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    肺腺癌焦亡相關(guān)特征模型的構(gòu)建和驗(yàn)證

    2023-11-29 04:01:08王楊淑怡林志豪黃約諾董曉亭
    檢驗(yàn)醫(yī)學(xué) 2023年9期
    關(guān)鍵詞:差異分析

    王楊淑怡 葉 威 林志豪 黃約諾 方 濤 董曉亭

    (浙江中醫(yī)藥大學(xué)附屬溫州中醫(yī)院,浙江 溫州 325000)

    細(xì)胞焦亡是一種程序性細(xì)胞死亡的形式,由炎癥小體觸發(fā),被半胱氨酸天冬氨酸特異性蛋白酶(cysteine-containing aspartate-specific protease,Caspase)執(zhí)行,以質(zhì)膜的快速破裂和促炎因子的釋放為特征[1]。細(xì)胞焦亡可分為Caspase-1依賴(lài)的經(jīng)典途徑和Caspase-4、Caspase-5、Caspase-11依賴(lài)的非經(jīng)典途徑[1]。Caspase-1依賴(lài)的經(jīng)典途徑可以被細(xì)菌、病毒等[2]激活,使消皮素D(gasdermin D,GSDMD)家族蛋白被剪切生成N端和C端,GSDMD與細(xì)胞膜磷脂結(jié)合形成10~20 nm的小孔,細(xì)胞內(nèi)容物通過(guò)孔隙緩慢釋放,觸發(fā)炎癥反應(yīng)[3]。細(xì)胞逐漸變平,產(chǎn)生 1~5 μm的凋亡囊泡狀突起,并逐漸膨脹,直至質(zhì)膜破裂[3]。Caspase-4、Caspase-5、Caspase-11依賴(lài)的非經(jīng)典途徑可由脂多糖等致炎因子激活,生成GSDMD氮端活性域的肽段,引起炎癥反應(yīng),啟動(dòng)細(xì)胞焦亡[3]。

    越來(lái)越多的研究發(fā)現(xiàn),細(xì)胞焦亡與腫瘤的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān)[4-5]。長(zhǎng)期、慢性的炎癥可能導(dǎo)致局部組織的異常增生,進(jìn)而發(fā)生癌變[4-5]。GAO等[2]的研究結(jié)果顯示,非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者GSDMD表達(dá)顯著上調(diào),參與了腫瘤的病理進(jìn)展。WANG等[6]發(fā)現(xiàn),辛伐他丁通過(guò)激活炎癥小體核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體3(nucleotidebinding oligomerization domain-like receptor 3,NLRP3)激活Caspase-1,介導(dǎo)細(xì)胞焦亡的經(jīng)典途徑,抑制癌細(xì)胞的增殖和遷移。肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)是NSCLC的常見(jiàn)病理類(lèi)型,患者的生存率和預(yù)后往往較差,因此制定有效的LUAD治療策略迫在眉睫[7]。目前,LUAD與細(xì)胞焦亡之間關(guān)系的研究較少。本研究通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)算法分析細(xì)胞焦亡基因在LUAD癌組織中的表達(dá)特征,及其在患者預(yù)后評(píng)估中的價(jià)值,為制定LUAD的干預(yù)措施提供一個(gè)新的思路。

    1 材料和方法

    1.1 數(shù)據(jù)收集

    從腫瘤基因組圖譜(the Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://portal.gdc.cancer.gov/)下載LUAD患者的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和對(duì)應(yīng)的臨床資料(截至2021月1月28日),包括535例LUAD癌組織樣本和59例癌旁組織樣本。TCGA-LUAD數(shù)據(jù)集采用R軟件limma程序包進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理(TCGA隊(duì)列)。

    從基因表達(dá)綜合(Gene Expression Omnibus,GEO)數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo)下載符合條件的LUAD轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和對(duì)應(yīng)的臨床數(shù)據(jù)。篩選條件:1)樣本量較大;2)包含年齡、性別、生存狀態(tài)、生存期等臨床信息。根據(jù)篩選條件納入符合條件的GEO隊(duì)列(GSE72094數(shù)據(jù)集),并進(jìn)行注釋。

