杜欣桐,張世亮
(1.山東中醫(yī)藥大學(xué),山東濟(jì)南 250355;2.山東中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院,山東濟(jì)南 250014)
竇性心動過緩(sinus bradycardia,SB)是緩慢性心律失常疾病的一種,當(dāng)竇房結(jié)自律性降低時,由竇房結(jié)產(chǎn)生的沖動低于正常的范圍,即低于60次/分。心率減慢是正常衰老和疾病進(jìn)展的一部分,因此SB在老年人中更為常見[1]。目前,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對SB缺乏有效的治療手段,一般通過異丙腎上腺素、氨茶堿、阿托品等藥物提高心室率[2]。大量臨床研究發(fā)現(xiàn),長期服用這些抗心律失常的藥物,可能會導(dǎo)致其他心律失常。近年來,隨著醫(yī)療與科學(xué)技術(shù)的不斷發(fā)展,植入心臟起搏器作為一種新興的治療手段,已經(jīng)成為治療緩慢性心律失常的重要方式,在改善心功能、降低心源性猝死率、提高生活質(zhì)量方面起到積極作用,但其長期療效依然有待進(jìn)一步研究。此外,受植入起搏器的手術(shù)風(fēng)險、術(shù)后并發(fā)癥及患者經(jīng)濟(jì)實力等因素的影響,起搏器在臨床上的應(yīng)用受到限制[3]。中醫(yī)從整體角度出發(fā),以辨證論治為原則,結(jié)合現(xiàn)代醫(yī)學(xué)辨識SB,并在治療上取得了顯著療效。趙曉敏等[4]通過分析近20年中醫(yī)治療緩慢性心律失常的文獻(xiàn),發(fā)現(xiàn)心腎陽虛證和心陽虧虛證為心律失常的常見證型。郭艷瓊等[5]通過聚類分析發(fā)現(xiàn)治療SB的中藥中使用頻率較高的前兩味中藥分別是甘草、桂枝?,F(xiàn)代研究表明,甘草、桂枝中的部分成分在抗心律失常、擴(kuò)張血管等方面發(fā)揮作用[6-7]。通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法構(gòu)建“藥物-靶點-基因-疾病”的相互作用網(wǎng)絡(luò),分析、預(yù)測多種藥物成分共同治療疾病的機(jī)制,其系統(tǒng)性與中醫(yī)學(xué)的整體辨治觀念,以及中藥及其方劑的多成分、多途徑、多靶點協(xié)同作用于人體的原理不謀而合[8]。本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,通過對藥物的化學(xué)成分、作用靶點和信號通路進(jìn)行分析,探究桂枝-甘草藥對干預(yù)SB的作用機(jī)制。
1.1 桂枝、甘草化學(xué)成分及靶點獲取 以“桂枝”“甘草”為關(guān)鍵詞,檢索中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP,https://tcmspw.com/tcmsp.php),以口服利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18為篩選條件,獲得桂枝、甘草的活性成分,并通過挖掘文獻(xiàn)對獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行驗證和補(bǔ)充。利用本草組鑒平臺(HERB,http://herb.ac.cn/)進(jìn)行藥物成分靶點預(yù)測。
1.2 SB疾病靶點獲取 以“sinus bradycardia”為關(guān)鍵詞,檢索HERB數(shù)據(jù)庫,匯總整理后得到SB疾病的相關(guān)靶點。
1.3 桂枝-甘草藥對預(yù)測靶點與SB疾病靶點的交集靶點篩選 將桂枝、甘草藥物成分預(yù)測靶點和SB疾病靶點導(dǎo)入InteractiVenn(http://www.interactivenn.net/),并繪制Venn圖。
1.4 桂枝、甘草成分預(yù)測靶點與SB靶點蛋白互作網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 為闡明靶點蛋白之間的相互作用,將藥物成分預(yù)測靶點和SB疾病靶點上傳至STRING 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org),限制物種為“homo sapiens”,設(shè)置靶點置信度分值為0.40,隱藏?zé)o相互作用關(guān)系的靶點后,以TSV 格式將靶點互作數(shù)據(jù)導(dǎo)出,導(dǎo)入Cytoscape3.9.1軟件中,繪制蛋白與蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,并對其進(jìn)行分析。
