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    新型分泌蛋白C6ORF120結(jié)構(gòu)及功能的生物信息學(xué)分析①

    2022-11-25 08:28:34吳苑妮韓曉旭王玉琪首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院北京100015
    中國(guó)免疫學(xué)雜志 2022年16期
    關(guān)鍵詞:糖基化位點(diǎn)氨基酸

    劉 輝 吳苑妮 張 瑞 韓曉旭 王玉琪 李 鑫(首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京地壇醫(yī)院,北京 100015)

    人類6號(hào)染色體是人體內(nèi)重要的染色體之一,近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)6號(hào)染色體上不同開放閱讀框編碼基因及其翻譯蛋白質(zhì)參與多種疾病的發(fā)生發(fā)展,為疾病的治療提供新靶點(diǎn)[1-2]。C6ORF120蛋白是由6號(hào)染色體第120開放閱讀框編碼基因(chromosome 6 open reading frame 120,C6orf120)翻譯成的蛋白質(zhì),是一種新發(fā)現(xiàn)的蛋白質(zhì)。C6ORF120蛋白被認(rèn)為是一種糖基化蛋白,2009年大連大學(xué)肝臟糖蛋白質(zhì)研究組首次提出C6ORF120蛋白可能在人類肝組織內(nèi)表達(dá)[3]。2011年本課題組首先報(bào)道C6ORF120蛋白在肝、淋巴組織及外周血非T淋巴細(xì)胞內(nèi)表達(dá),并且發(fā)現(xiàn)C6ORF120重組蛋白與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)居民蛋白存在共定位現(xiàn)象,提示C6ORF120分泌過(guò)程經(jīng)過(guò)肝細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng),進(jìn)一步研究表明C6ORF120可能通過(guò)誘導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,參與CD4+T細(xì)胞凋亡調(diào)控[4]。2018年ZHANG等[5]研究發(fā)現(xiàn)C6orf120基因敲除對(duì)ConA誘導(dǎo)的免疫性肝損傷有保護(hù)作用,其機(jī)制可能與抑制肝細(xì)胞的凋亡、上調(diào)CD4+CD25+FOXP3+Treg細(xì)胞表達(dá)頻數(shù)、下調(diào)細(xì)胞因子分泌有關(guān)。2019年該團(tuán)隊(duì)又發(fā)現(xiàn)C6orf120基因?qū)Cl4誘導(dǎo)的急性肝損傷可能具有一定的保護(hù)作用,其機(jī)制可能是通過(guò)抑制NLRP3-Caspase1-IL-1β和JNK信號(hào)通路有關(guān)[6]。2020年有學(xué)者進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)C6orf120可能通過(guò)調(diào)控Th17/Treg平衡參與自身免疫性肝炎的發(fā)展[7]。關(guān)于C6orf120的研究逐漸引起關(guān)注,可能是未來(lái)研究肝損傷的潛在分子標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),但是具體結(jié)構(gòu)及作用機(jī)制尚不清楚,迄今鮮有研究報(bào)道C6ORF120蛋白結(jié)構(gòu)及功能相關(guān)的生物信息學(xué)。本文使用生物信息學(xué)分析工具研究C6ORF120蛋白的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)及可能功能,為進(jìn)一步研究C6ORF120蛋白的作用機(jī)制及其作為肝損傷治療潛在靶點(diǎn)提供思路。

    1 材料與方法

    1.1 材料 在全球蛋白資源數(shù)據(jù)庫(kù)UniProt(http://www.uniprot.org/uni-prot)中在線檢索C6ORF120,同源序列物種可能有265種,其中有8種存在于高質(zhì)量的SwissProt數(shù)據(jù)庫(kù)中,包括:人類(HUMAN)、大鼠(RAT)、小鼠(MOUSE)、斑馬魚(DANRE)、食蟹猴(MACFA)、牛(BOVIN)、小雞(CHICK)及熱帶爪蟾(XENTR),獲得相對(duì)準(zhǔn)確的蛋白序列(FASTA格式)用于后續(xù)的生物信息學(xué)研究。

