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    基于CNN和Transformer的綠豆干旱脅迫識(shí)別模型

    2025-03-04 00:00:00蔣東山劉金洋張浩淼李士叢羅仔秋余驥遠(yuǎn)李潔陳新袁星星高尚兵

    收稿日期:2024-04-07

    基金項(xiàng)目:國(guó)家食用豆產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系崗位科學(xué)家項(xiàng)目(CARS-09-G13);江蘇省種業(yè)揭榜掛帥項(xiàng)目[JBGS(2021)004];江蘇省研究生實(shí)踐創(chuàng)新計(jì)劃項(xiàng)目(SJCX24_2146)

    作者簡(jiǎn)介:蔣東山(1998-),男,江蘇南京人,碩士,研究方向?yàn)樯疃葘W(xué)習(xí)、計(jì)算機(jī)視覺。(E-mail)dongshanJiang2022@163.com。劉金洋為共同第一作者。

    通訊作者:高尚兵,(E-mail)11060036@hyit.edu.cn;袁星星,(E-mail)20090049@jaas.ac.cn

    摘要:為了解決傳統(tǒng)綠豆干旱脅迫識(shí)別方法存在識(shí)別率低、時(shí)效性差的問題,本研究建立了基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)和轉(zhuǎn)換器(Transformer)的綠豆干旱脅迫識(shí)別模型Mungbean-droughtNet。該模型采用雙分支結(jié)構(gòu),利用全局特征提取模塊(GFEM)分支和局部特征提取模塊(LFEM)分支分別從輸入圖像提取局部特征和全局特征。最后利用多層感知器(MLP)模塊將局部特征和全局特征進(jìn)行融合,實(shí)現(xiàn)分類。在實(shí)際數(shù)據(jù)分析中,共采集14536張干旱脅迫下的綠豆葉綠素?zé)晒鈭D像,分為HR、R、MR、S、HS和對(duì)照6類。利用Mungbean-droughtNet模型對(duì)葉綠素?zé)晒鈭D像數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析,結(jié)果表明,Mungbean-droughtNet模型對(duì)測(cè)試集中葉綠素?zé)晒鈭D像的平均識(shí)別準(zhǔn)確率為95.57%,平均精度為98.18%,平均召回率為98.40%,平均F1分?jǐn)?shù)為98.28%。和目前先進(jìn)模型EfficientNetV2和SwinTransformer相比,Mungbean-droughtNet模型準(zhǔn)確率分別提高了3.56個(gè)百分點(diǎn)和2.62個(gè)百分點(diǎn),表現(xiàn)出更強(qiáng)的魯棒性和更好的識(shí)別效果。本研究結(jié)果為綠豆干旱脅迫研究和耐旱基因挖掘提供了基礎(chǔ)。

    關(guān)鍵詞:綠豆;干旱脅迫;卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò);轉(zhuǎn)換器;圖像識(shí)別;葉綠素?zé)晒鈭D像

    中圖分類號(hào):S522文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A文章編號(hào):1000-4440(2025)01-0087-14

    DroughtstressrecognitionmodelofmungbeanbasedonCNNandTransformer

    JIANGDongshan1,2,3,LIUJinyang2,3,ZHANGHaomiao1,2,LIShicong2,LUOZaiqiu1,YUJiyuan1,2,LIJie1,2,CHENXin2,YUANXingxing2,4,GAOShangbing1,4

    (1.FacultyofComputerandSoftwareEngineering,HuaiyinInstituteofTechnology,Huai’an223003,China;2.InstituteofEconomicCrops,JiangsuAcademyofAgriculturalSciences,Nanjing210014,China)

    Abstract:Toaddresstheissuesoflowrecognitionrateandpoortimelinessintraditionalmethodsforidentifyingdroughtstressinmungbeans,thisstudyestablishedamungbeandroughtstressrecognitionmodelnamedMungbean-droughtNetbasedonconvolutionalneuralnetwork(CNN)andtransformer.Themodelemployedadual-branchstructure,utilizedtheglobalfeatureextractionmodule(GFEM)branchandthelocalfeatureextractionmodule(LFEM)branchtoextractlocalandglobalfeaturesfromtheinputimages,respectively.Finally,multilayerperceptron(MLP)modulewasusedtofusethelocalandglobalfeaturesforclassification.Intheactualdataanalysis,atotalof14536chlorophyllfluorescenceimagesofmungbeansunderdroughtstresswerecollectedandclassifiedintosixcategories,includingHR,R,MR,S,HSandthecontrolgroup.TheMungbean-droughtNetmodelwasappliedtoanalyzethechlorophyllfluorescenceimagedataset,theresultsshowedthattheMungbean-droughtNetmodelachievedanaveragerecognitionaccuracyof95.57%,anaverageprecisionof98.18%,anaveragerecallratioof98.40%,andanaverageF1-scoreof98.28%forthechlorophyllfluorescenceimagesinthetestset.ComparedwiththecurrentadvancedmodelsEfficientNetV2andSwinTransformer,theaccuracyoftheMungbean-droughtNetmodelincreasedby3.56percentagepointsand2.62percentagepoints,respectively,demonstratingstrongerrobustnessandbetterrecognitionperformance.Thisstudyprovidesafoundationforresearchonmungbeandroughtstressandtheexcavationofdrought-resistantgenes.

