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    奶牛SP1基因結(jié)構(gòu)及對(duì)乳脂合成功能的初步分析

    2022-09-30 07:00:14周子薇張京一王博宇侯曉明
    畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2022年9期
    關(guān)鍵詞:乳脂奶牛乳腺

    楊 洋,周子薇,張京一,楊 碩,王博宇,葛 楠,林 葉,侯曉明

    (東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 細(xì)胞與遺傳工程黑龍江省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,哈爾濱 150030)

    奶牛作為重要的經(jīng)濟(jì)動(dòng)物,是我國(guó)畜牧業(yè)的重要組成部分。隨著人民生活水平的提高,人們對(duì)牛奶及乳制品的需求也日益增加。乳脂是牛奶中重要的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)之一,是衡量牛乳品質(zhì)的關(guān)鍵指標(biāo)。乳脂的主要成分是甘油三酯(triacylglycerol,TAG),占乳脂肪的95%~98%。奶牛乳脂的合成受到環(huán)境、激素和細(xì)胞因子等眾多因素的影響,激素及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)可以促進(jìn)乳腺的發(fā)育,對(duì)于泌乳的啟動(dòng)和維持至關(guān)重要。此外,在泌乳期間多基因的共同作用對(duì)牛奶的品質(zhì)有重要的調(diào)控作用,如固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白(sterol regulatory element binding proteins,SREBPs)和過(guò)氧化物酶體增殖物激活受體(peroxisome proliferator-activated receptors,PPARs)等在調(diào)控乳脂合成關(guān)鍵基因表達(dá)和促進(jìn)奶牛乳脂合成過(guò)程中起著重要的作用。

    特異性蛋白SP1(specificity protein 1,SP1)是一種進(jìn)化上高度保守的轉(zhuǎn)錄因子,C端含有3個(gè)串聯(lián)的Cys2His2型鋅指結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域特異性地識(shí)別GC盒(GGGGCGGGG)與GT盒(GGTGTGGG),參與幾乎所有細(xì)胞功能,包括細(xì)胞增殖、凋亡、分化和新生物的轉(zhuǎn)化等。通過(guò)對(duì)基因序列特征及其表達(dá)的研究發(fā)現(xiàn),湖羊1基因可抑制人卵巢顆粒細(xì)胞增殖、誘導(dǎo)其凋亡。Zhu等通過(guò)對(duì)西農(nóng)薩能奶山羊的1基因序列和表達(dá)信息分析,發(fā)現(xiàn)SP1在調(diào)節(jié)脂質(zhì)合成下游基因的表達(dá)及脂肪酸代謝中發(fā)揮重要作用。張廣杰等克隆了廣西巴馬小型豬1基因序列并測(cè)序,SP1蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果未發(fā)現(xiàn)信號(hào)肽和跨膜區(qū),是非外分泌型蛋白,主要在細(xì)胞內(nèi)活動(dòng)。王鳳等發(fā)現(xiàn),1基因的差異表達(dá)對(duì)小尾寒羊尾部前體脂肪細(xì)胞分化和脂質(zhì)沉積具有正向調(diào)控作用。先前的研究發(fā)現(xiàn),胰島素通過(guò)SP1調(diào)節(jié)SREBP-1c的轉(zhuǎn)錄,響應(yīng)胰島素誘導(dǎo)的脂肪生成,這對(duì)SP1調(diào)節(jié)脂質(zhì)代謝提供了一個(gè)有力依據(jù)。SP1靶向乳脂球-EGF因子8(milk fat globule-EGF factor 8,MFG-E8)5′端結(jié)合位點(diǎn),正向調(diào)節(jié)MFG-E8啟動(dòng)活性,在減輕炎癥和維持組織穩(wěn)態(tài)方面起著重要作用。奶牛乳腺上皮細(xì)胞的乳脂合成對(duì)乳品質(zhì)的提高至關(guān)重要,SP1作為調(diào)控基因表達(dá)普遍存在的轉(zhuǎn)錄因子,探究奶牛1基因的結(jié)構(gòu)及其對(duì)乳脂合成的影響,對(duì)于揭示奶牛乳脂合成的調(diào)控機(jī)制具有重要意義。大量研究表明,轉(zhuǎn)錄因子SP1在細(xì)胞生長(zhǎng)和代謝中起到關(guān)鍵作用,但其對(duì)奶牛乳脂合成的調(diào)控研究還鮮有報(bào)道。

