王道 符淳
摘 要:范可尼貧血互補(bǔ)群E(FANCE)屬于FA家族的重要成員之一,參與DNA鏈間交聯(lián)損傷修復(fù)并在某些腫瘤中起重要作用。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)方法對FANCE的同源性、理化性質(zhì)、親/疏水性、信號肽、亞細(xì)胞定位、跨膜結(jié)構(gòu)、蛋白結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)互相作用、B/T細(xì)胞優(yōu)勢抗原表位以及腫瘤相關(guān)性進(jìn)行預(yù)測。FANCE為無信號肽和跨膜區(qū)的疏水性蛋白,主要分布在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì),具有較高的保守性。其二級結(jié)構(gòu)以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,含有2個N-糖基化、9個O-糖基化以及48個磷酸化位點(diǎn),與FANCM、FANCD2、FANCC等蛋白發(fā)生相互作用。FANCE具有多個潛在的B/T細(xì)胞優(yōu)勢抗原表位和17個抗原決定簇,在急性髓性白血?。↙AML)和皮膚黑色瘤(SKCM)中低表達(dá),其低表達(dá)顯著影響患者總生存率。這為深入研究FANCE在腫瘤中的分子機(jī)制提供理論依據(jù),使FANCE可能成為新的治療靶點(diǎn)。
關(guān)鍵詞:FANCE;生物信息學(xué);結(jié)構(gòu);抗原表位;腫瘤
中圖分類號:Q987;R318.04? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A DOI:10.3969/j.issn.1007-7146.2023.01.011
Bioinformatics Analysis of Fundamental Properties and Antigenic Epitopes of FANCE
WANG Dao, FU Chun*
(Department of Obstetrics and Gynecology, the Second Xiangya Hospital, Central South University,? Changsha 410011, China)
Abstract: Fanconi anemia complementation group protein E (FANCE), which is a member of FA family, plays a critical role in DNA interstrand crosslink (ICL) repair and contributes to progression of tumor. We used series of bioinformatics to predict and analyze the properties of human FANCE, involving homology, physicochemical property, hydrophobicity, signal peptide, subcellular localization, protein structure, protein-protein interaction, B/T cell epitopes and its correlation with tumor. FANCE was hydrophobic protein, without signal peptide and transmembrane region, mainly distributed in nucleus and cytoplasm. It showed being high conserved in evolution, of which secondary structure was characterized as α-helices and random coils, and had 2 N-glycosylation, 9 O-glycosylation and 48 phosphorylation sites. FANCE also could interact with FANCM, FANCD2, FANCC etc., and had many potential B/T cell epitopes and 17 antigenic determinants. FANCE was lowly expressed in LAML and SKCM, low FANCE expression reduced overall patient survival in SKCM. This study provides a theoretical basis for further researching the molecular mechanism of FANCE in tumors, which may offer potential as a novel therapeutic target.
