葉 蕊,周玉紅,趙 雪,劉瑞廣,宋 丹,余紅嵐,王 宇△
1.貴陽(yáng)市第一人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,貴州貴陽(yáng) 550004;2.貴州醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與健康學(xué)院,貴州貴陽(yáng) 550025
流感嗜血桿菌(Hi)為革蘭陰性桿菌,無(wú)芽孢、無(wú)鞭毛,呈長(zhǎng)桿狀、球桿狀、絲狀等多形性,定植于人的鼻咽部,是引起社區(qū)獲得性感染的重要病原體,也是重要的條件致病菌。根據(jù)有無(wú)莢膜,可將Hi分為有莢膜(可分型)和無(wú)莢膜(不可分型)兩類(lèi)??煞中桶╝~f等6種血清型;不可分型無(wú)莢膜,不與任何一種分型血清凝集,即不可分型Hi(NTHi)菌株。隨著b型Hi(Hib)疫苗在全球范圍內(nèi)的推廣應(yīng)用,國(guó)內(nèi)外相關(guān)流行病學(xué)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)均表明Hib感染下降明顯,但非莢膜型Hi,尤其是NTHi正在悄然取代Hib逐漸成為重要的兒童下呼吸道感染的優(yōu)勢(shì)病原菌,并呈快速上升趨勢(shì)[1-3]。研究顯示嬰幼兒、老年人是最高危人群,其中免疫力低下及有基礎(chǔ)合并癥的個(gè)體是最易感人群并與高病死率相關(guān)。因此,如何控制NTHi及其他血清型Hi的感染是重要的公共衛(wèi)生問(wèn)題。此外,隨著各類(lèi)抗菌藥物的廣泛使用,Hi對(duì)各類(lèi)抗菌藥物耐藥率及產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶率不斷增加,Hi感染分布特點(diǎn)及耐藥性因呈地域性的差異而備受關(guān)注。本研究對(duì)貴陽(yáng)市第一人民醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱本院)Hi感染病例進(jìn)行分析,以了解本院Hi的分型與分布、產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶及耐藥基因的關(guān)系,有助于正確分析Hi 的耐藥機(jī)制,合理選擇抗菌藥物治療,提高臨床治療效果。
1.1菌株來(lái)源 1 170株Hi菌株(剔除來(lái)自同一患者相同部位的分離菌株)分離自本院2018年1月至2021年12月兒童及成人住院患者的呼吸道標(biāo)本,其中922株分離自痰液標(biāo)本,229株分離自咽拭子標(biāo)本,7株分離自肺泡灌洗液標(biāo)本2株分離自血液。
1.2試驗(yàn)材料 血平板、巧克力平板、MH平板、HTM平板購(gòu)于廣州市迪景微生物科技有限公司;藥敏紙片購(gòu)于賽默飛世爾科技有限公司;β-內(nèi)酰胺酶測(cè)試條購(gòu)于重慶龐通醫(yī)療器械有限公司。Ⅴ因子、Ⅹ因子、Ⅴ+Ⅹ因子紙片購(gòu)于溫州市康泰生物科技有限公司。采用Hi標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC 49247)、金黃色葡萄球菌標(biāo)準(zhǔn)株(ATCC 29213)、糞腸球菌(ATCC 29212)監(jiān)測(cè)質(zhì)控。
1.3儀器與試劑 恒溫水浴鍋、高速離心機(jī)、瞬時(shí)離心機(jī)、生物安全柜、PCR 擴(kuò)增儀(杭州晶格公司)、電泳儀(北京君意公司)和凝膠成像系統(tǒng)(VILBER BIO IMAGING公司)、BD全自動(dòng)細(xì)菌鑒定儀。細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(北京百泰克生物技術(shù)有限公司)、TaKaRa ExTaq 試劑盒 (日本 TaKaRa公司)、DL1000 標(biāo)志物。
1.4引物合成 依據(jù)參考文獻(xiàn)[4]和GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中相關(guān)基因序列設(shè)計(jì)引物。包括Hi特異性外膜蛋白引物omp6、Fuck基因、莢膜bexA基因、β-內(nèi)酰胺酶TEM-1,ROB-1基因等,用于Hi的鑒定、莢膜分型及氨芐西林耐藥Hi基因分型。見(jiàn)表1。
表1 PCR引物序列
1.5方法
