陳超,李俊霖,朱朝庚
(1.永州市中心醫(yī)院 肝膽外科,湖南 永州 425100;2.湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院 肝膽外科,湖南長沙 410021)
膽囊癌作為膽囊上皮惡性腫瘤,約占全部膽道腫瘤的2/3,與其他消化道腫瘤相比,膽囊癌起病隱匿,但早期已通過淋巴結(jié)、血液擴(kuò)散轉(zhuǎn)移,危害嚴(yán)重[1]。多數(shù)膽囊癌患者在發(fā)現(xiàn)時已至晚期,因此盡早發(fā)現(xiàn)與膽囊癌有關(guān)的因子,對于治療具有重要意義。微小RNA(microRNA,miRNA)作為過度保守的短鏈非編碼RNA,在腫瘤中通過靶向目標(biāo)基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯,進(jìn)而調(diào)控癌癥發(fā)展[2]。研究顯示,miR-103a-3p在不同癌細(xì)胞中的作用不同,在前列腺癌中抑制癌癥進(jìn)展,而在結(jié)直腸癌中促進(jìn)癌癥進(jìn)展[3-4]。目前有關(guān)miR-103a-3p在膽囊癌中的作用尚未見相關(guān)研究。SIX同源盒蛋白4(SIX homeobox 4,SIX4)的表達(dá)異常參與了腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程,增強(qiáng)多種類型腫瘤的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,同時SIX4亦是多種miRNA的靶基因[5-7],但SIX4 在膽囊癌中的功能尚不清楚。本研究旨在了解膽囊癌組織中miR-103a-3p、SIX4的表達(dá)情況,觀察過表達(dá)miR-103a-3p對膽囊癌細(xì)胞SIX4表達(dá)及癌細(xì)胞增殖、侵襲的影響,初步探討其機(jī)制,以期為膽囊癌的靶向治療提供一定參考。
組織:膽囊癌組織及癌旁組織(距離癌組織>2 cm)取自永州市中心醫(yī)院2019 年10 月至2021 年9 月32 例接受手術(shù)治療的膽囊癌患者,患者術(shù)前均未接受化療等抗腫瘤治療。從癌癥體細(xì)胞突變目錄(COSMIC)數(shù)據(jù)庫(https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic)中下載膽囊癌組織樣本數(shù)據(jù),包括樣本的基本信息和病理數(shù)據(jù)。
細(xì)胞:膽囊癌細(xì)胞系GBC-SD購自北納生物(產(chǎn)品編號:BNCC341817)。
引物由上海生工生物工程科技有限公司合成;SIX4 野生型(wild type,WT)、SIX4 突變型(mutant,MUT)、mimic NC、miR-103a-3p mimic、Lipofectamine?2000 試劑盒、pc DNA3.1 質(zhì)粒、pc DNA3.1-SIX4 質(zhì)粒均購自廣州銳博生物公司;CCK-8試劑盒購自碧云天生物科技有限公司(貨號:C0037);雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒、一抗兔源SIX4、增殖細(xì)胞核相關(guān)抗原Ki-67、增殖細(xì)胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)、基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinases,MMP)2、MMP9 以及內(nèi)參GAPDH、二抗羊抗兔,均購自英國Abcam公司(貨號分別為:ab228530、ab176713、ab16667、ab92552、ab92536、ab76003、ab9485、ab6721)。
實時熒光定量PCR(qRT-PCR)儀,美國Applied公司(型號:7500);蛋白凝膠成像系統(tǒng),上海天能科技有限公司(型號:Tanon 5200);酶標(biāo)儀,深圳匯松生物科技發(fā)展有限公司(型號:MB-530)。