1.5 交集靶點富集分析 將交集靶點導(dǎo)入Metascape平臺(https://metascape.org/gp/index.html),限制物種為“homo sapiens”,進(jìn)行基因本體(GO)富集分析與京都基因與基因組百科全書(KEGG)通路分析。其中,GO 富集分析由生物過程(BP)、細(xì)胞組分(CC)、分子功能(MF)3個部分組成。以P<0.01為篩選條件,選取符合條件的前20 條數(shù)據(jù),利用微生信平臺(http://www.bioinformatics.com.cn/)對其進(jìn)行可視化處理。
1.6 成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 將桂枝、甘草藥對化學(xué)成分與交集靶點對應(yīng)關(guān)系、交集靶點與KEGG通路對應(yīng)關(guān)系進(jìn)行映射,導(dǎo)入Cytoscape3.9.1軟件繪制桂枝-甘草藥對有效成分-SB疾病靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖。利用Cytoscape 3.9.1 內(nèi)置的Network Analyzer功能,分析有效成分及靶點的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù),獲得節(jié)點的連接度、介度、緊密度相關(guān)信息,并判斷核心靶點及干預(yù)SB的主要活性成分。
2.1 桂枝、甘草化學(xué)成分收集和成分靶點預(yù)測 經(jīng)檢索和篩選,獲得桂枝化學(xué)成分7 種,甘草化學(xué)成分92種。其中,谷甾醇(sitosterol)為兩者共同包含的化合物。預(yù)測桂枝對應(yīng)的成分靶點88個,預(yù)測甘草對應(yīng)的成分靶點1 756個,將兩者靶點合并且去重后獲得245個成分靶點。
2.2 SB疾病靶點 檢索HERB數(shù)據(jù)庫后共獲得SB疾病相關(guān)靶點570個。
2.3 桂枝、甘草成分靶點與SB靶點的交集靶點 將245個成分靶點與570個SB疾病靶點導(dǎo)入Interacti Venn后,共獲得交集靶點52個。見圖1(掃描標(biāo)題右側(cè)二維碼查看圖片)。
2.4 交集靶點的蛋白與蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建將52個交集靶點上傳至STRING數(shù)據(jù)庫,獲得PPI網(wǎng)絡(luò)信息,并利用Cytoscape 3.9.1軟件優(yōu)化靶蛋白PPI網(wǎng)絡(luò),見圖2(掃描標(biāo)題右側(cè)二維碼查看圖片)。圖2提示IL6、TNF、IL1B、CXCL8、MMP9、CCL2、EGF等靶點可能為桂枝-甘草藥對治療SB 的潛在核心靶點。
2.5 交集靶點富集分析結(jié)果 通過Metascape數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO 和KEGG 富集分析,篩選后共獲得BP 20項,主要與血液循環(huán)、系統(tǒng)過程的調(diào)節(jié)、細(xì)胞增殖的負(fù)調(diào)控、細(xì)胞脂質(zhì)的反應(yīng)等相關(guān);CC 11項,涉及膜筏、突觸后膜、過氧化物酶體等;MF 12項,包含細(xì)胞因子受體結(jié)合、G蛋白偶聯(lián)胺受體活性、血紅素結(jié)合等。與SB相關(guān)的KEGG 通路主要涉及流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、癌癥途徑、鈣信號通路、HIF-1信號通路、Fox O 信號通路等。利用微生信平臺對GO和KEGG富集分析結(jié)果進(jìn)行處理,分別得到GO 富集分析圖(見圖3,掃描標(biāo)題右側(cè)二維碼查看圖片)和KEGG通路富集分析氣泡圖(見圖4,掃描標(biāo)題右側(cè)二維碼查看圖片)。
