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    豬流行性腹瀉病毒Nsp6蛋白的分段表達(dá)及多克隆抗體制備

    2024-01-05 06:04:38陳東奇鄭殿重魏志穎王瑩李佳璇崔文姜艷平王曉娜周晗王麗喬薪瑗李一經(jīng)唐麗杰單智夫
    畜牧與獸醫(yī) 2024年1期
    關(guān)鍵詞:小鼠

    陳東奇,鄭殿重,2,魏志穎,王瑩,李佳璇,崔文,姜艷平,王曉娜,周晗,王麗,喬薪瑗,李一經(jīng),唐麗杰,單智夫*

    (1.東北農(nóng)業(yè)大學(xué)動物醫(yī)學(xué)學(xué)院,黑龍江 哈爾濱 150030;2.黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧所,黑龍江 哈爾濱 150030)

    豬流行性腹瀉(porcine epidemic diarrhea,PED)是由豬流行性腹瀉病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)感染引起豬的一種急性烈性腸道傳染病。該病呈世界性分布,以腹瀉、脫水、嘔吐為主要臨床特征,??蓪?dǎo)致仔豬死亡。PEDV感染嚴(yán)重影響動物的生產(chǎn)性能,自2010年以來,在包括中國在內(nèi)的主要養(yǎng)豬國家暴發(fā)和流行,成為最重要的豬病毒性腹瀉病之一,極大地阻礙了全球養(yǎng)豬業(yè)的健康發(fā)展[1]。對于PED的防控,最主要的措施是接種疫苗。然而,由于PEDV亞型多、具有很強(qiáng)的變異性,且存在持續(xù)性感染,接種疫苗并沒有達(dá)到預(yù)期的預(yù)防效果。PEDV的致病機(jī)制復(fù)雜,臨床上目前沒有有效的治療藥物。因此,深入研究PEDV的致病機(jī)制對該病的防控具有重要意義。

    細(xì)胞自噬是一種具有多種調(diào)節(jié)功能、可維持真核細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的正常細(xì)胞生理活動。目前研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞自噬與病毒的感染與復(fù)制之間存在著密切的聯(lián)系,如自噬可降解侵染細(xì)胞的病毒,同時病毒可阻礙自噬的發(fā)生,以逃避自噬對其本身復(fù)制的影響,甚至某些病毒會利用自噬體促進(jìn)自我復(fù)制。目前對PEDV感染的致病機(jī)制,尤其是誘導(dǎo)細(xì)胞自噬的機(jī)制仍不十分清楚。Guo等[2]發(fā)現(xiàn)自噬有利于PEDV復(fù)制,并且自噬可能與炎性細(xì)胞因子的表達(dá)有關(guān),在PEDV感染期間與NF-κB信號通路具有正反饋調(diào)節(jié)作用。用雷帕霉素誘導(dǎo)細(xì)胞自噬會抑制PEDV的感染,并減輕PEDV誘導(dǎo)上皮細(xì)胞的死亡[3]。Sun等[4]發(fā)現(xiàn)活性氧(reactive oxygen species,ROS)在PEDV感染期間在調(diào)節(jié)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum,ER)應(yīng)激介導(dǎo)的自噬中發(fā)揮重要作用,并且PERK和IER1通路參與誘導(dǎo)ROS依賴性內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激介導(dǎo)的自噬。Lin等[5]篩選出PEDV非結(jié)構(gòu)蛋白6(Nsp6)可誘導(dǎo)IPEC-J2細(xì)胞發(fā)生細(xì)胞自噬,是能夠引起細(xì)胞自噬的關(guān)鍵蛋白,然而其誘導(dǎo)細(xì)胞自噬的關(guān)鍵功能域尚未確定。因此,本研究獲得了在大腸桿菌系統(tǒng)中重組表達(dá)的PEDV Nsp6重組蛋白,純化后免疫小鼠制備相應(yīng)的多克隆抗體,用于鑒定Nsp6 分段基因的真核表達(dá)情況,為進(jìn)一步確定Nsp6蛋白誘導(dǎo)細(xì)胞自噬的關(guān)鍵功能域奠定基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    4周齡雌性BALB/c小鼠購自遼寧長生實(shí)驗(yàn)動物中心。PEDV毒株CH/HLJ/18(GenBank:MW561264.1)、豬小腸上皮細(xì)胞IPEC-J2購自上海信裕生物科技有限公司;鼠抗PEDV-N蛋白單克隆抗體、pMD19-T Simple載體、pSUMO原核表達(dá)載體pCMV-HA真核表達(dá)載體、大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞及大腸桿菌Rosetta感受態(tài)細(xì)胞均由本實(shí)驗(yàn)室保存;小鼠抗His標(biāo)簽、HA標(biāo)簽單克隆抗體均購自賽默飛世爾科技公司;HRP/FITC標(biāo)記山羊抗小鼠IgG抗體購自北京中杉金橋公司;T4 DNA連接酶、dNTP Mixture、DNA Marker 及PageRulerTMPlus預(yù)染蛋白分子量標(biāo)準(zhǔn)購自寶生物工程(大連)公司;中劑量質(zhì)粒提取試劑盒購自Promega公司;限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、XhoⅠ和EcoRⅠ均購自NEB公司;其他所用試劑均為分析純。

