范成平,白茂軍*,田玉琴,昝建朋,董延鑫,楊 索,王 瑩,陳 汶,楊小龍,李先偉,高正鋒,徐 絲
(1.貴州省煙草公司 安順市公司,貴州 安順 561000;2.云南農(nóng)業(yè)大學 煙草學院,云南 昆明 650201)
烤煙是我國的重要經(jīng)濟作物。近年來,頻繁發(fā)生的土傳病害造成了烤煙產(chǎn)量和質(zhì)量的嚴重下降,嚴重威脅了我國烤煙的生產(chǎn)安全[1]。煙草青枯病是由茄科雷爾氏菌(Ralstonia solanacearum)引起的細菌性土傳病害,在我國福建、四川、貴州等省份的植煙區(qū)暴發(fā)流行,每年造成的經(jīng)濟損失在1000萬元以上[2]。目前,煙草青枯病的主要防治手段有生物防治[3-4]、化學防治[5-6]、農(nóng)業(yè)防治等[7],但防治效果均不理想,例如:生物防治存在防治效果緩慢、適用范圍有限、容易受環(huán)境影響等問題;化學防治存在容易造成環(huán)境污染、農(nóng)藥殘留等問題;農(nóng)業(yè)防治存在防治周期長、成本高等問題[8-9]。根際土壤微生物是土壤微生態(tài)系統(tǒng)最重要的組成部分,根系分泌物是根際土壤微生物的主要營養(yǎng)來源[10],根系分泌物可以為微生物的生長提供碳源和氮源。酚酸類物質(zhì)是根系分泌物中最主要的功能性物質(zhì),其對植物的自毒作用也是導致連作障礙的重要因素[11]。有研究表明,煙草根系分泌物中的某些低分子有機酸如肉桂酸、苯甲酸等能夠通過降低土壤pH值促進土壤真菌的生長和繁殖,起到調(diào)節(jié)土壤真菌群體結(jié)構(gòu)的作用,并間接影響土壤的理化特性[12-13]。劉艷霞等[14]研究發(fā)現(xiàn),煙草根系分泌物中的苯甲酸和3-苯丙酸能同時促進土壤中病原菌和拮抗菌的生長繁殖,但對病原菌的促進作用顯著強于拮抗菌,是造成長期連作煙草青枯病嚴重發(fā)生的重要誘因。另外,土壤養(yǎng)分失衡[15-16]也加劇了土傳病害暴發(fā)的概率[17],造成植物生長不良、抗病性降低[18]。因此,土壤酚酸類物質(zhì)和營養(yǎng)元素會直接影響植物病害的發(fā)生,也會通過改變土壤微生物群落的組成間接影響植物病害的發(fā)生和發(fā)展[19-20]。迄今有關(guān)根際土壤中酚酸類物質(zhì)以及其他土壤因子對煙草青枯病發(fā)生的影響研究較少。鑒于此,筆者通過田間調(diào)查,收集青枯病不同發(fā)病程度的煙株根際土壤,測定土壤酚酸含量、理化性質(zhì)指標以及細菌、真菌的群落結(jié)構(gòu),探究了根際土壤環(huán)境因子對煙草青枯病發(fā)生的影響,旨在為煙草青枯病的科學防控提供理論依據(jù)。
土壤取樣地位于貴州省安順市紫云縣大田壩村(106°18′19″E,25°34′40″N,海拔1044 m)。取樣區(qū)域為同一地塊,其土壤質(zhì)地為砂質(zhì)土,且肥力均勻、地塊平整。試驗地的基礎(chǔ)理化性質(zhì):pH值為5.21,有機質(zhì)24.28 g/kg,全氮1.42 g/kg,堿解氮162.74 mg/kg,硝態(tài)氮19.18 mg/kg,銨態(tài)氮9.74 mg/kg,全磷0.03%,速效磷3.33 mg/kg,全鉀0.15%,速效鉀54.08 mg/kg。種植的煙草品種為云煙87。
參照煙草病蟲害分級及調(diào)查方法[21],將煙株按照發(fā)病程度進行劃分,即:健康煙株 (HTP),全株無??;中度發(fā)病煙株(MDQ),莖部病斑超過莖圍的1/2,或半數(shù)以上葉片出現(xiàn)輕度凋萎及少數(shù)葉片出現(xiàn)病斑;重度發(fā)病煙株(SDQ),莖部病斑環(huán)繞莖圍,或2/3以上葉片出現(xiàn)凋萎。
