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    甘露聚糖酶AfMan5A和RmMan134C的性質(zhì)差異分析及對多糖的協(xié)同降解

    2023-01-07 03:21:38盧海強(qiáng)王玉印田洪濤谷新晰
    食品科學(xué) 2022年24期
    關(guān)鍵詞:豆膠聚糖親和力

    劉 學(xué),盧海強(qiáng),王玉印,田洪濤,谷新晰

    (河北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院,河北 保定 071000)

    β-甘露聚糖酶(EC3.2.1.78)是一類水解甘露聚糖中β-1,4-D-吡喃甘露糖苷鍵的內(nèi)切酶[1],在食品、養(yǎng)殖業(yè)、造紙、生物燃料等領(lǐng)域應(yīng)用廣泛[2]。甘露聚糖酶主要來自細(xì)菌[3]、真菌[4]及放線菌等微生物[5-6],依據(jù)氨基酸序列和結(jié)構(gòu)差異可分為4 類,即GH5、GH26、GH113和GH134家族。目前GH5家族甘露聚糖酶的研究報道較多,是主要的商業(yè)用酶。2015年,GH134家族甘露聚糖酶首次在構(gòu)巢曲霉(Aspergillus nidulans)中獲得[7],是分子質(zhì)量最小的一類甘露聚糖酶。研究表明GH5、GH26和GH113家族的甘露聚糖酶有較大相似性,同屬于GH-A超家族,具有典型的(β/α)8-磷酸丙糖異構(gòu)酶(triosephoaphate isomerase,TIM)桶狀結(jié)構(gòu)并遵循異頭碳構(gòu)象保留型催化機(jī)制,而GH134家族甘露聚糖酶則表現(xiàn)出明顯差異,顯示出類似溶菌酶的折疊并采用異頭碳反轉(zhuǎn)型催化機(jī)制[8-9]。探究不同家族酶的性質(zhì)差異可為甘露聚糖酶的具體應(yīng)用提供借鑒,如Freiesleben等[10]表征了真菌來源的GH5和GH26家族甘露聚糖酶的性質(zhì),表明GH26家族甘露聚糖酶的最適pH值在5~7范圍內(nèi),最適反應(yīng)溫度在50~68 ℃之間,而GH5家族甘露聚糖酶的最適pH值為3~6,最適反應(yīng)溫度為78~87 ℃,且與GH26家族的甘露聚糖酶相比,其熱穩(wěn)定性強(qiáng);此外在降解甘露聚糖的過程中,發(fā)現(xiàn)GH5家族甘露聚糖酶的初始速率均低于GH26家族的甘露聚糖酶,但兩個家族酶的底物特異性沒有顯示出明顯差異。Tailford等[11]發(fā)現(xiàn),來自芽孢桿菌(Bacillus)的GH5和GH26家族甘露聚糖酶的亞位點對底物所含糖單元的識別與催化有嚴(yán)格特異性,其中來自瓊脂芽孢桿菌(Bacillus agaradhaerens)的BaMan5A在其-2和+1亞位點可容納葡萄糖或甘露糖,而來自枯草芽孢桿菌(B. subtilis)的BsMan26A在其負(fù)結(jié)合位點對甘露糖有嚴(yán)格的特異性。然而,作為結(jié)構(gòu)和催化機(jī)制存在巨大差異的GH5和GH134家族β-甘露聚糖酶的差異分析鮮有報道。

    多糖結(jié)構(gòu)復(fù)雜,分子質(zhì)量大、黏度高、水解困難,其完全降解需要多個酶的協(xié)同作用。對于甘露聚糖酶,已發(fā)現(xiàn)存在同質(zhì)協(xié)同和異質(zhì)協(xié)同兩種協(xié)同水解方法[12]。其中同質(zhì)協(xié)同是兩種主鏈切割酶(如甘露聚糖酶、甘露糖苷酶)或兩種側(cè)鏈切割酶(如乳糖苷酶、乙酰甘露聚糖酯酶)之間的協(xié)同作用,異質(zhì)協(xié)同則是一個主鏈切割酶和一個側(cè)鏈切割酶(如甘露聚糖酶和半乳糖苷酶)之間的協(xié)同作用[13-14]。Han Yejun等[15]研究表明細(xì)菌Caldanaerobius polysaccharolyticus來源的Man5A-TM1和Man5A-TM2對β-甘露聚糖和瓜爾豆膠的降解有協(xié)同作用,Man5A-TM1和Man5B對β-甘露聚糖和羧甲基纖維素的降解有協(xié)同作用,還原糖含量增加。Chen Xi等[3]發(fā)現(xiàn)Bacillus來源的BaMan5A與商業(yè)α-半乳糖苷酶水解半乳甘露聚糖時顯示有協(xié)同作用,最大協(xié)同系數(shù)可達(dá)1.58。因此采用復(fù)合甘露聚糖酶協(xié)同降解多糖,對提高多糖的水解效率有重要意義。