    1.2 方法 在Genecards數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索C6ORF120蛋白編碼基因,并基于THE HUMAN PROTEIN ATLAS數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)C6orf120基因進(jìn)行基因分布分析。在UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行C6ORF120蛋白同源序列物種的檢測(cè)并繪制系統(tǒng)進(jìn)化樹,運(yùn)用Prot Param、DNAMAN軟件分析C6ORF120蛋白的理化性質(zhì)、親水性/疏水性、二級(jí)結(jié)構(gòu),TMHMM軟件分析C6ORF120蛋白的跨膜區(qū),Signal P4.0 Server、BLAST工具分別預(yù)測(cè)其信號(hào)肽、結(jié)構(gòu)域,YinOYang 1.2 server、Net Glycate 1.0 server及Net Phos 3.1 Server在線軟件分析該蛋白翻譯后修飾位點(diǎn),STRING軟件預(yù)測(cè)與C6ORF120蛋白相互作用的蛋白,并且運(yùn)用AmiGO2在線軟件預(yù)測(cè)C6ORF120蛋白的可能生物學(xué)功能。

    2 結(jié)果

    2.1 C6ORF120蛋白編碼基因及表達(dá)情況 在Genecards中檢索“C6ORF120”,發(fā)現(xiàn)人C6ORF120蛋白編碼基因C6orf120所在位置如圖1所示,主要位于6號(hào)染色體長(zhǎng)臂2區(qū)7帶上。

    圖1 C6ORF120蛋白編碼基因位置Fig.1 Gene position of C6ORF120 protein

    在THE HUMAN PROTEIN ATLAS數(shù)據(jù)庫(kù)中分析發(fā)現(xiàn)人類C6orf120基因表達(dá)于60種不同組織中,按照由高表達(dá)到低表達(dá)的順序排列(圖2),可見C6orf120基因在人類肝組織中表達(dá)最高,其次分別是大腦皮層、胎盤、腎上腺等組織,對(duì)肝臟中不同細(xì)胞進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)C6orf120基因在肝臟細(xì)胞中呈現(xiàn)不同表達(dá)(圖3),主要存在于血液/免疫細(xì)胞的T細(xì)胞中,其次為上皮細(xì)胞、血管細(xì)胞、間質(zhì)細(xì)胞,并且發(fā)現(xiàn)細(xì)胞中C6orf120基因被分泌至細(xì)胞外發(fā)揮作用和功能(圖4)。

    圖2 不同組織中C6orf120基因的表達(dá)Fig.2 Expression of C6orf120 in different tissues

    圖3 肝臟不同類型細(xì)胞中C6orf120基因的表達(dá)Fig.3 Expression of C6orf120 gene in different types of liver cells

    圖4 C6orf120在細(xì)胞分泌過(guò)程的預(yù)測(cè)Fig.4 Prediction of C6orf120 secretion in cells

    2.2 C6ORF120蛋白同源序列的獲取 利用Uni-Prot對(duì)C6ORF120蛋白進(jìn)行各物種蛋白序列進(jìn)行檢索,共檢索到265個(gè)結(jié)果,其中SwissProt數(shù)據(jù)庫(kù)有8個(gè)物種,分別為人類、大鼠、小鼠、雞、食蟹猴、牛、斑馬魚、熱帶爪蟾,其中存在于人類中的C6ORF120蛋白長(zhǎng)度為191,與食蟹猴的長(zhǎng)度一致,并對(duì)不同物種C6ORF120蛋白的FASTA數(shù)據(jù)進(jìn)行下載保存,以備后續(xù)使用。

    2.3 C6ORF120蛋白同源序列比對(duì)及進(jìn)化分析將 人 類(Q7Z4R8)、食 蟹 猴(Q9BGQ6)、小 鼠(Q9DAY5)、大 鼠(Q6AY64)、牛(A2VDZ5)、雞(Q5ZLK8)、熱帶爪蟾(Q6DIW0)及斑馬魚(Q6NZZ3)的蛋白FASTA序列輸入MEGA軟件、DNAMAN軟件進(jìn)行C6ORF120蛋白的多序列對(duì)比,提示該蛋白在物種間的一致性為76.8%,提示該蛋白序列呈高度保守,結(jié)果如圖5所示,圖中黃色部分代表完全匹配的序列,可見保守度高且較長(zhǎng)的肽段位于第50~63位氨基酸,包含14個(gè)氨基酸序列。根據(jù)多序列比對(duì)結(jié)果建立系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果如圖6所示,發(fā)現(xiàn)人與食蟹猴、牛、大鼠、小鼠的保守性較高,達(dá)75%以上,其中人與猴間進(jìn)化具有最高保守性,達(dá)到98%,說(shuō)明C6ORF120蛋白在哺乳動(dòng)物間具有較高的保守性,可能具有相似功能。

