中圖分類號:S852.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1001-4330(2025)02-0502-08
0 引言
【研究意義】豬圓環(huán)病毒(Porcinecircovirus,PCV)是目前已知最小的DNA單股病毒,其直徑為 ,二十面體對稱結(jié)構(gòu),同時也是可以在哺乳動物細(xì)胞內(nèi)復(fù)制的最小DNA病毒之一。PCV2和PCV3病原已在全球流行,給養(yǎng)豬行業(yè)帶來經(jīng)濟(jì)損失?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】目前PCV分為4個基因型,分別是PCV1、PCV2和新發(fā)現(xiàn)的PCV3、PCV4。PCV1于1974年在豬腎細(xì)胞系PK15中發(fā)現(xiàn),無致病性[1]。PCV2在1998 年首次分離得到,是引起斷奶仔豬多系統(tǒng)衰竭綜合征的主要病原[2]。PCV3病毒可引起心臟和多系統(tǒng)炎癥、仔豬消瘦腹瀉及母豬繁殖障礙疾病等?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】PCV2感染豬后對機(jī)體獲得性免疫能力的建立影響重大,主要包括在全身性淋巴細(xì)胞衰竭和組織細(xì)胞浸潤增殖[3-7]。造肥淋巴器官的細(xì)胞凋亡,使宿主產(chǎn)生嚴(yán)重的免疫抑制效。豬只感染PCV3后會引起宿主細(xì)胞自噬、凋亡等,對先天免疫與炎癥反應(yīng)有一定影響,臨床表現(xiàn)為被毛粗亂、腹式呼吸、繁殖障礙疾病等。呼吸困難、體重減輕,個別豬只會出現(xiàn)腹瀉、黃疸等。目前新疆對PCV2和PCV3的研究較少,需闡明PCV2和PCV3在新疆的流行情況?!緮M解決的關(guān)鍵問題】研究采集7個規(guī)?;B(yǎng)豬場樣品檢測病原,調(diào)查PCV2和PCV3流行狀況,為PCV2和PCV3的防控和流行病學(xué)調(diào)查提供科學(xué)依據(jù)。
材料與方法
1.1 材料
1.1.1采樣
2022年10月至2023年9月,在新疆選取7個規(guī)?;B(yǎng)豬場,定期前往場區(qū)采集樣品,采集新生健康乳豬辜丸液樣品523份,健康豬精液樣品364份,病弱豬血清樣品208份(乳豬血清樣品31份、保育仔豬血清樣品69份,育肥豬血清樣品63份,妊娠母豬血清樣品45份),死亡豬組織樣品200份(心、肝、脾、腎、肺混樣),流產(chǎn)死胎樣品22份,病弱豬臍帶樣品86份,共計1403份樣品。表1
1. 1.2 儀器和耗材
儀器:全自動核酸提取儀(北京標(biāo)馳澤惠生物科技有限公司),組織研磨儀(析牛科技公司);離心機(jī)和移液槍(力辰儀器科技有限公司);熒光PCR儀(拓赫機(jī)電科技有限公司)。
耗材:移液槍頭(比克曼生物科技有限公司);快速磁珠法DNA/RNA提取試劑盒(北京標(biāo)馳澤惠生物科技有限公司); 2 . 0 m L EP管和1.5mLEP管(力辰儀器科技有限公司);八連排(愛思進(jìn)生物技術(shù)(杭州)有限公司);精液處理液(愛德士生物科技有限公司);PCV3型熒光PCR檢測試劑盒(內(nèi)蒙古金邁詩生物科技有限公司)。
1. 1.3 PCV2引物和探針設(shè)計
豬圓環(huán)2型病毒引物和探針根據(jù)GB/T35901 設(shè)計,探針及引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。表2
1. 1.4 PCV2標(biāo)準(zhǔn)品制備
所需標(biāo)準(zhǔn)品,據(jù)GenBank中公布的PCV2基因序列由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
1.1.5 PCV3引物、探針和標(biāo)準(zhǔn)品的來源
PCV3引物、探針和標(biāo)準(zhǔn)品均由內(nèi)蒙古金邁詩生物科技有限公司提供。
1.2 方法
1.2.1 試驗(yàn)設(shè)計
組織樣品、臍帶樣品、死胎樣品處理方式:每份樣品按 的重量剪取后放入 2 . 0 m L 無菌EP管中,加入適量滅菌生理鹽水,經(jīng)組織研磨儀研磨后放離心機(jī),
離心
