夏建洪 周立慶 嚴(yán)研 馬婷婷 蘇欣宇
肺腺癌是最常見(jiàn)的肺癌類型。盡管學(xué)者在肺腺癌的診斷和治療策略上已經(jīng)取得了進(jìn)展,但肺腺癌的死亡率依然很高。因此,闡明肺腺癌發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制,尋找早期檢測(cè)的新方法和新的分子治療靶點(diǎn)非常必要。微小RNA(microRNA,miRNA)是一種小的、高度保守的非編碼RNA分子,是一種有前途的生物標(biāo)志物,可用于早期癌癥的檢測(cè)和準(zhǔn)確的預(yù)后,并可作為癌癥治療的靶點(diǎn)[1-2]。miRNA的表達(dá)水平與肺腺癌細(xì)胞的生物學(xué)功能息息相關(guān)[3-4]。miR-30家族包括 miR-30a、miR-30b、miR-30c-1、miR-30c-2、miR-30d、miR-30e,這些基因在不同腫瘤中也起著重要的作用[5-7]。作為miR-30家族的一員,miR-30a-5p也被大家廣泛研究。盡管miR-30a-5p已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)其可以調(diào)控乳腺癌[8]、膽囊癌[9]、肝癌[10]、腎細(xì)胞癌[11]和口腔癌[12]等腫瘤細(xì)胞的發(fā)生、發(fā)展,但其在肺腺癌細(xì)胞中的功能和機(jī)制還鮮有研究。本研究通過(guò)生物信息學(xué)分析、分子實(shí)驗(yàn)和細(xì)胞功能實(shí)驗(yàn)探究miR-30a-5p與細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白對(duì)肺腺癌細(xì)胞增殖和侵襲的調(diào)節(jié)作用,為尋找肺腺癌新的靶向治療方法提供參考。
1.1 材料 肺腺癌細(xì)胞系SPC-A1(批號(hào):BNCC100120)、Calu-3(批號(hào):BNCC338514)、HCC827(批號(hào):BNCC342007)、PC14(批號(hào):BNCC341851)以及人正常支氣管上皮細(xì)胞BEAS-2B(批號(hào):BNCC338205)均購(gòu)自中國(guó)北納生物科技公司。miR-30a-5p模擬物及其陰性對(duì)照(批號(hào):miR10000087-1-5)、miR-30a-5p抑制劑及其陰性對(duì)照(批號(hào):miR20000087-1-5)均購(gòu)自中國(guó)銳博生物公司;Trizol試劑(批號(hào):10296010)、PBS(批號(hào):10010072)、免疫沉淀分析裂解緩沖液(批號(hào):FNN0011),BCA試劑盒(批號(hào):23227)、聚偏二氟乙烯(polyvinylidene fluoride,PVDF)膜(批號(hào):B1000B)均購(gòu)自美國(guó) Thermo Fisher公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒M-MLV reverse transcriptase(批號(hào):18057018)、Lipofectamine 2000試劑(批號(hào):11668019)均購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司;7500 real-time PCR system(批號(hào):4351107)購(gòu)自德國(guó)Applied Biosystems公司;含10%FBS的DMEM培養(yǎng)基(批號(hào):PM150210B)購(gòu)自武漢普諾賽賽生命科技有限公司;TBST溶液(批號(hào):28360)購(gòu)自中國(guó)Solarbio公司;二抗山羊抗兔IgG(1∶2 000,批號(hào):ab205718)、一抗為兔抗纖維連接蛋白(Fibronectin)(1∶1 000,批號(hào):ab32419)、兔抗磷酸化纖維連接蛋白(p-Fibronectin)(1∶1 000,批號(hào):ab3349826)、兔抗 E-鈣黏蛋白(E-Cadherin)(1∶500,批號(hào):ab15148)、兔抗磷酸化E-鈣黏蛋白(p-ECadherin)(1∶5 000,批號(hào):ab226779),兔抗 β-actin(1∶200,批號(hào):ab115777)均購(gòu)自英國(guó)Abcam公司;EC試劑盒(批號(hào):P0018S)購(gòu)自中國(guó)碧云天生物技術(shù)公司;二甲基亞砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)(批號(hào):D5879-100 ml)購(gòu)自美國(guó)Sigma公司;分光光度計(jì)(型號(hào):N50 Touch)購(gòu)自德國(guó)Implen公司;ECM-受體作用信號(hào)通路通道相關(guān)蛋白抑制劑(ML327,HY-103038)購(gòu)自美國(guó)Medchemexpress公司。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng) 將4種肺腺癌細(xì)胞及上皮BEAS-2B細(xì)胞放在含10%FBS的DMEM培養(yǎng)基中,置于37℃、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