    Keywords:mungbean;droughtstress;convolutionalneuralnetwork;transformer;imagerecognition;chlorophyllfluorescenceimage

    綠豆[Vignaradiata(L.)Wilczek]屬豆科豇豆屬一年生直立草本植物,在中國(guó)有2000多年的栽培史,是重要的雜糧作物[1]。綠豆富含維生素、礦物質(zhì)和活性物質(zhì),具有抗菌、抗腫瘤、降血壓和解毒等作用,屬于藥食同源作物[2]。然而,在中國(guó)北方干旱半干旱區(qū),綠豆栽培區(qū)常受到干旱的影響,干旱已成為綠豆生長(zhǎng)過(guò)程中的主要非生物脅迫。研究結(jié)果表明,中國(guó)每年因干旱造成的損失約占各類自然災(zāi)害損失總額的70%,直接經(jīng)濟(jì)損失占國(guó)民生產(chǎn)總值的3%~6%[3-4]。目前,傳統(tǒng)的干旱診斷方法如土壤水分監(jiān)測(cè)和農(nóng)業(yè)氣象預(yù)報(bào)等,主要基于對(duì)土壤和氣象的間接監(jiān)測(cè),易出現(xiàn)準(zhǔn)確性低和滯后問題[5]。此類方法往往依賴專家經(jīng)驗(yàn),難以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化和智能化,因而在大規(guī)模監(jiān)測(cè)和應(yīng)用中受到限制。葉綠素?zé)晒鈪?shù)作為植物響應(yīng)環(huán)境變化的內(nèi)在指標(biāo),被廣泛用于植物逆境脅迫的研究,通過(guò)分析葉綠素?zé)晒鈪?shù)的變化評(píng)估植物干旱脅迫狀態(tài)是一種可靠的方法[6]。

    為解決傳統(tǒng)方法識(shí)別準(zhǔn)確率低、時(shí)效性差等問題,國(guó)內(nèi)外學(xué)者將機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)引入生物和非生物脅迫識(shí)別中。岳煥然等[7]提取了不同干旱脅迫狀態(tài)的玉米圖像的顏色和紋理特征,并利用BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對(duì)玉米干旱脅迫狀態(tài)進(jìn)行識(shí)別,研究結(jié)果表明,該模型對(duì)玉米干旱脅迫狀態(tài)的識(shí)別準(zhǔn)確率均超過(guò)90%。Naik等[8]分別將10種機(jī)器學(xué)習(xí)方法用于大豆缺鐵黃化病的識(shí)別,結(jié)果表明,模型的平均識(shí)別精度為96%。龍燕等[9]結(jié)合狄利克雷分布(LDA)、支持向量機(jī)(SVM)和K近鄰(KNN)算法,以及葉綠素?zé)晒鈪?shù)和熒光圖像特征,構(gòu)建番茄苗期干旱脅迫狀態(tài)識(shí)別模型,結(jié)果表明其識(shí)別準(zhǔn)確率可達(dá)97.8%。Zhou等[10]將葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)和支持向量機(jī)(SVM)、徑向基函數(shù)(RBF)、BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等學(xué)習(xí)方法相結(jié)合,成功識(shí)別植物體內(nèi)水分含量和氮素水平。

    盡管機(jī)器學(xué)習(xí)算法在分析生物和非生物脅迫的研究中取得了顯著成果,但其仍存在無(wú)法自動(dòng)提取特征及難以處理海量圖像的問題[11]。隨著計(jì)算機(jī)視覺技術(shù)的發(fā)展,為解決圖像特征自動(dòng)提取和海量圖像處理的難題,人們開始尋求精度更高、更自動(dòng)化的圖像識(shí)別技術(shù)用于干旱診斷。以卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)為代表的深度學(xué)習(xí)技術(shù),因其卓越的圖像識(shí)別能力和分辨能力,已被廣泛用于產(chǎn)量估算[12]、病蟲害檢測(cè)[13-15]、作物品種分類[16]等多個(gè)領(lǐng)域。近年來(lái),CNN在生物和非生物脅迫診斷中被廣泛應(yīng)用[17]。趙奇慧等[18]采集了共2000張番茄葉片圖像,利用MaskR-CNN進(jìn)行葉片分割,結(jié)合DenseNet169網(wǎng)絡(luò)對(duì)番茄干旱脅迫狀態(tài)進(jìn)行識(shí)別,研究結(jié)果表明,該模型在測(cè)試集上的識(shí)別準(zhǔn)確率高達(dá)94.68%。利用AlexNet、GoogLeNet和InceptionV3模型對(duì)玉米、秋葵和大豆的干旱脅迫狀況進(jìn)行識(shí)別,研究結(jié)果表明,GoogLeNet模型的準(zhǔn)確率最高[19-20]。劉芳軍等[21]提出了一種基于改進(jìn)ResNet18模型的胡麻干旱脅迫狀態(tài)識(shí)別方法,該方法識(shí)別準(zhǔn)確率高達(dá)98.67%,且能夠滿足在嵌入式設(shè)備上實(shí)時(shí)檢測(cè)的要求。Xia等[22]發(fā)現(xiàn),在識(shí)別番茄光譜數(shù)據(jù)方面,多層感知器分類器(MLPC)算法和一對(duì)多分類器(ORC)算法的性能優(yōu)于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法。Kuo等[23]提出了1D-ResGC-Net模型,其中包含殘差全局上下文(ResGC)模塊,用于處理番茄葉片的可見光和近紅外光譜數(shù)據(jù),從而實(shí)現(xiàn)對(duì)番茄干旱脅迫的早期識(shí)別。

