摘要:煙草是一種被廣泛使用的模式植物,經(jīng)常被用于分子生物學(xué)研究。本研究利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化技術(shù)研究了一種新的外源基因在煙草葉片中瞬時表達的系統(tǒng)。首先,通過PCR擴增目的基因,與質(zhì)粒進行連接后與大腸桿菌轉(zhuǎn)化培養(yǎng),通過PCR、酶切驗證和測序確認基因插入,再轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌。經(jīng)侵染后成功在煙草中實現(xiàn)了目的基因(GFP)的表達。本研究有助于推進利用煙草作為模式植物的分子生物學(xué)研究,并在各個領(lǐng)域都有應(yīng)用潛力。
關(guān)鍵詞:煙草;農(nóng)桿菌介導(dǎo)轉(zhuǎn)化;瞬時基因表達;分子生物學(xué)研究
植物基因轉(zhuǎn)化技術(shù)中,盡管存在轉(zhuǎn)化效率低等問題,農(nóng)桿菌介導(dǎo)的轉(zhuǎn)化方法仍因其高效且便捷被廣泛應(yīng)用于基因功能研究。農(nóng)桿菌注射技術(shù)作為新興手段,以其瞬時表達和操作簡便性,為高通量基因功能分析提供了可能。近年研究通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法在植物中實現(xiàn)了外源基因的快速表達,為深入探索植物生物學(xué)提供了新的思路。這項技術(shù)已經(jīng)廣泛應(yīng)用于基因表達、基因相互作用、蛋白表達以及疫苗生產(chǎn)等領(lǐng)域的研究。如唐伶俐等利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)成功建立了厚皮甜瓜遺傳轉(zhuǎn)化體系[1]。孫蔓莉等通過在本氏煙草上共表達RB和Avrblb1,探究了影響農(nóng)桿菌介導(dǎo)基因瞬時表達效率的因素,如農(nóng)桿菌菌懸液OD600值、菌系、植物品種及生長發(fā)育階段等[2]。張悅婧等則以本氏煙草為材料,分析了不同農(nóng)桿菌菌株、菌液濃度和侵染時間對瞬時轉(zhuǎn)化過程中報告基因GFP熒光表達量的影響[3]。蔡瀾峰通過基因質(zhì)粒pCAMBIA2301為載體,在模式作物煙草上測試了五種農(nóng)桿菌菌株侵染能力,以及5個甘蔗品種的遺傳轉(zhuǎn)化方法進行了一系列優(yōu)化,包括愈傷組織、心葉和懸浮細胞三種靶組織類型[4]。這些研究展示了農(nóng)桿菌注射技術(shù)快速、靈活和高效的特點,為植物基因功能研究提供了新的思路和手段,為深入探索植物生物學(xué)提供了重要的技術(shù)支持。本研究基于此,構(gòu)建了一個農(nóng)桿菌介導(dǎo)的煙草葉片外源基因瞬時表達體系,并進行了一系列驗證,以期為植物基因表達提供新途徑。
1 方法與材料
1.1 質(zhì)粒提取與濃度測定
1.1.1 實驗材料
大腸桿菌菌液(DH5α):含有質(zhì)粒的大腸桿菌菌株。
質(zhì)粒提取試劑盒(TRAN Code:EM101-02 Lot:R51030-V2);離心機(eppendorf Centrifuge 5424);恒溫金屬?。℅INGOh2O3-100C);吸附柱;Nanodrop。
1.1.2 實驗方法