1.3.1 qRT-PCR檢測組織中SIX4 mRNA、miR-103a-3p水平:膽囊癌組織以及對應(yīng)癌旁組織分別取30 mg,冰上研磨充分,添加1 mL Trizol,提取組織中總RNA,分光光度計檢測RNA濃度和純度。RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,qRT-PCR儀檢測組織中SIX4、miR-103a-3p以及對應(yīng)內(nèi)參β-actin、U6。引物序列:SIX4 F:5’-TCTCGGGGTGATCGACAAGAA-3’,R:5’-CCC TTTGTTCATTCGTTCCTGG-3’;β-actin F:5’-CCTG GCACCCAGCACAAT-3’,R:5’-GCTGATCCACAT CTGCTGGAA-3’;miR-103a-3p F:5’-GAGCAGCAT TGTACAG-3’,R:5’-GTGCAGGGTCCGAGGT-3’;U6 F:5’-CTCGCTTCGGCAGCAGCACA-3’,R:5’-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3’。反應(yīng)條件:95 ℃、75 s;95 ℃、30 s,60 ℃、40 s,45個循環(huán)。2-ΔΔCT法對SIX4、miR-103a-3p表達(dá)水平進(jìn)行定量分析。
1.3.2 雙熒光素酶鑒定miR-103a-3p與SIX4的靶向關(guān)系:TargetScan數(shù)據(jù)庫查找SIX4 mRNA的3’UTR與miR-103a-3p的結(jié)合位點。設(shè)計合成SIX4的3’UTR WT和3’UTR MUT(SIX4 3’UTR-WT、SIX4 3’UTRMUT),分別與miR-103a-3p mimic或mimic NC共轉(zhuǎn)染GBC-SD細(xì)胞中,雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒檢測各組熒光素酶活性。
1.3.3 細(xì)胞培養(yǎng)及分組:GBC-SD細(xì)胞用10%胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)液培養(yǎng),將細(xì)胞置于37 ℃ 5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每天觀察細(xì)胞狀態(tài),在細(xì)胞密度85%左右傳代,細(xì)胞傳代3次進(jìn)行實驗。
實驗分五組:對照組、mimic NC組、miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1 組、miR-103a-3p mimic+SIX4組。對照組GBC-SD細(xì)胞正常培養(yǎng),mimic NC組GBC-SD細(xì)胞Lipofectamine?2000試劑盒轉(zhuǎn)染50 nmol/L mimic NC,其余各組Lipofectamine?2000試劑盒轉(zhuǎn)染50 nmol/L miR-103a-3p mimic,miR-103a-3p mimic組轉(zhuǎn)染至正常培養(yǎng)GBCSD細(xì)胞,miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組轉(zhuǎn)染至已經(jīng)轉(zhuǎn)染過pc DNA3.1空載體且穩(wěn)定表達(dá)的GBC-SD細(xì)胞,miR-103a-3p mimic+SIX4組轉(zhuǎn)染至已經(jīng)轉(zhuǎn)染過pc DNA3.1-SIX4質(zhì)粒且穩(wěn)定表達(dá)的GBC-SD細(xì)胞,轉(zhuǎn)染6 h,更換為10%胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)液繼續(xù)培養(yǎng)48 h,進(jìn)行后續(xù)研究。
1.3.4 qRT-PCR檢測細(xì)胞中SIX4 mRNA、miR-103a-3p水平:“1.3.3”細(xì)胞處理后,加1 mL Trizol,提取總RNA,參考“1.3.1”檢測細(xì)胞中SIX4 mRNA、miR-103a-3p水平。
1.3.5 蛋白印跡法檢測細(xì)胞中SIX4蛋白水平:“1.3.3”細(xì)胞處理后,添加蛋白裂解液,冰上孵育10 min,12 000 r/min 4 ℃離心20 min,上清為總蛋白,BCA蛋白試劑盒對總蛋白濃度進(jìn)行測定。25 μg蛋白上樣,聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白質(zhì),蛋白轉(zhuǎn)移至NC膜上,5%脫脂奶粉室溫封閉2 h;添加SIX4、GAPDH一抗,置于4 ℃孵育過夜;洗滌后添加對應(yīng)二抗,常溫下孵育1 h。DAB顯色試劑盒顯色,蛋白凝膠成像系統(tǒng)拍照和定量分析。
