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    紅樹林放線菌抗沃柑病原真菌的研究

    2022-08-18 03:22:30李菲楊玲王巧貞許秀松黃庶識楊慧歡覃仙玲
    中國抗生素雜志 2022年7期
    關(guān)鍵詞:放線菌原液分生孢子

    李菲 楊玲 王巧貞 許秀松 黃庶識 楊慧歡 覃仙玲,*

    (1 廣西科學(xué)院廣西近海海洋環(huán)境科學(xué)重點實驗室,南寧 530007;2 廣西科學(xué)院 廣西海洋天然產(chǎn)物與組合生物合成化學(xué)重點實驗室,南寧 530007;3 廣西師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,桂林 541006;4 廣西師范大學(xué) 珍稀瀕危動植物生態(tài)與環(huán)境保護教育部重點實驗室,桂林 541006;5 南寧學(xué)院機電與質(zhì)量技術(shù)工程學(xué)院,南寧 530200)

    柑橘是我國重要的水果產(chǎn)業(yè),品種多,分布廣,種植規(guī)模和產(chǎn)量均居全球第一[1]。沃柑系以色列研發(fā)的雜交柑橘品種,由于晚熟高糖和早結(jié)豐產(chǎn)等優(yōu)點,在我國廣受青睞[2-4]。沃柑晚熟,需要越冬,但又不防凍,因此適合我國廣西等積溫高的地區(qū)種植。截至2018年底,廣西沃柑種植面積約200萬畝(13.33萬hm2),產(chǎn)量約100萬噸,位居全國第一位[5]。沃柑作為廣西柑桔產(chǎn)業(yè)的支柱產(chǎn)品,對廣西的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟有著重大意義。然而,柑橘培育過程中發(fā)生的病蟲害不容小覷。據(jù)美國植物病理學(xué)會網(wǎng)站記錄,柑橘真菌性病害60余種,其危害程度因地區(qū)和品種而異[6]。為順利開展沃柑病害中病原真菌的防控工作,本課題組在廣西南寧上林沃柑培育基地開展了沃柑病害的調(diào)查,結(jié)果發(fā)現(xiàn)沃柑枝葉及果實在生長過程中,會出現(xiàn)不同程度的真菌感染,病征與柑橘炭疽病、柑橘潰瘍病及柑橘黑點病的癥狀相似,為弄清病原真菌種類及尋找針對性的防治方法,本研究對沃柑葉斑病害中病原真菌進行分離和初步鑒定,并開展了紅樹林放線菌抗沃柑病原真菌的研究。

    放線菌,尤其是鏈霉菌是天然抗菌活性產(chǎn)物的主要來源,約2/3的抗生素是由放線菌產(chǎn)生[7]。放線菌作為土壤中的優(yōu)勢菌群,經(jīng)過數(shù)十年來大規(guī)模的挖掘和篩選后,普通生態(tài)環(huán)境中挖掘出新穎的放線菌資源越來越困難,故人們將目光轉(zhuǎn)向了特殊生態(tài)環(huán)境。紅樹林作為海陸交界的特殊生態(tài)系統(tǒng),其微生物群落在適應(yīng)生態(tài)環(huán)境與自我保護中,通過通信、覓食、拮抗等互作的微生物生存機制,來適應(yīng)謂之“生命極限”的特殊環(huán)境,其獨特的生境必然會造成其代謝出更具特點的化合物及其相應(yīng)的生物活性[8]。研究發(fā)現(xiàn),紅樹林土壤放線菌不僅產(chǎn)生多種功能酶[9],而且還分泌具有抗菌、抗腫瘤、抗氧化等藥用活性的代謝產(chǎn)物[9-12]。本研究以分離到的植物病原真菌為指示菌,從紅樹林放線菌中篩選出了具有顯著抑菌活性的菌株,為沃柑葉斑病害的防控奠定了基礎(chǔ)。

    1 材料與方法

    1.1 試驗材料

    1.1.1 供試樣本

    (1)病害樣本于2021年10月采集自廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院園藝研究所的沃柑培育基地,采集有明顯病癥部位的葉片樣品,裝于密封袋帶回實驗室進行研究。

    (2)健康葉片樣本采自廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院科研基地,選取形態(tài)相近且健康的沃柑帶葉枝條若干,放置于密封袋保存帶回實驗室備用。

