倪雅麗,姚宇劍,武 素,謝毅強
(1.海南省第二人民醫(yī)院藥學(xué)部,海南 五指山 572200;2.海南省中醫(yī)院醫(yī)務(wù)部,海南 ???570203;3.海南省中醫(yī)院內(nèi)分泌科,海南 ???570203;4.海南醫(yī)學(xué)院中醫(yī)學(xué)院,海南 ???571199)
糖尿?。╠iabetes mellitus,DM)是全球發(fā)病率和導(dǎo)致死亡率增加的主要疾病之一。糖尿病腎?。╠iabetic nephropathy,DN)是糖尿病最嚴(yán)重的腎臟并發(fā)癥,是引起終末期腎病的最主要原因之一[1-3]。DN 發(fā)病的分子機制復(fù)雜多樣,目前尚未完全闡明[4,5]。益智仁(FructusAlpiniae oxyphyllae),性味辛,性溫,入腎、脾經(jīng),是補腎溫腎之良藥,同時又長于固澀縮尿,辛而不循經(jīng)走竄,溫而不燥,具有溫脾止瀉攝涎,暖腎縮尿固精之功效。臨床常用于遺尿,遺精,腎虛等癥,具有抗氧化、抗腫瘤、抗炎及抗應(yīng)激等方面的作用。前期研究發(fā)現(xiàn),益智仁可以明顯降低DN 小鼠血糖濃度、過氧化氫及超氧陰離子含量,減少尿白蛋白排泄量,改善腎臟功能,調(diào)節(jié)腸道微生物的豐富度[6,7]。
代謝組學(xué)可以識別特定生理和病理條件下的特異性分子標(biāo)記物,并可用于研究代謝性疾病的發(fā)病機制和治療藥物的作用機制。研究表明,以代謝組學(xué)為基礎(chǔ)的研究可以闡明中醫(yī)藥治療DN 的部分作用機制[8-10]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是建立在系統(tǒng)生物學(xué)理論基礎(chǔ)上的一門新興學(xué)科,是傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)現(xiàn)代研究的新方法和重點之一,并在分子和系統(tǒng)水平上提供關(guān)于單一草藥或潛在處方的生物活性成分及其作用機制的豐富信息[11]。因此,基于上述原理采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及代謝組學(xué)技術(shù),篩選益智仁治療的DN 相關(guān)潛在生物標(biāo)志物及代謝通路,系統(tǒng)性的分析益智仁治療DN 的作用機制。
益智仁,購自海南同仁堂藥業(yè)有限公司。厄貝沙坦片(安博維),購自賽諾菲(杭州)制藥有限公司,批號:9A275。實驗小鼠[生產(chǎn)許可證:SCXK(蘇)2015-0001,批號T002407],由南京動物研究所提供。
尿素氮測試盒(批號C013)、尿肌酐測定試劑盒(批號C011),上述試劑均購自南京建成生物工程研究所。尿白蛋白試劑盒(批號ml037573),購自上海酶聯(lián)生物科技有限公司。甲醇(CAEQ-4-003302-4000)、甲酸(CAEQ-4-014784-0500)、乙腈(CAEQ-4-000308-4000)均購置CNW 公司。L-2-氯苯丙氨酸(14091-11-3),購自上海恒創(chuàng)生物科技有限公司。
血糖儀(強生,英國);全波長酶標(biāo)儀(BioDeKInstruments,Inc.);冷 凍 離 心 機(Eppendorf);移液槍(Eppendorf,Germany);恒溫水浴鍋(藍(lán)天化驗儀器廠,杭州);恒溫箱(思昊科學(xué)儀器,湖北);全自動樣品快速研磨儀(凈信實業(yè)發(fā)展有限公司,上海);超聲波清洗機(新芝生物科技有限公司,寧波);漩渦振蕩器(汗諾儀器有限公司,上海);高分辨質(zhì)譜儀(Waters);高效液相色譜儀(Waters);色譜柱(Waters)。