Key words: FANCE; bioinformatics; structure; antigenic epitope; tumor
(Acta Laser Biology Sinica, 2023, 32(1): 076-088)
范可尼貧血(Fanconi anemia,F(xiàn)A)又名范可尼貧血綜合征,是一種復(fù)雜較為罕見的人類遺傳疾病[1],1927年由瑞士兒科醫(yī)生Fanconi首次發(fā)現(xiàn)并命名,每136 000名新生兒中約有1名患兒,屬于常染色體或者X染色體隱性遺傳。FA患者的常見臨床癥狀除表現(xiàn)為全血細(xì)胞減少外,還與多種出生缺陷和惡性腫瘤易感性相關(guān)[2]。先天性畸形常累及多種器官系統(tǒng),包括中樞神經(jīng)、心臟、胃腸道和骨骼等[3]。臨床特征主要表現(xiàn)為身材矮小、聽力下降、腎功能缺陷、皮膚色素沉著、拇指畸形和性腺減退等,70%以上的患者還會出現(xiàn)內(nèi)分泌功能障礙[4]。這些現(xiàn)象都表明,F(xiàn)A基因在造血、發(fā)育和腫瘤形成的機(jī)制中起著重要作用。
目前,至少22種FA家族相關(guān)基因被人們鑒定[5],包括FANCA、FANCB、FANCC、FANCD1、FANCD2、FANCE、FANCF、FANCG、FANCI、FANCJ、FANCL、FANCM、FANCN、FANCO、FANCP、FANCQ、FANCR、FANCS、FANCT、FANCU、FANCV和FANCW。它們都參與一個共同的信號通路(FA途徑),此通路在DNA損傷或合成的過程中被激活[6]。因此,它們當(dāng)中任何一個缺失或功能不良都會極大地降低DNA修復(fù)效率或影響DNA復(fù)制,隨后染色體會發(fā)生斷裂且累積,導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定、衰老,最終導(dǎo)致癌癥。
范可尼貧血互補(bǔ)群E(Fanconi anemia complementation group protein E,F(xiàn)ANCE)定位于染色體6p21.22上,是構(gòu)成FA核心復(fù)合體的一個重要元件,能對FANCD2-FANCI異二聚體單泛素化,從而激活FA途徑。有研究稱[7],F(xiàn)ANCE與免疫微環(huán)境中多種細(xì)胞的浸潤密切相關(guān),促使腫瘤細(xì)胞增殖。越來越多的研究證據(jù)[8-9]也表明,F(xiàn)ANCE突變以及異常與多種腫瘤疾病密切相關(guān)。而且,本課題組Fu等[10]研究證實(shí),F(xiàn)ANCE基因缺陷的雌性小鼠的動情周期會發(fā)生變化,使得卵泡嚴(yán)重缺乏和卵巢發(fā)育不良,導(dǎo)致雌鼠生育能力受損。同時,在雄性突變小鼠睪丸中發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ANCE基因?qū)υ忌臣?xì)胞(primordial germ cells,PGCs)的擴(kuò)張起著關(guān)鍵作用[11]。然而,國內(nèi)外關(guān)于FANCE基本特性和結(jié)構(gòu)的系統(tǒng)研究甚少,早期文獻(xiàn)僅揭示了重復(fù)螺旋基序結(jié)構(gòu)的存在[12]和C-末端殘基可能介導(dǎo)FANCE-FANCD2相互作用[13],F(xiàn)ANCE分子如何參與多種腫瘤進(jìn)展的機(jī)制尚未得到充分闡明。
本文借助生物信息學(xué)方法,對人FANCE的理化性質(zhì)、親/疏水性、跨膜結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位、信號肽、蛋白二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)、優(yōu)勢抗原表位以及腫瘤相關(guān)性進(jìn)行分析,構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)和分子發(fā)育進(jìn)化樹,為深入闡明FANCE結(jié)構(gòu)以及在腫瘤中的作用提供參考,以期為FANCE新藥研發(fā)奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