    1.1.2 主要試劑和儀器

    (1)試劑 培養(yǎng)基原料、TAE緩沖液、2×EasyTaqMasterMix、引物(ITS1和ITS4)、DNA marker、GoldView核酸染料,Chelex 100樹脂(Bio-Rad),其他有機試劑(分析純)等購于北京康為世紀生物科技有限公司。

    (2)儀器 SW-CJ-2F型超凈工作臺(杭州佳濾設(shè)備有限公司),HH·B11-BS-Ⅱ型恒溫培養(yǎng)箱(東莞市恒宇儀器有限公司),Tgradient型PCR擴增儀(德國Biometra),電泳儀(美國BioRad),Gel Logic 2200Pro凝膠成像儀(Carestream),VB-55型高壓滅菌鍋(德國Systec),MINI-6k型迷你離心機(常州市國旺儀器制造有限公司),MINIB-100型金屬浴(杭州米歐儀器有限公司),恒溫振蕩器(美國Crystal),N1000型旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)儀(日本Eyela)和光學(xué)顯微鏡(日本Nikon)等。

    1.1.3 培養(yǎng)基

    真菌分離、純化及拮抗菌篩選培養(yǎng)基:PDA固體培養(yǎng)基(土豆200.0 g,葡萄糖20.0 g,去離子水1000 mL,瓊脂14.0 g,pH 6.8~7.2)。

    發(fā)酵培養(yǎng)基:改良InternationalStreptomycesProject 2(ISP2)固體培養(yǎng)基[14]。

    1.1.4 供試放線菌菌株

    選取24株于2021年11月分離自廣西茅尾海紅樹林自然保護區(qū)內(nèi)桐花樹根際土壤的放線菌,通過EzBioCloud數(shù)據(jù)庫(https://www.ezbiocloud.net/)在線比對[15],這些放線菌隸屬于12屬,其中5株鏈霉菌屬(Streptomyces),5株紅球菌屬(Rhodococcus),3株微桿菌屬 (Microbacterium),3株小單孢菌屬 (Micromonospora),2株類諾卡菌(Nocardioides),壤霉菌屬(Agromyces)、短狀桿菌屬(Brachybacterium)、戈登菌屬(Gordonia)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、棲白蟻菌屬 (Isoptericola)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)和Phycicoccus屬各1株;均保藏于廣西科學(xué)院北部灣海洋微生物種質(zhì)資源庫中,具體信息見表1。

    表1 拮抗實驗用紅樹林放線菌信息Tab.1 Actinomycete strains from mangrove for antagonistic assay

    1.2 病原真菌分離與鑒定

    1.2.1 菌株分離純化

    用自來水沖洗患病葉片組織后,依次用75%乙醇和5%次氯酸鈉溶液浸泡組織各5 min,每次消毒后用滅菌水反復(fù)沖洗3次。處理后的病樣組織置于超凈工作臺晾干,用無菌剪刀將有病樣部位剪成小塊,分散鋪于PDA固體培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)3~5 d。觀察平板上菌落生長情況,挑取肉眼可見菌落進行純化培養(yǎng),并將純化好的菌株接種至PDA試管培養(yǎng)基中,待其生長至對數(shù)期后進行斜面保藏。

    1.2.2 真菌生長速率測定及形態(tài)觀察

    用打孔器(直徑6 mm)取新鮮的菌苔邊緣的菌絲塊轉(zhuǎn)接于PDA培養(yǎng)基(直徑90 mm)中央,置于28℃培養(yǎng),每株菌3組平行。用十字交叉法測量菌落直徑,待菌絲長滿即停止測量,菌落平均生長速率單位為mm/d。挑取PDA表面的分生孢子,在光學(xué)顯微鏡下觀察其形態(tài)。

    1.2.3 真菌菌株基因測序和系統(tǒng)發(fā)育分析

    采用chelex-100樹脂[16]快速提取待測真菌的基因組DNA作為PCR模板,對待測菌進行PCR擴增。引物ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′),特異性擴增出各個菌株的ITS1-5.8S-ITS2區(qū)域,基因序列長度約為550 bp;擴增條件:94℃預(yù)變性8 min,94℃變性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸2 min,共30個循環(huán),循環(huán)結(jié)束后,72℃延伸10 min。擴增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測合格后,委托生工生物工程(上海)股份有限公司進行測序分析。序列經(jīng)BioEdit Sequence Alignment Editor軟件整理后,測序結(jié)果在NCBI中進行BLAST同源性比對,分別獲得同源性相近的菌種序列,運用MEGA7.0軟件,采用Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)樹,對各菌株的系統(tǒng)發(fā)育地位進行分析[17]。