    本研究通過(guò)多種生物信息學(xué)軟件分析SP1蛋白的理化性質(zhì)與結(jié)構(gòu)特征,采用PCR方法構(gòu)建1重組過(guò)表達(dá)載體。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR和Western blot技術(shù)檢測(cè)不同時(shí)期奶牛乳腺組織SP1的表達(dá)情況。分離并純化奶牛乳腺上皮細(xì)胞,通過(guò)在細(xì)胞中過(guò)表達(dá)和干擾1,檢測(cè)SP1表達(dá)對(duì)TAG合成的影響。本研究為SP1的蛋白結(jié)構(gòu)和功能的相適應(yīng)性及其對(duì)奶牛乳脂合成的調(diào)控提供了理論依據(jù)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)材料

    本研究選取6頭健康的泌乳早期荷斯坦奶牛(第3胎次,52~54月齡產(chǎn)犢),其中3頭母牛在從妊娠期開(kāi)始到泌乳,第90天屠宰,3頭在干奶第30天屠宰。放血后在無(wú)菌環(huán)境下去除結(jié)締組織和脂肪組織,將乳腺實(shí)體組織剪成約1 cm的小塊置于液氮中速凍,然后-80 ℃保存,用于后續(xù)RNA和蛋白質(zhì)的提取。對(duì)于細(xì)胞培養(yǎng),將新鮮泌乳期奶牛乳腺組織置于D-hanks平衡鹽溶液中,立即送往實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行細(xì)胞分離培養(yǎng)。

    1.2 主要試劑與儀器

    TRIzol Reagent(15596026,Invitrogen)、Prime ScriptRT reagent Kit(RR037A,TaKaRa);Prime STAR HS DNA Polymerase(R010A,TaKaRa);Ace QqPCR SYBRGreen Master Mix kit(Q111-02,Vazyme);PCR產(chǎn)物純化回收試劑盒(AE0201-A,SparkJade);大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自擎科生物技術(shù)有限公司。

    冷凍離心機(jī)(5418R,Eppendorf);熒光定量PCR儀(Applied Biosystems 7500 Realtime PCR system,USA);PCR儀(Mastercycler nexus,Eppendoff);生物樣本低溫快速制備系統(tǒng)(BSH-C2,GeneReady);NanoDrop One/One(ND-ONE-W,Thermo Fisher)。

    1.3 引物設(shè)計(jì)

    根據(jù)GenBank上查找到的奶牛1基因序列(NM_001078027.1),采用Primer Premier 5.0軟件分別設(shè)計(jì)擴(kuò)增1基因CDS區(qū)全長(zhǎng)引物及熒光定量PCR引物,詳見(jiàn)表1。引物經(jīng)過(guò)Blast特異性比對(duì)后,送由擎科生物公司合成。

    表1 引物信息Table 1 Primers information

    1.4 SP1基因克隆

    TRIzol法提取泌乳期奶牛乳腺組織總RNA,用瓊脂糖凝膠電泳和NanoDrop檢測(cè)RNA的質(zhì)量及濃度。再根據(jù)PrimeScript RT Reagent Kit說(shuō)明書(shū)對(duì)得到的RNA進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,反應(yīng)體系:5×Prime Script Buffer 4 μL,Oligo(dT)(50 μmol·L)和Random 6 mers(100 μmol·L)各1 μL,總RNA 1 μg,PrimeScript RT Enzyme 1 μL,加入ddHO至20 μL。將混合物置于37 ℃孵育15 min,85 ℃ 5 s反轉(zhuǎn)錄酶變性滅活,得到的cDNA產(chǎn)物-20 ℃保存。

    PCR擴(kuò)增體系:cDNA模板1 μL,PrimeSTAR HS DNA Polymerase 1 μL,上、下游引物(10 mmol·L)各1 μL,dNTP(2.5 mmol·L)4 μL,加ddHO至50 μL。反應(yīng)程序:98 ℃預(yù)變性5 min;98 ℃變性10 s,60 ℃退火15 s,72 ℃延伸3 min,共32個(gè)循環(huán)。取5 μL PCR產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行純化回收,將純化后的PCR產(chǎn)物與pcDNA3.1(+)載體分別用d Ⅲ和Ⅰ進(jìn)行雙酶切,膠回收產(chǎn)物25 ℃連接2 h,構(gòu)建重組質(zhì)粒,并將其轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,37 ℃震蕩培養(yǎng)1 h。將轉(zhuǎn)化產(chǎn)物均勻涂布在帶有Amp抗性的LB瓊脂平板上,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng)。挑取單菌落接種在帶有Amp抗性的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃震蕩培養(yǎng)過(guò)夜。菌液送交擎科生物公司測(cè)序,測(cè)序結(jié)果用DNAMAN軟件進(jìn)行序列比對(duì)。將正確的菌液(記作:pcDNA3.1-SP1)提質(zhì)粒備用。