    本研究擬從煙曲霉(A. fumigatus)HBHF5和微孢根霉(Rhizopus microsporus)GZHF10中克隆表征GH5和GH134家族甘露聚糖酶(AfMan5A和RmMan134C),探究兩者在酶結(jié)構(gòu)、酶學(xué)特性、底物特異性和底物親和力方面的差異,并開展酶協(xié)同降解多糖的研究,旨在為GH5和GH134家族甘露聚糖酶的高效催化提供一定理論支持。

    1 材料與方法

    1.1 材料

    菌株A. fumigatusHBHF5、R. microsporusGZHF10、畢赤酵母(Pichia pastoris)GS115、質(zhì)粒pET30a(+)和pPIC9K由本課題組篩選并保存[16];感受態(tài)大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、E. coliBL21(DE3) 北京博邁德基因技術(shù)有限公司;質(zhì)粒提取試劑盒、膠回收試劑盒、RNA提取試劑盒 美基生物科技有限公司;Taq酶、限制性內(nèi)切酶 日本TaKaRa公司;His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒 碧云天生物技術(shù)有限公司;魔芋粉、刺槐豆膠、瓜爾豆膠、角豆膠、殼聚糖 源葉生物有限公司;微晶纖維素、羧甲基纖維素鈉、果膠、甘露糖 北京索萊寶科技有限公司;皂角米多糖由本實驗室提取并保存;其他試劑為國產(chǎn)分析純。

    誘導(dǎo)培養(yǎng)基:0.5% (NH4)2SO4、0.1% KH2PO4、0.05%MgSO4·7H2O、0.001% FeSO4·7H2O、0.02% CaCl2、0.3%酵母浸粉、0.3%魔芋粉;BMGY/BMMY培養(yǎng)基:1%酵母浸粉、2%蛋白胨、1.34%無氨基酸酵母氮源(含硫酸銨)、4×10-5%生物素、1%甘油、0.5%甲醇;LB培養(yǎng)基:0.5%酵母浸粉、1%胰蛋白胨、1%氯化鈉,固體培養(yǎng)基添加2%的瓊脂。

    1.2 儀器與設(shè)備

    T100TM聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)儀 伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品有限公司;SPX-250B-Z恒溫培養(yǎng)箱 上海博遠(yuǎn)實業(yè)有限公司;ZWY-2102C恒溫培養(yǎng)振蕩器 上海智城分析儀器制造有限公司;Universal 320高速冷凍離心機(jī) 德國Hettich公司;SCIENTZ-IID超聲波細(xì)胞粉碎機(jī) 寧波新芝生物科技股份有限公司;HH-2數(shù)顯恒溫水浴鍋 金壇市杰瑞爾儀器廠;TU-1810紫外分光光度計 北京普析通用儀器有限公司;DW-86L388J超低溫冰箱 海爾智家股份有限公司。

    1.3 方法

    1.3.1 生物信息學(xué)分析

    使用MEGA7.0軟件對AfMan5A(AFUA_7G01070)、RmMan134C(ORE23177.1)及其他GH5、GH26、GH113和GH134家族β-甘露聚糖酶的蛋白序列進(jìn)行比對,并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹[17-18]。采用軟件ProtParam(https://www.expasy.org/resources/protparam)分析蛋白質(zhì)理化性質(zhì),PredictProtein(https://predictprotein.org/)分析蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)。選擇與AfMan5A序列一致性為70.35%的晶體結(jié)構(gòu)(PDB:3wh9)和與RmMan134C(PDB:5xxa)序列一致性為77.78%的晶體結(jié)構(gòu)為模板,使用SWISSSMODEL軟件模擬構(gòu)建蛋白結(jié)構(gòu),使用The ConSurf Server(https://consurf.tau.ac.il/)分析蛋白保守序列,并通過軟件Pymol進(jìn)行蛋白保守序列的可視化分析,氨基酸殘基以梯度著色。

