杜文靜,劉丹,叢鑫,龐立麗,毛彤瑤,段招軍
1.甘肅中醫(yī)藥大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院,甘肅 蘭州 730000;2.中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所,北京 102206
札如病毒(sapovirus,SaV)為杯狀病毒科札幌病毒屬成員,于1976 年首次在英國人腹瀉糞便樣本中發(fā)現(xiàn),是引起人及動(dòng)物急性胃腸炎的重要非細(xì)菌性病原體,各年齡段人群均可被感染并導(dǎo)致疾病的發(fā)生[1-2]。
SaV為單股正鏈RNA病毒,其基因組全長7 100 ~7 700 bp,編碼2 或3 個(gè)開放閱讀框(open reading flame,ORF),其中ORF1 編碼1 個(gè)大的多聚蛋白,隨后被切割為6 個(gè)成熟的非結(jié)構(gòu)蛋白(NS1、NS2、NS3、NS4、NS5 和NS6-7)和1 個(gè)主要衣殼蛋白VP1;ORF2編碼次要結(jié)構(gòu)蛋白VP2;ORF3 編碼1 個(gè)小的堿性蛋白,但其功能尚不明確[3-4]。根據(jù)VP1基因的多樣性,SaV 被分為5 個(gè)基因群(GⅠ~GⅤ),其中GⅠ、GⅡ、GⅣ、GⅤ主要感染人[3-9]。2015 年,OKA 等[4]根據(jù)完整VP1核苷酸序列,又將人SaV(HuSaV)進(jìn)一步分為17個(gè)基因型,即GⅠ.1 ~7、GⅡ.1 ~7、GⅣ.1和GⅤ.1 ~2。
雖然SaV 已發(fā)現(xiàn)幾十年,但體外培養(yǎng)的完整體系尚未建立,嚴(yán)重阻礙了其進(jìn)一步研究。目前僅有少數(shù)幾株豬SaV 成功在原代豬腎細(xì)胞或豬腎細(xì)胞系(即LLC-PK1)中獲得培養(yǎng),而這些毒株的成功培養(yǎng)依賴于豬腸內(nèi)容物或膽汁酸的存在[10-12]。膽汁酸的存在是病毒從內(nèi)體逃逸至細(xì)胞質(zhì)以啟動(dòng)病毒復(fù)制的關(guān)鍵[13-15]。由于HuSaV 具有高度的遺傳多樣性,隨著研究的深入及時(shí)間的推移,新基因群或基因型還可能會(huì)出現(xiàn),這將給檢測(cè)、治療及防控帶來更多的困難。為此,本研究對(duì)GⅠ.1 型HuSaV 進(jìn)行體外細(xì)胞培養(yǎng)及其VP1 蛋白多克隆抗體的制備,以期為進(jìn)一步研究該病毒的感染機(jī)制及血清學(xué)診斷方法的建立奠定基礎(chǔ)。
1.1 標(biāo)本、載體及細(xì)胞 GⅠ.1型HuSaV陽性糞便標(biāo)本和pGEX-6P-1 載體均由中國疾病預(yù)防中心病毒病預(yù)防控制所腹瀉室保存;人十二指腸腺癌細(xì)胞(HuTu-80)購自ATCC;E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞購自天根生化科技(北京)有限公司。
1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 2 只SPF 級(jí)新西蘭大白兔,6 ~8 月齡,雌性,體質(zhì)量2.5 kg,購自蘇州博奧龍科技有限公司,動(dòng)物合格證號(hào):SCXK(蘇)2022-0004。本實(shí)驗(yàn)均以科研為目的對(duì)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物進(jìn)行養(yǎng)殖和使用,且嚴(yán)格按照中國疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所動(dòng)物實(shí)驗(yàn)倫理相關(guān)規(guī)定進(jìn)行(20200921048)。