    1.2.4 致病性測定

    參照趙洪濤等[18]的方法,按照柯赫氏法則,對分離到的疑似致病菌株進行回接驗證。具體操作如下,將新鮮葉子從枝條上剪下,用自來水進行表面沖洗后,再用75%乙醇溶液對其表面消毒3次,每次消毒后用無菌水沖洗3遍,置于超凈工作臺中晾干。用無菌牙簽在葉面上有序扎數(shù)個孔。用無菌生理鹽水制備真菌分生孢子液,懸浮液濃度約為1×107CFU/mL。滴加10 μL在扎孔處,對照組則滴加10 μL無菌生理鹽水。接種后的葉片置于玻璃平皿中,底部放入潤濕的無菌紗布,每組3張葉片,每組3個平行,置于28℃的人工氣候箱中,12 h光照/12 h黑暗交替培養(yǎng),注意補水保濕;定期觀察葉片發(fā)病情況,對發(fā)病葉片進行病原菌的分離和鑒定。

    1.3 拮抗菌的篩選及活性測試

    1.3.1 菌株抑菌活性初篩

    采用平板對峙法對24株供試菌株進行拮抗活性篩選,用無菌打孔器將分離到的病原真菌制成6 mm菌餅,接種于PDA固體平板中央,放置28℃培養(yǎng),病原真菌C1和C4培養(yǎng)2 d,C2和C3培養(yǎng)1 d后,再將待測放線菌接種于PDA固體平板四周,每板接4株細菌;以僅接種病原真菌菌餅的PDA固體平板為空白對照組,放置28℃培養(yǎng)5~7 d,觀察并記錄病原真菌的生長情況。

    1.3.2 菌株發(fā)酵產(chǎn)物的抗菌活性測試

    選取初篩活性良好的菌株進行菌株發(fā)酵產(chǎn)物活性檢測,旨在確定活性產(chǎn)物極性。選擇改良ISP 2培養(yǎng)基作為搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)基。采用與文獻[19]相同的菌株發(fā)酵條件及其次級代謝產(chǎn)物的提取方法。受試菌株留存3類樣品:①發(fā)酵液離心后的上清原液(下文簡稱為原液);②上清乙酸乙酯萃取后的甲醇濃縮物(下文簡稱酯相);③菌體丙酮浸提后的甲醇溶解液(下文簡稱菌體浸提物);3種樣品均用一次性過濾器(0.22 μm孔徑)處理后使用。采用牛津杯法[20]檢測菌株發(fā)酵產(chǎn)物的抑菌活性,以改良ISP2液體培養(yǎng)基/甲醇溶液為空白對照,每個牛津杯加入初始樣液150 μL,置于28℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)7 d,觀察并記錄指示真菌的生長情況,并計算拮抗菌株發(fā)酵產(chǎn)物的抑菌率,公式如下:

    抑菌圈直徑=對照組病原菌直徑-實驗組病原菌直徑

    抑菌率=抑菌圈直徑/對照組病原菌直徑×100%

    1.3.3 活性菌株發(fā)酵產(chǎn)物的病害防治測試

    選取真菌C4侵染健康的沃柑葉片,測試活性菌株發(fā)酵產(chǎn)物的病害防治效果。試驗設(shè)計2組,按“1.2.4”處理新鮮的待試沃柑葉片。試驗1:用無菌牙簽在葉面上有序扎8~10個孔,將發(fā)酵原液/酯相均勻噴灑至葉片的正面和背面,晾干后,在扎孔處滴加10 μL真菌C4的分生孢子液(濃度約為1×107CFU/mL)。試驗2:用無菌牙簽在待試沃柑葉面上有序扎8~10個孔,將10 μL真菌C4的分生孢子液(濃度同上)滴加在扎孔處,培養(yǎng)至葉片出現(xiàn)病斑,再將發(fā)酵原液/酯相均勻噴灑接種至葉片的正面和背面。兩組實驗均以噴灑改良的ISP2液體培養(yǎng)基/甲醇溶液作為空白對照,接種后的葉片均置于玻璃平皿中,底部放入潤濕的無菌紗布,每組20張葉片,置于28℃的人工氣候箱中,12 h光照/12 h黑暗交替培養(yǎng),注意補水保濕,定期觀察葉片發(fā)病情況,統(tǒng)計葉片上病斑數(shù)量,并計算沃柑葉片的病情指數(shù)和菌株發(fā)酵產(chǎn)物的防治效果。

