曾 濤,何 德(廣東醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗學(xué)院,廣東東莞 523808)
泛素-核糖體蛋白S27a(UBRPS27a)是泛素和核糖體蛋白的融合蛋白,由RPS27A基因編碼[1]。核糖體蛋白S27a(RPS27a)為核糖體40S亞基組成蛋白之一,除參與蛋白質(zhì)合成外,還具有其他重要功能。RPS27A基因在多種活性增殖細(xì)胞中高度表達(dá),其過表達(dá)是肝癌、胃癌、結(jié)腸癌等多種惡性腫瘤的典型特征,很可能是惡性轉(zhuǎn)化細(xì)胞或腫瘤組織的標(biāo)志物,但其在腫瘤細(xì)胞中的功能作用及其分子機制尚未清楚[2-5]。本研究以原核系統(tǒng)表達(dá)人UBRPS27a,旨在為進(jìn)一步研究其結(jié)構(gòu)與功能奠定基礎(chǔ)。
1.1 材料 原核表達(dá)載體pGEX4T-1、人急性早幼粒細(xì)胞白血病HL-60細(xì)胞株、大腸埃希菌JM109及BL21(DE3)由廣東醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究所保存。Taq DNA聚合酶、限性內(nèi)切酶BamHⅠ和SmaⅠ、DNA T4連接酶、DL2000 DNA分子標(biāo)記物、λHindⅢ標(biāo)記物、載體PMD18-T購自TaKaRa公司。質(zhì)粒抽提試劑盒和DNA凝膠回收試劑盒購自TIANGEN公司。TRIzol試劑和反轉(zhuǎn)錄(RT)聚合酶鏈反應(yīng)(PCR,RT-PCR)試劑盒購自Invitrogen公司。其他試劑均為國產(chǎn)或進(jìn)口分析純。
1.2 方法
1.2.1 RPS27A基因cDNA全長克隆 根據(jù)人RPS27A基因cDNA序列(GenBank NM_002954)以及pGEX4T-1載體上的多克隆位點設(shè)計上游引物P1(5′-CGC GGA TCC ATG CAG ATT TTC GTG AA-3′,下劃線部分為BamHⅠ酶切位點)及下游引物P2(5′-TCC CCC GGG TTA CTT GTC TTC TGG TTT G-3′,下劃線部分為SmaⅠ酶切位點),由上海生工公司合成。收集對數(shù)生長期HL-60細(xì)胞,TRIzol試劑抽提總RNA,Oligo dT18引物反轉(zhuǎn)錄合成RPS27AcDNA第1鏈;以P1和P2為引物,RT-PCR擴增RPS27A編碼區(qū)cDNA片段全長,擴增反應(yīng)條件為95℃5min,94℃45s、52℃1min、72℃1min循環(huán)35次,72℃10min,取擴增產(chǎn)物進(jìn)行2.0%瓊脂糖凝膠電泳,在紫外分析儀上觀察擴增結(jié)果并拍照;將膠回收法純化的目的片段與PMD18-T載體進(jìn)行T/A克隆重組,挑選單克隆菌落,PCR鑒定陽性克隆送上海生工公司測序;用質(zhì)粒提取試劑盒抽提經(jīng)測序驗證克隆正確的質(zhì)粒DNA(TRPS27A)。
1.2.2 pGEX4T-1-RPS27A重組質(zhì)粒構(gòu)建 以BamHⅠ和SmaⅠ對T-RPS27A質(zhì)粒和pGEX4T-1載體進(jìn)行雙酶切,酶切產(chǎn)物用瓊脂糖凝膠電泳分離;膠回收法純化的目的基因DNA片段與線性載體DNA片段在T4連接酶作用下連接過夜,轉(zhuǎn)化感受態(tài)JM109細(xì)菌;挑取單克隆菌落接種于含氨芐西林(Amp+)LB培養(yǎng)基中,37℃振蕩培養(yǎng)過夜,提取質(zhì)粒DNA,PCR與雙酶切法鑒定后將陽性候選克隆送上海生工公司測序。
1.2.3 重組質(zhì)粒誘導(dǎo)表達(dá) 以測序驗證正確的pGEX4T1-RPS27A重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化感受態(tài)BL21細(xì)菌,挑選單克隆菌落,PCR與雙酶切法鑒定;將含重組質(zhì)粒的BL21細(xì)菌接種于Amp+LB培養(yǎng)基,振蕩培養(yǎng)過夜;將過夜培養(yǎng)菌按體積比1∶30接種于新鮮LB培養(yǎng)基,37℃劇烈振蕩培養(yǎng)至A600約為0.5,加1mmol/L異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)培養(yǎng)4h;以冰預(yù)冷磷酸鹽緩沖液懸浮菌體,超聲破碎,離心取上清進(jìn)行12%十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE),考馬斯亮藍(lán)R250染色后觀察結(jié)果。
2.1 RPS27A基因cDNA全長克隆 RT-PCR擴增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,在200bp與500bp之間發(fā)現(xiàn)1條清晰DNA條帶,大小與目的基因預(yù)期片段480bp相符(見圖1)。