    圖5 C6ORF120蛋白同源序列的多序列比對(duì)Fig.5 Multi-sequence alignment of homologous sequences of C6ORF120

    圖6 不同物種間C6ORF120蛋白進(jìn)化樹Fig.6 Phylogenetic tree of C6ORF120 protein among different species

    2.4 人類C6ORF120蛋白的理化性質(zhì)及親水性/疏水性預(yù)測(cè)的分析 利用Prot Param數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)人類C6ORF120蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)預(yù)測(cè)分析,該蛋白總氨基酸殘基數(shù)為191個(gè),其中丙氨酸Ala(A)和異亮氨酸Leu(L)占比最高,分別是11.0%和11.5%,天冬酰胺Asn(N)和半胱氨酸Cys(C)占比最低,均為1.0%,帶負(fù)電荷氨基酸殘基(Asp+Glu)和帶正電荷氨基酸殘基(Arg+Lys)的總數(shù)分別為27和12,預(yù)測(cè)該蛋白PI為4.75,呈中性偏酸。蛋白質(zhì)總分子式為C932H1431N245O284S5,其原子總數(shù)為2 897,分子質(zhì)量為20 772.39(約20.77 kD),不穩(wěn)定系數(shù)為47.86,屬不穩(wěn)定蛋白質(zhì)。對(duì)C6ORF120蛋白表達(dá)的其他物種進(jìn)行理化特性分析,包括氨基酸殘基長(zhǎng)度、分子質(zhì)量、理論等電點(diǎn)、穩(wěn)定性指數(shù),如表1所示,總體來(lái)看,C6ORF120蛋白是一種不穩(wěn)定的酸性蛋白質(zhì),這8個(gè)物種的C6ORF120蛋白理化特性差異不大,說(shuō)明C6ORF120蛋白在不同物種進(jìn)化間比較保守。

    表1 各物種C6ORF120蛋白的理化特性Tab.1 Physicochemical characteristics of C6ORF120 protein from various species

    為進(jìn)一步了解人類C6ORF20蛋白的跨膜區(qū)、二級(jí)結(jié)構(gòu),運(yùn)用ProtScale在線軟件進(jìn)行親水性/疏水性檢測(cè)分析,如圖7所示,一般認(rèn)為總分值在(-0.5)~(+0.5)分之間的為兩性蛋白質(zhì),>(+0.5)為疏水性,<(-0.5)為親水性,分值越低親水性越強(qiáng),分值越高疏水性越強(qiáng),發(fā)現(xiàn)C6ORF120蛋白總平均疏水指數(shù)<0,認(rèn)為CORF120蛋白屬于一種親水性蛋白。

    圖7 人類C6ORF120蛋白的親水性、疏水性分析Fig.7 Analysis of hydrophilicity and hydrophobicity of human C6ORF120 protein

    2.5 人類C6ORF120蛋白的亞細(xì)胞定位分析 在Genecards網(wǎng)站對(duì)人類C6ORF120蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析結(jié)果,如圖8所示,發(fā)現(xiàn)該蛋白主要在細(xì)胞外和溶酶體分布,其次存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和線粒體,結(jié)果提示C6ORF120蛋白可能是胞內(nèi)溶酶體相關(guān)蛋白也可能是分泌蛋白,主要在細(xì)胞外發(fā)揮作用,這與C6orf120基因被分泌至細(xì)胞外的預(yù)測(cè)結(jié)果一致。

    圖8 人類C6ORF120蛋白的亞細(xì)胞定位分析Fig.8 Subcellular localization analysis of human C6ORF120 protein