1.2.2 細(xì)胞轉(zhuǎn)染及分組 將Calu-3細(xì)胞接種于24孔板(1×105個(gè)細(xì)胞/孔)中,當(dāng)細(xì)胞融合率達(dá)到70%~80%時(shí),根據(jù)產(chǎn)品說(shuō)明書(shū)使用Lipofectamine 2000 Reagent將miR-30a-5p模擬物及其陰性對(duì)照(設(shè)為miR-30a-5p模擬物組、模擬物對(duì)照組)、miR-30a-5p抑制劑及其陰性對(duì)照(設(shè)為miR-30a-5p抑制劑組、抑制劑對(duì)照組)轉(zhuǎn)染到細(xì)胞內(nèi),隨后,將細(xì)胞放置于37℃、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),轉(zhuǎn)染后48 h收集細(xì)胞行進(jìn)一步分析。在miR-30a-5p抑制劑組的細(xì)胞中加入ECM-受體相互作用通路相關(guān)蛋白抑制劑,設(shè)為miR-30a-5p抑制劑+ECM-受體相互作用抑制劑組。
1.2.3 miR-30a-5p的mRNA水平檢測(cè) 采用qRTPCR法。使用Trizol試劑從細(xì)胞中提取總RNA,并使用反轉(zhuǎn)錄試劑盒將miRNA轉(zhuǎn)化為cDNA。然后使用7500 real-time PCR system進(jìn)行qRT-PCR。以U6為miR-30a-5p的標(biāo)準(zhǔn)化內(nèi)參,miR-30a-5p上游引物:5'-TACGGATCCCCTTCATCTTACTTTTTTCCCCCAA-3',下游引物:5'-ATCGCTAGCGAAACTAGAAGCTCGGTGATGAATA-3';U6 上 游 引 物 :5'-GGTCGGGCAGGAAAGAGGGC-3';下游引物:5'-GCTAATCTTCTCTGTATCGTTCC-3'。采用 2-ΔΔCt法計(jì)算不同處理組細(xì)胞中miR-30a-5p相對(duì)表達(dá)量。
1.2.4 ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白(Fibronectin和E-cadherin)的表達(dá)水平及磷酸化水平檢測(cè) 采用Western blot法。將細(xì)胞用冷PBS洗滌3次,加入免疫沉淀分析裂解緩沖液后在冰上裂解10 min,采用BCA試劑盒測(cè)定蛋白水平。4℃12 000 r/min離心20 min,提取蛋白。將蛋白進(jìn)行SDS-PAGE電泳,電泳結(jié)束后將蛋白轉(zhuǎn)移至PVDF膜上。用含5%脫脂牛奶的PBS孵育過(guò)夜,加入一抗,4℃孵育過(guò)夜,一抗孵育結(jié)束后,用TBST溶液室溫下?lián)u床搖動(dòng)洗膜3次,5 min/次。結(jié)束后加入二抗山羊抗兔IgG進(jìn)行孵育,同樣用TBST溶液洗膜3次,5 min/次。用ECL試劑盒拍照觀察蛋白印記,實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。
1.2.5 細(xì)胞增殖能力檢測(cè) 采用噻唑藍(lán)[3-(4,5-dimethyl-2-thiazolyl)-2,5-diphenyl tetrazolium bromide,MTT]實(shí)驗(yàn)。將上述1.2.2部分轉(zhuǎn)染的肺腺癌細(xì)胞Calu-3以每孔4 000個(gè)細(xì)胞的密度接種于96孔板中。分別培養(yǎng)0、24、48、72 h后,每孔中添加20 μl MTT溶液(0.5 mg/ml),在37℃下孵育4 h,丟棄上層液,加入200 μl DMSO溶解細(xì)胞。在490 nm波長(zhǎng)處用分光光度計(jì)測(cè)量吸光度值。
1.2.6 細(xì)胞遷移能力檢測(cè) 采用細(xì)胞劃痕愈合實(shí)驗(yàn)。將細(xì)胞培養(yǎng)于6孔板中,密度為每孔2×105個(gè)。當(dāng)細(xì)胞達(dá)到80%的融合度時(shí),用100 μl無(wú)菌移液管輕輕刮擦穿過(guò)孔中心的單層。細(xì)胞用PBS洗滌后,在含有2%FBS的DMEM中孵育24 h,用顯微鏡觀察細(xì)胞遷移情況并拍照。
1.2.7 細(xì)胞侵襲能力檢測(cè) 采用Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)。Transwell過(guò)濾器的上表面涂有Matrigel。取上述1.2.2部分轉(zhuǎn)染后的肺腺癌細(xì)胞Calu-3進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),當(dāng)細(xì)胞處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期(即融合度達(dá)到70%-80%時(shí)),將細(xì)胞添加于Transwell的上室,下室加入200 μl含有10%FBS的DMEM培養(yǎng)基。37℃孵育24 h后,輕輕取出濾膜和培養(yǎng)基,用棉簽刮除過(guò)濾器上表面未被侵入的細(xì)胞,然后用4%甲醛溶液固定膜下細(xì)胞20 min,細(xì)胞用0.1%結(jié)晶紫染色,在光學(xué)顯微鏡下觀察入侵細(xì)胞并拍照。