    1.2 PCR引物的設(shè)計(jì)與合成

    參照GenBank中PEDV Nsp6基因序列(Gene ID:935181)及SMART網(wǎng)站對Nsp6基因功能域的預(yù)測,將Nsp6基因分為Nsp6-1、Nsp6-2、Nsp6-3段,并使用Oligo 6.0軟件設(shè)計(jì)克隆引物對Nsp6-F/Nsp6-R、N1-F/N1-R、N2-F/N2-R和N3-F/N3-R(見表1),分別用于PEDV Nsp6、Nsp6-1、Nsp6-2、Nsp6-3基因的擴(kuò)增。

    表1 引物序列

    1.3 目的基因的擴(kuò)增及重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定

    提取感染PEDV 的 IPEC-J2 細(xì)胞總RNA,經(jīng)反轉(zhuǎn)錄成cDNA后,以Nsp6-F/Nsp6-R為引物對,擴(kuò)增PEDV Nsp6基因。PCR擴(kuò)增結(jié)束后,對PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化并對回收片段雙酶切(BamHⅠ和XhoⅠ),再利用T4 DNA連接酶在16 ℃下作用14 h,連接到同樣雙酶切處理的pSUMO原核表達(dá)載體上。將連接產(chǎn)物熱轉(zhuǎn)化至大腸桿菌Rosetta感受態(tài)細(xì)胞,涂布在含卡那霉素抗性的LB固體培養(yǎng)基上,倒置于37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng);12 h后隨機(jī)挑取單菌落并進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒。一方面以質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR鑒定;另一方面進(jìn)行雙酶切鑒定,鑒定正確的質(zhì)粒送吉林庫美有限公司進(jìn)行測序驗(yàn)證,測序正確的質(zhì)粒命名為pSUMO-Nsp6,菌種命名為pSUMO-Nsp6/Rosetta。

    以pSUMO-Nsp6質(zhì)粒為模板,分別以Nsp6-F/Nsp6-R、N1-F/N1-R、N2-F/N2-R及N3-F/N3-R為引物對,PCR擴(kuò)增PEDV Nsp6、Nsp6-1、Nsp6-2、Nsp6-3基因。將膠回收產(chǎn)物與pMD19-T Simple連接,再將連接產(chǎn)物熱轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂布在含氨芐青霉素抗性的LB固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)后隨機(jī)挑取單菌落并進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒。一方面以質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR鑒定;另一方面進(jìn)行單、雙酶切鑒定,均正確的質(zhì)粒送吉林庫美有限公司進(jìn)行測序驗(yàn)證,測序正確的質(zhì)粒分別命名為pMD-19T-Nsp6、pMD-19T-Nsp6-1、pMD-19T-Nsp6-2、pMD-19T-Nsp6-3,菌種分別命名為pMD-19T-Nsp6/DH5α、pMD-19T-Nsp6-1/DH5α、pMD-19T-Nsp6-2/DH5α、pMD-19T-Nsp6-3/DH5α。

