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    觀賞植物花青素合成調(diào)控機(jī)理及組學(xué)技術(shù)應(yīng)用

    2025-07-08 00:00:00樊勇孫悅錄億隆于春雷李躍飛孫文松孫紅梅
    關(guān)鍵詞:生物

    Abstract:Flower color is animportant phenotypiccharacteristic of ornamental plants,which isof great significance inenhancing theircommercialvalue.Anthocyaninsarethemainsubstances forthepetal pigmentationofornamentalplants, andtheanthocyaninbiosynthesis ismainlyregulatedbytheinternal structural genesand transcription factorsof plants,in addition totheinfluenceof environment.Inrecent years,withthedevelopmentof research technology,thewidespreadapplicationof transcriptomics,metabolomics,and proteomics hasprovidednewmethodsand means for the studyof anthocyaninsynthesismechanism.Basedontheresearchresultsofanthocyaninbiosynthesisregulationinornamentalplantsathome andabroad,wereviewedthestructureofnthocyanins,biosyntheticpathways,keystructuralgenes,transcriptionfactors and the applicationofomics,and elaborated the regulatory mechanismof genes related to anthocyanin biosynthesis.The aim is toprovidetheoreticalreferenceforthemolecularimprovementofflowercolorandthebreedingof novelvarietiesofonamental plants.

    Keywords: ornamental plants; anthocyanin biosynthesis;regulation mechanism;omics

    觀賞植物的花色繽紛艷麗,其特殊表型對(duì)整個(gè)植株審美價(jià)值的提升具有重要意義[1]?;ㄉ厥怯绊懟ㄉ纬傻闹匾蛩?,研究發(fā)現(xiàn)植物色素的種類主要有類黃酮、生物堿和類胡蘿卜素[2]。花青素是自然界存在最普遍、分布最廣泛的次生代謝物質(zhì),是植物花色形成過(guò)程中最常見(jiàn)的一類類黃酮物質(zhì)。花青素主要以糖昔基化的形式分布在植物的液泡中,是促使植物花瓣、葉片、種子、果實(shí)呈現(xiàn)不同顏色的主要色素物質(zhì)[3]。此外,花青素還是植物應(yīng)對(duì)環(huán)境脅迫的重要調(diào)控物質(zhì),可以減輕植物細(xì)胞遭受干旱、紫外線、真菌等外界脅迫造成的損傷[4]

    前人對(duì)觀賞植物呈色機(jī)理進(jìn)行了深入研究,發(fā)現(xiàn)花色、葉色等形成受環(huán)境因素和自身基因調(diào)控,環(huán)境因素包括pH值、光照、溫度、礦物質(zhì)含量等[5],但是觀賞植物自身基因的調(diào)控作用對(duì)花青素合成的種類及含量影響最直接。伴隨植物著色過(guò)程,一系列相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因及轉(zhuǎn)錄因子編碼的關(guān)鍵酶會(huì)調(diào)控花青素的生物合成,隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展,高通量測(cè)序技術(shù)為觀賞植物花色呈色機(jī)制的組學(xué)研究提供了新的方法。

    基于花青素合成相關(guān)的花色調(diào)控技術(shù)已經(jīng)得到了廣泛的研究和應(yīng)用,但是有關(guān)花青素積累與基因表達(dá)之間關(guān)系的研究還不夠深入,特別是組學(xué)技術(shù)在該領(lǐng)域的應(yīng)用還不夠成熟、分析不夠全面。為了揭示觀賞植物花青素呈色機(jī)制,本文綜述了花青素的結(jié)構(gòu)、生物合成途徑以及相關(guān)結(jié)構(gòu)基因和轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控機(jī)理,并結(jié)合組學(xué)技術(shù)在相關(guān)方面的應(yīng)用,解析不同基因表達(dá)與觀賞植物著色之間的關(guān)系,進(jìn)一步揭示黃酮類色素的代謝途徑,為建立花青素的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供參考,對(duì)觀賞植物花色的分子設(shè)計(jì)育種和優(yōu)質(zhì)品種定向選育具有重要參考價(jià)值。

    1花青素的結(jié)構(gòu)及生物合成途徑

    1.1花青素苷的結(jié)構(gòu)及種類

    花青素又稱為花色素,是一類天然的水溶性植物色素物質(zhì),以糖苷基化形式穩(wěn)定存在[7-8]。植物通過(guò)類黃酮途徑產(chǎn)生黃酮、黃酮醇、異黃酮、黃烷酮、花青素等代謝物,花青素生物合成途徑是類黃酮生物合成途徑的一個(gè)重要分支。許多觀賞植物富含花青素,在菊花(Chrysanthemum morifolium)[9]、紫羅蘭(Mauhiola incana)[10]、嘉蘭(Gloriosa superba)[11]、花毛茛(Ranunculus asiaticusL.)[12]大花卷丹(Lili-umleichtliniivar.maximowiczii)[13]矮牽牛(Petuniahybrida)[14等植物中均有相關(guān)報(bào)道。由于不同植物營(yíng)養(yǎng)器官和生殖器官中花青素的含量和組成不同,所以植物產(chǎn)生了橙色、紅色、紫色和藍(lán)色等不同的顏色特征[15-16]?;ㄇ嗨亟?jīng)過(guò)糖基化、?;?、甲基化修飾作用后形成花青素昔,花青素苷的結(jié)構(gòu)較多,進(jìn)而形成豐富的花色類型[17]。植物中常見(jiàn)的花青素有飛燕草色素、矢車菊色素、天竺葵色素、矮牽牛色素、錦葵色素、芍藥色素等,其中矮牽牛色素、錦葵色素由飛燕草色素甲基化衍生而來(lái),芍藥色素由矢車菊色素甲基化衍生而來(lái)[18]。如圖1所示,當(dāng)花青素花色基團(tuán)的位置被不同基團(tuán)取代會(huì)形成不同的花青素,產(chǎn)生相對(duì)應(yīng)的花色,如橙色、紅色、紫色和藍(lán)色等。隨著花青素羥基化程度加深花瓣的顏色偏紫色,隨著甲基化、糖基化加深而紅色增強(qiáng),隨著?;由疃{(lán)色增強(qiáng)[19-20]

