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    基于相圖下的細(xì)胞折射率與厚度雙波長(zhǎng)解耦方法

    2022-05-24 01:28:46廖景榮冒菲菲王馨云王子琦徐媛媛薛雙雙孫玉娟王亞偉
    激光生物學(xué)報(bào) 2022年2期
    關(guān)鍵詞:實(shí)驗(yàn)檢測(cè)方法

    廖景榮,冒菲菲,王馨云,王子琦,徐媛媛*,薛雙雙,孫玉娟,王亞偉

    (江蘇大學(xué) a. 機(jī)械工程學(xué)院;b. 物電學(xué)院,鎮(zhèn)江 212013)

    細(xì)胞是生物的基本單位,其狀態(tài)關(guān)系著整個(gè)生命體的健康。而生物細(xì)胞的三維折射率分布中含有豐富的關(guān)于細(xì)胞的外表形態(tài)、內(nèi)部亞結(jié)構(gòu)和生化成分的信息[1]。因此,細(xì)胞折射率分布的精準(zhǔn)檢測(cè)對(duì)醫(yī)學(xué)診斷和生物學(xué)醫(yī)學(xué)研究具有十分重要的意義[2]。在醫(yī)學(xué)臨床診斷方面,光子晶體全內(nèi)反射(photonic crystal-total internal reflection,PC-TIR)生物傳感器利用細(xì)胞折射率作為唯一的對(duì)比參數(shù),實(shí)現(xiàn)了單個(gè)前列腺癌細(xì)胞的檢測(cè)[3];膀胱癌組織比正常膀胱組織的散射強(qiáng)度更強(qiáng),說(shuō)明其折射率的檢測(cè)可用于膀胱癌癥的臨床診斷[4];特別是癌癥早期檢測(cè)診斷時(shí)更加需要細(xì)胞相對(duì)折射率的精準(zhǔn)檢測(cè),才能從光譜數(shù)據(jù)中精確定量地獲得細(xì)胞的形態(tài)信息[5]。因此,細(xì)胞折射率的檢測(cè)方法可成為細(xì)胞疾病診斷的一種有效方法。在生物學(xué)醫(yī)學(xué)研究方面,神經(jīng)元放電時(shí),離子濃度的變化會(huì)引起細(xì)胞折射率的改變[6];人宮頸癌(Hela)細(xì)胞在細(xì)胞周期的不同階段,其折射率會(huì)發(fā)生相應(yīng)的改變[7]。此外,細(xì)胞折射率分布的檢測(cè)還可用于細(xì)胞免疫學(xué)、細(xì)胞化學(xué)、細(xì)胞分子生物學(xué)等幾乎醫(yī)學(xué)的各個(gè)學(xué)科方面[8]。

    血細(xì)胞無(wú)色透明的性質(zhì)使得普通顯微鏡很難對(duì)其結(jié)構(gòu)及內(nèi)部物質(zhì)進(jìn)行清晰的成像[9],從而出現(xiàn)了若干成像新技術(shù),如超分顯微、熒光顯微鏡、激光掃描共聚焦顯微、光學(xué)相干層析成像[10]、數(shù)字全息相位顯微和定量相位成像技術(shù)[11]等。在非光學(xué)領(lǐng)域有探針成像技術(shù),如掃描探針顯微鏡[12]、原子力顯微鏡[13]和掃描隧道顯微鏡[14]等。此外,使用X射線(xiàn)輻射成像技術(shù)也可對(duì)生物細(xì)胞進(jìn)行結(jié)構(gòu)重建[15]。由于上述若干技術(shù)尚不能對(duì)活性細(xì)胞進(jìn)行快速成像,因此,近十年來(lái)定量相位顯微技術(shù)在活性細(xì)胞快速顯微成像中脫穎而出,發(fā)展迅速。該技術(shù)融合了數(shù)字全息、光學(xué)顯微和現(xiàn)代數(shù)字圖像等技術(shù),與傳統(tǒng)檢測(cè)方式相比,具有無(wú)損傷、無(wú)侵入、無(wú)電離輻射、無(wú)需染色、可實(shí)時(shí)、可定量等優(yōu)點(diǎn),該方法已成為活性細(xì)胞顯微成像的一種主要技術(shù)。