1.3 主要試劑及儀器 DMEM和FBS購自美國Gibco公司;甘氨鵝脫氧膽酸(GCDCA)、甘氨膽酸(GCA)、IPTG 和弗氏佐劑購自美國Sigma 公司;SuperScript?Ⅲ反轉(zhuǎn)錄酶試劑盒購自美國Invitrogen 公司;預(yù)染蛋白marker 購自加拿大Fermentas 公司;HRP 標(biāo)記的山羊抗兔IgG 購自英國Abcam 公司;谷胱甘肽瓊脂糖磁珠和凝膠層析純化柱Superdex20010/600GL購自美國GE Healthcare Life Sciences 公司;QIAGEN One-step RT-PCR 和IAamp 病毒RNA 提取試劑盒購自德國Qiagen公司;Quick Taq HS購自日本Toyobo公司。
1.4 GⅠ.1型HuSaV糞便懸液及稀釋液的制備 在生物安全柜內(nèi)取GⅠ.1 型HuSaV 陽性糞便標(biāo)本并稱重,取0.5 g,加入4.5 mL 無菌DMEM,混勻,用渦旋振蕩器反復(fù)振蕩3 ~4次,4 ℃,1 800×g離心20 min;收集上清至潔凈無菌離心管中,重復(fù)離心1 次;用0.45 和0.22 μm 的濾膜分別過濾離心后的糞便濾液,分裝10%糞便懸液,100 μL/管,置-80 ℃保存。將10%糞便懸液按1∶10 比例用無菌DMEM 稀釋:取10 μL 10%糞便懸液(2×108拷貝/μL),加至90 μL DMEM 中,混勻,得到1∶10 的工作液;再取100 μL 1∶10 工作液,加至900 μL DMEM 中,混勻,得到1∶100的10%糞便懸液。
1.5 HuSaV感染HuTu-80細(xì)胞及其在細(xì)胞中生長動(dòng)力學(xué)檢測(cè) 將生長狀態(tài)良好的HuTu-80 細(xì)胞均勻接種于7.5 cm 培養(yǎng)皿中,待細(xì)胞長至70% ~80%單層后棄去上清,加入100 μL 制備的病毒稀釋液(約2×106個(gè)拷貝數(shù)),同時(shí)分別添加終濃度為500 μmol/L的GCDCA或1 000 μmol/L GCA,每種膽酸鹽設(shè)3個(gè)重復(fù),以不加病毒稀釋液的細(xì)胞作為陰性對(duì)照[16],置于37 ℃,5% CO2培養(yǎng)箱中過夜培養(yǎng);用500 μL 無血清DMEM 洗滌細(xì)胞培養(yǎng)皿3 次,加入1 mL 含2% ~3%FBS 的DMEM 培養(yǎng)液,繼續(xù)培養(yǎng)7 d;取各培養(yǎng)皿細(xì)胞上清液,利用病毒RNA 提取試劑盒提取病毒RNA,通過SuperScript?Ⅲ反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,以其為模板,用Quick Taq HS PCR擴(kuò)增VP1基因(279 bp)。上游引物1245Rfwd:5'-TAGTGTTTGARATGGAGGG-3';下游引物SV-G1-R:5'-CCCBGGTGGKAYGACAGAAG-3',SV-G2-R:5'-CCANCCAGCAAACATNGCRCT-3',SV-G4-R:5'-GCGTAGCAGATCCCAGATAA-3',SV-G5-R:5'-TTGGAGGWTGTTGCTCCTGTG-3'(確定膽酸鹽的選擇)。引物由北京擎科生物科技有限公司合成。PCR反應(yīng)條件:94 ℃2 min;94 ℃30 s,56 ℃30 s,68 ℃25 s,共35個(gè)循環(huán);68 ℃7 min。
為確定GⅠ.1 型HuSaV 感染HuTu-80 細(xì)胞不同時(shí)間的感染動(dòng)力學(xué),采用上述病毒液接種方式,同時(shí)添加1 000 μmol/L選擇的膽酸鹽,分別于感染后1、3、5 和7 d 收獲細(xì)胞上清液,于-80 ℃保存,提取病毒RNA,進(jìn)行RT-qPCR檢測(cè),引物及探針設(shè)計(jì)參照文獻(xiàn)[16]。首先制備標(biāo)準(zhǔn)品:取2 μL濃度為1011拷貝/μL的RNA加入18 μL DEPC水中,渦旋振蕩混勻后,取10 μL加入90 μL DEPC 水中,依次稀釋,直至100拷貝/μL。利用QIAGEN One-step RT-PCR 試劑盒對(duì)不同時(shí)間點(diǎn)提取的病毒RNA進(jìn)行RT-qPCR。
1.6 不同代次GⅠ.1型HuSaV對(duì)HuTu-80細(xì)胞感染性的檢測(cè) 將P1、P2、P3 代次病毒液(約1.5 × 106拷貝)分別接種HuTu-80細(xì)胞,同時(shí)添加1 000 μmol/L選擇的膽酸鹽,分別于感染后1、3、5 d收獲細(xì)胞上清液,提取病毒RNA,進(jìn)行RT-qPCR 檢測(cè)。每代次不同時(shí)間點(diǎn)均設(shè)3個(gè)重復(fù)。