取1.5 mL大腸桿菌菌液,在10000G下離心1 min,棄去上清液,留下菌體。加入250μL預(yù)冷的Resuspension Buffer(RB),輕柔顛倒混勻。隨后加入250μL Lysis Buffer(LB)8aznQdkbxag/64A9RgBALQ==,輕柔顛倒混勻6~8次。加入350μL Neutralizing Buffer(NB),輕柔顛倒混勻約10次后在12 000 G常溫離心5 min,上清液移到吸附柱上,用12 000 G常溫離心上清液1 min,倒掉清液。加入650μL Wash Buffer(WB)后12 000 G常溫離心1 min,倒出液體再12 000 G常溫離心1 min。加入30μL預(yù)熱至65℃的Elution Buffer(EB),將質(zhì)粒從橡膠柱上洗下,靜置溶解1min,再10 000 G常溫離心1 min。最終,用2μL樣品進行分光光度計濃度檢測。
1.2 引物設(shè)計和目的基因的PCR擴增
1.2.1 試驗材料
上游引物pCB-GFP-F:5'- GGACTCTAGAGGAT
CCATGGTGAGCAAG -3'(BamHI酶切位點)。
下游引物pCB-GFP-R:5'- GATCGGGGAAATTCGAGCTCTTACTTGTACAG -3'(SacI酶切位點)。
質(zhì)粒模板:載體質(zhì)粒pCAMBIA1300-35S-空-
GFP。pCAMBIA1300-35S-空-GFP質(zhì)粒含有GFP基因編碼區(qū)。
Taq Mix酶;PCR儀(BIO-RAD T100? Thermal
Cycler2)
1.2.2 試驗方法
以含有GFP基因的pCAMBIA1300-35S-空-GFP質(zhì)粒為模板進行GFP基因編碼區(qū)的PCR擴增。PCR反應(yīng)體系為50μL,其中,上下游引物(10μmol/L)各2μL,載體質(zhì)粒pFF19 DNA 1μL(XX ng),Taq Mix酶 25μL,加水補至50μL。
擴展條件:
預(yù)變性:95℃,5 min。
變性:95℃,30 s。
退火:55℃,30秒。
延伸:72℃,1 min。
循環(huán)次數(shù):34個循環(huán)。
最終延伸:72℃,50 min。
1.3 瓊脂糖凝膠電泳
1.3.1 試驗材料
瓊脂粉(tsingke TSJ001);1×TAE緩沖液;核酸膠染劑;PCR擴增產(chǎn)物;DNA Marker(tsingke DL2000 DNA Marker);GoldenView染色劑;DNA loading(EDTA,溴酚藍)。
1.3.2 試驗方法
取0.4 g瓊脂糖,加入40 mL1×TAE緩沖液中。隨后,將混合物加熱至溶解,然后冷卻至65℃左右,加入4μL核酸膠染劑,充分混合。接著將膠板放入膠槽內(nèi)并插入梳子,倒入瓊脂糖凝膠溶液,等待其完全凝固后拔出梳子。將膠板放入電泳槽內(nèi),槽內(nèi)加入足夠的1×TAE緩沖液使其覆蓋膠面。使用移液槍將樣品加入膠孔內(nèi)。隨后將電泳槽連接至電源并設(shè)定180V恒定電壓,直至溶液前端達到膠板底部。最后關(guān)閉電源,取出膠板,并進行照膠操作,以記錄和分析凝膠上的DNA遷移帶。
1.4 載體線性化與純化
1.4.1 試驗材料
大腸桿菌質(zhì)粒(DH5a);DNA loading buffer
緩沖液;BamHI-HF酶(NEW ENGLAND BioLabs
R3136S);SacI酶(NEW ENGLAND BioLabs
R0156L)。
1.4.2 試驗方法
線性化。在質(zhì)粒載體線性化的試驗中,加入37μL蒸餾水、6μL大腸桿菌質(zhì)粒(1μg)、5μL緩沖液、1μL Bam-HI酶和 1μL SacI-HF酶。反應(yīng)程序:37℃,1~2 h。
純化。如前所述進行核酸電泳后,將膠板取出,將目的條帶所在膠塊切下稱重,按照試劑所示流程進行膠回收,得到酶切產(chǎn)物。
1.5 線性化載體與目標(biāo)片段的連接與菌落培養(yǎng)
1.5.1 試驗材料
CE buffer(Vazyme 7E771E3);EXuasell酶(Vazyme 7E771E3);感受態(tài)大腸桿菌;LB培養(yǎng)基。