通過田間系統(tǒng)調(diào)查確定青枯病發(fā)病地塊后,在旺長期對不同青枯病發(fā)病程度的煙株根際土壤進行取樣,對相同發(fā)病程度的煙株取3株以上,采用抖根法收集根際0~2 mm的土壤,充分混勻后裝袋,一部分置于-80 ℃冰箱保存,用于提取土壤DNA,另一部分貯存在4 ℃冰箱,用于測定土壤養(yǎng)分含量。
采用電位法測定土壤的pH值。土壤中堿解氮、硝態(tài)氮、銨態(tài)氮、速效磷、速效鉀和有機質(zhì)含量的測定分別采用堿解擴散法、紫外分光光度法、可見分光光度法、0.05 mol/L HCl-0.025 mol/L(1/2H2SO4)法、NH4OAc浸提—火焰光度計測定法、重鉻酸鉀容量法—稀釋熱法。
土壤酚酸類化合物的測定采用高效液相(HPLC)法。首先對土壤進行前處理,稱取土樣20.0 g,置于50 mL離心管(3次重復),加入20 mL 1 mol/L NaOH后靜置24 h;然后在室溫下以200 r/min的轉(zhuǎn)速振蕩60 min,配平后離心20 min;然后用12 mol/L鹽酸將濾液酸化至pH值=2.5,2 h后離心除去胡敏酸,用1∶1的乙酸乙酯萃取3次;在50 ℃條件下旋轉(zhuǎn)蒸發(fā),用純凈水溶解后,定容至2 mL,將其過0.22 μm的纖維膜,濾液用高效液相色譜測定。儀器為Aglient1200高效液相色譜儀,色譜柱為Agilent (4.6 mm×250 mm),流速為1 mL/min,柱溫為25 ℃,采用全波長掃描法找到所測酚酸的最佳波長。流動相C(乙腈)和流動相D(0.3%磷酸水溶液)的梯度如下:0 min,流動相C 5%,流動相D 95%;3 min,流動相C 5%,流動相D 95%;14 min,流動相C 35%,流動相D 65%;18 min,流動相C 40%,流動相D 60%;20 min,流動相C 70%,流動相D 30%;20 min,流動相C 90%,流動相D 10%;25 min,流動相C 90%,流動相D 10%;25 min,流動相C 5%,流動相D 95%;30 min,流動相C 5%,流動相D 95%。標準樣品為鄰苯二甲酸、對羥基苯甲酸、香草酸、香蘭素、對香豆酸、阿魏酸、苯甲酸、水楊酸,進樣量為10 μL。
土壤細菌:采用Illumina Hiseq測序方法對土壤細菌的豐度和結(jié)構(gòu)進行評價。采用引物341F(5′-CCTACGGGNGGCWGCAG-3′)和806R(5′-GGACTACHVGGGTATCTAAT-3′)對16S DNA 中V3~V4區(qū)域進行擴增,檢測細菌的群落結(jié)構(gòu)與多樣性。使用TruSeq?DNA PCR-free Sample Preparation Kit試劑盒將純化的PCR產(chǎn)物進行文庫構(gòu)建。經(jīng)過Qubit和Q-PCR驗證文庫合格后,使用NovaSeq 6000對DNA文庫進行測序。通過Qiime V1.9.1去除測序數(shù)據(jù)中平均質(zhì)量分數(shù)低(Q<20)及長度短(<100 bp)的低質(zhì)量序列,得到最終的有效數(shù)據(jù)(Effective Tags)。利用Uparse對所有樣本的全部Effective Tags進行聚類,默認以97%的一致性序列聚類成為OTUs。進一步用Qiime V1.9.1中的BLAST方法與Unit (v7.2)數(shù)據(jù)庫對OTUs序列進行物種注釋,獲得不同分類水平下微生物的豐度數(shù)據(jù)。