    1.5 SP1基因的生物信息學(xué)分析

    NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)數(shù)據(jù)庫(kù)中查找并獲得不同物種1基因序列:牛(NM_001078027.1)、豬(XM_005652567.3)、馬(XM_023643655.1)、兔(XM_008256514.2)、小鼠(NM_013672.2)、大鼠(NM_012655.2)、獼猴(NM_001266924.1)、山羊(NM_001285760.1)、斑馬魚(yú)(NM_212662.2)、人(NM_001251825.2),利用Mega 7.0軟件進(jìn)行同源性比對(duì)并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。

    利用ExPASy網(wǎng)站(https://web.expasy.org/protscale/)在線分析預(yù)測(cè)中國(guó)荷斯坦奶牛SP1蛋白的親水性和理化性質(zhì);利用NCBI上的Conserved Domains程序(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)預(yù)測(cè)中國(guó)荷斯坦牛SP1蛋白的保守結(jié)構(gòu)域;采用NPSSOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/secpred_sopma.pl)和SWISS-MODEL(https://swissmodel.expasy.org/)在線軟件分別預(yù)測(cè)中國(guó)荷斯坦奶牛SP1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu);利用STRING(htps:/string-db.org/)在線預(yù)測(cè)與SP1可能相互作用的蛋白質(zhì)。

    1.6 實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)SP1基因的mRNA表達(dá)

    TRIzol法提取不同時(shí)期奶牛乳腺組織總RNA,反轉(zhuǎn)錄成cDNA。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)不同時(shí)期荷斯坦奶牛乳腺組織中1基因的表達(dá)水平。采用Applied Biosystems 7500 Real-time PCR system儀器和Ace QqPCR SYBRGreen Master Mix kit試劑盒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。反應(yīng)體系20 μL:Ace QqPCR SYBRGreen Master Mix 10 μL;上、下游引物(10 μmol·L)各0.4 μL;模板DNA 2 μL,加ddHO至20 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃變性10 s,60 ℃退火30 s,40個(gè)循環(huán),進(jìn)行3次獨(dú)立試驗(yàn),并對(duì)結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。以-的CT值為內(nèi)參,1基因表達(dá)量的計(jì)算方法為2,ΔCT=CT1-CT-。

    1.7 奶牛乳腺上皮細(xì)胞的培養(yǎng)與鑒定

    泌乳期奶牛乳腺實(shí)體組織經(jīng)過(guò)清洗、消毒處理后,采用組織塊法分離乳腺上皮細(xì)胞。將剪碎的乳腺組織以適當(dāng)密度均勻接種于預(yù)鋪鼠尾膠原的細(xì)胞培養(yǎng)瓶中,倒置于含5% CO,37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待組織塊牢固地貼在瓶底時(shí),加入含20%胎牛血清的DMEM/F12完全培養(yǎng)液,同時(shí)添加青霉素(100 U·mL)和鏈霉素(100 μg·mL)。觀察組織塊周?chē)莱黾?xì)胞的狀況,待細(xì)胞鋪滿培養(yǎng)瓶底時(shí)輕輕吹掉組織塊,并根據(jù)細(xì)胞對(duì)胰蛋白酶的敏感性不同,對(duì)細(xì)胞進(jìn)行純化。將1×10個(gè)純化后的細(xì)胞接種至35 mm玻底培養(yǎng)皿中,用4%多聚甲醛固定后加入5% BSA的PBST溶液封閉1 h,然后用角蛋白18(Keratin 18,CK18)抗體(兔源,1∶100稀釋,ABclonal)4 ℃孵育過(guò)夜,清洗一抗后用FITC標(biāo)記山羊抗兔的二抗(1∶200稀釋,ABclonal)孵育1 h,用1 μg·mL的DAPI標(biāo)記細(xì)胞核,激光共聚焦顯微鏡觀察CK18在細(xì)胞中的表達(dá)。

    1.8 細(xì)胞轉(zhuǎn)染

    將2×10個(gè)純化后的乳腺上皮細(xì)胞接種于6孔板中,待細(xì)胞生長(zhǎng)至70%融合單層時(shí),更換成無(wú)血清的培養(yǎng)液,每孔加入2.5 μg的pcDNA3.1-SP1質(zhì)粒及5 μL Lipofectamine 2000的混合物,對(duì)照組轉(zhuǎn)染pcDNA3.1(+)空載體;對(duì)于基因沉默,每孔加入10 μL1 siRNA(20 μmol·L)及5 μL Lipofectamine 2000的混合物,對(duì)照組每孔加入10 μL Negative control(20 μmol·L)。轉(zhuǎn)染后6 h換成完全培養(yǎng)基繼續(xù)在37 ℃、CO培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48 h,進(jìn)行后續(xù)檢測(cè)。1 siRNA干擾片段序列為(sense):5′-GCGUUUCUGCAGCUACCUUGA-3′;Negative control序列為(sense):5′-UUCUCCGAAC-GUGUCACGUTT-3′。

