顧 林 史穎莉? 倪 婕 陳 捷 李 瑛
1.南京醫(yī)科大學附屬南京婦幼保健院,江蘇南京 210004;2.江蘇省計劃生育研究所,江蘇南京 210029
TCAB1是人腫瘤細胞中近期發(fā)現(xiàn)的端粒酶蛋白組分,其表達缺失可使端粒酶復(fù)合物無法運送至染色體末端的端粒合成目的地,雖不影響端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶(hTERT)對自身攜帶RNA組分(hTR)的催化,但最終仍導(dǎo)致端粒形成受限。由于:①端粒機制與惡性腫瘤等細胞的增殖、遷移、侵襲屬性密切相關(guān)[1-2];②內(nèi)異癥雖為良性疾病,其遠處種植和生長特性卻與惡性腫瘤類似[3]。筆者前期研究中通過基因芯片實驗發(fā)現(xiàn),TCAB1異常表達于內(nèi)異癥異位內(nèi)膜組織,提示TCAB1可能通過端粒機制參與了內(nèi)異癥異位內(nèi)膜的生長、侵襲等病理機制,并介導(dǎo)了在內(nèi)異癥形成中的作用。為進一步研究TCAB1功能及作用機制,筆者擬構(gòu)建TCAB1的慢病毒表達載體。
總RNA抽提試劑盒購自天根生化科技(北京)有限公司;PCR Taq酶購自TaKaRa公司;限制 性內(nèi)切酶(EcoRI和NotI)購自NEB公司;感受態(tài)細胞TOP10實驗室自備;Agarose Gel DNA Purification Kit Ver2.0、TA克隆試劑盒購自TaKaRa;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(SuperScriptRⅢFirst-Strand Synthesis System)購自invitrogen公司;測序委托上海英俊生物公司進行;慢病毒過表達載體(pLVX-IRES-ZsGreen)購自Clonetech公司;子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞株(St-T1b)購自ATCC。
1.2.1 引物設(shè)計 根據(jù)Genebank中報道的基因序列,應(yīng)用軟件設(shè)計TCAB1全長基因擴增引物(Invitrogen公司):primer-F:CGGAATTCCGGCCATGAAGA CTTTGGAGACTCAAC;primer-R:ATTTGCGGCCGCACC TTATATCAGCTCA CC ACACCT;上下游引物分別含有EcoRI和NotI酶切位點;PCR終產(chǎn)物大小為1 675 bp。
1.2.2 RT-PCR TRIzol法抽提人子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞總RNA,Nanodrop檢測RNA濃度,1%變性瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA完整性,如見清晰的18 S和28 S兩條帶,說明總RNA完整性較好。取1μg總RNA進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),PCR循環(huán)參數(shù)為:5℃冷卻10 mim、50℃孵育50 min、85℃5 min終止反應(yīng)。
1.2.3 目的基因片段擴增PCR 以巢式PCR技術(shù)將目的基因片段擴增,第一次PCR循環(huán)參數(shù):95℃預(yù)變性5 min、94℃變性30 s、60℃退火30 s、72℃延伸90 s、72℃延伸10 min,共25個循環(huán);第二次PCR循環(huán)參數(shù)同第一次PCR,共30個循環(huán)。凝膠掃描成像系統(tǒng)記錄電泳結(jié)果。
1.2.4 PCR產(chǎn)物TA克隆 將PCR產(chǎn)物使用Agarose Gel DNA Purification Kit Ver 2.0回收,進行TA克隆,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞TOP10,使用含100 mg/mL氨芐抗生素的LB瓊脂平板篩選轉(zhuǎn)化子。挑取單個菌落,在含100 mg/mL氨芐抗生素的LB培養(yǎng)液中擴大培養(yǎng),提取質(zhì)粒并分別用EcoRI-HF和NotI-HF進行酶切鑒定,酶切成功送英俊公司測序。
將真核表達載體pLVX-IRES-ZsGreen1與測序成功的TCAB1-TA克隆用EcoRI和NotI雙酶切,膠回收線性化載體和PCR目的產(chǎn)物,用T4DNA連接酶連接線性化載體和PCR純化產(chǎn)物16°C過夜,轉(zhuǎn)化感受態(tài)細胞top10,含100 mg/mL氨芐抗生素的LB瓊脂平板篩選轉(zhuǎn)化子。挑取單個菌落,在含100 mg/mL氨芐抗生素的LB培養(yǎng)液中擴大培養(yǎng),提取質(zhì)粒并分別用EcoRI和NotI進行酶切鑒定。
將HEK293T細胞(病毒包被細胞)均勻接種于培養(yǎng)皿中,待細胞融合度至70%左右時,轉(zhuǎn)染慢病毒表達質(zhì)粒與包被質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染試劑與質(zhì)粒比例(μg)為2.5∶1.0,慢病毒表達質(zhì)粒與Pcgvp、Rev、Vsvg比例為1.5∶1.5∶1.0∶0.5,轉(zhuǎn)染48、72 h后收取病毒上清,2 000 g離心10 min棄細胞碎片,上清經(jīng)0.45μm濾器過濾后分裝,-80℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