    在植物的不同部位、不同發(fā)育時(shí)期花青素種類及含量存在差異,同時(shí)因氣候和栽培品種的不同花青素也存在較大差異。在高等植物中,花瓣豐富的色彩可以吸引各種動(dòng)物進(jìn)行傳粉和傳播種子,但也可能在野外被植物用作警告顏色[2I-22]?;ㄇ嗨乜梢杂行н^(guò)濾紫外線,使植物免受輻射損傷,同時(shí)花青素還可以增強(qiáng)植物對(duì)低溫脅迫的抵抗力[23]。植物果實(shí)的成熟需要適當(dāng)?shù)墓獯碳?,紫外光作為植物可以感受的一種環(huán)境信號(hào),影響類黃酮代謝途徑以及花青素的合成水平[24],Kataoka等[25]研究發(fā)現(xiàn)紫外光可以增強(qiáng)桃(Prunuspersica)果皮中花青素的積累。

    1.2花青素的生物合成途徑

    花青素的生物合成途徑和基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在許多植物中存在較為相似的模式,被認(rèn)為是高度保守的[26],如圖2所示,花青素苷主要在多個(gè)結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控因子的作用下,通過(guò)花青素生物合成途徑合成[27]。前人已從金魚(yú)草(Antirrhinummajus)、矮牽牛、蝴蝶蘭(Phalaenopsis)擬南芥(Arabidopsis thali-ana)卵葉牡丹(Paeoniaqiui)等觀賞植物中克隆分離出與花青素合成相關(guān)的關(guān)鍵基因,并對(duì)其功能進(jìn)行了驗(yàn)證[28-31]。苯丙氨酸作為花青素和其他黃酮類化合物生物合成的初始前體物質(zhì),在苯丙氨酸解氨酶(PAL)、肉桂酸4-羥化酶(C4H)、4-香豆酰輔酶A連接酶(4CL)、查爾酮合酶(CHS)、查爾酮異構(gòu)酶(CHI)催化作用下合成無(wú)色的柚皮素,隨后柚皮素在黃烷酮3-羥化酶 (F3H )、類黃酮 3 -羥化酶(F3H) 、類黃酮 3′,5 -羥化酶 (F35H) 和二氫黃酮醇4-還原酶(DFR)催化作用下合成無(wú)色花青素[32-33],最后不穩(wěn)定的花青素通過(guò)花青素合成酶(ANS)、udp-葡萄糖-類黃酮3-O-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(UFGT)轉(zhuǎn)化成穩(wěn)定的花青素苷,呈現(xiàn)紅色、粉色、藍(lán)色、紫色等顏色。MYB、bHLH和WD4O等轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)對(duì)花青素合成的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄調(diào)控,從而影響花色的形成[34-35] 。

    圖2花青素生物合成途徑Fig.2Anthocyanin biosynthesispathway

    PAL:苯丙氨酸解氨酶;C4H:肉桂酸4-羥化酶;4CL:4-香豆酰輔酶 A 連接酶;CHS:查爾酮合酶;CHI:查爾酮異構(gòu)酶; F3H :黃烷酮3-羥化酶;F3H :類黃酮3'-羥化酶; F35H :類黃酮3',5'-羥化酶;DFR:二氫黃酮醇4-還原酶;ANS:花青素合成酶;UFGT:udp-葡萄糖-類黃酮3-O-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶;GST:谷胱甘肽 s 轉(zhuǎn)移酶。

    2花青素生物合成中的主要結(jié)構(gòu)基因

    苯丙氨酸解氨酶( PAL) 是花青素生物合成前期的關(guān)鍵酶[36],催化 L -苯丙氨酸脫掉氨轉(zhuǎn)化成反式肉桂酸。許多植物的花青素含量與PAL活性有關(guān)[37]]滇水金鳳(Impatiensuliginosa)的IuPAL1和IuPAL2基因在深紅色花被中的表達(dá)量最高,促進(jìn)花青素的顯著積累[38],戊糖代謝途徑中合成的苯丙酮酸在PAL 的作用下可減少與氨的結(jié)合,朝著花青素合成方向發(fā)展[39]。 PAL 是連接初級(jí)代謝和苯丙氨酸代謝的必需酶[40],植物通過(guò)苯丙素途徑合成多種重要的次生代謝物質(zhì),除了生成花青素外,還生成木質(zhì)素、類黃酮、植保素等物質(zhì)。

    查爾酮合酶(CHS)可以將1分子香豆酰CoA和3分子丙二酰CoA縮合成查爾酮,是黃酮類物質(zhì)合成的關(guān)鍵聚合酶[41]。作為合成花青素等重要化合物的前體物質(zhì),查爾酮經(jīng)過(guò)其他酶的催化作用合成不同的中間產(chǎn)物,包括黃酮、黃酮醇、異黃酮、白藜蘆醇、花青素等。Huang等[42]研究發(fā)現(xiàn),馬纓杜鵑(Rhododendrondelavayi)的RdCHS1基因參與類黃酮的合成,在煙草中過(guò)表達(dá)RdCHS1基因,可使煙草的花色由淺粉色轉(zhuǎn)變?yōu)樯罘凵?。CHS屬于一個(gè)多基因家族編碼的酶,在不同物種間CHS的結(jié)構(gòu)具有一定的保守性。CHS基因在不同植物、不同組織器官中存在不同的表達(dá)和調(diào)控機(jī)制[43],所以研究CHS基因的分子特性具有重要意義。