以“益智仁”為檢索詞,于TCMSP 在線數(shù)據(jù)(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)中檢索主要活性成分及其相應(yīng)的靶點。以“Diabetic nephropathy”為檢索詞,應(yīng)用Genecards(https://www.genecards.org/)檢索疾病相關(guān)基因。使用在線工具Venny 2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)篩選益智仁治療DN 的作用靶點,并運用Cytoscape 3.7.2 軟件構(gòu)建“藥物-成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖”。
將益智仁治療DN 的作用靶點輸入Omicshare在線工(https://www.omicshare.com/tools/),選擇物種“Homo sapiens”,查找益智仁治療DN 的信號通路,并將信號通路進(jìn)行注釋分析。
實驗室制備濃度為0.25 g/mL 益智仁水煎液及1.67 mg/mL 厄貝沙坦水溶液。小鼠分為4 組,其中DB-/DB-小鼠8 只一組;db-/db-小鼠24 只,隨機分為3 組,每組8 只。所有小鼠置于溫度為(22±1)℃與相對濕度為50%±5%環(huán)境中飼養(yǎng),光照周期為12 h,給予無限的水喂養(yǎng)。DB-/DB-小鼠給予普通飼料喂養(yǎng)。db-/db-小鼠為自發(fā)型2 型糖尿病小鼠,給予高糖高脂飼料飼養(yǎng)4~5 周后,小鼠明顯出現(xiàn)肥胖,8~9 周出現(xiàn)微量白蛋白尿??崭寡牵?6.7 mmol/L(強生血糖儀)、24 h 尿白蛋白含量≥20 mg的為DN 小鼠模型。DN 小鼠造模成功后分為3 個組,分別為益智仁組(db-/db-Y)、厄貝沙坦組(db-/db-IRB)及生理鹽水組(db-/db-S);益智仁灌胃劑量(預(yù)實驗)與厄貝沙坦灌胃劑量(人與小鼠劑量換算公式:小鼠的劑量=9.1×人的劑量mg/kg)分為1.5 mg/g 與0.01 mg/g,灌胃量大約為0.2 mL 左右;正常組與生理鹽水組給予相應(yīng)體積的生理鹽水。連續(xù)灌胃8 周。
腎臟制成石蠟切片→石蠟切片脫蠟→至蒸餾水水洗,過碘酸酒清液10 min→自來水沖洗10 min后,Schiff 氏液染色10 min→流水沖洗5 min,用哈瑞蘇木精染核3 min→流水沖洗5 min,常規(guī)脫水、透明、封固。
1.9.1 稱取60 mg 糞便,向糞便中加入20 μL 的L-2-氯苯丙氨酸、20 μL 的Lyso PC17:0 與600 μL 的甲醇∶水(V∶V=4∶1)。
1.9.2 樣品中加入小鋼珠,在-20 ℃冰箱中放置2 min 預(yù)冷,放入研磨機(60 Hz,2 min),超聲提取10 min,隨后將樣品靜置于-20 ℃冰箱中30 min。
1.9.3 將樣品從冰箱中取出,置于離心機上,13 000 r/min,4 ℃,離心10 min,移液槍吸取200 μL 上清液,使用0.22 μm 的有機相針孔過濾器過濾后,轉(zhuǎn)移到LC 進(jìn)樣小瓶,進(jìn)行LC-MS 分析。
備注:所有提取試劑使用前均在-20 ℃進(jìn)行預(yù)冷。
色譜柱為ACQUITY UPLC BEH C18(100 mm×2.1 mm,1.7 um);流動相為 A-水(含0.1%甲酸),B-乙腈(含0.1%甲酸)。柱溫 45 ℃,流速 0.4 mL/min,進(jìn)樣體積2 μL。質(zhì)譜條件:電噴霧離子源,樣品質(zhì)譜信號采集分別采用正負(fù)離子掃描模式。
尿素氮、尿肌酐、尿白蛋白等數(shù)據(jù)用SPSS16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,結(jié)果以(±s)表示,P<0.05有統(tǒng)計學(xué)意義。代謝產(chǎn)物用UNIFI 1.8.1.軟件采集原始數(shù)據(jù),采集的數(shù)據(jù)用SIMCA 軟件包處理;兩組多元統(tǒng)計分析比較用PLS-DA 分析分析。采用Omicshare 數(shù)據(jù)庫(http://www.omicshare.com),將P值和Fold change 進(jìn)行可視化處理。通過Metabo-Analyst 5.0(https://www.metaboanalyst.ca/)將 篩選到的差異代謝產(chǎn)物富集相應(yīng)的代謝通路。