    1.9 Western blot檢測(cè)SP1蛋白的表達(dá)

    取20 mg不同時(shí)期的奶牛乳腺組織加入200 μL RIPA裂解液,用組織破碎儀低溫勻漿,充分裂解后,12 000 r·min離心10 min,取上清備用;對(duì)不同處理的奶牛乳腺上皮細(xì)胞,加入適量的細(xì)胞裂解液低溫裂解細(xì)胞,12 000 r·min離心10 min,取上清備用。采用BCA濃度測(cè)定試劑盒測(cè)定乳腺組織或細(xì)胞的總蛋白濃度。然后取20 μg蛋白樣品經(jīng)10% SDS-PAGE凝膠電泳分離,并轉(zhuǎn)移到NC膜。5%脫脂乳封閉1 h后分別與SP1和β-actin特異性抗體(均為兔源,1∶1 000稀釋,ABclonal)4 ℃孵育過(guò)夜。將NC膜用TBST沖洗3次后,用HRP標(biāo)記的山羊抗兔的二抗在37 ℃孵育1 h,TBST洗3次,采用化學(xué)發(fā)光檢測(cè)系統(tǒng)對(duì)印跡進(jìn)行檢測(cè)。采用Image J軟件對(duì)條帶進(jìn)行灰度分析,與內(nèi)參β-actin進(jìn)行比較,分析SP1蛋白的表達(dá)情況。

    1.10 SP1表達(dá)對(duì)TAG合成的影響

    細(xì)胞分別轉(zhuǎn)染1基因過(guò)表達(dá)質(zhì)粒和RNAi,48 h后細(xì)胞用裂解液低溫裂解約10 min,短暫離心后收集上清,采用TAG檢測(cè)試劑盒(E1003,普利萊)測(cè)定不同處理組奶牛乳腺上皮細(xì)胞中TAG含量;相應(yīng)細(xì)胞樣品的蛋白濃度由BCA濃度檢測(cè)試劑盒測(cè)定,每個(gè)處理重復(fù)3次。

    1.11 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)分析

    采用GraphPad Prism 6軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,試驗(yàn)數(shù)據(jù)以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)誤”表示。不同處理的兩組數(shù)據(jù)之間采用檢驗(yàn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)?!?”代表<0.05,表示統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著;“**”代表<0.01,表示統(tǒng)計(jì)學(xué)差異極顯著;>0.05表示差異不顯著。

    2 結(jié) 果

    2.1 SP1基因克隆

    提取奶牛乳腺組織總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,通過(guò)PCR擴(kuò)增1基因CDS區(qū),經(jīng)過(guò)1.0%瓊脂糖凝膠電泳后得到清晰明亮的條帶,大小與實(shí)際(2 361 bp)相符(圖1)。將PCR產(chǎn)物與pcDNA3.1(+)載體通過(guò)酶切、連接并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,挑取單菌落測(cè)序。測(cè)序結(jié)果通過(guò)DNAMAN軟件對(duì)比結(jié)果顯示該基因片段與預(yù)期序列一致,成功克隆出奶牛1基因。

    圖1 SP1基因CDS區(qū)PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 PCR amplification results of SP1 gene CDS region

    2.2 奶牛SP1基因序列同源性分析

    根據(jù)NCBI已發(fā)布的各物種基因序列,通過(guò)Mega7.0軟件對(duì)不同物種1序列進(jìn)行同源性比對(duì),結(jié)果顯示中國(guó)荷斯坦奶牛1基因與馬、豬、兔、獼猴、小鼠、大鼠、人的同源性分別為95.43%、95.43%、91.65%、94.29%、90.07%、91.55%、88.65%。其中,奶牛1序列與山羊的相似度最高為98.94%;與斑馬魚(yú)的相似度最低為40.35%。使用Mega 7.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),結(jié)果如圖2所示,奶牛1序列同源性與山羊最近,與斑馬魚(yú)最遠(yuǎn)。

    圖2 SP1基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)Fig.2 The phylogenetic tree of SP1 gene

    2.3 SP1蛋白結(jié)構(gòu)的生物信息學(xué)分析

    通過(guò)ExPASy-ProtParam網(wǎng)站對(duì)SP1蛋白分析發(fā)現(xiàn),該蛋白分子質(zhì)量為80 902.17 u,等電點(diǎn)為6.94,不穩(wěn)定指數(shù)為53.09,屬于不穩(wěn)定蛋白。1基因共編碼786個(gè)氨基酸,其中絲氨酸(Ser)含量最高(13.0%),色氨酸(Trp)含量最低(0.5%)(表2)。帶負(fù)電氨基酸(Asp + Glu)42個(gè),帶正電氨基酸(Arg + Lys)41個(gè)。預(yù)測(cè)的溶解度(歸一化后)為0.504,該蛋白屬于可溶性蛋白。