    2.6 人類C6ORF120蛋白結(jié)構(gòu)分析 使用DNAMAN分析軟件預(yù)測(cè)人類C6ORF120蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)可能性及成分比例,如圖9所示,該結(jié)果預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度約72.38%,其中α螺旋占11.0%,β-折疊占24.1%,無(wú)規(guī)則卷曲占64.9%。運(yùn)用SignalP4.0軟件檢測(cè)信號(hào)肽位置,采用神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法描述了前70位氨基酸序列(圖10),發(fā)現(xiàn)在第31位氨基酸位置上C值和Y值最大,說(shuō)明在第31位氨基酸序列上有1個(gè)剪切位點(diǎn),并且S值在這一段序列出現(xiàn)陡降,說(shuō)明在31位氨基酸序列位置上存在信號(hào)肽,D值結(jié)果為YES,說(shuō)明C6ORF120蛋白是一種分泌蛋白。

    圖9 人類C6ORF120蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)可能性預(yù)測(cè)Fig.9 Prediction of secondary structure possibility of human C6ORF120 protein

    圖10 人類C6ORF120蛋白的信號(hào)肽預(yù)測(cè)Fig.10 Signal peptide prediction of human C6ORF120 protein

    運(yùn)用TMHMM軟件對(duì)C6ORF120蛋白進(jìn)行跨膜區(qū)的檢測(cè)(圖11),發(fā)現(xiàn)C6ORF120蛋白含有191個(gè)氨基酸,這與前期結(jié)果一致,其中90%的蛋白位于細(xì)胞外(紫色線),只有約10%的蛋白位于細(xì)胞內(nèi)(藍(lán)色線),不存在跨膜區(qū),這與DNAMAN軟件進(jìn)行跨膜區(qū)檢測(cè)結(jié)果相一致。運(yùn)用CD-seach和pFam數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白質(zhì)的保守結(jié)構(gòu)域檢測(cè)(圖12),發(fā)現(xiàn)C6ORF120蛋白屬于UPF0669/pFam17065家族,保守結(jié)構(gòu)域位點(diǎn)位于7~191位氨基酸序列。

    圖11 人類C6ORF120蛋白的跨膜區(qū)檢測(cè)Fig.11 Detection of transmembrane region of human C6ORF120 protein

    圖12 人類C6ORF120蛋白保守結(jié)構(gòu)域檢測(cè)Fig.12 Detection of conserved domain of human C6ORF120 protein

    2.7 C6ORF120蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)的預(yù)測(cè) 運(yùn)用YinOYang 1.2 server、Net Glycate 1.0 server及Net Phos 3.1 Server在線軟件對(duì)C6ORF120蛋白的O-糖基化、N-糖基化與磷酸化位點(diǎn)進(jìn)行分析,結(jié)果見圖13~15。分析結(jié)果顯示,C6ORF120蛋白在O-糖基化位點(diǎn)有4個(gè),分別位于第12、21、81、105位氨基酸(圖13A),N-糖基化位點(diǎn)有1個(gè),位于第53位氨基酸(圖13B)。磷酸化位點(diǎn)有16個(gè),分別是第21、25、28、71、83、84、88、96、123、127、168、173位絲氨酸(Serine)位點(diǎn),第138位蘇氨酸(Threonine)位點(diǎn),第79、92、134位酪氨酸(Tyrosine)位點(diǎn)(圖13C)。

    圖13 C6ORF120蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)Fig.13 Analysis of post-translational modification sites of C6ORF120 protein

    2.8 C6ORF120蛋白互作蛋白的預(yù)測(cè) 利用STRING構(gòu)建蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)與C6ORF120蛋白相互作用的蛋白較多,圖14中展示出其中聯(lián)系密切的10個(gè),分別是多配體聚糖結(jié)合蛋白(syndecan binding protein,SDCBP)、核糖核酸酶2(recombinant ribonuclease T2,RNASET2)、巖藻糖苷酶1(alpha-L-fucosidase 1,FUCA1)、肌動(dòng)蛋白相關(guān)蛋白10(actin-related protein10,ACTR10)、轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白顆粒1(transport protein particle1,TRAPPC1)、氨基己糖苷酶B(hexosaminidase B,HEXB)、β-半乳糖苷酶(galactosidase beta 1,GLB1)、人γ谷氨酰水解酶(gamma-glutamyl hydrolase,GGH)、GDP解離抑制因子2(GDPdissociation inhibitor 2,GDI2)、ESCRT-Ⅲ相關(guān)分子(ESCRT-Ⅲassociated factor,IST1)。

