華炯鋼,葉偉成,倪 征,陳 柳,朱寅初,云 濤,張 存
(浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,浙江 杭州 310021)
鴨呼腸孤病毒(Duck reovirus,DRV)分為兩種基因型,即Ⅰ型和Ⅱ型[1-2]?;颌裥蜑榻?jīng)典鴨呼腸孤病毒(Classical DRV,CDRV),即番鴨呼腸孤病毒(Muscovey duck reovirus,MDRV),主要感染番鴨和半番鴨,引起鴨壞死性肝炎(俗稱番鴨“白點病”或“花肝病”),以肝脾等臟器組織出現(xiàn)大量粟狀壞死灶為病理特征,該基因型自1997 年以來在我國廣東、廣西、福建、浙江和江西等省流行[3]?;颌蛐蜑樾滦网喓裟c孤病毒(Novel DRV,NDRV),可引起番鴨、半番鴨、北京鴨和鵝等發(fā)病,特征性病變?yōu)楦纹⒊霈F(xiàn)嚴重壞死和出血(俗稱“出血性壞死性肝炎”),NDRV 最早發(fā)現(xiàn)于2000年,此后開始在我國江蘇、浙江、福建、廣東、河北、山東等省暴發(fā)與流行[2,4-5]。目前,NDRV 已成為我國流行的優(yōu)勢基因型[1-2,6]。
NDRV 基因組由10 個節(jié)段的雙鏈RNA 構(gòu)成,全長23 419 bp。病毒粒子由二十面體對稱的雙層衣殼組成,直徑70 nm,無囊膜。根據(jù)SDS-PAGE 電泳結(jié)果,將NDRV 基因組分為3 個群,分別是:L 組群(L1、L2、L3)、M 組群(M1、M2、M3)和S 組群(S1、S2、S3、S4)[2-3,5-6]。其中S3 節(jié)段編碼的σB 是NDRV 衣殼的主要組分和外衣殼蛋白,其功能與哺乳動物呼腸孤病毒(Mammalian reovirus,MRV)的σ3蛋白、雞呼腸孤病毒(Avian reovirus,ARV)及CDRV的σB 蛋白類似,均能夠誘導(dǎo)宿主機體產(chǎn)生群特異性中和抗體[7-8]。ARV 與CDRV 的σB 蛋白存在保守的群特 異 性 抗 原 表 位[9-10]。NDRV 與CDRV 為DRV 不 同 的基因型,且DRV 與ARV 均屬于禽正呼腸孤病毒(Avian orthoreovirus,ARVs)成員;NDRV σB 蛋白與ARV及CDRV σB 蛋白的氨基酸序列同源性約為60%和70%[2-3,6]。目前NDRV σB 蛋白的抗原表位及其是否存在群特異性抗原表位尚不清楚。因此,本實驗利用原核表達的NDRV σB 蛋白作為免疫原,通過免疫小鼠篩選并制備了該蛋白的單克隆抗體(MAb),并對其識別的抗原表位進行鑒定,為進一步建立NDRV 特異性檢測方法及研發(fā)表位標記疫苗奠定基礎(chǔ)。
1.1 細胞、病毒株及實驗動物骨髓瘤細胞(SP2/0)、雞胚成纖維細胞(DF-1)、ARV S1133株均由浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所禽病研究室保存;NDRV ZJ00M 株和CDRV ZJ2000M 株由浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所禽病研究室分離鑒定與保存[2,6];大腸桿菌DH5α 和BL21(DE3)感受態(tài)細胞購自北京全式金生物技術(shù)有限公司;pET-28a-SUMO 載體由浙江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所禽病研究室構(gòu)建、保存。6 周齡~8 周齡BALB/c 小鼠購自上海斯萊克實驗動物有限責(zé)任公司。
