王苗利,薛瑞雪,張 月,藺曉月,李玉杰,邢林林,孔祥華,王貴升
(山東省動物疫病預防與控制中心,山東 濟南 250100)
流感病毒(Influenza virus)屬于正粘病毒科流感病毒屬,病毒結構由內而外分為核芯、基質蛋白和囊膜三個部分,基因組包含8個分節(jié)段的單股負鏈RNA(ss-RNA)。流感病毒的基因組RNA(vRNA)與核蛋白(NP)結合,并與RNA聚合酶復合體纏繞成致密的核糖核蛋白復合體(RNPs),以異源三聚復合體的形式存在于感染宿主的細胞核內,主要參與病毒RNA的合成。流感病毒感染的宿主范圍十分廣泛,包括人和其他哺乳動物、禽類、鳥類等。
不均一性核糖核蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)是細胞核內的一類RNA結合蛋白,包括約30個高豐度表達的成員,這類蛋白可與新合成的不均一性RNAs(hnRNAs/pre-mRNAs)的內含子區(qū)域結合來協(xié)助完成內含子的剪切,并在mRNA從細胞核轉運至細胞質的過程中結合mRNA來穩(wěn)定mRNA結構。
本研究前期發(fā)現(xiàn)hnRNP H2蛋白能夠抑制流感病毒復制,為進一步探究hnRNP H2是否會抑制流感病毒復制及相關機制,本研究采用雙熒光素酶活性試驗、免疫共沉淀試驗等方法進行相關研究分析。
表1 引物序列
1.1 病毒株、細胞及質粒毒株A/WSN/1933(H1N1)、293T細胞系、犬腎上皮細胞系MDCK由本試驗室保存;含有流感病毒聚合酶識別序列的螢火蟲熒光素酶報告基因質粒(LUC)和含有CMV啟動子序列的海腎螢光素酶報告基因質粒(RENILLA)由本實驗室構建;pCMV-N-Flag載體、pCAGGS載體購自Novagen公司。
1.2 主要試劑兔抗beta Actin、Flag、hnRNP H2多抗和鼠抗A型流感病毒NP、M1、M2、PB1、PB2、PA多抗均購自ThermoFisher公司;T7 RNA體外轉錄試劑盒均購自Invitrogen公司;RNA提取試劑盒和質粒提試劑盒購自QIAGEN公司;RIPA裂解液(弱)和SDS-PAGE凝膠配置試劑盒均購自碧云天生物技術公司;ECL發(fā)光液和Dual Luciferase Reporter Gene Assay Kit雙熒光素酶報告基因檢測試劑盒均購自翊圣生物公司。
1.3 引物設計根據GenBank中登錄的hnRNP H2序列及流感病毒參考株的NP、PB1、PB2和PA序列,分別設計擴增引物。
1.4 利用雙熒光素酶報告基因試驗檢測hnRNP H2蛋白對流感病毒聚合酶的影響將LUC、RENILLA、pCAGGS-NP、pCAGGS-PB1、pCAGGS-PB2、pCAGGS-PA、pCMV-N-Flag-hnRNP H2(對 照 組pCMV-N-Flag)質粒共轉染293T細胞,轉染后30h,用Dual-Luciferase Reporter Assay System試劑盒按照說明書裂解細胞,取部分裂解上清加入蛋白上樣緩沖液,95℃10 min變性處理后,用鼠抗NP、PB1、PB2、PA(1:1000)多抗和兔抗beta Actin、Flag(1:1000)多抗為一抗,HRP標記的羊抗兔IgG(1:10000)、HRP標記的羊抗鼠IgG(1:10000)為二抗,利 用western blot檢 測NP、PB1、PB2、PA、hnRNP H2和beta Actin蛋白的表達水平。另取部分裂解上清于96孔板中,利用發(fā)光檢測儀檢測轉染pCMV-N-Flag-hnRNP H2以及pCMV-N-Flag空載體樣品的聚合酶活性。