1.5.1標(biāo)本分離及培養(yǎng) 標(biāo)本接種嚴(yán)格遵循《臨床檢驗(yàn)操作規(guī)程》(第4版)進(jìn)行操作。將合格送檢標(biāo)本分別接種于血平板及含有萬(wàn)古霉素的巧克力平板上,孵育條件:5% ~10% CO2,35~37 ℃培養(yǎng)18~24 h,挑取巧克力平板上呈優(yōu)勢(shì)生長(zhǎng)的透明或半透明、濕潤(rùn)、光滑、易乳化的疑似菌落,革蘭染色,鏡檢為革蘭陰性短小桿菌。
1.5.2菌株鑒定 用接種環(huán)挑取經(jīng)18~24 h培養(yǎng)的新鮮菌落于5 mL無(wú)菌水內(nèi),調(diào)制成0.5麥?zhǔn)隙染鷳乙海脽o(wú)菌棉拭子浸濕0.5麥?zhǔn)暇壕鶆蛲坎加贛H平板表面,粘貼Ⅴ因子、Ⅹ因子、Ⅴ+Ⅹ因子紙片后置于5%~10%CO2、35~37 ℃培養(yǎng)18~24 h后觀察結(jié)果。若Ⅴ因子、Ⅹ因子邊緣無(wú)細(xì)菌生長(zhǎng),Ⅴ+Ⅹ因子紙片邊緣可見(jiàn)細(xì)菌明顯生長(zhǎng)則初步鑒定為Hi。
1.5.3藥敏試驗(yàn) 采用世界衛(wèi)生組織推薦的紙片擴(kuò)散法(K-B法),挑取單個(gè)菌落配置成0.5麥?zhǔn)隙鹊木鷳乙?,用無(wú)菌棉拭子浸濕0.5麥?zhǔn)暇壕鶆蛲坎加贖i藥敏試驗(yàn)平板(HTM藥敏平板)上,粘貼藥敏紙片后置于5%~10%CO2,35~37 ℃環(huán)境培養(yǎng)18~24 h,測(cè)量抑菌圈直徑,遵循美國(guó)臨床實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(huì)(CLSI)2021版標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行判讀。并采用衛(wèi)生部臨檢中心的Hi(ATCC 49247)作為質(zhì)控菌株。
1.5.4β-內(nèi)酰胺酶測(cè)定 采用頭孢硝噻吩紙片法進(jìn)行測(cè)定。紙片用無(wú)菌水潤(rùn)濕后,蘸取Hi菌落,10 min 內(nèi)紙片由黃色變紅色即為產(chǎn)β-內(nèi)酰胺酶,為陽(yáng)性,不變色為陰性。用金黃色葡萄球菌(ATCC 29213)、糞腸球菌(ATCC 29212)作為質(zhì)控菌株。
1.5.5菌株DNA模板制備 采用DNA提取試劑盒(購(gòu)自北京百泰克生物技術(shù)有限公司)提取DNA模板。保存于-20 ℃冰箱備用。
1.5.6PCR檢測(cè) 采用TaKaRa ExTaq試劑盒(日本TaKaRa公司),反應(yīng)體系參照說(shuō)明書(shū)。擴(kuò)增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 30 s、50 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min(以O(shè)mp6為例,其余基因引物退火溫度見(jiàn)表1)。用無(wú)菌去離子水作陰性對(duì)照。
1.5.7瓊脂糖凝膠電泳 取5 μL擴(kuò)增產(chǎn)物,上樣于1.5%瓊脂糖凝膠加樣槽中,同時(shí)留1個(gè)空孔加入5 μL 1 000 bp相對(duì)分子質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn),恒壓100 V 25 min,于凝膠成像系統(tǒng)下觀察擴(kuò)增條帶,根據(jù)凝膠電泳結(jié)果判斷:P6基因和Fuck基因均陽(yáng)性則為Hi;P6基因陽(yáng)性,F(xiàn)uck基因陽(yáng)性,bexA基因陰性則為NTHi;P6基因陽(yáng)性,F(xiàn)uck基因陽(yáng)性,bexA基因陽(yáng)性則為莢膜型Hi。
1.5.8產(chǎn)物測(cè)序 將條帶明亮的PCR產(chǎn)物送至昆明擎科生物公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果在GenBank 數(shù)據(jù)庫(kù)中網(wǎng)上查詢比較,進(jìn)行 Blast比對(duì)分析。
1.6統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用WHONET5.6對(duì)所分離菌進(jìn)行藥敏分析,統(tǒng)計(jì)各抗菌藥物敏感率、耐藥率的情況,應(yīng)用SPSS22.0統(tǒng)計(jì)軟件及Excel軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)和分析,計(jì)數(shù)資料以率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn),P<0.05表示差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1Hi的PCR鑒定與分型 本研究收集的Hi菌株經(jīng)PCR鑒定分型檢測(cè)后均為NTHi。P6、Fuck基因,PCR產(chǎn)物凝膠電泳圖見(jiàn)圖1,均未檢出bexA基因。