土壤真菌:使用MN NucleoSpin soil Kit (Machery-nagel,Dueren,Germany)從0.75 g土壤中提取總DNA。根據(jù)真菌的ITS1保守區(qū)使用引物ITS1F(5′-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3′)和ITS2(5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)進行擴增。擴增體系為50 μL:10×Buffer KOD 5 μL、2 mmol/L dNTPs 5 μL、25 mmol/L MgSO43 μL、Index Primer(10 μmol/L)1 μL、Universal PCR Primer(10 μmol/L)1 μL、KOD酶1 μL、Template(100 ng/μL)1 μL,用ddH2O補至50 μL。對每個樣品進行重復擴增、合并,然后使用Cycle Pure Kit(Omega,Norcross,GA,USA)進行純化,形成測序文庫,最后使用Illumina HiSeq 2500技術(shù)進行測序分析。
利用SPSS 22.0和Excel 2010軟件對試驗數(shù)據(jù)進行處理;用LSD法進行差異顯著性檢驗;利用R語言進行插圖繪制。
從表1可以看出,青枯病不同發(fā)病階段煙株的土壤理化性狀與健康煙株存在顯著差異。具體來說,青枯病不同發(fā)病階段煙株根際土壤的堿解氮、硝態(tài)氮和速效鉀含量均高于健康煙株根際土壤的,其中土壤堿解氮和硝態(tài)氮含量隨發(fā)病程度的加重而增加,且差異達到了顯著水平;土壤pH值和銨態(tài)氮含量在HTP和SDQ兩個處理間差異顯著,SDQ較HTP分別降低了8.38%和26.95%。
表1 健康煙株與不同患病程度煙株根際土壤的理化性狀
選擇差異顯著的3個理化指標(有機質(zhì)、堿解氮、硝態(tài)氮含量),結(jié)合OTUs數(shù)據(jù)矩陣進行冗余分析(RDA)。
表2顯示:鄰苯二甲酸、對羥基苯甲酸、香草酸、水楊酸這4種酚酸含量在健康和發(fā)病煙株根際土壤樣品間沒有顯著差異;香蘭素、對香豆酸、阿魏酸、苯甲酸這4種酚酸含量在健康土壤樣品(HTP)和中度發(fā)病土壤樣品(MDQ)間均沒有顯著差異,而在HTP和重度發(fā)病土壤樣品(SDQ)之間均存在顯著差異,其中香蘭素含量表現(xiàn)為SDQ>HTP,而對香豆酸、阿魏酸、苯甲酸含量均表現(xiàn)為SDQ<HTP。
表2 健康與患病煙株根際土壤的酚酸類物質(zhì)含量 μg/g
選擇含量差異顯著的香蘭素、對香豆酸、阿魏酸、苯甲酸這4種酚酸類物質(zhì),結(jié)合OTUs 數(shù)據(jù)矩陣進行冗余分析(RDA)。
2.3.1 根際土壤細菌和真菌的Alpha多樣性 Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)可以反映群落的物種豐富度,Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)可以綜合反映群落的物種豐富度和均勻度。本研究結(jié)果(表3)表明,在不同土壤樣品間細菌和真菌的上述4個多樣性指數(shù)均無顯著差異,但健康煙株根際土壤細菌的Shannon、Chao1、Ace指數(shù)均高于發(fā)病煙株根際土壤的;健康與發(fā)病煙株根際土壤真菌的Shannon指數(shù)與Simpson指數(shù)相近,Ace、Chao1指數(shù)隨發(fā)病程度加重有先下降后增加的變化趨勢。
表3 煙株根際土壤微生物群落的Alpha多樣性指數(shù)分析結(jié)果
2.3.2 健康與發(fā)病煙株根際土壤細菌和真菌的Beta多樣性 健康與發(fā)病煙株根際土壤細菌和真菌的NMDS圖如圖1所示,細菌(圖1A)和真菌(圖1B)的stress值分別為0.002、0.011,均小于0.1,說明此模型能較準確地描述不同土壤樣本間微生物群落結(jié)構(gòu)的差異。中度發(fā)病(MDQ)與健康煙株(HTP)根際土壤樣品間細菌群落結(jié)構(gòu)的差異小于重度發(fā)?。⊿DQ)與HTP煙株根際土壤樣品間的(圖1A),而在HTP、MDQ和SDQ煙株根際土壤樣品間真菌群落結(jié)構(gòu)有較大的差異(圖1B),說明組間樣本的Beta多樣性隨發(fā)病程度增加而差異逐漸增大。