    對(duì)于類(lèi)球形均質(zhì)細(xì)胞,其形態(tài)結(jié)構(gòu)較為簡(jiǎn)單,折射率檢測(cè)比較容易,可應(yīng)用數(shù)字全息顯微技術(shù)[16]和灌水法[17]來(lái)檢測(cè)單介質(zhì)類(lèi)球形細(xì)胞的折射率。但是許多細(xì)胞不具有這樣的簡(jiǎn)單特征,往往為多介質(zhì)非球體,如白細(xì)胞,其折射率的檢測(cè)就相應(yīng)要困難。因此,多介質(zhì)非球體細(xì)胞折射率分布檢測(cè)技術(shù)的研究領(lǐng)域得到了國(guó)內(nèi)外眾多學(xué)者的關(guān)注。該類(lèi)檢測(cè)方法主要有正交相位成像熵層析法[18]、斷層相位顯微成像[19]、數(shù)字全息顯微成像[20]、掃描全息顯微成像[21]、定量相位成像法[22]、雙波長(zhǎng)法[23]、三波長(zhǎng)法[24]等。其中正交相位成像熵層析法是依據(jù)相位圖,通過(guò)最大熵方法迭代求出折射率的空間分布,但是空間網(wǎng)格的劃分產(chǎn)生了精準(zhǔn)度與速度的矛盾;斷層相位顯微成像、數(shù)字全息成像和掃描全息顯微成像等主要是利用衍射層析圖來(lái)解耦細(xì)胞折射率,由于采用的是多角度釆集吸收系數(shù)投影數(shù)據(jù)的實(shí)驗(yàn)方式,所以實(shí)驗(yàn)過(guò)程長(zhǎng)且計(jì)算量大;雙波長(zhǎng)法[25]和三波長(zhǎng)[24]法往往是基于定量相位成像或數(shù)字全息顯微成像方法來(lái)完成的,這些方法需要對(duì)相圖進(jìn)行特殊處理并做若干數(shù)學(xué)假設(shè)方能完成。此外,還有許多其他類(lèi)別的方法,如流式芯片檢測(cè)方法[26]、微球探針?lè)ǎ?7]、固體浸沒(méi)(solid immersion,SI)顯微方法[28]等,這類(lèi)方法存在著檢測(cè)對(duì)象的個(gè)性要求或者是實(shí)驗(yàn)平臺(tái)的特殊設(shè)計(jì)要求。Shan等[29]基于相位顯微成像的優(yōu)勢(shì),利用統(tǒng)計(jì)色散關(guān)系(statistical dispersion relations,SDR)提出的SDR方法可在不需要厚度分布的情況下獲得細(xì)胞折射率的精準(zhǔn)分布結(jié)果,給該領(lǐng)域的研究帶來(lái)了新啟發(fā)。

    綜上所述,基于細(xì)胞折射率分布檢測(cè)的重要意義,人們通過(guò)不斷的研究,已經(jīng)獲得了許許多多有效的細(xì)胞折射率的檢測(cè)方法,然而由于實(shí)驗(yàn)要求高、計(jì)算量大等主要因素的影響,折射率檢測(cè)方法的簡(jiǎn)單化、精準(zhǔn)化的研究仍然是人們努力的方向。由此,針對(duì)異形核細(xì)胞形態(tài)結(jié)構(gòu)復(fù)雜、核的形態(tài)難以擬合的問(wèn)題,基于光傳輸理論和數(shù)學(xué)分析方法,本文提出了基于雙波長(zhǎng)三維相位成像下的折射率和厚度的解耦方法。該方法主要應(yīng)用相移和色散理論,基于相位顯微成像技術(shù),利用相位分布和相位梯度分布特征及其與細(xì)胞結(jié)構(gòu)形態(tài)的關(guān)系,得到了雙波長(zhǎng)相位分布函數(shù)表示下的折射率和厚度分布的數(shù)學(xué)表達(dá)結(jié)果,由此利用穩(wěn)定的相位成像技術(shù)和比較簡(jiǎn)單的數(shù)學(xué)計(jì)算,可實(shí)現(xiàn)均質(zhì)和非均質(zhì)異形核細(xì)胞折射率和厚度分布的解耦。仿真實(shí)驗(yàn)的結(jié)果證明了該方法的有效性。

