趙 豐 鄧楹君 陳亞洲 高慶和 郭 俊 王 浩 任 凱 郭 軍
中國中醫(yī)科學院西苑醫(yī)院男科(北京 100091)
“異病同治”[1]指在中醫(yī)學上不同的疾病在其發(fā)生和發(fā)展過程中出現(xiàn)了相同病機,從而采用同樣方法加以治療的法則,是中醫(yī)學辨證論治的精髓之一,被廣泛用于臨床診療中?!爱惒 钡幕A是病機相同,濕熱下注是泌尿系疾病的主要證型之一,以小便頻數(shù)、淋漓澀痛、尿液混濁、尿道滴白、會陰脹痛、大便粘滯,舌紅苔黃膩,脈滑數(shù)等為主要表現(xiàn)。慢性前列腺炎癥(chronic prostatitis,CP)和良性前列腺增生癥(Benign Prostate Hyperplasia,BPH)同為泌尿男科的常見病,根據(jù)多項流行病學統(tǒng)計顯示,濕熱下注證是CP和BPH的主要證型之一[2-5]。
“同治”是治法相同,以方類證就是“異病同治”的體現(xiàn)。寧泌泰膠囊是由貴陽新天藥業(yè)股份有限公司生產(chǎn)的專利苗藥,臨床應用多年,廣泛應用于慢性前列腺炎、良性前列腺增生癥、尿路感染等中醫(yī)辨證為濕熱下注證的泌尿生殖系統(tǒng)疾病[6-7]。近年來在中藥治療CP領域,圍繞寧泌泰展開的研究已成為熱點[8]。寧泌泰對濕熱下注證CP和BPH具有顯著優(yōu)勢,是中醫(yī)理論“異病同治”的體現(xiàn),但寧泌泰治療二者的具體作用機制目前尚不明確。本研究利用網(wǎng)絡藥理學方法,對寧泌泰膠囊的藥物成分、靶點的相互作用關系和潛在通路進行研究,預測其治療CP和BPH的相關機制,為后續(xù)寧泌泰膠囊對CP與BPH的治療以及寧泌泰膠囊的進一步研究提供參考。
通過中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫與分析平臺(TCMSP)[9]和中藥分子機制的生物信息學分析工具(BATMANTCM)檢索寧泌泰膠囊組成藥物(四季紅、大風藤、白茅根、連翹、三顆針、仙鶴草、木芙蓉葉)。設置TCMSP的檢索條件為藥物口服生物利用度(OB)≥30%、藥物相似性(DL)≥0.18,將BATMAN-TCM中檢索到的活性成分輸入TCMSP中以同樣檢索條件進行篩選。同時檢索相關文獻,將文獻中明確報道的但未在二者數(shù)據(jù)庫中檢索到或未達到OB、DL要求的活性成分也納入本研究。在TCMSP中得到每個成分的作用靶點,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫將名稱規(guī)范化并去重。
以“chronic prostatitis”和“Benign Prostate Hyperplasia”為關鍵詞,在GeneCards[10]、OMIM[11]和Disgenet[12]數(shù)據(jù)庫搜索相關疾病靶點,其中在GeneCards數(shù)據(jù)庫以相關性評分(Relevance score)的中位數(shù)為卡值,去重后獲得與CP和BPH的疾病靶點。利用維恩圖制作工具將三者的靶點進行交集處理,獲得的結(jié)果即為寧泌泰治療CP和BPH的共同有效靶點。將上述數(shù)據(jù)導入Cytoscape[13]中進行“中藥-成分-靶點-疾病”互作可視化網(wǎng)絡繪制,并獲取該網(wǎng)絡的拓撲數(shù)據(jù)。
將共有靶點輸入STRING數(shù)據(jù)庫,限定物種為“人”進行PPI網(wǎng)絡構(gòu)建,取綜合評分>0.4分的結(jié)果,在Cytoscape軟件中進行拓撲結(jié)構(gòu)處理,以度值(Degree)、接近中心性(closeness centrality,CC)和介度中心性(Betweeness centrality,BC)等參數(shù)為卡值,篩選出寧泌泰治療CP和BPH的核心靶點。
將共有靶點輸入metascape[14]數(shù)據(jù)庫中,以“人”為限定物種,進行基因本體論(Gene ontology,GO)與京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,以獲得GO的生物過程(Biological Processes,BP)、分子功能(Molecular Functions,MF)、細胞組分(Cellular Components,CC)和KEGG通路,設定P≤0.01進行篩選和排序。
