金科華,向念慈,劉 洋
(1.湖北科技學(xué)院醫(yī)學(xué)部基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,湖北 咸寧 437100;2.湖北科技學(xué)院醫(yī)學(xué)部藥學(xué)院)
正常細(xì)胞在氧氣供應(yīng)充足時(shí),采用氧化磷酸化為其提供能量。旺盛生長的腫瘤細(xì)胞即使氧氣充足,也進(jìn)行旺盛的糖酵解,并為其提供ATP和合成核苷酸的原料,這一特點(diǎn)稱為Warburg效應(yīng)[1]。糖酵解途徑的抑制劑已有良好的抗腫瘤作用[2-5]。烯醇化酶1(ENO1)是糖酵解通路的重要酶,催化2-磷酸甘油酸轉(zhuǎn)化為磷酸烯醇式丙酮酸。已發(fā)現(xiàn)ENO1在肺癌、結(jié)腸癌、卵巢癌等癌細(xì)胞中高表達(dá)[6-9],已成為不少腫瘤細(xì)胞的診斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)[10]。抑制ENO1能干擾卵巢癌等腫瘤細(xì)胞的生長[11-12]。本研究旨在利用重組DNA技術(shù),在原核細(xì)胞中表達(dá)和純化ENO1,為建立ENO1抑制劑篩選模型奠定基礎(chǔ)。
ENO1 cDNA(廈門大學(xué)韓家淮院士饋贈(zèng));質(zhì)譜純引物、卡那霉素、IPTG、DNA相關(guān)操作試劑盒(生工生物工程股份有限公司);限制性核酸內(nèi)切酶(NEB公司);大腸桿菌、DNAMarker(北京全式金生物技術(shù)公司);DNA聚合酶、DNA連接試劑盒(TaKaRa公司);可溶性His標(biāo)簽蛋白純化試劑盒(康為世紀(jì)生物科技有限公司);蛋白質(zhì)marker(Thermo Scientific公司);BCA蛋白質(zhì)定量測定試劑盒(Bio-sharp公司);15mL截流分子量10KD超濾管(Millipore公司)。其余試劑為國產(chǎn)分析純,實(shí)驗(yàn)儀器略。
用Snapgene軟件設(shè)計(jì)擴(kuò)增ENO1 cDNA的上游引物PF:CACCATATGATGTCTATTCTCAAGATCCATGC;下游引物PR:ATCCTCGAGTTACTTGGCCAAGGGGTTTCTG。前三個(gè)字母是保護(hù)堿基,下劃線處分別為限制酶Nde I和Xho I位點(diǎn)。
將含ENO1 cDNA的菌液于37℃,260r/min培養(yǎng)24h,再按1∶100接種至含100μg/mL氨芐青霉素的LB,同法培養(yǎng)過夜,用柱式質(zhì)粒小量提取試劑盒制備含ENO1 cDNA的質(zhì)粒,按表1和2 PCR擴(kuò)增ENO1 cDNA。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定并切膠回收純化。
表1 PCR體系
表2 PCR參數(shù)
表3酶切ENO cDNA、pET-28a。用瓊脂糖凝膠電泳分離酶切的cDNA、質(zhì)粒pET-28a,并用試劑盒回收純化。取酶切的cDNA、pET-28a各2.5μL與5μL Solution I混合,16℃連接1h。連接產(chǎn)物熱激法轉(zhuǎn)化Top10感受態(tài)細(xì)胞,于含100μg/mL卡那霉素的LB平板(LBK培養(yǎng)基)篩選抗性菌落。
表3 酶切ENO1 cDNA、pET-28a及pET-28a-ENO1
按表3酶切重組質(zhì)粒pET-28a-ENO1和空質(zhì)粒pET-28a,用1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定酶切產(chǎn)物。酶切鑒定與ENO1 cDNA分子量相符的重組質(zhì)粒送華大基因測序。
