù) > 0.95,斜率在–3.0 ~ –3.9 之間的標(biāo)準(zhǔn)曲線都被認(rèn)為是可靠的[16]。本研究應(yīng)用重組質(zhì)粒 pMD19-T-B7-H4 連續(xù) 10 倍稀釋后得到的標(biāo)準(zhǔn)曲線為 Ct(B7-H4)= –3.1395 log(DNA 濃度) + 41.805,直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.994904;pMD19-T-GAPDH連續(xù)10 倍稀釋后得到的標(biāo)準(zhǔn)曲線為 Ct(GAPDH)= –3.2436 log(DNA 濃度) + 41.083,直線回歸相關(guān)系數(shù)= 0.998913,都在公認(rèn)的可接受范圍內(nèi)。本研究建立的TaqMan 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) B7-H4 的方法,能夠檢測(cè)低至 5.27 個(gè)拷貝的目的基因,并最終產(chǎn)生可高達(dá) 7 個(gè)數(shù)量級(jí)(5.27 × 101~ 5.27 × 107)的動(dòng)態(tài)檢測(cè)范圍;GAPDH 的最低拷貝數(shù)為 38.6,線性范圍為 3.86 × 102~ 3.86 × 107拷貝,B7-H4 和 GAPDH 在各自的范圍內(nèi),模板濃度與 Ct 之間的相關(guān)性均良好。另一個(gè)判斷實(shí)驗(yàn)結(jié)果優(yōu)劣的重要指標(biāo)是標(biāo)準(zhǔn)曲線的重復(fù)性,主要指標(biāo)之一是 CV(coefficient of variation,變異系數(shù))。TaqMan 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè) B7-H4 和 GAPDH 批間 CV 范圍分別在 2.39% ~ 3.59% 和 2.26% ~ 3.86%,均小于 5%,重復(fù)性較好。
本研究處理的胃癌組織標(biāo)本的例數(shù)相對(duì)較少,檢測(cè)了 8 例胃癌組織及相應(yīng)癌旁組織 B7-H4 相對(duì) RNA 水平,最主要的目的在于人協(xié)同刺激分子 B7-H4 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR 檢測(cè)方法的建立,并用建立好的體系檢測(cè)胃癌組織標(biāo)本以證明所建立的檢測(cè)體系是特異的,成功的。關(guān)于 B7-H4 mRNA 相對(duì)于 GAPDH mRNA 的表達(dá)水平與胃癌組織相關(guān)指標(biāo)(如:TNM 分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況、浸潤(rùn)程度等)的關(guān)系則有待于檢測(cè)大批量的胃癌組織標(biāo)本并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理后得出結(jié)論。
本研究結(jié)果表明 B7-H4 普遍表達(dá)于胃癌組織中,且表達(dá)強(qiáng)度相對(duì)于與管家基因 GAPDH 的范圍在0.044 ~ 0.888,相應(yīng)癌旁組織的表達(dá)量普遍低于或與癌組織接近,說(shuō)明 B7-H4 在胃癌組織中的表達(dá)量相對(duì)還是比較高的,在胃癌的發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中可能起到重要作用,和腫瘤的侵襲也有一定的關(guān)系。在乳腺癌中[17],正常的乳腺細(xì)胞和惡性的乳腺癌細(xì)胞的 B7-H4 表達(dá)譜有著很大的差異,過(guò)表達(dá) B7-H4 的乳腺癌細(xì)胞可以幫助其逃避免疫系統(tǒng)的監(jiān)測(cè)。B7-H4 的 mRNA 和蛋白在人漿液性卵巢癌和乳腺癌[18]中高表達(dá),而在正常組織中低表達(dá)或不表達(dá),B7-H4 的蛋白在癌細(xì)胞表面廣泛糖基化,促進(jìn)上皮細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化,保護(hù)上皮細(xì)胞的“失巢凋亡”,在人卵巢癌細(xì)胞系中過(guò)表達(dá) B7-H4 還可以促進(jìn)在裸鼠體內(nèi)的成瘤能力。非小細(xì)胞肺癌[19]中高表達(dá)的 B7-H4 在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的病例中普遍存在。同時(shí)表達(dá) B7-H4 和 B7-H1 的腎細(xì)胞癌患者有著更高的死亡風(fēng)險(xiǎn),因此可能是腎細(xì)胞癌的預(yù)后的一個(gè)重要的標(biāo)志物,可以作為腫瘤細(xì)胞和腫瘤新生血管的靶標(biāo)協(xié)助腫瘤的免疫治療[20]。隨著對(duì) B7-H4 研究的深入,B7-H4 過(guò)表達(dá)被認(rèn)為是胃癌預(yù)后差的一個(gè)關(guān)鍵因素[21],B7-H4 的激活有可能作為腫瘤的預(yù)后因素或者作為腫瘤治療的靶分子。
[1] Wang S, Zhu G, Chapoval AI, et al. Costimulation of T cells by B7-H2, a B7-like molecule that binds ICOS. Blood, 2000, 96(8):2808-2813.