利用PDB蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(http://www.Pdb.org/)下載PPI排名前3的核心靶點蛋白質(zhì)晶體結(jié)構(gòu),在Pubchem數(shù)據(jù)庫中下載Degree最高的3個活性成分的3D結(jié)構(gòu),將相關數(shù)據(jù)導入Autodock4.2.6軟件,對活性成分和核心靶點進行分子對接驗證。
通過篩選及文獻校對[15-17],共納入47個寧泌泰膠囊的活性成分,包括大風藤6個、白茅根4個、連翹18個、木芙蓉葉10個、三顆針6個、四季紅11個、仙鶴草6個;對應靶點280個,其中來自大風藤58個、白茅根58個、連翹211個、木芙蓉葉189個、三顆針66個、四季紅179個、仙鶴草172個,見表1。
表1 寧泌泰的活性成分相關信息
研究共獲得CP疾病靶點2259個,BPH疾病靶點2341個,將寧泌泰、CP、BPH三者靶點取交集如圖2,最終獲得1445個CP和BPH的共有靶點,占所有靶點總和的44.87%,這可能是CP和BPH“異病同治”的基礎,獲得168個寧泌泰治療CP與BPH的共同有效靶點,占所有靶點總和的5.22%,見圖1。
圖1 寧泌泰活性成分與疾病靶點維恩圖
“中藥-成分-靶點-疾病”互作關系網(wǎng)絡圖如圖2,其中寧泌泰的七味藥都具有較高節(jié)點度(degree);所有活性成分的節(jié)點度都高于2,其中以槲皮素(MOL000098)、 山 奈 酚 (MOL000422)、β谷 甾 醇(MOL000358)、木犀草素(MOL000006)的節(jié)點度最高,均超過100;靶點中degree排名較靠前的有PTGS2、PTGS1、NCOA2、HSP90AA1、ADRB2、PPARG、TOP2A、ADRA1B、AR等。
圖2 寧泌泰基于“異病同治”的“中藥-成分-靶點-疾病”互作關系網(wǎng)絡圖
PPI分析共得到797對綜合評分≥0.9的蛋白互作數(shù)據(jù),導入cytoscape軟件中進行網(wǎng)絡拓撲分析,分別以degree的二倍中位數(shù)和degree、BC、CC的中位數(shù)為卡值,獲得一個包含10個節(jié)點,32條邊的蛋白互作網(wǎng)絡,這些節(jié)點即為寧泌泰“異病同治”治療CP和BPH的核心靶點,篩選過程見圖3,核心靶點及相關數(shù)據(jù)見表2。
表2 核心靶點
圖3 核心靶點篩選過程
將168個共有靶點導入metascape數(shù)據(jù)庫中分別進行富集分析,選取P值≤0.01的結(jié)果。GO分析共得到248個BP條目,包括對無機物質(zhì)的反應(response to inorganic substance)、凋亡信號通路(apoptotic signaling pathway)、蛋白質(zhì)磷酸化的正調(diào)控(positive regulation of protein phosphorylation)等,6個CC條目,包括膜筏(membrane raft)、囊泡腔(vesicle lumen)、蛋白激酶復合物(protein kinase complex)等;79個MF條目,包括轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合(transcription factor binding)、激酶結(jié)合(kinase binding)、蛋白激酶活性(protein kinase activity)等,根據(jù)P值大?。≒≤0.01),用條形圖分別繪制各類P值前10的條目(圖4)。
圖4 GO分析結(jié)果
KEGG富集分析共獲得138條通路。根據(jù)P值(P≤0.01)篩選排序靠前的信號通路通路有AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications,以及PI3KAkt、IL-17、TNF、HIF-1、foxo等信號通路,主要與腫瘤、神經(jīng)內(nèi)分泌、免疫炎癥以及缺氧應激等有關。而其后的VEGF,P53,PPAR信號通路則與血管內(nèi)皮細胞,腫瘤細胞增殖、凋亡有關。對前20條信號通路以氣泡圖展示(見圖5)。
