徐 靜,萬家余,許 娜,許 琴,李 楠,王景龍,劉文森
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所,吉林省人獸共患病預(yù)防與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林 長春 130122)
MALDI質(zhì)譜成像的樣本制備技術(shù)及應(yīng)用研究進(jìn)展
徐 靜,萬家余,許 娜,許 琴,李 楠,王景龍,劉文森*
(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院軍事獸醫(yī)研究所,吉林省人獸共患病預(yù)防與控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,吉林 長春 130122)
*通訊作者
MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)(Maldi tof Imaging Mass Spectrometry,MALDI-IMS),是利用 MALDI質(zhì)譜技術(shù)將得到的蛋白組學(xué)數(shù)據(jù),結(jié)合計(jì)算機(jī)輔助成像產(chǎn)生分子圖像,進(jìn)而描繪出組織上已知及未知分子分布情況的新技術(shù)。該技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)的很多領(lǐng)域,如動植物生理學(xué)、病理學(xué)[1-3]、藥物研發(fā)[4-6]等。
MALDI質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵是樣品的制備[7],它主要包括冰凍切片的制備和基質(zhì)的選擇及應(yīng)用等。
1.1 冰凍切片的制備冰凍切片的制備是一項(xiàng)比較成熟的技術(shù),但為了保證質(zhì)譜成像結(jié)果的重復(fù)性和準(zhǔn)確性,在質(zhì)譜成像技術(shù)應(yīng)用范圍不斷得到拓展的同時,組織樣品的儲存、包埋以及切片厚度選擇等方面也得到了不斷的優(yōu)化和改進(jìn)。對于組織樣品的儲存,過去多推薦采用液氮快速冷凍后儲存于-80℃的方法,但新鮮組織放置于液氮中其內(nèi)部會因受冷不均勻而導(dǎo)致組織裂開,常常影響實(shí)驗(yàn)的重復(fù)性。Goodwin等[8]使用-70℃或更低溫度的乙醇或異丙醇代替液氮,經(jīng)過多次實(shí)驗(yàn)證明該方法在避免凍存組織裂開方面效果顯著。冷凍切片制備過程中包埋劑的選擇也值得關(guān)注,對于普遍使用的包埋劑OCT(Optimal cutting temperature polymer),由于其易離子化而使質(zhì)譜信號強(qiáng)度下降,所以應(yīng)盡量避免使用OCT包埋劑或使用OCT時避免污染樣本,現(xiàn)在多采用冰或聚合樹脂代替OCT來作為包埋劑[9]。切片的厚度對于MALDI-IMS實(shí)驗(yàn)結(jié)果有很大影響,切片不易過厚,因?yàn)楹袂衅幸恍﹄x子信號有干擾的物質(zhì)不易被乙醇充分清洗掉,另外,切片越厚其表面覆蓋基質(zhì)之后,相對于MALDI導(dǎo)電玻片的絕緣性就越強(qiáng),所以薄切片具有較低的電荷效應(yīng),3-5μm厚度的冰凍切片易于得到質(zhì)量較好的質(zhì)譜圖,尤其適合檢測m/z較大分子[10]。
1.2 基質(zhì)的選擇及應(yīng)用高質(zhì)量的 MALDI-IMS圖像從根本上依賴于高效的基質(zhì)對分析物的沉淀。高效的基質(zhì)可以從樣品中最大程度的抽提出分析物,同時限制分析物的擴(kuò)散,且能夠產(chǎn)生比MALDI分辨率更小的結(jié)晶,MALDI-TOF的空間分辨率一般為25-50μm。MALDI-IMS實(shí)驗(yàn)中常從選擇恰當(dāng)?shù)幕|(zhì)(表1)[11]及濃度,挑選合適的溶劑組分,使用高效的基質(zhì)覆蓋方法方面來優(yōu)化實(shí)驗(yàn)方案。合適的基質(zhì)溶劑應(yīng)既能將組織切片濕透、充分溶出分析物,同時又能快速干燥,有效避免樣品的遷移現(xiàn)象?;|(zhì)的覆蓋方法原則上有兩種,噴霧法和點(diǎn)樣法。比較兩種方法,噴霧法在噴霧和干燥循環(huán)交替進(jìn)行時易引起切片表面過濕,導(dǎo)致組織切片上分析物的位置遷移,另外基質(zhì)結(jié)晶的尺寸和同質(zhì)性也容易因?yàn)椴僮鞑煌苡绊憽|c(diǎn)樣法產(chǎn)生的基質(zhì)液滴體積為80-150pL,可形成直徑為100-200μm的圓形基質(zhì)結(jié)晶區(qū)域,其在一定程度上限制了分析物的空間位置遷移,但圖像分辨率易受到基質(zhì)斑的直徑和間距的影響。