給藥8 周后,測定各組小鼠尿白蛋白、尿素氮及尿肌酐含量,結(jié)果如表1 所示。與正常組相比,生理鹽水組24 h 尿液中的尿白蛋白、尿素氮及尿肌酐含量均顯著升高(P<0.01 或P<0.001);與生理鹽水組相比,厄貝沙坦組和益智仁組小鼠24 h 尿液中的白蛋白、尿素氮及尿肌酐含量均顯著下降(P<0.05或P<0.01)。
表1 各組小鼠尿白蛋白、尿素氮及尿肌酐含量(n=8,M/24 h,±s)Tab 1 Contents of urinary albumin,urea nitrogen and creatinine in mice of each group(n=8,M/24 h,±s)
表1 各組小鼠尿白蛋白、尿素氮及尿肌酐含量(n=8,M/24 h,±s)Tab 1 Contents of urinary albumin,urea nitrogen and creatinine in mice of each group(n=8,M/24 h,±s)
注:與生理鹽水組比*P<0.05、**P<0.01;與正常組相比##P<0.01、###P<0.001。
組別正常組厄貝沙坦組益智仁組生理鹽水組尿白蛋白0.09±0.01 0.17±0.02**0.38±0.02**1.12±0.04##P—P—P—0.003 0.007 0.000 0.002 0.003 0.001尿素氮19.17±1.27 29.35±3.36**31.16±4.90*56.89±6.20###0.001 0.017 0.000尿肌酐5.84±1.93 11.78±1.74**9.54±2.01**22.81±2.34###
結(jié)果如圖1 所示,給藥灌胃8 周后,與正常組相比,生理鹽水組可見腎小球彌漫性系膜擴張伴系膜細(xì)胞增殖;與生理鹽水組相比,益智仁組與厄貝沙坦組可見腎小球系膜細(xì)胞增生及系膜擴張相對減少。
圖1 腎臟病理切片PAS 染色(箭頭處為腎小球)Fig 1 PAS staining of renal pathological section (the arrow is glomerulus)
結(jié)果如圖2 所示,益智仁共篩選出治療DN 的4個有效成分及其28 個作用靶點。粉色六邊形表示4種有效成分,分別是胡蘿卜素(Daucosterol)、谷甾醇(sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)及谷甾醇棕櫚酸酯(sitosterol palmitate)。藍(lán)色圓形表示28 個作用靶點,包括NFKB1、BAX、PTGS1 及PTGS2 等。每種活性成連接多個靶點,多個靶點也連接多種成分,側(cè)面表明益智仁多成分、多靶點治療DN 的作用特點。
圖2 “藥物-成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)Fig 2 "Drug-component-target-disease" network
KEGG 通路富集分析共篩選出與28 個作用靶點相關(guān)的43 條通路(P<0.05),
剔出P值較小排名靠前的癌癥及其他疾病等假陽性相關(guān)通路,并繪制排名前20 的KEGG 富集分析氣泡圖,主要涉及的信號通路有:NF-κB 信號通路、TNF 信號通路、鞘脂信號通路及細(xì)胞凋亡等,見圖3A。將富集的43 條相關(guān)通路進(jìn)行注釋分析,其中與代謝作用相關(guān)的為脂質(zhì)代謝、輔因子和維生素代謝、外源生物降解與代謝及其他物質(zhì)的代謝等,見圖3B。查閱文獻(xiàn)[12],筆者認(rèn)為脂質(zhì)代謝是益智仁治療DN 過程中主要的代謝途徑之一。