    表2 中國(guó)荷斯坦牛SP1蛋白氨基酸組成Table 2 Amino acid composition of SP1 protein in China Holstein dairy cows

    疏水性分析對(duì)于預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)都具有重要的指導(dǎo)意義。利用Protscale軟件在線分析奶牛SP1蛋白氨基酸序列的親疏水性。如圖3A所示,親水性氨基酸大于疏水性氨基酸,總平均親疏水性為-0.438,說(shuō)明SP1是親水性蛋白。通過(guò)NCBI的Conserved Domains程序預(yù)測(cè)中國(guó)荷斯坦牛SP1蛋白保守結(jié)構(gòu)域發(fā)現(xiàn),該蛋白包含一個(gè)超家族結(jié)構(gòu)域,為SP1-4N超家族結(jié)構(gòu)域,位于第58~628位氨基酸處。在627~656、657~686、687~714位氨基酸區(qū)段包含3個(gè)C2H2鋅指結(jié)構(gòu)(圖3B)。使用NPSSOPMA和SWISS-MODEL分別預(yù)測(cè)中國(guó)荷斯坦牛SP1蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),該蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)包括α-螺旋(17.68%)、延伸鏈(20.87%)、無(wú)規(guī)則卷曲(52.29%)、β-轉(zhuǎn)角(9.16%),如圖3C所示,不同二級(jí)結(jié)構(gòu)在氨基酸序列中的位置,柱的寬窄代表上述蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的比例大小。利用SWISS-MODEL在線預(yù)測(cè)奶牛SP1蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)(圖3D),發(fā)現(xiàn)三級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)結(jié)果包含上述預(yù)測(cè)得到的二級(jí)結(jié)構(gòu)單元。

    A.奶牛SP1蛋白疏水性預(yù)測(cè);B.奶牛SP1蛋白保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè);C.奶牛SP1蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè);D.奶牛SP1蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)A. Hydrophobicity prediction of SP1 protein in dairy cow;B. Conserved domain prediction of SP1 protein in dairy cow;C. Secondary structure prediction of SP1 protein in dairy cow;D. Tertiary structure prediction of SP1 protein in dairy cow圖3 SP1蛋白結(jié)構(gòu)分析Fig.3 Analysis of SP1 protein structure

    2.4 SP1蛋白質(zhì)互作分析

    通過(guò)STRING網(wǎng)站分析與奶牛SP1蛋白相互作用的蛋白質(zhì)。結(jié)果顯示,SP1蛋白與組蛋白去乙?;?(Histone deacetylase 1,HDAC1)、轉(zhuǎn)錄因子AP-1(transcription factor AP-1,AP-1)、細(xì)胞腫瘤抗原p53(tumor protein 53,TP53)、雌激素受體α(estrogen receptor α,ERα)、CREB結(jié)合蛋白(recombinant CREB binding protein,CREBBP)、MYC原癌基因蛋白(MYC proto-oncogene,MYC)、轉(zhuǎn)錄因子RELA(transcription factor p65,p65)、視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤相關(guān)蛋白(retinoblastoma protein 1,RB1)和TATA盒結(jié)合蛋白(TATA-binding protein,TBP)等蛋白存在相互作用(圖4)。其中,與E1A結(jié)合蛋白P300(recombinant E1A binding protein P300,EP300)的結(jié)合分值最高,為0.998。該結(jié)果暗示SP1在細(xì)胞增殖和代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)調(diào)控等途徑發(fā)揮重要作用。

    圖4 SP1蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析Fig.4 Analysis of SP1 protein interaction network

    2.5 SP1在奶牛乳腺組織中的表達(dá)

    為比較1基因在奶牛不同生理時(shí)期乳腺組織中的表達(dá),采用熒光定量PCR方法分別檢測(cè)了3頭泌乳期和3頭干奶期奶牛乳腺組織中1基因mRNA的表達(dá)。結(jié)果如圖5A所示,1 mRNA在泌乳期奶牛乳腺組織中的表達(dá)顯著高于干奶期(<0.01)。隨后采用Western blot方法檢測(cè)不同生理時(shí)期奶牛乳腺組織中SP1蛋白水平的表達(dá)變化,以β-actin為內(nèi)參。圖5B和5C結(jié)果顯示,SP1蛋白在泌乳期奶牛乳腺組織中的表達(dá)顯著高于干奶期(<0.01),暗示SP1可能在奶牛乳腺泌乳過(guò)程中發(fā)揮作用。