具體在實(shí)驗(yàn)中,要結(jié)合分析物性質(zhì)來選擇。大量的實(shí)驗(yàn)圍繞基質(zhì)的選擇及運(yùn)用方法的優(yōu)化展開,取得了很多寶貴的數(shù)據(jù)和經(jīng)驗(yàn)。此外,針對不同種類的研究對象,在基質(zhì)應(yīng)用方面科學(xué)家們進(jìn)行了一些有益的探索值得借鑒,如Satu M.Puolitaival1等[12]實(shí)驗(yàn)證明利用升華作用得到的基質(zhì)層沉淀均勻,不易發(fā)生分析物空間位置遷移現(xiàn)象,特別適用于組織內(nèi)磷脂分子成像。Ruibing Chen等[13]通過調(diào)整基質(zhì)噴灑器的噴口與MALDI樣品靶之間的距離和噴射基質(zhì)溶液的流速,產(chǎn)生相對干和濕兩種基質(zhì)覆蓋狀態(tài),分別采集質(zhì)譜數(shù)據(jù)后比較結(jié)果發(fā)現(xiàn),對于分子量小于900Da的脂類,這兩種基質(zhì)覆蓋狀態(tài)下所得到的質(zhì)譜信號強(qiáng)度和峰型基本沒有差別。
2.1 基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究中的應(yīng)用MALDI質(zhì)譜成像作為提供唯一全面的組織內(nèi)分子分布信息的技術(shù),已成為科學(xué)家研究生命體內(nèi)各種生理和病理過程分子機(jī)制的最有力的手段。Vladimir等[14]利用MALDI質(zhì)譜成像得到飽和烴、不飽和烴(HCs)和蠟酯(WEs)在灰色麻蠅的翅膀和腿部、普通果蠅翅膀以及椰棗樹葉表面的分布圖像,建立了在昆蟲及植物角質(zhì)層表面直接進(jìn)行脂類和烴類化合物分子成像的實(shí)驗(yàn)方法,該方法正被應(yīng)用于果蠅體表化學(xué)信息的研究中。
表1 常用的基質(zhì)及應(yīng)用范圍
Stephanie S.DeKe 等[15]利 用 MALDI-TOFTOF,進(jìn)行甲殼類動物神經(jīng)組織內(nèi)神經(jīng)肽的分子成像實(shí)驗(yàn),得到了兩種蟹(Jona h crab和cancer borealis)的腦和心包器官內(nèi)神經(jīng)調(diào)節(jié)輔助成分的分子分布圖像,建立了質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)中復(fù)雜多樣的內(nèi)源性信號分子的樣品制備方法。這種器官水平的質(zhì)譜成像研究將有助于闡明同一神經(jīng)肽家族內(nèi)部不同神經(jīng)肽亞型間的空間分布關(guān)系,以及不同神經(jīng)肽家族之間的相對分布關(guān)系。
Yuki Sugiura等[16]利用MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)闡明了不同神經(jīng)節(jié)苷脂分子的分布,尤其探明了按照神經(jīng)鞘氨醇含碳原子數(shù)目分類的C18-神經(jīng)節(jié)糖苷和C20-神經(jīng)節(jié)糖苷的分布差異,前者廣泛的分布在前腦部位,后者選擇性的沿內(nèi)嗅區(qū)到海馬投影區(qū)分布,尤其在齒狀回(DG)分子層分布較多。該實(shí)驗(yàn)首次證明了神經(jīng)節(jié)苷脂在腦內(nèi)分布的選擇性,并推測這種選擇性與不同區(qū)域表達(dá)的神經(jīng)節(jié)糖苷的功能差異有關(guān)。
2.2 藥物研發(fā)中的應(yīng)用MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)在藥物研發(fā)方面有著廣泛的應(yīng)用前景,如可用于藥物靶向篩選、組織器官或細(xì)胞內(nèi)藥物及代謝產(chǎn)物分布等方面研究。Végvári等[17]設(shè)計(jì)了一種內(nèi)置于壓力調(diào)控微芯片上的微量分配器平臺系統(tǒng),其可耐受多種有機(jī)溶劑,最小可沉淀體積為100pL的基質(zhì)液滴,并可通過軟件嘗試多種基質(zhì)沉淀策略?;谠摶|(zhì)覆蓋技術(shù)的MALDI質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn),在肺組織切片中成功檢測到了治療肺慢性阻塞性疾病(COPD)的藥物Tiotropium的兩個二級離子信號,分別是152.1和170.1Da,實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明該技術(shù)沉淀基質(zhì)的重復(fù)性好,能形成指定厚度的基質(zhì)層,非常適用于小分子藥物的研究。