    分別提取pMD-19T-Nsp6、pMD-19T-Nsp6-1、pMD-19T-Nsp6-2、pMD-19T-Nsp6-3及pCMV-HA質(zhì)粒,利用限制性核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ和XhoⅠ進(jìn)行雙酶切,利用膠回收試劑盒回收目的片段。將膠回收的目的片段與pCMV-HA真核表達(dá)載體連接,并將連接產(chǎn)物熱轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞培養(yǎng);12 h后隨機(jī)挑取單菌落并進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng),提取質(zhì)粒。一方面以質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR鑒定;另一方面進(jìn)行單、雙酶切鑒定,均正確的質(zhì)粒送吉林庫美有限公司進(jìn)行測序驗(yàn)證,測序正確的質(zhì)粒分別命名為pCMV-Nsp6、pCMV-Nsp6-1、pCMV-Nsp6-2、pCMV-Nsp6-3,菌種分別命名為pCMV-Nsp6/DH5α、pCMV-Nsp6-1/DH5α、pCMV-Nsp6-2/DH5α、pCMV-Nsp6-3/DH5α。

    1.4 PEDV Nsp6的原核表達(dá)及鑒定

    將重組大腸桿菌pSUMO-Nsp6/Rosetta培養(yǎng)至OD600 nm為0.5時,取1 mL誘導(dǎo)前的菌體和上清液樣品作為對照,其余加入IPTG進(jìn)行誘導(dǎo),使IPTG終濃度為1.0 mmol/L,于37 ℃震蕩培養(yǎng)12 h后,離心收集菌體沉淀重懸并超聲破碎,再次離心后分別收集超聲后的沉淀和上清液,分別加入125 μL 5×SDS,混勻后置于沸水中作用10 min,用于SDS-PAGE和Western blot鑒定。分別配制12%分離膠和5%積層膠,用于SDS-PAGE檢測。點(diǎn)樣后進(jìn)行電泳,80 V電泳1 h,120 V電泳2 h;電泳結(jié)束,將凝膠放入考馬斯亮藍(lán)染色液中,置于室溫染色30 min,經(jīng)脫色液脫色后,觀察蛋白表達(dá)情況。用同樣方法將電泳后的蛋白轉(zhuǎn)印至0.2 μm PVDF膜,在100 V電壓下濕轉(zhuǎn)1.5 h;放入5%脫脂乳在室溫條件下封閉2 h后,利用 1×PBST反復(fù)清洗PEDV膜并加入小鼠抗His標(biāo)簽的單克隆抗體作為一抗,辣根過氧化物酶標(biāo)記的標(biāo)記山羊抗鼠IgG為二抗,依次經(jīng)室溫孵育1 h后進(jìn)行ECL顯色。

    1.5 真核表達(dá)質(zhì)粒的轉(zhuǎn)染與蛋白表達(dá)和鑒定

    使用Promega中劑量質(zhì)粒提取試劑盒制備無內(nèi)毒素質(zhì)粒pCMV-Nsp6、pCMV-Nsp6-1、pCMV-Nsp6-2和pCMV-Nsp6-3備用,將IPEC-J2細(xì)胞鋪至24孔板中,調(diào)整細(xì)胞密度為5×105個/孔,待細(xì)胞長成單層后進(jìn)行轉(zhuǎn)染。向無菌EP管中依次加入50 μL無血清Opti-MEM培養(yǎng)液、轉(zhuǎn)染試劑Lipo3000(LipofectamineTM3000 Transfection Reagent,Thermo,L3000001)3 μL及去內(nèi)毒素的重組質(zhì)粒1 μg,輕柔混勻,室溫作用5 min;向EP管中加入P3000 (LipofectamineTM3000 Transfection Reagent,Thermo,L3000001)2 μL,輕柔混勻,室溫作用20 min;清洗IPEC-J2細(xì)胞單層,每孔加入150 μL無血清的DMEM培養(yǎng)液,并向孔板中均勻滴加轉(zhuǎn)染試劑。轉(zhuǎn)染 24 h收集細(xì)胞,再通過以鼠抗HA標(biāo)簽單抗為一抗的免疫熒光法(IFA)和以小鼠抗Nsp6多抗為一抗的Western blot檢測法來判定Nsp6及截短蛋白在細(xì)胞中的表達(dá)情況。