圖1 RPS27AcDNA擴增產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳
2.2 pGEX4T1-RPS27A重組質(zhì)粒酶切鑒定 PCR鑒定陽性重組質(zhì)粒雙酶切產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳顯示,酶切獲得的2個片段分別與pGEX4T-1載體(4 950bp)及RPS27A目的片段(480bp)預(yù)期大小相符(見圖2)。測序結(jié)果顯示重組質(zhì)粒中插入DNA片段序列與RPS27A基因cDNA全長完全一致(見圖3)。
圖2 pGEX4T-1-RPS27A重組質(zhì)粒酶切鑒定
2.3 GST-UBRPS27a融合蛋白誘導(dǎo)表達(dá) pGEX4T-1-RPS27A重組質(zhì)粒誘導(dǎo)表達(dá)產(chǎn)物電泳圖出現(xiàn)了2個過表達(dá)蛋白條帶,1條與GST-UBRPS27a融合蛋白相對分子質(zhì)量(RMM)44×103(GST、UBRPS27a的RMM分別為26×103和18×103)相符,表達(dá)效率很高,另出現(xiàn)1條RMM稍小的蛋白條帶(見圖4)。
圖3 pGEX4T1-RPS27A重組質(zhì)粒中插入DNA片段部分測序圖譜
圖4 SDS-PAGE分析大腸桿菌GST-UBRPS27a重組蛋白的表達(dá)
人UBRPS27a蛋白N端是泛素,C端是RPS27a,兩端結(jié)構(gòu)域在不同物種中均高度保守。RPS27a通過C4型鋅指結(jié)構(gòu)域與DNA結(jié)合,組成核糖體結(jié)構(gòu),參與蛋白合成。RPS27a通常與泛素融合,主要存在于細(xì)胞質(zhì)中。泛素在核糖體合成過程中作為分子伴侶,在RPS27a進(jìn)入核糖體之前對其有保護和穩(wěn)定作用。本研究擴增了RPS27A基因編碼區(qū)全長cDNA,成功構(gòu)建了pGEX4T-1-RPS27A重組質(zhì)粒,并在大腸埃希菌中誘導(dǎo)表達(dá)了GST-UBRPS27a融合蛋白,為進(jìn)一步利用GST標(biāo)簽進(jìn)行UBRPS27a蛋白純化、制備其單克隆抗體及研究其結(jié)構(gòu)奠定了基礎(chǔ)。蛋白誘導(dǎo)表達(dá)產(chǎn)物電泳圖顯示除GST-UBRPS27a融合蛋白高效表達(dá)外,另有1條RMM相對較小的條帶(約30×103左右)過表達(dá)。為排除其他混雜克隆的干擾,本研究將pGEX4T-1-RPS27A重組克隆在Amp+LB培養(yǎng)基上進(jìn)行劃線培養(yǎng),挑取單克隆菌落重新誘導(dǎo)表達(dá)后,依然出現(xiàn)該條帶。由此可見該蛋白條帶是特異的,考慮可能為GST-UBRPS27a融合蛋白部分降解產(chǎn)物,有待后續(xù)實驗進(jìn)一步驗證。
RPS27A基因的表達(dá)在多種腫瘤組織中異常升高,可能在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中具有重要作用。該基因是一種早期生長反應(yīng)基因,在結(jié)腸癌及胃癌組織中的表達(dá)明顯高于周邊正常黏膜組織[4]。而且RPS27A基因在低分化肝癌中的表達(dá)較正常水平升高20倍以上,用RNA干擾方法沉默RPS27A基因可導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞周期停滯及細(xì)胞萎縮,說明該基因與肝癌發(fā)生有關(guān)[6]。RPS27A基因在胰腺癌的癌前病變組織表達(dá)水平升高,可用于胰腺癌早期鑒別診斷。深入分析RPS27A基因與腫瘤的關(guān)系有利于發(fā)現(xiàn)新的腫瘤標(biāo)志物及臨床治療靶標(biāo)。但目前對該分子在腫瘤細(xì)胞中的具體功能及分子作用機制所知尚少。蛋白激酶CK2與多種腫瘤密切相關(guān),是目前腫瘤治療研究中的靶點之一[7]。黃功華等[8]采用酵母雙雜交技術(shù)篩選HL-60細(xì)胞cDNA文庫時發(fā)現(xiàn),人UBRPS27a是CK2α′亞基的候選結(jié)合蛋白。但酵母雙雜交系統(tǒng)有可能存在假陽性結(jié)果。故本研究誘導(dǎo)表達(dá)的GST-UBRPS27a融合蛋白為采用GST pull down試驗驗證UBRPS27a與CK2α′亞基的相互作用準(zhǔn)備了條件,也為后續(xù)研究UBRPS27a結(jié)構(gòu)與功能及其在腫瘤發(fā)生發(fā)展過程的分子調(diào)控機制奠定了基礎(chǔ)。
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