    1.3.2 重組甘露聚糖酶基因的克隆與載體構(gòu)建

    菌株A. fumigatusHBHF5和R. microsporusGZHF10分別接種至誘導(dǎo)培養(yǎng)基中,45 ℃培養(yǎng)3 d,離心收集菌體備用。采用RNA提取試劑盒提取總RNA,-80 ℃保存?zhèn)溆谩@靡镞M(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得AfMan5A和RmMan134C基因,并將獲得的基因分別構(gòu)建重組質(zhì)粒pPIC9K-AfMan5A和pET30a-RmMan134C。引物AfMan5APF(GGGGAATTCCCCAGCGCAAAGAAATTCG)、AfMan5A-PR(GAATGCGGCCGCCTAAA CCCACCCCTGCTTC)、RmMan134C-PF(GGGGAATTCAGGCCCGGCGATAGAGGCC)、RmMan134C-PR(GAATGCGGCCGCTTAAATAGCGGTAA CGTCGACCCAG),由金唯智生物科技有限公司合成。

    1.3.3 重組甘露聚糖酶酶液的制備及純化

    質(zhì)粒pPIC9K-AfMan5A經(jīng)限制性內(nèi)切酶BglII線性化,并經(jīng)純化后電轉(zhuǎn)化至GS115感受態(tài)細(xì)胞,質(zhì)粒pET30a-RmMan134C熱激轉(zhuǎn)化至E. coliBL21(DE3)。分別參照酵母表達(dá)手冊和pET系統(tǒng)手冊篩選陽性轉(zhuǎn)化子。AfMan5A的陽性轉(zhuǎn)化子經(jīng) BMGY培養(yǎng)基搖床培養(yǎng)48 h后,菌泥重懸于50 mL BMMY培養(yǎng)基中,繼續(xù)培養(yǎng)72 h,并加入甲醇進(jìn)行誘導(dǎo),保持甲醇終體積分?jǐn)?shù)為0.5%。RmMan134C的陽性轉(zhuǎn)化子接種到含卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基中,直至OD600nm為0.5~0.8時,加入1/1 000的1 mol/L異丙基硫代半乳糖苷,進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。

    采用His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒純化蛋白,并用十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(sodium dodecyl sulfatepolyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)進(jìn)行結(jié)果分析。

    1.3.4AfMan5A和RmMan134C酶活力測定

    參考Miller[19]的方法,采用3,5-二硝基水楊酸(3,5-dinitrosalicylic acid,DNS)法測定甘露聚糖酶酶活力。將100 μL適當(dāng)稀釋的酶液加入到900 μL的0.25%魔芋底物溶液中,搖勻后50 ℃水浴20 min,加入1.5 mL的DNS試劑終止反應(yīng),煮沸5 min后冷卻至室溫,在540 nm波長處測定OD值。酶活力單位(U):該反應(yīng)條件下,每分鐘生成1 μmol甘露糖所需的酶量。

    1.3.5 溫度和pH值對酶活力的影響

    在10、20、30、40、50、60、70、80、90 ℃和100 ℃條件下測定重組酶的最適反應(yīng)溫度,以最高酶活力為100%,計算不同溫度下的相對酶活力。在50 ℃下處理AfMan5A和RmMan134C的酶液0~60 min,按標(biāo)準(zhǔn)方法測定酶活力,分析其熱穩(wěn)定性。以未經(jīng)處理的酶溶液作對照,其酶活力定為100%。

    用100 mmol/L的pH 2~3甘氨酸-鹽酸緩沖液、pH 3~8檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液和pH 8~12甘氨酸-氫氧化鈉緩沖液溶解的底物,按標(biāo)準(zhǔn)方法測定AfMan5A和RmMan134C酶活力,以最高酶活力為100%,計算不同pH值下的相對酶活力。使用上述緩沖液適當(dāng)稀釋酶液,于0 ℃處理酶液1 h,按標(biāo)準(zhǔn)方法測定酶活力,分析其pH值穩(wěn)定性。以最適pH值處理的酶溶液作對照,其酶活力定為100%。