    參照文獻[18]方法,將病情分級標(biāo)準制定如下:0級,無病斑;1級,每葉有1~3個病斑;3級,每葉有4~6個病斑;5級,每葉有7~10個病斑。

    病情指數(shù)=[Σ(各級病葉數(shù)×相對級數(shù)值)/(試驗總?cè)~數(shù)×5)]×100%

    防治效果=(對照組病情指數(shù)-處理組病情指數(shù))/對照組病情指數(shù)×100%

    1.4 目標(biāo)菌株基因組序列antiSMASH在線預(yù)測與分析

    對目標(biāo)菌株進行基因組測序分析。將菌株接種于改良ISP2液體培養(yǎng)基中,28℃、180 r/min搖瓶震蕩培養(yǎng)5 d,8000 r/min離心10 min收集菌體,用無菌水洗滌3次后裝入15 mL離心管,迅速冷凍后寄送至上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成基因組的提取、測序、組裝和注釋?;蚪M序列通過antiSMASH服務(wù)器(https://antismash.secondarymetabolites.org/)進行次級代謝生物合成基因簇的預(yù)測。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 病原真菌分離與鑒定

    2.1.1 菌落形態(tài)、生長速率及分生孢子等形態(tài)學(xué)觀察

    從病樣組織中分離出7個菌株,根據(jù)其菌落及分生孢子形態(tài)特征(圖1)分為4種真菌:①C1菌落呈棕黑色,橙紅色氣生菌絲致密,常產(chǎn)生橙色露珠狀液滴使之呈紅色,生長緩慢(8.02 mm/d);分生孢子呈短桿狀或橢圓狀。②C2菌落呈紫紅色,后期產(chǎn)生紫紅色色素,氣生菌絲白色濃密,生長較快(16.21 mm/d);分生孢子呈鐮刀形。③C3菌落呈粉紅色,氣生菌絲白色濃密,生長較快(16.13 mm/d);分生孢子呈鐮刀形。④C4菌落呈白色或奶白色,氣生菌絲灰白色濃密,生長較慢(12.58 mm/d);分生孢子呈磚格狀或鐮刀形。

    圖1 病樣分離菌株的菌落及分生孢子形態(tài)Fig.1 Colony and conidia morphology

    2.1.2 病原真菌的分子生物學(xué)鑒定

    經(jīng)測序比對,真菌C1的ITS基因序列與Boeremia exigua(登記號MH484014.1)完全一致;真菌C2、C3和C4均屬于鐮刀菌屬(Fusarium)菌株,其ITS基因序列分別與層出鐮刀菌Fusariumproliferatum(登記號HQ380763.1),藤黑鐮孢菌Fusariumfujikuroi(登記號KJ000429.1)和腐皮鐮刀菌Fusarium solani(登記號KT184399.1)一致,并對其構(gòu)建Neighbour-Joining系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2);并根據(jù)真菌鑒定手冊及相關(guān)文獻報道[21-25],這些真菌的分子鑒定結(jié)果與觀察到的生物學(xué)特性相吻合。

    圖2 基于ITS基因序列構(gòu)建菌株C1,C2,C3和C4的N-J系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 N-J phylogenetic tree of the strain C1,C2,C3 and C4 based on the ITS gene sequences

    2.1.3 致病性測定

    按照柯赫氏法則,通過針刺接種法將疑似致病菌株C1~C4的分生孢子接種到健康的沃柑葉片上。結(jié)果表明,接種C1的葉片在第5天出現(xiàn)褐色病斑,棕色處呈凹陷空洞,病健交界處出現(xiàn)黃綠暈圈(圖3a);接種C4的葉片在第2天出現(xiàn)黑色病斑,外延微微隆起,黑色病斑向外擴張,病癥惡化速度極快(圖3d);且從各自發(fā)病的葉片上,重新分離到C1和C4菌株。接種層出鐮刀菌C2(圖3b)和藤黑鐮孢菌C3(圖3c)則均與對照組的表征相同,未見病灶??梢?,真菌C1和C4均能感染沃柑葉片,且真菌C4的感染情況較真菌C1的感染情況嚴重。