2.2Hi分布及抗菌藥物耐藥性分析 收集的1 170株Hi菌株共來(lái)自19個(gè)科室,主要來(lái)自兒科及呼吸內(nèi)科,各占67.44%(789/1 170)、9.6%(101/1 170),其余來(lái)自其他各個(gè)科室(耳鼻喉科、全科、腎內(nèi)科等)。2018-2021年2歲以下兒童Hi分離率為54.44%(637/1 170),≥60歲以上老年人Hi分離率為17.18%(201/1 170)。將所有病例分為兒童組(≤14歲)及成人組(>14歲),并進(jìn)行各年度及2018-2021年耐藥率的分析。2018年成人組與兒童組阿奇霉素、左氧氟沙星耐藥率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),2020年成人組與兒童組氨芐西林、頭孢呋辛、左氧氟沙星耐藥率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)表2~6。
表2 2018年Hi對(duì)抗菌藥物的耐藥率(%)
表3 2019年Hi對(duì)抗菌藥物的耐藥率(%)
表4 2020年Hi對(duì)抗菌藥物的耐藥率(%)
表5 2021年Hi對(duì)抗菌藥物的耐藥率(%)
表6 2018-2021年Hi對(duì)抗菌藥物的耐藥率(%)
2.3菌株β-內(nèi)酰胺酶及其耐藥基因檢測(cè) 2018-2021年547株氨芐西林耐藥菌株經(jīng)頭孢硝噻吩紙片法檢出426株β-內(nèi)酰胺酶陽(yáng)性菌株,經(jīng)PCR及瓊脂凝膠電泳檢測(cè)耐藥基因型均為T(mén)EM-1型,未檢出ROB-1基因型。見(jiàn)表7。PCR產(chǎn)物凝膠電泳圖見(jiàn)圖2。
表7 2018-2021年Hi β-內(nèi)酰胺酶的檢出率對(duì)比
Hi常引起社區(qū)獲得性呼吸道感染、肺炎、支氣管炎、急性中耳炎、細(xì)菌性腦膜炎等疾病;嚴(yán)重者可引起化膿性腦膜炎和敗血癥等全身感染[5];主要感染免疫力相對(duì)低下的人群,如圍產(chǎn)兒、嬰幼兒、老年人等[2];感染以冬春季節(jié)高發(fā)[6-7];Hib是引起兒童Hi疾病的主要原因[8],但隨著Hib疫苗的推廣應(yīng)用,Hib的感染極大減少,而其他血清型及NTHi的感染呈逐年上升趨勢(shì)[9]。
本次研究的1 170株Hi,主要分布于兒科,以患肺炎為主。檢出Hi的標(biāo)本包括痰、咽拭子、分泌物、肺泡灌洗液、血液等,其中以痰標(biāo)本常見(jiàn),占78.80%(922/1 170)。這與TORUMKUNEY等[10]檢出標(biāo)本類(lèi)型研究一致,這可能與呼吸道感染常見(jiàn)咳痰癥狀,痰液獲得性高相關(guān)。2018-2021年2歲以下兒童Hi分離率為54.44%(637/1 170),≥60歲以上老年人Hi分離率為17.18%(201/1 170)。2歲以下兒童占比超過(guò)50%,可能與該年齡段兒童的免疫系統(tǒng)不健全,缺乏對(duì)Hi的抵抗力有關(guān);老年人感染的原因是機(jī)體免疫力、生理功能等隨著年齡的增長(zhǎng)不斷衰退,同時(shí)伴隨各系統(tǒng)基礎(chǔ)疾病的原因等導(dǎo)致感染率增加[11]。
本研究收集的Hi菌株經(jīng)PCR鑒定分型檢測(cè)后均為NTHi,均未檢出bexA基因,這與ELDERE 等[2]、王姜琳等[12]研究結(jié)果一致。通過(guò)2018-2021年兒童與成人藥敏結(jié)果對(duì)比可見(jiàn)2018年兒童的阿奇霉素耐藥率和2018-2021年兒童的左氧氟沙星耐藥率和2018年、2020年成人的左氧氟沙星耐藥率與我國(guó)細(xì)菌耐藥性監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)比較,均高于全國(guó)水平,其余抗菌藥物均低于其監(jiān)測(cè)結(jié)果[13-17]。針對(duì)2018年兒童組阿奇霉素較高耐藥率的情況,臨床依據(jù)耐藥監(jiān)測(cè)結(jié)果調(diào)整用藥習(xí)慣,2019-2021年兒童組阿奇霉素耐藥率有了明顯的降低。