1.5.2 試驗方法
首先在離心管中加入0.42μL DNA 片段(按照最適插入片段使用量=[0.04x 插入片段堿基對數(shù)]ng(0.06pmol)配比)與 6.5μL 載體(最適克隆載體使用量=[0.2×克隆載體堿基對數(shù)]ng(0.03pmol)配比),再加入CE buffer 4μL,EXuasell酶2μL,與去離子水7.06μL。其次將上述體系用PCR儀37℃培育30 min。之后將同源重組產(chǎn)物使用感受態(tài)大腸桿菌轉(zhuǎn)化,37℃搖勻培養(yǎng)30 min后涂布在對應(yīng)抗性的固體培養(yǎng)基上,倒置37℃過夜。
1.6 基因重組后的菌落的PCR鑒定
1.6.1 試驗材料
Taq酶mix。
F端引物pCB-GFP-F:5’- GGACTCTAGAG
GATCCATGGTGAGCAAG -3’(BamHI酶切位點)。
R端引物NOS-R:5’- GATAATCATCGCA
AGACCGG -3’(在NOS終止子上)。
1.6.2 試驗方法
挑取單菌落至40μL無菌水中。每個板挑取3個陽性菌落,取4份劑量的F端引物、R端引物、去離子水和Taq酶混合在一起,即F端引物和R端引物各4μL,40μL Taq酶,混勻。
配制PCR反應(yīng)體系,進行核酸電泳,觀察目的條帶。
1.7 重組質(zhì)粒提取與重組質(zhì)粒的酶切驗證
首先取37μL的蒸餾水放入離心管,其次加入1μg
質(zhì)粒(按提取的濃度應(yīng)加入4μL),接著加入5μL cutsmart緩沖液,構(gòu)建cutsmart體系,再加入1μL BamHI,然后加入1μL XmaI,接著37℃金屬浴1 h,如上所述進行核酸電泳。
1.8 農(nóng)桿菌的重組DNA的導(dǎo)入
1.8.1 試驗材料
農(nóng)桿菌(GV301);去離子水;含有GFP的質(zhì)粒;感受態(tài)細胞。
1.8.2 試驗方法
用提前培育2 d的農(nóng)桿菌(GV301)取2μL質(zhì)粒,與20μL感受態(tài),在冰上靜置5 min,然后放入液氮5 min,再37℃金屬浴5 min,再在冰上靜置5 min。28℃搖床2 h。接著把搖好的菌5 000 r/min離心1 min,吸去上清液,將剩余部分吹打混勻,滴加到培養(yǎng)基上,涂勻,在28℃培養(yǎng)2 d。
1.9 農(nóng)桿菌侵染煙草
1.9.1 實驗材料
農(nóng)桿菌(GV301);去離子水MgCl2溶液(1 mol/L);
ASG-乙酰丁香酮(1 mol/L);MES-2-嗎啉乙硫磺(15 mol/L)。
1.9.2 試驗方法
取提前培養(yǎng)好的農(nóng)桿菌5 mL,5000rpm離心5 min。配置侵染液,1 mL MgCl2溶液(1mol/L)、1 mL ASG-乙酰丁香酮(1mol/L)、1 mL MES-2-嗎啉乙硫磺(15 mol/L)。接著將離心好的菌液上清液倒出,取100μL,與900μL侵染液混合,在光度儀中測出濃度,運用公式(測出濃度×體積/需求濃度-體積)算出所稀釋的量(2.15×5/1~5 mL)=5.75 mL。按這個濃度來配置所需溶液,將其放在搖床上培育2 h。然后將搖好的菌拿出,用針管吸取,將煙草葉子翻轉(zhuǎn),背面朝上,用針尖扎一個孔,然后取下針尖,用食指抵住背面用注射器頭堵住葉片背面的孔,慢慢將注射器中的菌液到葉片里直至整個葉片都被菌液充滿(若一個孔不能使這個葉片布滿,則多扎幾個),最后繼續(xù)種植煙草約2 d。
2 試驗結(jié)果與分析
質(zhì)粒提取及濃度測定結(jié)果顯示,組別1的質(zhì)粒
濃度為247.956 g/μL,A260/A280為1.93左右,符合試驗要求。這說明提取的質(zhì)粒樣品具有足夠的濃度和較少的雜質(zhì)。