1.2 主要試劑HRP標記的山羊抗鼠IgG(IgG-HRP)、弗氏完全佐劑、弗氏不完全佐劑、PEG4000、次黃嘌呤-氨甲蝶呤-胸腺嘧啶核苷(HAT)、次黃嘌呤-胸腺嘧啶核苷(HT)均購自Sigma 公司;MAb 亞類鑒定試劑盒購自賽默飛公司;ECL 化學(xué)發(fā)光檢測試劑盒購自Thermo Fisher Scientific 公司;Ni-NTA kit 購自Novagen 公司。
1.3 重組質(zhì)粒pET-28a-SUMO-σB 的構(gòu)建、蛋白表達及純化利用Oligo6.0 軟件,以NDRV ZJ00M 株S3 節(jié)段全序列(KF154118)編碼的σB 基因ORF 為靶區(qū)域設(shè)計引物:SigB-F: 5'-CGCGGATCCATGGAGGT GCGTGTGCCAAAC-3'(BamH I)/SigB-R:5'-GCACTC GAGTTACCACCTACACTCCAGGAAG-3'(XhoI),擴增片段大小為1 104 bp,引物由Invitrogen 公司合成。提取NDRV ZJ00M 株RNA 并作為模板,采用上述引物經(jīng)RT-PCR 擴增σB 基因片段,用BamH I/XhoI 分別雙酶切目的片段σB 和載體pET-28-SUMO,經(jīng)T4 DNA 連接酶連接,構(gòu)建重組質(zhì)粒pET-28-SUMOσB,并經(jīng)BamH I 和XhoI 雙酶切及測序鑒定。將鑒定正確的重組質(zhì)粒pET-28-SUMO-σB 轉(zhuǎn)化宿主菌BL21,經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)表達,離心,超聲破碎,分離上清液和沉淀。通過SDS-PAGE 檢測表達情況。利用Ni-NTA 試劑盒對重組σ 蛋白(rσB)純化后通過SDSPAGE檢測其純度,并利用核酸蛋白儀測定rσB濃度。
1.4 小鼠的免疫選取6 周齡~8 周齡的BALB/c 小鼠,將純化的rσB 與弗氏完全佐劑等體積混合乳化后,采用頸背部皮下多點注射免疫(100 μg/只)。間隔2 周免疫一次,共免疫3 次。第二次和第三次免疫時用rσB 與等體積弗氏不完全佐劑乳化。三免7 d 后尾部采血,分離血清,2 倍倍比稀釋,利用純化的rσB 作為包被抗原,通過間接ELISA 方法[11]檢測血清抗體效價,選擇血清效價最高的小鼠,于融合前3 d再用rσB(100 μg/只)加強免疫,利用PEG4000 將小鼠脾細胞與SP2/0 細胞按常規(guī)方法融合[12]。
1.5 細胞融合及MAb 的制備細胞融合7 d 后,取雜交瘤細胞培養(yǎng)上清液經(jīng)1.4 中的間接ELISA 方法檢測以篩選陽性雜交瘤細胞,以1.4 中獲得的NDRV rσB 的小鼠陽性血清為陽性對照,以未融合的SP2/0細胞上清液為陰性對照。采用有限稀釋法對檢測的陽性雜交瘤細胞進行3 次克隆純化,直至篩選結(jié)果100%為陽性。對篩選出能夠穩(wěn)定分泌MAb 的雜交瘤細胞按常規(guī)方法制備腹水[12],采用親和層析方法純化腹水MAb,通過上述間接ELISA 方法檢測雜交瘤上清液和純化的腹水MAb 效價。
1.6 MAb 亞類鑒定利用MAb 亞類鑒定試劑盒鑒定MAb 的亞類。
1.7 MAb 反應(yīng)原性的western blot 鑒定將NDRV ZJ00M 株以MOI 0.01 感染DF-1 細胞,以不感染病毒的DF-1 細胞作為空白對照。72 h 后收獲DF-1細胞,煮沸裂解后離心,取上清液,以制備的MAb(1∶5 000)為一抗,羊抗鼠IgG-HRP(1∶5 000)為二抗,通過western blot 檢測MAb 與天然表達的σB 蛋白的反應(yīng)性。