    干旱脅迫會(huì)影響植物的光合作用,因此可以利用葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)檢測(cè)植物的光合作用,從而評(píng)估植物的干旱脅迫狀態(tài)。研究結(jié)果表明,最大光量子效率(Fv/Fm)與植物的光合作用密切相關(guān),是植物響應(yīng)干旱脅迫的重要參數(shù)[24-31]。Bresson等[32]研究發(fā)現(xiàn),在干旱脅迫的第14d,轉(zhuǎn)基因植株葉片與野生型植株葉片的Fv/Fm值差異顯著。而且,F(xiàn)v/Fm參數(shù)還與植株在干旱條件下的生存率有關(guān)。梁歡等[33]使用葉綠素?zé)晒鈪?shù)對(duì)不同品種的紫花苜蓿幼苗的抗旱性進(jìn)行了比較,在109份紫花苜蓿中,篩選出了14份抗旱性強(qiáng)且光合效率高的種質(zhì)。

    綜上所述,深度學(xué)習(xí)技術(shù)結(jié)合葉綠素?zé)晒鈭D像能夠準(zhǔn)確反映葉片光合特征的時(shí)空異質(zhì)性,從而有效鑒定綠豆的抗旱性,同時(shí)還能及時(shí)準(zhǔn)確地識(shí)別出綠豆受到的干旱脅迫程度,為采取措施緩解旱情提供依據(jù)。目前,對(duì)綠豆的研究主要集中在病蟲害防治及產(chǎn)量提升等方面[34-36],而結(jié)合深度學(xué)習(xí)技術(shù)和葉綠素?zé)晒鈭D像鑒定綠豆干旱脅迫狀態(tài)的研究較少。本研究擬以230份綠豆種質(zhì)資源為試驗(yàn)材料,構(gòu)建數(shù)據(jù)集,設(shè)計(jì)一種準(zhǔn)確率高、時(shí)效性強(qiáng)的綠豆干旱脅迫識(shí)別網(wǎng)絡(luò)模型,為監(jiān)測(cè)綠豆生長(zhǎng)發(fā)育情況和綠豆品種選育提供有效工具。

    1材料與方法

    1.1試驗(yàn)設(shè)計(jì)

    試驗(yàn)所用綠豆種質(zhì)資源來(lái)源于江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所豆類研究室。2023年10月至11月,在江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所智能溫室中對(duì)230份綠豆種質(zhì)資源進(jìn)行干旱脅迫處理。有研究結(jié)果表明,利用高含量的聚乙二醇6000(≥20%)模擬干旱脅迫,植物的光合作用會(huì)受到影響[37-38]。具體步驟如下:選取無(wú)破損、大小一致、飽滿的綠豆種子,用20%過(guò)氧化氫溶液對(duì)綠豆種子進(jìn)行消毒;將種子播種于10cm×10cm的塑料盆中,適量澆水并記錄發(fā)芽情況;待水培至第5d,綠豆種子長(zhǎng)出新葉,將40mL20%的聚乙二醇6000溶液加入培養(yǎng)液中,觀察綠豆幼苗的生長(zhǎng)情況。另設(shè)對(duì)照,在培養(yǎng)液中加入40mL水。在干旱脅迫處理的第5d,每份綠豆種質(zhì)資源的干旱脅迫處理和對(duì)照各取3株幼苗,置于葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)(FluorCam)的置物臺(tái)上。通過(guò)FluorCam7軟件進(jìn)行葉綠素?zé)晒鈭D像的采集和數(shù)據(jù)分析。

    1.2數(shù)據(jù)預(yù)處理

    利用FluorCam7.0軟件對(duì)采集到的熒光圖像進(jìn)行預(yù)處理,包括感興趣區(qū)域選擇(ROI)、背景分割、閾值設(shè)定、圖像裁剪與歸一化處理等。通過(guò)感興趣區(qū)域選擇提取圖像的關(guān)鍵特征,減少無(wú)關(guān)信息的干擾。為葉綠素?zé)晒鈪?shù)(Fv/Fm)設(shè)定1個(gè)閾值區(qū)間,保留處于區(qū)間內(nèi)的像素點(diǎn)。將葉綠素?zé)晒鈭D像裁剪為224×224像素,并進(jìn)行歸一化處理[39]。預(yù)處理后的圖像數(shù)據(jù)集按照8∶1∶1的數(shù)量比例劃分為訓(xùn)練集、驗(yàn)證集和測(cè)試集。