    1.6 PEDV Nsp6蛋白的純化及多克隆抗體的制備

    取200 mL誘導(dǎo)后的重組大腸桿菌pSUMO-Nsp6/Rosetta菌液,按照1.4所述方法制備蛋白樣并進(jìn)行SDS-PAGE;電泳結(jié)束后,將凝膠放入提前配制好的低溫KCl溶液中染色10 s,使用刀片切下白色的目的帶并將其放入含2 mL電泳緩沖液的透析袋中浸沒;正向100 V電泳2 h后,再反向電泳10 min,使蛋白從膠中析出;取出剩余膠條,將透析袋浸沒于1×PBS中,4 ℃平衡12 h;收集透析袋中溶液獲得純化的目的蛋白。

    每100 μg純化的PEDV Nsp6蛋白與100 μL弗氏完全佐劑混合,充分乳化后分別在第0、7和14天按每只50、50和100 μg的劑量腹腔注射免疫4周齡BALB/c小鼠。第3次免疫完成后7 d,采集小鼠血清,并采用間接ELISA方法測定血清抗體效價。以PEDV CH/HLJ/18株細(xì)胞培養(yǎng)毒包被酶標(biāo)板,封閉后,按照1∶20、1∶40、1∶80……1∶20 480倍比稀釋待檢血清并孵育,再添加辣根過氧化物酶標(biāo)記的山羊抗鼠IgG作為二抗,加入顯色液作用后終止反應(yīng),并用全波長酶標(biāo)儀讀取各孔OD450 nm值。不同稀釋度血清與陰性對照OD值比值(P/N)≥2的最大稀釋度判定為血清抗體的效價。

    1.7 鼠抗PEDV Nsp6蛋白多克隆抗體的特異性檢測

    通過Western blot首先驗(yàn)證鼠抗PEDV Nsp6蛋白多克隆抗體與Nsp6蛋白的結(jié)合情況。先將純化的Nsp6蛋白樣轉(zhuǎn)印至PVDF膜,加入1∶200稀釋的多克隆抗體孵育后再加入HRP標(biāo)記山羊抗鼠IgG作為二抗,最后進(jìn)行ECL顯色。為檢測多克隆抗體與PEDV培養(yǎng)物結(jié)合的情況,將PEDV細(xì)胞培養(yǎng)物及IPEC-J2細(xì)胞蛋白樣轉(zhuǎn)印至PVDF膜,按1∶200加入稀釋后的多克隆抗體孵育,再加入HRP標(biāo)記山羊抗鼠IgG作為二抗,最后進(jìn)行ECL顯色。

    2 結(jié)果

    2.1 目的基因的擴(kuò)增及重組質(zhì)粒的鑒定

    提取PEDV的RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以cDNA為模板,擴(kuò)增Nsp6基因片段并將其構(gòu)建到重組質(zhì)粒pSUMO-Nsp6,經(jīng)過PCR鑒定,可獲得大小為840 bp的目的條帶(圖1A)。再利用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、XhoⅠ進(jìn)行雙酶切鑒定,可以獲得大小約為5 598 bp的載體片段及大小約為840 bp的目的條帶(圖1B)。

    M1.DNA Marker DL2000;1.pSUMO-Nsp6 PCR鑒定結(jié)果;2.陰性對照;M2.DNA Marker DL8000;3.pSUMO-Nsp6 BamHⅠ、XhoⅠ雙酶切鑒定。

    以pSUMO-Nsp6質(zhì)粒為模板,利用EcoRⅠ及XhoⅠ切割下Nsp6并連接至pCMV-HA真核表達(dá)載體上,獲得重組質(zhì)粒pCMV-Nsp6。根據(jù)SMART網(wǎng)站對Nsp6功能域的預(yù)測,將Nsp6基因分為3段,分別連接到pCMV-HA真核表達(dá)載體上,構(gòu)建出pCMV-Nsp6-1、pCMV-Nsp6-2和pCMV-Nsp6-3三種重組質(zhì)粒,并進(jìn)一步進(jìn)行PCR鑒定,獲得長度分別為840、258、210 和402 bp的目的片段(圖2A);再次經(jīng)過限制性內(nèi)切酶進(jìn)行單、雙酶切鑒定后獲得相應(yīng)大小的目的片段(圖2B)。