    A. 熒光定量PCR檢測(cè)不同時(shí)期乳腺組織SP1 mRNA的相對(duì)表達(dá);B. Western blot檢測(cè)不同時(shí)期乳腺組織SP1蛋白的表達(dá);C. 乳腺組織SP1蛋白相對(duì)表達(dá)量。*.P<0.05;**.P<0.01,下同A. The relative mRNA expression of SP1 in mammary tissue at different physiology stages was detected by fluorescence quantification PCR; B. The expression of SP1 protein in mammary tissue at different physiology stages was detected by Western blot; C. Relative expression level of SP1 protein in mammary tissue. *. P<0.05; **. P<0.01; the same as below 圖5 不同時(shí)期奶牛乳腺組織中SP1的表達(dá)Fig.5 Expression of SP1 in mammary gland tissue of dairy cows at different physiology stages

    2.6 奶牛乳腺上皮細(xì)胞的培養(yǎng)及鑒定

    原代培養(yǎng)的奶牛乳腺上皮細(xì)胞如圖6A所示,在相差顯微鏡下觀察,培養(yǎng)第5天時(shí)組織塊周?chē)莱龃罅砍衫w維細(xì)胞;培養(yǎng)第10天可見(jiàn)少量乳腺上皮細(xì)胞呈現(xiàn)島嶼狀生長(zhǎng);培養(yǎng)第15天可見(jiàn)大量乳腺上皮細(xì)胞。CK18是上皮細(xì)胞的標(biāo)志性蛋白,通過(guò)免疫熒光的方法檢測(cè)細(xì)胞中CK18的表達(dá)情況來(lái)判定乳腺上皮細(xì)胞的純化程度,結(jié)果如圖6B所示,圖中淺灰色細(xì)絲狀為FITC標(biāo)記的CK18,灰色橢圓形為DAPI標(biāo)記的細(xì)胞核。CK18在乳腺上皮細(xì)胞的胞質(zhì)中表達(dá),表明已獲得純化的奶牛乳腺上皮細(xì)胞。

    A.相差顯微鏡觀察奶牛乳腺上皮細(xì)胞(200×);B.激光共聚焦顯微鏡觀察乳腺上皮細(xì)胞中CK18的表達(dá):a.FITC標(biāo)記的CK18,淺灰色細(xì)絲狀;b.DAPI標(biāo)記的細(xì)胞核,灰色橢圓形;c. a和b的合成圖A. Cultured bovine mammary epithelial cells were observed by phase contrast microscope (200×); B. The expression of CK18 was observed by confocal laser microscopy: a. FITC-labeled cytokeratin 18, grey filamentous; b. DAPI-labeled nucleus, grey oval; c. Merge of a and b圖6 奶牛乳腺上皮細(xì)胞的培養(yǎng)及鑒定Fig.6 Culture and identification of bovine mammary epithelial cells

    2.7 SP1表達(dá)對(duì)奶牛乳腺上皮細(xì)胞TAG合成的影響

    為研究1基因?qū)δ膛H橄偕掀ぜ?xì)胞乳脂合成的影響,本研究將牛pcDNA3.1-SP1過(guò)表達(dá)質(zhì)粒和1 RNAi干擾片段分別轉(zhuǎn)染奶牛乳腺上皮細(xì)胞。Western blot結(jié)果顯示,pcDNA3.1-SP1轉(zhuǎn)染的奶牛乳腺上皮細(xì)胞中SP1的表達(dá)極顯著高于對(duì)照組(圖7A和7B,<0.001);1過(guò)表達(dá)顯著提高細(xì)胞中TAG含量(圖7C,<0.01)。相反,將1 RNAi片段轉(zhuǎn)染至奶牛乳腺上皮細(xì)胞中,極顯著降低了細(xì)胞中SP1的表達(dá)(圖7D和7E,<0.001);TAG的合成顯著下降(圖7F,<0.01)。以上結(jié)果表明SP1能夠正向調(diào)節(jié)奶牛乳腺上皮細(xì)胞中乳脂的合成。

    A. Western blot檢測(cè)NC組和SP1過(guò)表達(dá)組SP1蛋白水平;B. SP1過(guò)表達(dá)后蛋白相對(duì)表達(dá)量;C. SP1過(guò)表達(dá)對(duì)TAG合成的影響;D. Western blot檢測(cè)NC組和SP1敲降組SP1蛋白水平;E. SP1敲降后蛋白相對(duì)表達(dá)量;F. SP1敲降對(duì)TAG合成的影響A. Western blot assays were used to evaluate the protein levels of SP1 in NC group and overexpression group; B. The relative expression level of SP1 in control and SP1 overexpressed cells; C. Effect of SP1 overexpression on TAG synthesis; D. Western blot assays were used to evaluate the protein levels of SP1 in NC group and SP1 knockdown group; E. The relative expression level of SP1 in control and SP1 knockdown cells; F. Effect of SP1 knockdown on TAG synthesis圖7 SP1對(duì)奶牛乳腺上皮細(xì)胞中乳脂合成的影響Fig.7 Effect of SP1 on milk fat synthesis in bovine mammary epithelial cells