    1.3.6 金屬離子對酶活力的影響

    分析金屬離子(Mg2+,Ca2+,F(xiàn)e3+,Cu2+,Zn2+,Li+,Na+,K+,Mn2+)對酶活力的影響。在標(biāo)準(zhǔn)酶活力反應(yīng)體系中,加入金屬離子,使其終濃度為1 mmol/L和5 mmol/L,以未處理為對照組,其酶活力定為100%,計算不同金屬離子處理酶溶液的相對酶活力。

    1.3.7AfMan5A和RmMan134C的蛋白含量測定

    參照Bradford[20]方法,以牛血清蛋白為標(biāo)準(zhǔn),用考馬斯亮藍(lán)法測定酶液的蛋白含量。

    1.3.8AfMan5A和RmMan134C底物譜和底物親和力的差異分析

    以蛋白質(zhì)量濃度為(1±0.04)mg/mL的酶液進(jìn)行底物譜和底物親和力分析。用pH 5的檸檬酸-磷酸氫二鈉緩沖液配制1.25 g/L的魔芋粉、皂角米多糖、刺槐豆膠、瓜爾豆膠、角豆膠、羧甲基纖維素鈉、微晶纖維素、殼聚糖和果膠底物,按照標(biāo)準(zhǔn)方法,分別在最適反應(yīng)溫度條件下測定酶活力,分析底物特異性。

    取底物溶液4 mL,加入2 mL蛋白質(zhì)量濃度為(1±0.04)mg/mL的酶液,于4 ℃、25 r/min條件下混勻8 h,12 000 r/min離心5 min取上清液,以1.25 g/L的魔芋粉為底物,未與底物結(jié)合酶液的酶活力定為100%,在最適反應(yīng)條件下測定它和上清液的酶活力,計算兩者差值,分析底物結(jié)合的親和力[21]。

    1.3.9AfMan5A和RmMan134C的協(xié)同酶解多糖分析

    取1.3.8節(jié)配制好的底物溶液,按照標(biāo)準(zhǔn)方法,將相同蛋白質(zhì)量濃度((1±0.04)mg/mL)的酶液在各自最適反應(yīng)溫度下反應(yīng),中途煮沸20 min滅活酶液,對照組為單個酶液反應(yīng),并添加100 μL蒸餾水代替酶液。測定AfMan5A和RmMan134C三種協(xié)同反應(yīng),包括兩者同時反應(yīng)、AfMan5A先反應(yīng)和RmMan134C先反應(yīng)。以甘露糖標(biāo)準(zhǔn)曲線計算對照組和雙酶協(xié)同組的還原糖含量,以協(xié)同系數(shù)判定AfMan5A和RmMan134C的協(xié)同降解作用。協(xié)同系數(shù)為協(xié)同組的還原糖含量值與對照組還原糖含量相加值的比值,協(xié)同系數(shù)小于1說明無協(xié)同作用,大于1有協(xié)同作用,且隨著比值的增加,協(xié)同作用顯著[22]。

    1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計

    每個實驗重復(fù)3 次,使用GraphPad Prism 8.0.1、Excel 2010和SPSS Statistics 17.0對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,結(jié)果以進(jìn)行評估。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 AfMan5A和RmMan134C的生物信息學(xué)分析及表達(dá)

    由4 個家族甘露聚酶的進(jìn)化樹結(jié)果可知(圖1),甘露聚糖酶按照家族各自構(gòu)成一個分支,同時發(fā)現(xiàn),GH134家族甘露聚糖酶與其他3 個家族的β-甘露聚糖酶相比,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。這與GH5、GH26和GH113家族的β-甘露聚糖酶屬于同一超級家族(GH-A)有關(guān),都遵循保留型催化機(jī)制,而GH134家族甘露聚糖酶則采用異頭碳反轉(zhuǎn)型催化機(jī)制。