圖3 益智仁治療DN 作用靶點KEGG 富集分析氣泡圖(A)及KEGG 富集通路注釋分析柱狀圖(B)Fig 3 Bubble diagram (A)and annotation histogram (B)of KEGG pathways enriched by the potential targets of Yizhien in the treatment of DN
對實驗小鼠糞便質(zhì)譜信息進(jìn)行PCA 和PLSDA 多元統(tǒng)計比較。PCA 得分圖中模型組和益智仁組糞便樣品分別聚集在一起,結(jié)果見圖4A。PLSDA 圖中2 組樣本呈現(xiàn)較好的聚類效果,2 組明顯區(qū)分,結(jié)果見圖4B。上述結(jié)果均表明兩組樣本之間的存在代謝差異。
圖4 PCA(A)與PLS-DA(B)Fig 4 PCA(A)and PLS-DA(B)
采用OPLS-DA 分析,根據(jù)VIP>1 及t檢驗中P<0.05 的條件,共篩選出益智仁組與DN 組潛在的584 個差異代謝物,包括磷脂酰膽堿PC(16∶0/0∶0)、溶血磷脂酰膽堿LysoPC(18∶1(9Z))及磷脂酰甘油PG(21∶0/0∶0)等。結(jié)果如圖5 所示,通過變量權(quán)重值(VIP 值),將VIP 值排名前30 對差異代謝物表達(dá)量進(jìn)行可視化分析,VIP 值越大,表明該代謝產(chǎn)物在兩組中造成的影響越大。
圖5 VIP 值排名前三十的差異代謝產(chǎn)物熱圖Fig 5 Heatmap of differential metabolites in the top 30 VIP values
運用MetaboAnalyst 5.0 在線數(shù)據(jù)庫,構(gòu)建差異代謝產(chǎn)物的相應(yīng)代謝途徑,篩選符合影響值>0.10且-log(P)>1.5 為條件的代謝途徑作為潛在靶標(biāo)代謝途徑。結(jié)果如圖6 所示,鞘脂代謝影響值與-log(P)值為0.154、2.355,甘油磷脂代謝影響值與-log(P)值為0.216、1.697,表明DN 小鼠模型代謝紊亂主要與鞘脂代謝與甘油磷脂代謝途徑有關(guān)。結(jié)合差異代謝產(chǎn)物分析結(jié)果,鞘脂代謝與甘油磷脂代謝途徑中包含的代謝產(chǎn)物主要為鞘磷脂、磷脂酰膽堿、溶血磷脂酰膽堿及磷脂酰乙醇胺。與生理鹽水組相比,這4 種代謝產(chǎn)物在益智仁組中的均顯著下降(P<0.01,P<0.001 或P<0.0001),結(jié)果如圖7所示。
圖6 DN 相關(guān)代謝途徑Fig 6 DN-related metabolic pathways
圖7 4 種代謝產(chǎn)物在兩組中的含量差異Fig 7 The content difference of four metabolites in two groups
DN 的特征是進(jìn)行性腎臟功能減弱與腎小球濾過率(GFR)<60 mL/min/per1.73 m2。DN 常規(guī)診斷方法主要包括尿白蛋白排泄率增加、腎小球濾過率下降及腎臟病理發(fā)生變化等。本研究通過測定24 h 尿液中尿白蛋白、尿肌酐、尿素氮含量及觀察腎臟病理變化進(jìn)行療效評價,發(fā)現(xiàn)益智仁能顯著降低模型小鼠24 h 尿液中尿蛋白、尿肌酐及尿素氮排泄量,并且能減少模型小鼠腎小球系膜細(xì)胞增生及系膜擴張。
“藥物-成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)圖”分析結(jié)果表明,益智仁治療DN 的相關(guān)基因為28 個,分別為NR3C1、BAX、KL及PTGS2等。糖皮質(zhì)激素受體(Glucocorticoid receptor,NR3C1),主 要 位 于 腎 小球、近端小管和髓袢升支粗段,存在于內(nèi)皮細(xì)胞、足細(xì)胞、系膜細(xì)胞和內(nèi)皮細(xì)胞。研究發(fā)現(xiàn),內(nèi)皮NR3C1 的缺失加速糖尿病腎病的發(fā)展,足細(xì)胞NR3C1 體對于糖尿病患者的腎小球內(nèi)皮細(xì)胞穩(wěn)態(tài)至關(guān)重要[13,14]。