    1.2 差異表達(dá)基因分析

    從GeneGards數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出r>0.1的細(xì)胞焦亡相關(guān)基因。在Pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/)中檢索關(guān)鍵詞“pyroptosis”,驗(yàn)證上述焦亡相關(guān)基因,共鑒定出52個(gè)細(xì)胞焦亡基因。通過(guò)limma程序包提取TCGA焦亡基因的表達(dá)量,將差異倍數(shù)(fold change,F(xiàn)C)≥1,即|log2FC|≥1且P<0.05設(shè)置為過(guò)濾條件,篩選出聚類(lèi)分型間的差異表達(dá)基因。鑒定出LUAD癌組織和癌旁組織間的差異表達(dá)基因,采用pheatmap程序包進(jìn)行可視化。通過(guò)STRING數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.string-db.org/)獲取差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作(proteinprotein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。運(yùn)用corrplot程序包計(jì)算差異表達(dá)基因的r值,以r=0.5為閾值進(jìn)行篩選。

    1.3 差異表達(dá)基因的共識(shí)聚類(lèi)分析

    將樣本的生存數(shù)據(jù)和樣本(含有差異表達(dá)焦亡基因的表達(dá)量)進(jìn)行合并、標(biāo)準(zhǔn)化等處理。利用survival程序包對(duì)基因進(jìn)行Cox回歸分析,篩選與生存相關(guān)的焦亡基因。根據(jù)生存相關(guān)焦亡基因的表達(dá)特征,采用limma程序包和ConsensusClusterPlus程序包對(duì)樣本進(jìn)行聚類(lèi)分析,分別獲取條件滿(mǎn)足組間關(guān)系不緊密和組間關(guān)系緊密的焦亡基因聚類(lèi)分型。采用survival程序包和survminer程序包對(duì)聚類(lèi)分型繪制Kaplan-Meier生存曲線(xiàn),用秩和法進(jìn)行檢驗(yàn)。采用pheatmap程序包繪制熱圖,展現(xiàn)不同聚類(lèi)分型在臨床特征中的分布情況。

    1.4 構(gòu)建基于LUAD細(xì)胞焦亡基因的預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型

    利用limma程序包對(duì)聚類(lèi)分型進(jìn)行差異分析,將|log2FC|≥1且P<0.05設(shè)置為過(guò)濾條件,篩選出焦亡模型間的差異表達(dá)基因。采用Cox回歸分析評(píng)估每個(gè)差異表達(dá)基因與LUAD患者生存的關(guān)系。以P<0.05為篩選標(biāo)準(zhǔn),鑒定出生存相關(guān)差異表達(dá)基因。采用glmnet程序包進(jìn)行最小絕對(duì)收縮和選擇算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)Cox回歸分析,縮小候選基因的范圍,建立預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型。懲罰系數(shù)(λ)是由最小參數(shù)決定候選基因及其系數(shù)。最后基于所有候選基因的系數(shù)值與基因表達(dá)總和的積確定風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分。

    將TCGA隊(duì)列作為測(cè)試集,用于內(nèi)部評(píng)估;GEO隊(duì)列作為驗(yàn)證集,用于外部評(píng)估。根據(jù)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的中位值將樣本劃分為高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組。采用timeROC程序包進(jìn)行1年生存、3年生存和5年生存的受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線(xiàn)分析。此外,根據(jù)TCGA風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分中位值將GEO隊(duì)列分為高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組,采用timeROC包繪制1年生存、3年生存和5年生存的ROC曲線(xiàn)進(jìn)行驗(yàn)證,曲線(xiàn)下面積(area under curve,AUC)>0.5提示模型有較好的預(yù)測(cè)價(jià)值。