1.7VP1基因的擴(kuò)增 根據(jù)GⅠ.1 型HuSaV 基因序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增VP1全長基因引物。上游引物:5'-GAGGATCCATGGAGGGCAATGGCTCCAATTC-3'(斜體部分為BamHⅠ酶切位點(diǎn)),下游引物:5'-ACGCGTCGACTCATTGGAACACCCGTCTGGCC-3'(斜體部分為SalⅠ酶切位點(diǎn)),擴(kuò)增片段大小為1 686 bp。引物由北京擎科生物科技有限公司合成。利用QIAamp病毒RNA提取試劑盒提取病毒RNA,通過SuperScript?Ⅲ反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA,以其為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)條件:98 ℃30 s;98 ℃10 s,58 ℃30 s,72 ℃50 s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃2 min。
1.8 重組表達(dá)質(zhì)粒的構(gòu)建 用DNA膠回收試劑盒回收PCR 產(chǎn)物,經(jīng)BamHⅠ和SalⅠ雙酶切,通過T4DNA 連接酶連接至同樣經(jīng)BamHⅠ和SalⅠ雙酶切的載體pGEX-6P-1 中,獲得重組表達(dá)質(zhì)粒pGEX-6P-1-VP1,轉(zhuǎn)化E.coliBL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞,涂布含100 μg/mL氨芐青霉素的LB培養(yǎng)板,隨機(jī)挑取單個(gè)陽性菌落培養(yǎng),提取質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定,并送北京擎科生物科技有限公司測(cè)序分析。
1.9 重組VP1 蛋白的表達(dá)及純化 將測(cè)序正確的陽性菌液按1%比例轉(zhuǎn)接至新的1.5 L LB 培養(yǎng)基中,37 ℃培養(yǎng)3 ~4 h,待菌液A600達(dá)0.6 ~1.0時(shí),加入終濃度為0.5 mmol/L 的IPTG,16 ℃誘導(dǎo)過夜;7 000×g離心10 min,棄上清,收集菌體,PBS 重懸,置于冰浴中超聲破碎(功率80%,超聲4 s,間隔7 s)90 min;4 ℃,16 000×g離心60 min,0.45 μm 濾膜過濾上清并留取樣本;同時(shí)設(shè)空質(zhì)粒pGEX-6P-1 轉(zhuǎn)化后并誘導(dǎo)菌液作為陰性對(duì)照。利用谷胱甘肽進(jìn)行蛋白純化:取過濾上清,與谷胱甘肽瓊脂糖磁珠混合,置于翻轉(zhuǎn)搖床中,4 ℃結(jié)合;用25 mL PBS 清洗7 次,加入3C 蛋白酶去除GST 蛋白標(biāo)簽,4 ℃翻轉(zhuǎn)過夜;于親和層析柱中收取流穿液,獲得目的蛋白。12%SDS-PAGE及考馬斯亮藍(lán)染色鑒定表達(dá)及純化產(chǎn)物。
1.10 動(dòng)物免疫 按照每劑500 μg 將純化的VP1 蛋白與弗氏佐劑混合,單劑組分:VP1 抗原380 μL,佐劑500 μL,120 μL 0.9% NaCl。經(jīng)背部皮下多點(diǎn)注射2 只新西蘭大耳白兔,1 mL/只,注射前采集少量兔耳中動(dòng)脈血作為陰性對(duì)照。于18、28、38 d按照初次免疫相同方法分別加強(qiáng)免疫1次。
1.11 血清效價(jià)的檢測(cè) 免疫后18、28、38 和48 d 采集兔耳中動(dòng)脈血,分離血清,ELISA法檢測(cè)血清效價(jià):將濃度為2 μg/mL 純化VP1 蛋白包被96 孔酶標(biāo)板,60 μL/孔,4 ℃孵育過夜;PBS-T 洗滌3 次,加入5%脫脂乳,250 μL/孔,37 ℃孵育1 h;PBS-T 洗滌3次,加入倍比稀釋的待測(cè)血清(起始稀釋度為1∶500),60 μL/孔,同時(shí)設(shè)空白對(duì)照和陰性血清對(duì)照孔,37 ℃孵育2 h;PBS-T 洗滌3次,加入HRP 標(biāo)記的山羊抗兔IgG(1∶5 000 稀釋),60 μL/孔,37 ℃孵育1 h;TMB顯色,1%NaF終止反應(yīng),酶標(biāo)儀測(cè)定A450值。