以pCAMBIA1300-35S-空-GFP質(zhì)粒為模板,使用pCB-GFP-F和pCB-GFP-R引物進行PCR擴增試驗,通過瓊脂糖凝膠電泳檢測觀察到明顯的、符合預(yù)期大小的PCR條帶(圖1),成功得到了預(yù)期大小為750 bp的擴增產(chǎn)物,說明PCR成功。
圖2的瓊脂糖電泳圖展示了載體線性化實驗的結(jié)果。通過瓊脂糖電泳圖可以發(fā)現(xiàn)1號泳道的上方較亮的條帶為10 000 bp左右的線性化后的載體,在下方較暗的條帶為750 bp的線性化載體;2號泳道僅有一條較亮條帶,長度約為750 bp,和BamHI位點與SacI位點之間的片段長度相符,應(yīng)為目的基因的PCR產(chǎn)物,說明載體線性化與PCR有效。
菌落擴培結(jié)果顯示,經(jīng)過37℃、12 h的培養(yǎng),培養(yǎng)基上含有GFP片段的菌落生長良好,有較多菌落,說明轉(zhuǎn)化較為成功。
菌落PCR結(jié)果如圖3所示,1、2、3泳道分別為培育好的含有GFP段落的不同獨立菌落的樣品,4為加入了無菌水的對照組。發(fā)現(xiàn)1、2、3泳道的條帶大小、位置基本一致,說明其取樣菌落均為真陽性,而4泳道的空白對照沒有條帶,說明無菌水無污染且實驗有效。
(M為DNA marker DL2000,1、2、3為不同的獨立菌落樣本,4為加了無菌水的對照重組質(zhì)粒提取與重組質(zhì)粒的酶切驗證實驗結(jié)果如圖4所示,可以看到泳道1、2均有一條較亮、長度約在10 000 bp的條帶,但由于酶切位點BamHI與XbaI之間還未插入目標(biāo)基因序列,只有極少量bp的片段,切下來的片段過短,在瓊脂糖凝膠電泳圖上不可見。所以圖中沒有第二條較小條帶為正常情況,實驗有效。
M為DNA marker DL2000,泳道1、2為同一份樣品質(zhì)粒轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌試驗結(jié)果獲得了一盆(三片葉子)經(jīng)過含有GFP片段的根癌農(nóng)桿菌侵染的本氏煙草,菌液基本充滿了目標(biāo)葉子。
3 總結(jié)與展望
本研究通過構(gòu)建一種農(nóng)桿菌介導(dǎo)的在煙草葉片中實現(xiàn)外源基因瞬時表達的體系,成功地實現(xiàn)了外源基因在本氏煙草上的快速而有效的表達。該方法具有較高的操作效率,為研究者們提供了一種新的、迅速的基因外部表達方式。農(nóng)桿菌介導(dǎo)的基因瞬時表達技術(shù)在植物基因工程領(lǐng)域展現(xiàn)出了巨大的潛力。然而,在充分利用這一技術(shù)的同時,我們也要正視其存在的一些局限性。首先,農(nóng)桿菌介導(dǎo)并非百分之百成功,其轉(zhuǎn)化效率受到植物天然防御機制的制約,導(dǎo)致試驗失敗的風(fēng)險存在[5]。解決這一問題需要深入研究植物與農(nóng)桿菌互作的機制,尋找提高轉(zhuǎn)化效率的途徑。其次,瞬時表達的特性使得其在子代中無法穩(wěn)定遺傳。這對于作物改良和育種工作來說是一個挑戰(zhàn)。未來的研究可以嘗試通過進一步改良農(nóng)桿菌介導(dǎo)技術(shù),使得其表達能力更具持久性,能夠穩(wěn)定傳遞給后代。此外,農(nóng)桿菌介導(dǎo)的基因瞬時表達在不同植物種類中可能存在差異。因此,未來的研究可以探索優(yōu)化該技術(shù)以適應(yīng)更廣泛的植物類型,提高其通用性和適應(yīng)性。通過克服其局限性,我們可以更好地利用這一技術(shù),為未來植物科研和農(nóng)業(yè)發(fā)展提供更多可能性。
參考文獻
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