[2] Ling V, Wu PW, Finnerty HF, et al. Cutting edge: identification of GL50, a novel B7-like protein that functionally binds to ICOS receptor. J Immunol, 2000, 164(4):1653-1657.
[3] Swallow MM, Wallin JJ, Sha WC. B7h, a novel costimulatory homolog of B7.1 and B7.2, is induced by TNFalpha. Immunity, 1999, 11(4):423-432.
[4] Yoshinaga SK, Whoriskey JS, Khare SD, et al. T-cell co-stimulation through B7RP-1 and ICOS. Nature, 1999, 402(6763):827-832.
[5] Dong H, Zhu G, Tamada K, et al. B7-H1, a third member of the B7 family, co-stimulates T-cell proliferation and interleukin-10 secretion. Nat Med, 1999, 5(12):1365-1369.
[6] Freeman GJ, Long AJ, Iwai Y, et al. Engagement of the PD-1 immunoinhibitory receptor by a novel B7 family member leads to negative regulation of lymphocyte activation. J Exp Med, 2000, 192(7):1027-1034.
[7] Latchman Y, Wood CR, Chernova T, et al. PD-L2 is a second ligand for PD-1 and inhibits T cell activation. Nat Immunol, 2001, 2(3): 261-268.
[8] Chapoval AI, Ni J, Lau JS, et al. B7-H3: a costimulatory molecule for T cell activation and IFN-gamma production. Nat Immunol, 2001, 2(3):269-274.
[9] Zang X, Loke P, Kim J, et al. B7x: a widely expressed B7 family member that inhibits T cell activation. Proc Natl Acad Sci U S A, 2003, 100(18):10388-10392.
[10] Li C, Jiang JT, Wu CP. Study progression of costimulatory molecule B7-H4 and tumor microenvironment. Chin Clin Oncol, 2012, 17(5): 466-469. (in Chinese)
李翀, 蔣敬庭, 吳昌平. 協(xié)同刺激分子B7-H4與腫瘤微環(huán)境的研究進(jìn)展. 臨床腫瘤學(xué)雜志, 2012, 17(5):466-469.
[11] Hu WW, Jiang JT, Wu CP. Experssion of B7-H4 and Its Significance in Human Maligant Tumor. Med Recapitulate, 2010, 16(1):52-54. (in Chinese)
胡文蔚, 蔣敬庭, 吳昌平. 協(xié)同刺激分子B7-H4在惡性腫瘤中的表達(dá)意義. 醫(yī)學(xué)綜述, 2010, 16(1):52-54.
[12] Jiang JT, Wu CP, Shen YP, et al. Experssion of costimulatory molecule B7-H4 in the gastric tissues and its correlation with prognosis. Chin
J Exp Surg, 2009, 26(9):1155-1158. (in Chinese)
蔣敬庭, 吳昌平, 沈月平, 等. 共刺激分子B7-H4在胃癌組織中表達(dá)及其與預(yù)后的關(guān)系. 中華實(shí)驗(yàn)外科雜志, 2009, 26(9):1155-1158.
[13] Thiery JP. Epithelial-mesenchymal transitions in tumour progression. Nat Rev Cancer, 2002, 2(6):442-454.
[14] Ke LD, Chen Z, Yung WK. A reliability test of standard-based quantitative PCR: exogenous vs endogenous standards. Mol Cell Probes, 2000, 14(2):127-135.