    查爾酮異構(gòu)酶(CHI)在植物體內(nèi)一般以單體形式存在,但在不同物種或者不同組織中的相對(duì)分子量有差異。CHI催化查爾酮分子異構(gòu)化形成(2S)-黃烷酮,再通過(guò)其他酶催化進(jìn)一步衍生為黃酮類物質(zhì),包括黃酮、異黃酮、黃酮醇和花青素[44]。已有研究發(fā)現(xiàn)CHI基因可以促進(jìn)類黃酮和花青素的合成,在日本牽牛(Ipomoeanil)中CHI基因編碼的EFP蛋白參與了類黃酮生物合成的早期階段,確保了類黃酮化合物的生成和花色素的沉積[45];在擬南芥突變體中, CHI(tt5) 基因功能的喪失導(dǎo)致類黃酮和花青素含量降低,促使種皮變黃[46]

    類黃酮 3′,5 -羥化酶 屬于細(xì)胞色素P450家族,可以催化二氫黃酮醇B環(huán) 3,5 位置合成羥基化的類黃酮[47]。已有報(bào)道將桔梗(Platyc-odongrandiflorus) PgF35H 基因轉(zhuǎn)化到煙草(Nicoti-anatabacum)中過(guò)表達(dá),煙草植株合成花青素的種類和含量均呈增加趨勢(shì),煙草花色由淺粉色轉(zhuǎn)變?yōu)槠芳t色[48]。前人研究發(fā)現(xiàn)豌豆(Pisumsativum)突變體由于缺乏 F35H 基因,不能合成飛燕草色素和矮牽牛色素而出現(xiàn)粉色花,這兩種色素是野生型豌豆紫色花的主要著色物質(zhì)[49]

    二氫黃酮醇4-還原酶(DFR)是花青素合成過(guò)程中的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)調(diào)控酶,可催化二氫山奈酚、二氫楊梅素、二氫槲皮素3種黃酮醇分別合成無(wú)色天竺葵素、無(wú)色飛燕草素、無(wú)色矢車菊素[50-51]。DFR 基因在不同植物、不同組織器官、不同發(fā)育階段的表達(dá)存在特異性,有研究結(jié)果表明,DFR基因在菊花舌狀花初露伸長(zhǎng)、花瓣伸長(zhǎng)時(shí)表達(dá)水平升高,隨著花序的開(kāi)放其表達(dá)水平逐漸降低[52]。Zan等[53]發(fā)現(xiàn)玫瑰(Rosarugosa)RrCCoAOMT1基因沉默時(shí),過(guò)表達(dá)RrDFR1基因可以提高矢車菊素-3,5-雙葡萄糖苷和芍藥素-3,5-葡萄糖苷的含量,使紅色花瓣顏色更濃。

    在花青素生物合成途徑末端,無(wú)色花青素在花青素合成酶(ANS)的作用下被催化轉(zhuǎn)變?yōu)橛猩幕ㄇ嗨豙54]。作為花青素合成后期重要的調(diào)節(jié)酶,在擬南芥中發(fā)現(xiàn)ANS的活性位點(diǎn)由金屬離子、共底物和兩分子的底物類似物(二氫槲皮素)共同構(gòu)成[55]ANS基因在觀賞植物花色素的呈色過(guò)程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用[56],有研究發(fā)現(xiàn)ANS基因的表達(dá)量與花青素的合成呈現(xiàn)正相關(guān)關(guān)系[57],其功能的缺失會(huì)導(dǎo)致植物器官轉(zhuǎn)變?yōu)闊o(wú)色或白色。Aharoni等[58]發(fā)現(xiàn)抑制草莓(FragariaXananassaDuch.)ANS基因的表達(dá)導(dǎo)致有色花青素?zé)o法合成,使草莓花朵的顏色由粉色轉(zhuǎn)變成了白色。

    黃酮醇合成酶(FLS)屬于2-氧酮戊二酸依賴型雙加氧酶(2-ODD)家族,是一種催化二氫黃酮醇轉(zhuǎn)化為黃烷醇的可溶性酶[59]。Luo等[60]研究結(jié)果表明,在類黃酮生物合成通路中FLS和DFR共同競(jìng)爭(zhēng)底物二氫黃醇酮,分別合成無(wú)色黃醇酮和有色花青素。FLS基因在觀賞植物著色過(guò)程中發(fā)揮重要的調(diào)控作用,已有研究結(jié)果證明矮牽牛FLS基因的反義表達(dá)減少了黃酮醇的合成,促進(jìn)花青素的生物合成,使花瓣和花絲由淺粉色變?yōu)榧t色[6];草原龍膽( Eu #stomagrandiflorum)反義表達(dá)FLS基因的植株比未轉(zhuǎn)化植株的花瓣顏色更紅[62]

    UDP-葡萄糖-類黃酮3-O-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(UF-GT)通過(guò)將花青素昔元的C-3位糖基化形成穩(wěn)定的花青素苷,然后花青素昔被轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞液泡中[56,63]。UFGT可以在花青素疏水分子中加入糖殘基,增加花青素的溶解度和穩(wěn)定性,促進(jìn)花青素昔的形成,花青素昔通過(guò)分子間和分子內(nèi)的堆疊效應(yīng)影響花瓣顏色[64]。已有報(bào)道日本牽?;ǎ↖pomoeanil)和圓葉牽?;ǎ↖pomoeapurpurea)突變體的UF-GT基因發(fā)生移碼突變而喪失活性,導(dǎo)致花朵中花青素積累量減少了約 80% ,突變體花色因此變淺[65]