促凋亡蛋白(Bax)是Bcl-2 家族的成員,是細(xì)胞凋亡內(nèi)在途徑的核心調(diào)節(jié)因子,在高糖誘導(dǎo)的足細(xì)胞中,Bax 表達(dá)水平明顯上調(diào)[15]。KLKlotho(KL)為一種抗衰老分子,主要在腎臟和大腦的脈絡(luò)膜叢中表達(dá),KL 過表達(dá)可能對治療糖尿病和糖尿病腎病具有潛在的治療作用[16]。PTGS2 又稱環(huán)氧化酶-2(COX-2),是花生四烯酸合成前列腺素的關(guān)鍵基因。Singh 等[17]發(fā)現(xiàn),抑制COX-2 上調(diào)可以改善糖尿病腎病大鼠疾病狀態(tài)。
KEGG 通路富集分析結(jié)果發(fā)現(xiàn),脂質(zhì)代謝是益智仁治療DN 過程中主要的代謝途徑之一。代謝組學(xué)分析結(jié)果顯示的鞘脂代謝與甘油磷脂代謝途徑也證實了這一觀點。基于益智仁組與DN 組差異代謝產(chǎn)物分析,上述代謝途徑中包含的代謝產(chǎn)物主要為鞘磷脂、磷脂酰膽堿、溶血磷脂酰膽堿及磷脂酰乙醇胺,且模型組小鼠在益智仁給藥后,這四種代謝產(chǎn)物含量均有顯著下降。代謝產(chǎn)物會隨著腎臟損傷的進(jìn)程發(fā)展而變化,進(jìn)而成為新的敏感性生物標(biāo)記物。鞘磷脂是真核生物膜磷脂的主要成分之一,與磷脂酰膽堿一起構(gòu)成50%以上的膜磷脂。有報道稱,鞘磷脂調(diào)控炎癥、脂肪組織功能、肥胖、糖尿病和動脈粥樣硬化等相關(guān)疾病的發(fā)展[18,19]。研究表明,高鞘磷脂水平可能導(dǎo)致腎臟疾病的發(fā)生和發(fā)展,增加患終末期腎病的風(fēng)險[20]。磷脂酰膽堿是細(xì)胞膜的主要成分,是脂質(zhì)第二信使的來源和細(xì)胞周期進(jìn)展的決定因素,在體內(nèi)具有多種生物活性,如抗炎[21]、改善腦功能[22]及調(diào)節(jié)脂蛋白穩(wěn)態(tài)[23]等作用。研究發(fā)現(xiàn),與正常組相比,DN 組小鼠代謝物磷脂酰膽堿含量顯著升高[24]。溶血磷脂酰膽堿是磷脂酰膽堿裂解形成的脂質(zhì)生物分子,通過G 蛋白偶聯(lián)受體信號通路對多種細(xì)胞產(chǎn)生有害影響,包括增強炎癥反應(yīng)、誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡和胰島素抵抗等[25]。DN 患者出現(xiàn)腎功能障礙的快速進(jìn)展與溶血磷脂酰膽堿增加有關(guān),溶血磷脂酰膽堿通過激活過氧化物酶體增殖物激活受體δ 引起脂滴積聚,進(jìn)而引起脂滴包被蛋白Perilipin 2 的上調(diào)和自噬通量的減少,從而導(dǎo)致近端腎小管細(xì)胞器應(yīng)激和細(xì)胞凋亡[26]。磷脂酰乙醇胺是真核細(xì)胞中含量排名第二的甘油磷脂,功能上與蛋白質(zhì)生物發(fā)生和活性、氧化磷酸化、自噬、膜融合及線粒體穩(wěn)定有關(guān),并且是其他脂質(zhì)的重要前體。研究發(fā)現(xiàn),磷脂酰乙醇胺是促進(jìn)早期糖尿病腎損害的代謝產(chǎn)物,與非糖尿病對照組相比,糖尿病患者腎小球和腎小管中的磷脂酰乙醇胺水平顯著增加[27]。
綜上所述,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合代謝組學(xué)技術(shù),進(jìn)一步揭示益智仁治療DN 的效應(yīng)物質(zhì)、作用靶點、代謝產(chǎn)物及代謝通路,充分體現(xiàn)了益智仁治療DN 多成分、多靶點、多途徑的作用特點。該方法為今后益智仁治療DN 的研究提供了科學(xué)依據(jù)。
作者貢獻(xiàn)度說明:
倪雅麗:負(fù)責(zé)實驗設(shè)計、數(shù)據(jù)處理及文章撰寫;姚宇劍、武素:負(fù)責(zé)中醫(yī)藥理論解釋、動物造模、樣本采集及檢測;謝毅強:負(fù)責(zé)實驗思路及最終文章的修改。
所有作者聲明不存在利益沖突關(guān)系。