    1 材料與方法

    1.1 無(wú)核均質(zhì)細(xì)胞的折射率解耦方法

    對(duì)于均質(zhì)無(wú)核細(xì)胞(如紅細(xì)胞),依據(jù)光強(qiáng)傳輸方程,當(dāng)光沿z軸透過(guò)樣品細(xì)胞時(shí)(為全文說(shuō)明方便,在此作外胞為球形,內(nèi)核為橢球形細(xì)胞模型,如圖1所示),在x-y面接收到的相位函數(shù)如下:

    圖1 三維細(xì)胞模型Fig. 1 Three-dimensional cell modelR1為細(xì)胞質(zhì)半徑;a、b、c分別為細(xì)胞核沿x、y、z方向的半徑。R1 is the radius of cytoplasm; a, b, c is the radius of nucleus along x, y, z direction respectively.

    式中,λi代表入射波長(zhǎng),nci為不同光源下樣品由于色散原因的細(xì)胞質(zhì)的不同折射率,nmi為不同光源下環(huán)境液由于色散原因的不同折射率,h(x,y)為樣品厚度。

    由式(1)可以看出,樣品的折射率與厚度信息相互耦合在相位信息中。在雙波長(zhǎng)相位顯微成像中,兩個(gè)波長(zhǎng)下的相移函數(shù)如下:

    設(shè)不同波長(zhǎng)下折射率差為δn可得:

    而當(dāng)選用色散系數(shù)高的環(huán)境液時(shí),δnm>>δnc,由式(2)和式(3)可以得到:

    由于環(huán)境液折射率可以預(yù)先得知,因此,由式(6)和式(7)分別可以得到細(xì)胞在不同波長(zhǎng)下的折射率,并且可以得到細(xì)胞厚度的分布,由此可實(shí)現(xiàn)均質(zhì)細(xì)胞折射率和厚度的解耦。

    1.2 外胞類(lèi)球有核細(xì)胞的折射率解耦方法

    成熟白細(xì)胞包括中性粒細(xì)胞、嗜堿性粒細(xì)胞、嗜酸性粒細(xì)胞、單核細(xì)胞、淋巴細(xì)胞這幾類(lèi),通常無(wú)色、球形、有核結(jié)構(gòu),且由于表面張力等原因外胞多為類(lèi)球形,但核多為非球形(圖2)。

    圖2 血細(xì)胞形態(tài)說(shuō)明圖Fig. 2 Illustration of blood cell morphology

    在相位顯微成像中,如圖1所示,當(dāng)光沿z軸透過(guò)細(xì)胞樣品時(shí),其相位將產(chǎn)生變化。根據(jù)相移理論,雙波長(zhǎng)下其相位表達(dá)式為:

    式中,λ1、λ2為光的兩種不同的波長(zhǎng),nh1、nh2分別為細(xì)胞核在兩波長(zhǎng)下的折射率,h1(x,y)、h2(x,y)為沿光軸方向細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核的厚度。對(duì)沿三個(gè)方向(x,y,z)相位成像的相位分布圖進(jìn)行梯度計(jì)算可得到其梯度分布圖,如圖3a~3c所示。依據(jù)圖3c的相位梯度分布可以找出非核區(qū),即光僅通過(guò)細(xì)胞質(zhì)區(qū)的相位,此時(shí)相位分布可以由式(2)和式(3)表示,因此,在兩個(gè)波長(zhǎng)下細(xì)胞質(zhì)的折射率可由式(7)得到。

    圖3 梯度分布Fig. 3 Gradient distribution(a)x軸方向梯度;(b)y軸方向梯度;(c)z軸方向梯度。(a) x-axis direction gradient; (b) y-axis direction gradient; (c) z-axis direction gradient.