1.8 MAb 交叉反應(yīng)性的間接免疫熒光試驗(IFA)分別將NDRV ZJ00M 株、CDRV ZJ2000M 株和ARV S1133株均以MOI 0.01感染DF-1細胞,培養(yǎng)48 h后固定細胞,分別以制備的MAb(1∶2 000),1.4 中獲得的小鼠rσB 陽性血清(1∶100)和未免疫小鼠血清(1∶100)作為一抗,羊抗鼠IgG-FITC(1∶1 000)為二抗,經(jīng)IFA鑒定本研究制備的MAb 對CDRV、ARV 是否有交叉反應(yīng)性。
1.9 MAb 抗原表位的肽掃描法鑒定將σB 蛋白截短成長度為15 個氨基酸、相互重疊5 個氨基酸的多肽,由南京金斯瑞生物科技有限公司合成,共37 條(表1),將多肽用DMSO 溶解后,分別以1 μg/孔包被ELISA板,以制備的各MAb(1∶5 000)為一抗,羊抗鼠IgG-HRP(1∶5 000)為二抗,經(jīng)ELISA篩選各MAb的抗原表位,以1.4中制備的rσB高免小鼠血清為一抗作為陽性對照,以未免疫小鼠血清為一抗作為陰性對照。
將37 條σB 蛋白多肽中與各MAb ELISA 檢測呈強陽性的多肽繼續(xù)以2 個氨基酸為步移,從N 端和C 端再分別逐步截短并合成,共合成8 條多肽(表1)。將這8 條多肽分別包被ELISA 板,采用上述ELISA 方法繼續(xù)篩選各MAb 的抗原表位。
表1 根據(jù)σB蛋白氨基酸序列合成的重疊多肽序列Table 1 Overlapping peptides synthesized according to the amino acid sequence of σB protein
1.10 抗原表位的保守性分析從GenBank 選取不同年代、不同地域且具有代表性的NDRV 與CDRV 分離株,以及鵝呼腸孤病毒(GRV)、新型鵝呼腸孤病毒(Novel GRV,NGRV)、ARV 和火雞呼腸孤病毒(Turkey reovirus,TARV)等ARVs 成員的代表性病毒,對各病毒中的σB 蛋白氨基酸序列進行比對分析,以確定抗原表位的保守性。
2.1σB 蛋白的原核表達、鑒定及純化結(jié)果重組質(zhì)粒pET-SUMO-σB 經(jīng)BamH I 和XhoI 雙酶切鑒定及測序鑒定結(jié)果顯示,σB 基因正確插入pET-28a-SUMO 載體中。將鑒定正確的重組質(zhì)粒pET-SUMO-σB轉(zhuǎn)化BL21(DE3)中,經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)表達后經(jīng)SDSPAGE 檢測結(jié)果顯示,重組蛋白主要以包涵體的形式表達,分子量約為55 ku,與預(yù)期大小相符;經(jīng)Ni-NTA His 柱純化后獲得了單一目的條帶(圖1)。表明,rσB 獲得了表達,且純化效果較好。經(jīng)計算該蛋白純度約為85%,經(jīng)核酸蛋白儀測定該蛋白濃度為1 mg/mL。
圖1 rσB表達與純化的SDS-PAGE檢測結(jié)果Fig.1 Detection results of expression and purification of recombinant σB protein by SDS-PAGE
2.2 McAbs 亞類鑒定及腹水效價的測定結(jié)果將小鼠脾細胞與SP2/0 細胞融合后,經(jīng)間接ELISA 方法篩選,對篩選獲得的陽性雜交瘤細胞株經(jīng)過3 次克隆純化,最終獲得3 株穩(wěn)定分泌NDRV σB 蛋白MAb的雜交瘤細胞株,其分泌的MAb 分別命名為10-A5、A1-G9 和B7-E5。間接ELISA 檢測結(jié)果顯示,3株雜交瘤細胞上清液中的抗體效價均為1∶1 280,腹水中的MAb 經(jīng)純化后效價均為1∶240 000??贵w亞類鑒定結(jié)果顯示,3 株MAb 均為IgG1,分泌的抗體輕鏈均為κ。
