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      實時熒光定量PCR特異性監(jiān)測曲線的表述方式探析

      2022-05-30 23:20:16陳燕
      新聞研究導(dǎo)刊 2022年10期
      關(guān)鍵詞:實時熒光定量PCR

      摘要:實時熒光定量PCR技術(shù)已廣泛應(yīng)用于醫(yī)療、制藥、農(nóng)業(yè)、食品安全等多個領(lǐng)域,各科技期刊涌現(xiàn)相關(guān)研究報道,但對該技術(shù)生成的特異性監(jiān)測曲線表述方式存在分歧。文章對該曲線的表述方式進(jìn)行統(tǒng)計分析,并結(jié)合英文翻譯,借助各類詞典、高等教育教科書及全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會的術(shù)語在線進(jìn)行探析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),該曲線在中文科技期刊中主要有兩種表述方式,分別為“熔解曲線”“溶解曲線”,且大多數(shù)期刊均使用過這兩種表述方式,經(jīng)分析推測“熔解曲線”為規(guī)范表述,由于“熔”和“溶”的拼音均為róng,字形相似,詞意相近,且作者和編輯對專業(yè)術(shù)語缺乏關(guān)注等,很多期刊將其誤寫成“溶解曲線”,對此提出相應(yīng)建議,為規(guī)范專業(yè)術(shù)語表達(dá)提供參考。

      關(guān)鍵詞:監(jiān)測曲線;熔解曲線;溶解曲線;實時熒光定量PCR;規(guī)范表述

      中圖分類號:Q503 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1674-8883(2022)10-0219-03

      基金項目:本論文為廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院基本科研業(yè)務(wù)專項“農(nóng)業(yè)科技期刊研究”成果,項目編號:桂農(nóng)科2021YT082

      近年來,隨著各學(xué)科的交叉滲透日益深入,分子生物學(xué)研究已成為前沿和熱點,在醫(yī)療、制藥、農(nóng)業(yè)、食品等多個領(lǐng)域占據(jù)非常重要的地位。人類利用分子生物學(xué)技術(shù)逐步突破了長期以來無法解決的科研瓶頸,取得了舉世矚目的科研成果。由于科技期刊是現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)的重要傳播途徑,所以各科技期刊涌現(xiàn)了大量新的科技術(shù)語。規(guī)范的專業(yè)用詞不僅是作者傳播自己科研成果和學(xué)術(shù)見解的重要體現(xiàn),也是避免概念錯誤和消除誤解的基本保證。目前全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會已按學(xué)科審定公布了大量規(guī)范科技術(shù)語,并得到了廣泛運(yùn)用。

      雖然我國高度重視科技名詞規(guī)范化工作,但目前規(guī)范化的科技術(shù)語使用情況不容樂觀。2012年以來,分子生物學(xué)方向的稿件逐年增加,至2021年,有25%左右的稿件屬于分子生物學(xué)研究領(lǐng)域,其中約30%稿件均使用實時熒光定量PCR技術(shù)。該技術(shù)是在PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))的基礎(chǔ)上發(fā)展而來的核酸定量技術(shù),現(xiàn)在已經(jīng)應(yīng)用到醫(yī)學(xué)、農(nóng)牧、生物相關(guān)分子生物學(xué)定量研究中[1],主要通過實時熒光定量PCR儀內(nèi)部熱循系統(tǒng)的升降溫變化,使DNA(脫氧核糖核酸)雙鏈結(jié)構(gòu)降解成單鏈,進(jìn)行復(fù)制擴(kuò)增,儀器中的光學(xué)系統(tǒng)采集伴隨DNA擴(kuò)增產(chǎn)生的熒光信號,并對熒光信號進(jìn)行分析轉(zhuǎn)化、數(shù)學(xué)運(yùn)算后,得到兩條曲線[2],其中一條為擴(kuò)增曲線,而另外一條曲線目前在中文科技期刊中有兩種中文表述方式,分別為“熔解曲線”和“溶解曲線”,但該曲線在國外SCI(科學(xué)引文索引)收錄期刊中的英文翻譯較統(tǒng)一,均為melting curve,該曲線可以反映PCR擴(kuò)增過程中隨著溫度升高DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的降解程度[1-2],可以用來判斷擴(kuò)增反應(yīng)的特異性。因此,文章對這兩個詞語的使用情況進(jìn)行分析,并借助各類詞典、高等教育教科書、百度搜索引擎,從英文翻譯、基本詞義、使用頻率出發(fā),依據(jù)全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會的術(shù)語在線搜索平臺(https://www.termonline.cn/index)對其進(jìn)行探析,為規(guī)范專業(yè)術(shù)語的表達(dá)提供參考。