    針對(duì)外胞為類(lèi)球形的細(xì)胞,依據(jù)對(duì)相位圖分布外輪廓線(xiàn)的擬合結(jié)果,可以得到外胞半徑R1(圖1),其外胞厚度分布可以表示為:

    其中x0、y0為樣品中心在坐標(biāo)系中的原點(diǎn)位置。

    式(10)分別對(duì)x和y求偏導(dǎo),可以得到如下表達(dá)式:

    為求細(xì)胞核的厚度分布,上述式(8)對(duì)波長(zhǎng)求偏導(dǎo)后可以得到如下表達(dá)式:

    式中,當(dāng)波長(zhǎng)滿(mǎn)足△λ=λ2-λ1<<λ1時(shí),△φ=φλ2-φλ1,λ=λ1。

    對(duì)方程組式(8)、式(9)求空間坐標(biāo)偏導(dǎo),式中考慮細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核折射率不變,得到如下表達(dá)式:

    式中,i對(duì)應(yīng)兩個(gè)波長(zhǎng),。

    選取特定點(diǎn),確定其坐標(biāo),從圖3a 、3b中選z軸截點(diǎn)較大處的細(xì)胞質(zhì)與細(xì)胞核分界點(diǎn),設(shè)其坐標(biāo)為(x1,y1),即滿(mǎn)足=0。取其較小的截距視為細(xì)胞核厚度,即可得到h2(x1,y1)。由式(10)可以得到h1(x1,y1),將其結(jié)果代入式(12)可以得到△nh。如表達(dá)式(15)。

    又因?yàn)椤鱪h-△nc=nh2-nh1-(nc2-nc1)=△nhc2-△nhc1,在式(11)中令可以得到其坐標(biāo)(x0,y0),將結(jié)果代入式(13),推導(dǎo)可以得到:

    依據(jù)式(10)、(12)、(15)、(16)和(17)可以得到細(xì)胞核區(qū)的折射率、細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核厚度參量的分布,即可求得nh、nc、h1、h2。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 無(wú)核均質(zhì)細(xì)胞的仿真結(jié)果與分析

    正常成熟的血紅細(xì)胞的形狀為雙凹圓盤(pán)狀,而且內(nèi)部無(wú)細(xì)胞核及其他細(xì)胞器,可被視為均質(zhì)細(xì)胞。為了說(shuō)明本文方法對(duì)無(wú)核均質(zhì)細(xì)胞折射率解耦的有效性,建立成熟紅細(xì)胞均質(zhì)模型,如圖4所示。該模型圖由式(18)鏡像組合而成,其中b為z軸方向半厚度。

    圖4 紅細(xì)胞模型Fig. 4 Erythrocyte model

    該紅細(xì)胞模型中半徑為4.00 μm,最大厚度為2.68 μm。光源波長(zhǎng)分別設(shè)置為532 nm和520 nm。在λ1(532 nm)下的折射率設(shè)置為nc1=1.410,λ2(520 nm)下的折射率設(shè)置為nc2=1.412。其環(huán)境液折射率在λ1下的折射率設(shè)置為nm1=1.451,λ2下的折射率設(shè)置為nm2=1.475。考慮到實(shí)驗(yàn)中噪聲的影響,在仿真實(shí)驗(yàn)中對(duì)相圖加入了35 dB的高斯白噪聲。

    依據(jù)本文的方法,仿真實(shí)驗(yàn)得到雙波長(zhǎng)下的紅細(xì)胞相位分布,如圖5所示。圖5a和5b分別對(duì)應(yīng)波長(zhǎng)532 nm和520 nm下的相位分布。

    圖5 仿真得到的紅細(xì)胞相位分布Fig. 5 Phase distribution of red blood cells obtained by simulation(a)λ1=532 nm;(b)λ2=520 nm。(a) λ1=532 nm; (b) λ2=520 nm.

    依據(jù)本文的解耦理論,仿真計(jì)算得到其厚度和折射率分布如圖6和圖7所示。圖6b為結(jié)果與模型設(shè)置值在最大截面上的比較圖,其紅細(xì)胞厚度分布最大截面的最大相對(duì)誤差為3.989%。圖7b是過(guò)紅細(xì)胞中心的折射率曲線(xiàn),計(jì)算得紅細(xì)胞折射率nc1與模型值的相對(duì)誤差為0.264%,折射率nc2與模型值的相對(duì)誤差為0.405%。由此說(shuō)明,本文的解耦方法對(duì)無(wú)核均質(zhì)細(xì)胞折射率解耦有效,并且可以得到較為精準(zhǔn)的厚度分布。

    圖6 紅細(xì)胞厚度的仿真實(shí)驗(yàn)結(jié)果Fig. 6 Simulation results of red blood cell thickness(a)厚度3D分布;(b)圖(a)過(guò)y軸原點(diǎn)的厚度截面分布。(a) 3D thickness distribution; (b) Thickness section distribution across the y-axis origin of (a).