    3花青素生物合成相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子

    花青素生物合成主要通過(guò)轉(zhuǎn)錄因子在轉(zhuǎn)錄水平對(duì)結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行調(diào)控完成[26]。迄今為止,已發(fā)現(xiàn)MYB、bHLH、WD4O、鋅指(Zincfinger)、MADS和WRKY等轉(zhuǎn)錄因子可以調(diào)控花青素的生物代謝過(guò)程[66-67]。To等[68]報(bào)道在花青素合成通路中,MYB、bHLH和WD40這3個(gè)主要轉(zhuǎn)錄因子家族特異性調(diào)控結(jié)構(gòu)基因的表達(dá),進(jìn)而影響花色素的合成。

    3.1 MYB類轉(zhuǎn)錄因子

    MYB轉(zhuǎn)錄因子具有兩個(gè)不同的功能域,一個(gè)高度保守的MYBDNA-binding結(jié)合域和一個(gè)可調(diào)控蛋白質(zhì)活性的C-terminal調(diào)節(jié)域[9],根據(jù)MYB結(jié)構(gòu)域的重復(fù)次數(shù),MYB被分為4大類,即R1、R2R3、R1R2R3和4R-MYB[70]。通過(guò)對(duì)擬南芥[71]和玉米(Zeamays)[72]R2R3-MYB的研究發(fā)現(xiàn)該基因家族的規(guī)模較大,盡管MYB結(jié)構(gòu)域外的氨基酸序列存在差異,但仍有一些保守的基序有助于識(shí)別R2R3型MYB轉(zhuǎn)錄因子DNA結(jié)合域外的功能域。植物中的R2R3-MYB家族成員已被證實(shí)主要參與調(diào)控花青素的生物合成[73]。R2R3-MYB可以作為正調(diào)控因子和負(fù)調(diào)控因子調(diào)控植物不同器官中花青素合成的種類和含量水平[74]

    已有研究發(fā)現(xiàn),在園藝植物中過(guò)表達(dá)MYB基因能夠促進(jìn)花青素的積累[75-76],在蘋(píng)果果皮中過(guò)表達(dá)藍(lán)星睡蓮(Nymphaeacolorata)NcMYB25基因,可以顯著增加果皮花青素的含量[7]。過(guò)表達(dá)AN4(R2R3-MYB編碼基因)可以促進(jìn)矮牽牛CHS、F3H和DFR基因的表達(dá),進(jìn)而增強(qiáng)花青素的生物合成[78]。對(duì)牡丹(Paeoniasuffruticosa)轉(zhuǎn)錄因子PsMYB114LPsMYB12L基因進(jìn)行異源表達(dá),發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子特異性調(diào)控DFR和ANS基因表達(dá),促進(jìn)花青素的沉積[79]。在蝴蝶蘭研究中發(fā)現(xiàn)Pe-MYB2PeMYB11和PeMYB12轉(zhuǎn)錄因子可以激活3個(gè)下游結(jié)構(gòu)基因F3H、DFR和ANS的表達(dá),促進(jìn)花瓣中花青素生物合成,這3個(gè)PeMYB還參與了單個(gè)花不同部位的色素沉著,促進(jìn)萼片和花瓣中紅色斑點(diǎn)及脈紋狀表型的形成[80] 。

    MYB類轉(zhuǎn)錄因子可以與結(jié)構(gòu)基因共同作用,抑制花青素的生物合成。已有報(bào)道發(fā)現(xiàn),菊花Cm-MYB4和 CmMYB5 轉(zhuǎn)錄因子基因異源表達(dá)導(dǎo)致花青素含量降低[81], PtrMYB182 轉(zhuǎn)錄因子基因在楊樹(shù)(Populus species)中過(guò)表達(dá)降低了花青素的積累[82]在葡萄(Vitisvinifera)中R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的表達(dá)水平與色素沉著密切相關(guān)[74],R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子基因在煙草中異源表達(dá)可以抑制花青素合成,使花瓣幾乎轉(zhuǎn)變?yōu)榘咨玔58.83]。Albert等[84]研究發(fā)現(xiàn),PhMYB27是矮牽?;ㄇ嗨厣锖铣傻囊种埔蜃?,RNAi轉(zhuǎn)錄因子PhMYB27增加了矮牽?;ㄇ嗨胤e累,而過(guò)表達(dá)則降低了其花青素的生物合成。通過(guò)郁金香(TulipagesnerianaL.)TgMYB4轉(zhuǎn)錄因子基因在煙草中過(guò)表達(dá),發(fā)現(xiàn)ANS和DFR基因的轉(zhuǎn)錄水平嚴(yán)重降低,抑制了花青素的合成,減少了花瓣中色素沉積[85]