2.6 成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建 運用Cytoscape 3.9.1構(gòu)建“桂枝-甘草藥對成分-交集靶點-通路”網(wǎng)絡(luò)圖,并通過其內(nèi)置工具分析網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)參數(shù),得到核心成分(槲皮素、山柰酚等)及核心作用靶點(ESRI、AR、NOS2、CALM3、ACN5A等)。桂枝、甘草與竇性心動過緩成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)圖見圖5(掃描標(biāo)題右側(cè)二維碼查看圖片)。桂枝、甘草與竇性心動過緩成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)中成分節(jié)點參數(shù)見表1。桂枝、甘草與竇性心動過緩成分-靶點-通路網(wǎng)絡(luò)中重要靶點網(wǎng)絡(luò)節(jié)點參數(shù)見表2。
表1 桂枝、甘草活性成分-竇性心動過緩疾病靶點-通路網(wǎng)絡(luò)中成分節(jié)點參數(shù)
表2 桂枝、甘草活性成分-竇性心動過緩疾病靶點-通路網(wǎng)絡(luò)中重要靶點網(wǎng)絡(luò)節(jié)點參數(shù)
中醫(yī)將SB歸于“心悸”“遲脈證”“怔忡”等范疇,認(rèn)為該病多因體虛勞倦、情志失調(diào)、外邪所傷及藥食不當(dāng)?shù)葘?dǎo)致氣血陰陽不足,心失濡養(yǎng),或邪滯心脈,擾亂心神而發(fā);病機(jī)以陽虛為主,此外亦有血瘀、痰濁、氣滯等,總屬本虛標(biāo)實之證;臨床用藥以補(bǔ)氣、溫通為主要方法。桂枝、甘草為臨床常用的藥對,如在《傷寒論》治療心悸的炙甘草湯、桂枝甘草湯中就有應(yīng)用。甘草味甘,性平,歸心、肺、脾、胃經(jīng),可補(bǔ)心益氣、復(fù)脈定悸,尤擅治療因心氣虛導(dǎo)致的心悸氣短、脈結(jié)代。桂枝味辛甘,性溫,歸心、肺、膀胱經(jīng),可溫通心脈,補(bǔ)助胸陽,止悸?,F(xiàn)代藥理學(xué)研究發(fā)現(xiàn),甘草中含有的甘草次酸及黃酮類成分可以降低心律失常的發(fā)生風(fēng)險[9];桂枝中的部分成分能夠有效改善冠狀動脈血流循環(huán)、增加心肌營養(yǎng),為抗心律失常作用提供物質(zhì)基礎(chǔ)[10]。
本研究結(jié)果推測,桂枝、甘草治療SB的活性成分為槲皮素、山柰酚、金雀花堿、紫檀素等。槲皮素可能通過抑制鈉離子(Na+)、鈣離子(Ca2+)內(nèi)流,促進(jìn)鉀離子(K+)外流,保護(hù)心肌細(xì)胞膜上Na+-K+-ATP酶的功能等多種途徑對抗心律失常[11]。山柰酚可通過抑制核因子κB(NF-κB)從而抑制炎癥因子、趨化因子和酶的表達(dá),同時可以通過抑制血管緊張素轉(zhuǎn)化酶,引起動靜脈血管擴(kuò)張,并起到抗血小板聚集和抗血栓形成的作用[12]。金雀花堿在阻止動脈粥樣硬化形成、減少血栓發(fā)生、增加組織血流量等心血管疾病方面均有積極作用[13]。
桂枝、甘草治療SB的核心靶點主要包括ESR1、AR、NOS2、CALM3、SCN5A。雌激素受體1(ESR1)的主要核受體為ERα,廣泛分布于心肌細(xì)胞、心臟成纖維細(xì)胞、血管內(nèi)皮細(xì)胞等,基本作用包括調(diào)節(jié)免疫反應(yīng)、抗炎、抗動脈粥樣硬化、改善心血管病變[14]。雄激素受體(AR)在心肌細(xì)胞、平滑肌細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞中均有表達(dá),因此與心血管相關(guān)疾病關(guān)系密切。AR 通過與雄激素相結(jié)合發(fā)揮其生物學(xué)效應(yīng)。研究表明,雄激素可直接作用于心室肌細(xì)胞,改變心室肌細(xì)胞膜的通透性,影響K+外流,從而調(diào)節(jié)心室肌復(fù)極化,故雄激素水平的改變可以導(dǎo)致心血管不良事件的發(fā)生[15]。一氧化氮合酶(NOS)2屬于NOS家族。當(dāng)NOS被激活時,一氧化氮(NO)合成增加,NO 作為細(xì)胞之間的通訊物質(zhì),在細(xì)胞免疫、調(diào)節(jié)血管功能和神經(jīng)信號的傳導(dǎo)等生理過程中充當(dāng)重要的信使分子,促進(jìn)多種細(xì)胞的協(xié)同工作[16];當(dāng)NOS被抑制時,可能導(dǎo)致缺血再灌注損傷,心肌細(xì)胞內(nèi)環(huán)磷酸鳥苷(cGMP)含量降低,會增加心律失常的可能。當(dāng)心肌缺血時,鈣泵活性降低,細(xì)胞膜上的Na+-Ca2+交換增多,胞內(nèi)Ca2+濃度升高甚至超載,這被廣泛認(rèn)為是心律失常的機(jī)制之一。鈣調(diào)蛋白3(CALM3)通過調(diào)控Ca2+通道,調(diào)節(jié)心肌細(xì)胞內(nèi)外的Ca2+濃度,防止Ca2+超載,發(fā)揮抗心律失常的作用[17]。鈉電壓門控通道α亞基5(SCN5A)為全身鈉通道的一種。Na+通道在工作時有靜息態(tài)、激活態(tài)和失活態(tài)3種狀態(tài)。在靜息態(tài)時,Na+通道受到超過閾值的電刺激,使心肌細(xì)胞興奮并產(chǎn)生動作電位,同時幫助傳導(dǎo),隨后Na+通道失活,通道重新進(jìn)入靜息態(tài)。藥物和基因突變等多種因素會影響通道構(gòu)象的改變,進(jìn)而影響其功能,導(dǎo)致心律失常的發(fā)生[18]。