      一、“熔解曲線”“溶解曲線”使用情況分析

      分子生物學(xué)試驗中,為了監(jiān)測實時熒光定量PCR結(jié)果的特異性,通過逐漸增加溫度監(jiān)測每一步的熒光信號從而產(chǎn)生一條曲線,通過該曲線可以判斷產(chǎn)物中是否存在非特異性產(chǎn)物或引物二聚體,如果曲線上僅在目標(biāo)核酸序列的熔解溫度有一特征峰,說明擴(kuò)增產(chǎn)物特異性好;出現(xiàn)雜峰則說明存在非特異性擴(kuò)增,特異性差,因此分子生物學(xué)論文中常出現(xiàn)該曲線的相關(guān)表述,以凸顯研究內(nèi)容的準(zhǔn)確性[2]。筆者分別以“熔解曲線”“溶解曲線”為搜索詞,對中國知網(wǎng)公布的文獻(xiàn)進(jìn)行全文搜索,并對其中部分文章進(jìn)行全文下載及深入分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)該曲線在各中文科技期刊中的表述方式不一致,甚至同一本期刊里的表述方式也不統(tǒng)一,主要為“熔解曲線”“溶解曲線”,且大多數(shù)期刊均使用過這兩種表述方式。在這條曲線分析的基礎(chǔ)上建立的高分辨熔解曲線分析技術(shù),在部分期刊也被表述為“高分辨溶解曲線分析技術(shù)”。

      以《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)》和《南方農(nóng)業(yè)學(xué)報》為例,對這兩種農(nóng)業(yè)綜合性中文核心期刊中“熔解曲線”“溶解曲線”的使用情況(2012—2021)進(jìn)行統(tǒng)計分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),在《中文核心期刊要目總覽(2020年版)》[3]農(nóng)業(yè)綜合性中文核心期刊中排名第1的《中國農(nóng)業(yè)科學(xué)》中使用“熔解曲線”的文章篇數(shù)較多,為136篇,占總篇數(shù)的61.8%,但有84篇使用“溶解曲線”;《南方農(nóng)業(yè)學(xué)報》在《中文核心期刊要目總覽(2020年版)》農(nóng)業(yè)綜合性中文核心期刊中排名第8,使用“熔解曲線”的文章篇數(shù)(26篇)稍多于使用“溶解曲線”的文章篇數(shù)(24篇)。隨著近年分子生物學(xué)稿件逐漸增多,《南方農(nóng)業(yè)學(xué)報》開始關(guān)注這個問題,“熔”和“溶”的拼音均為róng,且字形相似,詞意相近,初步推測“溶解曲線”和“熔解曲線”,其中之一應(yīng)該為錯誤表述。