    圖1 GH5和GH134家族β-甘露聚糖酶的系統(tǒng)進(jìn)化樹及結(jié)構(gòu)分析Fig. 1 Phylogenetic tree and structure analysis of β-mannanase from the GH5 and GH134 families

    經(jīng)同源建模分析AfMan5A由8 個α-螺旋及8 個β-折疊交替排列形成了TIM桶狀結(jié)構(gòu),排列在一起的8 個β-折疊片段形成桶狀內(nèi)部凹槽結(jié)構(gòu),與之相連接的α-螺旋則組成桶的外沿,其中有54.96%的無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)、31.1%的α-螺旋結(jié)構(gòu)、13.94%的β-折疊結(jié)構(gòu)。并由8 個保守氨基酸殘基構(gòu)成了該桶狀的活性口袋,分別是R76、H124、N191、E192、H265、Y267、E300及W330,其中第4個及第7個β-折疊的C末端是2 個高度保守的谷氨酸殘基(E192和E300),是β-甘露聚糖酶的親核催化及酸堿催化位點[23-24]。RmMan134C由9 個α-螺旋及2 個反向平行的β-折疊組成,其中無規(guī)卷曲結(jié)構(gòu)占65.03%、α-螺旋結(jié)構(gòu)占27.32%、β-折疊結(jié)構(gòu)占7.65%。分析RmMan134C的氨基酸序列,發(fā)現(xiàn)E55和D67是其活性催化位點,此外173~183位的氨基酸(DTRFWVDVTAI)組成了RmMan134C最短的保守區(qū),且該區(qū)域相對而言最為保守,主要是β-折疊片結(jié)構(gòu),推測可為RmMan134C的蛋白分子機(jī)構(gòu)穩(wěn)定提供保障。

    甘露聚糖酶AfMan5A基因全長1 119 bp,編碼373 個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量約為41.31 kDa,含28 個堿性氨基酸和38 個酸性氨基酸,等電點為5.52,不穩(wěn)定系數(shù)為16.54。RmMan134C基因由549 bp堿基組成,編碼183 個氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量約為20.71 kDa,含21 個堿性氨基酸和21 個酸性氨基酸,等電點為6.91,不穩(wěn)定系數(shù)為26.39。圖2為AfMan5A和RmMan134C的蛋白電泳圖,其分子大小均大于理論值,推測是由于具有糖基化位點[25]和N端的His標(biāo)簽引起[26],仍需進(jìn)一步研究。

    圖2 重組酶AfMan5A和RmMan134C的SDS-PAGE圖Fig. 2 SDS-PAGE pattern of recombinant AfMan5A and RmMan134C

    2.2 AfMan5A和RmMan134C的酶學(xué)性質(zhì)差異

    2.2.1 溫度和pH值對酶活力的影響

    如圖3所示,AfMan5A的最適溫度和最適pH值為60 ℃和6.0,RmMan134C的最適溫度和最適pH值為35 ℃和5.0。AfMan5A在50 ℃熱處理1 h后,可保持(90.0±2.7)%的殘余酶活力,RmMan134C在50 ℃熱處理1 h后,可保持(13.2±2.6)%的殘余酶活力。pH值穩(wěn)定性結(jié)果顯示,AfMan5A在pH 3.0~9.0范圍內(nèi),酶活力較穩(wěn)定,顯示出80%以上的殘余酶活力,RmMan134C在pH 6.0~9.0范圍內(nèi),酶活力較穩(wěn)定,顯示出60%以上的殘余酶活力。結(jié)果表明,AfMan5A屬于高溫酶,RmMan134C屬于中溫酶,熱處理結(jié)果顯示,較高的溫度條件下,AfMan5A的熱穩(wěn)定性優(yōu)于RmMan134C。pH值測定結(jié)果發(fā)現(xiàn),兩者均為偏酸性酶,在酸性和中性pH值范圍內(nèi)均有較好的耐受性。

    圖3 重組酶AfMan5A和RmMan134C的最適溫度(A)、溫度穩(wěn)定性(B)、最適pH值(C)及pH值穩(wěn)定性(D)Fig. 3 Optimum temperature (A), temperature stability (B), optimum pH (C) and pH stability (D) of recombinant AfMan5A and RmMan134C