    1.3干旱脅迫等級(jí)劃分

    干旱脅迫對(duì)抗旱能力較強(qiáng)的綠豆品種的影響較小,抗旱能力較強(qiáng)的綠豆品種適應(yīng)性和耐受力較強(qiáng)。最大光量子效率(Fv/Fm)可以間接評(píng)估綠豆對(duì)干旱脅迫的響應(yīng)程度,F(xiàn)v/Fm值越小表示綠豆抗旱性越弱,干旱對(duì)植物的影響越大。通過(guò)分析綠豆幼苗的葉綠素?zé)晒鈭D片,可以鑒定綠豆的抗旱能力,從而確定綠豆受到的干旱脅迫等級(jí),并篩選出抗旱的種質(zhì)資源。本研究基于最大光化學(xué)效率Fv/Fm值,結(jié)合文獻(xiàn)[40]中的分級(jí)方法,評(píng)估綠豆抗旱性,并進(jìn)行相應(yīng)的脅迫等級(jí)劃分,具體分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)如表1所示,不同抗旱性的葉綠素?zé)晒鈭D像如圖1所示。

    1.4數(shù)據(jù)增強(qiáng)

    在深度學(xué)習(xí)中,增加樣本數(shù)量能夠提升模型效果,增強(qiáng)模型的泛化能力。因此,為了提高模型的泛化能力和魯棒性,本研究采用數(shù)據(jù)增強(qiáng)技術(shù)[41]對(duì)數(shù)據(jù)集進(jìn)行擴(kuò)充。數(shù)據(jù)增強(qiáng)技術(shù)包括平移和翻轉(zhuǎn)、裁剪和縮放、添加噪聲點(diǎn)、添加遮罩、二值化[42]。如表2所示,經(jīng)過(guò)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后的數(shù)據(jù)集包含14536張圖片,其中訓(xùn)練集有11630張圖片,驗(yàn)證集有1453張圖片,測(cè)試集有1453張圖片。數(shù)據(jù)增強(qiáng)后的葉綠素?zé)晒鈭D像如圖2所示。

    如圖3所示,在原始數(shù)據(jù)集中,抗旱性極強(qiáng)(HR)的綠豆圖像有156張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到1092張;在原始數(shù)據(jù)集中,抗旱性強(qiáng)(R)的綠豆圖像有561張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到3928張;原始數(shù)據(jù)集中抗旱性中等(MR)的綠豆圖像有530張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到3711張;在原始數(shù)據(jù)集中,抗旱性弱(S)的綠豆圖像有250張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到1751張圖像;在原始數(shù)據(jù)集中,抗旱性極弱(HS)的綠豆圖像有156張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到1085張圖像;在原始數(shù)據(jù)集中,無(wú)干旱脅迫對(duì)照的綠豆圖像有424張,經(jīng)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后,圖像數(shù)量增加到2969張圖像。

    1.5Mungbean-droughtNet模型框架

    采用Mungbean-droughtNet模型對(duì)數(shù)據(jù)增強(qiáng)后的葉綠素?zé)晒鈭D像進(jìn)行特征提取和識(shí)別。Mungbean-droughtNet模型結(jié)構(gòu)如圖4所示,該模型為雙分支結(jié)構(gòu),包括全局特征提取模塊(Globalfeatureextractionmodule,GFEM)分支和局部特征提取模塊(Localfeatureextractionmodule,LFEM)分支。LFEM分支包括A模塊、B模塊和可分離卷積等;GFEM模塊包括殘差模塊、全局到局部的裂變和聚合(Global-to-localaggregationandfission,GLAF)模塊和視覺轉(zhuǎn)換器(Visiontransformer)模塊;MLP模塊包括2個(gè)全連接層和1個(gè)Tanh激活函數(shù)。上述2個(gè)分支分別對(duì)同一圖像進(jìn)行全局特征提取和局部特征提取,從而更好地捕捉上下文信息。最后使用MLP模塊進(jìn)行特征融合并分類。

    LFEM分支包含4個(gè)A模塊和11個(gè)B模塊,主要用于葉綠素?zé)晒鈭D像的局部特征提取。A模塊的主要功能是降低特征圖的空間維度,同時(shí)采用可分離卷積將普通卷積分解為深度卷積和逐點(diǎn)卷積,這樣可以在保證特征提取能力的同時(shí),顯著減少模型的參數(shù)量。B模塊通過(guò)聚焦更多有用信息從而優(yōu)化特征。LFEM分支采用不同模塊串聯(lián)堆疊的方式,這種設(shè)計(jì)既能有效降低參數(shù)量,又保證了模型能夠提取葉綠素?zé)晒鈭D像中的細(xì)微特征。