1.3.6 CCK-8法檢測細(xì)胞增殖情況:按照1.3.3處理細(xì)胞后,離心收集細(xì)胞,細(xì)胞濃度稀釋成1×104個/mL,每孔100 μL接種于96孔板中,置于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h,只添加培養(yǎng)液孔為空白組,培養(yǎng)相同時間,加入CCK-8試劑后繼續(xù)培養(yǎng)2 h,酶標(biāo)儀中450 nm處測定溶液吸光度(optical density,OD)值。
1.3.7 Transwell檢測細(xì)胞侵襲情況:Transwell小室經(jīng)基質(zhì)膠包被后放入24 孔板中。按照“1.3.3”處理細(xì)胞后,離心收集細(xì)胞,細(xì)胞用單純的RPMI 1640培養(yǎng)液稀釋成5×103個/mL,每孔500 μL接種于Transwell小室上層,小室下層添加10%胎牛血清的RPMI 1640培養(yǎng)液,24孔板置于37 ℃、5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48 h,取出細(xì)胞,結(jié)晶紫染色5 min,蒸餾水清除背景色,顯微鏡下拍照并計數(shù)。
1.3.8 蛋白印跡法檢測細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平:按照“1.3.5”方法檢測細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平,一抗為Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9、GAPDH。
統(tǒng)計學(xué)軟件GraphPad 9.0 對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。計量資料以()描述,兩組間比較采用配對t檢驗,多組間比較采用單因素方差分析,進(jìn)一步兩兩比較采用SNK-q檢驗;采用Person相關(guān)性分析檢測SIX4與miR-103a-3p的相關(guān)性。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
與癌旁組織相比,膽囊癌組織中SIX4 mRNA水平升高(t=21.795,P<0.001),miR-103a-3p水平降低(t=20.753,P<0.001),見圖1。SIX4與miR-103a-3p表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(r=-0.419,P=0.017),見圖2。在癌癥體細(xì)胞突變目錄(COSMIC)數(shù)據(jù)庫的168個膽囊癌樣本中,SIX4 mRNA的平均水平為(2.87±0.64),miR-103a-3p的平均水平為(0.49±0.05);Person分析結(jié)果顯示,SIX4與miR-103a-3p表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(r=-0.154,P=0.046),見圖3。
圖1 膽囊癌(n=32)及癌旁組織(n=32)中SIX4 mRNA(A)、miR-103a-3p(B)水平比較
圖2 臨床膽囊癌組織樣本(n=32)中SIX4 mRNA與miR-103a-3p的相關(guān)性分析
圖3 COSMIC數(shù)據(jù)庫中膽囊癌樣本(n=168)SIX4 mRNA與miR-103a-3p的相關(guān)性分析
TargetScan分析發(fā)現(xiàn),SIX4 mRNA的3’UTR含有miR-103a-3p序列保守堿基,見圖4A。雙熒光素酶實驗驗證二者的靶向關(guān)系,結(jié)果顯示,與mimic NC+SIX4 3’UTR-WT相比,miR-103a-3p mimic+SIX4 3’UTR-WT細(xì)胞熒光素酶相對活性下降(F=48.728,P<0.001),見圖4B。
圖4 miR-103a-3p與SIX4的靶點預(yù)測(A)和靶向關(guān)系驗證(B)