圖5 KEGG分析結(jié)果
將排名前3的關鍵化合物和PPI中排名前3的核心靶點進行分子對接結(jié)果見表3。結(jié)合能(affinity)越小說明對接效果越好,affinity<-7表示具有良好的結(jié)合性。
表3 分子對接結(jié)果
選擇結(jié)合能最好的前組對接結(jié)果進行展示,見圖6。圖6(A)顯示beta-sitosterol與SRC結(jié)合情況,圖6(B)顯示kaempferol與AKT1結(jié)合情況;圖6(C)kaempferol與TP53結(jié)合情況。
圖6 分子對接結(jié)果圖示
濕熱下注證是CP和BPH的常見證型,濕為陰邪,其性重濁黏滯,易襲下焦;熱為陽邪,易耗傷津液,二者合而為病,病程遷延不愈。濕熱下注膀胱,則膀胱氣化不利,可致尿頻、尿濁、尿痛;精室以通為用,精室濕熱,則見尿頻尿急,小便短赤;濕熱阻滯精道,引起精液粘稠不液化;濕熱結(jié)于陰器,則陰部瘙癢或陰囊潮濕異味[18]。多項研究表明,寧泌泰可明顯改善濕熱下注證CP所引起的下尿路癥狀[19],并可明顯緩解疼痛,提高生活質(zhì)量評分,安全有效[20-21]。在治療BPH方面,臨床研究顯示在服用寧泌泰治療后患者IPSS評分明顯下降,Qmax明顯提高[22];在另一項研究中,寧泌泰對尿路刺激癥狀的緩解更明顯,且在降低生活質(zhì)量指數(shù)(QOL)評分方面比對照藥物更優(yōu)[23]。方中四季紅清熱利濕、利尿通淋、解毒散瘀,為君藥;白茅根甘寒,清熱利尿、涼血止血,大風藤利水消腫、祛風止痛,連翹清熱涼血、活血解毒,三藥合用,俱為臣藥;三顆針清熱、利濕、散瘀,仙鶴草收斂止血、解毒、補虛,佐助君臣,共為佐藥;木芙蓉葉清熱、解毒、消腫,助諸藥以增效;全方清熱解毒、利濕通淋、養(yǎng)陰止血,且利濕而不傷陰、驅(qū)邪而不傷正。適用于濕熱下注型的CP和BPH患者[24-25]。
本研究篩選得到寧泌泰膠囊活性成分47個,靶點280個,CP疾病靶點2259個,BPH疾病靶點2341個,體現(xiàn)了寧泌泰治療CP和BPH具有多成分、多靶點的特點。從圖3可看出,寧泌泰組成的七味藥都具有較高節(jié)點度,活性成分中槲皮素、山奈酚、β谷甾醇、木犀草素的節(jié)點度最高,提示可能在治療CP和BPH上發(fā)揮了更大的作用。槲皮素與山奈酚同屬于天然黃酮類化合物,二者都具有良好的抗炎、抗氧化作用[26-27]。動物實驗表明,槲皮素可改善Ⅲ型慢性前列腺炎模型大鼠的前列腺病理和痛覺敏感性,并可降低大鼠血清中NFκB及TNF-α水平以及前列腺組織中的COX-2蛋白水平,說明槲皮素可能通過降低炎性因子表達,抑制炎癥反應來治療CP[28]。山奈酚能夠減弱促炎因子(如IL-6、IL-17A、TNF-α)的CD3+T細胞浸潤及基因表達[29-30]。BPH方面,臨床試驗表明,使用槲皮素干預后,BPH患者AUA癥狀評分明顯降低,并提升尿流率[31]。動物實驗中,山奈酚表現(xiàn)出類似雄激素的活性,抑制雙氫睪酮誘導的前列腺癌細胞(LNCaP)、人前列腺增生細胞(BPH-1)和人前列腺基質(zhì)永生化細胞(WPMY-1)的雄激素受體轉(zhuǎn)錄活性、前列腺特異抗原(PSA)和雄激素受體(AR)基因表達以及細胞增殖;持續(xù)降低BPH大鼠前列腺指數(shù),改善BPH大鼠的病理變化,使BPH大鼠血清中上調(diào)的T水平顯著降低[32]。β-谷甾醇屬植物甾醇,有降血脂、抗炎、抗腫瘤的作用。研究發(fā)現(xiàn)植物甾醇對維持男性前列腺健康的功能具有重要作用[33]。在一項治療BPH的多中心研究中,發(fā)現(xiàn)β-谷甾醇治療組的Boyarsky評分顯著下降,最大尿流率提升,殘余尿量減少[34]。