    GFEM分支主要由殘差模塊、GLAF模塊以及Visiontransfomer模塊構(gòu)成。初始卷積核對(duì)輸入圖像進(jìn)行初步特征提取,并通過(guò)下采樣降低特征圖的維度。在GFEM中,共有2個(gè)殘差模塊,每個(gè)殘差模塊均由2個(gè)1×1卷積核和1個(gè)3×3的卷積核串聯(lián)組成。在第1個(gè)殘差模塊中,第1層和第2層卷積核的數(shù)量均為64個(gè),而第3層卷積核的數(shù)量為256個(gè);第2個(gè)殘差模塊各層卷積核數(shù)量為第1個(gè)殘差模塊的2倍。引入2個(gè)殘差模塊有助于充分利用網(wǎng)絡(luò)的深度,讓模型能夠?qū)W習(xí)更多復(fù)雜的葉綠素?zé)晒鈭D像特征,從而提高模型的性能。GLAF模塊通過(guò)整合不同通道的注意力特征,增強(qiáng)了信息交互能力。經(jīng)過(guò)GLAF模塊整合后的注意力特征再通過(guò)Visiontransformer模塊進(jìn)行處理,進(jìn)一步提取全局特征。綜上,GFEM分支先利用殘差模塊增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)深度,然后通過(guò)GLAF模塊整合不同通道的注意力特征,最后利用Visiontransformer模塊進(jìn)一步關(guān)注圖像的關(guān)鍵特征,這種結(jié)構(gòu)可以從時(shí)間和空間維度上增強(qiáng)模型交互能力,從而提升對(duì)葉綠素?zé)晒鈭D像的處理效果。

    在分支的末端,將GFEM模塊提取到的192維全局特征與LFEM模塊提取到的2048維局部特征進(jìn)行融合,得到2240維的完整特征向量。接著,利用包含2個(gè)全連接層和1個(gè)Tanh激活函數(shù)的MLP分類模塊不斷調(diào)整權(quán)重和閾值,使Mungbean-droughtNet模型能夠從葉綠素?zé)晒鈭D像中提取更多差異性特征,從而提升網(wǎng)絡(luò)性能。

    1.5.1殘差連接由于深度網(wǎng)絡(luò)容易出現(xiàn)梯度消失和梯度爆炸等問題,因此采用殘差連接來(lái)加深網(wǎng)絡(luò)深度,提升模型的性能。殘差連接的核心思想是在網(wǎng)絡(luò)的某些層中,將輸入信號(hào)直接連接到輸出,從而實(shí)現(xiàn)跳躍連接。跳躍連接可以加速模型的訓(xùn)練,從而降低訓(xùn)練難度。其結(jié)構(gòu)圖如圖5所示,計(jì)算公式如下:

    Xl+1=X+F(X)(1)

    式中,X表示前一層的輸入信號(hào),Xl+1表示當(dāng)前層的特征映射。

    1.5.2全局到局部的裂變和聚合(GLAF)模塊如圖6所示,在GLAF模塊中,特征向量首先經(jīng)過(guò)2個(gè)3×3的卷積層處理,得到低層的特征映射。然后采用雙分支結(jié)構(gòu)分別提取局部注意力特征和全局注意力特征。其中,全局平均池化層用于去除多余的空間信息,保留全部的全局注意力特征,點(diǎn)卷積則用于降低特征圖的維度。最后,引入非線性激活函數(shù)Sigmoid,增強(qiáng)網(wǎng)絡(luò)的表達(dá)能力。

    1.5.3視覺轉(zhuǎn)換器模塊為了彌補(bǔ)卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)只能關(guān)注局部特征的不足,在Mungbean-droughtNet模型中引入視覺轉(zhuǎn)換器(Visiontransformer)模塊對(duì)綠豆葉綠素?zé)晒鈭D像進(jìn)行全局特征提取。如圖7所示,Visiontransformer模塊主要包括切片編碼層、轉(zhuǎn)換器(Transformer)模塊以及多層感知器(MLP)模塊。首先,切片編碼層將輸入圖像分割成多個(gè)切片。然后,將展平后的多個(gè)切片經(jīng)過(guò)特征映射,得到多個(gè)token編碼,并與位置編碼進(jìn)行拼接,從而將局部特征信息轉(zhuǎn)化為全局特征信息,輸入到Transformer模塊中。最后,將編碼后的結(jié)果傳入Transformer模塊進(jìn)行進(jìn)一步處理。

    2結(jié)果與分析

    2.1試驗(yàn)環(huán)境

    為了驗(yàn)證Mungbean-droughtNet模型對(duì)不同綠豆干旱脅迫等級(jí)圖像的識(shí)別能力,本研究在pytorch2.0.1框架上,使用制作的綠豆葉綠素?zé)晒鈭D像數(shù)據(jù)集進(jìn)行試驗(yàn)。試驗(yàn)平臺(tái)的軟硬件信息如表3所示。