    3.2 bHLH類轉(zhuǎn)錄因子

    bHLH轉(zhuǎn)錄因子由氨基酸末端的堿性結(jié)構(gòu)域和羧基末端的 α 螺旋-環(huán)- ?α 螺旋結(jié)構(gòu)域(HLH結(jié)構(gòu)域)組成,每個(gè)結(jié)構(gòu)域是由60個(gè)左右保守氨基酸殘基構(gòu)成的多肽序列。堿性結(jié)構(gòu)域參與bHLH轉(zhuǎn)錄因子與DNA順式元件E-box或G-box結(jié)合,HLH結(jié)構(gòu)域由兩個(gè)含有疏水殘基的 α 螺旋形成二聚體,改變不同信號(hào)通路靶基因的表達(dá)[86]。bHLH作為調(diào)控花青素合成的重要的調(diào)控因子,可以與結(jié)構(gòu)基因的啟動(dòng)子結(jié)合激活對(duì)應(yīng)基因的活性,在花青素生物合成通路中發(fā)揮重要作用[87-88] O

    bHLH通過(guò)直接調(diào)控結(jié)構(gòu)基因(DFR、ANS、UF-GT)的表達(dá)水平調(diào)控花青素的生物合成。在石斛(Dendrobium)中通過(guò)轉(zhuǎn)錄組分析鑒定到DhbHLH1轉(zhuǎn)錄因子,DhbHLH1可以與DhMYB2結(jié)合激活花瓣中DhDFR和DhANS基因的啟動(dòng)子,調(diào)控花青素的生物合成[89]。擬南芥中與黃酮類合成相關(guān)的bHLH已被歸為IIIf亞組[90],bHLH轉(zhuǎn)錄因子AtGL3、AtEGL3和AtTT8通過(guò)調(diào)控結(jié)構(gòu)基因,參與了花青素的積累[91]。bHLH在花青素合成途徑中可以發(fā)揮正向調(diào)控的作用,通過(guò)蓮花(Nelumbonucifera)NnTT8基因異源過(guò)表達(dá)分析發(fā)現(xiàn), NnTT8 正向調(diào)控花青素和原花青素(PA)的生物合成,與擬南芥AtTT8具有類似的功能[92]。從矮牽牛中鑒定出AN1和JAF13(bHLH1)轉(zhuǎn)錄因子可以直接激活dfrA基因的表達(dá),促進(jìn)色素在花瓣中積累[93]。前人研究發(fā)現(xiàn),bHLH還可以負(fù)調(diào)控花青素的生物合成,蠟梅(Chimonanthuspraecox)Cp-bHLH1轉(zhuǎn)錄因子通過(guò)抑制類黃酮生物合成途徑后期基因(LBG)的表達(dá)來(lái)抑制花青素的沉積[94]。Zhao等[95]研究發(fā)現(xiàn),LcbHLH92通過(guò)激活JAZ基因來(lái)抑制TT8的表達(dá),導(dǎo)致基因DFR和ANS的表達(dá)活性下降,起到顯著降低花青素積累的作用。

    3.3 WD40轉(zhuǎn)錄因子

    WD40蛋白也稱為WD重復(fù)蛋白(WD-repeatprotein),由4\~16個(gè)高度保守的WD40特征基序構(gòu)成。每個(gè)保守的特征基序從N末端甘氨酸-組氨酸(G-H)對(duì)開(kāi)始,到C末端天冬氨酸-色氨酸(W-D)對(duì)結(jié)束,也被稱為 Trp-Asp 基序[96-97],每個(gè)基序由4個(gè)反式折疊組成[98]。WD40蛋白在植物體中最重要的功能之一是參與花青素生物合成的調(diào)控[9-100],,通過(guò)WD40結(jié)構(gòu)域與其他轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合協(xié)同調(diào)控花瓣中色素沉積,所以WD40轉(zhuǎn)錄因子的發(fā)現(xiàn)進(jìn)一步完善了花青素生物合成機(jī)制理論。

    前人研究發(fā)現(xiàn)矮牽牛PhAN11基因編碼的WD40蛋白可以激活PhAN2的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)花青素的合成[I],而擬南芥TTG1轉(zhuǎn)錄因子與矮牽牛AN11高度同源,可以誘導(dǎo)DFR基因的表達(dá),調(diào)控花青素的積累及葉表皮毛的形成,TTG1基因的缺失會(huì)嚴(yán)重影響這些發(fā)育過(guò)程[102-103]。Saito等[63]在紫蘇(Peril-lafrutescens)葉色研究中鑒定到了調(diào)控花青素合成的PFWD蛋白,在擬南芥中過(guò)表達(dá)PFWD基因能夠使花青素的合成增強(qiáng),An等[104]從蘋(píng)果(Malus pum-ila)中克隆到WD40基因MdTTG1,并通過(guò)在擬南芥中異源表達(dá),鑒定出MdTTG1為調(diào)控花青素積累的關(guān)鍵基因。小蒼蘭(Freesiahybrida)WD40基因FhTTG1與花青素和原花青素的合成同步表達(dá),F(xiàn)hT-TG1可能與轉(zhuǎn)錄因子FhbHLH相互作用,正向調(diào)控與花青素、原花青素合成及毛狀體形成相關(guān)的基因,進(jìn)而影響相關(guān)發(fā)育過(guò)程[105] O