按方法1.3將pET-28a-ENO1轉(zhuǎn)化BL21(DE3)細(xì)胞,用接種針取一個(gè)單菌落接種于4mL LBK培養(yǎng)基,37℃ 260r/m培養(yǎng)過夜,作種子液。將1.5mL種子接種于150mL LBK培養(yǎng)基,平行接種兩份,37℃ 260r/m培養(yǎng)至OD600約0.7,一份加入終濃度0.2mmol/L的IPTG,另一份加蒸餾水作為對(duì)照,16℃ 260r/m培養(yǎng)24h。12 000r/min 4℃離心3min,收集菌體,稱重,按每克菌體加10mL蛋白抽提緩沖液(含1mmol/L PMSF)的比例,重懸菌體。以260W超聲10s停10s的程序,裂解菌體1h。裂解液于12 000r/min,4℃離心15min,取上清。預(yù)留120μL裂解液上清用于SDS-PAGE檢測。將上清與等體積Binding Buffer混合。向50mL離心管中加入3mL純化填料,12 000r/min,4℃離心2min,棄上清。用5倍體積的超純水重懸,洗滌殘留乙醇,12 000r/min,4℃離心2min,棄上清。重復(fù)洗滌一次。用5倍體積的Binding Buffer重懸填料,12 000r/min 4℃離心重懸的填料5min,棄上清。將混合后的上清液與填料4℃混勻10min,12 000r/min 4℃離心5min,吸走上清。20mmol/L咪唑洗滌:向離心管內(nèi)加入20mL含20mmol/L咪唑的Binding Buffer,4℃混勻5min,12 000r/min 4℃離心5min,取上清,重復(fù)此步2次,合并洗滌液,記為洗滌液1。40mmol/L咪唑洗滌:同法用含40mmol/L咪唑的Binding Buffer,洗滌填料3次,合并洗滌液,記為洗滌液2。500mmol/L咪唑洗脫:用60mL含500mmol/L咪唑的Binding Buffer洗脫ENO1,合并洗脫液。
洗脫的ENO1加入截留分子量(molecular weight of cut off,MWCO)10KD的超濾管,4 000×g 4℃離心濃縮至1.5mL,加入10.5mL pH7.2的PBS稀釋濃縮液,混勻,再次離心濃縮至1.5mL,重復(fù)稀釋—濃縮步驟10次,最后將ENO1濃縮至4mL。
取濃縮后的ENO1 10μL,用PBS稀釋20倍,BCA試劑盒測定濃度。向ENO1濃縮液加入終濃度2mmol/L的PMSF,與等體積無菌甘油混勻,分裝,保存于-20℃。
向方法1.5中預(yù)留的120μL裂解液上清、濃縮后稀釋20倍ENO1中各加入30μL 5×SDS-PAGE Loading Buffer,混勻,98℃變性10min。將蛋白Marker和誘導(dǎo)及未誘導(dǎo)的裂解液各2μL(分別與8μL 1×Loading混勻)、稀釋的ENO1 10μL上樣于SDS-PGAE膠(10%分離膠)。于80V 30min,120V 50min電泳分離。用考馬斯亮藍(lán)染色液浸泡凝膠,室溫染色30min?;厥杖旧海贸兯礈?,將凝膠浸泡于超純水,微波爐中煮沸脫色5min,棄脫色液。重復(fù)煮沸脫色5次,直至背景干凈,條帶清晰。
PCR產(chǎn)物的電泳鑒定結(jié)果如圖1,泳道2中最亮條帶的分子量位于1 200~1 400bp,與ENO1 cDNA大小(1305bp)相符(2泳道),陰性對(duì)照無擴(kuò)增條帶(3泳道),可見ENO1 cDNA擴(kuò)增成功。2泳道亮帶下方有一亮度較弱的條帶為非特異性擴(kuò)增產(chǎn)物,底部200bp左右的條帶可能為引物二聚體。
1:200bp DNA Ladder;2:ENO1 cDNA PCR產(chǎn)物;3:陰性對(duì)照PCR產(chǎn)物