    2.2試驗(yàn)參數(shù)與訓(xùn)練策略

    根據(jù)綠豆在不同干旱脅迫下的熒光特征調(diào)整Mungbean-droughtNet模型的訓(xùn)練參數(shù),以此確保試驗(yàn)結(jié)論的可靠性和真實(shí)性。在試驗(yàn)過(guò)程中,使用Adam優(yōu)化器更新網(wǎng)絡(luò)的權(quán)重,最小化損失函數(shù)。選擇交叉熵?fù)p失函數(shù)來(lái)衡量模型預(yù)測(cè)結(jié)果與真實(shí)標(biāo)簽之間的差異,學(xué)習(xí)率設(shè)置為0.0001,批量大?。˙atchsize)為16,最大迭代次數(shù)為300。

    2.3評(píng)價(jià)指標(biāo)

    本研究使用多個(gè)常用的評(píng)價(jià)指標(biāo)來(lái)衡量Mungbean-droughtNet模型的識(shí)別性能,包括準(zhǔn)確率(Accuracy)、精度(Precision)、召回率(Recall)和F1分?jǐn)?shù)(F1-score)。準(zhǔn)確率為模型正確識(shí)別的樣本數(shù)占總樣本數(shù)的比例。精度為模型識(shí)別的正樣本中,實(shí)際正樣本的占比。召回率為實(shí)際正樣本中,模型正確識(shí)別的正樣本的占比。F1分?jǐn)?shù)綜合考慮了精度和召回率的表現(xiàn),其計(jì)算方法如公式(2)~(5)所示。

    此外,為了更加直觀地展示模型對(duì)各個(gè)類別圖像的識(shí)別準(zhǔn)確性,本研究采用了混淆矩陣?;煜仃嚨男斜硎绢A(yù)測(cè)的抗旱等級(jí),列表示實(shí)際的抗旱等級(jí),主對(duì)角線上的數(shù)值表示該模型對(duì)該類別圖像的識(shí)別精度。主對(duì)角線上的數(shù)值越大,表明模型對(duì)該類別圖像的識(shí)別精度越高。

    Accuracy=TP+TNTP+TN+FP+FN(2)

    Precision=TPTP+FP(3)

    Recall=TPTP+FN(4)

    F1-score=2×Precision×RecallPrecision+Recall(5)

    式(2)~式(5)中,TP表示正樣本被正確識(shí)別的數(shù)量;FP表示負(fù)樣本被錯(cuò)誤識(shí)別為正樣本的數(shù)量;FN表示正樣本被錯(cuò)誤識(shí)別為負(fù)樣本的數(shù)量;TN表示負(fù)樣本被正確識(shí)別的數(shù)量。

    2.4Mungbean-droughtNet識(shí)別性能

    在綠豆葉綠素?zé)晒鈭D像數(shù)據(jù)集上驗(yàn)證Mungbean-droughtNet模型的有效性和適應(yīng)性。如表4所示,在驗(yàn)證集上,Mungbean-droughtNet模型的平均精度為97.60%,平均召回率為96.58%,平均F1分?jǐn)?shù)為97.60%。如表5所示,在測(cè)試集上,Mungbean-droughtNet模型的平均精度為98.18%,平均召回率為98.40%,平均F1分?jǐn)?shù)為98.28%,通過(guò)對(duì)比分析,可以發(fā)現(xiàn)Mungbean-droughtNet模型在驗(yàn)證集和測(cè)試集上的總體性能差異不大,表明Mungbean-droughtNet具有良好的泛化性能。同時(shí)使用混淆矩陣對(duì)Mungbean-droughtNet模型在驗(yàn)證集上每種抗旱等級(jí)的識(shí)別結(jié)果進(jìn)行可視化分析。如圖8所示,混淆矩陣的主對(duì)角線值都達(dá)到了最大,且在抗旱性極弱(HS)和對(duì)照上的識(shí)別精度都達(dá)到了100%,這表明Mungbean-droughtNet模型具有良好的識(shí)別性能。

    Mungbean-droughtNet模型的參數(shù)量為107.04M,計(jì)算復(fù)雜度為9.27GMac(Mac表示乘積累加操作數(shù))。訓(xùn)練集包含11630張圖片,經(jīng)過(guò)300次迭代后,總訓(xùn)練時(shí)間為17.5h。測(cè)試集包含1453張圖片,總的測(cè)試時(shí)間為24s,平均每張圖片的識(shí)別時(shí)間大約為0.016s。

    2.5Mungbean-droughtNet與其他模型的性能比較

    在相同數(shù)據(jù)集和試驗(yàn)參數(shù)的基礎(chǔ)上,將Mungbean-droughtNet模型與基于CNN的模型和基于Transformer的模型進(jìn)行比較,從而探索本研究提出的模型與現(xiàn)有模型在農(nóng)業(yè)圖像識(shí)別中的性能差異。