    圖3 C1-C4菌株致病性測定結(jié)果(真菌感染5~7d)Fig.3 Orah leaf infected by fungal strain C1-C4 after 5-7 days

    2.2 拮抗菌活性測試

    2.2.1 拮抗菌的篩選

    采用平板對峙法對24株紅樹林放線菌進行拮抗活性初篩,篩選到1株鏈霉菌M2020對4株病原真菌表現(xiàn)出顯著活性(圖4A組)。再用牛津杯法對菌株M2020的發(fā)酵原液、發(fā)酵液酯相及菌體浸提物進行抑制病原真菌C1~C4的活性測試。結(jié)果顯示,M2020菌體浸提物對真菌C1~C4均無抑菌活性,M2020的發(fā)酵原液對真菌C1、C2和C3無抑制作用,對真菌C4有抑制活性,抑菌圈小于等于22.74 mm,抑菌率為45.33%。M2020的發(fā)酵液酯相對真菌C1、C2、C3和C4均有抑制效果(圖4B組),抑菌圈直徑分別為25.70、47.60、37.10和25.30 mm,抑菌率分別為63.61%、62.63%、53.22%和47.65%。

    圖4 鏈霉菌M2020抗真菌C1~C4活性Fig.4 Antifungal activities of strain M2020 against fungal strains C1~C4

    2.2.2 鏈霉菌M2020的防病害效果

    以致病真菌C4作為指示菌株,通過針刺接種法將其分生孢子接種到健康的柑桔葉片上,用菌株M2020的發(fā)酵原液和酯相處理葉片,觀察葉片出現(xiàn)病害的情況,從而判斷M2020菌株的防病害效果。結(jié)果表明,菌株M2020的發(fā)酵原液和酯相對真菌C4侵染有顯著抑制效果。試驗1中,發(fā)酵原液處理組有2片葉子出現(xiàn)褐色病斑,部分葉片的扎孔處均有患病后結(jié)痂痕跡(圖5A-1),酯相處理組中有5片明顯病征的葉子,部分病斑出現(xiàn)中心斑塊淡化(圖5A-2);結(jié)合葉片患病指數(shù)和防治效果(表2),試驗1中發(fā)酵原液處理后的葉片患病率較低(患病指數(shù)為8.42%),即發(fā)酵原液防止真菌C4侵染效果較好(防治效果為89.87%)。試驗2中,發(fā)酵原液處理組有5葉片出現(xiàn)黑色病斑,有3處黑斑呈向外擴張惡化嚴重(圖5B-1);酯相處理組中多數(shù)葉斑呈現(xiàn)結(jié)痂狀態(tài)。從表2可知,試驗2中發(fā)酵酯相處理的葉片患病率較低(患病指數(shù)為5.00%),即發(fā)酵液酯相在沃柑葉片出現(xiàn)葉斑后的控制效果佳(防治效果為94.56%)。綜上,在沃柑葉斑病害(真菌C4感染)的防治上,可先用菌株M2020發(fā)酵原液處理葉片來預(yù)防病原真菌侵染;若葉片出現(xiàn)病癥,可用發(fā)酵液酯相控制該病害的擴大。

    圖5 M2020發(fā)酵產(chǎn)物對沃柑葉片患病前/后處理的藥效試驗圖Fig.5 Field test of strain M2020 fermentation products on pretreatment or post treatment of Ora

    表2 M2020發(fā)酵產(chǎn)物對沃柑葉片患病前/后處理的藥效試驗結(jié)果Tab.2 Field test of strain M2020 fermentation products on pretreatment or post treatment of Orah

    2.3 鏈霉菌M2020次級代謝產(chǎn)物合成潛力分析

    基于基因組信息對鏈霉菌M2020合成次級代謝產(chǎn)物的潛力進行預(yù)測,菌株M2020基因全長8.1 Mbp,GC含量為72.2 mol%。經(jīng)antiSMASH預(yù)測分析,其潛在的次級代謝產(chǎn)物生物合成基因簇(biosynthetic gene cluster,BGC)共有38個(表3),主要包含聚酮類(T1PKS、T2PKS和T3PKS)、非核糖體多肽類(NRPS)、萜烯類(terpene)、非α-多聚氨基酸類(NAPAA)、核糖體合成和翻譯后修飾肽(RiPP-like) 、羊毛硫肽類(lanthipeptide)、嗜鐵素(siderophore) 和四氫嘧啶(ectoine)等已知基因簇。