    M1.DNA Marker DL2000;1.陰性對照;2.pCMV-Nsp6 PCR鑒定;3.pCMV-Nsp6-1 PCR鑒定;4.pCMV-Nsp6-2 PCR鑒定;5.pCMV-Nsp6-3 PCR鑒定;M2.DNA Marker DL8000;6.pCMV-Nsp6 EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切鑒定;7.pCMV-Nsp6 EcoRⅠ單酶切鑒定;8.pCMV-Nsp6 XhoⅠ單酶切鑒定;9.pCMV-Nsp6-1 EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切鑒定;10.pCMV-Nsp6-1 EcoRⅠ單酶切鑒定;11.pCMV-Nsp6-1 XhoⅠ單酶切鑒定;12.pCMV-Nsp6-2 EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切鑒定;13.pCMV-Nsp6-2 EcoRⅠ單酶切鑒定;14.pCMV-Nsp6-2 XhoⅠ單酶切鑒定;15.pCMV-Nsp6-3 EcoRⅠ、XhoⅠ雙酶切鑒定;16.pCMV-Nsp6-3 EcoRⅠ單酶切鑒定;17.pCMV-Nsp6-3 XhoⅠ單酶切鑒定。

    2.2 Nsp6蛋白原核表達(dá)及純化鑒定

    將鑒定正確的重組菌pSUMO-Nsp6/Rosetta進(jìn)行大量培養(yǎng),用IPTG誘導(dǎo)蛋白表達(dá)。經(jīng)SDS-PAGE分析后結(jié)果如圖3A所示,誘導(dǎo)后菌體和超聲后菌體沉淀及上清液中,在47 kDa處可見目的蛋白表達(dá)條帶。以帶His標(biāo)簽的單克隆抗體為一抗通過Western blot對其進(jìn)一步鑒定,結(jié)果表明可在正確位置出現(xiàn)特異性條帶(圖3B)。

    M.蛋白Marker;1.誘導(dǎo)后上清液;2.誘導(dǎo)12 h菌體;3.誘導(dǎo)12 h超聲后沉淀,4.誘導(dǎo)12 h超聲后上清液;5.誘導(dǎo)前菌體沉淀;6~7.純化的Nsp6蛋白;8.空載體對照。

    2.3 鼠抗Nsp6多克隆抗體的鑒定及效價的測定

    將純化的Nsp6蛋白免疫小鼠,3次免疫后收集小鼠血清。為了驗(yàn)證所制多抗是否能夠與Nsp6蛋白相結(jié)合,利用Western blot法分別檢測含有SUMO標(biāo)簽的Nsp6蛋白及PEDV病毒培養(yǎng)物中的Nsp6蛋白與制備的鼠抗PEDV Nsp6多克隆抗體的結(jié)合情況,結(jié)果如圖4所示,分別檢測到約為47 kDa大小的含SUMO標(biāo)簽的Nsp6及約為32 kDa大小的PEDV Nsp6 蛋白條帶,說明所制多抗能夠與含SUMO標(biāo)簽的Nsp6蛋白和PEDV的Nsp6蛋白相結(jié)合。利用間接ELISA檢測免疫小鼠血清抗體效價,結(jié)果如圖5所示,P/N≥2時,血清最大稀釋比例為 1∶10 240,即制備的鼠抗Nsp6多克隆抗體的效價為1∶10 240。

    M.蛋白Marker;1.純化的Nsp6蛋白(含SUMO標(biāo)簽);2.空白細(xì)胞對照;3.PEDV培養(yǎng)物中Nsp6蛋白。

    圖5 間接ELISA方法檢測鼠抗Nsp6多克隆抗體效價

    2.4 Nsp6截短片段的真核表達(dá)及鑒定

    為確定連接真核表達(dá)載體的Nsp-6及其截短蛋白在IPEC-J2細(xì)胞中的表達(dá)情況,首先利用IFA檢測Nsp6及各截短片段轉(zhuǎn)染至IPEC-J2細(xì)胞中的表達(dá)情況,結(jié)果如圖6A所示。以鼠抗HA標(biāo)簽抗體作為一抗,F(xiàn)ITC標(biāo)記山羊抗小鼠IgG作為二抗,轉(zhuǎn)染后4種質(zhì)粒均可在IPEC-J2細(xì)胞中檢測到綠色熒光,表明目的蛋白獲得表達(dá)。再利用Western blot檢測pCMV-Nsp6、pCMV-Nsp6-1、pCMV-Nsp6-2、pCMV-Nsp6-3在IPEC-J2細(xì)胞中的表達(dá),結(jié)果如圖6B所示。在鼠抗Nsp6多克隆抗體的作用下,分別在32、10.6、8.7和15 kDa的位置檢出符合預(yù)期大小的蛋白條帶,表明4種蛋白在IPEC-J2細(xì)胞中均獲得表達(dá)。