    3.4轉(zhuǎn)錄因子MBW復(fù)合物的調(diào)控作用

    花色調(diào)控因子R2R3-MYB、bHLH與WD40相互作用組成復(fù)合體(MBW)[35,106],可以激活參與花青素、原花青素合成相關(guān)結(jié)構(gòu)基因的活性。MBW復(fù)合體通過(guò)與結(jié)構(gòu)基因的啟動(dòng)子特異性結(jié)合,實(shí)現(xiàn)對(duì)花青素生物合成途徑的調(diào)控作用[107-108],但是這些結(jié)構(gòu)基因的功能在不同物種之間存在差異[106]。在擬南芥中茉莉酸(JAs)誘導(dǎo)JAZ蛋白降解,使JAZ蛋白對(duì)bHLH和MYB的抑制作用解除,MBW復(fù)合體的調(diào)控活性恢復(fù),促進(jìn)了花青素的合成和毛狀體的產(chǎn)生[109]。月季中RcMYB與RcbHLH(RcbHLH42和RcEGL1)、RcTTG1結(jié)合形成兩種MWB復(fù)合體,通過(guò)瞬時(shí)表達(dá)發(fā)現(xiàn)這兩種復(fù)合體以功能冗余的方式正向調(diào)控花青素的合成[110]。Gu等[1]發(fā)現(xiàn)斑點(diǎn)牡丹PsMYB12與bHLH和WD40蛋白相互作用形成復(fù)合體,可以激活色斑中PsCHS基因特異性表達(dá)。苜蓿(Medicagotruncatula)花中MtTT8、MtWD40-1與MYB轉(zhuǎn)錄因子MtPAR相互作用,激活花青素還原酶(ANR)和花青素合成酶的活性,調(diào)節(jié)花青素的生物合成[112]。紫葉茶樹(shù)(Camel-liasinensis)中R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子CsAN1特異性激活CsGL3(bHLH),結(jié)合WD-repeat 蛋白CsTTG1,形成MYB-bHLH-WDR(MBW)復(fù)合物,促進(jìn)花青素合成途徑后期結(jié)構(gòu)基因(LBG)表達(dá),調(diào)控花青素積累[113]

    4組學(xué)研究在觀賞植物中的應(yīng)用

    4.1轉(zhuǎn)錄組學(xué)在觀賞植物研究中的應(yīng)用

    轉(zhuǎn)錄組學(xué)是生物體在一定發(fā)育階段或特定功能狀態(tài)下,通過(guò)對(duì)基因的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行研究,揭示該生物生長(zhǎng)發(fā)育特征分子機(jī)制的一種分析技術(shù)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)從特定組織或者特定細(xì)胞的整體層面對(duì)基因的表達(dá)情況進(jìn)行分析,從根本上對(duì)轉(zhuǎn)錄出來(lái)的mRNA集合進(jìn)行研究。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-seq)技術(shù)是通過(guò)對(duì)cDNA序列進(jìn)行測(cè)序得到大量read片段,再經(jīng)過(guò)特殊的運(yùn)算方法,最終獲得基因片段表達(dá)水平[114]的一種高通量測(cè)序技術(shù)?;谙乱淮鷾y(cè)序(NGS)的RNA-seq技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于鑒定園藝作物的關(guān)鍵調(diào)控基因[15-7]。李婧[118]利用 Illumina Hi-Seq 技術(shù)對(duì)三色堇(Viola×WittrockianaGams.)花瓣進(jìn)行高通量測(cè)序,與公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),挖掘出了參與花青素和類胡蘿卜素生物合成的關(guān)鍵基因,并在不同花色品種中對(duì)基因功能進(jìn)行了表達(dá)分析,揭示了三色堇花斑形成的分子機(jī)理。Qu等[119]對(duì)不同花期的綠絨蒿(Meconopsis)開(kāi)展轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)分析,鑒定出5個(gè)調(diào)控花色變化的重要差異基因。Shi等[120]基于Illumina Hi-Seq技術(shù)對(duì)黃色和紫紅色牡丹花瓣進(jìn)行了大規(guī)模轉(zhuǎn)錄組分析,共篩選出4個(gè)在紫紅色花色形成過(guò)程中發(fā)揮關(guān)鍵作用的結(jié)構(gòu)基因和轉(zhuǎn)錄因子,為今后更好地解析牡丹花著色機(jī)理提供了關(guān)鍵的基因靶點(diǎn)。

    基于IlluminaSolexa平臺(tái)的高通量測(cè)序技術(shù)作為挖掘花色相關(guān)基因和解析花瓣呈色機(jī)制的高效技術(shù)手段,在觀賞植物中得到了廣泛應(yīng)用,如石蒜花(Lycoris radiata)[121]、甘菊(Chrysanthemum lavandul-ifolium)[122]、馬蹄蓮(Zantedeschia aethiopica)[123],木槿(Hibiscussyriacus)[i24]等,這些分析結(jié)果為植物色素沉著的分子機(jī)制研究提供了大量有價(jià)值的基因資源,為次生代謝物合成相關(guān)調(diào)控基因的挖掘提供了重要的途徑。

    4.2代謝組學(xué)在觀賞植物中的應(yīng)用

    代謝組學(xué)是對(duì)某一生物體、組織或細(xì)胞中的所有低相對(duì)分子量(通常是指相對(duì)分子量 lt;1 000 )代謝產(chǎn)物進(jìn)行定量和定性分析的新興技術(shù)。通過(guò)檢測(cè)分析植物在正常生長(zhǎng)發(fā)育條件下與特殊環(huán)境或者處理下生成的差異次生代謝物,來(lái)揭示其生命活動(dòng)的變化規(guī)律[125]。根據(jù)植物中代謝物的差異變化也可以反映出植物生長(zhǎng)環(huán)境的動(dòng)態(tài)變化。利用樣本圖譜的檢測(cè)、識(shí)別技術(shù),對(duì)代謝過(guò)程中次生代謝物的富集、消耗及分布進(jìn)行研究、驗(yàn)證,找出可能與之相關(guān)的生物標(biāo)志物[126],可以對(duì)生物體的生理狀態(tài)作出一定的判斷。