因?yàn)榕R床對(duì)于兒童及成人兩個(gè)年齡群在入院肺炎診治時(shí)用藥習(xí)慣不同,呈現(xiàn)出對(duì)于氨芐西林、頭孢呋辛、左氧氟沙星等抗菌藥物耐藥率比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。本研究2018-2021年氨芐西林及頭孢呋辛兒童組與成人組的耐藥率均為波動(dòng)性變化,這與2018-2021年全國(guó)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)變化一致[13-17]。2020年氨芐西林及頭孢呋辛兒童組與成人組的耐藥率均呈現(xiàn)小幅度降低,但2018年與2021年比較兩種抗菌藥物的耐藥率明顯上升。本研究2018-2021年兒童組左氧氟沙星耐藥率均高于每年度細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù),耐藥率增高幅度以2019年較為明顯,考慮喹諾酮類(lèi)抗菌藥物的作用機(jī)制,需謹(jǐn)慎使用該藥物。對(duì)于該藥物的抑菌環(huán)邊緣值結(jié)果需確保菌種純度,必要時(shí)進(jìn)行結(jié)果復(fù)核。本研究2018年與2021年耐藥率比較可見(jiàn)兒童組及成人組的阿莫西林/克拉維酸、氨芐西林/舒巴坦、復(fù)方磺胺甲噁唑等抗菌藥物的耐藥率均呈上升趨勢(shì),兒童組及成人組均對(duì)三代頭孢菌素、美羅培南等抗菌藥物敏感性較高??赡苁且?yàn)榈貐^(qū)不同,耐藥率有所差異,但耐藥趨勢(shì)一致。
氨芐西林作為Hi感染的首選用藥,隨著廣泛的使用,耐藥率也逐漸上升,根據(jù)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示2018—2021年其耐藥率從57.2%上升至72.9%,上升幅度明顯。氨芐西林的耐藥通過(guò)兩種作用機(jī)制,其中β-內(nèi)酰胺酶的產(chǎn)生是主要的機(jī)制,它通常由TEM-1基因和罕見(jiàn)的ROB-1基因編碼[18]。第2種機(jī)制是細(xì)菌細(xì)胞壁上青霉素結(jié)合蛋白 3(PBP3) 的 ftsI 基因氨基酸位點(diǎn)置換使空間構(gòu)象發(fā)生改變,導(dǎo)致細(xì)菌與 β-內(nèi)酰胺類(lèi)抗菌藥物親和力下降,并影響氨基青霉素、β-內(nèi)酰胺酶抑制類(lèi)抗菌藥物和第一、二代頭孢的抗菌藥物活性[19]。本研究547株氨芐西林耐藥菌株經(jīng)頭孢硝噻吩紙片法,檢出426株β-內(nèi)酰胺酶陽(yáng)性菌株,陽(yáng)性率77.88%(426/547);耐藥基因型均為T(mén)EM-1型,未檢出ROB-1基因型,這與王姜琳等[12]、秦惠宏等[20]報(bào)道一致。β-內(nèi)酰胺酶陰性氨芐西林耐藥菌株(BLNAR)的檢出,是否是導(dǎo)致本院β-內(nèi)酰胺酶陽(yáng)性,以及第一、二代頭孢菌素和氨芐西林耐藥率高的原因還有待進(jìn)一步研究,應(yīng)引起重視。本次β-內(nèi)酰胺酶檢出率較全國(guó)細(xì)菌耐藥監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)高,可能是由于各地區(qū)用藥習(xí)慣不同而導(dǎo)致,氨芐西林已不適用于Hi感染首選治療。
研究發(fā)現(xiàn),定植于下呼吸道的NTHi可釋放高度炎癥抗原,如脂寡糖等,長(zhǎng)期不被消除會(huì)引起宿主的慢性復(fù)發(fā)性感染,反復(fù)抗菌藥物治療又增加耐藥菌株[21]。目前,一些國(guó)家都因Hib結(jié)合疫苗的接種降低了Hib感染率[22-23],而我國(guó)一些地區(qū)Hib結(jié)合疫苗的聯(lián)合接種率僅為54.9%[24],面對(duì)NTHi及其他血清型Hi感染的增加,有必要將Hib疫苗納入國(guó)家免疫Ⅰ類(lèi)計(jì)劃,并及時(shí)實(shí)施標(biāo)準(zhǔn)化的監(jiān)測(cè)方案和分型方法來(lái)監(jiān)測(cè)NTHi極為重要。本研究進(jìn)一步提示本院針對(duì)Hi感染應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)檢測(cè)并進(jìn)行分型研究,積極普及疫苗接種,以及結(jié)合藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果合理選用抗菌藥物,減少耐藥菌株的產(chǎn)生。