    圖14 C6ORF120蛋白互作網(wǎng)絡(luò)Fig.14 Interaction network of C6ORF120 protein

    2.9 C6ORF120蛋白的GO功能分析 使用Ami-GO2軟件對(duì)人C6ORF120進(jìn)行基因本體論的分析(圖15),顯示C6ORF120主要分布在細(xì)胞外。在細(xì)胞組分方面,C6ORF120蛋白存在嗜藍(lán)粒顆粒腔(azurophil granule lumen)、細(xì)胞外區(qū)域(extracelluar region)、溶酶體腔(lysosomal lumen)、黑素體(melanosome)、富含ficolin-1的顆粒內(nèi)腔(ficolin-1-rich granule lumen);在分子功能方面,C6ORF120蛋白具有水解酶活性(hydrolase activity)、水解O-糖基化合物(hydrolyzing O-glycosyl compounds)等功能;從生物學(xué)進(jìn)程上來(lái)說(shuō),C6ORF120蛋白具有中性粒細(xì)胞脫粒(neutrophil degranulation)、糖胺聚糖分解代謝過(guò)程(glycosaminoglycan catabolic process)、硫酸角質(zhì)素分解代謝過(guò)程(keratan sulfate catabolic process)、糖脂分解代謝過(guò)程(glycolipid catabolic process)、糖脂代謝過(guò)程(glycolipid metabolic process)、糖鞘脂代謝過(guò)程(glycosphingolipid metabolic process)、碳酸鹽分解代謝過(guò)程(carbohybrate catabolic process)、高分子代謝過(guò)程(macromolecule metabolic process)、己糖代謝過(guò)程(hexose metabolic process)、細(xì)胞生長(zhǎng)的積極調(diào)節(jié)(positive regulation of cell growth)、高爾基囊泡介導(dǎo)的內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum of Golgi vesicle-mediated transport)的功能。

    圖15 C6ORF120蛋白的GO功能富集分析Fig.15 GO function enrichment analysis of C6ORF120 protein

    3 討論

    C6ORF120蛋白是一種由細(xì)胞內(nèi)分泌到細(xì)胞外的新型分泌蛋白,有信號(hào)肽,但是沒有跨膜區(qū),其分泌途徑可能經(jīng)過(guò)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和溶酶體,主要在細(xì)胞外發(fā)揮作用,有研究表明其可能參與調(diào)節(jié)CD4+T細(xì)胞凋亡,但不參與CD8+T細(xì)胞,因此研究C6orf120基因的免疫功能成為熱門。C6orf120基因主要編碼C6ORF120蛋白,定位于6q27,其被發(fā)現(xiàn)于糖尿病、食管癌、先天性髓樣肉瘤、自身免疫性肝病等疾病,但具體功能機(jī)制尚不明確[8-10]。UniProt是信息最豐富、資源最廣、常用的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),由SwissProt和TrEMBL兩大數(shù)據(jù)庫(kù)組成,其中SwissProt為高質(zhì)量的、手工注釋的、非冗余的數(shù)據(jù)集,在基因組注釋中比較常用,而TrEMBL包含未校驗(yàn)的、自動(dòng)注釋的條目,因此本研究選取Uniprot中的SwissProt數(shù)據(jù)庫(kù)作為數(shù)據(jù)來(lái)源。本研究運(yùn)用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)檢索C6ORF120蛋白,發(fā)現(xiàn)C6ORF120蛋白包含191個(gè)氨基酸序列,在Uniprot數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)多個(gè)物種與人C6ORF120蛋白具有相似的序列,其相似度從高等靈長(zhǎng)類動(dòng)物食蟹猴到哺乳動(dòng)物牛、從嚙齒類動(dòng)物大鼠、小鼠到低等脊椎動(dòng)物斑馬魚等依次降低,說(shuō)明C6orf120基因進(jìn)化上相對(duì)保守,其可能參與基本生物學(xué)過(guò)程。對(duì)C6ORF120蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),其肽鏈上α螺旋和無(wú)規(guī)則卷曲水平較高,表明該蛋白具有較好的可塑性。理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn),C6ORF120蛋白是不穩(wěn)定的親水、酸性蛋白質(zhì),可能定位于細(xì)胞外(90%),發(fā)揮多種生物學(xué)作用。