    3 討 論

    全球?qū)?yōu)質(zhì)牛奶的需求正在增長(zhǎng),乳脂的合成過(guò)程受到環(huán)境、激素、細(xì)胞因子等多因素調(diào)控。乳腺上皮細(xì)胞是乳腺合成乳脂的最基本結(jié)構(gòu)和功能單位,乳脂從頭合成并分泌的過(guò)程首先在乙酰CoA羧化酶(acetyl-CoA carboxylase,ACC)和脂肪酸合酶(fatty acid synthase,F(xiàn)ASN)的作用下合成并延長(zhǎng)脂肪酸C鏈,隨后由分化抗原蔟36(cluster of differentiation 36,CD36)等參與脂肪酸的轉(zhuǎn)運(yùn)。最近研究發(fā)現(xiàn),乳腺中脂肪、蛋白質(zhì)和乳糖合成所涉及的蛋白質(zhì)編碼基因的轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控被用來(lái)提高牛奶合成效率,并提出包括一些重要轉(zhuǎn)錄因子(例如Spot14、ChREBP和SP1)的轉(zhuǎn)錄網(wǎng)絡(luò)模型。通過(guò)乳脂、蛋白質(zhì)和乳糖調(diào)節(jié)之間的相互作用來(lái)控制牛乳的合成,為研究乳脂合成基因的表達(dá)調(diào)控提供了理論依據(jù)。SP1作為重要的轉(zhuǎn)錄因子,參與幾乎所有的細(xì)胞功能,也成為疾病或腫瘤的治療靶點(diǎn)。本試驗(yàn)初步探究了奶牛乳腺中轉(zhuǎn)錄因子SP1的結(jié)構(gòu)及其對(duì)乳脂合成的調(diào)控作用,對(duì)提高乳脂合成分泌具有重要的試驗(yàn)價(jià)值。

    由于蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)決定其功能,SP1蛋白的結(jié)構(gòu)特征和理化性質(zhì)在中國(guó)荷斯坦奶牛中尚未見(jiàn)報(bào)道。本研究通過(guò)對(duì)奶牛1基因的同源性及序列分析發(fā)現(xiàn),1基因在不同物種間高度保守,且與山羊的同源性最高。氨基酸序列分析結(jié)果顯示,SP1屬于親水性可溶蛋白,其DNA結(jié)合區(qū)位于C末端,主要由3個(gè)典型的Cys2His2型鋅指結(jié)構(gòu)組成。先前的研究發(fā)現(xiàn),SP1通過(guò)調(diào)控轉(zhuǎn)錄相關(guān)因子的表達(dá),控制RNA聚合酶Ⅲ介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)錄,為其調(diào)控下游眾多基因的表達(dá)創(chuàng)造條件。SP1通過(guò)結(jié)合基因調(diào)控區(qū)的GC/GT盒以及與其他蛋白質(zhì)相互作用,發(fā)揮對(duì)基因轉(zhuǎn)錄的增強(qiáng)或抑制作用。SP1也可直接與轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物中TBP相關(guān)因子TAF4等蛋白相互作用,從而通過(guò)招募基本轉(zhuǎn)錄裝置或促進(jìn)其裝配而激活基因轉(zhuǎn)錄。在啟動(dòng)子處,SP1招募組蛋白去乙?;负鸵阴;竵?lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)該處組蛋白的乙?;癄顟B(tài)的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié),從而激活或者抑制基因表達(dá)。SP1蛋白序列的分析對(duì)揭示其與DNA結(jié)合模式及調(diào)控基因表達(dá)的分子機(jī)制具有重要意義,為后期探究奶牛SP1蛋白功能提供了理論基礎(chǔ)。本研究中蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,奶牛SP1蛋白富含無(wú)規(guī)則卷曲(52.29%),這通常作為蛋白質(zhì)分子行使功能和構(gòu)象變化的重要區(qū)域,對(duì)研究SP1在奶牛乳腺中對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控方式以及SP1與其他蛋白質(zhì)之間相互作用的模式具有重要意義。通過(guò)STRING蛋白相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)分析發(fā)現(xiàn),奶牛SP1蛋白與AP-1、p65、MYC、ERα、CREBBP、TBP等關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子或轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子存在相互作用,該結(jié)果暗示SP1在細(xì)胞增殖和代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因表達(dá)調(diào)控等途徑中發(fā)揮重要作用,也為探究SP1調(diào)控奶牛乳脂合成的機(jī)制提供了理論依據(jù)。