    本研究選取的基于CNN的網(wǎng)絡(luò)模型包含經(jīng)典模型ResNet50、ConvNext以及輕量級(jí)模型MobileNetV2、ShuffleNetV2和EfficientNetV2。如表6所示,本研究提出的Mungbean-droughtNet模型在驗(yàn)證集上的識(shí)別準(zhǔn)確率最高,為95.57%,分別比ResNet50、ConvNext、MobileNetV2、ShuffleNetV2以及EfficientNetV2高1.11個(gè)百分點(diǎn)、4.13個(gè)百分點(diǎn)、1.35個(gè)百分點(diǎn)、3.56個(gè)百分點(diǎn)和3.56個(gè)百分點(diǎn)。Mungbean-droughtNet模型的精度、召回率和F1分?jǐn)?shù)均優(yōu)于表6中的其他模型。

    選取4個(gè)常用的基于Transformer的模型和Mungbean-droughtNet模型進(jìn)行對(duì)比,選取的模型為ViT、Deit、MobileViT和SwinTransformer。如表6所示,Mungbean-droughtNet模型的總體性能最佳。與基于Transformer的模型SwinTransformer相比,Mungbean-droughtNet模型準(zhǔn)確率提高了2.62個(gè)百分點(diǎn),精度提高了2.12個(gè)百分點(diǎn),召回率提高了3.04個(gè)百分點(diǎn),F(xiàn)1分?jǐn)?shù)提高了2.62個(gè)百分點(diǎn)。試驗(yàn)結(jié)果證明了本研究提出方法的有效性和創(chuàng)新性。此外,本研究還分析了不同模型在訓(xùn)練過(guò)程中的準(zhǔn)確率和損失值曲線,如圖9所示,性能排名第2的模型EfficientNetV2的準(zhǔn)確率曲線和損失值曲線在270次迭代和280次迭代中逐漸收斂,排名第3的模型ResNet50的準(zhǔn)確率曲線和損失值曲線在280次迭代和260次迭代中逐漸收斂。而Mungbean-droughtNet模型的準(zhǔn)確率曲線和損失值曲線均在250次迭代中逐漸收斂。結(jié)果表明,與其他深度學(xué)習(xí)模型相比,Mungbean-droughtNet模型對(duì)綠豆葉綠素?zé)晒鈹?shù)據(jù)集的識(shí)別性能更好,收斂速度更快。

    利用訓(xùn)練得到的最優(yōu)的9個(gè)模型權(quán)重繪制混淆矩陣圖。如圖10所示,其中ResNet50、MobileNetV2、EfficientNetV2和SwinTransformer模型混淆矩陣的主對(duì)角線數(shù)值較高,表明ResNet50、MobileNetV2、EfficientNetV2和SwinTransformer對(duì)各類抗旱等級(jí)的識(shí)別性能均較好。將圖8和圖10進(jìn)行對(duì)比,對(duì)于HR、R、S、HS類別,Mungbean-droughtNet模型混淆矩陣主對(duì)角線上數(shù)值高于或等于其他模型,僅對(duì)于MR類別,Mungbean-droughtNet模型混淆矩陣主對(duì)角線上數(shù)值低于EfficientNetV2模型。總體而言,Mungbean-droughtNet模型對(duì)各類抗旱等級(jí)綠豆的識(shí)別性能均優(yōu)于其他模型。

    為了增加模型預(yù)測(cè)的可信度,本研究在測(cè)試集的每類圖像中各挑選了1張難以區(qū)分的圖像用于測(cè)試,并利用經(jīng)過(guò)預(yù)訓(xùn)練的10個(gè)模型權(quán)重對(duì)圖像類別進(jìn)行識(shí)別。每個(gè)模型的識(shí)別結(jié)果如圖11所示,10個(gè)模型對(duì)對(duì)照?qǐng)D像識(shí)別準(zhǔn)確率均高達(dá)100%。對(duì)HR、R、MR、S、HS類別圖像進(jìn)行識(shí)別,ResNet50、ShuffleNetV2、EfficientNetV2、ConvNext、ViT、Deit、SwinTransformer以及MobileViT均有2個(gè)或以上的識(shí)別錯(cuò)誤,其中MobileNetV2將真實(shí)標(biāo)簽為MR的類別錯(cuò)誤識(shí)別為S類別。而Mungbean-droughtNet模型對(duì)HR、R、MR、S、HS5個(gè)類別的識(shí)別準(zhǔn)確率分別高達(dá)98.8%、97.9%、99.0%、99.8%、99.6%。由此可見,本研究提出的Mungbean-droughtNet模型對(duì)綠豆抗旱等級(jí)的識(shí)別性能最佳。

    2.6消融試驗(yàn)

    為了研究模塊(GLAF模塊、Transformer模塊)數(shù)對(duì)模型性能的影響,在自建數(shù)據(jù)集上設(shè)計(jì)了一系列消融試驗(yàn)。此外,本研究還測(cè)試了不同卷積內(nèi)核的大小對(duì)A模塊性能的影響,從而選擇最佳的卷積內(nèi)核大小。