    對(duì)C6ORF120蛋白進(jìn)行功能性位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),其氨基酸序列中存在磷酸化位點(diǎn)、N-糖基化位點(diǎn)及O-糖基化位點(diǎn)。磷酸化位點(diǎn)是信號(hào)傳導(dǎo)調(diào)控中的常見分子結(jié)構(gòu),在細(xì)胞增殖及細(xì)胞周期中有著廣泛的調(diào)節(jié)作用,O-糖基化、N-糖基化位點(diǎn)是蛋白質(zhì)糖基化修飾的識(shí)別位點(diǎn),蛋白質(zhì)的糖基化修飾是生物體調(diào)控蛋白質(zhì)在組織和細(xì)胞中的定位、功能、活性、壽命和多樣性的一種普遍翻譯后方式,使糖鏈與糖結(jié)合蛋白相互作用,參與許多生理或病理過(guò)程,也可以作為微生物和有毒物質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)。由于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)特異性識(shí)別相關(guān)分子是其行使功能的關(guān)鍵,故該蛋白可能通過(guò)磷酸化、糖基化而發(fā)揮多種重要的生物學(xué)作用。

    在Genecards、NCBI、pFam數(shù)據(jù)庫(kù)中對(duì)C6ORF120蛋白分析發(fā)現(xiàn),C6ORF120蛋白屬于UPF0669/pFam17065家族,其結(jié)構(gòu)域位置可能在7~191位氨基酸序列,說(shuō)明該蛋白的功能區(qū)可能位于7~191氨基酸序列上。運(yùn)用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)C6ORF120蛋白互作蛋白構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)C6ORF120蛋白相關(guān)的蛋白有SDCBP、RNASET2、FUCA1、ACTR10、TRAPPC1、HEXB、GLB1、GGH、GDI2、IST1,其中SDCBP蛋白發(fā)現(xiàn)存在于大腸癌、乳腺癌及Sandhoff中[11-12],RNASET2蛋白編碼基因也位于6q27位置,可能是黑色素瘤中的腫瘤抑制基因,F(xiàn)UCA1發(fā)現(xiàn)存在于甲狀腺癌,被p53基因誘導(dǎo),HEXB存在于Sandhoff患兒中,GDI2發(fā)現(xiàn)與黑色素瘤的預(yù)后判斷有關(guān),可能通過(guò)miR-424-5p/SCAI軸發(fā)揮作用[13-16]。可見,與C6ORF120蛋白的作用蛋白多為蛋白酶類,推測(cè)其可能通過(guò)在不同的氨基酸位點(diǎn)發(fā)生磷酸化,從而與多種酶蛋白相互作用發(fā)揮其生物學(xué)功能。對(duì)上述C6ORF120互作蛋白的探索與驗(yàn)證,將有助于揭示以C6ORF120為核心的新型信號(hào)傳導(dǎo)通路。

    可見,人類C6orf120基因可能在體內(nèi)多種生理、病理過(guò)程中發(fā)揮作用,有必要對(duì)其進(jìn)行更深入的研究。本文通過(guò)生物信息學(xué)分析初步揭示了人類自身免疫性肝炎新型基因C6orf120及其編碼產(chǎn)物的基本特性,為進(jìn)一步開展C6orf120基因功能和相關(guān)分子機(jī)制研究奠定基礎(chǔ)。但是,單純運(yùn)用生物信息學(xué)方法進(jìn)行分析所得結(jié)果尚不夠全面,需要進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)結(jié)果加以驗(yàn)證以得到更可靠的依據(jù)。隨著生物信息學(xué)相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)及分析方法的不斷發(fā)展,生物信息學(xué)將會(huì)更廣泛應(yīng)用于多種研究領(lǐng)域,基因編碼蛋白相關(guān)功能的預(yù)測(cè)也將更加準(zhǔn)確。

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