PPI網(wǎng)絡結(jié)果顯示,寧泌泰膠囊的活性成分主要通過 如 蛋 白 激 酶 相 關 受 體(AKT1、MAPK1、MAPK8、MAPK14)、炎癥相關受體(TNF、IL-6、IL-1B、ALB)、生長因子相關受體(SRC、EGFR、KDR)、性激素受體(AR、ESR1)、癌癥相關因子(TP53、FOS、CCND1)等核心靶點對于治療CP和BPH發(fā)揮作用。AKT1調(diào)節(jié)巨噬細胞,包括促進抗炎性細胞因子的產(chǎn)生、吞噬、自噬并維持內(nèi)穩(wěn)態(tài)[35]。AKT1的過表達和前列腺體積的增大具有一定關聯(lián)[36]。IL-6是主要的抗炎性細胞因子,能夠抑制促炎因子的產(chǎn)生,研究報道CP患者的免疫應答中,IL-6誘導T、B細胞分化和增殖[37]。持續(xù)、頑固性炎癥被認為在BPH發(fā)病和疾病進展中占主導地位,表現(xiàn)為多種細胞因子和生長因子的分泌,這些因子可促進前列腺細胞的生長[38]。IL-6等促炎癥因子是BPH發(fā)病的重要因素之一,其所導致的慢性炎癥反應對整個發(fā)病進程起到重要促進作用[39]。因此預測AKT1、IL-6是寧泌泰“異病同治”治療CP和BPH的核心靶點。
目前公認的BPH主要發(fā)病機制主要集中于α-腎上腺素能受體誘導的自主神經(jīng)過度活動和雄激素刺激前列腺組織細胞生長。AR可被雄激素激活,調(diào)控下游轉(zhuǎn)錄因子,從而引起前列腺的異常增殖;研究發(fā)現(xiàn),BPH的前列腺組織中ERα、AR的蛋白及mRNA表達相比正常前列腺組織顯著增高[40],調(diào)節(jié)雌/雄激素的比例可影響前列腺基質(zhì)細胞的增殖和凋亡。在PPI網(wǎng)絡中,炎癥相關因子TNF、IL-6、IL-1B等靶點具有較高度值,多項臨床研究發(fā)現(xiàn),應用寧泌泰治療后,CP患者的不適癥狀減輕,并伴隨前列腺液中TNF-α、IL-1β等指標顯著下降[41-42]。根據(jù)研究結(jié)果,推測寧泌泰可能通過調(diào)節(jié)AR、ESR1、TNF、IL-1B等靶點分別治療CP和BPH。
GO分析結(jié)果顯示,寧泌泰膠囊可能通過對類固醇反應、氧化應激、激酶活性、凋亡信號通路和信號受體的調(diào)節(jié)來發(fā)揮治療CP和BPH的作用。結(jié)合KEGG富集分析結(jié)果,PI3K-Akt信號通路可能是寧泌泰治療CP和BPH的共同作用通路。磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信號通路可調(diào)節(jié)細胞的增殖、分化、凋亡等多種過程,動物實驗表明,去勢聯(lián)合丙酸睪酮注射方法建立的BPH模型大鼠與正常大鼠相比,前列腺明顯增生,PI3K/Akt/mTOR信號通路顯著激活[43];另一項動物實驗發(fā)現(xiàn),阻斷PI3K/Akt信號通路可抑制前列腺的增生[44];在BPH患者前列腺組織中,PI3K和AKT的基因表達水平隨著前列腺體積的增加而增加[45]。PI3K/AKT信號通路還參與多種炎癥反應和炎性疼痛的發(fā)生[46-47],該通路激活后,其下游NF-κB信號通路活化,引起炎癥反應[48],在抑制PI3K/Akt信號通路及其上下游的釋放后,可減輕炎癥痛及神經(jīng)病理性疼痛[49]。
絲裂原活化蛋白激酶(MAPK)家族參與細胞的生長、分化、炎癥反應等多種細胞生理病理過程,其家族中眾多成員均與前列腺相關疾病有密切聯(lián)系,如MAPK1、MAPK3在炎癥反應中起著關鍵的作用[50]。使用MAPK抑制劑可減少促炎性細胞因子的合成及信號傳導,從而治療CP[51]。MAPK家族成員ERK1/2在BPH患者前列腺上皮和基質(zhì)組織中呈高表達[52]。寧泌泰膠囊可能通過PI3K/AKT信號通路、MAPK信號通路對CP和BPH起到治療作用??赡芡ㄟ^與抑制促炎細胞因子的合成、抑制信號轉(zhuǎn)導、調(diào)節(jié)前列腺組織細胞生長、調(diào)節(jié)雄激素水平等機制來實現(xiàn)。
本研究通過網(wǎng)絡藥理學方法,在“異病同治”理念的指導下,篩選寧泌泰膠囊的活性成分及作用靶點,預測寧泌泰膠囊“異病同治”治療CP和BPH的關鍵靶點與相關通路,體現(xiàn)了寧泌泰膠囊“多成分、多靶點、多途徑”的特點,研究結(jié)果與當前相關領域內(nèi)的研究成果基本一致,具有較高的參考價值,為寧泌泰膠囊“異病同治”治療CP和BPH提供思路借鑒,并為進一步實驗驗證其作用機制提供理論依據(jù)。