1.2.8 生物信息學(xué)方法 通過(guò)癌癥基因組圖譜(the Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://portal.gdc.cancer.gov/)下載表達(dá)量數(shù)據(jù),利用“edgeR包”進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化分析,以miR-30a-5p表達(dá)量中位數(shù)進(jìn)行分組,利用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)軟 件(http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp)對(duì)miR-30a-5p進(jìn)行通路富集分析。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)量資料以表示,組間比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 肺腺癌細(xì)胞系和人正常支氣管上皮細(xì)胞中miR-30a-5p表達(dá)水平比較 與人正常支氣管上皮細(xì)胞BEAS-2B比較,肺腺癌細(xì)胞系SPC-A1、Calu-3、HCC827、PC14中miR-30a-5p表達(dá)水平均下調(diào)(均P<0.05),其中Calu-3細(xì)胞系miR-30a-5p表達(dá)水平相對(duì)較低,故采用Calu-3細(xì)胞系進(jìn)行后續(xù)的功能實(shí)驗(yàn),見(jiàn)圖1。
圖1 肺腺癌細(xì)胞系和人正常支氣管上皮細(xì)胞中miR-30a-5p表達(dá)水平比較
2.2 miR-30a-5p模擬物對(duì)Calu-3細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響 miR-30a-5p模擬物組Calu-3細(xì)胞中miR-30a-5p表達(dá)水平高于模擬物對(duì)照組(P<0.05),見(jiàn)圖2A。培養(yǎng)0、24、48和72 h后,miR-30a-5p模擬物組Calu-3細(xì)胞的增殖能力低于模擬物對(duì)照組(均P<0.05),見(jiàn)圖2B。miR-30a-5p模擬物組Calu-3細(xì)胞的遷移能力低于模擬物對(duì)照組(P<0.05),見(jiàn)圖2C。miR-30a-5p模擬物組Calu-3細(xì)胞的侵襲能力也低于模擬物對(duì)照組(P<0.05),見(jiàn)圖2D。這些結(jié)果顯示上調(diào)miR-30a-5p可以抑制肺腺癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲。
圖2 miR-30a-5p 模擬物對(duì)Calu-3 細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響(A:miR-30a-5p 模擬物組和模擬物對(duì)照組Calu-3 細(xì)胞中miR-30a-5p 的表達(dá)水平比較;B:miR-30a-5p 模擬物組和模擬物對(duì)照組Calu-3 細(xì)胞的增殖水平比較;C:miR-30a-5p 模擬物組和模擬物 對(duì)照組Calu-3 細(xì)胞的遷移變化比較,×40;D:miR-30a-5p 模擬物組和模擬物對(duì)照組Calu-3 細(xì)胞的侵襲能力比較,0.1%結(jié)晶紫染 色,×100)
2.3 miR-30a-5p通過(guò)調(diào)控ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白抑制Calu-3細(xì)胞的侵襲和遷移 GSEA通路富集分析結(jié)果顯示,在Calu-3細(xì)胞中,miR-30a-5p顯著富集在ECM-受體作用信號(hào)通路上,見(jiàn)圖3A。與抑制劑對(duì)照組相比,miR-30a-5p抑制劑組中Fibronectin和E-cadherin的磷酸化水平均上調(diào)(均P<0.05),miR-30a-5p抑制劑+ECM-受體相互作用抑制劑組Fibronectin和E-cadherin的磷酸化水平得到恢復(fù),見(jiàn)圖3B。與抑制劑對(duì)照組相比,miR-30a-5p抑制劑組Calu-3細(xì)胞的增殖能力提高(P<0.05),miR-30a-5p抑制劑+ECM-受體相互作用抑制劑組Calu-3細(xì)胞的增殖能力得到恢復(fù),見(jiàn)圖3C。還發(fā)現(xiàn),與抑制劑對(duì)照組相比,miR-30a-5p抑制劑組Calu-3細(xì)胞的遷移能力上調(diào)(P<0.05),miR-30a-5p抑制劑+ECM-受體相互作用抑制劑組Calu-3細(xì)胞的遷移能力得到恢復(fù),見(jiàn)圖3D。同樣,與抑制劑對(duì)照組相比,miR-30a-5p抑制劑組Calu-3細(xì)胞的侵襲能力上調(diào)(P<0.05),miR-30a-5p抑制劑+ECM-受體相互作用抑制劑組Calu-3細(xì)胞的侵襲能力得到恢復(fù),見(jiàn)圖3E。這些結(jié)果表明miR-30a-5p是通過(guò)調(diào)控ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白的磷酸化水平抑制肺Calu-3細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。