1.5 利用免疫共沉淀試驗檢測hnRNP H2與流感病毒RNA相互作用分別將pCMV-N-Flag-hnRNP H2質粒和pCMV-N-Flag質粒轉染293T細胞,24h后接種MOI 0.1 A/WSN/1933,感染后30 h,棄去上清,用RIPA裂解液(弱)4℃條件下裂解10~20 min,收集細胞裂解液,離心獲得上清,上清液中加入Anti-DDDDK-tag mAb-Magnetic Agarosse磁珠,4℃搖床過夜。預冷的RIPA洗滌4次,離心棄上清。將磁珠分為兩部分:一部分用兔抗hnRNP H2(1:1000)多抗為一抗,HRP標記的羊抗兔IgG(1:10000)為二抗,利用western blot檢測hnRNP H2蛋白的表達水平;另一部分提取RNA,RNA提取后分為兩部分,一部分用Oligo(dT)引物進行反轉錄,用WSN-PA-F1/R1引物檢測病毒mRNA水平,另一部分Uni 12引物進行反轉錄,用WSN-PA-F/R引物檢測病毒vRNA水平。
2.1 hnRNP H2蛋白抑制流感病毒聚合酶活性Western blot結果顯示,轉染的質粒均可檢測到PB1、PB2、PA、NP和Flag-hnRNP H2蛋白(圖1A)。在此基礎上,過表達hnRNP H2蛋白后,流感病毒聚合酶活性顯著下降(圖1B)。表明hnRNP H2蛋白能夠在流感病毒轉錄復制階段發(fā)揮抑制作用。
圖1 hnRNP H2蛋白過表達對流感病毒聚合酶的影響
2.2 hnRNP H2蛋白能夠與流感病毒RNA發(fā)生相互作用在293T細胞上分別轉染pCMV-N-Flag-hnRNP H2質粒和pCMV-N-Flag質粒,轉染后12h,將A/WSN/1933以MOI 0.1感染細胞,細胞感染后24h,利用Anti-DDDDK-tag mAb-Magnetic Agarosse磁珠進行CO-IP,結果顯示,hnRNP H2蛋白共沉淀下來的流感病毒vRNA和mRNA均明顯多于對照組(圖2),說明hnRNP H2蛋白能夠與流感病毒RNA發(fā)生相互作用。
圖2 免疫共沉淀驗證hnRNP H2蛋白與RNA相互作用
流感病毒在復制過程中,有大量的宿主蛋白參與其中,研究宿主蛋白與流感病毒之間的相互作用,能夠深入闡明流感病毒的復制及致病機制,為抗流感藥物的研發(fā)提供潛在靶標。流感病毒在細胞核內完成復制,核內一些蛋白蛋白會參與流感病毒復制,已有研究表明核內蛋白hnRNP K能夠與流感病毒NS1蛋白相互作用而參與流感病毒復制過程;Ecco等研究發(fā)現(xiàn)核蛋白ANP32能夠增強流感病毒聚合酶活性促進流感病毒復制;Chang等發(fā)現(xiàn)核內蛋白hnRNP A2/B1能夠與流感病毒NP蛋白相互作用影響病毒復制。
本研究在細胞內過表達hnRNP H2蛋白后影響了流感病毒的復制,通過熒光素酶活性試驗發(fā)現(xiàn),hnRNP H2蛋白能夠抑制流感病毒聚合酶的活性。hnRNP H2蛋白是一種RNA結合蛋白,在細胞內hnRNP H2蛋白與流感病毒核酸相互作用研究中發(fā)現(xiàn),hnRNP H2蛋白能夠與流感病毒RNA發(fā)生相互作用。這說明hnRNP H2蛋白可能通過與流感病毒的RNA結合而阻止核酸出核來發(fā)揮抑制流感病毒的作用,這將為抗流感病毒藥物研發(fā)提供思路。