2.3 MAb 反應(yīng)原性的western blot 鑒定結(jié)果將NDRV 感染DF-1 細胞72 h 后收獲細胞,通過western blot 鑒定上述3 株MAb 的反應(yīng)原性。結(jié)果顯示,3 個MAb 均在41 ku 處出現(xiàn)特異性條帶,而陰性對照DF-1 細胞無該條帶(圖2)。制備的10-A5、A1-G9 和B7-E5 均能夠與NDRV 感染DF-1 細胞的σB 蛋白發(fā)生反應(yīng),表明3 株MAb 均能夠識別NDRV 天然表達的σB 蛋白,反應(yīng)原性較強。
圖2 MAb反應(yīng)原性的western blot 鑒定Fig.2 Identification of MAbs reactivity by western blot
2.4 MAb 交叉反應(yīng)性的IFA 鑒定結(jié)果分別將NDRV、CDRV 和ARV 感染DF-1 細胞,并設(shè)相應(yīng)的對照,經(jīng)IFA鑒定MAb的交叉反應(yīng)性。結(jié)果顯示:分別以3 株MAb 及小鼠陽性血清為一抗時,感染NDRV的DF-1 細胞均出現(xiàn)了亮綠色熒光;而感染CDRV 和ARV的DF-1細胞均無綠色熒光;而以小鼠陰性血清為一抗時,所有病毒感染的細胞均無綠色熒光(圖3)。表明這3 株MAb 的特異性較強,與其他相關(guān)病毒均無交叉反應(yīng)性。
圖3 MAb與NDRV、CDRV和ARV交叉反應(yīng)性的IFA鑒定結(jié)果(200×)Fig.3 Identification of cross-reactivity of MAbs with NDRV,CDRV,and ARV by IFA
2.5 MAb 抗原表位的鑒定結(jié)果將人工合成的37條多肽分別包被ELISA 板后,再分別以3株MAb為一抗,經(jīng)間接ELISA 鑒定其識別的抗原表位。結(jié)果顯示,3株MAb 10-A5、A1-G9和B7-E5 及小鼠σB蛋白陽性血清均與SigB-4多肽呈陽性反應(yīng),而與其余的多肽及小鼠陰性血清均呈陰性反應(yīng)(圖4A)。SigB-4多肽的氨基酸序列31LWDIEEFHTPDVIRV45即為MAb的抗原表位。將呈陽性反應(yīng)的SigB-4 多肽從N 端和C 端分別以2 個氨基酸為步移截短合成的8 條短多肽包被ELISA 板,再 分 別 以10-A5、A1-G9 和B7-E5 為 一抗,進一步經(jīng)ELISA 鑒定其識別的抗原表位。結(jié)果顯示,將SigB-4 多肽從N 端截短2 個氨基酸和從C 端截短2 個氨基酸后的短多肽(分別對應(yīng)SigB-4-1 和SigB-4-5)均與10-A5、A1-G9 和B7-E5 3 呈強陽性反應(yīng)。陽性對照與陰性對照與上述結(jié)果一致(圖4B)。表明,上述3 株MAb 識別的最小抗原表位的氨基酸序列均為33DIEEFHTPDVI43。
圖4 各肽段(A)及SigB-4各截短肽段(B)經(jīng)ELISA掃描鑒定MAb識別的抗原表位Fig.4 Epitopes recognized by MAbs were identified by ELISA scaning of overlapping peptides(A)and sigB-4 truncated peptides(B)
2.6 抗原表位的保守性分析參照NCBI 數(shù)據(jù)庫中相關(guān)序列,利用BLAST 對已鑒定的線化抗原表位aa31~aa45 的保守性分析結(jié)果顯示,該抗原表位序列與不同地域和不同宿主來源的NDRV 和NGRV 分離株σB 蛋白對應(yīng)氨基酸序列的同源性均為100%;而與ARVs 其他成員CDRV、GRV、ARV 和TARV 不同分離株的相對應(yīng)蛋白氨基酸序列的同源性為53.3%~73.3%(表2,但數(shù)值未在該表中展示)。結(jié)果表明該抗原表位(aa33~aa43)在不同地域及不同來源的NDRV分離株中保守性很高,而在ARVs其他成員CDRV、GRV、ARV和TARV 中差異較大。