,取上清液1 . 0 m L ,置于無菌 1 . 5 m L EP管中, - 2 0 % 冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
血清處理:全血常溫靜置,析出血清并轉(zhuǎn)移血清至 1 . 5 m L 無菌EP管內(nèi), 離心5m i n ,取血清上清液 1 . 0 m L 置于 1 . 5 m L 無菌EP中,標(biāo)記血清信息,放入
冰箱冷凍保存?zhèn)溆谩?/p>
精液處理:取 1 m L 精液樣本于 1 . 5 m L 的離心管中, 1 2 0 0 0 r / m i n 離心 4 m i n ,棄上清留沉淀,加入 4 0 0 μ L ReaL PCR 緩沖液(精液處理液)吹打混勻后 7 0 % 溫浴
離心 1 m i n ,取 4 0 0 μ L 澄清裂解液于管中 1 . 5 m L 的離心管中備用。標(biāo)記好樣品信息進(jìn)行檢測。
1. 2.2 核酸提取。
預(yù)封裝試劑準(zhǔn)備:從試劑盒中取出預(yù)封裝試劑,多次顛倒使融珠重懸,輕輕搖動孔板,使試劑和磁珠集中在孔板底部,小心撕去鋁箔封口膜,使用前請確認(rèn)板子方向。撕封口膜時避免振動,防止液體濺出。
自動化儀器提取步驟:在96孔板試劑的第1列和第7列(注意有效工作孔位)中加入 3 0 0 μ L 樣本(投入體積可兼容 1 0 0 ~ 4 0 0 μ L 。將96深孔板放入核酸提取儀中,裝上磁棒套,確認(rèn)磁棒套安裝到位,進(jìn)行自動化提取。自動化程序結(jié)束后,將第6列和12列孔中(注意有效工作孔位)的洗脫液轉(zhuǎn)移至干凈的離心管中;如不立刻使用,請將洗脫立物置于 - 2 0 % 保存。
1.2.3檢測
1.2.3.1 PCV2檢測
(1)將PremixExTaq、引物、探針(要注意通光放置)RNaseFree 和持檢測樣品已提取好的DNA,充分混后置于冰盒上待用。
(2)在 0 . 2 m L PCR八聯(lián)排中、Premix Ex Taq(ProbeqPCR)試劑盒說明書比例配制試劑。 2 × Premix E x Taq為 1 2 . 5 μ L ,分別為PCV2上游引物1 μ L 、PCV2下游引物 1 μ L 、PCV2探針 1 μ L 、RNase free 和總體積 2 4 μ L 。
(3)在上述(2)分裝好的反應(yīng)體系中加人2μ L 的樣品。
(4)將配制好的試劑,放入PCR儀中進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)條件: 5 0 % 預(yù)反應(yīng) 反應(yīng)10
,擴(kuò)增40個循環(huán),在
時收集熒光
(5)熒光定量PCR通道選擇:為FAM(PCV2)單通道。
(6)陽性:被檢樣品 C t 值 ? 3 5 并出現(xiàn)特異性擴(kuò)增曲線為陽性;可疑:被檢樣品 C t 值 gt; 3 5 并出現(xiàn)特異性擴(kuò)增曲線,判為可疑,需進(jìn)行復(fù)測;如仍是可疑則判為陽性。陰性:被檢樣品無 C t 值。對于某些未呈現(xiàn)S型曲線,但本底較高的樣品,應(yīng)判定為陰性。
1.2.3.2 PCV3檢測程序
(1)取出PCR反應(yīng)液A和PCR反應(yīng)液B,待其融化后,充分混勻、瞬時離心后放置于冰盒上備用。
(2)反應(yīng)體系配制:PCR反應(yīng)液A 2 . 0 μ L× ,PCR反應(yīng)液 B 2 1 . 0 μ L× ( n + 1 ) ,總體積為 2 3 . 0 μ L× ( n+ 1 ) 。
(3)根據(jù)待測樣品、陰性對照、陽性對照總數(shù)量,準(zhǔn)備 0 . 2 m L PCR八聯(lián)管,向每個管中加入23μ L PCR反應(yīng)體系。
(4)吸取上樣品核酸、陰性對照和陽性對照各 2 μ L ,加人對應(yīng) 0 . 2 m L PCR八聯(lián)反應(yīng)管中,蓋好管蓋轉(zhuǎn)移到擴(kuò)增區(qū)。
(5)反應(yīng)程序設(shè)定: 預(yù)反應(yīng)
反應(yīng)5s
,擴(kuò)增40個循環(huán),在 5 7 % 時收集熒光。
(6)熒光定量PCR通道選擇:為FAM(PCV3)單通道。