    1基因作為廣泛性轉(zhuǎn)錄因子,幾乎存在于所有細(xì)胞中,參與機(jī)體生理與病理的多種調(diào)控過(guò)程。1基因敲除小鼠會(huì)出現(xiàn)發(fā)育異?,F(xiàn)象,如發(fā)育滯后、畸形、死胎等。在小鼠卵巢中1的缺失導(dǎo)致卵泡和卵母細(xì)胞在青春期前發(fā)生大規(guī)模丟失,導(dǎo)致卵巢早衰的發(fā)生,SP1通過(guò)調(diào)節(jié)小鼠顆粒前細(xì)胞發(fā)育來(lái)控制原始卵泡發(fā)生。一些研究已經(jīng)證明,SP1通過(guò)調(diào)節(jié)乳脂合成過(guò)程中的眾多基因表達(dá),參與調(diào)節(jié)人類、大鼠和山羊的脂肪酸合成。在小鼠中,約50%的1基因靶標(biāo)被轉(zhuǎn)錄因子SP1占據(jù),協(xié)同調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄。SP1在維持山羊乳腺上皮細(xì)胞乳脂滴合成方面發(fā)揮重要作用,SP1的異常表達(dá)可以抑制山羊TAG的積累以及與TAG合成和脂滴形成相關(guān)的基因的表達(dá)。研究發(fā)現(xiàn),水牛脂蛋白脂肪酶(lipoprteinlipase,)基因中的一個(gè)SNP允許轉(zhuǎn)錄因子SP1的結(jié)合,導(dǎo)致基因過(guò)表達(dá)(約2.5倍),暗示SP1通過(guò)對(duì)脂質(zhì)代謝關(guān)鍵基因的表達(dá)調(diào)控乳脂代謝。最近研究發(fā)現(xiàn),SP1與脂肪酸延長(zhǎng)酶7(elongation of very long chain fatty acids protein,7)啟動(dòng)子-143~+128位置堿基對(duì)的GC/GT盒特異相互作用,在乳腺上皮細(xì)胞中激活7的表達(dá)。本研究發(fā)現(xiàn),泌乳期奶牛乳腺組織中SP1的表達(dá)量顯著高于干奶期,暗示SP1在奶牛泌乳過(guò)程中可能發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。在泌乳期奶牛乳腺上皮細(xì)胞中過(guò)表達(dá)或干擾1,細(xì)胞中TAG的合成與SP1的表達(dá)呈正相關(guān)。前期研究發(fā)現(xiàn),在C57BL/6 J小鼠中SP1的表達(dá)減弱了microRNA-199a-3p對(duì)肝脂肪生成的影響,促進(jìn)TAG的積累和產(chǎn)脂基因的表達(dá),暗示SP1在維持小鼠肝TAG穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮潛在調(diào)控作用。在脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中,SP1可與PPARγ相互作用控制甘油三酯脂肪酶(adipose triglyceride lipase,ATGL)的轉(zhuǎn)錄。在大鼠肝中,1過(guò)表達(dá)增加地塞米松誘導(dǎo)的脂肪生成基因(1、)的表達(dá)和TAG的合成,暗示SP1介導(dǎo)產(chǎn)脂基因表達(dá)及TAG合成的調(diào)節(jié)。通過(guò)抑制SP1與啟動(dòng)子區(qū)域的結(jié)合,抑制1和2及其下游靶基因和的表達(dá),在調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞增殖和脂質(zhì)代謝中發(fā)揮重要作用。因此,SP1的表達(dá)與乳脂合成密切相關(guān),SP1可能通過(guò)與乳脂合成關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合調(diào)控下游基因表達(dá),或直接結(jié)合在乳脂合成關(guān)鍵基因的啟動(dòng)子區(qū),影響基因表達(dá)及TAG合成。盡管SP1在調(diào)節(jié)反芻動(dòng)物的脂肪代謝中起著重要作用,本研究初步探究了奶牛1基因結(jié)構(gòu)及對(duì)乳脂合成的影響,但其對(duì)奶牛乳脂合成的調(diào)節(jié)機(jī)制還有待進(jìn)一步研究。

    4 結(jié) 論

    本研究對(duì)奶牛1基因序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,1基因在不同物種中高度保守。PCR克隆得到中國(guó)荷斯坦奶牛1基因CDS序列,成功構(gòu)建了1基因的過(guò)表達(dá)載體。實(shí)時(shí)熒光定量PCR和Western blot結(jié)果顯示,SP1在泌乳期奶牛乳腺組織中高表達(dá)。分離純化得到了奶牛乳腺上皮細(xì)胞,1基因過(guò)表達(dá)顯著促進(jìn)TAG合成,1基因沉默顯著抑制TAG合成,提示其在奶牛乳腺上皮細(xì)胞中可以正向調(diào)控乳脂合成。該結(jié)果為深入研究SP1對(duì)泌乳奶牛乳脂合成調(diào)控機(jī)制提供了理論依據(jù)。

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