圖3 miR-30a-5p通過(guò)調(diào)控ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白抑制Calu-3細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲(A:miR-30a-5p的GSEA富集通路;B:各處理組細(xì)胞ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白磷酸化水平及蛋白表達(dá)水平比較;C:各處理細(xì)胞組處理后的增殖水平比較;D:各處理組細(xì)胞處理后的遷移能力比較,×40;E:各處理組細(xì)胞處理后的侵襲能力比較,0.1%結(jié)晶紫染色,×100)
肺腺癌是最常見(jiàn)的肺癌類型,嚴(yán)重危害著人類的生存。雖然肺腺癌的治療已經(jīng)取得了相當(dāng)大的進(jìn)展,包括手術(shù)切除、化療、放療或這些方法的結(jié)合,但患者的5年生存率仍然處于較低水平[13]。研究證明,miRNA作為致癌或抑癌基因調(diào)控腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)功能,包括細(xì)胞分化、侵襲、增殖、凋亡等功能[14-15]。作為miR-30a家族中的一員,miR-30a-5p已經(jīng)被證實(shí)與腫瘤的生長(zhǎng)有著必要的關(guān)系[16-18]。本研究證實(shí)miR-30a-5p在肺腺癌細(xì)胞中低表達(dá),而后的功能實(shí)驗(yàn)也證明了在肺腺癌細(xì)胞中過(guò)表達(dá)miR-30a-5p明顯抑制了細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,因此miR-30a-5p在肺腺癌細(xì)胞中很可能是一個(gè)抑癌因子,這與先前許多的研究相一致。例如,miR-30a-5p能夠通過(guò)阻斷F-盒蛋白45(F-box protein 45,F(xiàn)BXO45)的表達(dá)抑制肺鱗狀細(xì)胞癌增殖[19];還能夠通過(guò)靶向核苷酸 2(nucleobindin 2,NUCB2)來(lái)抑制鼻咽癌的進(jìn)展[20]。
ECM-受體相作用信號(hào)通路是細(xì)胞內(nèi)重要信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路之一,其在腫瘤的脫落、黏附、降解、運(yùn)動(dòng)和增生過(guò)程中都起著重要的作用[21]。Yan等[22]發(fā)現(xiàn)ECM參與了胃癌腫瘤細(xì)胞的侵襲過(guò)程。姜黃素能夠通過(guò)抑制致癌轉(zhuǎn)錄因子 AP-2 α(transcription factor AP-2 alpha,TFAP2A)介導(dǎo)的ECM途徑抑制LGR5(+)結(jié)腸直腸癌細(xì)胞的增殖[23]。同樣的,本研究對(duì)miR-30a-5p的GSEA通路富集結(jié)果顯示miR-30a-5p明顯富集在ECM-受體作用信號(hào)通路上。因此,本研究通過(guò)Western blot法檢測(cè)了ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白磷酸化水平,實(shí)驗(yàn)證明在肺腺癌細(xì)胞中下調(diào)miR-30a-5p顯著促進(jìn)了ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白的磷酸化水平。最后的功能實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)miR-30a-5p通過(guò)調(diào)控ECM-受體作用信號(hào)通路促進(jìn)肺腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲。
綜上所述,本研究表明miR-30a-5p在肺腺癌細(xì)胞中顯著下調(diào),miR-30a-5p對(duì)肺腺癌細(xì)胞有負(fù)調(diào)節(jié)作用,過(guò)表達(dá)miR-30a-5p能抑制肺腺癌細(xì)胞的生物學(xué)功能。而且miR-30a-5p對(duì)肺腺癌細(xì)胞的影響有部分是通過(guò)調(diào)控ECM-受體作用信號(hào)通路相關(guān)蛋白達(dá)到的。本研究結(jié)果有助于深入了解miR-30a-5p在肺腺癌中的作用,miR-30a-5p也有望成為肺腺癌早期診斷和臨床治療的分子靶向。