從Uniprot網(wǎng)站(http://www.uniprot.org)下載相應(yīng)物種的FANCE氨基酸序列對應(yīng)信息:人類(Homo sapiens,Q9HB96)、金絲猴(Rhinopithecus bieti,A0A2K6N191)、小鼠(Mus musculus,B8JJD6)、牛(Bos taurus,A0A3Q1MJJ3)、雪貂(Mustela putorius furo,M3XWT0)、斑馬魚(Danio rerio,A8WG52)、白尾鹿(Odocoileus virginianus texanus,A0A6J0X0R7)、黑猩猩(Pan troglodytes,A0A2I3TF08)、食蟹獼猴(Macaca fascicularis,A0A2K5UN03)、蘇門達(dá)臘猩猩(Pongo abelii,H2PIT2)。
1.2 方法
運(yùn)用Clustal Omega和MEGA 11本地軟件對不同物種FANCE氨基酸序列結(jié)構(gòu)進(jìn)行同源性分析并構(gòu)建進(jìn)化樹。同時,按照表1中所示的相關(guān)數(shù)據(jù)庫及在線網(wǎng)站對FANCE的理化性質(zhì)、親/疏水性、信號肽、亞細(xì)胞定位、二級和三級結(jié)構(gòu)、翻譯后修飾位點(diǎn)、蛋白互作網(wǎng)絡(luò)以及表達(dá)與腫瘤相關(guān)性等進(jìn)行分析和預(yù)測。
2 結(jié)果與分析
2.1 FANCE的序列同源性對比分析
運(yùn)用Uniprot網(wǎng)站獲取不同物種FANCE的氨基酸序列,利用本地軟件 Clustal Omega進(jìn)行對比分析(圖1a)。結(jié)果顯示,人與斑馬魚、小鼠、雪貂、金絲猴、食蟹獼猴、蘇門答臘猩猩、黑猩猩、牛、白尾鹿的同源性分別為33.33%、59.55%、72.68%、94.96%、92.15%、96.26%、95.69%、77.30%、72.30%。同時,同源進(jìn)化樹(圖1b)表明,F(xiàn)ANCE在哺乳類動物中的親緣關(guān)系較近,具有高度的保守性,其中人與黑猩猩、蘇門達(dá)臘猩猩的親緣性最接近,其次為金絲猴和食蟹獼猴,而斑馬魚、小鼠聚為另一分支,與白尾鹿、牛以及雪貂親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。
2.2 FANCE的理化性質(zhì)分析
采用ProtParam對FANCE的理化性質(zhì)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示:該蛋白由536個氨基酸組成,其中亮氨酸(Leu,103個)占19.2%,含量最多;組氨酸(His,4個)和酪氨酸(Tyr,4個)占0.7%,含量最少;其中包含60個帶正電荷的氨基酸殘基(Arg + Lys)和73個帶負(fù)電荷的氨基酸殘基(Asp + Glu)(圖 2);分子式為C2575H4237N719O786S27,分子量為58 710.93 Da,等電點(diǎn)為5.17;280 nm波長處消光系數(shù)為45 210,半衰期為30 h。此外,該蛋白不穩(wěn)定系數(shù)為64.17,故可推測FANCE為不穩(wěn)定蛋白;其脂肪系數(shù)為94.63,親水性平均值為 -0.238。
2.3 FANCE的親/疏水性分析
采用ProtScale在線網(wǎng)站基于Hphob/Kyte&Doolittle算法對FANCE的親/疏水性進(jìn)行分析。結(jié)果顯示:FANCE有9個高分值峰區(qū)(Score>1.5),分別在氨基酸的第101~102、116~118、345、348、371、402~403、422~423、438~440、454~455位氨基酸,其中最高分值的氨基酸是第117位氨基酸的纈氨酸(Score=1.911);有4個低分值(Score<-2)的峰區(qū),分別在第183、185~205、215、225~236位氨基酸,其中最低分值的氨基酸是第229位的組氨酸(Score=-3.622)。FANCE大多數(shù)氨基酸位于疏水區(qū),推測是疏水性蛋白(圖 3)。
2.4 FANCE的信號肽和跨膜區(qū)分析
運(yùn)用SignalP 6.0對FANCE的信號肽序列進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,其中OTHER的值為 1.000 1,SP的值為 0,提示該蛋白不存在信號肽序列,推測FANCE可能不是分泌蛋白(圖 4)。運(yùn)用TMHMM Server 2.0對FANCE的跨膜結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,該蛋白不存在跨膜結(jié)構(gòu),推測FANCE是非跨膜蛋白(圖 5)。
2.5 FANCE的翻譯后修飾分析