圖1 健康與發(fā)病對煙株根際土壤微生物群落Beta多樣性的影響
2.3.3 健康與發(fā)病煙株根際土壤微生物在門水平上的差異 對不同土壤樣品的測序結(jié)果進行分析,在不同青枯病發(fā)病程度煙株根際土壤細菌中所占比例較高的門有變形菌門(Proteobacteria)、Patescibacteria、擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)等。比較不同發(fā)病程度煙株根際土壤細菌門類的差異,變形菌門、放線菌門(Actinobacteria)等在發(fā)病土壤中的相對豐度高于健康土壤的,厚壁菌門、酸桿菌門(Acidobacteria)等在健康土壤中的相對豐度高于發(fā)病土壤的。隨著發(fā)病程度的增加,Patescibacteria的相對豐度從11.63%增加至16.96%,厚壁菌門從13.27%降低至8.84%(圖2A)。不同發(fā)病程度煙株根際土壤真菌的優(yōu)勢類群為子囊菌門(Ascomycota)、Anthophyta、毛霉門(Mucoromycota)、被孢霉門(Mortierellomycota)、擔子菌門(Basidiomycota),其中,子囊菌門的相對豐度表現(xiàn)為發(fā)病土壤>健康土壤,而Anthophyta的相對豐度則表現(xiàn)為健康土壤>發(fā)病土壤(圖2B)。
圖2 在門水平上不同發(fā)病程度煙株根際土壤微生物的物種分布
2.3.4 健康與發(fā)病煙株根際土壤微生物在屬水平上的差異 按照物種豐度排名,篩選出前10名屬水平的菌群。在健康土壤樣品(HTP)的細菌中,芽孢桿菌屬(Bacillus)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)和Bdellovibrio的相對豐度較高;與HTP土壤樣品相比,SDQ中上述幾個屬的相對豐度均有所降低(圖3A)。與HTP樣品相比,在MDQ的真菌中,被孢霉屬(Mortierella)、毛霉屬(Mucor)和Pseudaleuria的相對豐度均有所增加,而在SDQ中有所下降;Gongronella的相對豐度在MDQ中下降,而在SDQ中增加(圖3B)。
圖3 在屬水平上不同發(fā)病程度煙株根際土壤微生物的物種分布
2.3.5 微生物群落組成與土壤環(huán)境因子的相關(guān)性 從圖4A可以看出:2個排序軸解釋了95.88%的土壤細菌菌群變化,其中CCA1解釋了84.49%,CCA2解釋了11.39%;健康煙株和中度發(fā)病煙株根際土壤樣品主要分布在第三象限,重度發(fā)病煙株根際土壤樣品主要分布在第二象限;土壤硝態(tài)氮(NO-N)和堿解氮(AN)含量與橫坐標正軸的夾角小于其他指標的,表明這2個指標與CCA1的相關(guān)性較強;土壤苯甲酸和對香豆酸含量與縱坐標重合,表明這2個指標與CCA2的相關(guān)性很強;從箭頭分布來看,土壤香蘭素、硝態(tài)氮和堿解氮含量與重度發(fā)病煙株根際土壤細菌菌群存在較強的正相關(guān)性。由圖4B中的箭頭長度可以看出:土壤苯甲酸和對香豆酸含量對根際土壤真菌菌群結(jié)構(gòu)的影響較大;Bdellovibrio和鞘氨醇單胞菌屬與土壤阿魏酸、對香豆酸、苯甲酸含量呈正相關(guān),與有機質(zhì)(SOM)、NO-N和AN含量呈負相關(guān);毛霉屬和Pseudaleuria與土壤阿魏酸、對香豆酸、苯甲酸含量呈正相關(guān),與NO-N和AN含量呈負相關(guān)。
圖4 土壤因子與微生物群落間CCA分析結(jié)果