    2.2.2 金屬離子對酶活力的影響

    通過分析不同金屬離子對AfMan5A和RmMan134C酶活性的影響(表1),發(fā)現(xiàn)金屬離子Cu2+、Zn2+、Mn2+均可抑制兩個酶的酶活力,且Cu2+和Mn2+的抑制作用比Zn2+強(qiáng),但對兩個酶的抑制程度有差別,5 mmol/L的Cu2+、Zn2+和Mn2+對AfMan5A的抑制率為53.2%、21.2%和86.6%,對RmMan134C的抑制率為16.5%、7.6%和70.8%。根據(jù)顯著性分析結(jié)果,Mg2+、Ca2+、Fe3+、Li+、Na+、K+可提高AfMan5A的酶活性,其中Ca2+的促進(jìn)效果最為明顯,可提高175%的酶活力,而這些金屬離子除Fe3+、5 mmol/L的Mg2+和Li+對RmMan134C酶活性有輕微抑制作用外,其余的金屬離子對RmMan134C酶活力影響不大。數(shù)據(jù)表明,AfMan5A和RmMan134C對金屬離子耐受性較好。

    表1 金屬離子對AfMan5A和RmMan134C相對酶活力的影響Table 1 Effects of metal ions on the activity of AfMan5A and RmMan134C%

    2.3 酶的底物特異性及親和力分析

    甘露聚糖酶AfMan5A和RmMan134C對多種底物均表現(xiàn)出一定的水解活性,結(jié)果如表2所示。AfMan5A對甘露聚糖底物的特異性強(qiáng),可水解魔芋葡甘露聚糖及皂角米、刺槐豆膠、瓜爾豆膠和角豆膠來源的半乳甘露聚糖,對纖維素和醛酸類底物沒有顯示出降解能力。RmMan134C較AfMan5A具有更寬的底物譜,對甘露聚糖、纖維素和醛酸類底物均顯示出降解活性,最適底物為魔芋葡甘露聚糖,這一結(jié)果與微孢根霉來源的RmMan134A不同,它對刺槐豆膠(100%)有高酶活性,其次是魔芋(39.4%)和瓜爾豆膠(21.9%)[27]。

    表2 重組酶AfMan5A和RmMan134C的底物特異性和親和力分析Table 2 Substrate specificity and affinity analysis of AfMan5A and RmMan134C

    一般來說,酶的水解速率和酶與底物的吸附能力有關(guān),酶與底物親和力越大,酶催化效率越高,因此,分析酶的底物親和力可能會對酶與底物結(jié)合機(jī)制及在底物降解過程中與其他酶協(xié)同作用提供新的見解。由表2可知,AfMan5A對角豆膠的親和力最小,RmMan134C對刺槐豆膠的親和力最小,但均對魔芋葡甘露聚糖顯示出最高的親和力,這與魔芋葡甘露聚糖是AfMan5A和RmMan134C的最適底物結(jié)果一致。其中米曲霉來源的AoMan134A[28]酶解魔芋粉(kcat/Km=564 mL/(s·mg))時的動力學(xué)參數(shù)大于刺槐豆膠(kcat/Km=527 mL/(s·mg))和瓜爾豆膠(kcat/Km=77 mL/(s·mg)),也表現(xiàn)出相同結(jié)果。此外AfMan5A和RmMan134C對羧甲基纖維素鈉、微晶纖維素、殼聚糖的親和力相近,但AfMan5A對皂角米多糖、刺槐豆膠、瓜爾豆膠和果膠的親和力大于RmMan134C。