    1.5 風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分和LUAD患者生存之間的關(guān)系

    采用χ2檢驗(yàn)分析測(cè)試集中高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組與LUAD患者臨床病理特征之間的相關(guān)性,以熱圖形式呈現(xiàn)。采用Kaplan-Meier生存曲線(xiàn)分別比較測(cè)試集和驗(yàn)證集不同風(fēng)險(xiǎn)組之間生存情況的差異。采用單變量和多變量Cox回歸分析確定測(cè)試集和驗(yàn)證集風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分的獨(dú)立性。上述分析過(guò)程均采用survival程序包和survminer程序包完成。

    1.6 生物學(xué)功能分析

    采用limma程序包比較TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組之間的差異表達(dá)基因,以|log2FC|≥1且P<0.05為篩選條件。采用clusterProfiler程序包進(jìn)行基因本體論(Gene Ontology,GO)和京都基因與基因組百科全書(shū)(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析。以FDR<0.05為顯著富集的生物學(xué)功能和信號(hào)通路。

    1.7 免疫浸潤(rùn)分析

    采用GSVA程序包和GSEABase程序包對(duì)TCGA隊(duì)列和GEO隊(duì)列進(jìn)行單樣本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ssGSEA),量化免疫細(xì)胞和免疫相關(guān)通路,采用Mann-Whitney檢驗(yàn)比較TCGA隊(duì)列免疫浸潤(rùn)細(xì)胞和免疫相關(guān)通路的差異。采用CIBERSORT程序包(基于線(xiàn)性支持向量回歸的原理)對(duì)人類(lèi)22種免疫細(xì)胞亞型和免疫功能進(jìn)行量化分析。采用Wilcoxon秩和檢驗(yàn)比較高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組之間免疫浸潤(rùn)細(xì)胞的差異。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

    1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

    采用R 4.0.3軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

    2 結(jié)果

    2.1 差異表達(dá)的焦亡基因

    共篩選出41個(gè)差異表達(dá)的焦亡基因,其中表達(dá)下調(diào)10個(gè)(IL6、NLRC4、CASP5、IL1B、NLRP3、IL1A、CASP1、IRF1、CHMP3、NLRP1)、表達(dá)上調(diào)31個(gè)(TNF、SCAF11、CHMP2B、ELANE、CHMP6、CASP9、NLRP6、CHMP7、TIRAP、CHMP2A、PLCG1、GSDMD、CASP4、BAX、GPX4、CASP8、CHMP4A、CHMP4B、GSDME、TP53、PJVK、CYCS、CASP3、BAK1、CASP6、CHMP4C、GSDMA、GSDMB、NLRP7、GSDMC、AIM2)(P<0.05),見(jiàn)圖1(a)。PPI分析結(jié)果表明(相互作用分?jǐn)?shù)為0.9),CHMP3、CHMP4C、CHMP2A、CHMP7、CHMP4B、CHMP2B、CHMP6、CHMP4A、CASP6、CASP3、CASP8是核心基因,見(jiàn)圖1(b)。以閾值r=0.5為臨界點(diǎn)繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖,見(jiàn)圖1(c)。

    2.2 基于差異表達(dá)基因的腫瘤分型

    根據(jù)焦亡基因的表達(dá)特征將LUAD樣本通過(guò)聚類(lèi)分析分型。聚類(lèi)的變量用字母k表示,同時(shí)根據(jù)繪制圖形獲得最合適的分型。結(jié)果顯示,在k=2的情況下,LUAD患者可以分為2個(gè)完全不同的、不重疊的聚類(lèi)分型,見(jiàn)圖2(a)?;虮磉_(dá)譜和臨床病理特征(包括性別、年齡、Stage分期和TMN分期)在聚類(lèi)分型中的分布見(jiàn)圖2(b)。分型2的生存期顯著長(zhǎng)于分型1(P<0.05),見(jiàn)圖2(c)。