表2 3株MAb抗原表位保守性分析Table 2 Conservation analysis of antigenic epitopes of three MAbs
σB 是ARV 和DRV 主要的外衣殼蛋白,能夠誘導(dǎo)機體產(chǎn)生群特異性中和抗體[8-9]。對σB 蛋白抗原表位的精確定位為解析σB 介導(dǎo)的免疫保護機制,研發(fā)多肽表位疫苗及建立特異性檢測方法具有重要意義。MAb 是由單一B 細胞克隆產(chǎn)生的免疫球蛋白,具有特異性強、敏感性高、均質(zhì)性好、效價高等優(yōu)點,已成為研究抗原的結(jié)構(gòu)與功能、開發(fā)診斷試劑和抗原表位多肽疫苗的強有力工具[13-14]。由于NDRV 是水禽DRV新發(fā)的基因型,其σB 的MAb 及MAb 的抗原表位未被解析。為此,本研究制備了3 株鼠源抗NDRV σB蛋白的MAb(10-A5、A1-G9 和B7-E5),并對3 株MAb 的抗原表位進行了鑒定。
抗原表位又稱抗原決定簇,是引起宿主免疫應(yīng)答的物質(zhì)基礎(chǔ)。可分為T 細胞抗原表位和B 細胞抗原表位。B 細胞表位是由抗原表面的親水性氨基酸組成,易接近B 細胞受體和抗體分子并被識別,能夠誘導(dǎo)宿主產(chǎn)生體液免疫反應(yīng)。為了探究NDRV σB 蛋白的B 細胞抗原表位,本研究利用B 細胞雜交瘤技術(shù)制備并獲得了3 株NDRV σB 蛋白的MAb,且鑒定了各MAb 的抗原表位。常用的抗原B 細胞表位鑒定方法主要有噬菌體展示肽技術(shù)、肽掃描技術(shù)以及生物信息學(xué)方法預(yù)測技術(shù)等[15]。本研究根據(jù)NDRV σB蛋白序列合成37 條長度為15 個氨基酸、且相互重疊5 個氨基酸的多肽,利用肽掃描技術(shù)結(jié)合ELISA 方法,篩選各MAb 的抗原表位。該方法相較于噬菌體展示肽技術(shù)更簡便、快速,但其缺點是僅能鑒定出線性抗原表位[16]。
研究發(fā)現(xiàn),ARV、CDRV 和TARV σB 蛋白的保守氨基酸序列主要位于N 端(aa1~aa113)[10,17]。對于ARV σB 蛋白,已鑒定出兩個抗原表位:21KTPACW26和32WDTVTFH38,位于σB 蛋白N 端aa21~aa38,且這兩個抗原表位為ARV 特異性B 細胞線性表位[10];而對于CDRV σB 蛋白,也已鑒定出兩個抗原表位,即抗原表位A(65TDGVCFPHHK74)和表位B(19YIRAPACWD27),位 于σB 蛋 白N 端aa19~aa74,且 表 位B 是ARV 和CDRV 的群特異性表位,表位A 是CDRV 的特異性表位[17]。本研究鑒定出的NDRV σB 蛋白的最小抗原表位(33DIEEFHTPDVI43)也位于其N 端,但位點不同。對3 株MAb 識別抗原表位的保守性分析表明,該表位在不同基因型DRV(即CDRV 與NDRV)之間的保守性比較低(同源性小于54.5%),僅為NDRV的特異性表位。這一結(jié)果與不同基因型DRV 之間僅能與各自基因型的血清高度中和,而與異源血清僅有弱的交叉中和作用的結(jié)論一致[18]。因此,本研究制備的3 株MAb(10-A5、A1-G9 和B7-E5)均可作為鑒別檢測NDRV 和CDRV 感染的候選抗體。
NDRV 是目前中國流行鴨呼腸孤病毒病的主要基因型,至今還未有NDRV B 細胞抗原表位的相關(guān)報道,本研究首次通過制備針對NDRV σB 蛋白的MAb 對其抗原表位進行了鑒定,為NDRV 的型特異性檢測方法及其表位標記疫苗的研究奠定了基礎(chǔ)。