KEGG富集分析結(jié)果顯示,桂枝、甘草作用于SB主要涉及流體剪切應(yīng)力與動脈粥樣硬化、鈣信號通路、HIF-1信號通路、Fox O 信號通路等多種信號通路,可能具有影響血管內(nèi)皮功能、抗細(xì)胞缺氧損傷能力等。切應(yīng)力通過細(xì)胞膜上的受體、胞間連接信號、基底黏著斑蛋白參與調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞增殖、遷移、凋亡等生物過程,可以影響與促進(jìn)動脈粥樣硬化斑塊生成有關(guān)的基因的表達(dá)。低切應(yīng)力能增強(qiáng)NF-κB的活性,增加鈣化基因、炎癥細(xì)胞因子等基因的表達(dá),抑制eNOS基因,導(dǎo)致NO的產(chǎn)生減少,從而引發(fā)內(nèi)皮功能障礙[19]。缺氧誘導(dǎo)因子-1(HIF-1)是缺氧過程中的重要分子,能夠促進(jìn)血管生成、重建細(xì)胞代謝途徑等,使組織細(xì)胞適應(yīng)低氧環(huán)境。機(jī)體處于缺氧時,HIF-1能促進(jìn)NOS基因表達(dá),減少心肌細(xì)胞的凋亡,降低心肌損傷[20]。因此,HIF-1在缺血性疾病中起到至關(guān)重要的作用。Fox O通路參與細(xì)胞凋亡、周期調(diào)控等多種細(xì)胞生物過程,可以調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激反應(yīng),并有抗老化的作用,F(xiàn)ox O 蛋白活性增加會產(chǎn)生氧化應(yīng)激抵抗,減少細(xì)胞凋亡,降低心血管疾病的發(fā)病率[21]。
本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探索桂枝-甘草藥對治療SB的作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)桂枝-甘草藥對中有多種活性成分作用于疾病靶點,并參與多種信號通路的調(diào)控。然而,依靠上述方法探究藥物作用機(jī)制仍然需要思考一些問題,如中藥配伍時劑量不同,其所含單體成分濃度亦有差異,進(jìn)而導(dǎo)致不同的藥效,且多數(shù)中藥的藥效成分及起效形式等尚未明確,不同成分之間還存在協(xié)同、拮抗作用,難以全部納入分析。現(xiàn)有研究大多以O(shè)B≥30%、DL≥0.18為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行有效成分篩選,然而將OB及DL作為評判成分活性程度的唯一指標(biāo)過于絕對,如甘草中的主要成分甘草酸(OB=19.62%,DL=0.11)、桂枝中的主要成分桂皮醛(OB=31.99%,DL=0.02)無法被上述策略篩選,普遍存在于各種中藥中的槲皮素、山柰酚等成分卻因為具有良好的OB、DL值,被推測為重要成分。此外,中藥也可以改變腸道菌群。腸道微生物能通過生物轉(zhuǎn)化將中藥成分代謝為其他活性物質(zhì),在藥物代謝動力學(xué)和藥物效應(yīng)動力學(xué)方面起重要作用,如甘草酸因分子量較大,口服后不易通過腸道屏障進(jìn)入血液發(fā)揮效用,但經(jīng)腸道菌群轉(zhuǎn)化后,其代謝產(chǎn)物甘草次酸的生物利用度更高[22]。這種動態(tài)關(guān)聯(lián)在網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)“成分-靶點-疾病”的靜態(tài)網(wǎng)絡(luò)中難以體現(xiàn)?,F(xiàn)階段網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已成為研究中醫(yī)藥藥理基礎(chǔ)與作用機(jī)制的熱門工具,為臨床藥物優(yōu)化提供支持,但由于自身局限性,仍需要通過動物實驗、現(xiàn)代基礎(chǔ)研究等方式驗證和豐富其合理性,減少同質(zhì)化。