    代謝組學(xué)在園藝植物花色研究方面已被廣泛應(yīng)用,通過(guò)分析差異代謝物的沉積規(guī)律,揭示花青素類物質(zhì)的生物合成途徑和花色呈色機(jī)制[127]。Park等[128]利用代謝組學(xué)分析了白色、紫色和紅色杜鵑(Rhododendronschlippenbachii)表型的變化和代謝物的積累,鑒定出40種差異次生代謝物,發(fā)現(xiàn)紅色花的花青素積累量最高,主要成分是矢車菊素。Shen等[129]利用代謝組學(xué)對(duì)紫葉茶新品種ZX進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)紫葉茶中與花青素合成相關(guān)的代謝產(chǎn)物含量保持了較高水平,而在綠葉茶中與葉綠素、類胡蘿卜素合成有關(guān)的代謝產(chǎn)物含量較高,這些發(fā)現(xiàn)有助于解析紫葉茶葉色的形成機(jī)制。Su等[130]采用代謝組學(xué)對(duì)玫瑰品種ChenXi在不同光照條件下花瓣中類黃酮代謝物進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)不同處理間有56種類黃酮化合物存在差異,主要富集在異黃酮、類黃酮、黃酮和黃酮醇、苯丙素以及花青素的生物合成途徑中,分析認(rèn)為花青素是引起玫瑰花在光照下轉(zhuǎn)變?yōu)榧t色的主要原因。陳勇等[131]通過(guò)代謝組學(xué)分析發(fā)現(xiàn),洋紫荊花(BauhiniavariegataL.)不同顏色花瓣積累的花青素種類存在差異,紫紅色花瓣積累的主要是錦葵色素衍生物和飛燕草色素衍生物,白色花則以天竺葵色素衍生物為主。此外,通過(guò)代謝組學(xué)研究與植物色澤相關(guān)的次生代謝物還有較多報(bào)道,如Ai等[132]對(duì)建蘭(Cymbidium ensifolium)的研究、Zhao 等[133]對(duì)睡蓮(Nymphaea)的研究、Sawada等[134]對(duì)菊花的研究以及桑賢東等[135]對(duì)大紅花(Hibiscusrosa-sinensis)的研究。

    4.3蛋白質(zhì)組學(xué)在觀賞植物中的應(yīng)用

    蛋白質(zhì)組學(xué)是從生物體或者細(xì)胞水平研究某一生理過(guò)程的全部蛋白質(zhì),分析這一過(guò)程中蛋白質(zhì)的差異表達(dá)、修飾作用及蛋白質(zhì)之間的互作等規(guī)律,從而揭示某一生命活動(dòng)的生理或者分子機(jī)制的一種分析技術(shù)[136]。目前蛋白質(zhì)組學(xué)主要有雙向分離凝膠電泳技術(shù)、質(zhì)譜分析技術(shù)、同位素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量技術(shù)、蛋白質(zhì)芯片技術(shù)、免疫共沉淀技術(shù)等,其中同位素標(biāo)記技術(shù)(iTRAQ)和串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)記技術(shù)(TMT)操作效率和靈敏度較高,廣泛用于蛋白質(zhì)分析研究[137]。觀賞植物著色相關(guān)基因在植株生長(zhǎng)發(fā)育不同時(shí)間、不同部位表達(dá)情況并不完全相同,所以有必要進(jìn)行多時(shí)期、多部位、多水平的蛋白質(zhì)組學(xué)研究,建立色澤形成的功能蛋白質(zhì)庫(kù)和基因庫(kù),為觀賞植物種質(zhì)資源創(chuàng)制、分子輔助育種提供理論基礎(chǔ)。

    蛋白質(zhì)是各種生命活動(dòng)的承擔(dān)者和執(zhí)行者,通過(guò)對(duì)蛋白質(zhì)類物質(zhì)進(jìn)行分析,從生物化學(xué)角度探究觀賞植物表型特征[138],有助于揭示其花色形成機(jī)理。吳欣欣等[139]采用雙向電泳和蛋白質(zhì)質(zhì)譜鑒定技術(shù),對(duì)紅色和白色跳枝梅(PrunusmumeFubanTiaozhi)花蕾的差異表達(dá)蛋白質(zhì)進(jìn)行分析,共鑒定到表達(dá)豐度差異達(dá)到2倍以上的蛋白質(zhì)21個(gè),對(duì)其中12個(gè)關(guān)鍵蛋白質(zhì)編碼基因在分子水平進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的生長(zhǎng)素結(jié)合蛋白質(zhì)、與茉莉酸甲酯合成相關(guān)的丙二烯氧化物環(huán)化酶可能是導(dǎo)致梅花顏色差異的關(guān)鍵因子。為了探究紅掌(Anthuriumandraeanum)佛焰苞顏色變化的機(jī)理,高樂(lè)[i40]以紅色野生型及玫瑰紅、白色突變體為研究對(duì)象進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)研究,鑒定到21個(gè)參與類黃酮合成、葡萄糖代謝、抗逆性、基因調(diào)節(jié)和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等生命活動(dòng)過(guò)程的功能蛋白,推測(cè)這些蛋白質(zhì)的差異表達(dá)是花朵呈現(xiàn)不同顏色的主要原因。李林寶[141]在蓮大灑錦色斑區(qū)蛋白質(zhì)組學(xué)研究中鑒定到參與花青素生物合成的差異表達(dá)蛋白質(zhì)(酶)9個(gè),其中有6個(gè)酶在著色區(qū)域呈上調(diào)趨勢(shì),特別是ANS和CHII對(duì)花青素在色斑區(qū)的積累影響顯著[141]。通過(guò)蛋白質(zhì)組學(xué)對(duì)觀賞植物花色呈色機(jī)理進(jìn)行解析,為關(guān)鍵基因挖掘研究提供了理論基礎(chǔ),對(duì)花色分子改良具有重要意義。