5組間比較,SIX4 mRNA(F=82.606,P<0.001)和蛋白(F=229.772,P<0.001)水平及miR-103a-3p水平(F=48.603,P<0.001)差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義。分別與對照組、mimic NC組相比,miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組、miR-103a-3p mimic+SIX4組細(xì)胞中SIX4 mRNA和蛋白水平降低(P<0.05),miR-103a-3p水平升高(P<0.05);分別與miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組相比,miR-103a-3p mimic+SIX4組細(xì)胞中SIX4 mRNA和蛋白水平升高(P<0.05),miR-103a-3p水平降低(P<0.05),見圖5。
圖5 各組細(xì)胞中SIX4 mRNA(A)和蛋白(B)、miR-103a-3p(C)水平比較(n=6,)
5 組細(xì)胞OD450值比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=25.985,P<0.001)。分別與對照組、mimic NC組相比,miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組細(xì)胞中OD450降低(P<0.05);分別與miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組相比,miR-103a-3p mimic+SIX4組細(xì)胞中OD450升高(P<0.05)。見圖6。
圖6 各組細(xì)胞增殖情況比較(n=6,)
5組細(xì)胞侵襲數(shù)量比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=96.255,P<0.001)。分別與對照組、mimic NC組相比,miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組、miR-103a-3p mimic+SIX4組細(xì)胞侵襲數(shù)量降低(P<0.05);分別與miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組相比,miR-103a-3p mimic+SIX4組細(xì)胞侵襲數(shù)量升高(P<0.05)。見圖7、圖8。
圖7 各組細(xì)胞侵襲情況(×200)
圖8 各組細(xì)胞侵襲數(shù)量比較(n=6,)
5組細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=18.133、80.484、27.124、68.126,均P<0.001)。分別與對照組、mimic NC組相比,miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平,miR-103a-3p mimic+SIX4 組細(xì)胞中PCNA蛋白水平降低(P<0.05);分別與miR-103a-3p mimic組、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1組相比,miR-103a-3p mimic+SIX4 組細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平升高(P<0.05)。見圖9。
圖9 各組細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白水平比較(n=6,)
目前治療膽囊癌的有效方法是膽囊癌根治性切除術(shù),但只對早期膽囊癌有較好的治療效果,晚期(Ⅲ、Ⅳ期)患者尚無手術(shù)指征[8-9]。膽囊癌初期無明顯癥狀,發(fā)現(xiàn)時往往已至晚期,不再適合手術(shù)治療,且晚期患者常出現(xiàn)淋巴結(jié)及遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致其預(yù)后較差[10]。因此,尋找新的治療方法及靶點對于膽囊癌的治療具有較高意義。
目前,許多研究證明miRNA畸變與膽囊癌進(jìn)展有關(guān)。Jiang等[11]報道,與相鄰的正常組織相比,miR-365在人類膽囊癌組織中的表達(dá)降低,miR-365可能具有抑制腫瘤的作用。Li等[12]研究發(fā)現(xiàn),miR-188-5p在人膽囊癌組織中表達(dá)下調(diào),miR-188-5p通過靶向Wnt2b和Smad2 在膽囊癌中發(fā)揮抑癌作用。Zong等[13]發(fā)現(xiàn),miR-125b在膽囊癌組織中下調(diào),是膽囊癌進(jìn)展的抑制因子。以上研究均提示miRNAs可能被用作膽囊癌的治療標(biāo)志物。