(7)結(jié)果判定:若待檢樣品的擴(kuò)增曲線呈標(biāo)準(zhǔn)S曲線,且 Ct 值 ? 3 5 ,則結(jié)果判定為陽性。若待檢樣品 C t 值 gt; 3 8 ,則結(jié)果判定為陰性。若待檢樣品 3 5 lt; C t 值 lt; 3 8 ,則結(jié)果判定為可疑,即該樣品需復(fù)檢。
1.3 數(shù)據(jù)處理
陽性樣品提交圣湘生物科技股份有限公司測序,樣品編號為 P C V 3- X J- 0 0 7 和PCV3-XJ-008。將測序結(jié)果在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行比對,將樣本序列與從GenBank數(shù)據(jù)庫中下載的參考序列進(jìn)行序列分析。使用MEGA7程序構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,使用Megaligement進(jìn)行同源性分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 不同場區(qū)PCV2和PCV3陽性率比較
研究表明,檢測的7個規(guī)?;B(yǎng)豬場均存在PCV2和PCV3感染。其中有45份樣品中檢出PCV2陽性,陽性率為 3 . 2 1 % ;有463份樣品中檢出PCV3陽性,陽性率為 3 3 . 0 0 % ;只有11份樣品同時檢測為PCV2和PCV3陽性,檢出率為0 . 7 8 % 。其中,C場陽性率最高,PCV2陽性率為7 . 4 6 % ,PCV3陽性率為 6 4 . 1 8 % (36/134),PCV2和PCV3混合感染率為 3 . 7 3 % ;F場陽性率最低,PCV3陽性率為 2 . 7 5 % (10/364),PCV2無檢出。PCV3在新疆規(guī)?;B(yǎng)豬場流行率遠(yuǎn)高于PCV2,且出現(xiàn)PCV2和PCV3混合感染。表3
2.2 不同類型樣品PCV2和PCV3陽性率比較
研究表明,在各類型樣品中,乳豬睪丸液樣品PCV2和PCV3陽性率最高,PCV2陽性率為4 . 7 8 % (25/523);PCV3陽性率為 5 7 . 3 6 % ( 523),PCV2和PCV3同時檢出的樣品有乳豬丸液(3. 7 3 % ,5/523)臍帶樣( 1 . 9 2 % ,3/86)組織樣 ( 1 . 7 5 % , 3 / 2 0 0 ) 。表4
2.3 不同階段豬群血清 P C V2 + P C V3 陽性率
研究表明,在208份血液樣品中,PCV2陽性檢出率最高的是乳豬血清 3 . 2 3 % (1/31);PCV3陽性檢出率最高的是乳豬血清 4 8 . 3 9 % (15/31)。僅1份乳豬血清同時檢出PCV2和PCV3,檢出率為 3 . 2 3 % 。表5
2.4 不同季度樣品PCV2和PCV3陽性率
研究表明,在1403份樣品中,第1季度檢測252份樣品,第2季度檢測486份,第3季度檢測501份,第4季度檢測164份。PCV2陽性率從高到低依次是第4季度 5 . 4 9 % (9/164)第1季度4 . 3 7 % (11/252)第2季度 2 . 6 7 % (13/486)第3季度2. 4 0 % (12/501);PCV3陽性率從高到低依次是第3季度 3 6 . 3 3 % (182/501)、第2季度3 3 . 9 5 % (165/486)第1季度 2 8 . 1 7 % (71/252)、第4季度 2 7 . 4 4 % (45/164)。PCV3在1年4季的檢出率均較高。表6
2.5 基因序列的比較
研究表明, P C V 3- X J- 0 0 7 與參考序列之間的同源性最高的為福建KP1株(MF589111.1)9 9 . 7 % ,與參考序列之間的同源性最低的是新疆株、廣西株為 9 8 . 3 % 。 P C V 3- X J- 0 0 8 與參考序列之間的同源性最高的為江西S1株(MF589133)9 9 . 4 % 。與參考序列之間的同源性最低的是江西62株(KY075989)為 9 8 . 8 % 。圖1
2.6 PCV3ORF2基因遺傳進(jìn)化
研究表明, 與福建株MF589111和福建株MF589108屬于同一分支,為PCV3c型毒株。PCV3-XJ-008 與江西株MF589133和江西株MF589107屬于同一分支,為PCV3b型毒株。
3討論