NetNGlyc1.0預(yù)測FANCE存在2個N-糖基化位點(diǎn),分別是第359和503位氨基酸(圖 6);NetOGlyc4.0預(yù)測FANCE存在9個O-糖基化位點(diǎn),分別是第3、149、180、194、204、210、238、241和247位氨基酸;NetPhos3.1預(yù)測FANCE可能存在33個絲氨酸、13個蘇氨酸和2個酪氨酸磷酸化位點(diǎn)(圖 7)。GSP-Lipid1.0預(yù)測FANCE有15個脂質(zhì)修飾化位點(diǎn),其中包括2個N-肉豆蔻酰化位點(diǎn),分別是第7和10位氨基酸;13個S-棕櫚?;稽c(diǎn),分別是第68、94、160、168、222、319、328、345、391、399、421、422、477位氨基酸。
2.6 FANCE的亞細(xì)胞定位分析
PSORTII在線網(wǎng)站對FANCE進(jìn)行亞細(xì)胞定位,結(jié)果顯示,F(xiàn)ANCE分布于細(xì)胞核、細(xì)胞質(zhì)、線粒體、細(xì)胞骨架和細(xì)胞膜上的概率分別為 69.6%、17.4%、4.3%、4.3%、4.3%,推測其主要存在于細(xì)胞核內(nèi)和細(xì)胞質(zhì)中的概率較大。
2.7 FANCE的二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域分析
運(yùn)用SOPMA在線分析網(wǎng)站,對FANCE的二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,F(xiàn)ANCE含有290個α-螺旋、9個延伸鏈、18個β-轉(zhuǎn)角和219個無規(guī)則卷曲,其中α-螺旋占54.10%、延伸鏈占1.68%、β-轉(zhuǎn)角占3.36%、無規(guī)則卷曲占40.86%,充分說明α-螺旋和無規(guī)則卷曲是FANCE數(shù)量最多的主要結(jié)構(gòu)(圖 8)。 然后,NCBI網(wǎng)站的Conserved domain分析顯示,F(xiàn)ANCE屬于FANCE_C-term 超家族,該結(jié)構(gòu)域由261個氨基酸殘基構(gòu)成,包含與疾病相關(guān)的突變位點(diǎn)和蛋白-蛋白相互作用位點(diǎn)(圖 9)。
2.8 FANCE的三級結(jié)構(gòu)分析
利用SWISS-MODEL對FANCE的三級結(jié)構(gòu)模型進(jìn)行同源建模預(yù)測,得到一種預(yù)測模型。該模型的GMQE數(shù)值為0.77,在0~1.00之間,越接近1.00則模型質(zhì)量越好,序列的相似性為61%,相似波形圖穩(wěn)定,說明模型較可靠(圖 10a)。
進(jìn)一步運(yùn)用拉曼光譜圖驗(yàn)證FANCE的三級結(jié)構(gòu)模型的可靠性。結(jié)果顯示,87.5%的氨基酸殘基位于最合理區(qū)域內(nèi),10.9%的氨基酸殘基位于額外合理區(qū),0.9%的氨基酸位于一般合理區(qū),推導(dǎo)位于合理區(qū)間的總氨基酸殘基比例達(dá)99.3.%,說明該模型形成的二面角合理可靠(圖10b)。
2.9 FANCE相互作用的蛋白質(zhì)分析
采用STRING在線數(shù)據(jù)庫預(yù)測與FANCE發(fā)生相互作用的蛋白質(zhì),結(jié)果給出了TOP10蛋白質(zhì)相互作用的網(wǎng)絡(luò)圖(圖 11)和詳細(xì)得分信息(表 2)。相互作用的蛋白質(zhì)分別為FANCM、FANCD2、FANCC、FANCF、FANCG、FANCA、C1orf86、C17orf70、STRA13、APITD1。
2.10 FANCE的B/T細(xì)胞抗原表位和抗原決定簇分析
利用ABCpred Prediction Server對FANCE進(jìn)行B細(xì)胞表位預(yù)測,閾值設(shè)為0.5,分值大于0.5為B細(xì)胞表位,結(jié)果得到40個B細(xì)胞抗原表位(表 3),優(yōu)勢抗原表位為 269~288、220~239、314~333、211~230、230~249 等位點(diǎn);利用SYFPEITHI對FANCE的T細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測,分值大于20為T細(xì)胞表位,結(jié)果得到37個T細(xì)胞抗原表位(表 4),優(yōu)勢表位為 436~444、297~305、97~105、101~109、283~291、290~298、343~351 等位點(diǎn)。
利用Immunomedicine Group對FANCE抗原決定簇進(jìn)行分析,平均抗原傾向性為1.036 9,共17個抗原決定簇表位,主要位于氨基酸序列的13~34、42~49、62~75、81~127、131~138、153~170、235~241、247~258、273~296、306~409、415~426、430~444、449~460、467~480、488~498、508~514、523~532 位點(diǎn)(圖 12),表明該蛋白抗原傾向性高,容易形成抗原決定簇。