    圖7 仿真得到的紅細(xì)胞折射率分布Fig. 7 Refractive index distribution of red blood cells obtained by simulation(a)折射率3D分布;(b)折射率曲線(xiàn)分布。(a) 3D distribution of refractive index; (b) Refractive index curve distribution.

    2.2 有核細(xì)胞的仿真結(jié)果與分析

    為了驗(yàn)證該方法的可行性,本文基于MATLAB數(shù)值仿真平臺(tái)進(jìn)行數(shù)值仿真實(shí)驗(yàn)。考慮到白細(xì)胞中為異形核,在此取細(xì)胞核為橢球形(圖1)。細(xì)胞質(zhì)外圍設(shè)半徑為8.0 μm,且其中心在坐標(biāo)原點(diǎn),橢球核其長(zhǎng)、短半徑分別為3.5 μm和2.5 μm,光源波長(zhǎng)λ1=520 nm和λ2=532 nm,細(xì)胞質(zhì)在兩個(gè)波長(zhǎng)下的折射率分別為nc1=1.469和nc2=1.473,雙波長(zhǎng)下環(huán)境液折射率分別為nm1=1.451和nm2=1.467,細(xì)胞核折射率為nh1=1.483和nh2=1.520??紤]到實(shí)際實(shí)驗(yàn)中的噪聲,在仿真實(shí)驗(yàn)相位圖中加入了30 dB的高斯白噪聲。

    根據(jù)上述參數(shù)設(shè)置和定量相位成像原理,基于MATLAB平臺(tái)進(jìn)行仿真實(shí)驗(yàn),得到兩個(gè)波長(zhǎng)下的相位分布,如圖8所示。

    圖8 相位分布Fig. 8 Phase distribution(a)波長(zhǎng)λ1沿x軸方向的相位分布;(b)波長(zhǎng)λ1沿y軸方向的相位分布;(c)波長(zhǎng)λ1沿z軸方向的相位分布;(d)波長(zhǎng)λ2沿x軸方向的相位分布;(e)波長(zhǎng)λ2沿y軸方向的相位分布;(f)波長(zhǎng)λ2沿z軸方向的相位分布。 (a) Phase distribution of λ1 along the x-axis; (b) Phase distribution of λ1 along the y-axis; (c) Phase distribution of λ1 along the z-axis; (d) Phase distribution of λ2 along the x-axis; (e) Phase distribution of λ2 along the y-axis; (f) Phase distribution of λ2 along the z-axis.

    依據(jù)本文的解耦理論,在高色散環(huán)境液中,δnm>>δnc即可以認(rèn)為△nc=0,仿真實(shí)驗(yàn)得到兩個(gè)波長(zhǎng)下的細(xì)胞質(zhì)折射率分別為nc1=nc2=1.466,兩個(gè)波長(zhǎng)下的細(xì)胞核折射率分別為nh1=1.490、nh2=1.545。誤差分析表明,波長(zhǎng)λ1下的細(xì)胞質(zhì)折射率相對(duì)誤差為0.175%,波長(zhǎng)λ2下的細(xì)胞質(zhì)折射率相對(duì)誤差為0.426%,細(xì)胞核仿真結(jié)果nh1與模型值的相對(duì)誤差為0.444%,nh2與模型值的相對(duì)誤差為1.436%。具體分析結(jié)果如表1所示。由此說(shuō)明,本文方法對(duì)于有核細(xì)胞解耦有效。

    表1 誤差分析結(jié)果Tab. 1 Error analysis results

    厚度分布仿真實(shí)驗(yàn)結(jié)果中細(xì)胞質(zhì)的直徑為h1(x,y)=15.764 μm,與模型值的相對(duì)誤差為1.475%,細(xì)胞核的厚度h2(x,y)分布如圖9所示。圖9b中紅色實(shí)線(xiàn)是過(guò)z軸在x-z最大截面上的厚度分布,其最大誤差發(fā)生在最大厚度值(4.784 μm)處,與模型值的相對(duì)誤差為4.32%。由此說(shuō)明,本文方法對(duì)異質(zhì)有核細(xì)胞的折射率解耦和厚度分布確定依然有效。

    圖9 仿真得到的細(xì)胞核厚度分布Fig. 9 Nucleus thickness distribution obtained by simulation(a)2D厚度分布;(b)過(guò)胞核中心截面厚度分布。(a) 2D thickness distribution; (b) Thickness distribution across the center of the nucleus.