    4.4多組學(xué)聯(lián)合在觀賞植物中的應(yīng)用

    采用轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多組學(xué)進(jìn)行聯(lián)合分析,探究不同基因、次生代謝物、蛋白質(zhì)的差異表達(dá)及互作關(guān)系,已成為解析觀賞植物花色素苷合成、花色調(diào)控機(jī)制的方向和熱點(diǎn)。Fan等[142]通過(guò)代謝組學(xué)技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)草原龍膽雙色花發(fā)育過(guò)程中與花青素生物合成途徑的差異表達(dá)代謝物與差異表達(dá)基因進(jìn)行聯(lián)合分析,挖掘了調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中關(guān)鍵基因與代謝物的關(guān)聯(lián)性,為揭示草原龍膽雙色花形成中花青素積累的分子機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

    為了探究鹿角杜鵑花色變異的分子機(jī)制,Xiao等[143]以淺粉色、紫色花為研究對(duì)象進(jìn)行代謝組學(xué)與轉(zhuǎn)錄組學(xué)聯(lián)合分析,挖掘了與呈色相關(guān)的代謝產(chǎn)物、關(guān)鍵基因和轉(zhuǎn)錄因子,發(fā)現(xiàn)隨著RIF3GT1表達(dá)量的增加和RILAR、RANR表達(dá)量的降低,錦葵色素-3-0-葡萄糖昔和芍藥色素-3-0-葡萄糖苷的表達(dá)量增加,使鹿角杜鵑花呈現(xiàn)紫色,研究還發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子RIMYB4、結(jié)構(gòu)基因RILAR與代謝物蘋(píng)果苷-3-O-葡萄糖昔和豌豆昔-3-O-葡萄糖昔之間存在調(diào)控關(guān)系。吳艷梅[144]通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的聯(lián)合分析解析華麗龍膽(Gentianasino-ornata)藍(lán)色花呈色機(jī)制,篩選出1247個(gè)差異表達(dá)基因和825個(gè)差異表達(dá)蛋白質(zhì),鑒定出與花青素生物合成相關(guān)的關(guān)鍵基因 F35H 、5GT、5AT及聚類基因群(包括3GT、UF3GT,DFR,ANS,bHLH, ,推測(cè)這些基因調(diào)控飛燕草素苷的生物合成、修飾、轉(zhuǎn)運(yùn)等過(guò)程,可能是華麗龍膽花冠呈藍(lán)色的關(guān)鍵基因。Deng等[145]綜合運(yùn)用代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對(duì)蓮花花瓣紅白雙色模式進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)花青素3-0-葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(UF-GT)積累的減少導(dǎo)致花瓣白色部分花青素糖基化失敗,使花瓣不同部位花青素苷差異沉積,形成紅白雙色花。楊娟[146]以紫色和白色燕子花(Iris laevigata)為試驗(yàn)材料,通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)聯(lián)合分析發(fā)現(xiàn),紫色燕子花中花青素種類和含量顯著高于白色花,特別是飛燕草色素大量積累,而轉(zhuǎn)錄因子IIMYB4和IIMYB5競(jìng)爭(zhēng)與IbHLH3結(jié)合,促進(jìn)IANR表達(dá)量增加,使白色花中花青素的生物合成通路受到阻礙進(jìn)而抑制花青素的合成。

    5展望

    觀賞植物花青素生物合成受結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控因子的共同作用,隨著組學(xué)的應(yīng)用,科研人員對(duì)觀賞植物呈色機(jī)制的研究將更加深入。挖掘與花瓣著色相關(guān)的關(guān)鍵基因并對(duì)其功能進(jìn)行驗(yàn)證,采用基因改良技術(shù)使花色研究朝滿足市場(chǎng)需求的方向發(fā)展,將為觀賞植物花色改良和分子輔助育種提供理論參考。

    隨著高通量測(cè)序技術(shù)、代謝組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等的發(fā)展和完善,不同組學(xué)聯(lián)合解析在觀賞植物花色形成和基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)控方面具有廣闊的應(yīng)用空間?;ㄉ氐姆e累是一個(gè)復(fù)雜的代謝過(guò)程,涉及到的差異基因、代謝物、蛋白質(zhì)相對(duì)較多,目前相關(guān)代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究還不夠完善,因此通過(guò)多組學(xué)聯(lián)合從多維度解析花色素積累的調(diào)控機(jī)制尤為重要。結(jié)合表觀遺傳特征,從不同角度深入挖掘影響差異表型形成的基因資源,為花色調(diào)控提供理論基礎(chǔ)。

    觀賞植物的花瓣除了具有全色以外,還具有雙色、斑狀、霧狀、茶色等特殊表型,例如雙色大麗花、斑狀百合、茶色草原龍膽等具有較高的商業(yè)價(jià)值,廣受市場(chǎng)歡迎。觀賞植物這些特異性狀相對(duì)穩(wěn)定,但是其分子遺傳規(guī)律很少被揭示,采用較先進(jìn)的技術(shù)分析手段,揭示背后控制這些性狀的主效基因和轉(zhuǎn)錄因子,可以為觀賞植物種質(zhì)創(chuàng)新和花色改良育種提供理論基礎(chǔ)。

    環(huán)境因素影響觀賞植物花青素苷的穩(wěn)定性,基因與環(huán)境的互作可以調(diào)控花色的表型,環(huán)境因子通過(guò)影響花青素合成關(guān)鍵基因的表達(dá)來(lái)調(diào)控花色素的積累。挖掘不同環(huán)境因子的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方式,分析環(huán)境對(duì)關(guān)鍵基因表達(dá)的影響及其與呈色物質(zhì)積累的關(guān)聯(lián)性,對(duì)觀賞植物栽培過(guò)程中環(huán)境因子的調(diào)控和觀賞植物觀賞價(jià)值的提高具有重要意義。

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    (責(zé)任編輯:黃克玲)

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