2.11 FANCE與腫瘤相關(guān)性分析
運(yùn)用GEPIA對FANCE的表達(dá)量進(jìn)行分析,結(jié)果顯示,F(xiàn)ANCE在彌漫性大B細(xì)胞淋巴瘤(lymphoid neoplasm diffuse large B-cell lymphoma,DLBC)、多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)、腦低級別膠質(zhì)瘤(brain lower grade glioma,LGG)、肺鱗狀細(xì)胞癌(lung squamous cell carcinoma,LUSC)、胸腺瘤(thymoma,THYM)中高表達(dá),在急性髓性白血?。╝cute myeloid leukemia,LAML)和皮膚黑色素瘤(skin cutaneous melanoma,SKCM)中低表達(dá)(P<0.05)(圖13)。對FANCE的預(yù)后分析顯示,其低表達(dá)與SKCM患者的總生存率(overall survival,OS)顯著相關(guān)(P<0.05),而與無病生存期(disease free survival,DFS)不相關(guān)(P>0.05)(圖14)。
3 討論
FA是一種遺傳染色體不穩(wěn)定綜合征,大多數(shù)FA患者都與FANC/BRCA通路相關(guān)蛋白的基因突變有關(guān)[14],這與本文預(yù)測FANCE是一個不穩(wěn)定的蛋白相符。Sumpter等 [15]的研究表明,F(xiàn)A基因中任何一個純合或雜合失活突變都會導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定,增加早發(fā)性骨髓衰竭和患癌率,特別是乳腺癌、食道癌、泌尿系統(tǒng)以及頭頸部腫瘤等[16]。近年來,全世界被診斷為癌癥患者的數(shù)量不斷增加,癌癥復(fù)發(fā)率又高,針對特定基因異?;蚍肿犹卣鞯哪[瘤類型無關(guān)治療已經(jīng)成為一種革命性的癌癥治療方法[17]。因此,本研究利用生物信息學(xué)對FANCE的分子特性和抗原表位進(jìn)行預(yù)測。
不同物種FANCE氨基酸序列比對顯示,人與金絲猴、食蟹獼猴、蘇門答臘猩猩、黑猩猩的同源性都超過90.0%,F(xiàn)ANCE表現(xiàn)出高度的進(jìn)化保守性。以往研究[18]也證實(shí)這些核心復(fù)合體基因表現(xiàn)出管家基因的特征屬性,具有高度序列保守性。另外,本文發(fā)現(xiàn)FANCE是一種無信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)的疏水性蛋白質(zhì),主要定位在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì),推測FANCE基因產(chǎn)物主要位于人類細(xì)胞核和細(xì)胞漿中,這與Sondalle等[19]報(bào)道FA蛋白定位于核仁,還在核糖體中起生物合成作用的證據(jù)相一致。本文蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析表明,F(xiàn)ANCE以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主,α-螺旋結(jié)構(gòu)一般位于蛋白質(zhì)內(nèi),而無規(guī)則卷曲則位于蛋白質(zhì)表面,易于和抗體相結(jié)合,成為抗原表位區(qū)。另外,該蛋白三級空間結(jié)構(gòu)表明該模型具有合理和穩(wěn)定的分子二面角結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)鏈呈現(xiàn)帶狀,從N端的藍(lán)色到C末端的紅色呈現(xiàn)彩虹色。有研究稱,F(xiàn)ANCE蛋白的結(jié)構(gòu)特征對其促進(jìn)復(fù)合體的完整性發(fā)揮著重要作用,尤其是位于高度保守的C末端的苯丙氨酸(Phe)是介導(dǎo)FANCD2-FANCI復(fù)合物單泛素化的關(guān)鍵殘基[20]。此外,本研究預(yù)測FANCE存在2個N-糖基化位點(diǎn)、9個O-糖基化位點(diǎn)和48個磷酸化位點(diǎn)。糖基化異常一般與腫瘤相關(guān)聯(lián),磷酸化則是生命體重要的修飾方式。早期Wang等[21]報(bào)道,Chk1可以直接磷酸化FANCE蛋白亞單位(T346和S374),這與本文預(yù)測的磷酸化位點(diǎn)結(jié)果相符,特別是S374,我們預(yù)測該位點(diǎn)能夠被PKA、RSK和DNAPK激酶磷酸化的可能性是最大的。Yu等[22]通過雙熒光素酶試驗(yàn)證實(shí)miR-26a-5p可以下調(diào)FANCE,促進(jìn)晶狀體上皮細(xì)胞的遷移、增殖和轉(zhuǎn)化,提示我們調(diào)節(jié)FANCE還可能存在額外的途徑。