良好的土壤環(huán)境可以為農(nóng)作物的健康生長奠定基礎(chǔ),而土壤養(yǎng)分失衡、板結(jié)等是引發(fā)煙草青枯病的主要原因[22]。本研究發(fā)現(xiàn),不同程度青枯病發(fā)病煙株根際土壤的堿解氮(AN)、硝態(tài)氮(NO-N)和速效鉀(AK)含量均高于健康煙株根際土壤的,可能是因為不同發(fā)病階段的根際土壤養(yǎng)分失衡,而部分養(yǎng)分富集會增加煙株的感病性[23]。有研究表明,施用不同形態(tài)的氮既可以為植物提供養(yǎng)分,又具有減輕烤煙青枯病發(fā)生的作用,其中硝酸鹽的同化有助于青枯菌在根系的黏附、莖部的定殖以及毒性增強[24]。在本試驗中,土壤硝態(tài)氮和堿解氮的含量與重度發(fā)病煙株根際土壤細菌菌群存在較強的正相關(guān)性,可能是因為發(fā)病煙株根際土壤含有較多的硝態(tài)氮,而硝酸鹽同化的增加導致發(fā)病程度加重。
作物根際土壤微生物會隨著發(fā)病程度的變化而變化。黎妍妍等[25]的研究結(jié)果表明,青枯病發(fā)病煙株根際土壤細菌的多樣性低于健康煙株根際土壤的,而土壤真菌的多樣性會隨著發(fā)病程度的加重而逐漸增加,這與本研究結(jié)果相似。在本研究中,中度發(fā)病土壤中真菌被孢霉屬(Mortierella)、毛霉屬(Mucor)和Pseudaleuria的相對豐度高于健康土壤的,這可能是因為Pseudaleuria屬于子囊菌門(Ascomycota)中的小囊菌目(Microascales),而小囊菌目中的真菌能夠引發(fā)多種植物病害[26]。本研究還發(fā)現(xiàn),土壤細菌群落中鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)和Bdellovibrio的相對豐度隨著發(fā)病程度的增加而逐漸下降,這是因為鞘氨醇單胞菌屬是土壤中的有益微生物[27],它的減少可能導致病原微生物數(shù)量的增加。因此,推測煙株根際土壤中毛霉屬與Pseudaleuria豐度的增加以及鞘氨醇單胞菌屬豐度的降低可能是青枯病發(fā)生程度加重的關(guān)鍵微生物因素。
土傳病害、根系分泌物及根茬殘留腐解物的化感自毒作用被認為是引起作物連作障礙的主要因子,且根系分泌物是連作制度下土傳病害發(fā)生的原初誘因[28]。根系分泌物對某些微生物具有吸引作用,這類具有趨化性的細菌或真菌能夠在根際土壤中大量聚集和繁殖,比如豆科植物對根瘤菌的誘導;而根系分泌物對某些病原菌具有抑制作用,比如小麥根系分泌物中的酚酸具有抗細菌的活性,并且其抗菌活性具有協(xié)同作用[14]。本研究結(jié)果表明:土壤香蘭素含量與重度發(fā)病煙株根際土壤細菌與真菌菌群均存在較強的正相關(guān)性;真菌中的毛霉屬和Pseudaleuria,以及細菌中的Bdellovibrio和鞘氨醇單胞菌屬與土壤阿魏酸、對香豆酸、苯甲酸含量均呈正相關(guān)。張克勤等[29]研究表明,阿魏酸和苯甲酸在根際土壤中存在強烈的自毒效應,其中阿魏酸是煙草根系分泌物中的主要酚酸,其分泌速率分別是對羥基苯甲酸和苯甲酸的12.2和38.5倍。通過適當提高土壤pH值來增加土壤自毒酚酸物質(zhì)的分解速率,該方法能有效地防治煙草青枯病[30]。苯甲酸等能夠通過降低土壤的pH值促進真菌的生長和繁殖,起到調(diào)節(jié)土壤真菌群體結(jié)構(gòu)的作用,并間接影響土壤的理化特性[12]。但土壤微生物群落是一個復雜的群體,其微生物種類、數(shù)量以及相互作用關(guān)系受多方面因素的調(diào)節(jié),單從根系分泌物上不能完整解釋其動態(tài)變化的過程,尚需要結(jié)合土壤養(yǎng)分、水分及微生物間互作關(guān)系開展進一步研究。
煙株根際土壤酚酸類物質(zhì)在患病與健康土壤中存在顯著差異,患病煙株根際土壤細菌的多樣性降低,真菌的多樣性隨青枯病發(fā)生程度的加重而先降低后增加,其中毛霉屬和Pseudaleuria的相對豐度在中度發(fā)病土壤中增加,鞘氨醇單胞菌屬的相對豐度在患病土壤中降低,均與土壤對香豆酸、阿魏酸、苯甲酸含量呈正相關(guān)。