      二、熔解和溶解的基本詞義

      (一)熔解

      根據(jù)《新編漢語詞典》[4]和術(shù)語在線的《物理學(xué)名詞》,熔解指固體(晶體)加熱到一定溫度(熔點)后從固相轉(zhuǎn)變?yōu)橐合嗟倪^程,屬于物理變化。根據(jù)《英漢雙解詞典》[5]及術(shù)語在線的《物理學(xué)名詞》和《生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞》,熔解的英文翻譯為fuse或melting,其中fuse為《物理學(xué)名詞》中熔解的英文翻譯,而melting為《生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞》中熔解的英文翻譯。從物質(zhì)數(shù)量來看,熔解沒有物質(zhì)數(shù)量限制。從物質(zhì)轉(zhuǎn)化形態(tài)來看,熔解通常是由固態(tài)到液態(tài)。從溫度來看,熔解過程要吸收熱量,故需要進(jìn)行加熱,且熔解過程吸收熱量的多少只能影響熔解的快慢,而不能影響熔解溫度的高低。當(dāng)固體(晶體)要加熱到一定溫度才能熔解,該溫度稱為“熔點(melting point)”。綜上所述,熔解在《生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞》中已被認(rèn)定為分子生物學(xué)相關(guān)研究領(lǐng)域的專業(yè)術(shù)語,且其英文翻譯與國外SCI收錄期刊一致。

      (二)溶解

      根據(jù)《新編漢語詞典》[4]和《物理學(xué)名詞》,溶解是指兩種或兩種以上物質(zhì)混合成為一個分子狀態(tài)的均勻相的過程。根據(jù)《英漢雙解詞典》[5]《物理學(xué)名詞》及《化工名詞(三)化學(xué)工程基礎(chǔ)》,溶解的英文翻譯為solvation、dissolution或solution?!渡锘瘜W(xué)與分子生物學(xué)名詞》中查不到該詞及其英文翻譯。從物質(zhì)數(shù)量來看,溶解有物質(zhì)數(shù)量限制。從物質(zhì)轉(zhuǎn)化形態(tài)來看,溶解是一種液體對固體、液體或氣體產(chǎn)生物理或化學(xué)反應(yīng)使其成為分子狀態(tài)的均勻相的過程。從溫度來看,溶解對溫度沒有明顯限定,因此也就沒有“溶點”的說法。溶解可能存在物理變化和化學(xué)變化,例如物質(zhì)溶解于水,通常經(jīng)過兩個過程:一種是溶質(zhì)分子(或離子)的擴(kuò)散過程,這種過程為物理過程,需要吸收熱量;另一種是溶質(zhì)分子(或離子)和溶劑(水)分子作用,形成溶劑(水合)分子(或水合離子)的過程,這種過程是化學(xué)過程,放出熱量。

      三、熔解和溶解的使用

      DNA作為主要的遺傳物質(zhì),是由兩條多脫氧核苷酸鏈以極性相反、反向平行的方式圍繞一個共同的中心軸盤繞,通過堿基間的氫鍵形成的堿基配對構(gòu)成穩(wěn)定的雙螺旋結(jié)構(gòu)[6-7]。當(dāng)DNA分子的雙鏈結(jié)構(gòu)隨溫度升高而降解成單鏈,DNA雙鏈結(jié)構(gòu)降解一半的溫度定義為熔解溫度(melting temperature)[6-7]、熔點(melting temperature/point)[7]、變性溫度(denaturation temperature)[6-7],具有明顯的溫度限定,且DNA雙鏈結(jié)構(gòu)解鏈過程并不是兩種物質(zhì)以上混合成為一個分子狀態(tài)的均勻相的過程,沒有物質(zhì)數(shù)量的限定。因此,從這個角度推測“溶解曲線”表述不夠準(zhǔn)確。而且DNA的雙鏈結(jié)構(gòu)隨溫度升高而降解成單鏈,破壞的只是氫鍵,氫鍵屬于分子間作用力的一種,不是化學(xué)鍵,沒有新物質(zhì)的生成,屬于物理變化。因此,從這個角度推測“熔解曲線”表述更為準(zhǔn)確。