3.1PCV2感染后會影響仔豬生,引起母豬繁豬障礙,且保育豬和生長育肥豬會出現(xiàn)體型消瘦和咳嗽、打噴嚏等呼吸系統(tǒng)疾病2]。PhanTG等[3]報道了PCV3在患病母豬中檢出。PCV3可以引起多系統(tǒng)炎癥綜合征、繁殖障礙疾病、豬皮炎與腎病綜合征以及亞臨床感染,影響豬群健康狀態(tài),但不會表現(xiàn)出明顯的臨床癥狀。
3.2回衛(wèi)榮等報道顯示,2015至2019年河北省PCV2的感染率為 4 4 . 0 8 % ~ 8 6 . 8 9 % ,PCV3陽性率為 2 5 . 6 % ,而PCV2和PCV3混合感染率為1 2 . 1 % 。甘雨等[10]報道,在1408份樣品中,PCV2陽性率為 5 1 . 9 2 % (731/1408),PCV3陽性率為3 3 . 4 5 % (471/1408),PCV2和PCV混合感染率2 5 . 0 7 % (353/1408)。鐘順平等[1研究表明,在
2019年云南省勐臘縣PCV2陽性檢出率為 3 6 . 0 5 % (31/86),PCV3陽性檢出率 1 7 . 4 4 % (15/86),PCV2和PCV3混合感染率為15. 12 % (13/86)。顏友榮等[調(diào)查表明,蘇中地區(qū)PCV2陽性率為 1 0 . 7 % (39/363)。陳翔鴻等[3調(diào)查表明,2019年至2020年我國中南地區(qū)豬場中豬PCV2陽性率為 3 6 . 0 8 % (616/1707)。黃正波等[14]研究表明,2021年東北地區(qū)PCV2陽性率為 1 9 . 0 0 % (38/200)。高詩敏等[15]對2019年山西省PCV3 陽性率調(diào)查結(jié)果顯示,陽性率為 8 5 . 2 2 % (444/521)。劉文波等[在2020至2022年廣西豬圓環(huán)病毒3型調(diào)查發(fā)現(xiàn),樣品陽性率為 1 7 . 8 3 % ( 4 1 / 2 3 0 ) 。黃夢杰等[17對2021至2022年山東省1040份樣品檢測。結(jié)果顯示PCV3檢出率為 2 . 3 % (24/1040),不同季節(jié)和階段均可檢出。劉東旭等[18]在吉林省研究調(diào)查表明PCV3陽性率為 3 4 . 2 % ( 2 4 1 / 7 0 4 ) 。李蕊等[9]對北京市的調(diào)查研究顯示PCV3總體陽性率為 1 . 0 % (12/1177)。李靜等[20在2019年9月至2020年12月期間對新疆阿克蘇地區(qū)、巴音郭楞蒙古自治州、伊犁哈薩克自治州等6個地區(qū)PCV3陽性率研究表明,北部地區(qū)PCV3平均陽性率為 1 4 . 5 % ( 6 5 / 449)。袁科等21報道,在2021年10月至2022年7月新疆北部地區(qū)PCV3陽性率為 2 4 . 1 5 % (107/443),且不同階段豬群均可感染。莫紹江等[22]調(diào)查表明,阿克蘇部分地區(qū)PCV3陽性率為 7 . 5 3 % (44/584)。
3.3研究表明,新疆PCV2總體陽性率 3 . 2 0 % ,低于蘇中地區(qū)的 1 0 . 7 % ;低于中南地區(qū)的 3 6 . 0 8 % ;低于東北地區(qū)的 1 9 . 0 0 % ;整體陽性率處于全國較低水平,PCV3總體陽性率為 3 3 . 0 % (463/1403),高于李靜等( 1 4 . 5 % )、袁科等( 2 4 . 1 5 % )和莫紹江等( 的研究結(jié)果,相較于山西低5 2 . 2 2 % ;比山東高 3 0 . 7 % ;比北京高 3 2 . 0 0 % ;比廣西高 1 5 . 1 7 % ,與甘雨等[10]( 3 3 . 4 5 % ,471/1408)和劉旭東等[18]( 3 4 . 2 % 2 4 1 / 7 0 4 )研究結(jié)果相接近。PCV2和PCV3混合感染率( 7 . 8 4 % )低于河北0 1 2 . 1 % )、云南( 1 5 . 1 2 % )混合感染率。目前尚無一款商品化PCV3疫苗,解除PCV2感染造肥的機(jī)體免疫抑制,增強(qiáng)自身健康情況,降低PCV3感染風(fēng)險[23],減少PCV2和PCV3混合感染率。
4結(jié)論
目前,在新疆PCV2陽性率為 3 . 2 0 % ( 4 5 / 1403),PCV3流行率達(dá) 3 3 . 0 0 % (463/1403),