傳代培養(yǎng)人子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞株(St-T1b),將其接種于6孔板中(105/mL),待細胞融合度達60%左右時,加入病毒上清,同時加入終濃度5μg/mL的poly brene,培養(yǎng)72 h在熒光顯微鏡觀察熒光表達情況以判斷感染效率。
收集感染過表達慢病毒的人子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞株,以空載慢病毒做對照。按照TRIzol試劑說明書提取細胞中總RNA,并進行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),獲得cDNA產(chǎn)物。以此cDNA為模板,在ABI 7500型實時定量PCR儀上進行實時定量PCR反應(yīng)。引物序列為Sense:5′-cagccagacacctcctacg-3′,Anti-sense:5′-tgaatgcgtcccagatat-3′,Roche LNA probe:#66(CAGCAGCC);18s sense:5′-gcaattattccccatgaacg-3′,Anti-sense:5′-gggacttaatcaacgcaagc-3′,Roche LNA probe:#48(TTCCCAGT)。實時定量PCR反應(yīng)體系為:Master Mix 10μL,cDNA 1μL,引物探針共1μL,雙蒸水8μL,共20μL。擴增條件:預(yù)變性95℃2min后,95℃10s,60℃30s,70℃45s,重復(fù)40個循環(huán)。用△△CT法計算TCAB1的相對表達量。
以基因組為模板進行PCR擴增,得到大小為1 675 bp的片段(圖1),DNA測序證明擴增片段的核苷酸序列與Genbank中的TCAB1序列完全一致。
圖1 目的基因TCAB1的PCR產(chǎn)物凝膠電泳分析
結(jié)果顯示提取的質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶酶切后得到了與設(shè)定長度一致的TCAB1 cDNA片段,酶切成功送英俊公司測序,雙向測通,經(jīng)比對后,與Genbank比對后,無堿基突變。
構(gòu)建慢病毒表達質(zhì)粒,提取質(zhì)粒并分別用EcoRI和NotI進行酶切鑒定,結(jié)果顯示構(gòu)建成功(圖2)。
圖2 慢病毒載體構(gòu)建與酶切鑒定
熒光顯微鏡下觀察:TCAB1基因重組慢病毒感染靶細胞后,可見較大比例的St-T1b表達綠色熒光(圖3A),提示TCAB1慢病毒感染成功;實時定量PCR法檢測結(jié)果提示:TCAB1基因重組慢病毒感染的細胞中TCAB1顯著過表達(圖3B)。證明TCAB1基因經(jīng)重組慢病毒載體感染至St-T1b細胞后,能夠在靶細胞中穩(wěn)定持續(xù)表達。
TCAB1是端粒酶的新蛋白組分,它主要位于細胞核卡哈爾體內(nèi),控制端粒酶信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。進行生物信息學分析后發(fā)現(xiàn),該基因(NM_001143990.1)mRNA全長1 837 bp,開放閱讀框1 647 bp,編碼548個氨基酸,預(yù)測分子量59.3 kDa;NCBI在線Blast Genome分析提示,TCAB1基因定位于染色體17p13.1;運用TMHMM2.0、SignaliP和WoLF PSORT等生物信息學工具分析其蛋白屬性發(fā)現(xiàn),其編碼蛋白無跨膜區(qū),可能位于胞漿內(nèi)。TCAB1位于細胞核卡哈爾體內(nèi),控制端粒酶信號轉(zhuǎn)導(dǎo),與端粒形成密切相關(guān)[4]。已知TCAB1在多種腫瘤細胞中異常表達,能夠促進細胞轉(zhuǎn)移[5]。內(nèi)異癥具有類似惡性腫瘤的遠處種植和生長特性,文獻已證實內(nèi)異癥在位內(nèi)膜組織中端粒酶活性與端粒長度高于正常內(nèi)膜[6],但未見涉及TCAB1、端粒酶、端粒在內(nèi)異癥形成中功能研究的相關(guān)報道。由于TCAB1功能尚不是很清楚,因此構(gòu)建該基因的過表達載體十分必要。
實現(xiàn)基因的過表達(gain of function)是基因功能研究的重要策略,其中慢病毒載體是基因表達的重要工具。慢病毒載體是以人類免疫缺陷Ⅰ型病毒為基礎(chǔ)發(fā)展起來的基因治療載體,該載體可以將外源基因有效地整合到宿主染色體上,從而達到持久表達。同時由于對分裂細胞和非分裂細胞均具有感染能力,對于干細胞和原代細胞研究具有重要意義。慢病毒的感染效率高、激發(fā)免疫反應(yīng)的作用弱,而且目前沒有證據(jù)表明其對宿主細胞有毒性作用或影響宿主細胞的活力。慢病毒表達載體感染后所獲得的穩(wěn)轉(zhuǎn)細胞基因表達穩(wěn)定、持續(xù)時間長,避免了瞬時轉(zhuǎn)染每次試驗均需重復(fù)操作的試驗過程,而且也避免了瞬時轉(zhuǎn)染時所需轉(zhuǎn)染試劑對實驗的影響。因此本實驗選擇慢病毒載體研究基因的工具。本實驗選擇的慢病毒表達載體是pLVX-IRES-ZsGreen1,ZsGreen1熒光蛋白可以作為包被及病毒感染時候的marker,可以方便的觀察轉(zhuǎn)染和病毒感染效率,也可以在后續(xù)研究中通過熒光篩選穩(wěn)定表達株。本實驗成功構(gòu)建人TCAB1基因特異性的重組慢病毒過表達載體,且證實包被的慢病毒可實現(xiàn)TCAB1基因在人子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞株的過表達,為后續(xù)人TCAB1在人子宮內(nèi)膜間質(zhì)細胞的功能研究奠定了良好的實驗基礎(chǔ)。
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