      近年生物學(xué)、醫(yī)學(xué)等高等教育教科書對相關(guān)知識點的表述比較統(tǒng)一,即DNA的雙鏈結(jié)構(gòu)是兩條核苷酸鏈由堿基對之間的氫鍵連接而成,當(dāng)DNA溶液被加熱后,氫鍵會發(fā)生斷裂,導(dǎo)致兩條核苷酸鏈逐漸彼此分離,該過程定義為熔解(melting)或變性(denaturation)[6-7]。且部分高等教育教科書[7]明確指出,“260nm紫外吸收值的增加與解鏈程度成一定比例關(guān)系,當(dāng)緩慢加熱DNA溶液,并在不同溫度測定其A260值,可得到‘S形DNA熔解曲線”。全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會公布的《生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞》也明確指出,“熔解(melting)是指核酸溶液在溫度升高時,因其配對堿基的氫鍵受到破壞,雙鏈DNA分子或RNA分子變性為單鏈”。綜上所述,推測“熔解曲線”為規(guī)范表述,但相關(guān)文稿中常把“熔”誤寫成“溶”。

      四、原因分析

      (一)詞義理解錯誤

      日常生活中更多人習(xí)慣上認(rèn)為,加熱至一定溫度(熔點)時,固體從固相轉(zhuǎn)變?yōu)橐合嗟倪^程被稱為熔化,如金屬熔化,較少表述成金屬熔解,即“熔解”一詞的使用較少。

      “熔”和“溶”的拼音均為róng,二者字形相似,意思相近,但人們在生活中經(jīng)常使用“溶解”,如糖溶解(或溶化)于水。

      很多作者誤認(rèn)為DNA就像糖溶解于水中一樣,因此撰寫文章時不假思索地錯誤表述為“溶解曲線”,并沒有真正了解DNA熔解的含義,也沒有認(rèn)真查閱求證。

      而且用百度引擎進(jìn)行搜索時,能搜索到“熔解曲線”和“溶解曲線”兩種表述方式,且公布的意思基本一致,進(jìn)一步誤導(dǎo)了作者。

      筆者在工作中發(fā)現(xiàn)很多作者投稿時文中使用“溶解曲線”,當(dāng)批注“溶”為錯別字,并要求作者認(rèn)真核實時,作者返回修改稿件中均將“溶”改為“熔”,且未提出任何異議,表明作者投稿時并不知道“溶解曲線”為不規(guī)范表述。

      此外,很多科技期刊編輯部中部分編輯無相關(guān)專業(yè)背景,無法從專業(yè)的角度理解該詞匯的準(zhǔn)確含義。

      綜上,導(dǎo)致“熔解曲線”誤寫成“溶解曲線”。

      (二)作者和編輯態(tài)度不認(rèn)真

      全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會公布的《生物化學(xué)與分子生物學(xué)名詞》(第二版)明確指出“熔解”為正確表述,但已刊發(fā)的文稿仍頻頻出現(xiàn)“熔解曲線”誤寫成“溶解曲線”的現(xiàn)象,間接說明很多作者和編輯對全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會公布的專業(yè)名詞缺乏關(guān)注或視而不見,缺乏嚴(yán)謹(jǐn)和求真務(wù)實的精神。

      首先,作者作為專業(yè)研究人員,準(zhǔn)確理解專業(yè)術(shù)語的含義,且時刻保持嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膽B(tài)度是開展科研工作最基本的素養(yǎng),錯別字滿天飛的文章很難得到公眾的認(rèn)可,其研究內(nèi)容的準(zhǔn)確性也會被質(zhì)疑。

      其次,科技期刊編輯作為科研文稿的主要把關(guān)者,不僅要對稿件中的標(biāo)點符號和文字表述進(jìn)行校正和潤色,還應(yīng)承擔(dān)規(guī)范化使用科技術(shù)語的職責(zé)。但很多編輯在編校稿件時對分子生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的專業(yè)術(shù)語并不了解,經(jīng)常錯誤地認(rèn)為作者對專業(yè)名詞的理解更透徹,會正確使用專業(yè)術(shù)語,且以作者文責(zé)自負(fù)為由推脫責(zé)任。對這兩個詞的使用應(yīng)引起各大期刊的高度重視,確保正確使用專業(yè)術(shù)語對有效傳播科技成果至關(guān)重要。