    2.4 AfMan5A和RmMan134C的協(xié)同酶解

    由圖4可知,AfMan5A和RmMan134C同時降解魔芋粉、皂角米多糖、刺槐豆膠、瓜爾豆膠和角豆膠底物,協(xié)同系數(shù)均小于1,顯示無協(xié)同效果。而進(jìn)一步探究AfMan5A和RmMan134C反應(yīng)的先后順序?qū)f(xié)同作用的影響,結(jié)果顯示AfMan5A和RmMan134C按不同的先后順序反應(yīng)時,協(xié)同組的還原糖含量仍小于對照組還原糖含量相加值,因此,結(jié)果表明AfMan5A和RmMan134C對甘露聚糖類底物無協(xié)同作用。以羧甲基纖維素鈉或殼聚糖為底物時,發(fā)現(xiàn)AfMan5A先反應(yīng)時顯示有協(xié)同效果,協(xié)同系數(shù)分別為1.29和4.19。在降解微晶纖維素底物時,AfMan5A先反應(yīng)或后反應(yīng),結(jié)果均顯示有協(xié)同作用,協(xié)同系數(shù)為分別為6.10和1.14,且AfMan5A先反應(yīng)時,與其他底物的降解效果相比,其還原糖含量值最高,協(xié)同效果最顯著。結(jié)果表明,AfMan5A和RmMan134C對甘露聚糖類底物無協(xié)同作用,對纖維素類底物有協(xié)同作用,且協(xié)同效果與酶液反應(yīng)的先后順序有關(guān)。因此對于纖維素類底物的降解,AfMan5A和RmMan134C可作為新的酶制劑選擇,高效應(yīng)用于實際生產(chǎn)。

    圖4 AfMan5A和RmMan134C對多糖的協(xié)同酶解作用Fig. 4 Synergistic hydrolysis of AfMan5A and RmMan134C on polysaccharides

    3 討 論

    GH5家族的β-甘露聚糖酶分子質(zhì)量在30~70 kDa之間,具有典型的(β/α)8-TIM桶狀結(jié)構(gòu),催化機(jī)制為保留型。與AfMan5A相比,來源于黑曲霉(A. niger)AEY76082.1、宇佐美曲霉(A. usamii)ADZ99027.1和硫色曲霉(A. sulphureus)ABC59553.1的甘露聚糖酶α-螺旋結(jié)構(gòu)占31.85%、33.94%和31.07%,β-折疊結(jié)構(gòu)占19.06%、18.80%和20.63%,且等電點為4.45、4.38和4.19,均屬于酸性蛋白質(zhì)。目前已報道的4 個GH134家族的β-甘露聚糖酶分子質(zhì)量小,為20 kDa左右,催化機(jī)制為反轉(zhuǎn)型,與GH5家族相比差異顯著。分析蛋白結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),來自于構(gòu)巢曲霉(A. nidulans)AnMan134A[7]、米曲霉(A. oryzae)AoMan134A[28]、鏈霉菌屬(Streptomycessp.)SsGH134[5]和RmMan134A[27]的甘露聚糖酶α-螺旋結(jié)構(gòu)與β-折疊結(jié)構(gòu)的占比差異較大,其中AoMan134A的α-螺旋結(jié)構(gòu)(46.33%)與β-折疊結(jié)構(gòu)的占比(8.47%)相差最大,為37.86%,同時AoMan134A的α-螺旋結(jié)構(gòu)占比也最大。此外,GH134家族的β-甘露聚糖酶等電點在5.5~7.5之間,與GH5家族的β-甘露聚糖酶相比也具有較明顯差異。His標(biāo)簽分子質(zhì)量低,其中His中的咪唑環(huán)可與金屬離子如Ni2+、Zn2+等特異性結(jié)合,被廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)的純化,但也會破壞蛋白質(zhì)構(gòu)象,降低酶的活性和穩(wěn)定性[29]。Halliwell等[30]將His標(biāo)簽融合到嗜熱脂肪芽孢桿菌(B.stearothermophilus)L-乳酸脫氫酶的N端或C端,結(jié)果表明與野生型和N-末端標(biāo)記的酶相比,C-末端標(biāo)記的酶顯示出較低的活性。而Esen等[31]構(gòu)建了N端和C端His標(biāo)記的嗜熱毛殼菌(Chaetomium thermophilum)的甲酸脫氫酶(CtFDH),發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)的溶解度不受標(biāo)簽位置的影響,但與N-CtFDH相比,C-CtFDH 的比活性高約3 倍,催化效率高2 倍。因此關(guān)于His標(biāo)簽對AfMan5A和RmMan134C酶活力的影響仍需進(jìn)一步研究。