[15] Vandenbroucke II, Vandesompele J, Paepe AD, et al. Quantification of splice variants using real-time PCR. Nucleic Acids Res, 2001, 29(13): E68-E88.
[16] van der Velden VH, Hochhaus A, Cazzaniga G, et al. Detection of minimal residual disease in hematologic malignancies by real-time quantitative PCR: principles, approaches, and laboratory aspects. Leukemia, 2003, 17(6):1013-1034.
[17] Mugler KC, Singh M, Tringler B, et al. B7-h4 expression in a range of breast pathology: correlation with tumor T-cell infiltration. Appl Immunohistochem Mol Morphol, 2007, 15(4):363-370.
[18] Salceda S, Tang T, Kmet M, et al. The immunomodulatory protein B7-H4 is overexpressed in breast and ovarian cancers and promotes epithelial cell transformation. Exp Cell Res, 2005, 306(1):128-141.
[19] Sun Y, Wang Y, Zhao J, et al. B7-H3 and B7-H4 expression in non-small-cell lung cancer. Lung Cancer, 2006, 53(2):143-151.
[20] Krambeck AE, Thompson RH, Dong H, et al. B7-H4 expression in renal cell carcinoma and tumor vasculature: associations with cancer progression and survival. Proc Natl Acad Sci U S A, 2006, 103(27): 10391-10396.
[21] Jiang J, Zhu Y, Wu C, et al. Tumor expression of B7-H4 predicts poor survival of patients suffering from gastric cancer. Cancer Immunol Immunother, 2010, 59(11):1707-1714.
Quantification of B7-H4 with real-time fluorescent PCR and its preliminary application in gastric carcinoma
WANG Qi, JIANG Jing-ting, WEI Wen-xiang
Department of Cell Biology, School of Biology and Basic Medicine Science, Medical College, Soochow University, Suzhou 215123, China (WANG Qi, WEI Wen-xiang); Department of Tumor Biological Treatment, The Third Affiliated Hospitial of Soochow University, Changzhou 213003, China (JIANG Jing-ting)
Toestablish a real-time fluorescent polymerase chain reaction for quantifying B7-H4 and detect the expression of B7-H4 in human gastric carcinoma.
The B7-H4 and internal reference gene GAPDH fragments in correct sequence from RT-PCR were cloned into pMD19-T vector, and recombinant plasmids were purified and quantified by spectrophotometry. Standard curves was established by using a serial dilution of quantified plasmids in order to measure B7-H4 and GAPDH. Real-time fluorescent PCR was used to quantify the expression level of B7-H4 relative to GAPDH in 8 gastric carcinoma tissues.
For B7-H4, the detection of the minimum copy number was 5.27 copies. The linear range of 5.27 × 101~5.27 × 107copies of the standard curve equation (y = -3.1395 x + 41.805) was found and the correlation coefficient for 0.994 904 was obtained. The inter-assay CV ranged from 2.39% to 3.59% and the amplification efficiency was 108.2%. For GAPDH, the detection of the minimum copy number was 38.6 copies. The linear range of 3.86 × 102to 3.86 × 107copies of the standard curve equation (y = –3.2436 x + 41.083) was found and the correlation coefficient of 0.998 913 was obtained. The inter-assay CV ranged from 2.26% to 3.86% and the amplification efficiency was 103.4%. mRNA levels of B7-H4 relative to GAPDH in 8 gastric carcinoma tissues were between 0.044 and 0.888.
The real-time fluorescent quantitative PCR system established for quantifying B7-H4 is rapid, specific, sensitive and accurate. The standard system is repeatable and has a good linear range.
Stomach neoplasms; Real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction; B7-H4
WEI Wen-xiang, Email: wenxiangw@suda.edu.cn
10.3969/cmba.j.issn.1673-713X.2013.02.001
國(guó)家自然科學(xué)基金(81171653、30972703);江蘇省自然科學(xué)基金(BK2011246、BK2011247);“六大人才高峰”第六批資金資助項(xiàng)目(BRA2010037);常州市科技支撐計(jì)劃(社會(huì)發(fā)展)計(jì)劃基金(CJ20112020、CZ20110024、CS20102020)
魏文祥,Email:wenxiangw@suda.edu.cn
2012-12-17