    M.蛋白Marker;1.Nsp6;2、6.細(xì)胞對照;3.Nsp6-1;4.Nsp6-2;5.Nsp6-3。

    3 討論

    PEDV是具有囊膜的單鏈正向RNA病毒,其RNA基因組大小約為28 kb[6]。PEDV基因組編碼4種結(jié)構(gòu)蛋白:刺突蛋白(S)、囊膜蛋白(E)、膜蛋白(M)和核衣殼蛋白(N),以及16種非結(jié)構(gòu)蛋白(Nsp1~Nsp16)和輔助蛋白ORF3[7]。非結(jié)構(gòu)蛋白是冠狀病毒復(fù)制和形成轉(zhuǎn)錄復(fù)合物(RTC)以及逃避免疫系統(tǒng)的關(guān)鍵要素。通過劫持內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜,Nsps幫助病毒建立RTC[8]。目前對于與PEDV同屬冠狀病毒成員SARS-CoV2的研究表明,Nsp6蛋白也能夠引起細(xì)胞自噬[9]。Cottam 等[10]發(fā)現(xiàn)Nsp6可以誘導(dǎo)宿主細(xì)胞中的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)形成自噬體。通過突變Nsp6可以導(dǎo)致SARS-CoV-2的毒性降低,從而影響病毒的致病性[11]。對以傳染性支氣管炎病毒為代表的禽冠狀病毒研究也證明了Nsp6損害了由饑餓誘導(dǎo)的自噬溶酶體的形成[12],進(jìn)一步證明了Nsp6蛋白對自噬的復(fù)雜調(diào)節(jié)作用。Nsp6、Nsp1及Nsp12蛋白具有干擾素拮抗作用[13]。此外,Nsp6能夠與TANK激酶1(TBK1)結(jié)合并在不影響TBK1的磷酸化的基礎(chǔ)上抑制IRF3的磷酸化,從而減少Ⅰ型干擾素的產(chǎn)生[14]。Nsp6和Nsp13能夠通過抑制信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子1和2(STAT1和STAT2)的磷酸化進(jìn)而抑制干擾素信號的傳導(dǎo)[15]。

    Nsp6 在PEDV感染IPEC-J2細(xì)胞的過程中也對誘發(fā)細(xì)胞自噬產(chǎn)生重要的作用[4],然而目前針對Nsp6蛋白引起細(xì)胞自噬產(chǎn)生的具體功能域研究則鮮有報道。為進(jìn)一步確定Nsp6蛋白誘導(dǎo)細(xì)胞自噬產(chǎn)生的關(guān)鍵功能域,本試驗(yàn)通過SMART網(wǎng)站對Nsp6蛋白的潛在結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測,評估了蛋白可能的跨膜區(qū)域。在盡量不破壞其原有的結(jié)構(gòu)域基礎(chǔ)上,將Nsp6基因分段為3段,分別構(gòu)建真核表達(dá)質(zhì)粒,并轉(zhuǎn)染至IPEC-J2細(xì)胞中表達(dá)。

    為確定Nsp6及其分段基因的真核表達(dá)情況,本試驗(yàn)構(gòu)建重組原核表達(dá)質(zhì)粒pSUMO-Nsp6,并將其在大腸桿菌中原核表達(dá),獲得的蛋白用于制備抗Nsp6 蛋白的多克隆抗體。Western blot結(jié)果表明,該抗體既可以與含SUMO標(biāo)簽的Nsp6原核表達(dá)蛋白結(jié)合,又可以與PEDV的天然Nsp6蛋白相結(jié)合,說明該抗體能夠用于識別PEDV,且通過Western blot確定了Nsp6及其分段基因在IPEC-J2細(xì)胞中均得到了表達(dá)。

    總之,本文為進(jìn)一步確定Nsp6蛋白誘導(dǎo)細(xì)胞自噬的關(guān)鍵功能域做好了鋪墊,為闡明PEDV在感染宿主上皮細(xì)胞IPEC-J2過程中的分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ),對深入了解PEDV的致病機(jī)理提供重要線索,也為研究PEDV的抗病毒藥物提供重要的靶點(diǎn)。

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