    表3 M2020次級代謝產(chǎn)物生物合成基因簇Tab.3 Secondary metabolite biosynthesis gene clusters of M2020

    此外,T1PKS(5451、18350和46353 bp)terpene(20950 bp) lanthipeptide class Ⅲ(22729 bp)RiPP-like(10227 bp和10842 bp) lassopeptide(22442 bp)other(32525 bp) butyrolactone (10342 bp和10920 bp)基因簇未匹配到同源基因簇的序列。

    3 結(jié)論與討論

    廣西的沃柑種植面積位居全國第一位,對廣西的農(nóng)業(yè)經(jīng)濟意義明顯。本研究針對沃柑真菌病害,從廣西南寧采集的沃柑葉片上分離到代號C1~C4的4株真菌,經(jīng)初步鑒定,分別為大豆莖點霉、層出鐮刀菌、藤黑鐮孢菌和腐皮鐮刀菌。文獻調(diào)研表明,大豆莖點霉是破壞性極強的病原真菌,可導(dǎo)致棉花[26]、秋葵[27]、煙草[28]及大豆[29]等農(nóng)作物患病。鐮刀菌是另一類分布廣泛的植物病原真菌,能侵染多種糧食和飼料作物的根、莖、葉及果實而引起根腐、穗腐和莖腐等病害[30]。其中腐皮鐮刀菌是由厚垣孢子可通過微小創(chuàng)面進入植物體的維管束中萌發(fā),導(dǎo)致一系列植物腐爛病害[31]。本研究的回接實驗證實了大豆莖點霉C1和腐皮鐮刀菌C4能導(dǎo)致沃柑的健康葉片染病。

    在此基礎(chǔ)上,利用廣西紅樹林特境來源的24株放線菌對4株病原真菌(代號C1~C4)進行拮抗活性篩選,其中鏈霉菌M2020對真菌C1~C4均表現(xiàn)出拮抗活性,其活性物質(zhì)分布在發(fā)酵原液和酯相中。經(jīng)16S rRNA基因序列比對分析,菌株M2020與鏈霉菌Streptomyces angustmyceticusNRRLB-2347T系統(tǒng)發(fā)育最為密切,相似率為100%。文獻調(diào)研表明,Streptomyces angustmyceticus對植物病原真菌具有高效廣譜抑制活性,如對大白菜葉斑病病原菌Colletotrichumsp.和Curvularia lunata的抑菌率達75.6%和69.5%[32],對植物病原真菌尖孢鐮刀菌黃瓜專化型(Fusarium oxysporumf.sp.cucumerinum,F(xiàn)oc)、禾谷鐮刀菌(Fusarium graminearum)和灰葡萄孢(Botrytis cinerea)均有很好的抑制作用[33]。為預(yù)測菌株M2020潛在合成產(chǎn)物,對其全基因組進行次級代謝產(chǎn)物生物合成基因簇比對分析。菌株M2020的基因組中預(yù)測出38個BGC,其中與已有基因簇相似度較高(30%~100%)的BGC有12個,對應(yīng)合成具有抑菌活性的已知化合物有4類,即大環(huán)內(nèi)酯caniferolide A/B/C/D、硫肽類抗生素環(huán)噻唑霉素cyclothiazomycin、創(chuàng)新霉素chuangxinmycin和聚酮類piericidin A1,菌株M2020可能會產(chǎn)生這些具有抑菌活性的化合物或其類似物。此外,有15個BGC與已有基因簇相似值低于30%,11個BGC未匹配到同源基因簇,這些未知BGC的存在暗示菌株M2020有產(chǎn)生新抗生素的潛力。值得一提的是,S.angustmyceticusNRRLB-2347T生產(chǎn)的一種核苷類抗生素狹霉素(angustmycins),具有很好的植物生長調(diào)節(jié)活性和一定抑菌活性[34]??傊?,鏈霉菌M2020具有顯著且廣譜的抑制真菌活性效果,在沃柑真菌病害防治上得到了一定的驗證。然而,該菌株的抑菌活性是由何種次級代謝產(chǎn)物決定,是否產(chǎn)生狹霉素,其對田間沃柑真菌病害的藥效如何,是否對柑橘其他真菌病害有防治潛力等問題,均是亟須進一步研究的內(nèi)容。

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