    圖2 基于差異表達(dá)基因特征的腫瘤分型

    2.3 基于LUAD焦亡基因的預(yù)后模型構(gòu)建及其臨床價(jià)值

    篩選出聚類(lèi)分型間的差異表達(dá)基因,采用Cox回歸分析鑒定出11個(gè)與生存相關(guān)的差異表達(dá)基因,分別為:ANO1、PKHD1L1、FMO2、TDRD1、TBX4、ABCC12、AQP4、CPXM2、WFIKKN2、ATP1A4、IGSF10。風(fēng)險(xiǎn)比(hazard ratio,HR)>1的基因?yàn)轱L(fēng)險(xiǎn)基因,即基因的表達(dá)量越多,預(yù)后越差,HR<1的基因?yàn)楸Wo(hù)基因,即基因的表達(dá)量越多,預(yù)后越好。采用LASSO-Cox回歸分析,并根據(jù)最佳λ值構(gòu)建預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型。Kaplan-Meier生存曲線(xiàn)分析結(jié)果顯示,測(cè)試集(TCGA隊(duì)列)高風(fēng)險(xiǎn)組的生存期顯著短于低風(fēng)險(xiǎn)組(P<0.05)。與低風(fēng)險(xiǎn)組相比,高風(fēng)險(xiǎn)組的死亡例數(shù)更多、生存期更短。ROC曲線(xiàn)分析結(jié)果顯示,預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型判斷TCGA隊(duì)列LUAD患者1年生存的AUC為0.744,3年生存的AUC為0.697,5年生存的AUC為0.667。見(jiàn)圖3。

    圖3 預(yù)后模型對(duì)TCGA隊(duì)列的預(yù)后評(píng)估效能

    Kaplan-Meier生存曲線(xiàn)分析結(jié)果顯示,驗(yàn)證集(CEO隊(duì)列)高風(fēng)險(xiǎn)組生存期短于低風(fēng)險(xiǎn)組(P<0.05)。與低風(fēng)險(xiǎn)組比較,高風(fēng)險(xiǎn)組生存期更短,死亡率更高。ROC曲線(xiàn)分析結(jié)果顯示,預(yù)后模型判斷GEO隊(duì)列LUAD患者1年生存的AUC為0.561、3年生存的AUC為0.611、5年生存的AUC為0.734。見(jiàn)圖4。

    圖4 預(yù)后模型對(duì)GEO隊(duì)列的預(yù)后評(píng)估效能

    2.4 預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型與LUAD患者預(yù)后的關(guān)系

    單因素Cox回歸分析結(jié)果顯示,依據(jù)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型得出的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分是TCGA隊(duì)列LUAD患者預(yù)后的危險(xiǎn)因素[HR=2.911,95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)為1.355~6.256,P=0.006]。多因素Cox回歸分析結(jié)果顯示,在排除其他混雜因素(年齡、性別、T分期、N分期、M分期)后,依據(jù)預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型得出的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分是TCGA隊(duì)列LUAD患者預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素(HR=4.815,95%CI為2.963~7.824,P<0.001)。但基于GEO隊(duì)列得出了不同的結(jié)果(HR=1.857,95%CI為0.857~4.071,P=0.122)?;赥CGA隊(duì)列11個(gè)差異表達(dá)基因的熱圖分析結(jié)果顯示,高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組之間性別、臨床分期、T分期、N分期差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖5。

    圖5 預(yù)后風(fēng)險(xiǎn)模型的Cox回歸分析和TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組臨床病理特征的差異熱圖

    2.5 TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組差異表達(dá)基因的生物學(xué)功能分析

    KEGG富集分析和GO富集分析結(jié)果顯示,TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組和低風(fēng)險(xiǎn)組差異表達(dá)基因主要與趨化因子介導(dǎo)腫瘤相關(guān)信號(hào)通路、免疫反應(yīng)、細(xì)胞膜功能相關(guān)。見(jiàn)圖6。

    圖6 TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組差異表達(dá)基因的功能分析和ssGSEA結(jié)果