    大量研究指出微生物來源的β-甘露聚糖酶最適溫度在40~60 ℃之間,且一般來源于嗜熱微生物的酶最適反應(yīng)溫度較高,如來源于A. nigerManBK[32]、藍(lán)狀菌(Talaromyces leycettanus)Man5A[33]、小巢狀曲霉(A. nidulans)Man5XZ7[34]的GH5家族嗜熱β-甘露聚糖酶的最適溫度分別為80、90、80 ℃。然而本研究的RmMan134C與這些嗜熱菌來源酶有很大不同,其最適溫度為35 ℃,屬于低溫酶,這可能與RmMan134C的氨基酸組成和蛋白結(jié)構(gòu)有關(guān),而且RmMan134C最適溫度與其他報道的GH134家族β-甘露聚糖酶相近,如AnMan134A、AoMan134A、SsGH134和RmMan134A的最適溫度分別為30、30、40、50 ℃。比較酶的最適反應(yīng)pH值,發(fā)現(xiàn)不同來源的β-甘露聚糖酶pH值差異也較大,一般真菌來源的酶最適反應(yīng)pH值偏酸性,細(xì)菌來源的酶最適反應(yīng)pH值偏堿性或中性,測定結(jié)果表明,AfMan5A和RmMan134C的最適反應(yīng)pH值分別為6.0和5.0,無較大差異,且與多數(shù)真菌來源的酶最適pH值相似。值得注意的是,在降解魔芋葡甘露聚糖底物時,發(fā)現(xiàn)RmMan134C的比活力(0.31 U/mg)大于AfMan5A(0.21 U/mg),因此,相比于GH5家族的甘露聚糖酶,GH134家族甘露聚糖酶的催化能力更為明顯。

    與多糖相比,寡糖分子質(zhì)量低,黏度低、生物活性高。目前酶解法因特異性強(qiáng)、條件溫和、綠色環(huán)保等優(yōu)點,已成為制備寡糖的首選方法[35]。此外,由于多糖結(jié)構(gòu)復(fù)雜,難降解,因此采用復(fù)合酶協(xié)同降解多糖來制備寡糖是有必要的,可增強(qiáng)酶解效率和寡糖制備率[36]。本實驗以AfMan5A和RmMan134C為研究對象,探討了兩個酶的不同加樣順序?qū)Χ嗵堑膮f(xié)同降解效果。結(jié)果表明,AfMan5A和RmMan134C對甘露聚糖類底物無協(xié)同作用,對纖維素類底物有協(xié)同作用,且酶液反應(yīng)的順序不同其協(xié)同效果也不同,在酶解羧甲基纖維素鈉和殼聚糖時,AfMan5A先反應(yīng)時具有協(xié)同作用,協(xié)同系數(shù)分別為1.29和4.19,酶解微晶纖維素時,AfMan5A先反應(yīng)和后反應(yīng)均有協(xié)同效果,其中AfMan5A先反應(yīng)時的協(xié)同效果最大,協(xié)同系數(shù)為6.10,這可能是由于多糖結(jié)構(gòu)差異和酶的復(fù)雜性導(dǎo)致產(chǎn)生了不同的協(xié)同效果。

    4 結(jié) 論

    本研究成功從A. fumigatusHBHF5和R. microsporusGZHF10中獲得GH5和GH134家族的β-甘露聚糖酶,發(fā)現(xiàn)兩個酶的三維結(jié)構(gòu)差異明顯。甘露聚糖酶AfMan5A和RmMan134C的最適溫度分別為60 ℃和35 ℃,也相差較大,此外金屬離子對AfMan5A酶活性的影響效果明顯。底物特異性和親和力實驗結(jié)果表明,兩個酶的最適底物均為魔芋葡甘露聚糖,且均對魔芋葡甘露聚糖有最高親和力,但AfMan5A對皂角米多糖、刺槐豆膠、瓜爾豆膠和果膠的親和力大于RmMan134C。兩個酶協(xié)同降解多糖時,發(fā)現(xiàn)對微晶纖維素、殼聚糖和羧甲基纖維素鈉均顯示出一定的協(xié)同作用,其中對微晶纖維素的協(xié)同效果最好。本研究分析了GH5和GH134家族AfMan5A和RmMan134C的結(jié)構(gòu)及性質(zhì),以及二者協(xié)同降解多糖的能力,為β-甘露聚糖酶的實際應(yīng)用提供數(shù)據(jù)支持。

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