蛋白相互作用提示,F(xiàn)ANCE能與FANCM、FANCD2、FANCC、FANCF、FANCG、FANCA、STRA13、APITD1等蛋白發(fā)生相互作用,以上這些蛋白都參與了FA途徑,協(xié)調(diào)DNA鏈間交聯(lián)損傷修復(fù),這與相關(guān)文獻(xiàn)[23]提出的單泛素化FANCI-FANCD2的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)相一致。在斑馬魚研究中,F(xiàn)ANCE被證實(shí)是蛋白相互作用的關(guān)鍵介質(zhì),對維持正常生長發(fā)育、基因組完整性和生育能力是至關(guān)重要的[24]。STRA13是一種轉(zhuǎn)錄抑制因子,在細(xì)胞分化、再生、免疫內(nèi)環(huán)境平衡和新陳代謝方面具有重要作用[25]。APITD1上調(diào)可以抑制非小細(xì)胞肺癌的遷移、生長和侵襲[26]。在蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中,F(xiàn)ANCE與這些蛋白關(guān)系密切,說明FANCE在腫瘤和代謝生長等疾病中發(fā)揮了一定的作用,但后續(xù)還需結(jié)合試驗(yàn)才能闡明其可能的分子機(jī)制。
然后,本文還預(yù)測FANCE含有多個潛在的B/T細(xì)胞優(yōu)勢抗原表位和17個抗原決定簇。綜合分析B細(xì)胞表位和T細(xì)胞表位,292~306和401~410位點(diǎn)具有較強(qiáng)的免疫原性,F(xiàn)ANCE半衰期也達(dá)30 h,能作為免疫抗原在宿主體內(nèi)穩(wěn)定停留較長時間,這些特性都將為重大疾病的表位鑒定和高效多表位抗原疫苗的設(shè)計(jì)發(fā)揮重要作用。我們還通過GEPIA數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ANCE在DLBC、GBM、LGG、LUSC、THYM存在高水平表達(dá),但在LAML和SKCM的表達(dá)水平低于癌旁正常組織,可推測FANCE的表達(dá)在這兩種腫瘤組織中被抑制。據(jù)以往文獻(xiàn)報(bào)道,F(xiàn)A患者易患各種類型的癌癥,例如,F(xiàn)ANCD1和FANCN突變的患者通常存在LAML和胚胎腫瘤(神經(jīng)母細(xì)胞瘤、成神經(jīng)管細(xì)胞瘤和腎母細(xì)胞瘤),而其他FA互補(bǔ)群中具有突變的患者則發(fā)展為LAML和鱗狀細(xì)胞癌[27-28]。Park等[29]通過對比急性和非急性早幼粒細(xì)胞性白血病中的表達(dá)數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)前者相關(guān)的DNA修復(fù)基因表達(dá)顯著低于后者,而且DNA修復(fù)基因過度表達(dá)可能是非急性早幼粒細(xì)胞性白血病中一個不良的預(yù)后標(biāo)志物。Takahashi等[30]發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ANCE在HCC(hepatocellular carcinoma)中高表達(dá),高表達(dá)的FANCE對總生存率有著顯著影響,F(xiàn)ANCE可能為肝癌提供潛在的治療靶點(diǎn)。本研究也發(fā)現(xiàn),高水平表達(dá)FANCE的SKCM患者的總生存率同樣明顯下降,推測FANCE可能通過FA途徑在腫瘤進(jìn)展中發(fā)揮關(guān)鍵作用,也可能成為評估SKCM病情發(fā)展的標(biāo)志物。
綜上所述,本文對FANCE的基本特性、分子空間結(jié)構(gòu)、相互作用蛋白、B/T細(xì)胞抗原表位以及腫瘤相關(guān)性進(jìn)行多方位探究,為進(jìn)一步研究FANCE在腫瘤中的分子機(jī)制提供依據(jù),以期FANCE成為治療癌癥的新靶標(biāo)。
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收稿日期:2022-10-24;修回日期:2022-11-25。
基金項(xiàng)目:國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(82271674);湖南省自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(2022JJ30804)。
作者簡介:王道,主管技師,主要從事女性生殖系統(tǒng)疾病的基礎(chǔ)研究。
* 通信作者:符淳,主任醫(yī)師,主要從事婦科腫瘤等疾病的研究。E-mail: fuchun0814@csu.edu.cn。