      五、結(jié)語

      導(dǎo)致出現(xiàn)科技術(shù)語不規(guī)范現(xiàn)象的原因很多,既有外界環(huán)境影響,也有作者和編輯自身的問題。全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員審定的科技術(shù)語是經(jīng)過仔細(xì)斟酌和審核的,準(zhǔn)確性極高,作者和編輯不應(yīng)該隨意更改。因此,作者和編輯是造成科技術(shù)語不規(guī)范使用的主要原因,間接說明編輯和作者對科技術(shù)語的掌握不全面。作者平時更專注試驗研究,對科技術(shù)語規(guī)范和論文寫作技巧缺乏關(guān)注,且思想上依賴編輯,認(rèn)為編輯更專業(yè),會做好后續(xù)論文編校工作,對編輯的修改沒有認(rèn)真琢磨,一味認(rèn)同。

      這對科技期刊編輯提出了更高的要求,不僅要對稿件中的文字和標(biāo)點符號進(jìn)行校正,還應(yīng)承擔(dān)語言文字特別是科技術(shù)語規(guī)范化表達(dá)的職責(zé)。

      針對目前學(xué)科交叉發(fā)展日益凸顯的形勢,編輯部應(yīng)確保編輯人員具備專業(yè)知識背景,這是勝任相關(guān)審稿和編校工作的基本保障。

      編輯除了要做好本職工作外,還要及時了解相關(guān)研究領(lǐng)域發(fā)展前沿和熱點,力求掌握科技名詞的正確含義,并重視科技術(shù)語的規(guī)范使用,遇到專業(yè)術(shù)語問題時及時在全國科學(xué)技術(shù)名詞審定委員會的術(shù)語在線搜索平臺進(jìn)行查詢。

      編輯和作者都要有嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)態(tài)度,編輯有義務(wù)提醒作者規(guī)范使用科技術(shù)語,對把握不準(zhǔn)的用詞要及時求證,嚴(yán)格把好編校質(zhì)量關(guān),對學(xué)術(shù)問題,要溯本求源,尋求規(guī)范化表述方式,不能無知妄改或視而不見。

      同時,國家也應(yīng)加大科技名詞使用的管理力度,以確保我國科技術(shù)語的規(guī)范和統(tǒng)一,同時不斷提高編輯、作者和讀者對科技術(shù)語規(guī)范化表述的重視程度,從而促進(jìn)學(xué)術(shù)成果的有效交流和傳播。

      參考文獻(xiàn):

      [1] 崔宏恩,張超,姚紹衛(wèi).一種基于熔解曲線的實時熒光定量PCR儀校準(zhǔn)方法[J].中國測試,2018,44(S1):22-28.

      [2] 紀(jì)冬,辛紹杰.實時熒光定量PCR的發(fā)展和數(shù)據(jù)分析[J].生物技術(shù)通訊,2014(4):541.

      [3] 陳建龍,張俊娥,蔡蓉華.中文核心期刊要目總覽(2020年版)[M].北京:北京大學(xué)出版社,2021:220.

      [4] 李廷安.新編漢語詞典[M].北京:開明出版社,2018:975.

      [5] 周全珍.英漢雙解詞典[M].成都:四川辭書出版社,2014:797-798.

      [6] 朱玉賢,李毅,鄭曉峰,等.現(xiàn)代分子生物學(xué)[M]. 4版.北京:高等教育出版社,2018:29-31.

      [7] 郭藹光.基礎(chǔ)生物化學(xué)[M].北京:高等教育出版社,2009:30-31.

      作者簡介 陳燕,碩士,編輯,研究方向:分子生物學(xué)文稿寫作規(guī)范。

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