    采用ssGSEA量化TCGA隊(duì)列LUAD患者的免疫相關(guān)通路。與高風(fēng)險(xiǎn)組比較,低風(fēng)險(xiǎn)組B淋巴細(xì)胞、抗原遞呈細(xì)胞、T淋巴細(xì)胞、人類(lèi)白細(xì)胞抗原、中性粒細(xì)胞、腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞、調(diào)節(jié)性T細(xì)胞的比例更高。見(jiàn)圖6。

    采用CIBERSORT量化免疫浸潤(rùn)細(xì)胞。與高風(fēng)險(xiǎn)組比較,低風(fēng)險(xiǎn)組CD4+記憶T淋巴細(xì)胞、肥大細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞比例更高(P<0.05)。見(jiàn)圖6。

    3 討論

    細(xì)胞焦亡是一種新的促炎程序性細(xì)胞死亡方式,在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮著雙重作用[1,3]。一方面,在細(xì)胞焦亡的進(jìn)程中釋放大量的炎癥因子,促進(jìn)腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[8-9];另一方面,細(xì)胞焦亡的促炎作用可減輕耐藥性,更好地發(fā)揮藥物的抗癌作用[8-9]。細(xì)胞焦亡可能是一種潛在的腫瘤治療新策略。本研究發(fā)現(xiàn)了41個(gè)在LUAD患者癌組織和癌旁組織中呈差異表達(dá)的焦亡基因,其中CHMP3、CHMP4C、CHMP2A、CHMP7、CHMP4B、CHMP2B、CHMP6、CHMP4A、CASP6、CASP3、CASP8在LUAD的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用。基于差異基因的表達(dá)特征,本研究將LUAD樣本分成2個(gè)聚類(lèi)分型,與LUAD患者預(yù)后相關(guān)。進(jìn)一步篩選出聚類(lèi)分型間11個(gè)生存相關(guān)的差異表達(dá)基因,包括ANO1、PKHD1L1、FMO2、TDRD1、TBX4、ABCC12、AQP4、CPXM2、WFIKKN2、ATP1A4、IGSF10。生存分析結(jié)果顯示,高表達(dá)的ANO1與較差的預(yù)后相關(guān);PKHD1L1、FMO2、TDRD1、TBX4、ABCC12、AQP4、CPXM2、WFIKKN2、ATP1A4、IGSF10為保護(hù)基因,其高表達(dá)與較好的預(yù)后相關(guān)。這些基因可能是LUAD和細(xì)胞焦亡聯(lián)系的關(guān)鍵節(jié)點(diǎn),在疾病進(jìn)展中發(fā)揮著截然不同的作用。通過(guò)LASSOCox回歸分析建立了一個(gè)焦亡相關(guān)的預(yù)后模型,具有不同的性別、臨床分期、T分期、N分期和M分期的特征。外部驗(yàn)證集獲得相似的結(jié)果,并發(fā)現(xiàn)高、低風(fēng)險(xiǎn)組間的差異基因與腫瘤免疫相關(guān)。

    本研究KEGG富集分析結(jié)果顯示,差異表達(dá)基因在腫瘤相關(guān)信號(hào)通路上存在顯著差異。有研究證實(shí),細(xì)胞焦亡通過(guò)調(diào)控某個(gè)靶點(diǎn)或某些信號(hào)通路的活性來(lái)發(fā)揮抗惡性腫瘤的作用[10]。核因子-κB(nuclear factor-kappa B,NF-κB)信號(hào)通路的持續(xù)異常激活能導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞在抗凋亡的同時(shí)促使其浸潤(rùn)、轉(zhuǎn)移,在惡性腫瘤的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用,抑制NF-κB信號(hào)通路的異常激活能夠促進(jìn)包括細(xì)胞焦亡在內(nèi)的程序性死亡,進(jìn)而發(fā)揮抗腫瘤作用[11]。CIBERSORT程序包分析結(jié)果顯示,TCGA隊(duì)列高風(fēng)險(xiǎn)組與低風(fēng)險(xiǎn)組之間免疫浸潤(rùn)細(xì)胞比例存在差異。細(xì)胞焦亡能調(diào)節(jié)免疫浸潤(rùn)細(xì)胞的狀態(tài),調(diào)控腫瘤微環(huán)境的組分。部分腫瘤細(xì)胞發(fā)生焦亡后,釋放的炎性介質(zhì)可激活T細(xì)胞,調(diào)節(jié)腫瘤免疫微環(huán)境,激活機(jī)體的免疫反應(yīng),發(fā)揮抗腫瘤的功能[12]。