    2.6.1全局和局部的注意力特征(GLAF)模塊數(shù)的消融試驗(yàn)GLAF模塊用于提取初級(jí)特征圖的局部注意力特征和全局注意力特征。過(guò)多的模塊會(huì)產(chǎn)生冗余信息,不僅增加了模型的參數(shù)量和大小,還會(huì)增加模型運(yùn)行時(shí)間。而模塊數(shù)量過(guò)少,則難以捕捉完整的特征信息,從而導(dǎo)致模型的準(zhǔn)確率降低。在保持其他參數(shù)不變的情況下,將模型的GLAF模塊數(shù)分別設(shè)置為4、5、6,各訓(xùn)練了300次。如表7所示,當(dāng)GLAF模塊數(shù)為5時(shí),模型的各項(xiàng)指標(biāo)均最優(yōu)。和GLAF模塊數(shù)為4相比,GLAF模塊數(shù)為5的模型精度、召回率、F1分?jǐn)?shù)分別高了1.31個(gè)百分點(diǎn)、1.53個(gè)百分點(diǎn)、1.43個(gè)百分點(diǎn)。因此,將GLAF模塊的數(shù)量設(shè)置為5,雖然犧牲一定的參數(shù)量,但是獲得了最佳模型性能。

    2.6.2轉(zhuǎn)換器(Transformer)模塊數(shù)的消融試驗(yàn)視覺轉(zhuǎn)換器(Visiontransformer)模塊中每個(gè)轉(zhuǎn)換器模塊都包含自注意力機(jī)制,能夠幫助模型捕捉葉綠素?zé)晒鈭D像中不同位置之間的長(zhǎng)距離依賴關(guān)系。在實(shí)際特征分析中,通過(guò)堆疊多個(gè)Transformer模塊,模型能夠逐步整合更廣泛的上下文信息。為了驗(yàn)證不同數(shù)量的Transformer對(duì)模型性能的影響,將Transformer模塊數(shù)分別設(shè)置為2、3、4,并對(duì)模型性能進(jìn)行對(duì)比。如表8所示,當(dāng)Transformer模塊數(shù)為2時(shí),模型的平均精度高達(dá)98.18%,比Transformer模塊數(shù)為3、4時(shí)分別高了2.47個(gè)百分點(diǎn)、0.63個(gè)百分點(diǎn)。綜上,Transformer模塊數(shù)為2時(shí),模型各方面的性能最佳,且模型體積最小。

    2.6.3卷積核大小的消融試驗(yàn)卷積核的大小影響了卷積層的感受野和特征提取能力,可分離卷積是A模塊的核心組成部分,為了探究可分離卷積的卷積核大小對(duì)A模塊的影響,本研究將卷積核的大小分別設(shè)置為3×3、5×5、7×7,并訓(xùn)練了300次。如表9所示,卷積核為5×5、7×7的模型的整體性能明顯不如卷積核為3×3的模型,且卷積核為5×5、7×7的模型很難提取到更多有效的特征。由此,最終選擇3×3的卷積核。

    3討論

    為了解決傳統(tǒng)綠豆干旱脅迫狀態(tài)診斷方法具有的識(shí)別率低、及時(shí)性差等問題,本研究提出了一種準(zhǔn)確率更高、魯棒性更強(qiáng)的綠豆干旱脅迫識(shí)別模型Mungbean-droughtNet。Mungbean-droughtNet模型對(duì)綠豆干旱脅迫下的葉綠素?zé)晒鈭D像數(shù)據(jù)集具有較好的識(shí)別性能,識(shí)別準(zhǔn)確率最高可達(dá)到98.14%,平均精度為98.18%,平均召回率為98.40%,平均F1分?jǐn)?shù)為98.28%。相比于其他方法,Mungbean-droughtNet模型識(shí)別精度最高,魯棒性最強(qiáng),訓(xùn)練損失值最低,能夠準(zhǔn)確識(shí)別6類干旱脅迫,具有廣闊的應(yīng)用前景。并且該模型可以在移動(dòng)端和嵌入式設(shè)備上應(yīng)用。

    本研究仍存在需要改進(jìn)之處,主要包括以下幾個(gè)方面:(1)在參數(shù)量方面仍有優(yōu)化空間,可以進(jìn)一步優(yōu)化為輕量級(jí)網(wǎng)絡(luò);(2)由于目前缺乏公開的作物干旱脅迫熒光數(shù)據(jù)集,Mungbean-droughtNet模型只能在自建數(shù)據(jù)集上驗(yàn)證其性能,無(wú)法在其他數(shù)據(jù)集上驗(yàn)證其泛化能力。未來(lái)可以通過(guò)增加數(shù)據(jù)集中每個(gè)類別的圖像數(shù)量,使數(shù)據(jù)集更加全面。在保證模型精度的同時(shí),利用剪枝算法或者量化感知訓(xùn)練等方法對(duì)模型進(jìn)行裁剪,減少模型體積,進(jìn)一步提升網(wǎng)絡(luò)速度。

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    (責(zé)任編輯:成紓寒)

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