1.12 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 應(yīng)用GraphpadPrism7.0軟件(Graph-Pad Software,CA,USA)對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行方差分析,以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 HuSaV體外培養(yǎng)膽酸鹽的選擇 GⅠ.1型HuSaV感染的HuTu-80 細(xì)胞添加GCDCA 或GCA 培養(yǎng)7 d后,細(xì)胞上清的PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見279 bp的特異條帶,大小與預(yù)期一致,且GCA能有效促進(jìn)病毒對(duì)細(xì)胞的感染。見圖1。
圖1 HuSaV感染的HuTu-80的PCR產(chǎn)物電泳圖Fig.1 Electrophoretic profile of PCR product of HuTu-80 infected by HuSaV
2.2 GⅠ.1型HuSaV 在HuTu-80細(xì)胞中的生長動(dòng)力學(xué)分析 GⅠ.1 型HuSaV 感染HuTu-80 細(xì)胞并添加GCA后,病毒滴度從感染后1 d的2 log10拷貝/140 μL快速增加至3 d 的4.1 log10拷貝/140 μL,5 d 時(shí)達(dá)病毒增殖平臺(tái)期(約4.5 log10拷貝/140 μL),見圖2。表明GⅠ.1 型HuSaV 感染HuTu80 細(xì)胞后可顯著增殖。
圖2 GⅠ.1型HuSaV在HuTu-80細(xì)胞中的生長動(dòng)力學(xué)Fig.2 Growth kinetics of HuSaV GI.1 in HuTu-80 cells
2.3 不同代次GⅠ.1型HuSaV對(duì)HuTu-80細(xì)胞的感染性 RT-qPCR 結(jié)果顯示,P1、P2、P3 代次GⅠ.1 型HuSaV 均可感染HuTu-80 細(xì)胞,且各代次病毒感染后3、5 d 與1 d 相比,RNA 拷貝數(shù)均顯著上升(P1:F= 143.5,P<0.000 1;P2:F= 41.04,P= 0.000 3;P3:F= 124.3,P<0.000 1),見圖3。表明GⅠ.1 型HuSaV在HuTu-80細(xì)胞中能穩(wěn)定連續(xù)傳3代次。
圖3 不同代次GⅠ.1型HuSaV感染性的鑒定Fig.3 Identification of infectivity of different passages of HuSaV GⅠ.1
2.4VP1基因擴(kuò)增產(chǎn)物的鑒定VP1基因擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析,可見1 686 bp 的特異性片段,大小與預(yù)期一致,見圖4。
圖4 VP1基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig.4 Electrophoretic profile of PCR product of VP1 gene
2.5 重組表達(dá)質(zhì)粒的鑒定 1.5%瓊脂糖凝膠電泳分析顯示,重組表達(dá)質(zhì)粒pGEX-GⅠ.1-VP1經(jīng)BamHⅠ和SalⅠ雙酶切,可見4 984 bp的載體片段和1 686 bp的目的基因片段,大小均與預(yù)期一致,見圖5。測(cè)序結(jié)果表明,重組表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建正確。