有研究已經(jīng)揭示miR-103a-3p在前列腺癌[14]、甲狀腺癌[15]中均影響癌細(xì)胞增殖、侵襲、遷移,為疾病治療提供新靶標(biāo),但目前尚缺少其在膽囊癌中作用的研究。本研究發(fā)現(xiàn),miR-103a-3p在膽囊癌組織中低表達(dá),推測低表達(dá)miR-103a-3p可能影響膽囊癌的發(fā)生發(fā)展。深入研究發(fā)現(xiàn),在膽囊癌細(xì)胞中過表達(dá)miR-103a-3p可以抑制癌細(xì)胞的增殖和侵襲,這與其在非小細(xì)胞肺癌中的研究[16]正好相反,推測其可能是由于細(xì)胞類型不同導(dǎo)致miR-103a-3p的表達(dá)趨勢發(fā)生改變。本研究進(jìn)一步驗證了細(xì)胞增殖、侵襲的蛋白表達(dá)情況。Ki-67、PCNA作為增殖標(biāo)志蛋白,Ki-67高表達(dá)與腫瘤細(xì)胞周期、腫瘤轉(zhuǎn)移關(guān)系密切,PCNA在細(xì)胞增殖啟動中發(fā)揮重要作用[17];MMP2 作為重要的Ⅳ型膠原酶,分泌過多會促進(jìn)腫瘤擴(kuò)散和轉(zhuǎn)移[18];MMP9 參與腫瘤細(xì)胞穿透基底膜和血管,可促進(jìn)腫瘤發(fā)生和發(fā)展[19]。本研究發(fā)現(xiàn),在膽囊癌細(xì)胞中過表達(dá)miR-103a-3p可抑制細(xì)胞中Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白表達(dá),與增殖、侵襲實驗結(jié)果一致,證實miR-103a-3p可通過下調(diào)相關(guān)蛋白表達(dá)抑制膽囊癌細(xì)胞增殖和侵襲。
miRNA通過結(jié)合靶基因的3’UTR調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯,進(jìn)而調(diào)控疾病。既往研究揭示了miR-103a-3p在各種腫瘤中的多個靶點,如非小細(xì)胞肺癌中的CCNE1[20]、膠質(zhì)瘤中的PDK4[21]。在本研究中,生物信息學(xué)分析預(yù)測SIX4 3’UTR是miR-103a-3p的潛在結(jié)合位點,并經(jīng)雙熒光素酶驗證了這一預(yù)測。SIX4作為同源盒基因家族成員之一,最早發(fā)現(xiàn)其可調(diào)控Na+/K+-ATP酶亞基的表達(dá)[22];SIX4在肝細(xì)胞癌組織中表達(dá)高于癌旁組織和遠(yuǎn)端正常組織,且其表達(dá)水平與預(yù)后關(guān)系密切,可作為臨床預(yù)測肝細(xì)胞癌預(yù)后的指標(biāo)[23];食管鱗狀細(xì)胞癌中SIX4 表達(dá)上調(diào),可促進(jìn)食管鱗狀細(xì)胞癌的腫瘤生長和細(xì)胞轉(zhuǎn)移[24]。上述研究說明SIX4可能是一種促癌因子。在本研究中,膽囊癌組織中SIX4 表達(dá)上調(diào),推測SIX4 可能影響膽囊癌疾病進(jìn)展并參與介導(dǎo)miR-103a-3p抑制膽囊癌進(jìn)展的過程。此外,在miR-103a-3p過表達(dá)基礎(chǔ)上SIX4表達(dá)升高可促進(jìn)細(xì)胞增殖、侵襲,并上調(diào)Ki-67、PCNA、MMP2、MMP9蛋白表達(dá),提示miR-103a-3p可能通過抑制靶基因SIX4 從而抑制膽囊癌細(xì)胞增殖、侵襲,實現(xiàn)對疾病的緩解。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)膽囊癌組織中miR-103a-3p低表達(dá)、SIX4 高表達(dá),在膽囊癌細(xì)胞中過表達(dá)miR-103a-3p后能抑制SIX4的表達(dá),從而降低膽囊癌細(xì)胞增殖、侵襲,發(fā)揮抗腫瘤作用。本研究為膽囊癌的發(fā)生提供了可能的新機(jī)制,為膽囊癌患者提供了可能的治療靶點。越來越多的證據(jù)表明,miRNA替代療法(miRNA活性的提高)可以恢復(fù)失去的功能,是一種非常有前途的癌癥治療方法[25]。因此,本研究結(jié)果為miR-103a-3p膽囊癌替代治療研究提供了理論依據(jù)。然而,對于miR-103a-3p替代治療的臨床應(yīng)用,miRNA的體內(nèi)傳遞仍然是一個很大的挑戰(zhàn)。此外,還需要進(jìn)一步的實驗來分析miR-103a-3p在體內(nèi)對膽囊癌的抗腫瘤作用,以開發(fā)從實驗室到臨床的新的治療策略。再者,miR-103a-3p靶基因較多,亦可能通過別的基因發(fā)揮作用,發(fā)現(xiàn)更多與膽囊癌關(guān)系密切的靶基因也是本研究未來的重點。