    3 討論

    當(dāng)今細(xì)胞折射率解耦技術(shù)主要可以分為厚度評(píng)估法和層析相位顯微法。厚度評(píng)估法主要是通過(guò)實(shí)驗(yàn)結(jié)構(gòu)設(shè)置或理論方法來(lái)對(duì)厚度進(jìn)行確定,繼而實(shí)現(xiàn)折射率解耦。這類(lèi)方法主要存在實(shí)驗(yàn)裝置設(shè)計(jì)復(fù)雜(如微流控自動(dòng)配對(duì)下的高通量細(xì)胞折射率的檢測(cè)方法)、實(shí)驗(yàn)方法會(huì)破壞細(xì)胞的原生狀態(tài)(如灌注介質(zhì)法會(huì)使細(xì)胞膨脹)、理論計(jì)算耗時(shí)長(zhǎng)(如對(duì)厚度進(jìn)行高斯-牛頓法求解下的非線(xiàn)性最小二乘迭代法求解折射率)等缺點(diǎn)。層析相位顯微法主要是通過(guò)光源或樣品的旋轉(zhuǎn)獲取眾多角度下的相位分布,從而進(jìn)行三維重建,由三維相位信息來(lái)確定折射率的分布。這類(lèi)方法雖然具有很高的精準(zhǔn)度,能夠在任何形態(tài)細(xì)胞中應(yīng)用,但是實(shí)驗(yàn)裝置復(fù)雜、實(shí)驗(yàn)時(shí)間長(zhǎng)、計(jì)算量大。本課題組提出的最大熵重建方法雖然避免了多角度相位成像,但是重建過(guò)程仍然需要一定的計(jì)算時(shí)間。傳統(tǒng)基于相位圖下的多波長(zhǎng)細(xì)胞折射率解耦方法往往需要許多假設(shè)條件,如對(duì)細(xì)胞折射率的預(yù)判或者是假設(shè)細(xì)胞為球體,尚不適應(yīng)非球形核的細(xì)胞。對(duì)此,本文所提出的基于三維相位顯微成像下的雙波長(zhǎng)細(xì)胞折射率和厚度解耦方法,主要利用無(wú)損三維相位顯微成像的相位信息,基于雙波長(zhǎng)相移數(shù)學(xué)表達(dá),依據(jù)色散和相位梯度的特征分析,實(shí)現(xiàn)單介質(zhì)和雙介質(zhì)外胞類(lèi)球形血細(xì)胞折射率和厚度的解耦。本方法通過(guò)數(shù)值仿真驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)表明了其可行性。與基于正交相位圖下的兩波長(zhǎng)和三波長(zhǎng)傳統(tǒng)解耦方法相比較,本文方法對(duì)細(xì)胞核形態(tài)沒(méi)有要求,但是傳統(tǒng)方法由于利用的是正交相圖的邊緣輪廓作為分析依據(jù)[30],這種情況下只有細(xì)胞核是球形時(shí)才能夠得到精準(zhǔn)結(jié)果,如果不是球形細(xì)胞核形態(tài),只能近似到球形模型處理,此時(shí)得到的結(jié)果與真實(shí)情況比較必然存在著較大的誤差,所以本文的解耦方法具有較高的精準(zhǔn)性。本方法可對(duì)均質(zhì)細(xì)胞(如紅細(xì)胞)和外胞類(lèi)球形細(xì)胞(如白細(xì)胞五個(gè)亞類(lèi))實(shí)現(xiàn)無(wú)損折射率和厚度分布的準(zhǔn)確解耦,因此在血細(xì)胞精準(zhǔn)分類(lèi)中具有重要的潛在應(yīng)用性,同時(shí)也適用于相位體亞結(jié)構(gòu)形態(tài)結(jié)構(gòu)的三維重建。

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