圖5 重組表達(dá)質(zhì)粒pGEX-GⅠ.1-VP1的雙酶切(BamHⅠ/SalⅠ)鑒定Fig.5 Restriction map of recombinant expression plasmid pGEX-GⅠ.1-VP1(BamHⅠ/SalⅠ)
2.6 表達(dá)及純化產(chǎn)物的鑒定 12%SDS-PAGE分析顯示,表達(dá)的重組GST-VP1蛋白相對(duì)分子質(zhì)量約86 000,純化后約60 000(切除GST 標(biāo)簽),經(jīng)薄層掃描分析,純化蛋白與重組蛋白約占總蛋白的70%和35%;而誘導(dǎo)的空質(zhì)粒pGEX-6P-1 可見相對(duì)分子質(zhì)量約26 000的GST條帶。見圖6。
圖6 表達(dá)及純化產(chǎn)物的SDS-PAGE分析Fig.6 SDS-PAGE analysis of expressed and purified products
2.7 兔血清效價(jià) ELISA 檢測(cè)結(jié)果顯示,制備的抗HuSaV VP1 蛋白多克隆抗體效價(jià)可達(dá)1∶12 800 以上,見圖7。
圖7 2只兔的抗血清效價(jià)測(cè)定Fig.7 Determination of antiserum titers of two rabbits
SaV被分為5個(gè)基因群(GⅠ~GⅤ),其中GⅠ、GⅡ、GⅣ、GⅤSaV 是引起人群急性胃腸炎散發(fā)和暴發(fā)的主要原因之一,常在托兒所、護(hù)理中心、學(xué)校、軍事機(jī)構(gòu)、醫(yī)院等人口密集場(chǎng)所暴發(fā)群體性或散發(fā)感染,給人類帶來一定的疾病負(fù)擔(dān)[1,17-19]。SaV 與諾如病毒一樣,進(jìn)化速率較快,基因重組和氨基酸位點(diǎn)突變的積累均可擴(kuò)大病毒的多樣性,并進(jìn)化出新的變異毒株。在世界范圍內(nèi),GⅠ和GⅡ是主要的流行毒株,但近年來從患有嚴(yán)重胃腸炎兒童體內(nèi)分離出另一種新的重組GⅡ.NA 型HuSaV[6,8,20]。目前全球尚無特異性藥物或疫苗用于治療和預(yù)防HuSaV感染。
HuSaV 的體外分離培養(yǎng)是研究其感染及致病機(jī)制的前提。研究者一直嘗試用多種原代細(xì)胞和永生化細(xì)胞培養(yǎng)HuSaV,但均未獲得成功。近年,HuSaV的體外培養(yǎng)取得了突破性進(jìn)展,研究顯示,HuSaV 可在添加膽酸鹽(GCA 或GCDCA)的HuTu-80 細(xì)胞中復(fù)制及增殖[16]。因此,本研究以GⅠ.1 型HuSaV 為研究對(duì)象,將其接種添加GCDCA 或GCA 的HuTu-80細(xì)胞,結(jié)果顯示,GCA 能夠有效促進(jìn)HuSaV 對(duì)HuTu-80細(xì)胞的感染及增殖,但GCDCA 未如上述文獻(xiàn)報(bào)道促進(jìn)HuSaV 的感染,分析原因可能國內(nèi)GⅠ.1 型HuSaV 與國外毒株對(duì)膽酸鹽的敏感性存在一定差異。相關(guān)研究顯示,膽汁或膽酸鹽的淤積能引起免疫功能障礙,并干擾內(nèi)源性干擾素活性[21-22]。干擾素自1956 年發(fā)現(xiàn)以來,一直被認(rèn)為是抵抗病毒天然免疫的關(guān)鍵成分[23-24]。推測(cè)這可能是GCA促使HuSaV在HuTu-80 細(xì)胞中增殖的原因。此外,本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,隨著病毒感染代次增加,其增殖能力有衰減趨勢(shì),分析可能該毒株對(duì)HuTu-80 細(xì)胞感染適應(yīng)性并不十分理想,后續(xù)會(huì)進(jìn)一步重復(fù)連續(xù)傳代觀察,以確證該毒株在體外是否具有穩(wěn)定傳代能力,為研究其感染及暴發(fā)流行機(jī)制等提供數(shù)據(jù)支持。近年來,實(shí)驗(yàn)室對(duì)SaV 的診斷及流行檢測(cè)除電鏡觀察其形態(tài)外,最常用的方法是ELISA 和RT-PCR[25-26]。而SaV VP1 蛋白屬于衣殼蛋白,是完整病毒的主要組成部分[4]。因此,本研究用VP1 蛋白免疫動(dòng)物獲得多克隆抗體也將為HuSaV的鑒定提供新方法。