2.3 疾病早期診斷中的應(yīng)用MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)在尋找疾病生物標(biāo)記物、研發(fā)疾病早期診斷方法等方面具有其他技術(shù)無法比擬的優(yōu)勢,已逐漸成為該領(lǐng)域內(nèi)的研究熱點(diǎn)。Shuichi Shimma等[18]利用MALDI-IMS技術(shù)尋找人類結(jié)腸癌疾病的生物標(biāo)記物,由于磷脂在細(xì)胞膜組分中發(fā)揮重要的作用,所以將其作為重要檢測目標(biāo),實(shí)驗(yàn)最終發(fā)現(xiàn)兩種磷脂分子存在明顯的表達(dá)差異,并使用MS/MS技術(shù)進(jìn)行了鑒定,可作為該病潛在的生物標(biāo)志物進(jìn)行進(jìn)一步研究。
A.F.Maarten Altelaar等[19]利用 MALDI質(zhì)譜成像進(jìn)行了大白鼠、小白鼠及人腦垂體內(nèi)神經(jīng)肽的序列差異分析,由于垂體切片?。ㄖ睆?02-103 μm),實(shí)驗(yàn)中將 MALDI-IMS技術(shù)分別與離子顯微鏡和 TIC(total-ion-count)成像技術(shù)結(jié)合使用,得到500nm的像素點(diǎn)和4μm的空間分辨率,彌補(bǔ)了MALDI-IMS分辨率相對較低的弱點(diǎn)。這一技術(shù)可用于尋找正常組織病變后小肽或蛋白質(zhì)發(fā)生的氨基酸序列異常變化(如:氨基酸置換、翻譯后修飾改變等),這將對于疾病的快速診斷具有重要意義。
Siddharth S.Samsi等[20]提出了一種區(qū)分濾泡性淋巴瘤的類別的系統(tǒng)化實(shí)驗(yàn)方法,將甲醛固定石蠟包埋的組織塊,切成5μm厚的切片,進(jìn)行切片原位酶解后 MALDI質(zhì)譜成像分析,同時進(jìn)行H&E染色分析,再將質(zhì)譜成像得到的蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)結(jié)合組織形態(tài)學(xué),有望發(fā)展一種新的診斷工具,即通過MALDI質(zhì)譜成像區(qū)分濾泡、套膜、濾泡內(nèi)區(qū)域,進(jìn)而更加準(zhǔn)確的對濾泡性淋巴瘤進(jìn)行診斷和分類。
MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)發(fā)展迅速,與其他成像技術(shù)相比存在顯著優(yōu)勢。首先,其所得到的質(zhì)荷比(m/z)信息是以分子的原子組成為基礎(chǔ),是已被普遍采用的參數(shù),該技術(shù)不需要對分析物進(jìn)行標(biāo)記,便可對未知分子成像;其次,借助質(zhì)譜儀的高分辨率,還可以區(qū)分分子間的細(xì)微差別;第三,盡管次級離子質(zhì)譜(SIMS)的分辨率可達(dá)1μm,明顯高于 MALDI,但SIMS質(zhì)量測量范圍明顯不及MALDI。另外,MALDI儀器的廣泛應(yīng)用,也是其快速發(fā)展的重要原因之一。
MALDI質(zhì)譜成像技術(shù)作為快速、直觀的蛋白組學(xué)研究工具前景十分廣闊,但在具體實(shí)驗(yàn)中還存在很多技術(shù)上的難題。一方面,在研究藥物及其代謝產(chǎn)物組織內(nèi)分布方面,由于藥物分子在組織細(xì)胞內(nèi)含量低,對實(shí)驗(yàn)靈敏度要求較高,因此實(shí)驗(yàn)中基質(zhì)選擇及應(yīng)用方法方面仍需要進(jìn)行較多的嘗試[21,22]。另一方面,利用質(zhì)譜成像技術(shù)篩選得到的未知蛋白質(zhì)的鑒定相對小肽的鑒定仍存在較多困難,使用顯微切割系統(tǒng)結(jié)合標(biāo)準(zhǔn)的蛋白組學(xué)方法對組織切片上目的蛋白進(jìn)行鑒定,或者對組織切片原位酶解后利用二級質(zhì)譜方法對肽段進(jìn)行鑒定,均易受到組織上目的蛋白的彌散分布、蛋白水解過程或者目的蛋白豐度較低等因素的干擾,而很難得到令人滿意的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。因此,建立完善和成熟的 MALDI質(zhì)譜成像實(shí)驗(yàn)方法仍然是這一技術(shù)優(yōu)勢得到充分發(fā)揮的前提和基礎(chǔ)。
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1007-4287(2012)10-1939-04
國家自然科學(xué)基金(30972197)
徐靜,31歲,女,碩士,助理實(shí)驗(yàn)師,研究方向:瘋牛病發(fā)病機(jī)制研究。
2012-06-16)