CrossDome 工具或可預(yù)測基于T 細(xì)胞的免疫療法是否會錯誤地攻擊健康細(xì)胞

據(jù)Fonseca AF 2023 年6 月12 日（Front Immunol，2023，14.https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1142573.）報道，美國休斯頓大學(xué)的研究人員努力讓T 細(xì)胞免疫療法更加安全，他們開發(fā)了一種名為CrossDome 的工具，該工具結(jié)合遺傳信息和生化信息來預(yù)測T細(xì)胞免疫療法是否可能錯誤地攻擊健康細(xì)胞。

基于T 細(xì)胞的免疫療法在抗擊癌癥和傳染病方面有著巨大的潛力，因?yàn)樗鼈冇心芰ｉT識別靶向病變細(xì)胞，包括癌癥轉(zhuǎn)移。然而，由于它可能識別健康細(xì)胞的未知靶標(biāo)，這種潛力受到了安全問題的影響。在一種情形下，研究人員構(gòu)建了特殊的T 細(xì)胞，它們被認(rèn)為靶向一種在稱為黑色素瘤的皮膚癌中發(fā)現(xiàn)的蛋白。 然而，這些T 細(xì)胞最終也攻擊一些患者的心臟細(xì)胞，因其蛋白不同。 這對心臟造成了嚴(yán)重?fù)p害。

CrossDome 工具有助于預(yù)測基于T 細(xì)胞的免疫療法的潛在風(fēng)險。 它使用不同類型的信息（稱為多組學(xué)）的組合來進(jìn)行預(yù)測，并確定這種療法除了靶向預(yù)定的病變細(xì)胞之外，是否可能意外地傷害健康細(xì)胞。 通過分析多種因素，CrossDome 為基于T 細(xì)胞的免疫療法的安全性提供了新的見解，并可能幫助人們開發(fā)更安全的治療方法。

為了測試CrossDome 的有效性，研究人員用它來預(yù)測16 個廣為人所知的T 細(xì)胞交叉反應(yīng)病例中的潛在錯誤，包括黑色素瘤-心臟損害病例。該工具成功地將一種心臟蛋白確定為T 細(xì)胞的潛在靶標(biāo)，在數(shù)以千計(jì)的其他蛋白中把它列為高風(fēng)險的候選靶標(biāo)。為了加強(qiáng)這些研究結(jié)果，研究人員結(jié)合了來自不同功能數(shù)據(jù)集的信息，以幫助評估某些基因的表達(dá)量，以及它們與某種名為HLA 的分子結(jié)合的可能性，從而引發(fā)免疫反應(yīng)。 這些信息幫助人們決定哪些潛在的非靶標(biāo)基因值得在實(shí)驗(yàn)中測試。