PCV2和PCV3混合感染率為 7 . 8 4 % (11/1403)。C 場PCV2和PCV3陽性檢出率最高,PCV2為7 . 4 6 % (10/134),PCV3為 6 4 . 1 8 % (36/134),PCV2和PCV3混合感染率為 3 . 7 3 % (5/134)。新生乳豬睪丸檢出PCV2和PCV3陽性率最高,PCV2陽性率為 4 . 7 8 % (25/523);PCV3檢出率為5 7 . 3 6 % (300/523)。PCV2和PCV3不僅可以感染不同階段的豬只,而且一年四季感染率較高。新疆部分地區(qū),PCV2感染率處在全國低等水平,PCV3感染率處于全國中等水平,且新疆部分地區(qū)PCV3流行毒株為PCV3b和PCV3c型。
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Monitoring of Porcine circovirus (PCV) types 2 and 3 in some large - scale pig farms in Xinjiang
QI Weiyi1,XU Heng2,LIU Yingyu1,ZHENG XIA Lining',LIU Junfei2
(1. College of Animal Medicine, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830o52,China; 2. Xinjiang Tekon Animal Husbandry Science and Technology Co. Ltd. ,Changji Xinjiang 8311oo, China)
Abstract:【Objective】 To investigate the prevalence of Porcine circovirus type 2(PCV2) and Porcine circovirus type 3(PCV3)in Xinjiang.【Methods】From October 2022 to September 2023,1403 samples from 7 large- scale pig farms were detected and sequenced by fluorescent quantitative PCR. 【Results】The overall positive rate of PCV2 was 3 , 2 0 % (45/1403),the overall positive rate of PCV3 was 3 3 . 0 0 % (463/ 1403),and the combined infection rate of PCV2 and PCV3 was 7 . 8 4 % (11/1403). The positive detection rate of PCV2 and PCV3 in C field was the highest,with PCV2 7 . 4 6 % (10/134),PCV3 64.18%(36/134), and PCV2 and PCV3 mixed infection rate 3 . 7 3 % (5/134). The positive rate of PCV2 and PCV3 was the highest,and the positive rate of PCV2 was 4 . 7 8 % (25/523). The detection rate of PCV3 was 57.36%(300/ 523).The detection rates of PCV2 and PCV3 were high in allseasons,and the PCV3 strain was PCV3b and PCV3c.【Conclusion】PCV3 infection has been found in some large - scale pig farms in Xinjiang and the prevalence rate of PCV3 is much higher than that of PCV2,and PCV3 strain is PCV3b and PCV3c.
Key words:Porcine circovirus type 3; Porcine circovirus type 2; fluorescent quantitative PCR; pig