    本研究采用ssGSEA、CIBERSORT分析高風(fēng)險(xiǎn)組、低風(fēng)險(xiǎn)組之間的免疫特性,結(jié)果顯示,低風(fēng)險(xiǎn)組擁有更高的T淋巴細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞、肥大細(xì)胞,與免疫相關(guān)通路有關(guān),有著更好的預(yù)后。細(xì)胞焦亡在腫瘤微環(huán)境中能夠激活抗腫瘤免疫,抑制腫瘤生長(zhǎng)。HSU等[13]的研究結(jié)果顯示,在GSDME-鼠的三陰性乳腺癌細(xì)胞系EMT6和結(jié)直腸癌細(xì)胞系CT26的微環(huán)境中,CD8+T淋巴細(xì)胞和自然殺傷細(xì)胞浸潤(rùn)的減少伴隨著腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞釋放顆粒酶B和穿孔素的減少[13]。腫瘤細(xì)胞發(fā)生細(xì)胞焦亡時(shí)會(huì)產(chǎn)生促炎因子和免疫抗原,激活Gasdermin家族蛋白,N端分子結(jié)構(gòu)域在細(xì)胞膜表面聚集形成寡肽空,促進(jìn)細(xì)胞裂解,誘導(dǎo)機(jī)體發(fā)生瀑布級(jí)聯(lián)炎癥反應(yīng),激活以T細(xì)胞為主的抗腫瘤免疫反應(yīng)[12]。

    近年來(lái),相關(guān)研究構(gòu)建了很多LUAD的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)后模型,為L(zhǎng)UAD的診斷和預(yù)后提供了新的思路。本研究證實(shí)了焦亡基因?qū)UAD的診斷和預(yù)后具有重要價(jià)值,通過(guò)LASSO-Cox回歸分析建立風(fēng)險(xiǎn)預(yù)后模型,采用傳統(tǒng)方法證明風(fēng)險(xiǎn)預(yù)后模型的有效性。細(xì)胞焦亡會(huì)激活機(jī)體免疫反應(yīng),發(fā)揮抗癌的作用,設(shè)計(jì)誘導(dǎo)細(xì)胞焦亡的治療策略可以加強(qiáng)抗腫瘤免疫反應(yīng),將“冷”免疫型腫瘤和無(wú)免疫反應(yīng)腫瘤轉(zhuǎn)化為“熱”免疫型腫瘤。此外,化療藥物一直在晚期惡性腫瘤的治療中占據(jù)著重要的地位?;熕幬锒嘁蕾?lài)劑量殺傷惡性腫瘤細(xì)胞,劑量越大療效越好,但由于患者自身因素、藥物副作用等的限制,化療藥物的使用劑量往往有上限[14]。如果將誘導(dǎo)細(xì)胞焦亡與化療藥物協(xié)同使用,可以增加腫瘤細(xì)胞單次殺傷能力,減少化療藥物毒副作用,獲得更好的療效[14]。

    總之,LUAD癌組織和癌旁組織之間存在著41個(gè)差異表達(dá)的焦亡基因,可用于區(qū)分LUAD癌組織和癌旁組織,表明細(xì)胞焦亡和LUAD存在緊密的聯(lián)系?;诮雇鱿嚓P(guān)預(yù)后模型獲得的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分是預(yù)測(cè)LUAD預(yù)后的獨(dú)立危險(xiǎn)因素,與腫瘤免疫有關(guān)。但是,本研究仍存在一定的局限,未來(lái)仍需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證預(yù)后模型在LUAD病例中的臨床價(jià)值。

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