酶切鑒定結(jié)果見圖2,重組質(zhì)粒pET-28a-ENO1和空質(zhì)粒pET-28a(5369bp)經(jīng)Nde I+Xho I酶切后皆有介于5000~6000bp的條帶(2、3泳道),前者產(chǎn)生的1000~2000bp小片段與ENO1 cDNA分子量(1305bp)相符(3泳道),后者無此條帶??梢姡琍CR產(chǎn)物已重組至pET-28a質(zhì)粒中。
1:1kb DNA Ladder;2:pET-28a Nde I+Xho I 酶切產(chǎn)物;3:pET-28a-ENO1 Nde I+Xho I 酶切產(chǎn)物;4:Trans2KDNA Marker
pET-28a-ENO1的測序結(jié)果如圖3所示(僅展示一部分),DNAman軟件比對(duì)顯示連入pET-28a中的序列與ENO1 cDNA堿基序列一致,無突變。藍(lán)色下劃線序列為載體pET-28a中的Nde I位點(diǎn),紅色箭頭序列為ENO1的起始密碼子編碼序列,箭頭指向ENO1 cDNA的3′端。
圖3 pET-28a-ENO1序列測定
ENO1的SDS-PAGE鑒定結(jié)果如圖4。pET-28a-ENO1-BL21(DE3)經(jīng)0.2mmol/L IPTG誘導(dǎo)后,上清中有一豐度最高的蛋白,位于40~55Ku(3泳道),與ENO1分子量(47Ku)一致,可知重組菌表達(dá)了可溶性ENO1。經(jīng)Ni2+純化的ENO1(4泳道紅色箭頭所示)純度高,雜帶少。ENO1經(jīng)濃縮和更換緩沖液后,濃度約為16mg/mL,故150mL菌液經(jīng)0.2mmol/L IPTG誘導(dǎo)后,獲得64mg純化的ENO1。由此計(jì)算,ENO1的表達(dá)量約為427mg/L。未經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的菌體也有一條較濃且與ENO1分子量相近的條帶(2泳道紅色虛線箭頭所示),疑為本底水平表達(dá)的ENO1,但未能純化到ENO1,可見此帶為大腸桿菌BL21(DE3)內(nèi)源表達(dá)的其他高豐度蛋白。
1:Protein Marker;2:pET-28a-ENO1-BL21(DE3)未經(jīng)IPTG誘導(dǎo)的上清;3:pET-28a-ENO1-BL21(DE3)0.2mmol/L IPTG誘導(dǎo)后的上清;4:上清中純化的ENO1
本文構(gòu)建了ENO1原核表達(dá)載體pET28a-ENO1?;蚬こ叹鷓ET28a-ENO1-BL21(DE3)經(jīng)0.2mmol/L IPTG誘導(dǎo),表達(dá)了可溶性的ENO1,經(jīng)組氨酸標(biāo)簽蛋白純化試劑盒純化,ENO1產(chǎn)量達(dá)427mg/L。
組氨酸標(biāo)簽蛋白純化試劑盒多采用調(diào)節(jié)洗滌液和洗脫液的流速來純化重組蛋白,這種操作雖然合理,但耗時(shí)長。本文用離心—取上清的方法取代上述法洗滌和洗脫重組蛋白,簡化了操作,極大縮短了純化時(shí)間,獲得了高純度的ENO1。
考馬斯亮藍(lán)染色的凝膠通常用含甲醇(或乙醇)和醋酸的脫色液來脫色,甲醇和醋酸有強(qiáng)烈的刺激性氣味,對(duì)操作者有害,污染環(huán)境,用量大,成本高。本文采用的水煮法脫色,無需使用任何試劑,有縮短時(shí)間、降低成本、利于環(huán)保的三重優(yōu)勢,可供同行參考。
ENO1催化2-磷酸甘油酸轉(zhuǎn)化為磷酸烯醇式丙酮酸,不易檢測的磷酸烯醇式丙酮酸可被丙酮酸激酶(pyruvate kinase,PK)轉(zhuǎn)化為丙酮酸,同時(shí)生成ATP。在氧氣存在時(shí),ATP和熒光素可被熒光素酶催化反應(yīng)[13],產(chǎn)生熒光,熒光強(qiáng)度與ATP濃度成正比,故可通過測定熒光強(qiáng)度來間接測定ENO1的酶活性。筆者正著手構(gòu)建PK和熒光素酶表達(dá)載體、生產(chǎn)PK和熒光素酶,通過三酶偶聯(lián)法建立基于分光光度法的ENO1抑制劑篩選模型。